上村想太郎 Uemura Sotaro

研究者番号	00447442
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2020年度 – 2023年度: 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 2007年度 – 2008年度: 東京大学, 大学院・薬学系研究科, 助教
審査区分/研究分野	研究代表者生物系 / 中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野研究代表者以外中区分27:化学工学およびその関連分野
キーワード	研究代表者リボソーム / タンパク質翻訳 / GFP / 1分子計測 / 蛍光イメージング / ZMW法 / 膜タンパク質 / １分子 / 脂質膜 / ナノポア … もっと見る / 機械学習 / ペプチド / ナノポア計測 / １分子計測 … もっと見る研究代表者以外微生物 / イメージング / 遺伝学 / 発酵 / 酵母 / 細胞分取 / 指向性進化法隠す

リボソーム融合型ナノポア技術による１分子タンパク質網羅定量解析研究代表者
- 研究代表者
  
  上村想太郎
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2023
- 研究種目
  
  挑戦的研究(開拓)
- 審査区分
  
  中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
- 研究機関
  東京大学
インテリジェント指向性進化法の創出と酵母への展開
- 研究代表者
  
  合田圭介
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 審査区分
  
  中区分27:化学工学およびその関連分野
- 研究機関
  東京大学
リボソームのタンパク質合成メカニズムの1分子機能解析研究代表者
- 研究代表者
  
  上村想太郎
- 研究期間 (年度)
  2007 – 2008
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  東京大学
光ピンセット法によるタンパク質翻訳機構の1分子操作研究代表者
- 研究代表者
  
  上村想太郎
- 研究期間 (年度)
  2007 – 2008
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  東京大学

すべて 2023 2022 2021 2020 2009 2008 2007

すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] 最新分子マシン2008
- 著者名/発表者名
  上村想太郎
- 総ページ数
  145
- 出版者
  化学同人編集部編
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19042003
[図書] 最新分子マシン2008
- 著者名/発表者名
  上村想太郎
- 総ページ数
  145
- 出版者
  化学同人編集部編
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19037009
[雑誌論文] Comprehensive quantitative analysis of single-molecule proteins using ribosome fusion nanopore technology2023
- 著者名/発表者名
  Uemura Sotaro
- 雑誌名
  
  Impact
  
  巻: 2023 号: 2 ページ: 50-52
- DOI
  10.21820/23987073.2023.2.50
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K18232
[雑誌論文] Accumulation of TERT in mitochondria shows two opposing effects on apoptosis2023
- 著者名/発表者名
  Hiroshi Ebata, Tomohiro Shima, Ryo Iizuka, Sotaro Uemura
- 雑誌名
  
  FEBS Open Bio
  
  巻: 13 号: 9 ページ: 1667-1682
- DOI
  10.1002/2211-5463.13682
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K05310, KAKENHI-PROJECT-21K18232
[雑誌論文] Time-dependent cell-state selection identifies transiently expressed genes regulating ILC2 activation2023
- 著者名/発表者名
  Tanaka Yumiko、Yamagishi Mai、Motomura Yasutaka、Kamatani Takashi、Oguchi Yusuke、Suzuki Nobutake、Kiniwa Tsuyoshi、Kabata Hiroki、Irie Misato、Tsunoda Tatsuhiko、Miya Fuyuki、Goda Keisuke、Ohara Osamu、Funatsu Takashi、Fukunaga Koichi、Moro Kazuyo、Uemura Sotaro、Shirasaki Yoshitaka
- 雑誌名
  
  Communications Biology
  
  巻: 6 号: 1 ページ: 915-915
- DOI
  10.1038/s42003-023-05297-w
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K18232, KAKENHI-PROJECT-21H02750, KAKENHI-PROJECT-23K24342
[雑誌論文] Upregulation of IL-4 receptor signaling pathway in circulating ILC2s from asthma patients2022
- 著者名/発表者名
  Baba Rie、Kabata Hiroki、Shirasaki Yoshitaka、Kamatani Takashi、Yamagishi Mai、Irie Misato、Watanabe Risa、Matsusaka Masako、Masaki Katsunori、Miyata Jun、Moro Kazuyo、Uemura Sotaro、Fukunaga Koichi
- 雑誌名
  
  Journal of Allergy and Clinical Immunology: Global
  
  巻: 1 号: 4 ページ: 299-304
- DOI
  10.1016/j.jacig.2022.07.007
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K08240, KAKENHI-PROJECT-21K18232, KAKENHI-PROJECT-23K24342
[雑誌論文] Whole-embryonic identification of maternal microchimeric cell types in mouse using single-cell RNA sequencing2022
- 著者名/発表者名
  Fujimoto Kana、Nakajima Akira、Hori Shohei、Tanaka Yumiko、Shirasaki Yoshitaka、Uemura Sotaro、Irie Naoki
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 12 号: 1 ページ: 18313-18313
- DOI
  10.1038/s41598-022-20781-9
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K18232, KAKENHI-PROJECT-21K19254, KAKENHI-PROJECT-22K19422, KAKENHI-PLANNED-22H05191, KAKENHI-PROJECT-21H04801
[雑誌論文] Zero-mode waveguides and nanopore-based sequencing technologies accelerate single-molecule studies2022
- 著者名/発表者名
  Ryo Iizuka, Hirohito Yamazaki, Sotaro Uemura
- 雑誌名
  
  Biophysics and Physicobiology
  
  巻: 19 号: 0 ページ: n/a
- DOI
  10.2142/biophysico.bppb-v19.0032
- ISSN
  2189-4779
- 言語
  英語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K05310, KAKENHI-PROJECT-21K18232
[雑誌論文] レーザートラップや蛍光を用いた1分子計測のタンパク質翻訳機構への応用2009
- 著者名/発表者名
  上村想太郎
- 雑誌名
  
  BIO INDUSTRY 26
  
  ページ: 15-20
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19037009
[雑誌論文] レーザートラップや蛍光を用いた1分子計測のタンパク質翻訳機構への応用2009
- 著者名/発表者名
  上村想太郎
- 雑誌名
  
  BIO INDUSTRY 26
  
  ページ: 15-20
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19042003
[雑誌論文] Single molecule force measurement for protein synthesis on the ribosome2008
- 著者名/発表者名
  S. Uemura
- 雑誌名
  
  World Scientific
  
  ページ: 21-36
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19037009
[雑誌論文] Single molecule force measurement for protein synthesis on the ribosome2008
- 著者名/発表者名
  S. Uemura
- 雑誌名
  
  World Scientific
  
  ページ: 21-36
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19042003
[雑誌論文] Single molecule imaging of full protein synthesis by immobilized ribosomes2008
- 著者名/発表者名
  S. Uemura., R. lizuka., T. Ueno., Y. Shimizu., H. Taguchi., T. Ueda., J. D. Puglisi and T. Funatsu
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research 36
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19042003
[雑誌論文] タンパク質の翻訳と折りたたみ過程の1分子蛍光イメージング2008
- 著者名/発表者名
  上村想太郎、船津高志
- 雑誌名
  
  ぶんせき 11
  
  ページ: 582-586
- NAID
  10025215299
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19037009
[雑誌論文] Single molecule imaging of full protein synthesis by immobilized ribosomes2008
- 著者名/発表者名
  S. Uemura., R. lizuka., T. Ueno., Y. Shimizu., H. Taguchi., T. Ueda., J. D. Puglisi and T. Funatsu
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research 36
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19037009
[雑誌論文] タンパク質の翻訳と折りたたみ過程の1分子蛍光イメージング2008
- 著者名/発表者名
  上村想太郎、船津高志
- 雑誌名
  
  ぶんせき 11
  
  ページ: 582-586
- NAID
  10025215299
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19042003
[雑誌論文] リボソームによるタンパク質合成の1分子力学測定による研究2007
- 著者名/発表者名
  上村想太郎
- 雑誌名
  
  Dojin News 124
  
  ページ: 1-5
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19037009
[雑誌論文] リボソームによるタンパク質合成の1分子力学測定による研究2007
- 著者名/発表者名
  上村想太郎
- 雑誌名
  
  Dojin News 124
  
  ページ: 1-5
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19042003
[学会発表] A study on the structural dynamics of the nucleosome containing H2A.B using solid-state nanopores2022
- 著者名/発表者名
  Hikaru Nozawa, Hirohito Yamazaki, Ryo Iizuka, Rina Hirano, Tomoya Kujirai, Hitoshi Kurumizaka, Sotaro Uemura
- 学会等名
  第60回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K18232
[学会発表] ナノポア計測によるCALHM2チャネルダイナミクスの解明2022
- 著者名/発表者名
  中村宗太郎、山崎洋人、志甫谷渉、濡木理、上村想太郎
- 学会等名
  第60回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00317
[学会発表] A study on the structural dynamics of the nucleosome containing H2A.B using solid-state nanopores2022
- 著者名/発表者名
  Hikaru Nozawa, Hirohito Yamazaki, Ryo Iizuka, Rina Hirano, Tomoya Kujirai, Hitoshi Kurumizaka, Sotaro Uemura
- 学会等名
  第60回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00317
[学会発表] Feasibility study of the method for obtaining fluorogenic RNA aptamers using water-in-oil microdroplets2022
- 著者名/発表者名
  Keisuke Ito, Ryo Iizuka, Sotaro Uemura
- 学会等名
  第60回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00317
[学会発表] ナノポア計測によるCALHM2チャネルダイナミクスの解明2022
- 著者名/発表者名
  中村宗太郎、山崎洋人、志甫谷渉、濡木理、上村想太郎
- 学会等名
  第60回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K18232
[学会発表] Investigation of the effect of spherical (three-dimensional) confinement on the higher order structure of 12-mer nucleosome arrays2022
- 著者名/発表者名
  Masahiro Okabe, Ryo Iizuka, Munetaka Akatsu, Kenta Echigoya, Tomoya Kujirai, Hitoshi Kurumizaka, Sotaro Uemura
- 学会等名
  第60回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00317
[学会発表] Development of a single-particle inclusions detection method by solid-state nanopore for miRNA in single exosome detection2022
- 著者名/発表者名
  Takumi Uchida, Hirohito Yamazaki, Ryo Iizuka, Sotaro Uemura
- 学会等名
  第60回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K18232
[学会発表] ショウジョウバエアルゴノート 2 の N 末端領域はアミロイド様凝集体を形成する（N-terminal region of Drosophila Argonaute2 can form amyloid-like aggregates）2022
- 著者名/発表者名
  成田晴香、島知弘、飯塚怜、塩見美喜子、上村想太郎
- 学会等名
  第21回東京大学生命科学シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00317
[学会発表] Development of a single-particle inclusions detection method by solid-state nanopore for miRNA in single exosome detection2022
- 著者名/発表者名
  Takumi Uchida, Hirohito Yamazaki, Ryo Iizuka, Sotaro Uemura
- 学会等名
  第60回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00317
[学会発表] Mitochondrial Translocation of Telomerase Reverse Transcriptase Changes Cell Death Process2021
- 著者名/発表者名
  Hiroshi Ebata, Tomohiro Shima, Yoshitaka Shirasaki, Sotaro Uemura
- 学会等名
  Cell Bio Virtual 2021
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00317
[学会発表] CALHM2をナノポアとして用いた多様なサイズの分子検出法の開発2021
- 著者名/発表者名
  中村宗太郎、山崎洋人、志甫谷渉、濡木理、上村想太郎
- 学会等名
  第59回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K18232
[学会発表] テロメラーゼ逆転写酵素TERTのミトコンドリア輸送の細胞死制御2021
- 著者名/発表者名
  江端拓志, 島知弘, 白崎善隆, 上村想太郎
- 学会等名
  第44回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00317
[学会発表] Photothermally enhanced single molecule nanopore sensing2021
- 著者名/発表者名
  Hirohito Yamazaki, Sotaro Uemura
- 学会等名
  第59回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K18232
[学会発表] レーザー照射による固液界面でのリポソームの捕捉と破壊2021
- 著者名/発表者名
  内田匠、山崎洋人、上村想太郎
- 学会等名
  第59回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K18232
[学会発表] フォトサーマル効果を活用した一分子ナノポア計測技術の創出2021
- 著者名/発表者名
  山崎洋人、上村想太郎
- 学会等名
  第82回応用物理学会秋季学術講演会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K18232
[学会発表] 出芽酵母の大規模な遺伝子解析のための高スループット細胞形態分取法2020
- 著者名/発表者名
  H. Matsumura, A. Isozaki, Y. Zhao, K. Huang, T. Wakamiya, D. Yuan, H. Mikami, S. Ohnuki, S. Uemura, Y. Ohya, and K. Goda
- 学会等名
  化学とマイクロ・ナノシステム学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00317
[学会発表] タンパク質翻訳開始複合体における30S-mRNA結合力の1分子顕微解析2008
- 著者名/発表者名
  増田智彰, 船津高志, 上村想太郎
- 学会等名
  日本分子生物学会年会
- 発表場所
  神戸
- 年月日
  2008-12-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19042003
[学会発表] 1分子計測技術の現状と展望2008
- 著者名/発表者名
  上村想太郎
- 学会等名
  科学技術交流財団第5回研究会
- 発表場所
  名古屋
- 年月日
  2008-10-07
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19042003
[学会発表] Single molecule measurement for protein synthesis2008
- 著者名/発表者名
  S. Uemura
- 学会等名
  SSF-JST Joint Symposium
- 発表場所
  ストックホルム、スウェーデン
- 年月日
  2008-05-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19037009
[学会発表] ナノ開口基板上でのタンパク質翻訳中における高濃度tRNAの1分子ダイナミクス2008
- 著者名/発表者名
  上村想太郎、清水義宏、飯塚怜、上田卓也、赤堀玲奈、島本直伸、谷井孝至、大泊巌、Joseph.D.Puglisi、船津高志
- 学会等名
  日本生物物理学会年会
- 発表場所
  福岡
- 年月日
  2008-12-04
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19042003
[学会発表] タンパク質翻訳開始複合体における30S-mRNA結合力の1分子顕微解析2008
- 著者名/発表者名
  増田智彰, 船津高志, 上村想太郎
- 学会等名
  日本分子生物学会年会
- 発表場所
  神戸
- 年月日
  2008-12-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19037009
[学会発表] Single molecule imaging of full protein synthesis by immobilized ribosomes2008
- 著者名/発表者名
  Sotaro Uemura
- 学会等名
  Biophysical Society Annual Meeting
- 発表場所
  横浜
- 年月日
  2008-02-07
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19042003
[学会発表] Single molecule imaging of full protein synthesis by immobilized ribosomes2008
- 著者名/発表者名
  Sotaro Uemura
- 学会等名
  Biophysical Society Annual Meeting
- 発表場所
  横浜
- 年月日
  2008-02-07
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19037009
[学会発表] ナノ開口基板上でのタンパク質翻訳中における高濃度tRNAの1分子ダイナミクス2008
- 著者名/発表者名
  上村想太郎、清水義宏、飯塚怜、上田卓也、赤堀玲奈、島本直伸、谷井孝至、大泊巌、Joseph. D. Puglisi、船津高志
- 学会等名
  日本生物物理学会年会
- 発表場所
  福岡
- 年月日
  2008-12-04
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19037009
[学会発表] タンパク質誕生の1分子イメージング2008
- 著者名/発表者名
  上村想太郎
- 学会等名
  東大生命科学シンポジウム
- 発表場所
  東京
- 年月日
  2008-09-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19042003
[学会発表] タンパク質誕生の1分子イメージング2008
- 著者名/発表者名
  上村想太郎
- 学会等名
  東大生命科学シンポジウム
- 発表場所
  東京
- 年月日
  2008-09-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19037009
[学会発表] 1分子計測技術の現状と展望2008
- 著者名/発表者名
  上村想太郎
- 学会等名
  科学技術交流財団第5回研究会
- 発表場所
  名古屋
- 年月日
  2008-10-07
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19037009
[学会発表] Single molecule measurement for protein synthesis2008
- 著者名/発表者名
  S. Uemura
- 学会等名
  SSF-JST Joint Symposium
- 発表場所
  ストックホルム、スウェーデン
- 年月日
  2008-05-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19042003
[学会発表] タンパク質翻訳におけるリボソームの分子モーターとしての役割2007
- 著者名/発表者名
  上村想太郎
- 学会等名
  日本生物物理学会年会
- 発表場所
  横浜
- 年月日
  2007-12-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19042003
[学会発表] タンパク質翻訳におけるリボソームの分子モーターとしての役割2007
- 著者名/発表者名
  上村想太郎
- 学会等名
  日本生物物理学会年会
- 発表場所
  横浜
- 年月日
  2007-12-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19037009

1. 合田圭介 (70518696)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
2. 大矢禎一 (20183767)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
3. 飯塚怜

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
4. 加畑宏樹

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

上村 想太郎 Uemura Sotaro

研究課題

研究成果

共同研究者

リボソーム融合型ナノポア技術による１分子タンパク質網羅定量解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

インテリジェント指向性進化法の創出と酵母への展開

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

リボソームのタンパク質合成メカニズムの1分子機能解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

光ピンセット法によるタンパク質翻訳機構の1分子操作研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[図書] 最新分子マシン2008

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] 最新分子マシン2008

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[雑誌論文] Comprehensive quantitative analysis of single-molecule proteins using ribosome fusion nanopore technology2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Accumulation of TERT in mitochondria shows two opposing effects on apoptosis2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Time-dependent cell-state selection identifies transiently expressed genes regulating ILC2 activation2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Upregulation of IL-4 receptor signaling pathway in circulating ILC2s from asthma patients2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Whole-embryonic identification of maternal microchimeric cell types in mouse using single-cell RNA sequencing2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Zero-mode waveguides and nanopore-based sequencing technologies accelerate single-molecule studies2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

ISSN

言語

データソース

[雑誌論文] レーザートラップや蛍光を用いた1分子計測のタンパク質翻訳機構への応用2009

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] レーザートラップや蛍光を用いた1分子計測のタンパク質翻訳機構への応用2009

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Single molecule force measurement for protein synthesis on the ribosome2008

著者名/発表者名

上村想太郎 Uemura Sotaro