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猿渡 茂  ENDO Shigeru

ORCIDORCID連携する *注記
… 別表記

遠渡 茂  ENDO Shigeru

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研究者番号 00265729
その他のID
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2007年度 – 2008年度: 北里大学, 理学部, 准教授
2003年度 – 2006年度: 北里大学, 理学部, 助教授
1999年度 – 2000年度: 北里大学, 理学部, 助教授
1997年度: 北里大学, 理学部, 助教授
審査区分/研究分野
研究代表者
応用ゲノム科学 / 生物物理学
研究代表者以外
生物物理学 / 生体生命情報学
キーワード
研究代表者
2面角 / ProMode / dihedral angle / 内部座標 / 分子動力学 / energy minimization / Eckart condition / rotational vector / external motion / internal motion … もっと見る / protein complex / P2対称性 / タンパク質 / 同種3量体 / 同種2量体 / 同種多量体 / 内部自由度 / Eckert条件 / 基準振動解析 / エネルギー極小化 / Eckart条件 / 回転ベクトル / 外部運動 / 内部運動 / タンパク質複合体 / 434 repressor / nonlinear effect / energy transfer / internal coordinate / molecular dynamics / 434リプレッサー / 非線形効果 / エネルギー移動 / NMR / ロボット工学 / ディスタンス・ジオメトリ … もっと見る
研究代表者以外
ProMode / 基準振動解析 / homologous protein / lysozyme / normal mode analysis / dynamic structure of protein / トリプシン・インヒビター / 蛋白質の動的構造 / 酵素 / SCOP / 相同タンパク質 / リゾチーム / タンパク質の動的構造 / 分子構造表現 / 弾性ネットワークモデル / タンパク質のダイナミクス / データベース / PDB / タンパク質立体構造のダイナミクス 隠す
  • 研究課題

    (5件)
  • 研究成果

    (48件)
  • 共同研究者

    (1人)
  •  タンパク質の二面角系弾性ネットワークモデルによる基準振動解析

    • 研究代表者
      輪湖 博
    • 研究期間 (年度)
      2006 – 2008
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      生体生命情報学
    • 研究機関
      早稲田大学
  •  タンパク質分子系の基準振動における解離会合モードの解析とデータベースの作成研究代表者

    • 研究代表者
      猿渡 茂
    • 研究期間 (年度)
      2005 – 2007
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      応用ゲノム科学
    • 研究機関
      北里大学
  •  タンパク質の基準振動解析データベースを利用した動的構造の比較研究

    • 研究代表者
      輪湖 博
    • 研究期間 (年度)
      2003 – 2005
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      早稲田大学
  •  タンパク質分子の基準振動間のカップリングに基づく動的構造の解析研究代表者

    • 研究代表者
      猿渡 茂
    • 研究期間 (年度)
      1999 – 2000
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      北里大学
  •  2次構造を単位とした蛋白質の分子動力学シミュレーション研究代表者

    • 研究代表者
      猿渡 茂
    • 研究期間 (年度)
      1997
    • 研究種目
      重点領域研究
    • 研究機関
      北里大学

すべて 2008 2007 2006 2005 2004

すべて 雑誌論文 学会発表

  • [雑誌論文] Comparisons between dynamic properties of homologous protein structures in ProMode(Database of Normal Mode Analyses on Proteins)2005

    • 著者名/発表者名
      H., Wako, M., Otsuka, Y., Tomizawa, M., Kato, S., Endo
    • 雑誌名

      Genome Informatics 16-1

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [雑誌論文] Comparisons between dynamic properties of homologous protein structures in ProMode (Database of normal mode analyses of proteins)2005

    • 著者名/発表者名
      H.Wako, M.Otsuka, Y.Tomizawa, M.Kato and S.Endo
    • 雑誌名

      Genome Informatics Series 16・1

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [雑誌論文] Comparisons between Dynamic Properties of Homologous Protein Structures in ProMode (Database of Normal Mod Analyses of Proteins)2005

    • 著者名/発表者名
      H.Wako, M.Otsuka, Y.Tomizawa, M.Kato, S.Endo
    • 雑誌名

      Genome Informatics Series 16・1

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [雑誌論文] ProMode : a database of normal mode analyses on protein molecules with a full-atom model2004

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Wako, Masaki Kato, Shigeru Endo
    • 雑誌名

      Bioinformatics 20(13)

      ページ: 2035-2043

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15570139
  • [雑誌論文] ProMode : a database of normal mode analyses on protein molecules with a full-atom model2004

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Wako, Masaki Kato, Shigeru Endo
    • 雑誌名

      Bioinformatics 20

      ページ: 2035-2043

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15570139
  • [学会発表] 二面角系での弾性ネットワークモデルによる基準振動解析の評価2008

    • 著者名/発表者名
      輪湖 博, 猿渡 茂
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      福岡県福岡市
    • 年月日
      2008-12-03
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] 二面角系での弾性ネットワークモデルによる基準振動解析の評価2008

    • 著者名/発表者名
      輪湖博、猿渡茂
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡県福岡市
    • 年月日
      2008-12-03
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] 二面角系での弾性ネットワークモデルによる基準振動解析2008

    • 著者名/発表者名
      輪湖 博, 猿渡 茂
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      東京都江戸川区
    • 年月日
      2008-06-11
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] アミノ酸配列情報を用いた蛋白質運動性の予測2008

    • 著者名/発表者名
      廣瀬修一, 横田恭宣, 輪湖 博, 猿渡 茂, 黒田 裕, 金井 理, 野口 保
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      東京都江戸川区
    • 年月日
      2008-06-10
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] 二面角系での弾性ネットワークモデルによる基準振動解析2008

    • 著者名/発表者名
      輪湖博、猿渡茂
    • 学会等名
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      東京都江戸川区
    • 年月日
      2008-06-10
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] タンパク質複合体の基準振動における結合モードの解析2008

    • 著者名/発表者名
      猿渡茂、佐々木彰吾、輪湖博
    • 学会等名
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      東京都江戸川区
    • 年月日
      2008-06-10
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] 蛋白質複合体の基準振動における結合モードの解析2008

    • 著者名/発表者名
      猿渡 茂, 佐々木彰吾, 輪湖 博
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      東京都江戸川区
    • 年月日
      2008-06-10
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] アミノ酸配列情報を用いた蛋白質運動性の予測2008

    • 著者名/発表者名
      廣瀬修一、横田恭宣、輪湖博、猿渡茂、黒田裕、金井理、野口保
    • 学会等名
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      東京都江戸川区
    • 年月日
      2008-06-10
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] 基準振動解析における結合モードに基づく蛋白質複合体の動的構造の分類2008

    • 著者名/発表者名
      猿渡 茂, 輪湖 博
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      福岡県福岡市
    • 年月日
      2008-12-03
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] A stand-alone application for users to perform normal analyses of proteins using data from ProMode2008

    • 著者名/発表者名
      H.Wako, Y.Tomizawa, and S.Endo
    • 学会等名
      The Sixth Asia-Pacific Bioinformatics Conference (APBC2008)
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2008-01-14
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [学会発表] A stand-alone application for users to perform normal mode analyses of protein using data from ProMode2008

    • 著者名/発表者名
      輪湖博、富澤裕樹、猿渡茂
    • 学会等名
      The sixth Asia-Pacific Bioinformatics Conference
    • 発表場所
      京都府京都市
    • 年月日
      2008-01-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] A stand-alone application for users to perform normal analyses of proteins using data from PraMode.2008

    • 著者名/発表者名
      H.Wako, Y.Tomizawa, and S.Endo
    • 学会等名
      The Sixth Asia-Pacific Bioinformatics Conference(APBC2008)
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2008-01-14
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [学会発表] A stand-alone application for users to perform normal mode analvses of proteinsusing data from ProMode2008

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Wako, Yuhki Tomizawa, Shigeru Endo
    • 学会等名
      Asia-Pacific Bioinformatics Conference
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2008-01-14
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] 基準振動解析における結合モードに基づくタンパク質複合体動的構造の分類2008

    • 著者名/発表者名
      猿渡茂、輪湖博
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡県福岡市
    • 年月日
      2008-12-03
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] ProModeデータを利用したタンパク質の基準振動解析プログラムの開発2007

    • 著者名/発表者名
      輪湖 博、富澤 裕樹、猿渡 茂
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [学会発表] 蛋白質2分子複合体の基準振動の包括的解析2007

    • 著者名/発表者名
      猿渡 茂、輪湖 博
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] ProModeユーザーのための基準振動解析プログラムの開発2007

    • 著者名/発表者名
      輪湖 博、富澤 裕樹、猿渡 茂
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2007-05-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [学会発表] ProModeを利用したタンパク質の基準振動解析プログラムの開発2007

    • 著者名/発表者名
      輪湖博、富澤裕樹、猿渡茂
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      神奈川県横浜市
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] Comprehensive Analyses of Normal Modes of Dimeric Protein Complexes2007

    • 著者名/発表者名
      S., Endo
    • 学会等名
      45th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      2007-12-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [学会発表] ProModeユーザーのための基準振動解析プログラムの開発2007

    • 著者名/発表者名
      輪湖博、富澤裕樹、猿渡茂
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      宮城県仙台市
    • 年月日
      2007-05-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] 立体構造不定領域のあるタンパク質の動的構造の解析とデータベースProModeヘの取りこみ2007

    • 著者名/発表者名
      猿渡 茂、輪湖 博
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2007-04-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [学会発表] 蛋白質2分子複合体の基準振動の包括的解析2007

    • 著者名/発表者名
      猿渡 茂、輪湖 博
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [学会発表] ProModeユーザーのための基準振動解析プログラムの開発2007

    • 著者名/発表者名
      輪湖 博、富澤 祐樹、猿渡 茂
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2007-05-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] 立体構造不定領域のあるタンパク質の動的構造の解析とデータベースProModeへの取りこみ2007

    • 著者名/発表者名
      猿渡 茂、輪湖 博
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2007-05-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [学会発表] 立体構造不定領域のあるタンパク質の動的構造の解析とデータベースProModeへの取り込み2007

    • 著者名/発表者名
      猿渡茂、輪湖博
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      宮城県仙台市
    • 年月日
      2007-05-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] 立体構造不定領域のあるタンパク質の動的構造の解析とデータベースProModeへの取り込み2007

    • 著者名/発表者名
      猿渡 茂、輪湖 博
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2007-05-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] 蛋白質2分子複合体の基準振動の包括的解析2007

    • 著者名/発表者名
      猿渡茂、輪湖博
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      神奈川県横浜市
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] Analysis of dynamic structures of proteins with missing residues and registration to the database ProMode2007

    • 著者名/発表者名
      S., Endo
    • 学会等名
      The 8th annual meeting of the protein society of Japan
    • 発表場所
      Sendai
    • 年月日
      2007-05-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [学会発表] ProModeデータを利用したタンパク質の基準振動解析プログラムの開発2007

    • 著者名/発表者名
      輪湖 博、富澤 祐樹、猿渡 茂
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] Normal Mode Analyses of multimeric proteins with symmetry in Dihedral Angle Space2006

    • 著者名/発表者名
      S., Endo
    • 学会等名
      EABS & BSJ 2006
    • 発表場所
      Okinawa
    • 年月日
      2006-11-13
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [学会発表] Dynamic structures of proteins characterized by networks formed by connecting positively correlated residues in normal mode vibrations2006

    • 著者名/発表者名
      輪湖博、猿渡茂
    • 学会等名
      日本生物物理学会第44回年会&Fifth East Asian Biopyhsics Symposium
    • 発表場所
      沖縄県那覇市
    • 年月日
      2006-11-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] Normal Mode Analyses of multimeric proteins with symmetry in Dihedral Angle Space2006

    • 著者名/発表者名
      S.Endo and H.Wsko
    • 学会等名
      5th East Asian Biophysics Symposium & 44th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan (EABS & BSJ 2006)
    • 発表場所
      Okinawa
    • 年月日
      2006-11-13
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [学会発表] Normal mode analyses of multimeric proteins with symmetry in dihedral angle space2006

    • 著者名/発表者名
      猿渡茂、輪湖博
    • 学会等名
      日本生物物理学会第44回年会&Fifth East Asian Biopyhsics Symposium
    • 発表場所
      沖縄県那覇市
    • 年月日
      2006-11-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] T4リゾチーム変異体における動的構造-活性相関2006

    • 著者名/発表者名
      猿渡 茂、柳田 直人、輪湖 博
    • 学会等名
      第6回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2006-04-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [学会発表] T4リゾチーム変異体における動的構造-活性相関2006

    • 著者名/発表者名
      猿渡茂、柳田直人、輪湖博
    • 学会等名
      第6回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      京都府京都市
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18500227
  • [学会発表] Dynamic structures of proteins characterized by networks formed by connecting positively correlated residues in normal mode vibrations2006

    • 著者名/発表者名
      H.Wako and S.Endo
    • 学会等名
      EABS & BSJ 2006
    • 発表場所
      Okinawa
    • 年月日
      2006-11-13
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [学会発表] Dynamics-Activity Relationship among T4 Lysozyme Mutants2006

    • 著者名/発表者名
      S., Endo
    • 学会等名
      The 7th annual meeting of the protein society of Japan
    • 発表場所
      Kyoto
    • 年月日
      2006-04-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [学会発表] 異種及び同種2量体タンパク質の基準振動解析2005

    • 著者名/発表者名
      猿渡 茂、輪湖 博
    • 学会等名
      第43回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2005-11-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [学会発表] 相同なタンパク質の動的構造I.ヒトリゾチームの動的構造に対するアミノ酸置換の影響2005

    • 著者名/発表者名
      猿渡 茂、輪湖 博
    • 学会等名
      第5回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2005-06-30
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [学会発表] 相同なタンパク質の動的構造II.スーパーファミリー内での比較2005

    • 著者名/発表者名
      輪湖 博、大塚 元央、富澤 裕樹、加藤 雅樹、猿渡 茂
    • 学会等名
      第5回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2005-06-30
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [学会発表] 基準振動解析による相同なタンパク質の動的構造の比較2005

    • 著者名/発表者名
      輪湖 博、大塚 元央、富澤 裕樹、加藤 雅樹、猿渡 茂
    • 学会等名
      第43回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2005-11-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [学会発表] Normal mode analyses of hetero and homo dimeric proteins2005

    • 著者名/発表者名
      S., Endo
    • 学会等名
      43th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      Sapporo
    • 年月日
      2005-11-23
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • [学会発表] Dynamic structures of homologous proteins I. The effects of amino acid substitution on the dynamic structures of human lysozyme2005

    • 著者名/発表者名
      S., Endo
    • 学会等名
      The 6th annual meeting of the protein society of Japan
    • 発表場所
      Fukuoka
    • 年月日
      2005-06-30
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17510169
  • 1.  輪湖 博 (60158607)
    共同の研究課題数: 4件
    共同の研究成果数: 41件

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