ＣａｒｎｉｎｃｉＰｉｅｒｏ Carninci Piero

… 別表記

Carninci Piero カルニンチピエロ

CARNINCI Piero カルニンチピエロ

CARNINCI PIero カルニンチピエロ

PIERO Carninci

研究者番号	10333296
所属 (現在)	2025年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, チームディレクター
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2018年度 – 2020年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 副センター長 2015年度 – 2017年度: 国立研究開発法人理化学研究所, ライフサイエンス技術基盤研究センター, 副センター長 2014年度: 独立行政法人理化学研究所, ライフサイエンス技術基盤研究センター, 副センター長 2012年度: 独立行政法人理化学研究所, ゲノム機能研究チーム, チームリーダー 2011年度: 独立行政法人理化学研究所, 研究員 … もっと見る 2008年度 – 2010年度: 独立行政法人理化学研究所, ゲノム機能研究チーム, チームリーダー 2009年度: ゲノム機能研究チーム, チームリーダー 2007年度: 独立行政法人理化学研究所, 林崎生体分子機能研究室, 先任研究員隠す
審査区分/研究分野	研究代表者ゲノム医科学 / 分子生物学 / 生体医工学・生体材料学 / ゲノム生物学 / 応用ゲノム科学研究代表者以外ゲノム医科学 / 生物系
キーワード	研究代表者 SINEUP / iPS / Non-coding mutations / Non-coding RNA / cancer / Transcriptomics / Enhancer / Promoter / Retrotransposons / Cancer … もっと見る / Genomics / SINEB2 elements / EEA elements / asRNA / lncRNAs / RBP / RNA biology / CLIP / RNA therapeutics / lentivirus / reprogramming / transcription factor / upregulation / Functional analysis / Clustering / Differential expression analysis / Data survey / Raw data processing and filtering / Repeat analysis / Regulatory Analysis / Transcriptome / Promoters / Deep-RACE / 可塑性 / トランスクリプトーム / ヒストン脱アセチル化酵素 / トリコスタチンA / バルプロ酸 / 非コードRNA / ナノCAGE / エピゲノム / ノンーコードRNA / プロモーター / RNA発現 / 転写 / 再プログラム / 幹細胞 / レトロトランスポゾン / ノンコードRNA / ゲノム … もっと見る研究代表者以外レット症候群 / Transcriptome analysis / ChIP sequencing / Transcriptome Analysis / ChIP Sequencing / FoxG1 / Mecp2 / Rett Syndrome / NOGO / ミエリン / マイクロアレー / 抑制性伝達 / 暗室飼育 / 視覚野 / クロマチン / エピジェニック / ヒストン / DNAメチル化 / ヒストン脱アセチル化 / エピジェネティック / Otx2 / ホメオ蛋白 / 可塑性 / 大脳視覚野 / パルブアルブミン / 大脳発達 / GABA / マイクロアレイ / 視覚 / 臨界期隠す

ゲノムの可塑性と疾病におけるレトロトランスポゾンの役割研究代表者
- 研究代表者
  
  Carninci Piero
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2020
- 研究種目
  
  特別研究員奨励費
- 研究分野
  
  ゲノム医科学
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
ＳＩＮＥＵＰ　ｎｃＲＮＡの解明：　期待される次代の分子生物工学技術ツール研究代表者
- 研究代表者
  
  Carninci Piero
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2019
- 研究種目
  
  特別研究員奨励費
- 研究分野
  
  分子生物学
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
ＳＩＮＥＵＰｓ：非翻訳アンチセンスＲＮＡ研究代表者
- 研究代表者
  
  Carninci Piero
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2017
- 研究種目
  
  特別研究員奨励費
- 研究分野
  
  生体医工学・生体材料学
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
ハイスループット・トランスクリプトミクスを通じてのニューロン構造可塑性規制の分析研究代表者
- 研究代表者
  
  CARNINCI Piero, CARNINCI Piero
- 研究期間 (年度)
  2013 – 2014
- 研究種目
  
  特別研究員奨励費
- 研究分野
  
  ゲノム生物学
- 研究機関
  独立行政法人理化学研究所
マウス視覚野におけるMecp2とFoxg1の標的ゲノム領域探索
- 研究代表者
  
  ARNER Erik (ARNER ERIK)
- 研究期間 (年度)
  2011 – 2012
- 研究種目
  
  若手研究(A)
- 研究分野
  
  ゲノム医科学
- 研究機関
  独立行政法人理化学研究所
神経可塑性への系統的システム生物学アプローチ研究代表者
- 研究代表者
  
  CARNINCI Piero (CARNINCI PIero)
- 研究期間 (年度)
  2008 – 2011
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 研究分野
  
  応用ゲノム科学
- 研究機関
  独立行政法人理化学研究所
総合的研究手法による大脳視覚野形成機構の解明
- 研究代表者
  
  HENSCH Takao (TAKAO Hensch)
- 研究期間 (年度)
  2005 – 2009
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  独立行政法人理化学研究所

すべて 2011 2010 2009 2008 2007 2006 2005 その他

すべて雑誌論文学会発表産業財産権

[雑誌論文] NanoCAGE : A High-Resolution Technique to Discover and Interrogate Cell Transcriptomes2011
- 著者名/発表者名
  Salimullah M, Mizuho S, Plessy C, Carninci P
- 雑誌名
  
  Cold Spring Harb Protoc
  
  ページ: 1-11
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[雑誌論文] The genome sequence of the spontaneously hypertensive rat : Analysis and functional significance.2010
- 著者名/発表者名
  Atanur SS, Birol I, Guryev V, Hirst M, Hummel O, Morrissey C, Behmoaras J, Fernandez-Suarez XM, Johnson MD, McLaren WM, Patone G, Petretto E, Plessy C, Rockland KS, Rockland C, Saar K, Zhao Y, Carninci P, Flicek P, Kurtz T, Cuppen E, Pravenec M, Hubner N, Jones SJ, Birney E, Aitman TJ
- 雑誌名
  
  Genome Research
  
  巻: 20 ページ: 791-803
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[雑誌論文] Linking promoters to functional transcripts in small samples with nanoCAGE and CAGEscan2010
- 著者名/発表者名
  Plessy C, Bertin N, Takahashi H, Salimullah M, Lassmann T, Vitezic M, Severin J, Olivarius S, Lazarevic D, Hornig N, Orland V, Bell I, Gao H, Dumais J, Kapranov P, Wang H, Davis CA, Gingeras TR, Kawai J, Daub CO, Hayashizaki Y, Gustincich S, Carninci P.
- 雑誌名
  
  Nature Mothods
  
  巻: 7 ページ: 528-34
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[雑誌論文] RNA dust : where are the genes?2010
- 著者名/発表者名
  Carninci P.
- 雑誌名
  
  DNA Research
  
  巻: 17 ページ: 51-9
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[雑誌論文] Whole transcriptome analysis : what are we still missing?2010
- 著者名/発表者名
  Saxena A, Carninci P.
- 雑誌名
  
  Wires ; Systems Biology and Medicine
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[雑誌論文] Altruistic functions for selfish DNA2009
- 著者名/発表者名
  Geoffrey J.Faulkner, Piero Caminci
- 雑誌名
  
  Cell Cycle 8:18
  
  ページ: 2895-2900
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[雑誌論文]2009
- 著者名/発表者名
  Piero Carninci
- 雑誌名
  
  Tagging Transcription Starting Sites with CAGE in the Cap-Analysis Gene Expression Book(Panstanford, Singapore)
  
  ページ: 7-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[雑誌論文] Tunable fractionation of nucleic acids2009
- 著者名/発表者名
  Salimullah M., Kato S., Murata N., Kawazu C., Plessy C., Carninci P
- 雑誌名
  
  BioTechniques 47(6)
  
  ページ: 1041-1042
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[雑誌論文] A resource for transcriptomic analysis in the mouse brain2008
- 著者名/発表者名
  Plessy C., Fagiolini M., Wagastuma A., Harasawa N., Kuji T., Oba A., Kanzaki Y., Waki K., Nakahara H., Hensch T.K., Carninci P.
- 雑誌名
  
  PLoS One 3,No.8
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17021047
[雑誌論文] High-throughput verification of transcriptional starting sites by Deep-RACE2008
- 著者名/発表者名
  Signe Olivarius, Charles Plessy, Piero Carninci
- 雑誌名
  
  BioTechniques Vol. 46
  
  ページ: 130-132
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[雑誌論文] A Resource for Transcriptomic Analysis in the Mouse Brain2008
- 著者名/発表者名
  Charles Plessy, Michela Fagiolini, Akiko Wagatsuma, Norihiro Harasawa, Takenobu Kuji, Atsuko, Asaka-Oba, Yukari Kanzaki, Sayaka Fujishima, Kazunori Waki, Hiroyuki Nakahara, Takao K. Hensch, Piero Carninci
- 雑誌名
  
  POLS One Vol. 3
  
  ページ: 1-10
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[雑誌論文] The transcriptional landscape of the mammalian genome.2005
- 著者名/発表者名
  Carninci et al.
- 雑誌名
  
  Science 309
  
  ページ: 1559-1563
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17021047
[雑誌論文] RNA dust : where are the Genes
- 著者名/発表者名
  Piero Carninci
- 雑誌名
  
  DNA Research (In press)
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[産業財産権] A Method of Manufacturing a Mixture of Amplified Double-Stranded Nucleic Acids Comprising Unknown Sequence2008
- 発明者名
  PIERO CARNINCI, CHARLES PLESSY, ROBERT SIMONE
- 権利者名
  理化学研究所
- 産業財産権番号
  2008-159527
- 出願年月日
  2008-06-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[産業財産権] EPIGENETICAL EGULATION OF BRAIN PLASTICITY2007
- 発明者名
  SNG, Judy, HENSCH, Takao, FAGIOLINI, Michela, CARNINCI, Piero, LENNARTSSON, Andreas
- 権利者名
  独立行政法人理化学研究所
- 出願年月日
  2007-04-09
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17021047
[学会発表] Sequencing RNA from cell compartments with CAGE2011
- 著者名/発表者名
  Carninci Piero
- 学会等名
  Workshop "Chromatin structure and Nuclear Organization"
- 発表場所
  IFOM-IEO Campus
- 年月日
  2011-01-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[学会発表] Deciphering mammalian transcriptome complexity by deep-CAGE2010
- 著者名/発表者名
  Carninci Piero
- 学会等名
  BCCA Research Seminar Series
- 発表場所
  BC Cancer Research Centre, Vancouver(Invited)
- 年月日
  2010-12-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[学会発表] Deciphering mammalian transcriptome complexity by deep-CAGE2010
- 著者名/発表者名
  Caminci Piero
- 学会等名
  Seminar Series 2010 at University Medical Center Groningen
- 発表場所
  UMCG (University Medical Center Groningen), Groningen, Netherlands(Invited)
- 年月日
  2010-10-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[学会発表] Deciphering mammalian transcriptome complexity by deep-CAGE2010
- 著者名/発表者名
  Carninci Piero
- 学会等名
  Seminar at Ecole Polytechnique Federale de Lausanne
- 発表場所
  Ecole Polytechnique Federale de Lausanne (EPFL), Lausanne, Switzerland(Invited)
- 年月日
  2010-11-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[学会発表] Deciphering mammalian transcriptome complexity by deep-CAGE2010
- 著者名/発表者名
  Carninci Piero
- 学会等名
  Seminar at University of Geneva Medical School
- 発表場所
  University of Geneva Medical School, Geneva, Switzerland(Invited)
- 年月日
  2010-11-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[学会発表] Mapping RNAs and their cellular compartmentalization via analysis of capped 5' ends of RNAs2009
- 著者名/発表者名
  Piero Carninci
- 学会等名
  The Biology of Genomes
- 発表場所
  The Cold Spring Harbor Laboratory, New York
- 年月日
  2009-05-09
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[学会発表] Deciphering the RNA dark matter by deepCAGE sequencing2009
- 著者名/発表者名
  Piero Carninci
- 学会等名
  The 32nd annual meeting of the molecular biology society of Japan, MBSJ
- 発表場所
  PACIFICO YOKOHAMA
- 年月日
  2009-12-11
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[学会発表] Deciphering the RNA dark matter by deepCAGE sequencing2009
- 著者名/発表者名
  Piero Carninci
- 学会等名
  23rd International Mammalian Genome Conference
- 発表場所
  Hilton La Jolla Torrey Pines, USA
- 年月日
  2009-11-02
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[学会発表] Nano CAGE promotome analysis of the mouse olfactory epithelium2008
- 著者名/発表者名
  CARNINCI Piero
- 学会等名
  IMGC-22nd International Mammalian Genome Conference
- 発表場所
  Prague, Czech
- 年月日
  2008-11-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[学会発表] Dynamics and complexity of the coding and non-coding transcriptome2008
- 著者名/発表者名
  CARNINCI Piero
- 学会等名
  MGRED11-The 11^<th> International Meeting of the Microarray and Gene Expression Data Society
- 発表場所
  Trieste, Italy
- 年月日
  2008-08-31
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[学会発表] Transcriptome of homogeneous neuron populations using nano-CAGE2008
- 著者名/発表者名
  CARNINCI Piero
- 学会等名
  MGRED11-The 11^<th> International Meeting of the Microarray and Gene Expression Data Society
- 発表場所
  Trieste, Italy
- 年月日
  2008-08-31
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20241047
[学会発表] Molecular mechanisms of critical period reactivation2007
- 著者名/発表者名
  Piero Carninci, et. al.
- 学会等名
  第30回日本分子生物学会
- 発表場所
  横浜
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17021047
[学会発表] Covalent modifications of chromatin regulate critical period plasticity in visual cortex2007
- 著者名/発表者名
  Sng J.C., Lennartsson A., Carninci P., Fagiolini M., Hensch T.K.
- 学会等名
  7th Annual Meeting of Society for Neuroscience (Neuroscience 2007)
- 発表場所
  San Diego, USA
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17021047
[学会発表] Epigenetic regulation of critical period plasticity in visual cortex2007
- 著者名/発表者名
  Sng J.C., Lennartsson A., Fagiolini M., Carninci P., Hensch T.K.
- 学会等名
  第30回日本神経科学大会・第50回日本神経化学会大会・第17回日本神経回路学会大会(Neuro2007)
- 発表場所
  横浜
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17021047
[学会発表] Gene expression profiling for the single population of interneuron in mouse cortex2007
- 著者名/発表者名
  Wagatsuma A., Kuji T., Oba A., Carninci P., Hensch T.K.
- 学会等名
  37th Annual Meeting of Society for Neuroscience (Neuroscience 2007)
- 発表場所
  San Diego, USA
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17021047
[学会発表] Full-length cDNA microarray analysis of critical period closure in mouse visual cortex2006
- 著者名/発表者名
  Hensch T.K., Fagiolini M., Kanzaki Y., Plessy C., Oba A., Wagatsuma A., Kuji T., Nakamura M., Kishikawa T., Chung M.H., Carninci P.
- 学会等名
  36th Annual Meeting of Society for Neuroscience (Neuroscience 2006)
- 発表場所
  Atlanta, USA
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17021047

1. HENSCH Takao (60300878)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 6件
2. FAGIOLINI Michela (20332330)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 4件
3. 神崎ゆかり (80391928)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
4. ARNER Erik (20571839)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. FORREST Alistair (40569084)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. SAXENA Alka (20618772)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. KWON Tae-Jun

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. KWON Tae・jun

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. BUDIC MARUSKA

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. RAHMAN MOHAMMED

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
11. ROBBE PAULINE

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件

Ｃａｒｎｉｎｃｉ Ｐｉｅｒｏ Carninci Piero

Carninci Piero カルニンチ ピエロ

CARNINCI Piero カルニンチ ピエロ

CARNINCI PIero カルニンチ ピエロ

PIERO Carninci

研究課題

研究成果

共同研究者

ゲノムの可塑性と疾病におけるレトロトランスポゾンの役割研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ＳＩＮＥＵＰ ｎｃＲＮＡの解明： 期待される次代の分子生物工学技術ツール研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ＳＩＮＥＵＰｓ：非翻訳アンチセンスＲＮＡ研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ハイスループット・トランスクリプトミクスを通じてのニューロン構造可塑性規制の分析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

マウス視覚野におけるMecp2とFoxg1の標的ゲノム領域探索

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

神経可塑性への系統的システム生物学アプローチ研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

総合的研究手法による大脳視覚野形成機構の解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] NanoCAGE : A High-Resolution Technique to Discover and Interrogate Cell Transcriptomes2011

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] The genome sequence of the spontaneously hypertensive rat : Analysis and functional significance.2010

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Linking promoters to functional transcripts in small samples with nanoCAGE and CAGEscan2010

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] RNA dust : where are the genes?2010

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Whole transcriptome analysis : what are we still missing?2010

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Altruistic functions for selfish DNA2009

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文]2009

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Tunable fractionation of nucleic acids2009

著者名/発表者名

ＣａｒｎｉｎｃｉＰｉｅｒｏ Carninci Piero

Carninci Piero カルニンチピエロ

CARNINCI Piero カルニンチピエロ

CARNINCI PIero カルニンチピエロ

ＳＩＮＥＵＰ　ｎｃＲＮＡの解明：　期待される次代の分子生物工学技術ツール研究代表者