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ENDO Shigeru  猿渡 茂

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猿渡 茂  エンド シゲル

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Researcher Number 00265729
Other IDs
Affiliation (based on the past Project Information) *help 2007 – 2008: Kitasato University, School of Science, Associate Prof.
2003 – 2006: 北里大学, 理学部, 助教授
1999 – 2000: 北里大学, 理学部, 助教授
1997: 北里大学, 理学部, 助教授
Review Section/Research Field
Principal Investigator
Applied genomics / Biophysics
Except Principal Investigator
Biophysics / Bioinformatics/Life informatics
Keywords
Principal Investigator
2面角 / ProMode / dihedral angle / 内部座標 / 分子動力学 / energy minimization / Eckart condition / rotational vector / external motion / internal motion … More / protein complex / P2対称性 / タンパク質 / 同種3量体 / 同種2量体 / 同種多量体 / 内部自由度 / Eckert条件 / 基準振動解析 / エネルギー極小化 / Eckart条件 / 回転ベクトル / 外部運動 / 内部運動 / タンパク質複合体 / 434 repressor / nonlinear effect / energy transfer / internal coordinate / molecular dynamics / 434リプレッサー / 非線形効果 / エネルギー移動 / NMR / ロボット工学 / ディスタンス・ジオメトリ … More
Except Principal Investigator
ProMode / 基準振動解析 / homologous protein / lysozyme / normal mode analysis / dynamic structure of protein / トリプシン・インヒビター / 蛋白質の動的構造 / 酵素 / SCOP / 相同タンパク質 / リゾチーム / タンパク質の動的構造 / 分子構造表現 / 弾性ネットワークモデル / タンパク質のダイナミクス / データベース / PDB / タンパク質立体構造のダイナミクス Less
  • Research Projects

    (5 results)
  • Research Products

    (48 results)
  • Co-Researchers

    (1 People)
  •  Normal mode analysis of proteins using an elastic network model in dihedral angle space

    • Principal Investigator
      WAKO Hiroshi
    • Project Period (FY)
      2006 – 2008
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      Bioinformatics/Life informatics
    • Research Institution
      Waseda University
  •  Analyses of binding normal modes in protein complexes and registration to the database ProModePrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      ENDO Shigeru
    • Project Period (FY)
      2005 – 2007
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      Applied genomics
    • Research Institution
      Kitasato University
  •  A comparative study of dynamic structures of proteins by using normal mode analysis database.

    • Principal Investigator
      WAKO Hiroshi
    • Project Period (FY)
      2003 – 2005
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      Biophysics
    • Research Institution
      Waseda University
  •  The dynamic structure of protein molecules based on coupling among normal modesPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      ENDO Shigeru
    • Project Period (FY)
      1999 – 2000
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      Biophysics
    • Research Institution
      Kitasato University
  •  2次構造を単位とした蛋白質の分子動力学シミュレーションPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      猿渡 茂
    • Project Period (FY)
      1997
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Research Institution
      Kitasato University

All 2008 2007 2006 2005 2004

All Journal Article Presentation

  • [Journal Article] Comparisons between dynamic properties of homologous protein structures in ProMode(Database of Normal Mode Analyses on Proteins)2005

    • Author(s)
      H., Wako, M., Otsuka, Y., Tomizawa, M., Kato, S., Endo
    • Journal Title

      Genome Informatics 16-1

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Journal Article] Comparisons between dynamic properties of homologous protein structures in ProMode (Database of normal mode analyses of proteins)2005

    • Author(s)
      H.Wako, M.Otsuka, Y.Tomizawa, M.Kato and S.Endo
    • Journal Title

      Genome Informatics Series 16・1

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Journal Article] Comparisons between Dynamic Properties of Homologous Protein Structures in ProMode (Database of Normal Mod Analyses of Proteins)2005

    • Author(s)
      H.Wako, M.Otsuka, Y.Tomizawa, M.Kato, S.Endo
    • Journal Title

      Genome Informatics Series 16・1

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Journal Article] ProMode : a database of normal mode analyses on protein molecules with a full-atom model2004

    • Author(s)
      Hiroshi Wako, Masaki Kato, Shigeru Endo
    • Journal Title

      Bioinformatics 20(13)

      Pages: 2035-2043

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15570139
  • [Journal Article] ProMode : a database of normal mode analyses on protein molecules with a full-atom model2004

    • Author(s)
      Hiroshi Wako, Masaki Kato, Shigeru Endo
    • Journal Title

      Bioinformatics 20

      Pages: 2035-2043

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15570139
  • [Presentation] 二面角系での弾性ネットワークモデルによる基準振動解析の評価2008

    • Author(s)
      輪湖 博, 猿渡 茂
    • Organizer
      日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      福岡県福岡市
    • Year and Date
      2008-12-03
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] 二面角系での弾性ネットワークモデルによる基準振動解析の評価2008

    • Author(s)
      輪湖博、猿渡茂
    • Organizer
      日本生物物理学会第46回年会
    • Place of Presentation
      福岡県福岡市
    • Year and Date
      2008-12-03
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] 二面角系での弾性ネットワークモデルによる基準振動解析2008

    • Author(s)
      輪湖 博, 猿渡 茂
    • Organizer
      日本蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      東京都江戸川区
    • Year and Date
      2008-06-11
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] アミノ酸配列情報を用いた蛋白質運動性の予測2008

    • Author(s)
      廣瀬修一, 横田恭宣, 輪湖 博, 猿渡 茂, 黒田 裕, 金井 理, 野口 保
    • Organizer
      日本蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      東京都江戸川区
    • Year and Date
      2008-06-10
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] 二面角系での弾性ネットワークモデルによる基準振動解析2008

    • Author(s)
      輪湖博、猿渡茂
    • Organizer
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      東京都江戸川区
    • Year and Date
      2008-06-10
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] タンパク質複合体の基準振動における結合モードの解析2008

    • Author(s)
      猿渡茂、佐々木彰吾、輪湖博
    • Organizer
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      東京都江戸川区
    • Year and Date
      2008-06-10
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] 蛋白質複合体の基準振動における結合モードの解析2008

    • Author(s)
      猿渡 茂, 佐々木彰吾, 輪湖 博
    • Organizer
      日本蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      東京都江戸川区
    • Year and Date
      2008-06-10
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] アミノ酸配列情報を用いた蛋白質運動性の予測2008

    • Author(s)
      廣瀬修一、横田恭宣、輪湖博、猿渡茂、黒田裕、金井理、野口保
    • Organizer
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      東京都江戸川区
    • Year and Date
      2008-06-10
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] 基準振動解析における結合モードに基づく蛋白質複合体の動的構造の分類2008

    • Author(s)
      猿渡 茂, 輪湖 博
    • Organizer
      日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      福岡県福岡市
    • Year and Date
      2008-12-03
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] A stand-alone application for users to perform normal analyses of proteins using data from ProMode2008

    • Author(s)
      H.Wako, Y.Tomizawa, and S.Endo
    • Organizer
      The Sixth Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC2008)
    • Place of Presentation
      Kyoto
    • Year and Date
      2008-01-14
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Presentation] A stand-alone application for users to perform normal mode analyses of protein using data from ProMode2008

    • Author(s)
      輪湖博、富澤裕樹、猿渡茂
    • Organizer
      The sixth Asia-Pacific Bioinformatics Conference
    • Place of Presentation
      京都府京都市
    • Year and Date
      2008-01-15
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] A stand-alone application for users to perform normal analyses of proteins using data from PraMode.2008

    • Author(s)
      H.Wako, Y.Tomizawa, and S.Endo
    • Organizer
      The Sixth Asia-Pacific Bioinformatics Conference(APBC2008)
    • Place of Presentation
      Kyoto
    • Year and Date
      2008-01-14
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Presentation] A stand-alone application for users to perform normal mode analvses of proteinsusing data from ProMode2008

    • Author(s)
      Hiroshi Wako, Yuhki Tomizawa, Shigeru Endo
    • Organizer
      Asia-Pacific Bioinformatics Conference
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2008-01-14
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] 基準振動解析における結合モードに基づくタンパク質複合体動的構造の分類2008

    • Author(s)
      猿渡茂、輪湖博
    • Organizer
      日本生物物理学会第46回年会
    • Place of Presentation
      福岡県福岡市
    • Year and Date
      2008-12-03
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] ProModeデータを利用したタンパク質の基準振動解析プログラムの開発2007

    • Author(s)
      輪湖 博、富澤 裕樹、猿渡 茂
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-23
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Presentation] 蛋白質2分子複合体の基準振動の包括的解析2007

    • Author(s)
      猿渡 茂、輪湖 博
    • Organizer
      日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-23
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] ProModeユーザーのための基準振動解析プログラムの開発2007

    • Author(s)
      輪湖 博、富澤 裕樹、猿渡 茂
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2007-05-25
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Presentation] ProModeを利用したタンパク質の基準振動解析プログラムの開発2007

    • Author(s)
      輪湖博、富澤裕樹、猿渡茂
    • Organizer
      日本生物物理学会第45回年会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      2007-12-23
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] Comprehensive Analyses of Normal Modes of Dimeric Protein Complexes2007

    • Author(s)
      S., Endo
    • Organizer
      45th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Yokohama
    • Year and Date
      2007-12-23
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Presentation] ProModeユーザーのための基準振動解析プログラムの開発2007

    • Author(s)
      輪湖博、富澤裕樹、猿渡茂
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      宮城県仙台市
    • Year and Date
      2007-05-25
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] 立体構造不定領域のあるタンパク質の動的構造の解析とデータベースProModeヘの取りこみ2007

    • Author(s)
      猿渡 茂、輪湖 博
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2007-04-25
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Presentation] 蛋白質2分子複合体の基準振動の包括的解析2007

    • Author(s)
      猿渡 茂、輪湖 博
    • Organizer
      第45回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-23
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Presentation] ProModeユーザーのための基準振動解析プログラムの開発2007

    • Author(s)
      輪湖 博、富澤 祐樹、猿渡 茂
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2007-05-25
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] 立体構造不定領域のあるタンパク質の動的構造の解析とデータベースProModeへの取りこみ2007

    • Author(s)
      猿渡 茂、輪湖 博
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2007-05-25
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Presentation] 立体構造不定領域のあるタンパク質の動的構造の解析とデータベースProModeへの取り込み2007

    • Author(s)
      猿渡茂、輪湖博
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      宮城県仙台市
    • Year and Date
      2007-05-25
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] 立体構造不定領域のあるタンパク質の動的構造の解析とデータベースProModeへの取り込み2007

    • Author(s)
      猿渡 茂、輪湖 博
    • Organizer
      日本蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2007-05-25
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] 蛋白質2分子複合体の基準振動の包括的解析2007

    • Author(s)
      猿渡茂、輪湖博
    • Organizer
      日本生物物理学会第45回年会
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      2007-12-23
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] Analysis of dynamic structures of proteins with missing residues and registration to the database ProMode2007

    • Author(s)
      S., Endo
    • Organizer
      The 8th annual meeting of the protein society of Japan
    • Place of Presentation
      Sendai
    • Year and Date
      2007-05-25
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Presentation] ProModeデータを利用したタンパク質の基準振動解析プログラムの開発2007

    • Author(s)
      輪湖 博、富澤 祐樹、猿渡 茂
    • Organizer
      日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-23
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] Normal Mode Analyses of multimeric proteins with symmetry in Dihedral Angle Space2006

    • Author(s)
      S., Endo
    • Organizer
      EABS & BSJ 2006
    • Place of Presentation
      Okinawa
    • Year and Date
      2006-11-13
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Presentation] Dynamic structures of proteins characterized by networks formed by connecting positively correlated residues in normal mode vibrations2006

    • Author(s)
      輪湖博、猿渡茂
    • Organizer
      日本生物物理学会第44回年会&Fifth East Asian Biopyhsics Symposium
    • Place of Presentation
      沖縄県那覇市
    • Year and Date
      2006-11-12
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] Normal Mode Analyses of multimeric proteins with symmetry in Dihedral Angle Space2006

    • Author(s)
      S.Endo and H.Wsko
    • Organizer
      5th East Asian Biophysics Symposium & 44th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan (EABS & BSJ 2006)
    • Place of Presentation
      Okinawa
    • Year and Date
      2006-11-13
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Presentation] Normal mode analyses of multimeric proteins with symmetry in dihedral angle space2006

    • Author(s)
      猿渡茂、輪湖博
    • Organizer
      日本生物物理学会第44回年会&Fifth East Asian Biopyhsics Symposium
    • Place of Presentation
      沖縄県那覇市
    • Year and Date
      2006-11-12
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] T4リゾチーム変異体における動的構造-活性相関2006

    • Author(s)
      猿渡 茂、柳田 直人、輪湖 博
    • Organizer
      第6回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2006-04-25
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Presentation] T4リゾチーム変異体における動的構造-活性相関2006

    • Author(s)
      猿渡茂、柳田直人、輪湖博
    • Organizer
      第6回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      京都府京都市
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [Presentation] Dynamic structures of proteins characterized by networks formed by connecting positively correlated residues in normal mode vibrations2006

    • Author(s)
      H.Wako and S.Endo
    • Organizer
      EABS & BSJ 2006
    • Place of Presentation
      Okinawa
    • Year and Date
      2006-11-13
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Presentation] Dynamics-Activity Relationship among T4 Lysozyme Mutants2006

    • Author(s)
      S., Endo
    • Organizer
      The 7th annual meeting of the protein society of Japan
    • Place of Presentation
      Kyoto
    • Year and Date
      2006-04-25
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Presentation] 異種及び同種2量体タンパク質の基準振動解析2005

    • Author(s)
      猿渡 茂、輪湖 博
    • Organizer
      第43回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2005-11-23
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Presentation] 相同なタンパク質の動的構造I.ヒトリゾチームの動的構造に対するアミノ酸置換の影響2005

    • Author(s)
      猿渡 茂、輪湖 博
    • Organizer
      第5回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2005-06-30
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Presentation] 相同なタンパク質の動的構造II.スーパーファミリー内での比較2005

    • Author(s)
      輪湖 博、大塚 元央、富澤 裕樹、加藤 雅樹、猿渡 茂
    • Organizer
      第5回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2005-06-30
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Presentation] 基準振動解析による相同なタンパク質の動的構造の比較2005

    • Author(s)
      輪湖 博、大塚 元央、富澤 裕樹、加藤 雅樹、猿渡 茂
    • Organizer
      第43回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2005-11-23
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Presentation] Normal mode analyses of hetero and homo dimeric proteins2005

    • Author(s)
      S., Endo
    • Organizer
      43th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Sapporo
    • Year and Date
      2005-11-23
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [Presentation] Dynamic structures of homologous proteins I. The effects of amino acid substitution on the dynamic structures of human lysozyme2005

    • Author(s)
      S., Endo
    • Organizer
      The 6th annual meeting of the protein society of Japan
    • Place of Presentation
      Fukuoka
    • Year and Date
      2005-06-30
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • 1.  WAKO Hiroshi (60158607)
    # of Collaborated Projects: 4 results
    # of Collaborated Products: 41 results

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