• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Kaminuma Eli  神沼 英里

ORCIDConnect your ORCID iD *help
… Alternative Names

KAMINUMA Eli  神沼 英里

山本 英里  ヤマモト エリ

Less
Researcher Number 90314559
Other IDs
Affiliation (Current) 2025: 名古屋市立大学, 大学院芸術工学研究科, 准教授
Affiliation (based on the past Project Information) *help 2022 – 2025: 名古屋市立大学, 大学院芸術工学研究科, 准教授
2012 – 2014: 国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 助教
2008: The Institute of Physical and Chemical Research, 生命情報基盤研究部門, 研究員
2007: The Institute of Physical and Chemical Research, オミックス情報統合化研究チーム, 研究員
2005 – 2006: 独立行政法人理化学研究所, ゲノム変異機能情報研究チーム, 研究員 … More
2004: 独立行政法人理化学研究所, ゲノム知識ベース研究開発チーム, 研究員
2001: 和歌山大, システム工学部, 助手
2000: 和歌山大学, システム工学部, 助手 Less
Review Section/Research Field
Principal Investigator
Bioinformatics/Life informatics / Basic Section 90010:Design-related / 計算機科学
Except Principal Investigator
Sections That Are Subject to Joint Review: Basic Section03060:Cultural assets study-related , Basic Section03070:Museology-related / Basic Section 03070:Museology-related / Basic Section 03060:Cultural assets study-related / Genome biology
Keywords
Principal Investigator
トライコーム / μX線CT / 3次元形状計測 / シロイヌナズナ / デザイン / 道路網 / 街路樹 / 深層学習 / デジタルツイン / ゲノム多様性 … More / 遺伝的多様性 / DNA多型 / WGS / 一塩基多型 / 解析ワークフロー / データベース / 多様性指標 / Sequence Read Archive / 次世代シークエンサ / SNP / 変異体スクリーニング / 形態形質 / in silico / bioluminescence / Luciferase reporter / digital in situ hybridization / time-lapse images / 標準形状モデル / スクリーニング / 変異体 / バイオインフォマティクス / 葉片 / 葉面特異的分化器官 / 形質 / 個人性 / 形状 / 発話 / 構音 / 顔 / CG … More
Except Principal Investigator
機械学習・深層学習 / モニタリング / 構造安全性 / 組積造 / 文化財 / denovo アセンブル / クラウドコンピューティング / de novoアセンブリ / SNP / リシーケンス / HLA / ChIP-Seq / RNA-Seq / クラウド / 解析パイプライン / 次世代シーケンサー / ゲノム Less
  • Research Projects

    (8 results)
  • Research Products

    (23 results)
  • Co-Researchers

    (8 People)
  •  人間と生成AIエージェントの協働によるものづくりDX機器人材育成の効率化の研究Principal Investigator

    • Principal Investigator
      神沼 英里
    • Project Period (FY)
      2025 – 2027
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Review Section
      Basic Section 90010:Design-related
    • Research Institution
      Nagoya City University
  •  Monitoring Technologies on Structural Safety of Cultural Property Masonry Structures

    • Principal Investigator
      青木 孝義
    • Project Period (FY)
      2023 – 2025
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Review Section
      Basic Section 03060:Cultural assets study-related
      Basic Section 03070:Museology-related
      Sections That Are Subject to Joint Review: Basic Section03060:Cultural assets study-related , Basic Section03070:Museology-related
    • Research Institution
      Nagoya City University
  •  Deep learning-based layout design of urban roadside trees on the road network within digital twinsPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      神沼 英里
    • Project Period (FY)
      2022 – 2024
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Review Section
      Basic Section 90010:Design-related
    • Research Institution
      Nagoya City University
  •  Integration of plant strain SNPs using NGS Sequence Read Archive and diversity statistics analysisPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      KAMINUMA Eli
    • Project Period (FY)
      2012 – 2014
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      Bioinformatics/Life informatics
    • Research Institution
      National Institute of Genetics
  •  The Development of a cloud computing-based annotation system for next-generation sequencing data

    • Principal Investigator
      NAGASAKI Hideki
    • Project Period (FY)
      2012 – 2014
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      Genome biology
    • Research Institution
      National Institute of Genetics
  •  Constructing morphological template models of Arabidopsis thaliana for computational mutant screeningPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      KAMINUMA Eli
    • Project Period (FY)
      2006 – 2008
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • Research Field
      Bioinformatics/Life informatics
    • Research Institution
      The Institute of Physical and Chemical Research
  •  シロイヌナズナの葉面特異的分化器官の3次元形状計測と形質定量化Principal Investigator

    • Principal Investigator
      神沼 英里
    • Project Period (FY)
      2004 – 2005
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • Research Field
      Bioinformatics/Life informatics
    • Research Institution
      The Institute of Physical and Chemical Research
  •  CG顔の構音に個人性を反映する身体形状パラメータの研究Principal Investigator

    • Principal Investigator
      山本 英里
    • Project Period (FY)
      2000 – 2001
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      計算機科学
    • Research Institution
      Wakayama University

All 2015 2014 2013 2012 2009 2008 2005 2004 Other

All Journal Article Presentation Book

  • [Book] 実験医学別冊 「次世代シークエンス解析スタンダード」2014

    • Author(s)
      長崎英樹、望月孝子、谷沢靖洋、神沼英里、中村保一
    • Total Pages
      8
    • Publisher
      羊土社
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24510273
  • [Book] 実験医学別冊「次世代シークエンス解析スタンダード」:Ⅵ-4 DDBJ Read Annotation Pipeline 解析パイプラインによるRNA-Seq de novo assemblyとイネ多型解析2014

    • Author(s)
      長崎英樹,望月孝子,谷沢靖洋,神沼英里,中村保一
    • Publisher
      羊土社
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24500366
  • [Journal Article] DDBJ read annotation pipeline: a cloud computing-based pipeline for high-throughput analysis of next-generation sequencing data.2013

    • Author(s)
      Nagasaki H, Mochizuki T, Kodama Y, Saruhashi S, Morizaki S, Sugawara H, Ohyanagi H, Kurata N, Okubo K, Takagi T, Kaminuma E, Nakamura Y.
    • Journal Title

      DNA Res.

      Volume: 20 Pages: 383-390

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24510273
  • [Journal Article] Quantitative analysis of heterogeneous spatial distribution of Arabidopsis leaf trichomes using micro X-ray computed tomography2008

    • Author(s)
      Kaminuma E, Yoshizumi T, Wada T, Matsui M, Toyoda T.
    • Journal Title

      The Plant Journal 56

      Pages: 470-482

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18700296
  • [Journal Article] Three-dimensional definition of leaf morphological traits of Arabidopsis in silico phenotypic analysis2005

    • Author(s)
      E.Kaminuma, et al.
    • Journal Title

      Journal of Bioinformaitcs and Computational Biology 3・2

      Pages: 401-414

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16700278
  • [Journal Article] In silico phenotypic screening method of mutants based on statistical modeling of genetically mixed samples2005

    • Author(s)
      E.Kaminuma, et al.
    • Journal Title

      Journal of Bioinformaitcs and Computational Biology 3.6

      Pages: 1281-1293

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16700278
  • [Journal Article] Automatic quantification of morphological traits via three-dimensional measurement of Arabidopsis2004

    • Author(s)
      E.Kaminuma, et al.
    • Journal Title

      The Plant Journal 38・2

      Pages: 358-365

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16700278
  • [Journal Article] In silico phenotypic analysis of Arabidopsis based on shape model reconstruction from 3D images by microfocus X-ray computed tomography

    • Author(s)
      E.Kaminuma, et al.
    • Journal Title

      (発表予定)

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16700278
  • [Presentation] DNA Polymorphism Database from New-Generation Sequence Read Archive and Analytical Workflow2015

    • Author(s)
      Mochizuki T, Tanizawa Y, Fujisawa T, Nikoh N, Toyoda A, Fujiyama A, Kurata N, Nagasaki H, Shimizu T, Kaminuma E, Nakamura Y
    • Organizer
      Plant & Animal Genome XXIII
    • Place of Presentation
      San Diego (USA)
    • Year and Date
      2015-01-14
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24500366
  • [Presentation] Constructing an integrated DNA polymorphism database and an analytical workflow for plants and bacteria2014

    • Author(s)
      Takako Mochizuki, Takatomo Fujisawa, Yasuhiro Tanizawa, Hideki Nagasaki, Eli Kaminuma, Tokurou Shimizu, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, Nori Kurata, Naruo Nikoh and Yasukazu Nakamura
    • Organizer
      Plant and Animal Genome XXII (PAG XXII) Conference
    • Place of Presentation
      Town and Country Hotel, San Diego, USA
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24500366
  • [Presentation] 遺伝研スパコン概要と、NGSアーカイブデータを用いたSNP解析2014

    • Author(s)
      神沼英里、望月孝子、長崎英樹、谷沢靖洋、小笠原理、大久保公策、高木利久、中村保一
    • Organizer
      日本育種学会第126回講演会「NGS 使い倒し講座 - Breeding Informatics 研究 XIII」
    • Place of Presentation
      南九州大学(都城市)
    • Year and Date
      2014-09-26
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24500366
  • [Presentation] Liverwort Genome Analysis using DDBJ Pipeline and Construction of the Genome Annotation Database2013

    • Author(s)
      Hideki Nagasaki, Takatomo Fujisawa, Takako Mochizuki, Eli Kaminuma, Yasukazu Nakamura et al.
    • Organizer
      International Plant & Animal Genome XXI
    • Place of Presentation
      San Diego, CA, USA
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24510273
  • [Presentation] NGS由来ゲノムワイド多型マーカ構築とそのRDF注釈情報統合化2013

    • Author(s)
      Eli Kaminuma, Takatomo Fujisawa, Takako Mochizuki, Yasuhiro Tanizawa, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, Nori Kurata, Tokurou Shimizu, Yasukazu Nakamura
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24500366
  • [Presentation] DNA多型統合データベースと解析ワークフローの構築 : 植物、微生物への取り組み2013

    • Author(s)
      望月 孝子, 藤澤 貴智, 谷澤 靖洋, 長崎 英樹, 神沼 英里, 大柳 一, 清水 徳朗, 豊田 敦, 藤山 秋佐夫, 倉田 のり, 二河 成男, 中村 保一
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24500366
  • [Presentation] 新型シークエンサのアーカイブ配列と解析パイプライン:系統間SNP解析を事例として2012

    • Author(s)
      神沼英里
    • Organizer
      第122回日本育種学会講演会ワークショップ06 "育種のための情報解析ツール使い倒し塾"
    • Place of Presentation
      京都産業大学
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24500366
  • [Presentation] DDBJパイプラインによるゼニゴケゲノム解析とゲノムアノテーションデータベースの構築2012

    • Author(s)
      長崎 英樹, 藤澤 貴智, 望月 孝子, 神沼 英里, 中村 保一ら
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場・マリンメッセ福岡
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24510273
  • [Presentation] シロイヌナズナのオミックス総合データベース2009

    • Author(s)
      豊田哲郎, 神沼英里
    • Organizer
      第50回日本植物生理学会年会 シンポジウム
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18700296
  • [Presentation] シロイヌナズナLucTagラインを用いた遺伝子発現定量解析2008

    • Author(s)
      神沼英里, 吉積毅, 栗山朋子, 越智子, 武藤周, 松井南, 豊田哲郎
    • Organizer
      人工知能学会第36回分子生物情報研究会(SIG-MBI)
    • Place of Presentation
      横浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18700296
  • [Presentation] シロイヌナズナLucTagラインを用いた遺伝子発現定量解析2008

    • Author(s)
      神沼 英里, 吉積 毅, 栗山 朋子, 越 智子, 武藤 周, 豊田 哲郎, 松井 南
    • Organizer
      人工知能学会第36回分子生物情報研究会(SIG-MBI)
    • Place of Presentation
      理化学研究所 横浜研究所中央研究棟2階
    • Year and Date
      2008-01-11
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18700296
  • [Presentation] 植物形状Template modelを用いたLucTagラインの時空間遺伝子発現定量解析2008

    • Author(s)
      神沼英里, 吉積毅, 栗山朋子, 越智子, 武藤周, 松井南, 豊田哲郎
    • Organizer
      第72回日本植物学会大会 シンポジウム「バイオイメージングと画像情報処理が拓くもの」
    • Place of Presentation
      高知
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18700296
  • [Presentation] デジタルwhole mount in situ hybridizationに向けたシロイヌナズナLucTagラインの遺伝子発現時系列画像の定量化2008

    • Author(s)
      神沼 英里, 吉積 毅, 栗山 朋子, 越 智子, 武藤 周, 豊田 哲郎, 松井 南
    • Organizer
      植物生理学会第49回年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2008-03-22
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18700296
  • [Presentation] デジタルwhole mount in situ hybridizationに向けたシロイヌナズナLucTagラインの遺伝子発現時系列画像の定量化2008

    • Author(s)
      神沼英里, 吉積毅, 栗山朋子, 越智子, 武藤周, 松井南, 豊田哲郎
    • Organizer
      第49回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18700296
  • [Presentation] 植物形状Template Model を用いたLucTag Lineの時空間遺伝子発現定量解析2008

    • Author(s)
      神沼 英里, 吉積 毅, 栗山 朋子, 越 智子, 武藤 周, 松井 南, 豊田 哲郎,
    • Organizer
      植物学会第72回大会 シンポジウム
    • Place of Presentation
      高知大学
    • Year and Date
      2008-09-26
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18700296
  • 1.  NAGASAKI Hideki (70624451)
    # of Collaborated Projects: 2 results
    # of Collaborated Products: 9 results
  • 2.  TOYODA Tetsuro (20342818)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 8 results
  • 3.  MATSUI Minami (80190396)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 7 results
  • 4.  YOSHIZUMI Takeshi (80342872)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 7 results
  • 5.  MOCHIZUKI Takako (40709284)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 6 results
  • 6.  大野 暁彦 (00758401)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 7.  青木 孝義 (10202467)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 8.  張 景耀 (50546736)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results

URL: 

Are you sure that you want to link your ORCID iD to your KAKEN Researcher profile?
* This action can be performed only by the researcher himself/herself who is listed on the KAKEN Researcher’s page. Are you sure that this KAKEN Researcher’s page is your page?

この研究者とORCID iDの連携を行いますか?
※ この処理は、研究者本人だけが実行できます。

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi