ONO Naoaki 小野直亮

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小野直亮オノナオアキ

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Researcher Number	60395118
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Affiliation (Current)	2025: 奈良先端科学技術大学院大学, データ駆動型サイエンス創造センター, 准教授
Affiliation (based on the past Project Information) *help	2021 – 2025: 奈良先端科学技術大学院大学, データ駆動型サイエンス創造センター, 准教授 2017 – 2018: 奈良先端科学技術大学院大学, データ駆動型サイエンス創造センター, 准教授 2015 – 2016: 奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 助教 2011: 大阪大学, 大学院・情報科学研究科, 特任准 2009 – 2011: Osaka University, 大学院・情報科学研究科, 特任准教授
Review Section/Research Field	Principal Investigator Science and Engineering / Basic Section 90130:Medical systems-related / Medium-sized Section 62:Applied informatics and related fields / Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related / Bioinformatics/Life informatics Except Principal Investigator Basic Section 40020:Wood science-related / Biofunction/Bioprocess
Keywords	Principal Investigator 診断支援 / 深層学習 / 医用画像解析 / 膵がん / 免疫染色 / 病理組織画像 / 遺伝子発現解析 / 長期コホート解析 / 腎臓Perfusionモデル / PET画像 … More / 診断支援モデル / 代謝疾患 / 冠動脈疾患 / 深層学習モデル / PETイメージング / 多種染色法 / 教師なしクラスタリング / 病理組織画像解析 / バイオインフォマティクス / すい癌 / 組織画像検査 / 生体生命情報学 / Deep Neural Network / 変異解析 / 実験室進化 / DNAマイクロアレイ / 数理生物学 / モデル化 / 発現制御 / 遺伝子 / マイクロアレイ … More Except Principal Investigator 統合ゲノム科学 / 代謝物解析 / 発現遺伝子解析 / 統合ゲノム解析 / ポドフィロトキシン / リグナン / 比増殖速度 / 発現プロファイル / バイオプロダクション / 進化工学 / ストレス耐性 / 変異解析 / DNAマイクロアレイ / ゲノム Less

Recurrent 3D-UNetを用いたPET時系列からの灌流機能画像の生成Principal Investigator
- Principal Investigator
  
  小野直亮
- Project Period (FY)
  2025 – 2029
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Review Section
  
  Basic Section 90130:Medical systems-related
- Research Institution
  Nara Institute of Science and Technology
Elucidation of the mechanism for antitumor lignan biosynthesis based on integrated genome analysis
- Principal Investigator
  
  梅澤俊明
- Project Period (FY)
  2022 – 2024
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- Review Section
  
  Basic Section 40020:Wood science-related
- Research Institution
  Kyoto University
Optimization of feature extraction of histopathological images using deep learningPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  ONO Naoaki
- Project Period (FY)
  2021 – 2023
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Review Section
  
  Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related
- Research Institution
  Nara Institute of Science and Technology
Development of statistical model for analysis of dynamic of metabolic diseases using PETPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  小野直亮
- Project Period (FY)
  2021 – 2026
- Research Category
  
  Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
- Review Section
  
  Medium-sized Section 62:Applied informatics and related fields
- Research Institution
  Nara Institute of Science and Technology
深層学習を用いたすい癌の病理組織画像からの細胞タイプ識別モデルの構築Principal Investigator
- Principal Investigator
  
  小野直亮
- Project Period (FY)
  2017 – 2018
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
- Review Section
  
  Science and Engineering
- Research Institution
  Nara Institute of Science and Technology
遺伝子発現情報のクラスタリングにもとづいた肺がん組織病理画像の特徴抽出Principal Investigator
- Principal Investigator
  
  小野直亮
- Project Period (FY)
  2015 – 2016
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
- Review Section
  
  Science and Engineering
- Research Institution
  Nara Institute of Science and Technology
Creation of stress tolerant strain based on single nucleotide mutational analysis of in whole genome
- Principal Investigator
  
  SHIMIZU Hiroshi
- Project Period (FY)
  2009 – 2011
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- Research Field
  
  Biofunction/Bioprocess
- Research Institution
  Osaka University
Evolutionary simulation of gene regulatory networks based on comprehensive transcriptome and mutation analysis.Principal Investigator
- Principal Investigator
  
  ONO Naoaki
- Project Period (FY)
  2009 – 2010
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- Research Field
  
  Bioinformatics/Life informatics
- Research Institution
  Osaka University

All 2024 2023 2022 2018 2017 2016 2011 2010 2009

All Journal Article Presentation

[Journal Article] Quantitative evaluation model of variable diagnosis for chest X-ray images using deep learning2024
- Author(s)
  Nakagawa Shota、Ono Naoaki、Hakamata Yukichika、Ishii Takashi、Saito Akira、Yanagimoto Shintaro、Kanaya Shigehiko
- Journal Title
  
  PLOS Digital Health
  
  Volume: 3 Issue: 3 Pages: e0000460-e0000460
- DOI
  10.1371/journal.pdig.0000460
- Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21KK0183, KAKENHI-PROJECT-22K08277, KAKENHI-PROJECT-21K12111
[Journal Article] Two O-methyltransferases from Phylogenetically Unrelated Cow Parsley (Anthriscus sylvestris) and Hinoki-asunaro (Thujopsis dolabrata var. hondae) as a Signature of Lineage-specific Evolution in Lignan Biosynthesis2023
- Author(s)
  Masaomi Yamamura, Masato Kumatani, Akira Shiraishi, Yu Matsuura, Keisuke Kobayashi, Ayano Suzuki, Atsushi Kawamura, Honoo Satake, Safendrri Komara Ragamustari, Shiro Suzuki, Hideyuki Suzuki, Daisuke Shibata, Shingo Kawai, Eiichiro Ono, Toshiaki Umezawa
- Journal Title
  
  Plant and Cell Physiology
  
  Volume: 64 Issue: 1 Pages: 124-147
- DOI
  10.1093/pcp/pcac164
- Peer Reviewed / Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23671, KAKENHI-PROJECT-23K23921
[Journal Article] <i>Anthriscus sylvestris</i> Deoxypodophyllotoxin Synthase Involved in?the Podophyllotoxin Biosynthesis2023
- Author(s)
  Kobayashi Keisuke、Yamamura Masaomi、Mikami Bunzo、Shiraishi Akira、Kumatani Masato、Satake Honoo、Ono Eiichiro、Umezawa Toshiaki
- Journal Title
  
  Plant And Cell Physiology
  
  Volume: 64 Issue: 12 Pages: 1436-1448
- DOI
  10.1093/pcp/pcad103
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23671, KAKENHI-PROJECT-23K23921
[Journal Article] Information maximization-based clustering of histopathology images using deep learning2023
- Author(s)
  MI Rumman, N Ono, K Ohuchida, MD Altaf-Ul-Amin, M Huang, S Kanaya
- Journal Title
  
  PLOS Digital Health
  
  Volume: 2 Issue: 12 Pages: e0000391-e0000391
- DOI
  10.1371/journal.pdig.0000391
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K05739, KAKENHI-PROJECT-21K12111
[Journal Article] Classification of ischemia from myocardial polar maps in 15O?H2O cardiac perfusion imaging using a convolutional neural network2022
- Author(s)
  Teuho Jarmo、Schultz Jussi、Kl?n Riku、Knuuti Juhani、Saraste Antti、Ono Naoaki、Kanaya Shigehiko
- Journal Title
  
  Scientific Reports
  
  Volume: 12 Issue: 1 Pages: 2839-2839
- DOI
  10.1038/s41598-022-06604-x
- Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21KK0183, KAKENHI-PROJECT-22KF0261
[Journal Article] Classification of lung adenocarcinoma transcriptome subtypes from pathological images using deep convolutional networks2018
- Author(s)
  3.Antonio, V. A. A., Ono, N., Saito, A., Sato, T., Altaf-Ul-Amin, M., & Kanaya, S.
- Journal Title
  
  International journal of computer assisted radiology and surgery
  
  Volume: 13(12) Issue: 12 Pages: 1905-1913
- DOI
  10.1007/s11548-018-1835-2
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17K00406, KAKENHI-PROJECT-18K08170, KAKENHI-PUBLICLY-17H05297
[Journal Article] Transcriptome analysis of parallel-evolved Escherichia coli strains under ethanol stress2011
- Author(s)
  Takaaki Horinouchi, Kuniyasu Tamaoka, Chikara Furusawa, Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Takashi Hirasawa, Tetsuya Yomo, Hiroshi Shimizu
- Journal Title
  
  BMC Genomics
  
  Volume: 11 Pages: 579-579
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Journal Article] Transition from positive to neutral in mutation fixation along with continuing rising fitness in thermal adaptive evolution.2010
- Author(s)
  Toshihiko Kishimoto, Leo Iijima, Makoto Tatsumi, Naoaki Ono, Ayana Oyake, Tomomi Hashimoto, Moe Matsuo, Masato Okubo, Shingo Suzuki, Kotaro Mori, Akiko Kashiwagi, Chikara Furusawa, Bei-Wen Ying, Tetsuya Yomo
- Journal Title
  
  PLoS Genet Vol.6, No.10
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Journal Article] Transcriptome analysis of parallel-evolved Escherichia coli strains under ethanol stress.2010
- Author(s)
  Takaaki Horinouchi, Kuniyasu Tamaoka, Chikara Furusawa, Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Takashi Hirasawa, Tetsuya Yomo, Hiroshi Shimizu.
- Journal Title
  
  BMC Genomics Vol.11
  
  Pages: 579-579
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Journal Article] Transcriptome analysis of parallel-evolved Escherichia coli strains under ethanol stress2010
- Author(s)
  Takaaki Horinouchi, Kuniyasu Tamaoka, Chikara Furusawa, Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Takashi Hirasawa, Tetsuya Yomo, Hiroshi Shimizu.
- Journal Title
  
  BMC Genomics
  
  Volume: 11 Issue: 1 Pages: 579-579
- DOI
  10.1186/1471-2164-11-579
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Journal Article] A model-based analysis method for detection of single-base substitution using resequencing microarrays2009
- Author(s)
  Naoaki Ono
- Journal Title
  
  Proc.of Asia Pacific Biochemical Engineering Conference 2009(APBioChEC'09)
- NAID
  210000003657
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Journal Article] Development of a thermodynamic model to predict hybridization on high-density oligonucleotide microarray.2009
- Author(s)
  Ono, N., Suzuki, S., Furusawa, C., Shimizu, H., Yomo, T.
- Journal Title
  
  Proc. of the International Symposium on Complex Systems Biology
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Journal Article] Genome-wide mutational and expression analysis of evolved Escherichia coli strains under ethanol stress.2009
- Author(s)
  Horinouchi, T., Tamaoka, K., Furusawa, C., Hirasawa, T., Ono, N., Suzuki, S., Yomo, T., Shimizu, H.
- Journal Title
  
  Proc. of the 20th International Conference on Genome Informatics (GIW 2009)
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Journal Article] Model-based analysis of non-specific binding for background correction of high-density oligonucleotide microarrays.2009
- Author(s)
  Chikara Furusawa, Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Tomoharu Agata, Hiroshi Shimizu, Tetsuya Yomo
- Journal Title
  
  Bioinfromatics Vol.25, No.1
  
  Pages: 36-41
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Journal Article] Genome-wide mutational and expression analysis of ethanol-tolerant Escherichia coli.2009
- Author(s)
  Horinouchi, T., Tamaoka, K., Furusawa, C., Hirasawa, T., Ono, N., Suzuki, S., Yomo, T., Shimizu, H.
- Journal Title
  
  Proc. of the International Symposium on Complex Systems Biology
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Journal Article] A model-based analysis method for detection of single-base substitution using resequencing microarrays.2009
- Author(s)
  Ono, N., Suzuki, S., Furusawa, C., Shimizu, H., Yomo, T.
- Journal Title
  
  Proc. of Asia Pacific Biochemical Engineering Conference 2009 (APBioChEC' 09)
- NAID
  210000003657
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Journal Article] Development of a thermodynamic model to predict hybridization on high-density oligonucleotide microarray2009
- Author(s)
  Naoaki Ono
- Journal Title
  
  Proc.of the International Symposium on Complex Systems Biology
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] Feature Extraction and Unsupervised Clustering of Histopathological Images of Pancreatic Cancer Using Information Maximization2022
- Author(s)
  Rumman Mahfujul Islam、Ono Naoaki、Ohuchida Kenoki、Altaf-Ul-Amin Md.、Huang Ming、Kanaya Shigehiko
- Organizer
  2022 IEEE 11th Global Conference on Consumer Electronics (GCCE)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12111
[Presentation] Straightforward Clustering for Morphological-Level Pancreatic Carcinoma Identification2022
- Author(s)
  Guangxian Zhu, Zheng Chen, Kenoki Ohuchida, Ming Huang, Naoaki Ono, MD. Amin, and Shigehiko Kanaya
- Organizer
  Engineering in Medicine and Biology Conference
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12111
[Presentation] 深層学習を用いたすい癌の病理組織画像からの細胞タイプ識別モデルの構築2018
- Author(s)
  小野直亮
- Organizer
  「多元計算解剖学」第４回国際シンポジウムについて
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05297
[Presentation] Feature extraction and Cluster analysis of Pancreatic Pathological Image Based on Unsupervised Convolutional Neural Network2018
- Author(s)
  Konosuke Asano, Naoaki Ono, Chika Iwamoto, Kenoki Ohuchida, Koji Shindo, Shigehiko Kanaya
- Organizer
  BIBM 2018 : 2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05297
[Presentation] Implementation of Stacked Convolutional Neural Networks for the Classification of Lung Adenocarcinoma Transcriptome Subtypes2017
- Author(s)
  Naoaki Ono
- Organizer
  The International Forum on Medical Imaging in Asia (IFMIA) 2017
- Place of Presentation
  Tenbusu Naha, Naha, Okinawa
- Year and Date
  2017-01-19
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-15H01123
[Presentation] Feature Extraction of Lung Cancer Pathological Images Using Convolutional Autoencoder2017
- Author(s)
  Naoaki Ono
- Organizer
  The 3rd International Symposium on Multi-disciplinary Computational Anatomy
- Place of Presentation
  Nara Prefectural Cultural Center, Nara
- Year and Date
  2017-03-08
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-15H01123
[Presentation] 畳み込みニューラルネットワークを用いた肺がん病理画像の高効率自己符号化の実装2016
- Author(s)
  小野直亮
- Organizer
  医用画像工学会
- Place of Presentation
  千葉大学、千葉
- Year and Date
  2016-07-21
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-15H01123
[Presentation] 人工進化工学と網羅的遺伝子発現情報解析によるストレス耐性細胞の創製2011
- Author(s)
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
- Organizer
  化学工学会第76年会
- Place of Presentation
  東京農工大学
- Year and Date
  2011-03-23
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] 人工進化工学と網羅的遺伝子発現情報解析によるストレス耐性細胞の創製2011
- Author(s)
  堀之内貴明、玉岡邦康、古澤力、小野直亮、鈴木真吾、平沢敬、四方哲也、清水浩
- Organizer
  化学工学会第76年会
- Place of Presentation
  東京農工大学
- Year and Date
  2011-03-22
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] Genome-Wide Mutational and Expression Analyses of Evolved Escherichia Coli Strains under Ethanol Stress2011
- Author(s)
  Naoaki Ono, Chikara Furusawa, Takaaki Horinouchi, Kuniyasu Tamaoka, Shingo Suzuki, Takashi Hirasawa, Tetsuya Yomo Hiroshi Shimizu
- Organizer
  Asian Congress on Biotechnology(ACB-2011)
- Place of Presentation
  Shanghai, China
- Year and Date
  2011-05-13
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] illuminaを用いた大腸菌全ゲノムリシーケンシング2011
- Author(s)
  小野直亮, Roche, SOLiD
- Organizer
  NGS(次世代シークエンサ)現場の会第1回研究会
- Place of Presentation
  熱海ニューフジヤホテル,静岡県
- Year and Date
  2011-05-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] Genome-Wide Mutational and Expression Analyses of Evolved Escherichia Coli Strains under Ethanol Stress2011
- Author(s)
  Naoaki Ono
- Organizer
  Asian Congress on Biotechnology (ACB-2011)
- Place of Presentation
  Shanghai Everbright Convention & Exhibition Centre (SECEC), Shanghai (China)
- Year and Date
  2011-05-13
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] エタノールストレス環境下の進化実験により得られた大腸菌のゲノムワイドな変異解析と遺伝子発現解2011
- Author(s)
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
- Organizer
  化学工学会第43回秋季大会
- Place of Presentation
  名古屋工業大学
- Year and Date
  2011-09-05
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] 大腸菌エタノール耐性進化株の次世代シーケンサを用いた全ゲノム解析2011
- Author(s)
  小野直亮, 堀之内貴明, 玉岡邦康, 鈴木真吾, 平沢敬, 古澤力, 四方哲也, 清水浩
- Organizer
  第64回日本生物工学会大会
- Place of Presentation
  東京農工大学
- Year and Date
  2011-09-28
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] 大腸菌エタノール耐性進化株の次世代シーケンサを用いた全ゲノム解析2011
- Author(s)
  小野直亮
- Organizer
  第64回日本生物工学会大会
- Place of Presentation
  東京農工大学(東京都)
- Year and Date
  2011-09-28
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] Roche, SOLiD, illuminaを用いた大腸菌全ゲノムリシーケンシング2011
- Author(s)
  小野直亮
- Organizer
  NGS(次世代シークエンサ)現場の会第1回研究会
- Place of Presentation
  熱海ニューフジヤホテル(静岡県)
- Year and Date
  2011-05-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] Whole genome resequencing of experimentally evolved Escherichia coli using a next generation sequencer2011
- Author(s)
  小野直亮
- Organizer
  日本生物物理学会第49回年会
- Place of Presentation
  兵庫県立大学(兵庫県)
- Year and Date
  2011-09-16
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] Whole genome resequencing of experimentally evolved Escherichia coli using a next generation sequencer2011
- Author(s)
  小野直亮, 堀之内貴明, 玉岡邦康, 鈴木真吾, 平沢敬, 古澤力, 四方哲也, 清水浩
- Organizer
  日本生物物理学会第49回年会
- Place of Presentation
  兵庫県立大学
- Year and Date
  2011-09-16
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] エタノール環境下での長期植え継ぎ培養によって得られた耐性大腸菌株の遺伝子発現・ゲノム変異解析2010
- Author(s)
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
- Organizer
  第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010)
- Place of Presentation
  神戸ポートピアアイランド,兵庫県
- Year and Date
  2010-12-10
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] エタノール環境下での長期植え継ぎ培養によって得られた耐性大腸菌株の遺伝子発現・ゲノム変異解析2010
- Author(s)
  堀之内貴明、玉岡邦康、古澤力、小野直亮、鈴木真吾、平沢敬、四方哲也、清水浩
- Organizer
  第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010)
- Place of Presentation
  神戸ポートアイランド
- Year and Date
  2010-12-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] 人工進化工学と網羅的遺伝子発現情報解析によるストレス耐性細胞の創製2010
- Author(s)
  堀之内貴明、玉岡邦康、古澤力、小野直亮、鈴木真吾、平沢敬、四方哲也、清水浩
- Organizer
  化学工学会第76年会
- Place of Presentation
  東京農工大学
- Year and Date
  2010-03-22
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] 大腸菌エタノールストレス人工進化株の網羅的解析によるエタノール耐性付与2010
- Author(s)
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
- Organizer
  定量生物学の会第三回年会
- Place of Presentation
  東京大学生産技術研究所
- Year and Date
  2010-11-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] 大腸菌エタノールストレス人工進化株の全ゲノム変異解析・遺伝子発現解析2010
- Author(s)
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
- Organizer
  定量生物学の会第二回年会
- Year and Date
  2010-01-10
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] 次世代シーケンサを用いた大腸菌DH1株の全ゲノム解析2010
- Author(s)
  小野直亮
- Organizer
  第62回日本生物工学会大会
- Place of Presentation
  宮崎シーガイアワールドコンベンションセンターサミット、宮崎県
- Year and Date
  2010-10-28
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] 人工進化実験における発現制御ダイナミクスの進化的シミュレーション2010
- Author(s)
  堀之内貴明, 古澤力, 清水浩, 四方哲也, 小野直亮
- Organizer
  定量生物学の会第三回年会
- Place of Presentation
  東京大学生産技術研究所
- Year and Date
  2010-11-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] 人工進化実験によって得られたエタノール耐性大腸菌株の網羅的遺伝子発現解析とゲノム異変解析2010
- Author(s)
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
- Organizer
  宮崎シーガイアワールドコンベンションセンターサミット
- Year and Date
  2010-10-28
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] 次世代シーケンサを用いた大腸菌DH1株の全ゲノム解析2010
- Author(s)
  小野直亮, 鈴木真吾, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
- Organizer
  第62回日本生物工学会大会
- Place of Presentation
  宮崎シーガイアワールドコンベンションセンターサミット
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] 人工進化実験における発現制御ダイナミクスの進化的シミュレーション2010
- Author(s)
  小野直亮, 堀之内貴明, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
- Organizer
  定量生物学の会第三回年会
- Place of Presentation
  東京大学生産技術研究所
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] エタノール環境下での長期植え継ぎ培養によって得られた耐性大腸菌株の遺伝子発現・ゲノム変異解析2010
- Author(s)
  堀之内貴明、玉岡邦康、古澤力、小野直亮、鈴木真吾、平沢敬、四方哲也、清水浩
- Organizer
  第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010)
- Place of Presentation
  神戸ポートアイランド
- Year and Date
  2010-12-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] 複数時間スケールを持つ環境適応ダイナミクス:エタノールストレス環境下での大腸菌人工進化実験における網羅的表現型/遺伝子型解析2010
- Author(s)
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
- Organizer
  第48回生物物理学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] 高密度オリゴヌクレオチドアレイにおけるハイブリダイゼーションの熱力学モデルを用いた発現解析および変異解析アルゴリズムの開発2010
- Author(s)
  小野直亮
- Organizer
  定量生物学の会第二回年会
- Place of Presentation
  大阪大学
- Year and Date
  2010-01-10
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] 大腸菌エタノールストレス人工進化株の網羅的解析によるエタノール耐性付与2010
- Author(s)
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
- Organizer
  定量生物学の会第三回年会
- Place of Presentation
  東京大学生産技術研究所
- Year and Date
  2010-11-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] 人工進化実験における発現制御ダイナミクスの進化的シミュレーション2010
- Author(s)
  小野直亮, 堀之内貴明, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
- Organizer
  定量生物学の会第三回年会
- Place of Presentation
  東京大学生産技術研究所
- Year and Date
  2010-11-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] 大腸菌エタノールストレス人工進化株の全ゲノム変異解析・遺伝子発現解析2010
- Author(s)
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
- Organizer
  定量生物学の会第二回年会
- Place of Presentation
  大阪大学
- Year and Date
  2010-01-09
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] 次世代シーケンサを用いた大腸菌DH1株の全ゲノム解析2010
- Author(s)
  小野直亮, 鈴木真吾, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
- Organizer
  第62回日本生物工学会大会
- Place of Presentation
  宮崎シーガイアワールドコンベンションセンターサミット
- Year and Date
  2010-10-28
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] 人工進化実験によって得られたエタノール耐性大腸菌株の網羅的遺伝子発現解析とゲノム異変解析2010
- Author(s)
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
- Organizer
  第62回日本生物工学会大会
- Place of Presentation
  宮崎シーガイアワールドコンベンションセンターサミット
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] 人工進化実験における発現制御ダイナミクスの進化的シミュレーション2010
- Author(s)
  小野直亮
- Organizer
  定量生物学の会第三回年会
- Place of Presentation
  東京大学生産技術研究所、東京都
- Year and Date
  2010-11-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] 高密度オリゴヌクレオチドアレイにおけるハイブリダイゼーションの熱力学モデルを用いた発現解析および変異解析アルゴリズムの開発2010
- Author(s)
  小野直亮, 鈴木真吾, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
- Organizer
  定量生物学の会第二回年会
- Year and Date
  2010-01-10
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] 大腸菌エタノールストレス人工進化株の網羅的解析によるエタノール耐性付与2010
- Author(s)
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 平沢敬,小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
- Organizer
  定量生物学の会第三回年会
- Place of Presentation
  東京大学生産技術研究所
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] 複数時間スケールを持つ環境適応ダイナミクス:エタノールストレス環境下での大腸菌人工進化実験における網羅的表現型/遺伝子型解析2010
- Author(s)
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
- Organizer
  第48回生物物理学会年会
- Place of Presentation
  東北大学
- Year and Date
  2010-09-20
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] タイリングアレイを用いたエタノール耐性大腸菌株のゲノム変異解析2009
- Author(s)
  玉岡邦康, 堀之内貴明, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
- Organizer
  第61回日本生物工学会大会
- Place of Presentation
  名古屋大学
- Year and Date
  2009-09-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] 次世代シーケンサにおけるメイトベアの距離情報を利用した配列解析アルゴリズムの開発2009
- Author(s)
  小野直亮
- Organizer
  第47回日本生物物理学会年会
- Place of Presentation
  アスティ徳島
- Year and Date
  2009-11-01
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] 次世代シーケンサにおけるメイトペアの距離情報を利用した配列解析アルゴリズムの開発2009
- Author(s)
  小野直亮, 鈴木真吾, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
- Organizer
  第47回生物物理学会年会
- Place of Presentation
  徳島文理大学
- Year and Date
  2009-11-01
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] タイリングアレイを用いたエタノール耐性大腸菌株のゲノム変異解析2009
- Author(s)
  玉岡邦康, 堀之内貴明, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
- Organizer
  第61回日本生物工学会大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] A model-based analysis method for detection of single-base substitution using resequencing microarrays2009
- Author(s)
  Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu, Tetsuya Yomo
- Organizer
  Asia Pacific Biochemical Engineering Conference 2009(APBioChEC' 09)
- Place of Presentation
  Kobe, Japan
- Year and Date
  2009-11-25
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] メイトペア情報に基づいた次世代シーケンサによるresequencing解析アルゴリズムの開発2009
- Author(s)
  小野直亮、鈴木真吾、古澤力、清水浩、四方哲也
- Organizer
  第61回日本生物工学会大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] エタノール耐性大腸菌株のタイリングアレイを用いたゲノムワイド変異解析2009
- Author(s)
  玉岡邦康, 堀之内貴明, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
- Organizer
  生物工学若手研究者の集い夏のセミナー2009
- Place of Presentation
  コミュニティ嵯峨野
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] 次世代シーケンサにおけるメイトペアの距離情報を利用した配列解析アルゴリズムの開発2009
- Author(s)
  小野直亮, 鈴木真吾, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
- Organizer
  第47回日本生物物理学会年会
- Year and Date
  2009-11-01
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] Genome-Wide Mutational and Expression Analyses of Evolved Escherichia Coli Strains Under Ethanol Stress2009
- Author(s)
  Takaaki Horinouchi, Kuniyasu Tamaoka, Chikara Furusawa, Takashi Hirasawa, Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Tetsuya Yomo, Hiroshi Shimizu
- Organizer
  The 20th International Conference on Genome Informatics(GIW 2009)
- Place of Presentation
  Yokohama, Japan
- Year and Date
  2009-12-14
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] メイトペア情報に基づいてた次世代シーケンサによるresequencing解析アルゴリズムの開発2009
- Author(s)
  小野直亮
- Organizer
  日本生物工学会第61回大会
- Place of Presentation
  名古屋大学
- Year and Date
  2009-09-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] メイトペア情報に基づいた次世代シーケンサによるresequencing解析アルゴリズムの開発2009
- Author(s)
  小野直亮
- Organizer
  第61回日本生物工学会大会
- Place of Presentation
  名古屋大学
- Year and Date
  2009-09-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[Presentation] A model-based analysis method for detection of single-bace substitution using resequencing microarrays2009
- Author(s)
  Naoaki Ono
- Organizer
  Asia Pacific Biochemical Engineering Conference 2009(APBioCHEC'09)
- Place of Presentation
  神戸国際会議場
- Year and Date
  2009-11-25
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] メイトペア情報に基づいた次世代シーケンサによるresequencing解析アルゴリズムの開発2009
- Author(s)
  小野直亮, 鈴木真吾, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
- Organizer
  第61回日本生物工学会大会
- Place of Presentation
  名古屋大学
- Year and Date
  2009-09-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[Presentation] A model-based analysis method for detection of single-base substitution using resequencing microarrays.2009
- Author(s)
  Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu, Tetsuya Yomo
- Organizer
  Asia Pacific Biochemical Engineering Conference 2009 (APBioChEC'09)
- Place of Presentation
  Kobe International Conference Center Port Island, Kobe, Japan.
- Year and Date
  2009-11-25
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21700324

1. SHIMIZU Hiroshi (00226250)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 18 results
2. FURUSAWA Chikara (00372631)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 18 results
3. HIRASAWA Takashi (20407125)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 13 results
4. 大内田研宙 (20452708)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 2 results
5. 飯田秀博 (30322720)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
6. 下地佐恵香 (50791563)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
7. 梅澤俊明 (80151926)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 2 results
8. 山村正臣 (00948367)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 2 results
9. 飛松裕基 (20734221)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
10. 金谷重彦 (90224584)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 1 results
11. AMIN MD.ALTAFUL

# of Collaborated Projects: 0 results

# of Collaborated Products: 1 results

ONO Naoaki 小野 直亮

小野 直亮 オノ ナオアキ

Research Projects

Research Products

Co-Researchers

Recurrent 3D-UNetを用いたPET時系列からの灌流機能画像の生成Principal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Elucidation of the mechanism for antitumor lignan biosynthesis based on integrated genome analysis

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Optimization of feature extraction of histopathological images using deep learningPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Development of statistical model for analysis of dynamic of metabolic diseases using PETPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

深層学習を用いたすい癌の病理組織画像からの細胞タイプ識別モデルの構築Principal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

遺伝子発現情報のクラスタリングにもとづいた肺がん組織病理画像の特徴抽出Principal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Creation of stress tolerant strain based on single nucleotide mutational analysis of in whole genome

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

Evolutionary simulation of gene regulatory networks based on comprehensive transcriptome and mutation analysis.Principal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

[Journal Article] Quantitative evaluation model of variable diagnosis for chest X-ray images using deep learning2024

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Two O-methyltransferases from Phylogenetically Unrelated Cow Parsley (Anthriscus sylvestris) and Hinoki-asunaro (Thujopsis dolabrata var. hondae) as a Signature of Lineage-specific Evolution in Lignan Biosynthesis2023

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] <i>Anthriscus sylvestris</i> Deoxypodophyllotoxin Synthase Involved in?the Podophyllotoxin Biosynthesis2023

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Information maximization-based clustering of histopathology images using deep learning2023

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Classification of ischemia from myocardial polar maps in 15O?H2O cardiac perfusion imaging using a convolutional neural network2022

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Classification of lung adenocarcinoma transcriptome subtypes from pathological images using deep convolutional networks2018

Author(s)

ONO Naoaki 小野直亮

小野直亮オノナオアキ