坂本尚昭 Sakamoto Naoaki

研究者番号	00332338
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 広島大学, 統合生命科学研究科(理), 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2019年度 – 2024年度: 広島大学, 統合生命科学研究科(理), 准教授 2017年度 – 2018年度: 広島大学, 理学研究科, 准教授 2016年度: 広島大学, 大学院理学研究科, 准教授 2013年度 – 2015年度: 広島大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 2007年度 – 2011年度: 広島大学, 大学院・理学研究科, 准教授 … もっと見る 2006年度: 広島大学, 大学院理学研究科, 助教授 2005年度: 広島大学, 大学院・理学研究科, 助教授 2002年度: 理研, 研究員隠す
審査区分/研究分野	研究代表者小区分43050:ゲノム生物学関連 / ゲノム生物学 / 遺伝・ゲノム動態 / 神経化学・神経薬理学研究代表者以外発生生物学 / 小区分42020:獣医学関連 / 小区分43050:ゲノム生物学関連 / 小区分43040:生物物理学関連 / システムゲノム科学
キーワード	研究代表者インスレーター / ゲノム / CRISPR-Cas9 / ゲノム編集 / 棘皮動物 / 発生 / 細胞核 / ライブイメージング / 核構造 / HP1 … もっと見る / Nucleolin / CenpA / 初期型ヒストン遺伝子 / ポリケチド合成酵素 / 核内構造 / ウニ / エンハンサー遮断活性 / ヌクレオソーム / 反復配列 / 非コードDNA / DNA構造 / DNA 構造 / クロマチン … もっと見る研究代表者以外イエネコ / ゲノム編集 / 発現制御 / ゲノム / 遺伝子 / 発生・分化 / NGS解析 / 疾患 / White locus / 数理モデル / ライブ観察 / 染色体動態 / DNA二本鎖切断修復 / 核小体 / X染色体対合形成 / CTCF / 核スペックル / ウニ / 遺伝子制御 / 核内構造体 / エピゲノム / ゲノム構造・動態 / 揺らぎ / エンハンサー遮断活性 / 弾性 / ねじれ / インスレーター / DNA / バイオテクノロジー / genome / regulation of expression / development / gene / 転写調節因子 / 発生分化 / ゆらぎ / 発生制御隠す

細胞実験と数理によるイエネコ白色遺伝子の機能及び疾患への影響の網羅的探索
- 研究代表者
  
  粟津暁紀
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分42020:獣医学関連
- 研究機関
  広島大学
棘皮動物におけるインスレーターを介したゲノムの組織化とその進化研究代表者
- 研究代表者
  
  坂本尚昭
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分43050:ゲノム生物学関連
- 研究機関
  広島大学
非コードDNAをコアとする核内構造体による転写制御のライブ観察駆動型数理研究
- 研究代表者
  
  粟津暁紀
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分43050:ゲノム生物学関連
- 研究機関
  広島大学
ゲノム編集を利用した非コードDNAによるインスレーター機能の解析研究代表者
- 研究代表者
  
  坂本尚昭
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分43050:ゲノム生物学関連
- 研究機関
  広島大学
1分子DNAのねじれ応答測定による弾性調節型インスレーター機能の検証
- 研究代表者
  
  村山能宏
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2020
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分43040:生物物理学関連
- 研究機関
  東京農工大学
初期胚の核構造変化と細胞分化におけるゲノム動態のイメージング解析研究代表者
- 研究代表者
  
  坂本尚昭
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2019
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  ゲノム生物学
- 研究機関
  広島大学
ゲノム編集を利用した遺伝子ノックイン新技術の開発
- 研究代表者
  
  山本卓
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  システムゲノム科学
- 研究機関
  広島大学
ゲノム機能の適正な発現を担うインスレーターと非コードDNAの物理的特性研究代表者
- 研究代表者
  
  坂本尚昭
- 研究期間 (年度)
  2013 – 2015
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  ゲノム生物学
- 研究機関
  広島大学
発生のロバストネス(頑強性)を支える細胞間相互作用の定量的解析
- 研究代表者
  
  山本卓
- 研究期間 (年度)
  2009 – 2011
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  発生生物学
- 研究機関
  広島大学
Arsインスレーター作用機構の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  坂本尚昭
- 研究期間 (年度)
  2007 – 2008
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  遺伝・ゲノム動態
- 研究機関
  広島大学
発生過程の特異的遺伝子発現を担う遺伝子ネットワークの解明
- 研究代表者
  
  山本卓
- 研究期間 (年度)
  2005 – 2007
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  発生生物学
- 研究機関
  広島大学
ポリグルタミン病モデル系のトランスクリプトーム解析研究代表者
- 研究代表者
  
  坂本尚昭
- 研究期間 (年度)
  2002
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  神経化学・神経薬理学
- 研究機関
  理化学研究所

[図書] Shall We 遺伝学2009
- 著者名/発表者名
  坂本尚昭
- 総ページ数
  182
- 出版者
  講談社サイエンティフィック
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570226
[図書] Shall We遺伝学2009
- 著者名/発表者名
  坂本尚昭
- 総ページ数
  182
- 出版者
  講談社サイエンティフィック
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570226
[図書] DNA Structure, Chromatin and Gene Expression2006
- 著者名/発表者名
  Sakamoto N. et al.
- 総ページ数
  252
- 出版者
  Transworld Research Network, India
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17570179
[図書] Gene Expression and Chromatin2006
- 著者名/発表者名
  Sakamoto, N.
- 出版者
  Involvement of nuclear matrix and chromatin loop formation in the functions of insulators
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17570179
[雑誌論文] Possibilities of skin coat color‐dependent risks and risk factors of squamous cell carcinoma and deafness of domestic cats inferred via RNA‐seq data2023
- 著者名/発表者名
  Awazu Akinori、Takemoto Daigo、Watanabe Kaichi、Sakamoto Naoaki
- 雑誌名
  
  Genes to Cells
  
  巻: 28 号: 12 ページ: 893-905
- DOI
  10.1111/gtc.13076
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K18234, KAKENHI-PROJECT-21K06124
[雑誌論文] The crucial role of CTCF in mitotic progression during early development of sea urchin2023
- 著者名/発表者名
  Watanabe Kaichi、Fujita Megumi、Okamoto Kazuko、Yoshioka Hajime、Moriwaki Miki、Tagashira Hideki、Awazu Akinori、Yamamoto Takashi、Sakamoto Naoaki
- 雑誌名
  
  Development, Growth and Differentiation
  
  巻: 65 号: 7 ページ: 395-407
- DOI
  10.1111/dgd.12875
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K18234, KAKENHI-PROJECT-21K06124
[雑誌論文] Partial exogastrulation due to apical-basal polarity of F‐actin distribution disruption in sea urchin embryo by omeprazole2022
- 著者名/発表者名
  Watanabe Kaichi、Yasui Yuhei、Kurose Yuta、Fujii Masashi、Yamamoto Takashi、Sakamoto Naoaki、Awazu Akinori
- 雑誌名
  
  Genes to Cells
  
  巻: - 号: 6 ページ: 1-17
- DOI
  10.1111/gtc.12934
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H03223, KAKENHI-PROJECT-21K06124, KAKENHI-PROJECT-21K18234, KAKENHI-PROJECT-19K20382, KAKENHI-PROJECT-20K06602
[雑誌論文] CRISPR-Cas9 editing of non-coding genomic loci as a means of controlling gene expression in the sea urchin.2021
- 著者名/発表者名
  Pieplow A, Dastaw M, Sakuma T, Sakamoto N, Yamamoto T, Yajima M, Oulhen N, Wessel GM
- 雑誌名
  
  Developmental Biology
  
  巻: 472 ページ: 85-97
- DOI
  10.1016/j.ydbio.2021.01.003
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06602, KAKENHI-PROJECT-18K06149, KAKENHI-PROJECT-19K16111
[雑誌論文] Recycling endosomes associate with Golgi stacks in sea urchin embryos.2020
- 著者名/発表者名
  Fujii S, Tago T, Sakamoto N, Yamamoto T, Satoh T, Satoh AK
- 雑誌名
  
  Communicative & Integrative Biology
  
  巻: 13(1) 号: 1 ページ: 59-62
- DOI
  10.1080/19420889.2020.1761069
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06602, KAKENHI-PROJECT-18K06149, KAKENHI-PROJECT-19K06663
[雑誌論文] Insulator Activities of Nucleosome-Excluding DNA Sequences without Bound Chromatin Looping Proteins2019
- 著者名/発表者名
  Matsushima Yuki、Sakamoto Naoaki、Awazu Akinori
- 雑誌名
  
  The Journal of Physical Chemistry B
  
  巻: 123 号: 5 ページ: 1035-1043
- DOI
  10.1021/acs.jpcb.8b10518
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17KT0024, KAKENHI-PROJECT-17K05614, KAKENHI-PROJECT-17K07241, KAKENHI-PROJECT-18K06149
[雑誌論文] Establishment of knockout adult sea urchins by using a CRISPR‐Cas9 system2019
- 著者名/発表者名
  Daming Liu, Akinori Awazu, Tetsushi Sakuma, Takashi Yamamoto, Naoaki Sakamoto
- 雑誌名
  
  Development Growth and Regeneration
  
  巻: 61 号: 6 ページ: 378-388
- DOI
  10.1111/dgd.12624
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17KT0024, KAKENHI-PROJECT-19K16111, KAKENHI-PROJECT-16H04035, KAKENHI-PROJECT-17K05614, KAKENHI-PROJECT-17K07241
[雑誌論文] Biased genome editing using the local accumulation of DSB repair molecules system.2018
- 著者名/発表者名
  Nakade S, Mochida K, Kunii A, Nakamae K, Aida T, Tanaka K, Sakamoto N, Sakuma T, Yamamoto T
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 9(1) 号: 1 ページ: 3270-3270
- DOI
  10.1038/s41467-018-05773-6
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07241, KAKENHI-PROJECT-18K19494, KAKENHI-PROJECT-17H01409, KAKENHI-PROJECT-17H02216, KAKENHI-PROJECT-16K07085, KAKENHI-PROJECT-17K15045
[雑誌論文] Dynamic changes in the interchromosomal interaction of early histone gene loci during development of sea urchin2017
- 著者名/発表者名
  Matsushita Masaya、Ochiai Hiroshi、Suzuki Ken-ichi T.、Hayashi Sayaka、Yamamoto Takashi、Awazu Akinori、Sakamoto Naoaki
- 雑誌名
  
  Journal of Cell Science
  
  巻: 130 号: 24 ページ: 4097-4107
- DOI
  10.1242/jcs.206862
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17KT0024, KAKENHI-PROJECT-17K05614, KAKENHI-PROJECT-17K07241
[雑誌論文] Simple Elastic Network Models for Exhaustive Analysis of Long Double-Stranded DNA Dynamics with Sequence Geometry Dependence2015
- 著者名/発表者名
  Shuhei Isami, Naoaki Sakamoto, Hiraku Nishimori, and Akinori Awazu
- 雑誌名
  
  PLoS One
  
  巻: 10 号: 12 ページ: 143760-143760
- DOI
  10.1371/journal.pone.0143760
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26610117, KAKENHI-PUBLICLY-26120525, KAKENHI-PROJECT-25430169
[雑誌論文] Microhomology-mediated end-joining-dependent integration of donor DNA in cells and animals using TALENs and CRISPR/Cas92014
- 著者名/発表者名
  S. Nakade, T. Tsubota, Y. Sakane, S. Kume, N. Sakamoto, M. Obara, T. Daimon, H. Sezutsu, T. Yamamoto, T. Sakuma and K. T. Suzuki
- 雑誌名
  
  Nat Commun
  
  巻: 5 号: 1 ページ: 5560-5560
- DOI
  10.1038/ncomms6560
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-22124001, KAKENHI-PROJECT-23688008, KAKENHI-PUBLICLY-25124708, KAKENHI-PROJECT-25292202, KAKENHI-PROJECT-25890014, KAKENHI-PROJECT-26290070
[雑誌論文] Nucleosome exclusion from the interspecies conserved central AT-rich region of the Arsinsulater2012
- 著者名/発表者名
  Takagi H, Inai Watanabe SI, Tatemoto S, Yajima M, Akasaka K, Yamamoto T, SakamotoN
- 雑誌名
  
  J. Biochem
  
  巻: 151(1) ページ: 78-87
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570226
[雑誌論文] HpSumf1 is involved in the activation of sulafatases responsible for regulation of skeletogenesisduring sea urchin development2011
- 著者名/発表者名
  Sakuma T, Ohnishi K, Fujita K, Ochia H, Sakamoto N, Yamamoto T.
- 雑誌名
  
  Development Genes and Evolution
  
  巻: 221(3) ページ: 157-166
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570226
[雑誌論文] Dicer is required for the normalde velopment of sea urchin2010
- 著者名/発表者名
  Okamitsu Y, Yamamoto T, Fujii T, Ochiai H, Sakamoto N
- 雑誌名
  
  Hemicentrotus pulcherrimus. Zoological Science
  
  巻: 27 ページ: 477-486
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570226
[雑誌論文] Targeted mutagenesis in the sea urchin embryo usingzinc-finger nucleases2010
- 著者名/発表者名
  Ochiai H, Fujita K, Suzuki K, Nishikawa M, Shibata T, Sakamoto N, Yamamoto T.
- 雑誌名
  
  Genes to Cells
  
  巻: 15 ページ: 875-885
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570226
[雑誌論文] Implication of HpEts in gene regulatory networks responsible for specification of seaurchin sleletogenic primary me senchyme cells2010
- 著者名/発表者名
  Yajima M, Umeda R, Fuchikami T, Kataoka M, Sakamoto N, Yamamoto T, Akasaka K.
- 雑誌名
  
  Zoological Science
  
  巻: 27 ページ: 638-646
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570226
[雑誌論文] Mammalian arylsulfatase A functions as a novel component of the extracellular matrix2010
- 著者名/発表者名
  Fujita K, Teramura N, Hattori S, Irie S, Mitsunaga-Nakatsubo K, Akimoto Y, SakamotoN, Yamamoto T, Akasaka K.
- 雑誌名
  
  Connective Tissue Research
  
  巻: 51 ページ: 388-396
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570226
[雑誌論文] HpSulf, a heparin sulfate 6-O-endosulfatase, is involved in the regulation of VEGF signaling during seaurchin development2009
- 著者名/発表者名
  Fujita K, Takechi E, Sakamoto N, SumiyoshiN, Izumi S, Miyamoto T, Matsuura S, Tsurugaya T, Akasaka K, Yamamoto T.
- 雑誌名
  
  Mechanisms of Development
  
  巻: 127 ページ: 235-245
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570226
[雑誌論文] Role of the nanos homolog during sea urchin development2009
- 著者名/発表者名
  Fujii T, Sakamoto N, Ochiai H, Fujita K, Okamitsu Y, Sumiyoshi N, Minokawa T, Yamamoto T.
- 雑誌名
  
  Developmental Dynamics
  
  巻: 238 ページ: 2511-2521
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570226
[雑誌論文] Suppressor of hairless(Su(H)) is required for foregut development in the sea urchin embryo2009
- 著者名/発表者名
  Karasawa K, Sakamoto N, Fujita K, Ochiai H, Fujii T, Akasaka K, Yamamoto T.
- 雑誌名
  
  Zoological Science
  
  巻: 26 ページ: 686-690
- NAID
  40016807049
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570226
[雑誌論文] Analysis of cis-regulatory elements controlling spatio-temporal expression of T-brain gene in sea urchin, Hemicentrotus pulcherrimus.2008
- 著者名/発表者名
  Ochiai, H., Sakamoto, N., Momiyama, A., Akasaka, K., and Yamamoto T.
- 雑誌名
  
  Mechamism of Development Vol. 125
  
  ページ: 2-17
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770005
[雑誌論文] The Ars insulator facilitates I-SceI meganuclease-mediated transgenesis in the sea urchin embryo.2008
- 著者名/発表者名
  Ochiai, H., Sakamoto, N., Suzuki, K., Akasaka, K., and Yamamoto T.
- 雑誌名
  
  Developmental Dynamics Vol. 237
  
  ページ: 2475-2482
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770005
[雑誌論文] DNA variations within the sea urchin Otx gene enhancer.2007
- 著者名/発表者名
  Yamamoto, T., Kawamoto, R., Fujii, T., Sakamoto, N., and Shibata T.
- 雑誌名
  
  FEBS Letters Vol. 581
  
  ページ: 5234-5240
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770005
[産業財産権] 新規DNA結合ドメインおよびそれを含む新規DNA切断酵素2011
- 発明者名
  山本卓・坂本尚昭・佐久間哲史・野地澄晴
- 権利者名
  広島大学
- 産業財産権番号
  2011-242250
- 出願年月日
  2011-11-04
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570226
[学会発表] ウニのCTCFは初期発生において分裂期の進行に必須である2023
- 著者名/発表者名
  坂本尚昭, 渡辺開智, 藤田恵, 岡本和子, 吉岡一, 森脇三貴, 田頭英樹, 粟津暁紀, 山本卓,
- 学会等名
  日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06124
[学会発表] 培養細胞を用いた白いネコ特有のゲノムと疾患の解析2023
- 著者名/発表者名
  渡邊開智, 竹本大悟, 坂本尚昭, 粟津暁紀
- 学会等名
  日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06124
[学会発表] ウニFLVCR遺伝子機能解析とFLVCR遺伝子ノックアウト胚の表現型観察2023
- 著者名/発表者名
  竹本大悟, 三澤祐太朗, 渡辺開智, 坂本尚昭, 粟津暁紀
- 学会等名
  日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06124
[学会発表] Exogastrulation due to cytoskeletal polarity distribution in sea urchin embryo2022
- 著者名/発表者名
  Kaichi Watanabe, Yuhei Yasui, Yuta Kurose, Naoaki Sakamoto, Akinori Awazu
- 学会等名
  The 60th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06124
[学会発表] ムラサキウニにおけるCRISPR/Cas9システムを用いたゲノム編集2022
- 著者名/発表者名
  坂本尚昭, 渡辺開智, 粟津暁紀, 山本卓
- 学会等名
  日本ゲノム編集学第7回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06602
[学会発表] ウニ胚形態形成の細胞骨格観察に基づくモデル化2021
- 著者名/発表者名
  渡辺開智, 安井優平, 黒瀬友太, 坂本尚昭, 粟津暁紀
- 学会等名
  日本動物学会第92回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06602
[学会発表] エンハンサー・プロモーター間のDNA特性による転写活性化への影響2021
- 著者名/発表者名
  中川春風, 高木春奈, 立本小百合, 粟津暁紀, 山本卓, 坂本尚昭
- 学会等名
  日本動物学会第92回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06602
[学会発表] MaChIAto：CRISPRによるゲノム編集結果と標的のゲノム特性との関連性プロファイリングツール2020
- 著者名/発表者名
  中前和恭、武永充正、中出翔太、名塚一郎、粟津暁紀、坂本尚昭、佐久間哲史、山本卓
- 学会等名
  第43回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06602
[学会発表] ウニ胚形態形成の細胞骨格観察に基づくモデル化2020
- 著者名/発表者名
  渡辺開智, 黒瀬友太, 安井優平, 坂本尚昭, 粟津暁紀
- 学会等名
  日本動物学会第91回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06602
[学会発表] ウニの発生初期における核内染色体構造の動的および細胞特異的変化2020
- 著者名/発表者名
  安井優平, 杉山文香, 坂本尚昭, 粟津暁紀
- 学会等名
  第58回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06602
[学会発表] ウニ胚形態形成の細胞骨格観察に基づくモデル化2020
- 著者名/発表者名
  渡辺開智, 黒瀬友太, 安井優平, 坂本尚昭, 粟津暁紀
- 学会等名
  第58回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06602
[学会発表] ウニの発生初期における核内染色体構造の動的および細胞特異的変化2020
- 著者名/発表者名
  安井優平, 杉山文香, 坂本尚昭, 粟津暁紀
- 学会等名
  日本動物学会第91回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06602
[学会発表] ウニ初期胚の核及び核内動態の蛍光イメージング観察・解析2020
- 著者名/発表者名
  今田実子, 杉山文香, 林紗弥香, 渡邊開智, 安井優平, 坂本尚昭, 粟津暁紀
- 学会等名
  第58回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06602
[学会発表] Extended analysis of amplicon sequencing data with MaChIAto for Prime Editing2020
- 著者名/発表者名
  Nakamae K, Takenaga M, Nakade S, Nazuka I, Awazu A, Sakamoto N, Sakuma T, Yamamoto T
- 学会等名
  CSHL meeting - Genome Engineering: CRISPR Frontiers
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06602
[学会発表] MaChIAto: detailed profiling tool for various genomic features affecting the efficacy of gene knockout, homology-based knock-in, and Prime Editing2020
- 著者名/発表者名
  Sakura T, Nakamae K, Takenaga M, Nakade S, Mitsuhashi T, Nazuka I, Awazu A, Sakamoto N, Yamamoto T
- 学会等名
  CRISPR and Beyond
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06602
[学会発表] ArsInsC配列及びDNA反復配列の物理的特性・機能性解析2020
- 著者名/発表者名
  小田竜平, 藤井雅史, 坂本尚昭, 粟津暁紀
- 学会等名
  第58回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06602
[学会発表] Establishment of knockout adult sea urchin by using CRISPR-Cas9 system2019
- 著者名/発表者名
  Liu D, Awazu A, Sakuma T, Yamamoto T, Sakamoto N
- 学会等名
  日本ゲノム編集学会第4 回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07241
[学会発表] ヌクレオソーム排他的領域のインスレーター機能の解析2018
- 著者名/発表者名
  松島佑樹, 西森拓, 坂本尚昭, 粟津暁紀
- 学会等名
  第56会生物物理学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06149
[学会発表] Dynamic changes in the interchromosomal interaction of early histone gene loci during development of sea urchin2018
- 著者名/発表者名
  松下将也, 落合博, 鈴木賢一, 林紗弥香, 杉山文香, 山本卓, 粟津暁紀, 坂本尚昭
- 学会等名
  第56会生物物理学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06149
[学会発表] CRISPR/Cas9システムを用いたバフンウニにおけるゲノム編集2018
- 著者名/発表者名
  Liu Daming, 粟津暁紀, 佐久間哲史, 山本卓, 坂本尚昭
- 学会等名
  第41回日本分子生物学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07241
[学会発表] バフンウニ初期発生における初期型ヒストン遺伝子動態の解析2016
- 著者名/発表者名
  松下将也, 落合博, 山本卓, 粟津暁紀, 坂本尚昭
- 学会等名
  第33回染色体ワークショップ・第14回核ダイナミクス研究会合同開催
- 発表場所
  松島一の坊（宮城）
- 年月日
  2016-01-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430169
[学会発表] 粗視化モデルを用いたDNAの塩基配列の特性と塩基配列に依存した構造・運動・機能・の関係の解析2016
- 著者名/発表者名
  亀田健, 勇修平, 池谷淳, 西森拓, 坂本尚昭, 粟津暁紀
- 学会等名
  第33回染色体ワークショップ・第14回核ダイナミクス研究会合同開催
- 発表場所
  松島一の坊（宮城）
- 年月日
  2016-01-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430169
[学会発表] Simple elastic network models for exhoustive analysis of long double-stranded DNA dynamics with sequence geometry dependence.2016
- 著者名/発表者名
  Shuhei Isami, Naoaki Sakamoto, Hiraku Nishimori, Akinori Awazu
- 学会等名
  The 7th Taiwan-Japan Joint Workshop for Young Scholar in Applied Mathematics
- 発表場所
  National Cheng Kung Univ. (Taiwan)
- 年月日
  2016-02-27
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430169
[学会発表] Arsインスレーターにおける作用メカニズムの解析2016
- 著者名/発表者名
  池谷淳, 亀田健, 勇修平, 山本卓, 粟津暁紀, 坂本尚昭
- 学会等名
  第33回染色体ワークショップ・第14回核ダイナミクス研究会合同開催
- 発表場所
  松島一の坊（宮城）
- 年月日
  2016-01-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430169
[学会発表] 弾性ネットワークモデルによるDNA配列依存的な力学特性と機能の関係の網羅的解析2016
- 著者名/発表者名
  勇修平, 西森拓, 坂本尚昭, 粟津暁紀
- 学会等名
  第33回染色体ワークショップ・第14回核ダイナミクス研究会合同開催
- 発表場所
  松島一の坊（宮城）
- 年月日
  2016-01-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430169
[学会発表] 弾性ネットワークモデルを用いたゲノムの動態と機能の解析2016
- 著者名/発表者名
  亀田健, 勇修平, 西森拓, 坂本尚昭, 粟津暁紀
- 学会等名
  日本物理学会年会
- 発表場所
  東北大学
- 年月日
  2016-03-19
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430169
[学会発表] Analysis of the relationship among sequences, structures, motions and the functions of DNA by elastic network models.2015
- 著者名/発表者名
  Shuhei Isami, Sayuri Tatemoto, Atsushi Ikegaya, Hiraku Nishimori, Naoaki Sakamoto, Akinori Awazu
- 学会等名
  日本生物物理学会年会
- 発表場所
  金沢大学
- 年月日
  2015-09-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430169
[学会発表] Simple elastic network models for exhoustive analysis of long double-stranded DNA dynamics with sequence geometry dependence.2015
- 著者名/発表者名
  Shuhei Isami, Atsushi Ikegaya, Naoaki Sakamoto, Hiraku Nishimori, Akinori Awazu
- 学会等名
  4th International Symposium of the Mathematics on Chromatin Live Dynamics
- 発表場所
  JMS Aster PLAZA. (Hiroshima)
- 年月日
  2015-12-07
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430169
[学会発表] バフンウニCTCFホモログ(HpCTCF)のArsインスレーター結合能および機能の解析2011
- 著者名/発表者名
  坂本尚昭
- 学会等名
  第34回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  横浜
- 年月日
  2011-12-15
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570226
[学会発表] Arsインスレーター機能の分子メカニズムの解析2007
- 著者名/発表者名
  坂本尚昭
- 学会等名
  第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
- 発表場所
  パシフィコ横浜
- 年月日
  2007-12-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770005
[学会発表] Ars インスレーター機能の分子メカニズムの解析2007
- 著者名/発表者名
  坂本尚昭
- 学会等名
  第30回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  横浜
- 年月日
  2007-12-15
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17570179
[学会発表] Study on the functional mechanism of Ars insulator2007
- 著者名/発表者名
  Sakamoto, N
- 学会等名
  30st annual meeting for molecular biology society of Japan
- 発表場所
  Yokohama
- 年月日
  2007-12-12
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17570179
[学会発表] Arsインスレーター機能の分子メカニズムの解析2007
- 著者名/発表者名
  坂本尚昭
- 学会等名
  第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
- 発表場所
  パシフィコ横浜
- 年月日
  2007-12-15
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770005
[学会発表] Arsインスレーター機能の分子メカニズムの解析2007
- 著者名/発表者名
  坂本尚昭
- 学会等名
  第30回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  横浜
- 年月日
  2007-12-12
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17570179
[学会発表] Analysis of dynamic characteristics of Ars-insulator by coarse-grained models
- 著者名/発表者名
  Shuhei Isami, Sayuri Tatemoto, Hiraku Nishimori, Naoaki Sakamoto, Akinori Awazu
- 学会等名
  第52回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター（北海道）
- 年月日
  2014-09-25 – 2014-09-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430169
[学会発表] 分子動力学法を用いたDNAの塩基配列に依存した力学的特性の考察
- 著者名/発表者名
  勇修平, 立本小百合, 西森拓, 坂本尚昭, 粟津暁紀
- 学会等名
  日本生物物理学会第6回中国四国支部大会
- 発表場所
  とりぎん文化会館（鳥取）
- 年月日
  2014-05-17 – 2014-05-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430169
[学会発表] DNAの粗視化モデルによるArsインスレーターの運動性と機能性の解析
- 著者名/発表者名
  山本佳典, 立本小百合, 坂本尚昭, 粟津暁紀
- 学会等名
  第51回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  国立京都国際会館
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430169
[学会発表] 弾性ネットワークモデルによるDNAの配列・構造・運動と機能の関係の考察
- 著者名/発表者名
  勇修平, 立本小百合, 池谷淳, 西森拓, 坂本尚昭, 粟津暁紀
- 学会等名
  生命動態の分子メカニズムと数理
- 発表場所
  京都大（京都）
- 年月日
  2015-03-16 – 2015-03-17
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430169
[学会発表] MMEJ-mediated integration of donor DNA in cells and animals using TALENs and CRISPR/Cas9
- 著者名/発表者名
  Nakade S, Tsubota T, Sakane Y, Kume S, Sakamoto N, Obara M, Daimon T, Sezutsu H, Yamamoto T, Sakuma T and Suzuki KI
- 学会等名
  Keystone Sympsia
- 発表場所
  Big Sky, MT, USA
- 年月日
  2015-01-11 – 2015-01-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26290070
[学会発表] 粗視化モデルを用いたArsインスレーターの力学的特性の考察
- 著者名/発表者名
  勇修平, 立本小百合, 西森拓, 坂本尚昭, 粟津暁紀
- 学会等名
  日本物理学会2014年秋季大会
- 発表場所
  中部大（愛知）
- 年月日
  2014-09-07 – 2014-09-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430169
[学会発表] DNAの粗視化モデルによるArsインスレーターの力学的特性の考察
- 著者名/発表者名
  勇修平, 立本小百合, 池谷淳, 坂本尚昭, 西森拓, 粟津暁紀
- 学会等名
  第32回染色体ワークショップ・第13回核ダイナミクス研究会
- 発表場所
  安芸グランドホテル（広島）
- 年月日
  2014-12-15 – 2014-12-17
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430169
[学会発表] DNAの配列・構造・運動と機能の関係の考察
- 著者名/発表者名
  勇修平, 立本小百合, 池谷淳, 西森拓, 坂本尚昭, 粟津暁紀
- 学会等名
  日本物理学会第70回年次大会
- 発表場所
  早稲田大（東京）
- 年月日
  2015-03-21 – 2015-03-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430169
[学会発表] DNAの粗視化モデルによるArsインスレーターの運動性と機能性の解析
- 著者名/発表者名
  山本佳典, 立本小百合, 西森拓, 坂本尚昭, 粟津暁紀
- 学会等名
  日本物理学会 2013年秋季大会
- 発表場所
  徳島大学常三島キャンパス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430169
[学会発表] Analysis of dynamic characteristics of Ars-insulator by coarse-grained DNA models
- 著者名/発表者名
  Shuhei Isami, Sayuri Tatemoto, Atsushi Ikegaya, Naoaki Sakamoto, Hiraku Nishimori, Akinori Awazu
- 学会等名
  The 4D Nucleome 2014
- 発表場所
  安芸グランドホテル（広島）
- 年月日
  2014-12-17 – 2014-12-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430169

1. 粟津暁紀 (00448234)

共同の研究課題数: 5件

共同の研究成果数: 24件
2. 山本卓 (90244102)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 10件
3. 柴田達夫 (10359888)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 1件
4. 相田知海 (50540481)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 鈴木賢一 (90363043)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
6. 村山能宏 (60334249)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 谷口俊介 (00505331)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 上野勝 (90293597)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 下出紗弓 (90772103)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 秋野順治

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
11. 林文夫

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
12. 西森拓

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

坂本 尚昭 Sakamoto Naoaki

研究課題

研究成果

共同研究者

細胞実験と数理によるイエネコ白色遺伝子の機能及び疾患への影響の網羅的探索

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

棘皮動物におけるインスレーターを介したゲノムの組織化とその進化研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

非コードDNAをコアとする核内構造体による転写制御のライブ観察駆動型数理研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

ゲノム編集を利用した非コードDNAによるインスレーター機能の解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

1分子DNAのねじれ応答測定による弾性調節型インスレーター機能の検証

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

初期胚の核構造変化と細胞分化におけるゲノム動態のイメージング解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ゲノム編集を利用した遺伝子ノックイン新技術の開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ゲノム機能の適正な発現を担うインスレーターと非コードDNAの物理的特性研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

発生のロバストネス(頑強性)を支える細胞間相互作用の定量的解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

Arsインスレーター作用機構の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

発生過程の特異的遺伝子発現を担う遺伝子ネットワークの解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ポリグルタミン病モデル系のトランスクリプトーム解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[図書] Shall We 遺伝学2009

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

坂本尚昭 Sakamoto Naoaki