Uchiyama Taku 内山拓

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UCHIYAMA Taku 内山拓

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Researcher Number	70450658
Affiliation (based on the past Project Information) *help	2016 – 2017: 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 特任研究員 2015: 東京大学, 農学生命科学研究科, 研究員 2010 – 2011: 独立行政法人産業技術総合研究所, 生物プロセス研究部門, 研究員 2007 – 2008: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, 生物機能工学研究部門, 研究員
Review Section/Research Field	Principal Investigator Applied microbiology / Applied biochemistry
Keywords	Principal Investigator メタゲノム / HS-AFM / Processivity / Cellulase / 産業用酵素 / フローサイトメーター / ハイスループットスクリーニング / 有用微生物スクリーニング / 転写制御因子 / 酵素 … More / ゲルマイクロドロップ / 微生物センサー / バイオテクノロジー / FACS / PIGEX / メタゲノムライブラリー / SIGEX / スクリーニング法 / メタゲノムライブラリ Less

Analysis of the mechanism of efficient degradation of crystalline substrate by cellulases from ActinomycetesPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  Uchiyama Taku
- Project Period (FY)
  2015 – 2017
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Research Field
  
  Applied biochemistry
- Research Institution
  The University of Tokyo
A new method for high-throughput screening of enzymes using microbial sensorPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  UCHIYAMA Taku
- Project Period (FY)
  2010 – 2011
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- Research Field
  
  Applied microbiology
- Research Institution
  National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
Development of a new metagenomic library screening methodPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  UCHIYAMA Taku
- Project Period (FY)
  2007 – 2008
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
- Research Field
  
  Applied microbiology
- Research Institution
  National Institute of Advanced Industrial Science and Technology

All 2017 2016 2015 2011 2010 2009 2008

All Journal Article Presentation Book Patent

[Book] Metagenomics : Methods in Molecular Biology, Substrate-induced gene expression (SIGEX) screening a method for high-throughput screening of metagenome libraries.2010
- Author(s)
  内山拓、宮崎健太郎
- Total Pages
  341
- Publisher
  Springer
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22780081
[Book] Metagenomics ; Methods in Molecular Biology, Substrate-induced gene expression(SIGEX) screening ; a method for high-throughput screening of metagenome libraries2010
- Author(s)
  内山拓、宮崎健太郎
- Publisher
  Springer
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22780081
[Book] 難培養微生物研究の最新技術II～ゲノム解析を中心とした最前線と将来展望～、SIGEX:メタゲノムからのハイスループットな代謝系遺伝子スクリーニング法2010
- Author(s)
  内山拓
- Total Pages
  287
- Publisher
  シーエムシー出版
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22780081
[Book] 難培養微生物研究の最新技術II.ゲノム解析を中心とした最前線と将来展望.、SIGEX :メタゲノムからのハイスループットな代謝系遺伝子スクリーニング法2010
- Author(s)
  内山拓
- Publisher
  シーエムシー出版
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22780081
[Journal Article] Crystal structure and identification of a key amino acid for glucose tolerance, substrate specificity and transglycosylation activity of metagenomic β-glucosidase Td2F2.2016
- Author(s)
  Tomohiko Matsuzawa, Toshinori Jo, Taku Uchiyama, Jenny A Manninen, Takatoshi Arakawa, Kentaro Miyazaki, Shinya Fushinobu, Katsuro Yaoi
- Journal Title
  
  FEBS Journal
  
  Volume: - Issue: 12 Pages: 2340-2353
- DOI
  10.1111/febs.13743
- Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26850067, KAKENHI-PROJECT-15H02443, KAKENHI-PROJECT-15K07383, KAKENHI-PROJECT-26660083
[Journal Article] Development of simple random mutagenesis protocol for the protein expression system in Pichia pastoris2016
- Author(s)
  Tachioka, M., Sugimoto, N., Nakamura, A., Sunagawa, N., Ishida, T., Uchiyama, T., Igarashi, K., and Samejima, M.
- Journal Title
  
  Biotechnol. Biofuels
  
  Volume: 9 Issue: 1 Pages: 199-199
- DOI
  10.1186/s13068-016-0613-z
- Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-24114008, KAKENHI-PROJECT-15K07383, KAKENHI-PROJECT-15J10657
[Journal Article] Single-molecule imaging analysis of binding, processive movement, and dissociation of cellobiohydrolase Trichoderma reesei Cel6A and its domains on crystalline cellulose2016
- Author(s)
  Nakamura A, Tasaki T, Ishiwata D, Yamamoto M, Okuni Y, Visootsat A, Maximilien M, Noji H, Uchiyama T, Samejima M, Igarashi K, Iino R
- Journal Title
  
  J. Biol. Chem.
  
  Volume: 291 Issue: 43 Pages: 22404-22413
- DOI
  10.1074/jbc.m116.752048
- Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access / Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-16H00789, KAKENHI-PLANNED-24114008, KAKENHI-PROJECT-15H06898, KAKENHI-PROJECT-15K07383, KAKENHI-PROJECT-26000011
[Journal Article] Glucose-tolerant beta-glucosidase retrieved from a Kusasya gravy metagenome2015
- Author(s)
  Taku Uchiyama, Katsuro Yaoi, Kentaro Miyazaki
- Journal Title
  
  Frontiers in Microbiology
  
  Volume: 6 Pages: 548-548
- DOI
  10.3389/fmicb.2015.00548
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K07383, KAKENHI-PROJECT-26292048
[Journal Article] メタゲノムからの未知遺伝子スクリーニング法2011
- Author(s)
  内山拓
- Journal Title
  
  土と微生物
  
  Volume: Vol.65 Pages: 73-77
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22780081
[Journal Article] Product induced gene expression, a product responsive reporter assay used to screen metagenomic libraries for enzyme encoding genes2010
- Author(s)
  内山拓、宮崎健太郎
- Journal Title
  
  Applied and Environmental Microbiology
  
  Volume: Vol.76 Pages: 7029-7035
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22780081
[Journal Article] Product-induced gene expression, a product-responsive reporter assay used to screen metagenomic libraries for enzyme-encoding genes.2010
- Author(s)
  内山拓、宮崎健太郎
- Journal Title
  
  Applied and Environmental Microbiology
  
  Volume: 76 Pages: 7029-7035
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22780081
[Journal Article] Substrate-induced gene expression (SIGEX) screening of metagenome libraries2008
- Author(s)
  内山拓, 渡邉一哉
- Journal Title
  
  Nat. Protoc. 3
  
  Pages: 1202-1212
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040
[Journal Article] Substrate-induced gene expression (SIGEX) screening of metagenome libraries2008
- Author(s)
  内山拓, 渡邉一哉
- Journal Title
  
  Nat. Protoc Vol. 3
  
  Pages: 1202-1212
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040
[Journal Article] メタゲノムを利用した新規酵素のスクリーニング2008
- Author(s)
  内山拓, 宮崎健太郎
- Journal Title
  
  バイオーサイエンスとバイオインダストリー 66
  
  Pages: 234-239
- NAID
  10024745363
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040
[Journal Article] メタゲノムを利用した新規酵素のスクリーニング2008
- Author(s)
  内山拓, 宮崎健太郎
- Journal Title
  
  バイオサイエンスとバイオインダストリー 66巻
  
  Pages: 234-239
- NAID
  10024745363
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040
[Patent] 酵素遺伝子スクリーニング法2008
- Inventor(s)
  内山拓, 宮崎健太郎
- Industrial Property Rights Holder
  内山拓、宮崎健太郎
- Filing Date
  2008-08-01
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040
[Patent] 酵素遺伝子スクリーニング法2008
- Inventor(s)
  内山拓, 宮崎健太郎
- Industrial Property Rights Holder
  独立行政法人産業技術総合研究所
- Filing Date
  2008-08-01
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040
[Presentation] セルラーゼのプロセッシビティを中心とした機能解析2017
- Author(s)
  内山拓、五十嵐圭日子、鮫島正浩
- Organizer
  第12回バイオマス科学会議
- Place of Presentation
  東京大学弥生講堂　（東京都・文京区）
- Year and Date
  2017-01-18
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K07383
[Presentation] メタゲノム由来β-グルコシダーゼKs5A7の性状解析2016
- Author(s)
  内山拓、矢追克郎、宮崎健太郎
- Organizer
  第１１回バイオマス科学会議
- Place of Presentation
  朱鷺メッセ（新潟県・新潟市）
- Year and Date
  2016-01-20
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K07383
[Presentation] セルロース資化性放線菌Cellulomonas fimi由来セルラーゼのプロセッシビティを中心とした機能解析2016
- Author(s)
  内山拓、内橋貴之、金子哲、中村彰彦、五十嵐圭日子、鮫島正浩
- Organizer
  日本応用糖質科学会平成28年度大会
- Place of Presentation
  広島県民文化センターふくやま　（広島県・福山市）
- Year and Date
  2016-09-14
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K07383
[Presentation] メタゲノム由来β-グルコシダーゼKs5A7の性状解析2016
- Author(s)
  内山拓、矢追克郎、宮崎健太郎
- Organizer
  日本農芸化学会２０１６年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道・札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K07383
[Presentation] 放線菌由来GH6セルラーゼの結晶性基質分解機構の解析2016
- Author(s)
  内山拓、内橋貴之、金子哲、中村彰彦、石田卓也、五十嵐圭日子、鮫島正浩
- Organizer
  第30回セルラーゼ研究会大会
- Place of Presentation
  佐久平プラザ21　（長野県・佐久市）
- Year and Date
  2016-07-15
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K07383
[Presentation] Processive movement observation of four cellulases from cellulolytic bacteria Cellulomonas fimi2015
- Author(s)
  Taku Uchiyama, Masahiro Samejima, Kiyohiko Igarashi
- Organizer
  Gordon Research Conferences
- Place of Presentation
  Andover (United States)
- Year and Date
  2015-08-02
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K07383
[Presentation] PIGEX法のハイスループット化の検討2011
- Author(s)
  内山拓、宮崎健太郎
- Organizer
  第63回日本生物工学会大会
- Place of Presentation
  東京
- Year and Date
  2011-09-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22780081
[Presentation] メタゲノムからの有用遺伝子取得法の開発2011
- Author(s)
  内山拓
- Organizer
  LS-BT合同研究発表会
- Place of Presentation
  つくば
- Year and Date
  2011-02-01
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22780081
[Presentation] PIGEX法のハイスループット化の検討2011
- Author(s)
  内山拓、宮崎健太郎
- Organizer
  第63回日本生物工学会大会
- Place of Presentation
  東京都、東京農工大学
- Year and Date
  2011-09-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22780081
[Presentation] PIGEX法のさらなるハイスループット化の検討2011
- Author(s)
  内山拓、宮崎健太郎
- Organizer
  日本農芸化学会2011年度大会
- Place of Presentation
  京都
- Year and Date
  2011-03-28
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22780081
[Presentation] メタゲノムからの未利用遺伝子資源の探索2010
- Author(s)
  内山拓
- Organizer
  第5回産業用酵素シンポジウム
- Place of Presentation
  長浜
- Year and Date
  2010-11-06
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22780081
[Presentation] PIGEX (Product-Induced Gene Expression):微生物センサーを利用した酵素遺伝子スクリーニング法の開発2010
- Author(s)
  内山拓、宮崎健太郎
- Organizer
  第62回日本生物工学会大会
- Place of Presentation
  宮崎
- Year and Date
  2010-10-28
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22780081
[Presentation] PIGEX(Product Induced Gene Expression):微生物センサーを利用した酵素遺伝子スクリーニング法の開発2010
- Author(s)
  内山拓、宮崎健太郎
- Organizer
  第62回日本生物工学会大会
- Place of Presentation
  宮崎
- Year and Date
  2010-10-28
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22780081
[Presentation] メタゲノムを活用した有用酵素の開発2010
- Author(s)
  内山拓
- Organizer
  平成22年度産学官連携推進会議
- Place of Presentation
  京都
- Year and Date
  2010-06-05
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22780081
[Presentation] 微生物センサーを利用した酵素活性スクリーニング法の開発2009
- Author(s)
  内山拓, 六谷明子, 宮崎健太郎
- Organizer
  日本農芸化学会2009年度大会
- Place of Presentation
  福岡
- Year and Date
  2009-03-28
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040
[Presentation] 微生物センサーを利用した酵素開発スクリーニング法の開発2009
- Author(s)
  内山拓, 他
- Organizer
  日本農芸化学会2009年度大会
- Place of Presentation
  福岡
- Year and Date
  2009-03-28
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040
[Presentation] 微生物センサーを利用した酵素活性スクリーニング法の開発2009
- Author(s)
  内山拓, 六谷明子, 宮崎健太郎
- Organizer
  平成20年度ライフサイエンス分野合同会議
- Place of Presentation
  つくば
- Year and Date
  2009-01-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040
[Presentation] 微生物センサーを利用した酵素活性スクリーニング法の開発2009
- Author(s)
  内山拓, 他
- Organizer
  平成20年度ライフサイエンス分野合同会議
- Place of Presentation
  つくば市
- Year and Date
  2009-01-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040
[Presentation] メタゲノムスクリーニングを指向した宿主・ベクター系の開発2008
- Author(s)
  内山拓, 他
- Organizer
  日本農芸化学会2008年度大会
- Place of Presentation
  名古屋
- Year and Date
  2008-03-28
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040
[Presentation] メタゲノムからの有用遺伝子の探索2008
- Author(s)
  内山拓, 他
- Organizer
  農業環境技術研究所公開セミナー「農業分野におけるメタゲノム解析技術の応用の可能性」
- Place of Presentation
  つくば市
- Year and Date
  2008-12-17
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040
[Presentation] メタゲノムからの有用遺伝子の探索2008
- Author(s)
  内山拓
- Organizer
  農業環境技術研究所公開セミナー「農業分野におけるメタゲノム解析技術の応用の可能性」
- Place of Presentation
  つくげ
- Year and Date
  2008-12-17
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040
[Presentation] The SIGEX scheme : High throughput screening of metagenomes for isolation of novel catabolic genes2008
- Author(s)
  内山拓
- Organizer
  ISSMサテライトシンポジウム
- Place of Presentation
  Tokyo
- Year and Date
  2008-11-15
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040
[Presentation] メタゲノムスクリーニングを指向した宿主・ベクター系の開発2008
- Author(s)
  内山拓、六谷明子、宮崎健太郎
- Organizer
  日本農芸化学会2008年度(平成20年度)大会
- Place of Presentation
  名城大学天白キャンパス
- Year and Date
  2008-03-28
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040
[Presentation] The SIGEX scheme: High throughput screening of metagenomes for isolation of novel catabolic genes2008
- Author(s)
  内山拓, 他
- Organizer
  ISSM サテライトシンポジウ
- Place of Presentation
  Tokyo
- Year and Date
  2008-11-15
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040
[Presentation] PIGEX : A fluorescence-based novel activity-independent screening technology for enzymes2008
- Author(s)
  内山拓, 六谷明子, 宮崎健太郎
- Organizer
  The 12^<th> International Symposium on Microbial Ecology
- Place of Presentation
  Australia
- Year and Date
  2008-08-19
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040
[Presentation] メタゲノムからの未知有用遺伝子スクリーニング法の開発2008
- Author(s)
  内山拓、渡辺一哉、宮崎健太郎
- Organizer
  第2回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  大阪大学コンベンションセンター
- Year and Date
  2008-03-06
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040
[Presentation] PIGEX: A fluorescence-based novel activity-independent screening technology for enzymes2008
- Author(s)
  内山拓, 他
- Organizer
  The 12th International Symposium on Microbial Ecolog
- Place of Presentation
  Australia
- Year and Date
  2008-08-19
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040
[Presentation] メタゲノムからの未知有用遺伝子スクリーニング法の開発2008
- Author(s)
  内山拓, 他
- Organizer
  第2回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  大阪
- Year and Date
  2008-03-06
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19880040

1. UCHIHASHI TAKAYUKI (30326300)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 2 results
2. ISHIDA TAKUYA (10714628)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 1 results
3. IINO Ryota

# of Collaborated Projects: 0 results

# of Collaborated Products: 1 results
4. 松沢智彦

# of Collaborated Projects: 0 results

# of Collaborated Products: 1 results
5. 五十嵐圭日子

# of Collaborated Projects: 0 results

# of Collaborated Products: 1 results

Uchiyama Taku 内山 拓

UCHIYAMA Taku 内山 拓

Research Projects

Research Products

Co-Researchers

Analysis of the mechanism of efficient degradation of crystalline substrate by cellulases from ActinomycetesPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

A new method for high-throughput screening of enzymes using microbial sensorPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

Development of a new metagenomic library screening methodPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

[Book] Metagenomics : Methods in Molecular Biology, Substrate-induced gene expression (SIGEX) screening a method for high-throughput screening of metagenome libraries.2010

Author(s)

Total Pages

Publisher

Data Source

[Book] Metagenomics ; Methods in Molecular Biology, Substrate-induced gene expression(SIGEX) screening ; a method for high-throughput screening of metagenome libraries2010

Author(s)

Publisher

Data Source

[Book] 難培養微生物研究の最新技術II～ゲノム解析を中心とした最前線と将来展望～、SIGEX:メタゲノムからのハイスループットな代謝系遺伝子スクリーニング法2010

Author(s)

Total Pages

Publisher

Data Source

[Book] 難培養微生物研究の最新技術II.ゲノム解析を中心とした最前線と将来展望.、SIGEX :メタゲノムからのハイスループットな代謝系遺伝子スクリーニング法2010

Author(s)

Publisher

Data Source

[Journal Article] Crystal structure and identification of a key amino acid for glucose tolerance, substrate specificity and transglycosylation activity of metagenomic β-glucosidase Td2F2.2016

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Development of simple random mutagenesis protocol for the protein expression system in Pichia pastoris2016

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Single-molecule imaging analysis of binding, processive movement, and dissociation of cellobiohydrolase Trichoderma reesei Cel6A and its domains on crystalline cellulose2016

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Glucose-tolerant beta-glucosidase retrieved from a Kusasya gravy metagenome2015

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] メタゲノムからの未知遺伝子スクリーニング法2011

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] Product induced gene expression, a product responsive reporter assay used to screen metagenomic libraries for enzyme encoding genes2010

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] Product-induced gene expression, a product-responsive reporter assay used to screen metagenomic libraries for enzyme-encoding genes.2010

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] Substrate-induced gene expression (SIGEX) screening of metagenome libraries2008

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] Substrate-induced gene expression (SIGEX) screening of metagenome libraries2008

Author(s)

Journal Title

Uchiyama Taku 内山拓

UCHIYAMA Taku 内山拓