松本篤幸 MATSUMOTO SHIGEYUKI

研究者番号	00753906
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 京都大学, 医学研究科, 特定准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2021年度 – 2024年度: 京都大学, 医学研究科, 特定准教授 2018年度 – 2020年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 科技ハブ産連本部, 研究員 2017年度: 神戸大学, 医学研究科, 特命助教 2016年度: 神戸大学, 大学院医学研究科, 助教 2015年度 – 2016年度: 神戸大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分43020:構造生物化学関連 / 生物物理学研究代表者以外中区分49:病理病態学、感染・免疫学およびその関連分野 / 中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野 / 医化学一般 / 創薬化学
キーワード	研究代表者分子動力学計算 / 低分子化合物 / 結合親和性予測 / 深層学習 / 親和性予測 / NMR / ダイナミクス / State遷移 / 立体構造 / 分子動力学シミュレーション … もっと見る / state transition / 動的平衡 / X線結晶構造解析 / がん変異体 / Ras … もっと見る研究代表者以外癌 / シグナル伝達 / 抗ウイルス薬 / ヌクレオカプシド / エボラウイルス / 電子顕微鏡 / 融合構造解析 / ハイブリッド構造解析 / NMR / 単粒子解析 / クライオ電子顕微鏡 / 高分子構造・物性 / 脂質 / 蛋白質 / がん遺伝子 / がん / 分子標的薬 / 医薬分子設計隠す

フィロウイルスの増殖機構の分子構造基盤の解明と制御法の開発
- 研究代表者
  
  野田岳志
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 審査区分
  
  中区分49:病理病態学、感染・免疫学およびその関連分野
- 研究機関
  京都大学
深層学習技術を用いた動的情報からの化合物ータンパク質結合親和性の抽出研究代表者
- 研究代表者
  
  松本篤幸
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分43020:構造生物化学関連
- 研究機関
  京都大学
cryoEM-NMR融合構造解析の確立
- 研究代表者
  
  加藤貴之
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  挑戦的研究(開拓)
- 審査区分
  
  中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
- 研究機関
  大阪大学
がん遺伝子産物Rasの動的な構造特性を介した機能発現メカニズムの解明研究代表者
- 研究代表者
  
  松本篤幸
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2021
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  京都大学
   国立研究開発法人理化学研究所
   神戸大学
創薬への応用に向けたrasがん遺伝子産物の構造ダイナミクスの分子機構の解明
- 研究代表者
  
  島扶美
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  創薬化学
- 研究機関
  神戸大学
低分子量G蛋白質Rasの翻訳後脂質修飾の役割の構造科学的研究
- 研究代表者
  
  片岡徹
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  医化学一般
- 研究機関
  神戸大学

すべて 2022 2021 2020 2017 2016 2015

すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] がん分子標的治療2015
- 著者名/発表者名
  Fumi Shima, Yoko Yoshikawa, Higeyuki Matsumoto, Tohru Kataoka
- 総ページ数
  166
- 出版者
  メディカルレビュー社
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26293026
[雑誌論文] Oncogenic mutations Q61L and Q61H confer active form-like structural features to the inactive state (state 1) conformation of H-Ras protein2021
- 著者名/発表者名
  Matsumoto Shigeyuki、Taniguchi-Tamura Haruka、Araki Mitsugu、Kawamura Takashi、Miyamoto Ryo、Tsuda Chiemi、Shima Fumi、Kumasaka Takashi、Okuno Yasushi、Kataoka Tohru
- 雑誌名
  
  Biochemical and Biophysical Research Communications
  
  巻: 565 ページ: 85-90
- DOI
  10.1016/j.bbrc.2021.05.084
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15106
[雑誌論文] Extraction of protein dynamics information from cryo-EM maps using deep learning2021
- 著者名/発表者名
  Matsumoto Shigeyuki、Ishida Shoichi、Araki Mitsugu、Kato Takayuki、Terayama Kei、Okuno Yasushi
- 雑誌名
  
  Nature Machine Intelligence
  
  巻: 3 号: 2 ページ: 153-160
- DOI
  10.1038/s42256-020-00290-y
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15106
[雑誌論文] E487K-induced disorder in functionally relevant dynamics of mitochondrial aldehyde dehydrogenase 22020
- 著者名/発表者名
  Matsumoto S, Araki M, Isaka Y, Ono F, Hirohashi K, Ohashi S, Muto M, Okuno Y
- 雑誌名
  
  Biophysical Journal
  
  巻: 119 号: 3 ページ: 628-637
- DOI
  10.1016/j.bpj.2020.07.002
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K08369, KAKENHI-PROJECT-17K15106, KAKENHI-PROJECT-18H02692
[雑誌論文] Structural basis for intramolecular interaction of post-translationally modified H-Ras?GTP prepared by protein ligation2017
- 著者名/発表者名
  Ke Haoliang、Matsumoto Shigeyuki、Murashima Yosuke、Taniguchi-Tamura Haruka、Miyamoto Ryo、Yoshikawa Yoko、Tsuda Chiemi、Kumasaka Takashi、Mizohata Eiichi、Edamatsu Hironori、Kataoka Tohru
- 雑誌名
  
  FEBS Letters
  
  巻: 591 号: 16 ページ: 2470-2481
- DOI
  10.1002/1873-3468.12759
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15106
[雑誌論文] Structural transition of solvated H-Ras/GTP revealed by molecular dynamics simulation and local network entropy2017
- 著者名/発表者名
  Matsunaga Shota、Hano Yuta、Saito Yuta、Fujimoto Kazuhiro J.、Kumasaka Takashi、Matsumoto Shigeyuki、Kataoka Tohru、Shima Fumi、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  Journal of Molecular Graphics and Modelling
  
  巻: 77 ページ: 51-63
- DOI
  10.1016/j.jmgm.2017.07.028
- NAID
  120006406708
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15106, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Molecular Mechanism for Conformational Dynamics of Ras·GTP Elucidated from In-Situ Structural Transition in Crystal.2016
- 著者名/発表者名
  Matsumoto S, Miyano N, Baba S, Liao J, Kawamura T, Tsuda C, Takeda A, Yamamoto M, Kumasaka T, Kataoka T, Shima F.
- 雑誌名
  
  Sci Rep.
  
  巻: - 号: 1
- DOI
  10.1038/srep25931
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26293026, KAKENHI-PROJECT-26293065
[雑誌論文] rasがん遺伝子産物Rasを分子標的としたがん治療薬開発の現状2015
- 著者名/発表者名
  島扶美、吉川陽子、松本篤幸、片岡徹
- 雑誌名
  
  がん分子標的治療
  
  巻: 13巻ページ: 92-98
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26293065
[雑誌論文] Current status of the development of Ras inhibitors.2015
- 著者名/発表者名
  Fumi Shima, Shigeyuki Matsumoto, Yoko Yoshikawa, Takashi Kawamura, Masayuki Isa, Tohru Kataoka
- 雑誌名
  
  Journal of Biochemistry
  
  巻: 158 号: 2 ページ: 91-99
- DOI
  10.1093/jb/mvv060
- NAID
  40020554051
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26293065
[雑誌論文] Current statue of the development of Ras inhibitors2015
- 著者名/発表者名
  Shima F, Matsumoto S, Yoshikawa Y, Kawamura T, Isa M, Kataoka T
- 雑誌名
  
  The Journal of Biochemistry
  
  巻: 158 ページ: 91-99
- NAID
  40020554051
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26293026
[学会発表] Extracting protein dynamics from experimental cryo-EM maps using a machine learning technique combining with MdD simulations2022
- 著者名/発表者名
  Shigeyuki Matsumoto
- 学会等名
  第60回日本生物物理学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K06112
[学会発表] Novel insights into the structural perturbation induced by the oncogenic mutations, Q61L and Q61H, in Ras state 12020
- 著者名/発表者名
  Shigeyuki Matsumoto
- 学会等名
  64th Annual Meeting of the Biophysical Society
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15106
[学会発表] 深層学習技術による cryo-EM密度マップデータに隠された動的情報の抽出2020
- 著者名/発表者名
  松本篤幸
- 学会等名
  第一回クライオ電子顕微鏡画像からの高度情報処理研究会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15106
[学会発表] がん遺伝子産物H-RasQ61L 変異体の構造解析2017
- 著者名/発表者名
  谷口-田村はるか　松本篤幸　宮本涼生　河村高志　熊坂崇　片岡徹
- 学会等名
  平成29年度日本結晶学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15106
[学会発表] 翻訳後修飾型H-Ras・GTPにおける分子内相互作用によるc-Raf-1認識のための立体構造の形成2017
- 著者名/発表者名
  松本篤幸　柯浩亮　村嶋陽亮　谷口-田村はるか　宮本涼生、吉川陽子　津田智恵美　熊坂崇　溝端栄一　枝松裕紀　片岡徹
- 学会等名
  consortium of biological sciences 2017
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15106
[学会発表] Sortase Aを利用した翻訳後脂質修飾型Rasの産生と構造物学研究2016
- 著者名/発表者名
  村嶋　陽亮、柯　浩亮、松本　篤幸、枝松　裕紀、片岡　徹
- 学会等名
  第14回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム（日本薬学会物理系薬学部会）
- 発表場所
  ロッジ舞洲（大阪府・大阪市）
- 年月日
  2016-08-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26293065

1. 島扶美 (60335445)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 5件
2. 片岡徹 (40144472)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 6件
3. 北原亮 (70512284)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 田中成典 (10379480)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 熊坂崇 (30291066)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
6. 枝松裕紀 (70335438)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
7. 加藤貴之 (20423155)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 宮ノ入洋平 (80547521)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 野田岳志 (00422410)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 大野浩章 (30322192)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
11. 大橋真也

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

松本 篤幸 MATSUMOTO SHIGEYUKI

研究課題

研究成果

共同研究者

フィロウイルスの増殖機構の分子構造基盤の解明と制御法の開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

深層学習技術を用いた動的情報からの化合物ータンパク質結合親和性の抽出研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

cryoEM-NMR融合構造解析の確立

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

がん遺伝子産物Rasの動的な構造特性を介した機能発現メカニズムの解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

創薬への応用に向けたrasがん遺伝子産物の構造ダイナミクスの分子機構の解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

低分子量G蛋白質Rasの翻訳後脂質修飾の役割の構造科学的研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[図書] がん分子標的治療2015

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[雑誌論文] Oncogenic mutations Q61L and Q61H confer active form-like structural features to the inactive state (state 1) conformation of H-Ras protein2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Extraction of protein dynamics information from cryo-EM maps using deep learning2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] E487K-induced disorder in functionally relevant dynamics of mitochondrial aldehyde dehydrogenase 22020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Structural basis for intramolecular interaction of post-translationally modified H-Ras?GTP prepared by protein ligation2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Structural transition of solvated H-Ras/GTP revealed by molecular dynamics simulation and local network entropy2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

データソース

[雑誌論文] Molecular Mechanism for Conformational Dynamics of Ras&middot;GTP Elucidated from In-Situ Structural Transition in Crystal.2016

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] rasがん遺伝子産物Rasを分子標的としたがん治療薬開発の現状2015

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

松本篤幸 MATSUMOTO SHIGEYUKI

[雑誌論文] Molecular Mechanism for Conformational Dynamics of Ras·GTP Elucidated from In-Situ Structural Transition in Crystal.2016