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川口 修治  KAWAGUCHI SHUJI

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 00525404
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 京都大学, 医学研究科, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2019年度 – 2021年度: 京都大学, 医学研究科, 准教授
2017年度 – 2018年度: 京都大学, 医学研究科, 助教
2016年度: 京都大学, 医学研究科, 特定助教
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分48040:医化学関連 / ゲノム医科学
キーワード
研究代表者
バイオインフォマティクス / 遺伝統計学 / 次世代シークエンサー / HLA / データベース / 統計遺伝学 / 難病解明 / NGS / 深層学習 / 宿主・ウイルスゲノム統合解析 … もっと見る / KIR / 網膜色素変性 / HTLV-1 関連脊髄症 / 希少難治性疾患 / 機械学習 / 人工知能 / 免疫学 / ゲノム / HTLV-1 / 関連解析 / ソフトウェア / ジェノタイピング / マルチプレックスPCR / アルゴリズム / タイピング 隠す
  • 研究課題

    (2件)
  • 研究成果

    (19件)
  •  高精細化ゲノム情報による難治性疾患の原因遺伝子変異同定および高度解析技術の確立研究代表者

    • 研究代表者
      川口 修治
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2021
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分48040:医化学関連
    • 研究機関
      京都大学
  •  難病解明に向けた大規模HLAシークエンスと多重リスク因子の包括的解析法の確立研究代表者

    • 研究代表者
      川口 修治
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2018
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      ゲノム医科学
    • 研究機関
      京都大学

すべて 2021 2020 2019 2018 2017 2016

すべて 雑誌論文 学会発表 図書 産業財産権

  • [図書] 次世代シークエンスデータと国際データベースを用いたHLA遺伝子型の決定、最新醫學74巻2号、214-2192019

    • 著者名/発表者名
      川口 修治、日笠 幸一郎、山田 亮、松田 文彦
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      最新医学社
    • ISBN
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K18474
  • [図書] Comprehensive HLA Typing from a Current Allele Database Using Next-Generation Sequencing Data., Methods Mol. Biol., Vol. 1802, Sebastian Boegel (Eds): HLA Typing, doi:10.1007/978-1-4939-8546-3_162018

    • 著者名/発表者名
      Shuji Kawaguchi, Koichiro Higasa, Ryo Yamada, Fumihiko Matsuda
    • 出版者
      Springer-Verlag New York
    • ISBN
      9781493985456
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K18474
  • [図書] Comprehensive HLA Typing from a Current Allele Database Using Next-Generation Sequencing Data, in Methods Mol Biol., 1802, Sebastian Boegel (Eds): HLA Typing, 225-233.2018

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi Shuji、Higasa Koichiro、Yamada Ryo、Matsuda Fumihiko
    • 総ページ数
      9
    • 出版者
      Humana Press, New York, NY
    • ISBN
      9781493985456
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K18474
  • [雑誌論文] High-Definition Genomic Analysis of HLA Genes Via Comprehensive HLA Allele Genotyping2020

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi, S. and Matsuda, F.
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol.

      巻: 2131 ページ: 31-38

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-0389-5_3

    • ISBN
      9781071603888, 9781071603895
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K07349
  • [雑誌論文] HLA-HD: An accurate HLA typing algorithm for next-generation sequencing data2017

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi Shuji, Higasa Koichiro, Shimizu Masakazu, Yamada Ryo, Matsuda Fumihiko
    • 雑誌名

      Human Mutation

      巻: 38 号: 7 ページ: 788-797

    • DOI

      10.1002/humu.23230

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K18474, KAKENHI-PROJECT-17K07255
  • [産業財産権] 被験者のHLA遺伝子のアレルペアを判定する方法2021

    • 発明者名
      松田 文彦, 川口 修治, 日笠 幸一郎, 山田 亮
    • 権利者名
      京都大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 取得年月日
      2021
    • 外国
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K18474
  • [産業財産権] HLA遺伝子のPCRプライマーセット及びそれを用いたシークエンス法2020

    • 発明者名
      松田 文彦, 川口 修治, 清水 正和, 日笠 幸一郎
    • 権利者名
      京都大学
    • 産業財産権種類
      特許
    • 取得年月日
      2020
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K18474
  • [産業財産権] HAM/TSP発症リスク判定方法2019

    • 発明者名
      松田文彦、川口修治
    • 権利者名
      松田文彦、川口修治
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2019-205747
    • 出願年月日
      2019
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K07349
  • [産業財産権] HLA遺伝子のPCRプライマーセット及びそれを用いたシークエンス法2018

    • 発明者名
      松田文彦、川口修治、清水正和、日笠幸一郎
    • 権利者名
      松田文彦、川口修治、清水正和、日笠幸一郎
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2018
    • 外国
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K18474
  • [産業財産権] HLA遺伝子のPCRプライマーセット及びそれを用いたシークエンス法2017

    • 発明者名
      松田 文彦, 川口 修治, 清水 正和, 日笠 幸一郎
    • 権利者名
      松田 文彦, 川口 修治, 清水 正和, 日笠 幸一郎
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2017-024397
    • 出願年月日
      2017-02-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K18474
  • [産業財産権] 被験者のHLA遺伝子のアレルペアを判定する方法2016

    • 発明者名
      松田 文彦, 川口 修治, 日笠 幸一郎, 山田 亮
    • 権利者名
      松田 文彦, 川口 修治, 日笠 幸一郎, 山田 亮
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2016-257041
    • 出願年月日
      2016-12-28
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K18474
  • [学会発表] Classification of causative genes for retinitis pigmentosa by an image clustering based on deep learning2021

    • 著者名/発表者名
      Shuji Kawaguchi, Hiroki Nakano, Shogo Numa, Yuichi Inadomi, Akio Oishi, Akitaka Tsujikawa, Atsushi Takano, Fumihiko Matsuda
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第66回大会 第28回日本遺伝子診療学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K07349
  • [学会発表] NGSショートリードによるHLA遺伝子全長配列の決定2021

    • 著者名/発表者名
      岩崎 毅, 川口 修治, 稲富 雄一, 清水 正和, 松田 文彦
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第66回大会 第28回日本遺伝子診療学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K07349
  • [学会発表] 1.HTLV-1 プロウイルスゲノム変異の大規模解析によるHAM/TSP発症リスク予測モデルの構築2021

    • 著者名/発表者名
      北田 せり, 川口 修治, 清水 正和, 安永 純一朗, 佐藤 知雄, 田 耕平, 原田 瑛介, 高橋 めい子, 山野 嘉久, 松岡 雅雄, 松田 文彦
    • 学会等名
      第7回日本HTLV-1学会学術集会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K07349
  • [学会発表] 大規模検体における HLA・HTLV-1 プロウイルス量の統合解析による HAM/TSP 発症リスクの推定2019

    • 著者名/発表者名
      川口 修治, 清水 正和, 安永 純一朗, 高橋 めい子, 岡山 昭彦, 山野 嘉久, 内丸 薫, JSPFAD, 川上 純, 松岡 雅雄, 松田 文彦
    • 学会等名
      第6回日本HTLV-1学会学術集会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K07349
  • [学会発表] Development of an AI-assisted algorithm for the prediction of novel causal genes and variants for mendelian disorders2018

    • 著者名/発表者名
      Shuji Kawaguchi, Reitaro Tokumasu, Koichiro Higasa, Fumihiko Matsuda
    • 学会等名
      From Molecules and Cells to Human Health : Ideas and concepts
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K18474
  • [学会発表] 次世代シークエンサーと国際データベースを用いた高効率・高精度なHLA遺伝子群の包括的タイピング技術の確立2018

    • 著者名/発表者名
      川口 修治、日笠 幸一郎、清水 正和、山田 亮、松田 文彦
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第63回大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K18474
  • [学会発表] HTLV-1 高浸淫地域における大規模HLA解析による感染およびHAM/TSP発症リスクの関連解析2018

    • 著者名/発表者名
      川口 修治、ペノヴァ マリナ、川口 喬久、清水 正和、高橋 めい子、日笠 幸一郎、松田 文彦
    • 学会等名
      第五回日本HTLV-1学会学術集会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K18474
  • [学会発表] HLA-HD: a high performance HLA typing algorithm using next generation sequencing results to create a reliable catalog of HLA alleles2016

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi S, Higasa K, Yamada R, Matsuda F
    • 学会等名
      ICHG 2016
    • 発表場所
      Kyoto
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K18474

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