Araki Michihiro 荒木通啓

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araki michihiro 荒木通啓

ARAKI Michihiro 荒木通啓

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Researcher Number	40396867
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Affiliation (Current)	2025: 立命館大学, 薬学部, 教授 2025: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 国立健康・栄養研究所 AI栄養統括研究室, 客員研究員 2025: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 医薬基盤研究所 AI健康・医薬研究センター, 客員研究員
Affiliation (based on the past Project Information) *help	2022 – 2024: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 医薬基盤研究所 AI健康・医薬研究センター, 副センター長 2016: 神戸大学, 科学技術イノベーション研究科, 特命准教授 2013 – 2015: 神戸大学, 自然科学系先端融合研究環重点研究部, 准教授 2012: 京都大学, 薬学研究科(研究院), 准教授 2008 – 2010: Kyoto University, 先端技術グローバルリーダー養成ユニット, 准教授
Review Section/Research Field	Principal Investigator Complex systems / System genome science / ゲノム情報科学 Except Principal Investigator Basic Section 27040:Biofunction and bioprocess engineering-related
Keywords	Principal Investigator バイオインフォマティクス / 合成生物学 / 代謝工学 / バイオラクノロジー / synthetic biology / 生物・生体工学 / ゲノム / 生体生命情報学 / 生合成 / ケモインフォマティクス … More Except Principal Investigator … More 遺伝子発現量解析 / 機械学習 / プラスミドライブラリィ / プラットホーム / プラスミド構成要素 / 遺伝子発現パターン / 大腸菌 Less

代謝ブラックボックスの可視化から紐解く遺伝子導入パターン最適化手法の確立
- Principal Investigator
  
  野田修平
- Project Period (FY)
  2022 – 2024
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- Review Section
  
  Basic Section 27040:Biofunction and bioprocess engineering-related
- Research Institution
  Kobe University
人工代謝経路のスコープの拡張Principal Investigator
- Principal Investigator
  
  荒木通啓
- Project Period (FY)
  2014 – 2015
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
- Review Section
  
  Complex systems
- Research Institution
  Kobe University
Informatics analysis on selectivity and diversity of enzymatic reactionPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  araki michihiro
- Project Period (FY)
  2014 – 2016
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Research Field
  
  System genome science
- Research Institution
  Kobe University
人工代謝経路の設計基盤の構築Principal Investigator
- Principal Investigator
  
  荒木通啓
- Project Period (FY)
  2012 – 2013
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
- Review Section
  
  Complex systems
- Research Institution
  Kobe University
  Kyoto University
Reconstruction of Metabolic Network for Extracting Design Principles of Natural ProductsPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  ARAKI Michihiro
- Project Period (FY)
  2008 – 2010
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- Research Field
  
  ゲノム情報科学
- Research Institution
  Kyoto University

All 2017 2016 2015 2014 2013 2012 2011 2010 2009 2008 Other

All Journal Article Presentation Book Patent

[Book] 合成生物工学によるモノづくり微生物のデザインに向けて2015
- Author(s)
  石井純、荒木通啓、中津井雅彦、崎濱由梨、柘植陽太、蓮沼誠久、近藤昭彦
- Total Pages
  5
- Publisher
  生物工学会誌
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Book] 合成生物工学によるモノづくり微生物のデザインに向けて2015
- Author(s)
  石井純、荒木通啓、中津井雅彦、崎濱由梨、柘植陽太、蓮沼誠久、近藤昭彦
- Total Pages
  5
- Publisher
  生物工学会誌
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[Book] データベースからの再発見2014
- Author(s)
  荒木通啓
- Total Pages
  1
- Publisher
  生物工学会誌（バイオミディア）
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[Book] データベースからの再発見2014
- Author(s)
  荒木通啓
- Total Pages
  1
- Publisher
  生物工学会誌（バイオミディア）
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Journal Article] A Systematic Approach to Time-series Metabolite Profiling and RNA-seq Analysis of Chinese Hamster Ovary Cell Culture2017
- Author(s)
  Hsu, HH., Araki, M., Mochizuki, M., Hori, Y., Murata, M., Kahar, P., Yoshida, T., Hasunuma, T. and Kondo A.
- Journal Title
  
  Scientific Reports
  
  Volume: 7 Issue: 1 Pages: 43518-43518
- DOI
  10.1038/srep43518
- NAID
  120006346139
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Journal Article] Application of LC-MS/MS analysis for time-lapse amino acid metabolomics analysis in CHO cell culture2017
- Author(s)
  Hsu, H.H., Hasunuma, T., Araki, M., Yoshida, T., Hori, Y., Murata, M., Kondo, A.
- Journal Title
  
  Shimadzu Journal
  
  Volume: 5 Pages: 17-17
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Journal Article] Targeted nucleotide editing using hybrid prokaryotic and vertebrate adaptive immune systems2016
- Author(s)
  Nishida, K., Arazoe, T., Yachie, N., Banno, S., Kakimoto, M., Tabata, M., Mochizuki, M., Miyabe, A., Araki, M., Hara, K.Y., Shimatani, Z. and Kondo, A.
- Journal Title
  
  Science
  
  Volume: 353 Issue: 6305 Pages: 6305-6305
- DOI
  10.1126/science.aaf8729
- Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198, KAKENHI-PROJECT-15K18647, KAKENHI-PROJECT-16K14654, KAKENHI-PROJECT-15K18466, KAKENHI-PROJECT-15K14436
[Journal Article] Evaluation of genes involved in oxidative phosphorylation in yeast by developing a simple and rapid method to measure mitochondrial ATP synthetic activity.2015
- Author(s)
  Ye X, Morikawa K, Ho SH, Araki M, Nishida K, Hasunuma T, Hara KY, Kondo A.
- Journal Title
  
  Microbial Cell Factories
  
  Volume: 14 Issue: 1 Pages: 56-56
- DOI
  10.1186/s12934-015-0239-z
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119710, KAKENHI-PROJECT-26430198, KAKENHI-PUBLICLY-26119711, KAKENHI-PUBLICLY-26117715
[Journal Article] M-path: A Compass for Navigating Potential Metabolic Pathways2015
- Author(s)
  Araki, M., Cox III, RS., Makiguchi, H., Ogawa, T., Taniguchi, T., Miyaoku, K., Nakatsui M., Hara, K.Y., Kondo, A.
- Journal Title
  
  Bioinformatics
  
  Volume: 31 Issue: 6 Pages: 905-911
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btu750
- Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711, KAKENHI-PROJECT-26430198
[Journal Article] Improvement of oxidized glutathione fermentation by thiol redox metabolism engineering in Saccharomyces cerevisiae2015
- Author(s)
  Hara, K.Y., Aoki, N., Kobayashi, J., Kiriyama, K., Nishida, K., Araki, M., Kondo, A.
- Journal Title
  
  Appl. Microbiol. Biotechnol.
  
  Volume: 99 Issue: 22 Pages: 9771-9778
- DOI
  10.1007/s00253-015-6847-z
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198, KAKENHI-PUBLICLY-26119711, KAKENHI-PUBLICLY-26117715
[Journal Article] Development of bio-based fine chemical production through synthetic bioengineering2014
- Author(s)
  Hara, K.Y., Araki, M., Okai, N., Wakai, S., Hasunuma, T., Kondo, A.
- Journal Title
  
  Microbial Cell Factories
  
  Volume: 13 Issue: 1 Pages: 173-173
- DOI
  10.1186/s12934-014-0173-5
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711, KAKENHI-PROJECT-26430198
[Journal Article] An Approach for Dynamical Network Reconstruction of Simple Network Motifs2013
- Author(s)
  Nakatsui, M., Araki, M., Kondo, A.
- Journal Title
  
  BMC Systems Biology
  
  Volume: 7 (Suppl 6) Issue: S6 Pages: 54-54
- DOI
  10.1186/1752-0509-7-s6-s4
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[Journal Article] Extraction and analysis of chemical modification patterns in drugdevelopment2009
- Author(s)
  Shigemizu, D., Araki, M., Okuda, S., etal.
- Journal Title
  
  Journal of Chemical Information and Modeling 49(4)
  
  Pages: 1122-1129
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[Journal Article] Analysis of Chemical Modification Patterns Extracted from KEGG Drug Structure Maps2009
- Author(s)
  Shigemizu, D., Araki, M., Okuda, S., etal.
- Journal Title
  
  IBSB2009 Boston
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[Journal Article] A Web Tool for Expression Pattern-Based Data Retrieval and Relevant Network Discovery fromvast Public Microarray Database2009
- Author(s)
  Feng, C., Araki, M., etal.
- Journal Title
  
  GIW2009,PosterAbstracts P056
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[Journal Article] Extraction and analysis of chemical modification patterns in drug development.2009
- Author(s)
  Shigemizu D, Araki M, Okuda S, Goto S, Kanehisa M.
- Journal Title
  
  J Chem Inf Model. 49(4)
  
  Pages: 1122-1129
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[Journal Article] GEM-TREND : a web tool for gene expression datamining toward relevant network discovery2009
- Author(s)
  Feng, C., Araki, M., etal.
- Journal Title
  
  BMCG enomics 10
  
  Pages: 411-411
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[Journal Article] GEM-TREND : a web tool for gene expression data mining toward relevant network discovery.2009
- Author(s)
  Feng C, Araki M, Kunimoto R, Tamon A, Makiguchi H, Niijima S, Tsujimoto G, Okuno Y.
- Journal Title
  
  BMC Genomics 10
  
  Pages: 411-411
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[Journal Article] Prediction of drug-target interaction networks from the integration of chemical and genomic spaces2008
- Author(s)
  Yamanishi, Y., Araki, M., Gutteridge, A., Honda, W., and Kanehisa, M.
- Journal Title
  
  Bioinformatics 24
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[Journal Article] KEGG for linking genomes to life and the environment2008
- Author(s)
  Kanehisa, M., Araki, M., etal.
- Journal Title
  
  Nucleic Acids Research 36
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[Journal Article] Predictionof drug-target interaction networks from the integration of chemical and genomic spaces2008
- Author(s)
  Yamanishi, Y., Araki, M., Gutteridge, A., etal.
- Journal Title
  
  Bioin for matics(ISMB2008) 24
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[Patent] 合成経路作成装置、合成経路作成方法及び合成経路作成プログラムならびに3‐ヒドロキシプロピオン酸の製造方法2010
- Inventor(s)
  荒木通啓、宮奥康平、谷口岳志
- Industrial Property Rights Holder
  三菱化学株式会社
- Filing Date
  2010-12-17
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[Patent] 合成経路作成装置、合成経路作成プログラムならびに3-ヒドロキシプロピオン酸の製造方法2010
- Inventor(s)
  荒木通啓、宮奥康平、谷口岳志
- Industrial Property Rights Holder
  荒木通啓、宮奥康平、谷口岳志
- Industrial Property Number
  2010-281794
- Filing Date
  2010-12-17
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[Presentation] 代謝経路デザインの限界2017
- Author(s)
  荒木通啓
- Organizer
  第11回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  慶応義塾大学（神奈川県、藤沢市）
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] In Silico代謝設計ツールの開発とその展開2016
- Author(s)
  荒木通啓
- Organizer
  農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道・札幌市）
- Year and Date
  2016-03-30
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[Presentation] Expanding the Scope of Metabolic Pathway In Silico2016
- Author(s)
  Michihiro Araki
- Organizer
  The 7th International Symposium of Innovative BioProduction Kobe (iBioK)
- Place of Presentation
  神戸大学（兵庫県・神戸市）
- Year and Date
  2016-01-27
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[Presentation] バイオプロセスデザインプラットフォームの構築2016
- Author(s)
  牧口大旭、小川哲平、荒木通啓
- Organizer
  第39回日本分子生物学会
- Place of Presentation
  パシフィコ横浜（神奈川県、横浜市）
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] 大腸菌における1,4-ブタンジオール人工生合成経路の構築2016
- Author(s)
  江口晃一、工藤基徳、荒木通啓、石井純、山本浩明、近藤昭彦
- Organizer
  農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道・札幌市）
- Year and Date
  2016-03-30
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] 代謝デザインの展開2016
- Author(s)
  荒木通啓
- Organizer
  第1回デザイン生命工学研究会
- Place of Presentation
  東京工業大学（神奈川県・横浜市）
- Year and Date
  2016-03-08
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] Development of Design Platform for Metabolic Pathways2016
- Author(s)
  Ogawa, T., Makiguchi, H. and Araki, M
- Organizer
  生命医薬情報学連合大会2016年大会
- Place of Presentation
  東京国際交流館プラザ平成（東京都）
- Year and Date
  2016-09-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] 代謝デザインの展開2016
- Author(s)
  荒木通啓
- Organizer
  第1回デザイン生命工学研究会
- Place of Presentation
  東京工業大学（神奈川県・横浜市）
- Year and Date
  2016-03-08
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[Presentation] インシリコ代謝経路設計基盤の展開2016
- Author(s)
  荒木通啓、牧口大旭、小川哲平、近藤昭彦
- Organizer
  日本薬学会第136回年会
- Place of Presentation
  パシフィコ横浜（神奈川県・横浜市）
- Year and Date
  2016-03-28
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[Presentation] スマートセル開発に向けたIT/AI技術の展望2016
- Author(s)
  荒木通啓
- Organizer
  産業構造審議会商務流通情報分科会バイオ小委員会（第4回）
- Place of Presentation
  経済産業省（東京都）
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] 大腸菌における1,4-ブタンジオール人工生合成経路の構築2016
- Author(s)
  江口晃一、工藤基徳、荒木通啓、石井純、山本浩明、近藤昭彦
- Organizer
  農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道・札幌市）
- Year and Date
  2016-03-30
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[Presentation] In Silico代謝設計ツールの開発とその展開2016
- Author(s)
  荒木通啓
- Organizer
  農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道・札幌市）
- Year and Date
  2016-03-30
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] Expanding the Scope of Metabolic Pathway In Silico2016
- Author(s)
  Michihiro Araki
- Organizer
  The 7th International Symposium of Innovative BioProduction Kobe (iBioK)
- Place of Presentation
  神戸大学（兵庫県・神戸市）
- Year and Date
  2016-01-27
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] インシリコ代謝経路設計基盤の展開2016
- Author(s)
  荒木通啓、牧口大旭、小川哲平、近藤昭彦
- Organizer
  日本薬学会第136回年会
- Place of Presentation
  パシフィコ横浜（神奈川県・横浜市）
- Year and Date
  2016-03-28
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] New approach for Metabolomics pathway analysis2015
- Author(s)
  Oshida, T., Ogawa, T., Yokoi, Y., Fukamachi, Y., Araki, M., Makiguchi, H.
- Organizer
  ASMS2015
- Place of Presentation
  America's Center【St. Louis（USA）】
- Year and Date
  2015-05-31
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] New approach for Metabolomics pathway analysis2015
- Author(s)
  Oshida, T., Ogawa, T., Yokoi, Y., Fukamachi, Y., Araki, M., Makiguchi, H.
- Organizer
  ASMS2015
- Place of Presentation
  America's Center【St. Louis（USA）】
- Year and Date
  2015-05-31
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[Presentation] M-Path＆PathPod：バイオプロセスデザインプラットフォームと統合型パスウェイデータベースシステム2015
- Author(s)
  牧口大旭、小川哲平、近藤昭彦、荒木通啓
- Organizer
  第38回分子生物学会
- Place of Presentation
  神戸国際会議場（兵庫県・神戸市）
- Year and Date
  2015-12-02
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] Development of M-path platform for Navigating Potential Metabolic Pathways2015
- Author(s)
  Ogawa, T., Makiguchi, H., Cox III, RS., Nakatsui M., Kondo, A., and Araki, M.
- Organizer
  ISMB 2015
- Place of Presentation
  the Convention Centre Dublin【Dublin（Ireland）】
- Year and Date
  2015-07-10
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[Presentation] M-Path＆PathPod：バイオプロセスデザインプラットフォームと統合型パスウェイデータベースシステム2015
- Author(s)
  牧口大旭、小川哲平、近藤昭彦、荒木通啓
- Organizer
  第38回分子生物学会
- Place of Presentation
  神戸国際会議場（兵庫県・神戸市）
- Year and Date
  2015-12-02
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[Presentation] M-path Database: Navigating Potential Metabolic Pathways2015
- Author(s)
  小川哲平、牧口大旭、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦、荒木通啓
- Organizer
  M-path Database: Navigating Potential Metabolic Pathways
- Place of Presentation
  京都大学（京都府・宇治市）
- Year and Date
  2015-10-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] M-path Database: Navigating Potential Metabolic Pathways2015
- Author(s)
  小川哲平、牧口大旭、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦、荒木通啓
- Organizer
  生命医薬情報学連合大会2015年大会
- Place of Presentation
  京都大学（京都府・宇治市）
- Year and Date
  2015-10-29
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[Presentation] Development of M-path platform for Navigating Potential Metabolic Pathways2015
- Author(s)
  Ogawa, T., Makiguchi, H., Cox III, RS., Nakatsui M., Kondo, A., and Araki, M.
- Organizer
  ISMB 2015
- Place of Presentation
  the Convention Centre Dublin【Dublin（Ireland）】
- Year and Date
  2015-07-10
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] 代謝設計基盤（M-path）によるバイオ合成スコープの拡張2014
- Author(s)
  荒木通啓
- Organizer
  合成生物工学シンポジウム
- Place of Presentation
  神戸大学、神戸
- Year and Date
  2014-11-25
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] Computational platform for designing synthetic metabolic pathways2014
- Author(s)
  Michihiro Araki
- Organizer
  7th International Congress on Biocatalysis
- Place of Presentation
  Hamburg University of Technology, Hamburg, Germany
- Year and Date
  2014-09-03
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[Presentation] M-path: 拡張代謝パスウェイデータベースの構築2014
- Author(s)
  牧口大旭、小川哲平、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦、谷口岳志、宮奥康平、荒木通啓
- Organizer
  第37回分子生物学会
- Place of Presentation
  パシフィコ横浜, 横浜
- Year and Date
  2014-11-26
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[Presentation] 代謝設計基盤（M-path）によるバイオ合成スコープの拡張2014
- Author(s)
  荒木通啓
- Organizer
  合成生物工学シンポジウム
- Place of Presentation
  神戸大学, 神戸
- Year and Date
  2014-11-25
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[Presentation] M-path: 拡張代謝パスウェイデータベースの構築2014
- Author(s)
  牧口大旭、小川哲平、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦、谷口岳志、宮奥康平、荒木通啓
- Organizer
  第37回分子生物学会
- Place of Presentation
  パシフィコ横浜、横浜
- Year and Date
  2014-11-26
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] Computational platform for designing synthetic metabolic pathways2014
- Author(s)
  Michihiro Araki
- Organizer
  7th International Congress on Biocatalysis
- Place of Presentation
  Hamburg University of Technology, Hamburg, Germany
- Year and Date
  2014-09-03
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] 生合成パスウェイの設計基盤構築2013
- Author(s)
  荒木通啓
- Organizer
  日本薬学会第133回年会
- Place of Presentation
  パシフィコ横浜（神奈川県）
- Year and Date
  2013-03-30
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[Presentation] A Computational Platform for Designing Natural Products2012
- Author(s)
  Michihiro Araki
- Organizer
  INCOB2012
- Place of Presentation
  バンコク（タイ）
- Year and Date
  2012-10-03
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[Presentation] 多様な代謝パスウェイの In silico デザイン2012
- Author(s)
  荒木通啓
- Organizer
  第２回代謝工学研究部会
- Place of Presentation
  大阪大学（大阪府）
- Year and Date
  2012-11-29
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[Presentation] 代謝設計基盤のポテンシャル2012
- Author(s)
  荒木通啓
- Organizer
  「細胞を創る」研究会5.0
- Place of Presentation
  東京工業大学（神奈川県）
- Year and Date
  2012-11-22
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[Presentation] 生合成パスウェイ設計のための情報解析技術の開発2012
- Author(s)
  荒木通啓
- Organizer
  第64回日本生物工学会
- Place of Presentation
  神戸国際会議場（兵庫県）
- Year and Date
  2012-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[Presentation] 合成生物事始め2011
- Author(s)
  荒木通啓
- Place of Presentation
  三菱化学科学技術センター横浜
- Year and Date
  2011-03-05
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[Presentation] 医薬品-臨床知識統合データベースの構築2010
- Author(s)
  馮春来、荒木通啓、他
- Organizer
  日本薬学会第130年会
- Place of Presentation
  岡山
- Year and Date
  2010-03-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[Presentation] retrobiosynthesisに向けた天然化合物のアーキテクチャ解析2010
- Author(s)
  荒木通啓
- Organizer
  第3回医薬品研究会
- Place of Presentation
  東京大学医科学研究所
- Year and Date
  2010-08-02
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[Presentation] 医薬品-疾病作用情報データベース2009
- Author(s)
  荒木通啓、馮春来, 多門啓子, 薮内弘昭, 奥野恭史
- Organizer
  日本薬学会129年会
- Place of Presentation
  京都
- Year and Date
  2009-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[Presentation] 医薬品-疾病作用情報データベース2009
- Author(s)
  荒木通啓、馮春来、他
- Organizer
  日本薬学会第129年会
- Place of Presentation
  京都
- Year and Date
  2009-03-26
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[Presentation] 統合型薬学情報ナビゲーションシステムの開発2009
- Author(s)
  多門啓子、牧口大旭、荒木通啓、他
- Organizer
  日本薬学会第129年会
- Place of Presentation
  京都
- Year and Date
  2009-03-26
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[Presentation] ケミカルゲノミクス情報を用いた標的タンパク質の予測法の開発2009
- Author(s)
  藤田淳人、藪内弘昭、小川哲平、荒木通啓、他
- Organizer
  日本薬学会第129年会
- Place of Presentation
  京都
- Year and Date
  2009-03-26
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[Presentation] 代謝パスウェイデータベースからの知識抽出
- Author(s)
  荒木通啓
- Organizer
  第65回生物工学会大会　シンポジウム
- Place of Presentation
  広島国際会議場
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[Presentation] インフォマティクスを糸口とした合成生物工学の展開
- Author(s)
  荒木通啓
- Organizer
  生物工学会東日本支部　生物工学フォーラム
- Place of Presentation
  東京農工大学
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[Presentation] 代謝パスウェイ情報の抽象化と具体化
- Author(s)
  荒木通啓
- Organizer
  酵素工学研究会　第70回講演会
- Place of Presentation
  東京大学山上会館
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[Presentation] Bioprocess design platform : Development of the bioprocess database of amino acids
- Author(s)
  牧口大旭、小川哲平、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦、荒木通啓
- Organizer
  第36回分子生物学会
- Place of Presentation
  神戸国際会議場
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[Presentation] A Knowledge-Based Approach for Metabolic Pathway Design
- Author(s)
  Michihiro Araki
- Organizer
  Enzyme Engineering XXII
- Place of Presentation
  富山国際会議場
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[Presentation] M-path: Construction of a Database for Expanded Metabolic Pathways
- Author(s)
  Ogawa, T., Makiguchi, H., Cox III, RS., Nakatsui M., Kondo, A., Taniguchi, T., Miyaoku, K. and Araki, M.
- Organizer
  Active Enzyme Molecule 2014
- Place of Presentation
  Toyama International Conference Center, Toyama
- Year and Date
  2014-12-17 – 2014-12-19
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] Meta-synthetic metabolism: in silico design of novel amino acids from all-organism data
- Author(s)
  Cox III, RS., Nakatsui M., Makiguchi, H., Ogawa, T., Kondo, A., Araki, M.
- Organizer
  GIW ISCB-ASIA 2014
- Place of Presentation
  CBRC, Tokyo
- Year and Date
  2014-12-15 – 2014-12-17
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[Presentation] M-path: Construction of a Database for Expanded Metabolic Pathways
- Author(s)
  Ogawa, T., Makiguchi, H., Cox III, RS., Nakatsui M., Kondo, A., Taniguchi, T., Miyaoku, K. and Araki, M.
- Organizer
  Active Enzyme Molecule 2014
- Place of Presentation
  Toyama International Conference Center, Toyama
- Year and Date
  2014-12-17 – 2014-12-19
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[Presentation] Meta-synthetic metabolism: Identification of critical intermediates for synthetic amino acid derivative production
- Author(s)
  Cox III, RS., Nakatsui M., Makiguchi, H., Ogawa, T., Kondo, A., Araki, M.
- Organizer
  CBI学会 2013年大会
- Place of Presentation
  船堀タワーホール
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[Presentation] Mpath: Computationally-Aided Design of Synthetic Metabolic Pathways
- Author(s)
  Cox III, RS., Nakatsui M., Makiguchi, H., Ogawa, T., Kondo, A., Araki, M.
- Organizer
  SEED2014
- Place of Presentation
  Manhattan Beach, LA, USA
- Year and Date
  2014-07-14 – 2014-07-17
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] バイオプロセス合成経路データベース"M-path"の構築
- Author(s)
  小川哲平、牧口大旭、谷口岳志、宮奥康平、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦、荒木通啓
- Organizer
  第３回生命医薬情報学連合大会
- Place of Presentation
  仙台国際センター、仙台
- Year and Date
  2014-10-02 – 2014-10-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] Mpath: Computationally-Aided Design of Synthetic Metabolic Pathways
- Author(s)
  Cox III, RS., Nakatsui M., Makiguchi, H., Ogawa, T., Kondo, A., Araki, M.
- Organizer
  SEED2014
- Place of Presentation
  Manhattan Beach, LA, USA
- Year and Date
  2014-07-14 – 2014-07-17
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[Presentation] バイオプロセス合成経路データベース"M-path"の構築
- Author(s)
  小川哲平、牧口大旭、谷口岳志、宮奥康平、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦、荒木通啓
- Organizer
  第３回生命医薬情報学連合大会
- Place of Presentation
  仙台国際センター, 仙台
- Year and Date
  2014-10-02 – 2014-10-04
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[Presentation] Meta-synthetic metabolism: in silico design of novel amino acids from all-organism data
- Author(s)
  Cox III, RS., Nakatsui M., Makiguchi, H., Ogawa, T., Kondo, A., Araki, M.
- Organizer
  GIW ISCB-ASIA 2014
- Place of Presentation
  CBRC, Tokyo
- Year and Date
  2014-12-15 – 2014-12-17
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[Presentation] Construction of a computational platform for metabolic pathway design
- Author(s)
  Araki, M
- Organizer
  CBI学会 2013年大会
- Place of Presentation
  船堀タワーホール
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508

1. 野田修平 (30710131)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
2. 白井智量 (00639586)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
3. 西田敬二

# of Collaborated Projects: 0 results

# of Collaborated Products: 1 results

Araki Michihiro 荒木 通啓

araki michihiro 荒木 通啓

ARAKI Michihiro 荒木 通啓

Research Projects

Research Products

Co-Researchers

代謝ブラックボックスの可視化から紐解く遺伝子導入パターン最適化手法の確立

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

人工代謝経路のスコープの拡張Principal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Informatics analysis on selectivity and diversity of enzymatic reactionPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

人工代謝経路の設計基盤の構築Principal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Reconstruction of Metabolic Network for Extracting Design Principles of Natural ProductsPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

[Book] 合成生物工学によるモノづくり微生物のデザインに向けて2015

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[Book] 合成生物工学によるモノづくり微生物のデザインに向けて2015

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[Book] データベースからの再発見2014

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Data Source

[Book] データベースからの再発見2014

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[Journal Article] A Systematic Approach to Time-series Metabolite Profiling and RNA-seq Analysis of Chinese Hamster Ovary Cell Culture2017

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NAID

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[Journal Article] Application of LC-MS/MS analysis for time-lapse amino acid metabolomics analysis in CHO cell culture2017

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[Journal Article] Targeted nucleotide editing using hybrid prokaryotic and vertebrate adaptive immune systems2016

Author(s)

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Data Source

[Journal Article] Evaluation of genes involved in oxidative phosphorylation in yeast by developing a simple and rapid method to measure mitochondrial ATP synthetic activity.2015

Author(s)

Journal Title

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Data Source

[Journal Article] M-path: A Compass for Navigating Potential Metabolic Pathways2015

Author(s)

Journal Title

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Araki Michihiro 荒木通啓

araki michihiro 荒木通啓

ARAKI Michihiro 荒木通啓