白井智量 Shirai Tomokazu

研究者番号	00639586
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 上級研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2021年度 – 2024年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 上級研究員
審査区分/研究分野	研究代表者以外小区分27040:バイオ機能応用およびバイオプロセス工学関連 / 大区分F / 学術変革領域研究区分(Ⅱ)
キーワード	研究代表者以外遺伝子発現量解析 / 機械学習 / プラスミドライブラリィ / プラットホーム / プラスミド構成要素 / 遺伝子発現パターン / 大腸菌 / 代謝シミュレーション / 代謝フェロモン / シミュレーション … もっと見る / 細胞間コミュニケーション / 翻訳後修飾 / 化学遺伝学 / 内在性代謝物 / 人工解糖経路 / 無細胞分子システム / 酵素反応 / 最適化モデル / ATP生産システム / ノネナール / ATP合成システム / ノネナール検出 / 統計的因果推論 / システム最適化隠す

化学遺伝学と情報科学による内在性代謝物の隠された機能の解明
- 研究代表者
  
  吉田稔
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2027
- 研究種目
  
  基盤研究(S)
- 審査区分
  
  大区分F
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
代謝ブラックボックスの可視化から紐解く遺伝子導入パターン最適化手法の確立
- 研究代表者
  
  野田修平
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分27040:バイオ機能応用およびバイオプロセス工学関連
- 研究機関
  神戸大学
計算科学にもとづく「最適」無細胞分子システムのボトムアップ構築
- 研究代表者
  
  油谷幸代
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2025
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅱ)
- 研究機関
  国立研究開発法人産業技術総合研究所

すべて 2024 2023 2022 2021

すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] 微生物を活用した有用物質の製造技術2023
- 著者名/発表者名
  白井智量, 森裕太郎
- 総ページ数
  6
- 出版者
  CMC出版
- ISBN
  9784781317403
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05230
[図書] Genomics and the Global Bioeconomy (Translational and Applied Genomics) Chapter 3: Computational approaches for smart cell creation in the bioeconomy era.2022
- 著者名/発表者名
  Sachiyo Aburatani, Koji Ishiya, Tomokazu Shirai, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara, Hiroaki Takaku, and Tomohiro Tamura.
- 総ページ数
  23
- 出版者
  ELSEVIER
- ISBN
  9780323916028
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05230
[雑誌論文] Styrene Production in Genetically Engineered Escherichia coli in a Two-Phase Culture2024
- 著者名/発表者名
  Noda Shuhei、Fujiwara Ryosuke、Mori Yutaro、Dainin Mayumi、Shirai Tomokazu、Kondo Akihiko
- 雑誌名
  
  BioTech
  
  巻: 13 号: 1 ページ: 2-2
- DOI
  10.3390/biotech13010002
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K14777, KAKENHI-PUBLICLY-23H04565, KAKENHI-PROJECT-23K23153
[雑誌論文] Discovery of Novel Substrate-Competitive Lysine Methyltransferase G9a Inhibitors as Anticancer Agents2023
- 著者名/発表者名
  Yosuke Nishigaya, Shohei Takase, Tatsunobu Sumiya, Ko Kikuzato, Tomohiro Sato, Hideaki Niwa, Shin Sato, Akiko Nakata, Takeshi Sonoda, Noriaki Hashimoto, Ryosuke Namie, Teruki Honma, Takashi Umehara, Mikako Shirouzu, Hiroo Koyama, Minoru Yoshida, Akihiro Ito, Fumiyuki Shirai
- 雑誌名
  
  Journal of Medicinal Chemistry
  
  巻: 66 号: 6 ページ: 4059-4085
- DOI
  10.1021/acs.jmedchem.2c02059
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22KJ2790, KAKENHI-PROJECT-19H05640, KAKENHI-PLANNED-23H04882, KAKENHI-PROJECT-23H05473
[雑誌論文] Investigation of two metabolic engineering approaches for (R,R)-2,3-butanediol production from glycerol in Bacillus subtilis2023
- 著者名/発表者名
  Vikromvarasiri Nunthaphan、Noda Shuhei、Shirai Tomokazu、Kondo Akihiko
- 雑誌名
  
  Journal of Biological Engineering
  
  巻: 17 号: 1 ページ: 3-13
- DOI
  10.1186/s13036-022-00320-w
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K23153, KAKENHI-PLANNED-21H05230, KAKENHI-PROJECT-23H05473
[雑誌論文] In Silico Design Strategies for the Production of Target Chemical Compounds Using Iterative Single-Level Linear Programming Problems.2022
- 著者名/発表者名
  Tomokazu Shirai, Akihiko Kondo.
- 雑誌名
  
  Biomolecules
  
  巻: 12 号: 5 ページ: 620-620
- DOI
  10.3390/biom12050620
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05230
[雑誌論文] G6P-capturing molecules in the periplasm of Escherichia coli accelerate the shikimate pathway2022
- 著者名/発表者名
  Fujiwara, R., Nakano, M., Hirata, Y., Otomo, C., Nonaka, D., Kawada, S., Nakazawa, H., Umetsu, M., Shirai, T., Noda, S.*, Tanaka, T.*, Kondo, A.
- 雑誌名
  
  Metabolic Engineering
  
  巻: 72 ページ: 68-81
- DOI
  10.1016/j.ymben.2022.03.002
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H02526, KAKENHI-PROJECT-21K14777, KAKENHI-PROJECT-20H00321, KAKENHI-PROJECT-22KJ2279, KAKENHI-PROJECT-19K15370, KAKENHI-PROJECT-20K22574, KAKENHI-PROJECT-23K23148, KAKENHI-PROJECT-23K23153
[雑誌論文] Metabolic engineering design to enhance (R,R)-2,3-butanediol production from glycerol in Bacillus subtilis based on flux balance analysis.2021
- 著者名/発表者名
  Vikromvarasiri Nunpathan, Tomokazu Shirai, Akihiko Kondo.
- 雑誌名
  
  Microb. Cell Fact.
  
  巻: 20 号: 1 ページ: 196-196
- DOI
  10.1186/s12934-021-01688-y
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05230
[雑誌論文] Direct 1,3-butadiene biosynthesis in Escherichia coli via a tailored ferulic acid decarboxylase mutant2021
- 著者名/発表者名
  Yutaro Mori, Shuhei Noda, Tomokazu Shirai, Akihiko Kondo
- 雑誌名
  
  Nat. Commun.
  
  巻: 12 号: 1 ページ: 2195-2195
- DOI
  10.1038/s41467-021-22504-6
- NAID
  120007035635
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05230
[学会発表] ヒストンメチル化酵素G9aの阻害剤による体細胞クローン法の改善2023
- 著者名/発表者名
  的場章悟、四方大樹、黒滝陽子、白井文幸、山田祐子、渡邉奈緒美、伊藤昭博、眞貝洋一、佐々木えりか、吉田稔、小倉　淳郎
- 学会等名
  第70回日本実験動物学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23H05473
[学会発表] Butadiene production by constructing an artificial metabolic pathway with enzyme engineering technology.2023
- 著者名/発表者名
  Tomokazu Shirai
- 学会等名
  Nature Inspires Creativity Engineers (N.I.C.E)
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23H05473
[学会発表] Metabolic Engineering of Escherichia coli for the Production and Degradation of Microbial-Polymer2023
- 著者名/発表者名
  Shuhei Noda1,2*, Sangho Koh1, Akinobu Katano3, Daisuke Nonaka3, Yutaro Mori3, Ryosuke Fujiwara, Tomokazu Shirai, Tsutomu Tanaka, Seiichi Taguchi, Akihiko Kondo
- 学会等名
  16th Asian Congress on Biotechnology 2023
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K23153
[学会発表] 人工代謝経路の構築による合成ゴム原料の微生物発酵生産2022
- 著者名/発表者名
  白井智量
- 学会等名
  第3回天然ゴム研究会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05230
[学会発表] 人工代謝経路設計技術を利用した有用化合物の微生物による生産2022
- 著者名/発表者名
  白井智量
- 学会等名
  第74回日本生物工学会大会シンポジウム
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05230
[学会発表] 人工代謝経路設計による微生物を用いた化石資源由来化合物の生産2022
- 著者名/発表者名
  白井智量
- 学会等名
  日本バイオインフォマティクス学会年会第11回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2022）
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05230
[学会発表] 人工代謝経路設計による有用化合物のバイオ生産に関する研究2021
- 著者名/発表者名
  白井智量
- 学会等名
  日本化学会第101春季年会シンポジウム
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05230

1. 油谷幸代 (10361627)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
2. 本田孝祐 (90403162)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 吉田稔 (80191617)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
4. 西村慎一 (30415260)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 伊藤昭博 (40391859)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
6. 野田修平 (30710131)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
7. 荒木通啓 (40396867)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 田中勉

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
9. 藤原良介

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

白井 智量 Shirai Tomokazu

研究課題

研究成果

共同研究者

化学遺伝学と情報科学による内在性代謝物の隠された機能の解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

代謝ブラックボックスの可視化から紐解く遺伝子導入パターン最適化手法の確立

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

計算科学にもとづく「最適」無細胞分子システムのボトムアップ構築

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[図書] 微生物を活用した有用物質の製造技術2023

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[図書] Genomics and the Global Bioeconomy (Translational and Applied Genomics) Chapter 3: Computational approaches for smart cell creation in the bioeconomy era.2022

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[雑誌論文] Styrene Production in Genetically Engineered Escherichia coli in a Two-Phase Culture2024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Discovery of Novel Substrate-Competitive Lysine Methyltransferase G9a Inhibitors as Anticancer Agents2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Investigation of two metabolic engineering approaches for (R,R)-2,3-butanediol production from glycerol in Bacillus subtilis2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] In Silico Design Strategies for the Production of Target Chemical Compounds Using Iterative Single-Level Linear Programming Problems.2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] G6P-capturing molecules in the periplasm of Escherichia coli accelerate the shikimate pathway2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Metabolic engineering design to enhance (R,R)-2,3-butanediol production from glycerol in Bacillus subtilis based on flux balance analysis.2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Direct 1,3-butadiene biosynthesis in Escherichia coli via a tailored ferulic acid decarboxylase mutant2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

データソース

[学会発表] ヒストンメチル化酵素G9aの阻害剤による体細胞クローン法の改善2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Butadiene production by constructing an artificial metabolic pathway with enzyme engineering technology.2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Metabolic Engineering of Escherichia coli for the Production and Degradation of Microbial-Polymer2023

著者名/発表者名

白井智量 Shirai Tomokazu