Yokota Hiroshi 横田宏

Researcher Number	10846356
Other IDs	https://orcid.org/0000-0002-7949-1337
Affiliation (Current)	2024: 東京都立大学, 理学研究科, 助教
Affiliation (based on the past Project Information) *help	2022 – 2024: 京都大学, 人間・環境学研究科, 特定研究員 2021 – 2022: 国立研究開発法人理化学研究所, 数理創造プログラム, 特別研究員
Review Section/Research Field	Principal Investigator Transformative Research Areas, Section (III) / Basic Section 13040:Biophysics, chemical physics and soft matter physics-related
Keywords	Principal Investigator クロマチン / 粗視化分子動力学シミュレーション / 染色体凝縮 / writhe / twist / Rouse mode / 緩和モード / 染色体 / 生物物理 / 核様体 / 相転移 / 細胞内相分離

Research Projects
(3 results)
Research Products
(19 results)

ねじれを伴う高分子の運動モードを用いて、染色体形成を理解するPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  横田宏
- Project Period (FY)
  2023 – 2024
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
- Review Section
  
  Transformative Research Areas, Section (III)
- Research Institution
  Kyoto University
細胞内相分離における分子配向の役割Principal Investigator
- Principal Investigator
  
  横田宏
- Project Period (FY)
  2022 – 2024
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
- Review Section
  
  Basic Section 13040:Biophysics, chemical physics and soft matter physics-related
- Research Institution
  Kyoto University
曲げとねじれのモードカップリングを通して、分裂期染色体の凝縮を理解するPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  横田宏
- Project Period (FY)
  2021 – 2022
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
- Review Section
  
  Transformative Research Areas, Section (III)
- Research Institution
  Institute of Physical and Chemical Research

All 2024 2023 2022 2021

All Journal Article Presentation

[Journal Article] Simulation study on “ torsion ” and local structure of chromosome: Loop structure via torsion-adding loop extrusion2024
- Author(s)
  H. Yokota, and M. Tachikawa
- Journal Title
  
  Journal of Advanced Simulation in Science and Engineering
  
  Volume: 11 Issue: 1 Pages: 54-72
- DOI
  10.15748/jasse.11.54
- ISSN
  2188-5303
- Language
  English
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18H05276, KAKENHI-PUBLICLY-23H04298, KAKENHI-PUBLICLY-23H04320
[Journal Article] Stability Analysis for Consensus Systems with Distributed Time Delays2024
- Author(s)
  YAMAKAWA Rijo、KATANAYA Yoshinori、YOKOTA Hiroshi、KOMATSU Hirokazu
- Journal Title
  
  Transactions of the Society of Instrument and Control Engineers
  
  Volume: 60 Issue: 3 Pages: 256-267
- DOI
  10.9746/sicetr.60.256
- ISSN
  0453-4654, 1883-8189
- Language
  Japanese
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K14018
[Presentation] Simulation study on “torsion” and local structure of chromosome:Loop structure via one side loop extrusion with twist deformation2024
- Author(s)
  Hiroshi Yokota, Masashi Tachikawa
- Organizer
  The 42nd JSST Annual International Conference on Simulation Technology
- Invited / Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-23H04298
[Presentation] 細胞分裂中の葉緑体DNAのトポロジーとそのダイナミクス2024
- Author(s)
  横田宏, 西村芳樹
- Organizer
  ソフトバイオ研究会2023
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-23H04298
[Presentation] 合意制御に基づくサッカーエージェントのボール追従に敵エージェントが及ぼす影響の考察2024
- Author(s)
  佐藤風汰, 小松弘和, 横田宏
- Organizer
  第11回制御部門マルチシンポジウム
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K14018
[Presentation] MASを用いたサッカーロボットのボール追従制御に敵エージェントが及ぼす影響の考察2024
- Author(s)
  佐藤風太, 小松弘和, 横田宏, 杉浦藤虎, 及川大
- Organizer
  2023年度計測自動制御学会関西支部・システム制御情報学会シンポジウム
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K14018
[Presentation] Dynamical mode of DNA-like polymer with “torsion”2024
- Author(s)
  横田宏
- Organizer
  学術変革領域A ゲノムモダリティ「若手の会 2023」
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-23H04298
[Presentation] Topology-dependent Dynamics of Chloroplast DNA in Chlamydomonas during Cell Division2024
- Author(s)
  Hiroshi Yokota, Yoshiki Nishimura
- Organizer
  International Conference on Biological Physics
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-23H04298
[Presentation] Twist変形を伴うループ押し出し機構による染色体の局所構造2024
- Author(s)
  横田宏, 立川正志
- Organizer
  日本物理学会年次大会
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-23H04298
[Presentation] DNA-likeなねじれの自由度を持つ高分子の運動モードのモデル2024
- Author(s)
  横田宏, 佐藤勝彦
- Organizer
  日本物理学会春季大会
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-23H04298
[Presentation] Twist変形を伴うループ押し出し機構による染色体の局所構造2024
- Author(s)
  横田宏, 立川正志
- Organizer
  第41 回染色体ワークショップ・第22 回核ダイナミクス研究会
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-23H04298
[Presentation] 細胞分裂時における葉緑体DNAのトポロジーと“ねじれ”を含む高分子の運動モード2024
- Author(s)
  横田宏, 西村芳樹, 佐藤勝彦
- Organizer
  第十二回京都若手ソフトマター研究会
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-23H04298
[Presentation] クラミドモナスの細胞分裂時における葉緑体内DNAの粗視化分子動力学シミュレーション2023
- Author(s)
  横田宏
- Organizer
  日本物理学会 2023年春季大会
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-21H05765
[Presentation] Twist変形を伴う片側ループ押し出し機構によるループ構造2023
- Author(s)
  横田宏
- Organizer
  日本物理学会 2023年春季大会
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-21H05765
[Presentation] Twist変形を伴う片側ループ押し出し機構によるループ構造2022
- Author(s)
  横田宏
- Organizer
  新学術・学術変革領域合同若手の会
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-21H05765
[Presentation] Twist変形を伴う片側ループ押し出し機構によるループ構造のループ長さ依存性2022
- Author(s)
  横田宏
- Organizer
  ソフトバイオ研究会
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-21H05765
[Presentation] Loop structure and its net loop size via one sided loop extrusion with twist deformation2022
- Author(s)
  横田宏
- Organizer
  第40回染色体ワークショップ・第21回核ダイナミクス研究会
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-21H05765
[Presentation] 熱的なクロマチンループ形成のダイナミクスとその妥当性2022
- Author(s)
  横田宏
- Organizer
  2022年度遺伝研研究会ゲノムモデリング研究会
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-21H05765
[Presentation] Twist変形を含むone-sided loop extrusionが導くループ構造2021
- Author(s)
  横田宏
- Organizer
  第39回染色体ワークショップ・第19回核ダイナミクス研究会
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-21H05765

Yokota Hiroshi 横田 宏

Research Projects

Research Products

ねじれを伴う高分子の運動モードを用いて、染色体形成を理解するPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

細胞内相分離における分子配向の役割Principal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

曲げとねじれのモードカップリングを通して、分裂期染色体の凝縮を理解するPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

[Journal Article] Simulation study on “ torsion ” and local structure of chromosome: Loop structure via torsion-adding loop extrusion2024

Author(s)

Journal Title

DOI

ISSN

Language

Data Source

[Journal Article] Stability Analysis for Consensus Systems with Distributed Time Delays2024

Author(s)

Journal Title

DOI

ISSN

Language

Data Source

[Presentation] Simulation study on “torsion” and local structure of chromosome:Loop structure via one side loop extrusion with twist deformation2024

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] 細胞分裂中の葉緑体DNAのトポロジーとそのダイナミクス2024

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] 合意制御に基づくサッカーエージェントのボール追従に敵エージェントが及ぼす影響の考察2024

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] MASを用いたサッカーロボットのボール追従制御に敵エージェントが及ぼす影響の考察2024

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] Dynamical mode of DNA-like polymer with “torsion”2024

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] Topology-dependent Dynamics of Chloroplast DNA in Chlamydomonas during Cell Division2024

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] Twist変形を伴うループ押し出し機構による染色体の局所構造2024

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] DNA-likeなねじれの自由度を持つ高分子の運動モードのモデル2024

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] Twist変形を伴うループ押し出し機構による染色体の局所構造2024

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] 細胞分裂時における葉緑体DNAのトポロジーと“ねじれ”を含む高分子の運動モード2024

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] クラミドモナスの細胞分裂時における葉緑体内DNAの粗視化分子動力学シミュレーション2023

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] Twist変形を伴う片側ループ押し出し機構によるループ構造2023

Yokota Hiroshi 横田宏