寺口俊介 Teraguchi Shunsuke

研究者番号	00467276
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 滋賀大学, データサイエンス学系, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2022年度: 滋賀大学, データサイエンス学系, 准教授 2021年度: 滋賀大学, データサイエンス学部, 准教授 2020年度: 大阪大学, 免疫学フロンティア研究センター, 特任准教授(常勤) 2016年度: 東北大学, 東北メディカルメガバンク機構, 助教 2013年度 – 2015年度: 大阪大学, 免疫学フロンティア研究センター, 特任助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分43060:システムゲノム科学関連 / 生命・健康・医療情報学研究代表者以外皮膚科学
キーワード	研究代表者機械学習 / タンパク質立体構造予測 / 検証実験 / 深層学習 / クラスタリング / レパトアシークエンシング / 1細胞シークエンシング / エピトープ / T細胞受容体 / 1細胞遺伝子発現解析 … もっと見る / SARS-CoV-2 / １細胞遺伝子発現解析 / 免疫レパトア / エピトープ予測 / 確率モデル / 免疫システム / シミュレーション / 数理モデル … もっと見る研究代表者以外ケモカイン / 接触性皮膚炎 / KikGRマウス / 細胞遊走 / シングルセル解析 / 免疫抑制 / 炎症性皮膚疾患 / 制御性T細胞隠す

T細胞受容体の抗原エピトープを予測する機械学習システムの開発、検証、及び、応用研究代表者
- 研究代表者
  
  寺口俊介
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分43060:システムゲノム科学関連
- 研究機関
  滋賀大学
   大阪大学
単細胞遺伝子発現解析による高機能な制御性T細胞の集積を誘導する皮膚炎治療薬の開発
- 研究代表者
  
  池渕良洋
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2016
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  皮膚科学
- 研究機関
  大阪大谷大学
細胞間の多様性に基づいた新しい細胞内モデリング手法－その発展と応用－研究代表者
- 研究代表者
  
  寺口俊介
- 研究期間 (年度)
  2013 – 2015
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  大阪大学

すべて 2022 2020 2016 2013

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Improved Antibody‐Specific Epitope Prediction Using AlphaFold and AbAdapt**2022
- 著者名/発表者名
  Xu Zichang、Davila Ana、Wilamowski Jan、Teraguchi Shunsuke、Standley Daron M.
- 雑誌名
  
  ChemBioChem
  
  巻: 23 号: 18
- DOI
  10.1002/cbic.202200303
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06610
[雑誌論文] Unbiased integration of single cell transcriptome replicates2022
- 著者名/発表者名
  Loza Martin、Teraguchi Shunsuke、Standley Daron M、Diez Diego
- 雑誌名
  
  NAR Genomics and Bioinformatics
  
  巻: 4 号: 1
- DOI
  10.1093/nargab/lqac022
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06610
[雑誌論文] AbAdapt: an adaptive approach to predicting antibody?antigen complex structures from sequence2022
- 著者名/発表者名
  Davila Ana、Xu Zichang、Li Songling、Rozewicki John、Wilamowski Jan、Kotelnikov Sergei、Kozakov Dima、Teraguchi Shunsuke、Standley Daron M
- 雑誌名
  
  Bioinformatics Advances
  
  巻: 2 号: 1
- DOI
  10.1093/bioadv/vbac015
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06610
[雑誌論文] Methods for sequence and structural analysis of B and T cell receptor repertoires2020
- 著者名/発表者名
  Teraguchi Shunsuke、Saputri Dianita S.、Llamas-Covarrubias Mara Anais、Davila Ana、Diez Diego、Nazlica Sedat Aybars、Rozewicki John、Ismanto Hendra S.、Wilamowski Jan、Xie Jiaqi、Xu Zichang、Loza-Lopez Martin de Jesus、van Eerden Floris J.、Li Songling、Standley Daron M.
- 雑誌名
  
  Computational and Structural Biotechnology Journal
  
  巻: 18 ページ: 2000-2011
- DOI
  10.1016/j.csbj.2020.07.008
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06610, KAKENHI-PROJECT-20K16286, KAKENHI-PROJECT-18H02430
[雑誌論文] A rare subset of skin-tropic regulatory T cells expressing Il10/Gzmb inhibits the cutaneous immune response.2016
- 著者名/発表者名
  Ikebuchi R, Teraguchi S, Vandenbon A, Honda T, Shand FH, Nakanishi Y, Watanabe T, Tomura M.
- 雑誌名
  
  Sci Rep. 6: 35002, doi:
  
  巻: 6 号: 1 ページ: 35002-35002
- DOI
  10.1038/srep35002
- NAID
  120006223629
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-24111007, KAKENHI-PLANNED-24111009, KAKENHI-PROJECT-15F15113, KAKENHI-PROJECT-15K19687
[学会発表] Single-cell Gene & Protein Expression Analysis Revealed Unique Functional Subsets of Regulatory T Cells2016
- 著者名/発表者名
  Ryoyo IKEBUCHI, Shunsuke TERAGUCHI, Alexis VANDENBON, Yasutaka NAKANISHI, Taiki MORIYA, Hiromi OKUYAMA, Yutaka KUSUMOTO, Tetsuya HONDA, Michio TOMURA
- 学会等名
  International Conference on Single Cell Research 2016
- 発表場所
  Tokyo, Japan
- 年月日
  2016-11-16
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K19687
[学会発表] Stochastic Binary Modeling and Network Motifs2013
- 著者名/発表者名
  Shunsuke Teraguchi
- 学会等名
  The International Conference on Systems Biology 2013
- 発表場所
  Tivoli Congress Center, Copenhagen, Denmark
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870396
[学会発表] Stochastic Binary Modeling and Network Motifs2013
- 著者名/発表者名
  寺口俊介
- 学会等名
  定量生物学の会　第六回年会
- 発表場所
  大阪大学銀杏会館
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870396
[学会発表] Stochastic binary modeling and network motifs2013
- 著者名/発表者名
  Shunsuke Teraguchi
- 学会等名
  EMBO Workshop, Complex Systems in Immunology
- 発表場所
  Matrix Building, Biopolis, Singapre
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870396

1. 池渕良洋 (00747529)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
2. 戸村道夫 (30314321)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
3. 楠本豊 (40252689)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
4. 守屋大樹 (30759759)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
5. 中山隆志 (60319663)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 松尾一彦 (70615921)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. Alexis Vandenbon (60570140)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 榊原修平 (10618838)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. VANDENBON ALEXIS

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

寺口 俊介 Teraguchi Shunsuke

研究課題

研究成果

共同研究者

T細胞受容体の抗原エピトープを予測する機械学習システムの開発、検証、及び、応用研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

単細胞遺伝子発現解析による高機能な制御性T細胞の集積を誘導する皮膚炎治療薬の開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

細胞間の多様性に基づいた新しい細胞内モデリング手法－その発展と応用－研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Improved Antibody‐Specific Epitope Prediction Using AlphaFold and AbAdapt**2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Unbiased integration of single cell transcriptome replicates2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] AbAdapt: an adaptive approach to predicting antibody?antigen complex structures from sequence2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Methods for sequence and structural analysis of B and T cell receptor repertoires2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] A rare subset of skin-tropic regulatory T cells expressing Il10/Gzmb inhibits the cutaneous immune response.2016

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

データソース

[学会発表] Single-cell Gene & Protein Expression Analysis Revealed Unique Functional Subsets of Regulatory T Cells2016

著者名/発表者名

学会等名

発表場所

年月日

データソース

[学会発表] Stochastic Binary Modeling and Network Motifs2013

著者名/発表者名

学会等名

発表場所

データソース

[学会発表] Stochastic Binary Modeling and Network Motifs2013

著者名/発表者名

学会等名

発表場所

データソース

[学会発表] Stochastic binary modeling and network motifs2013

著者名/発表者名

学会等名

発表場所

データソース

寺口俊介 Teraguchi Shunsuke