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WATANABE Chiduru  渡邉 千鶴

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渡邉 千鶴  ワタナベ チヅル

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Researcher Number 60549187
Other IDs
Affiliation (Current) 2025: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 研究員
Affiliation (based on the past Project Information) *help 2023: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 研究員
2018 – 2020: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 研究員
Review Section/Research Field
Principal Investigator
Medium-sized Section 47:Pharmaceutical sciences and related fields
Except Principal Investigator
Basic Section 47020:Pharmaceutical analytical chemistry and physicochemistry-related
Keywords
Principal Investigator
フラグメント分子軌道(FMO)法 / IFIE / FMO / 機械学習 / 相互作用エネルギー / タンパク質-タンパク質相互作用(PPI) / 抗原-抗体 / フラグメント分子軌道法
Except Principal Investigator
相互作用エネルギー / 活性値予測 … More / タンパク質リガンド間相互作用 / フラグメント分子軌道(FMO)法 / 創薬研究 / ドッキング / 活性予測 / 機械学習 / タンパク質-リガンド相互作用 / 量子化学計算 / データベース / フラグメント分子軌道法 Less
  • Research Projects

    (2 results)
  • Research Products

    (9 results)
  • Co-Researchers

    (4 People)
  •  Construction of a predictive model for antigen-antibody interaction energies using the FMO databasePrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      渡邉 千鶴
    • Project Period (FY)
      2023 – 2025
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    • Review Section
      Medium-sized Section 47:Pharmaceutical sciences and related fields
    • Research Institution
      Institute of Physical and Chemical Research
  •  Collection of inter- and intramolecular interactions data and applications of database to drug discovery based on fragment molecular orbital method

    • Principal Investigator
      Takaya Daisuke
    • Project Period (FY)
      2018 – 2020
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Review Section
      Basic Section 47020:Pharmaceutical analytical chemistry and physicochemistry-related
    • Research Institution
      Institute of Physical and Chemical Research

All 2021 2020 2019 2018

All Journal Article Presentation

  • [Journal Article] FMODB: The World’s First Database of Quantum Mechanical Calculations for Biomacromolecules Based on the Fragment Molecular Orbital Method2021

    • Author(s)
      Daisuke Takaya, Chiduru Watanabe, Shunpei Nagase, Kikuko Kamisaka, Yoshio Okiyama, Hirotomo Moriwaki, Hitomi Yuki, Tomohiro Sato, Noriyuki Kurita, Yoichiro Yagi, Tatsuya Takagi, Norihito Kawashita, Kenichiro Takaba, Tomonaga Ozawa, Midori Takimoto-Kamimura, Shigenori Tanaka, Kaori Fukuzawa, and Teruki Honma
    • Journal Title

      J. Chem. Inf. Model.

      Volume: 61 Issue: 2 Pages: 777-794

    • DOI

      10.1021/acs.jcim.0c01062

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18K06615, KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PROJECT-18K06619, KAKENHI-PLANNED-17H06353
  • [Journal Article] <b>Development of an automated fragment molecular orbital (FMO) calculation protocol toward construction of quantum mechanical </b><b>calculation database for large biomolecules </b>2019

    • Author(s)
      Watanabe Chiduru、Watanabe Hirofumi、Okiyama Yoshio、Takaya Daisuke、Fukuzawa Kaori、Tanaka Shigenori、Honma Teruki
    • Journal Title

      Chem-Bio Informatics Journal

      Volume: 19 Issue: 0 Pages: 5-18

    • DOI

      10.1273/cbij.19.5

    • NAID

      130007618360

    • ISSN
      1347-0442, 1347-6297
    • Year and Date
      2019-03-22
    • Language
      English
    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18K06619, KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
  • [Presentation] 新型コロナウイルスによるパンデミックに対する FMODB の取り組み2020

    • Author(s)
      渡邉千鶴、神坂紀久子、大山達也、高谷大輔、加藤幸一郎、川嶋裕介、半田佑磨、山本亜美、渡邉一樹、福澤薫、本間光貴
    • Organizer
      第48回構造活性相関シンポジウム
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18K06619
  • [Presentation] FMO法に基づく相互作用記述子を用いた p38 MAPキナーゼの阻害活性予測2020

    • Author(s)
      神坂 紀久子, 渡邉 千鶴, 髙谷 大輔, 原田 俊幸, 佐藤 朋広, 幸 瞳, 本間 光貴
    • Organizer
      第48回構造活性相関シンポジウム
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18K06619
  • [Presentation] フラグメント分子軌道法と機械学習を用いた Aurora キナーゼ阻害剤活性予測モデル構築2019

    • Author(s)
      原田俊幸,渡邉千鶴,森脇寛智,神坂紀久子,原田祐希,佐藤朋広,高谷大輔,本間光貴
    • Organizer
      第47回構造活性相関シンポジウム
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18K06619
  • [Presentation] FMODBの開発と相互作用データの適用に関する研究2019

    • Author(s)
      高谷大輔、渡邉千鶴、神坂紀久子、本間光貴
    • Organizer
      第47回構造活性相関シンポジウム
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18K06619
  • [Presentation] FMOデータベースにおける相互作用の統計解析と創薬分子設計への応用2019

    • Author(s)
      渡邉千鶴
    • Organizer
      日本薬学会第139年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18K06619
  • [Presentation] Development of FMO database and its recent updates, 20182018

    • Author(s)
      Daisuke Takaya, Chiduru Watanabe, Shunpei Nagase, Kikuko Kamisaka, Teruki Honma
    • Organizer
      CBI学会2018年大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18K06619
  • [Presentation] Statistical analysis of inter- and intramolecular interactions for drug design based on FMO database2018

    • Author(s)
      Chiduru Watanabe, Daisuke Takaya, Shunpei Nagase, Kikuko Kamisaka, Kaori Fukuzawa, Teruki Honma
    • Organizer
      CBI学会2018年大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18K06619
  • 1.  Takaya Daisuke (50571395)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 5 results
  • 2.  佐藤 朋広 (00595358)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 3.  沖山 佳生 (80536384)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 4.  川下 理日人
    # of Collaborated Projects: 0 results
    # of Collaborated Products: 1 results

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