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松本 篤幸  MATSUMOTO SHIGEYUKI

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 00753906
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 京都大学, 医学研究科, 特定准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2021年度 – 2024年度: 京都大学, 医学研究科, 特定准教授
2018年度 – 2020年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 科技ハブ産連本部, 研究員
2017年度: 神戸大学, 医学研究科, 特命助教
2016年度: 神戸大学, 大学院医学研究科, 助教
2015年度 – 2016年度: 神戸大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分43020:構造生物化学関連 / 生物物理学
研究代表者以外
中区分49:病理病態学、感染・免疫学およびその関連分野 / 中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野 / 医化学一般 / 創薬化学
キーワード
研究代表者
分子動力学計算 / 低分子化合物 / 結合親和性予測 / 深層学習 / 親和性予測 / NMR / ダイナミクス / State遷移 / 立体構造 / 分子動力学シミュレーション … もっと見る / state transition / 動的平衡 / X線結晶構造解析 / がん変異体 / Ras … もっと見る
研究代表者以外
癌 / シグナル伝達 / 抗ウイルス薬 / ヌクレオカプシド / エボラウイルス / 電子顕微鏡 / 融合構造解析 / ハイブリッド構造解析 / NMR / 単粒子解析 / クライオ電子顕微鏡 / 高分子構造・物性 / 脂質 / 蛋白質 / がん遺伝子 / がん / 分子標的薬 / 医薬分子設計 隠す
  • 研究課題

    (6件)
  • 研究成果

    (16件)
  • 共同研究者

    (11人)
  •  フィロウイルスの増殖機構の分子構造基盤の解明と制御法の開発

    • 研究代表者
      野田 岳志
    • 研究期間 (年度)
      2024 – 2026
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 審査区分
      中区分49:病理病態学、感染・免疫学およびその関連分野
    • 研究機関
      京都大学
  •  深層学習技術を用いた動的情報からの化合物ータンパク質結合親和性の抽出研究代表者

    • 研究代表者
      松本 篤幸
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2025
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分43020:構造生物化学関連
    • 研究機関
      京都大学
  •  cryoEM-NMR融合構造解析の確立

    • 研究代表者
      加藤 貴之
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2024
    • 研究種目
      挑戦的研究(開拓)
    • 審査区分
      中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
    • 研究機関
      大阪大学
  •  がん遺伝子産物Rasの動的な構造特性を介した機能発現メカニズムの解明研究代表者

    • 研究代表者
      松本 篤幸
    • 研究期間 (年度)
      2017 – 2021
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      京都大学
      国立研究開発法人理化学研究所
      神戸大学
  •  創薬への応用に向けたrasがん遺伝子産物の構造ダイナミクスの分子機構の解明

    • 研究代表者
      島 扶美
    • 研究期間 (年度)
      2014 – 2016
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      創薬化学
    • 研究機関
      神戸大学
  •  低分子量G蛋白質Rasの翻訳後脂質修飾の役割の構造科学的研究

    • 研究代表者
      片岡 徹
    • 研究期間 (年度)
      2014 – 2016
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      医化学一般
    • 研究機関
      神戸大学

すべて 2022 2021 2020 2017 2016 2015

すべて 雑誌論文 学会発表 図書

  • [図書] がん分子標的治療2015

    • 著者名/発表者名
      Fumi Shima, Yoko Yoshikawa, Higeyuki Matsumoto, Tohru Kataoka
    • 総ページ数
      166
    • 出版者
      メディカルレビュー社
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26293026
  • [雑誌論文] Oncogenic mutations Q61L and Q61H confer active form-like structural features to the inactive state (state 1) conformation of H-Ras protein2021

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto Shigeyuki、Taniguchi-Tamura Haruka、Araki Mitsugu、Kawamura Takashi、Miyamoto Ryo、Tsuda Chiemi、Shima Fumi、Kumasaka Takashi、Okuno Yasushi、Kataoka Tohru
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 565 ページ: 85-90

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2021.05.084

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K15106
  • [雑誌論文] Extraction of protein dynamics information from cryo-EM maps using deep learning2021

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto Shigeyuki、Ishida Shoichi、Araki Mitsugu、Kato Takayuki、Terayama Kei、Okuno Yasushi
    • 雑誌名

      Nature Machine Intelligence

      巻: 3 号: 2 ページ: 153-160

    • DOI

      10.1038/s42256-020-00290-y

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K15106
  • [雑誌論文] E487K-induced disorder in functionally relevant dynamics of mitochondrial aldehyde dehydrogenase 22020

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto S, Araki M, Isaka Y, Ono F, Hirohashi K, Ohashi S, Muto M, Okuno Y
    • 雑誌名

      Biophysical Journal

      巻: 119 号: 3 ページ: 628-637

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2020.07.002

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K08369, KAKENHI-PROJECT-17K15106, KAKENHI-PROJECT-18H02692
  • [雑誌論文] Structural basis for intramolecular interaction of post-translationally modified H-Ras?GTP prepared by protein ligation2017

    • 著者名/発表者名
      Ke Haoliang、Matsumoto Shigeyuki、Murashima Yosuke、Taniguchi-Tamura Haruka、Miyamoto Ryo、Yoshikawa Yoko、Tsuda Chiemi、Kumasaka Takashi、Mizohata Eiichi、Edamatsu Hironori、Kataoka Tohru
    • 雑誌名

      FEBS Letters

      巻: 591 号: 16 ページ: 2470-2481

    • DOI

      10.1002/1873-3468.12759

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K15106
  • [雑誌論文] Structural transition of solvated H-Ras/GTP revealed by molecular dynamics simulation and local network entropy2017

    • 著者名/発表者名
      Matsunaga Shota、Hano Yuta、Saito Yuta、Fujimoto Kazuhiro J.、Kumasaka Takashi、Matsumoto Shigeyuki、Kataoka Tohru、Shima Fumi、Tanaka Shigenori
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Graphics and Modelling

      巻: 77 ページ: 51-63

    • DOI

      10.1016/j.jmgm.2017.07.028

    • NAID

      120006406708

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K15106, KAKENHI-PLANNED-17H06353
  • [雑誌論文] Molecular Mechanism for Conformational Dynamics of Ras·GTP Elucidated from In-Situ Structural Transition in Crystal.2016

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto S, Miyano N, Baba S, Liao J, Kawamura T, Tsuda C, Takeda A, Yamamoto M, Kumasaka T, Kataoka T, Shima F.
    • 雑誌名

      Sci Rep.

      巻: - 号: 1

    • DOI

      10.1038/srep25931

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26293026, KAKENHI-PROJECT-26293065
  • [雑誌論文] rasがん遺伝子産物Rasを分子標的としたがん治療薬開発の現状2015

    • 著者名/発表者名
      島扶美、吉川陽子、松本篤幸、片岡徹
    • 雑誌名

      がん分子標的治療

      巻: 13巻 ページ: 92-98

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26293065
  • [雑誌論文] Current status of the development of Ras inhibitors.2015

    • 著者名/発表者名
      Fumi Shima, Shigeyuki Matsumoto, Yoko Yoshikawa, Takashi Kawamura, Masayuki Isa, Tohru Kataoka
    • 雑誌名

      Journal of Biochemistry

      巻: 158 号: 2 ページ: 91-99

    • DOI

      10.1093/jb/mvv060

    • NAID

      40020554051

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26293065
  • [雑誌論文] Current statue of the development of Ras inhibitors2015

    • 著者名/発表者名
      Shima F, Matsumoto S, Yoshikawa Y, Kawamura T, Isa M, Kataoka T
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 158 ページ: 91-99

    • NAID

      40020554051

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26293026
  • [学会発表] Extracting protein dynamics from experimental cryo-EM maps using a machine learning technique combining with MdD simulations2022

    • 著者名/発表者名
      Shigeyuki Matsumoto
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K06112
  • [学会発表] Novel insights into the structural perturbation induced by the oncogenic mutations, Q61L and Q61H, in Ras state 12020

    • 著者名/発表者名
      Shigeyuki Matsumoto
    • 学会等名
      64th Annual Meeting of the Biophysical Society
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K15106
  • [学会発表] 深層学習技術による cryo-EM密度マップデータに隠された動的情報の抽出2020

    • 著者名/発表者名
      松本篤幸
    • 学会等名
      第一回クライオ電子顕微鏡画像からの高度情報処理研究会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K15106
  • [学会発表] がん遺伝子産物H-RasQ61L 変異体の構造解析2017

    • 著者名/発表者名
      谷口-田村 はるか 松本 篤幸 宮本 涼生  河村 高志 熊坂 崇 片岡 徹
    • 学会等名
      平成29年度 日本結晶学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K15106
  • [学会発表] 翻訳後修飾型H-Ras・GTPにおける分子内相互作用によるc-Raf-1認識のための立体構造の形成2017

    • 著者名/発表者名
      松本 篤幸 柯 浩亮 村嶋 陽亮 谷口-田村 はるか 宮本 涼生、吉川 陽子 津田 智恵美 熊坂 崇 溝端 栄一 枝松 裕紀 片岡 徹
    • 学会等名
      consortium of biological sciences 2017
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K15106
  • [学会発表] Sortase Aを利用した翻訳後脂質修飾型Rasの産生と構造物学研究2016

    • 著者名/発表者名
      村嶋 陽亮、柯 浩亮、松本 篤幸、枝松 裕紀、片岡 徹
    • 学会等名
      第14回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム(日本薬学会物理系薬学部会)
    • 発表場所
      ロッジ舞洲(大阪府・大阪市)
    • 年月日
      2016-08-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26293065
  • 1.  島 扶美 (60335445)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 5件
  • 2.  片岡 徹 (40144472)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 6件
  • 3.  北原 亮 (70512284)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 4.  田中 成典 (10379480)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 5.  熊坂 崇 (30291066)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 6.  枝松 裕紀 (70335438)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 7.  加藤 貴之 (20423155)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 8.  宮ノ入 洋平 (80547521)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 9.  野田 岳志 (00422410)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 10.  大野 浩章 (30322192)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 11.  大橋 真也
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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