田中成典 TANAKA SHIGENORI

研究者番号	10379480
その他のID	https://orcid.org/0000-0002-6659-2788
外部サイト
所属 (現在)	2024年度: 神戸大学, システム情報学研究科, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2016年度 – 2022年度: 神戸大学, システム情報学研究科, 教授 2014年度 – 2016年度: 神戸大学, その他の研究科, 教授 2015年度: 神戸大学, システム情報, 教授 2013年度 – 2014年度: 神戸大学, システム情報学研究科, 教授 2012年度: 神戸大学, その他の研究科, 教授 2011年度: 神戸大学, システム情報学研究科, 教授 2004年度 – 2005年度: 神戸大学, 大学院・自然科学研究科, 教授
審査区分/研究分野	研究代表者小区分43040:生物物理学関連 / 小区分17050:地球生命科学関連 / 理工系 / 物理系薬学 / 数理物理・物性基礎研究代表者以外物理化学 / 遷移状態制御 / ナノ材料・ナノバイオサイエンス / 創薬化学
キーワード	研究代表者分子動力学法 / 第一原理計算 / 生命の起源 / 細胞内夾雑環境 / 生体高分子 / フラグメント分子軌道法 / 水 / 熱伝導度 / 温度生物学 / 深海熱水噴出孔 … もっと見る / 隕石衝突 / 生体分子合成 / 化学反応 / 硫化鉄 / 化学反応ネットワーク / 密度汎関数法 / 第一原理シミュレーション / システム生物学 / 分子認識 / 核酸 / 蛋白質 / ハイパフォーマンス・コンピューティング / 非平衡熱力学 / 生体分子 / モンテカルロ法 / 解離会合過程 / 量子性 / 情報熱力学 / エネルギー移動 / 温度緩和 / 発熱反応 / 加水分解反応 / 非平衡解離過程 / タンパク質多量体 / 細胞内分子夾雑 / 量子生命科学 / 熱伝導 / アミロイド / 自由エネルギー / 会合解離 / 分子夾雑 / 産官学連携 / ハイパフォーマンスコンピューティング / クラスター分析 / 相互作用解析 / 電子状態計算 / リガンドドッキング / インシリコ創薬 / 核量子効果 / 積分方程式 / 経路積分法 / 量子モンテカルロ法 / 電子状態 … もっと見る研究代表者以外量子化学計算 / フラグメント分子軌道法 / 温度因子 / 生体高分子 / 熱揺らぎ / 構造解析 / 創薬 / 熱ゆらぎ / 構造最適化 / 電子密度 / 構造生命科学 / リガンド結合 / タンパク質 / 超分解能解析 / 構造精密化 / 電子密度解析 / 計算構造生物学 / 創薬分子設計 / 機能改良 / 遷移状態解析 / 計算結果と実験結果の対応 / 反応経路自動探索プログラム / 遷移状態構造探索 / 酵素反応 / 加水分解反応 / 反応経路自動探索 / 実験結果と計算結果の対応 / 活性化エネルギー / 遷移状態構造 / 計算精度 / ハロ酸脱ハロゲン化酵素 / QM/MM計算 / 遷移状態エネルギー分割法 / quantum chemical calculation / crrent-voltage property / DNA charge transfer / molecular orbital calculation / molecular dynamics simulation / DNA chip / 電荷平衡法 / フロンティア分子軌道 / 電流電圧特性 / 密度汎関数法 / DNAミスマッチ / PNA / 電荷移動 / DNAチップ / 癌 / がん遺伝子 / シグナル伝達 / がん / 分子標的薬 / 医薬分子設計隠す

生体分子系におけるミクロな熱緩和現象の理論・シミュレーション解析研究代表者
- 研究代表者
  
  田中成典
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分43040:生物物理学関連
- 研究機関
  神戸大学
生命の起源物質生成の計算機シミュレーション：アミノ酸・核酸とその重合化研究代表者
- 研究代表者
  
  田中成典
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2020
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分17050:地球生命科学関連
- 研究機関
  神戸大学
水を通して見る生体分子夾雑系の情報熱力学研究代表者
- 研究代表者
  
  田中成典
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2021
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  理工系
- 研究機関
  神戸大学
酵素の機能改良のための遷移状態解析法の開発
- 研究代表者
  
  中村卓
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2018
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  遷移状態制御
- 研究機関
  長浜バイオ大学
量子化学計算に基づく生体高分子の超分解能構造解析技術の開発と創薬への応用
- 研究代表者
  
  福澤薫 (秋葉薫)
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2017
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  物理化学
- 研究機関
  星薬科大学
   日本大学
創薬への応用に向けたrasがん遺伝子産物の構造ダイナミクスの分子機構の解明
- 研究代表者
  
  島扶美
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  創薬化学
- 研究機関
  神戸大学
計算創薬のための蛋白質複合系の精密構造・相互作用解析手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  田中成典
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  物理系薬学
- 研究機関
  神戸大学
量子モンテカルロ－フラグメント分子軌道法による水の第一原理シミュレーション研究代表者
- 研究代表者
  
  田中成典
- 研究期間 (年度)
  2011 – 2013
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  数理物理・物性基礎
- 研究機関
  神戸大学
量子化学計算による電流検出型DNAチップの特性解析
- 研究代表者
  
  栗田典之
- 研究期間 (年度)
  2003 – 2005
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  ナノ材料・ナノバイオサイエンス
- 研究機関
  豊橋技術科学大学

[図書] Recent Advances of the Fragment Molecular Orbital Method: Enhanced Performance and Applicability2021
- 著者名/発表者名
  Y. Mochizuki, S. Tanaka, K. Fukuzawa
- 総ページ数
  616
- 出版者
  Springer
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825
[図書] Recent Advances of the Fragment Molecular Orbital Method: Enhanced Performance and Applicability2021
- 著者名/発表者名
  Y. Mochizuki, S. Tanaka, K. Fukuzawa
- 総ページ数
  616
- 出版者
  Springer
- ISBN
  9789811592348
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[図書] Entropy-Enthalpy Compensation: Finding a Methodological Common Denominator through Probability, Statistics, and Physics2021
- 著者名/発表者名
  E. B. Starikov, B. Norden, S. Tanaka
- 総ページ数
  398
- 出版者
  Jenny Stanford Publishing
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825
[図書] Entropy-Enthalpy Compensation: Finding a Methodological Common Denominator through Probability, Statistics, and Physics2021
- 著者名/発表者名
  E.B. Starikov, B. Norden, S. Tanaka
- 総ページ数
  398
- 出版者
  Jenny Stanford Publishing
- ISBN
  9789814877305
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[図書] 計算分子生物学：物質科学からのアプローチ2018
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 総ページ数
  184
- 出版者
  内田老鶴圃
- ISBN
  9784753623136
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[図書] 計算分子生物学：物質科学からのアプローチ2018
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 総ページ数
  184
- 出版者
  内田老鶴圃
- ISBN
  9784753623136
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825
[図書] Recent Progress in Quantum Monte Carlo (ACS Symposium Series 1234)2016
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka, P.-N. Roy, L. Mitas
- 総ページ数
  173
- 出版者
  American Chemical Society
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[図書] Advances in Quantum Monte Carlo2012
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka, S.M. Rothstein, W.A. Lester, Jr.
- 総ページ数
  230
- 出版者
  American Chemical Society
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[図書] "Advances in Quantum Monte Carlo" (ACS Symposium Series 1094)2012
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka, S.M. Rothstein, and W.A. Lester, Jr., ed
- 総ページ数
  230
- 出版者
  American Chemical Society, Washington, DC
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[雑誌論文] Quantum Chemical Interaction Analysis between SARS-CoV-2 Main Protease and Ensitrelvir Compared with Its Initial Screening Hit2023
- 著者名/発表者名
  C. Watanabe, S. Tanaka, Y. Okiyama, H. Yuki, T. Ohyama, K. Kamisaka, D. Takaya, K. Fukuzawa, and T. Honma
- 雑誌名
  
  J. Phys. Chem. Lett.
  
  巻: 14 号: 15 ページ: 3609-3620
- DOI
  10.1021/acs.jpclett.2c03768
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06098
[雑誌論文] Renormalization in Quantum Brain Dynamics2023
- 著者名/発表者名
  A. Nishiyama, S. Tanaka, and J.A. Tuszynski
- 雑誌名
  
  AppliedMath
  
  巻: 3 号: 1 ページ: 117-146
- DOI
  10.3390/appliedmath3010009
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06098
[雑誌論文] Non-Equilibrium Phi4 Theory in a Hierarchy: Towards Manipulating Holograms in Quantum Brain Dynamics2023
- 著者名/発表者名
  A. Nishiyama, S. Tanaka, and J.A. Tuszynski
- 雑誌名
  
  Dynamics
  
  巻: 3 号: 1 ページ: 1-17
- DOI
  10.3390/dynamics3010001
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06098
[雑誌論文] Thermal Conductivity and Conductance of Protein in Aqueous Solution: Effects of Geometrical Shape2023
- 著者名/発表者名
  I. Kurisaki, S. Tanaka, I. Mori, T. Umegaki, Y. Mori, and S. Tanaka
- 雑誌名
  
  J. Comput. Chem.
  
  巻: 44 号: 7 ページ: 857-868
- DOI
  10.1002/jcc.27048
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06098, KAKENHI-PROJECT-21K06113
[雑誌論文] Dynamical Free Energy Based Model for Quantum Decision Making2022
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka, T. Umegaki, A. Nishiyama, and H. Kitoh-Nishioka
- 雑誌名
  
  Physica A
  
  巻: 605 ページ: 127979-127979
- DOI
  10.1016/j.physa.2022.127979
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06098
[雑誌論文] Quantum Brain Dynamics in 2 + 1 Dimensions: Non-Equilibrium Analysis towards Memory Formations2022
- 著者名/発表者名
  A. Nishiyama, S. Tanaka, and J.A. Tuszynski
- 雑誌名
  
  Physica A
  
  巻: 598 ページ: 127397-127397
- DOI
  10.1016/j.physa.2022.127397
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06098
[雑誌論文] Computational prediction of heteromeric protein complex disassembly order using hybrid Monte Carlo/molecular dynamics simulation2022
- 著者名/発表者名
  Kurisaki Ikuo、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  Physical Chemistry Chemical Physics
  
  巻: 24 号: 17 ページ: 10575-10587
- DOI
  10.1039/d2cp00267a
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353, KAKENHI-PROJECT-21K06098
[雑誌論文] Thermal and Quantum Fluctuations of Harmonic Oscillator2022
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka and Y. Komeiji
- 雑誌名
  
  J. Phys. Chem. Res.
  
  巻: 4 号: 3 ページ: 151-151
- DOI
  10.36266/jpcr/151
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06098
[雑誌論文] Protein-ligand binding affinity prediction of cyclin‐dependent kinase‐2 inhibitors by dynamically averaged fragment molecular orbital‐based interaction energy2022
- 著者名/発表者名
  Takaba Kenichiro、Watanabe Chiduru、Tokuhisa Atsushi、Akinaga Yoshinobu、Ma Biao、Kanada Ryo、Araki Mitsugu、Okuno Yasushi、Kawashima Yusuke、Moriwaki Hirotomo、Kawashita Norihito、Honma Teruki、Fukuzawa Kaori、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  Journal of Computational Chemistry
  
  巻: 43 号: 20 ページ: 1362-1371
- DOI
  10.1002/jcc.26940
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06098, KAKENHI-PROJECT-18K06615
[雑誌論文] Remarked suppression of Aβ42 protomer-protomer dissociation reaction elucidated by molecular dynamics simulation2022
- 著者名/発表者名
  Kurisaki Ikuo、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics
  
  巻: 2022 号: 7 ページ: 1-9
- DOI
  10.1002/prot.26319
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353, KAKENHI-PROJECT-21K06098
[雑誌論文] Interspecies Comparison of Interaction Energies between Photosynthetic Protein RuBisCO and 2CABP Ligand2022
- 著者名/発表者名
  M. Fujii and S. Tanaka
- 雑誌名
  
  Int. J. Mol. Sci.
  
  巻: 23 号: 19 ページ: 11347-11347
- DOI
  10.3390/ijms231911347
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06098
[雑誌論文] Quantum Brain Dynamics and Holography2022
- 著者名/発表者名
  A. Nishiyama, S. Tanaka, and J.A. Tuszynski
- 雑誌名
  
  Dynamics
  
  巻: 2 号: 2 ページ: 187-218
- DOI
  10.3390/dynamics2020010
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06098
[雑誌論文] Fragment molecular orbital calculations containing Mg2+ ions: PPlase domain of Cyclophilin G2022
- 著者名/発表者名
 M. Fujii, C. Watanabe, K. Fukuzawa, and S. Tanaka
- 雑誌名
 
 ＣＢＩジャーナル
 
 巻: 22 号: 0 ページ: 55-62
- DOI
 10.1273/cbij.22.55
- ISSN
 1347-0442, 1347-6297
- 年月日
 2022-09-16
- 言語
 英語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
 KAKENHI-PROJECT-21K06098
[雑誌論文] Inhibition of Melittin Activity Using a Small Molecule with an Indole Ring2022
- 著者名/発表者名
  S. Kanemitsu, K. Morita, Y. Tominaga, K. Nishimura, T. Yashiro, H. Sakurai, Y. Yamamoto, I. Kurisaki, S. Tanaka, M. Matsui, T. Ooya, A. Tamura, and T. Maruyama
- 雑誌名
  
  J. Phys. Chem. B
  
  巻: 126 号: 31 ページ: 5793-5802
- DOI
  10.1021/acs.jpcb.2c03595
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06098, KAKENHI-PROJECT-20H02542
[雑誌論文] Dynamic Cooperativity of Ligand?Residue Interactions Evaluated with the Fragment Molecular Orbital Method2021
- 著者名/発表者名
  Tanaka Shigenori、Tokutomi Shusuke、Hatada Ryo、Okuwaki Koji、Akisawa Kazuki、Fukuzawa Kaori、Komeiji Yuto、Okiyama Yoshio、Mochizuki Yuji
- 雑誌名
  
  The Journal of Physical Chemistry B
  
  巻: 125 号: 24 ページ: 6501-6512
- DOI
  10.1021/acs.jpcb.1c03043
- NAID
  120007170803
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12010, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] In silico modeling of PAX8-PPARγ fusion protein in thyroid carcinoma: influence of structural perturbation by fusion on ligand-binding affinity2021
- 著者名/発表者名
  Sakaguchi Kaori、Okiyama Yoshio、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  Journal of Computer-Aided Molecular Design
  
  巻: 35 号: 5 ページ: 629-642
- DOI
  10.1007/s10822-021-00381-x
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Collective residue interactions in trimer complexes of SARS-CoV-2 spike proteins analyzed by fragment molecular orbital method2021
- 著者名/発表者名
  Okuwaki Koji、Akisawa Kazuki、Hatada Ryo、Mochizuki Yuji、Fukuzawa Kaori、Komeiji Yuto、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  Applied Physics Express
  
  巻: 15 号: 1 ページ: 017001-017001
- DOI
  10.35848/1882-0786/ac4300
- NAID
  120007181729
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12010, KAKENHI-PLANNED-17H06353, KAKENHI-PROJECT-21K06098
[雑誌論文] Appearance of Thermal Time2021
- 著者名/発表者名
  Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  Foundations of Physics
  
  巻: 51 号: 2 ページ: 34-34
- DOI
  10.1007/s10701-021-00445-w
- NAID
  120007026363
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353, KAKENHI-PROJECT-21K06098
[雑誌論文] Density-Matrix Based Scheme of Basis Selection for Linear Combination of Fragment Molecular Orbitals2021
- 著者名/発表者名
  Okiyama Yoshio、Mochizuki Yuji、Yamanaka Masanori、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  Journal of the Physical Society of Japan
  
  巻: 90 号: 6 ページ: 064301-064301
- DOI
  10.7566/jpsj.90.064301
- NAID
  40022591155
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Elucidating microscopic events driven by GTP hydrolysis reaction in the Ras-GAP system with semi-reactive molecular dynamics simulations: the alternative role of a phosphate binding loop for mechanical energy storage2021
- 著者名/発表者名
  Kurisaki Ikuo、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  Physical Chemistry Chemical Physics
  
  巻: 23 号: 46 ページ: 26151-26164
- DOI
  10.1039/d1cp04061h
- NAID
  120007179185
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353, KAKENHI-PROJECT-21K06098
[雑誌論文] Non-equilibrium Quantum Brain Dynamics II: Formulation in 3+1 dimensions2021
- 著者名/発表者名
  Nishiyama Akihiro、Tanaka Shigenori、Tuszynski Jack A.
- 雑誌名
  
  Physica A: Statistical Mechanics and its Applications
  
  巻: 567 ページ: 125706-125706
- DOI
  10.1016/j.physa.2020.125706
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353, KAKENHI-PROJECT-21K06098
[雑誌論文] Fragment molecular orbital based interaction analyses on complexes between SARS-CoV-2 RBD variants and ACE22021
- 著者名/発表者名
  Akisawa Kazuki、Hatada Ryo、Okuwaki Koji、Kitahara Shun、Tachino Yusuke、Mochizuki Yuji、Komeiji Yuto、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  Japanese Journal of Applied Physics
  
  巻: 60 号: 9 ページ: 090901-090901
- DOI
  10.35848/1347-4065/ac1857
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12010, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Improvement of the Force Field for β-d-Glucose with Machine Learning2021
- 著者名/発表者名
  Ikejo Makoto、Watanabe Hirofumi、Shimamura Kohei、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  Molecules
  
  巻: 26 号: 21 ページ: 6691-6691
- DOI
  10.3390/molecules26216691
- NAID
  120007170798
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353, KAKENHI-PROJECT-21K06098
[雑誌論文] FMODB: The World’s First Database of Quantum Mechanical Calculations for Biomacromolecules Based on the Fragment Molecular Orbital Method2021
- 著者名/発表者名
  Daisuke Takaya, Chiduru Watanabe, Shunpei Nagase, Kikuko Kamisaka, Yoshio Okiyama, Hirotomo Moriwaki, Hitomi Yuki, Tomohiro Sato, Noriyuki Kurita, Yoichiro Yagi, Tatsuya Takagi, Norihito Kawashita, Kenichiro Takaba, Tomonaga Ozawa, Midori Takimoto-Kamimura, Shigenori Tanaka, Kaori Fukuzawa, and Teruki Honma
- 雑誌名
  
  J. Chem. Inf. Model.
  
  巻: 61 号: 2 ページ: 777-794
- DOI
  10.1021/acs.jcim.0c01062
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06615, KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PROJECT-18K06619, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Molecular recognition of SARS-CoV-2 spike glycoprotein: quantum chemical hot spot and epitope analyses2021
- 著者名/発表者名
  Watanabe Chiduru、Okiyama Yoshio、Tanaka Shigenori、Fukuzawa Kaori、Honma Teruki
- 雑誌名
  
  Chemical Science
  
  巻: 12 号: 13 ページ: 4722-4739
- DOI
  10.1039/d0sc06528e
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Statistical interaction analyses between SARS-CoV-2 main protease and inhibitor N3 by combining molecular dynamics simulation and fragment molecular orbital calculation2021
- 著者名/発表者名
  Hatada Ryo、Okuwaki Koji、Akisawa Kazuki、Mochizuki Yuji、Handa Yuma、Fukuzawa Kaori、Komeiji Yuto、Okiyama Yoshio、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  Applied Physics Express
  
  巻: 14 号: 2 ページ: 027003-027003
- DOI
  10.35848/1882-0786/abdac6
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12010, KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Reaction Pathway Sampling and Free-Energy Analyses for Multimeric Protein Complex Disassembly by Employing Hybrid Configuration Bias Monte Carlo/Molecular Dynamics Simulation2021
- 著者名/発表者名
  Kurisaki Ikuo、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  ACS Omega
  
  巻: 6 号: 7 ページ: 4749-4758
- DOI
  10.1021/acsomega.0c05579
- NAID
  120007026370
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Interaction analyses of SARS-CoV-2 spike protein based on fragment molecular orbital calculations2021
- 著者名/発表者名
  Akisawa Kazuki、Hatada Ryo、Okuwaki Koji、Mochizuki Yuji、Fukuzawa Kaori、Komeiji Yuto、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  RSC Advances
  
  巻: 11 号: 6 ページ: 3272-3279
- DOI
  10.1039/d0ra09555a
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12010, KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] New Modified Deoxythymine with Dibranched Tetraethylene Glycol Stabilizes G-quadruplex Structures2020
- 著者名/発表者名
  H. Tateishi-Karimata, T. Ohyama, T. Muraoka, S. Tanaka, K. Kinbara, and N. Sugimoto
- 雑誌名
  
  Molecules
  
  巻: 25 号: 3 ページ: 705-705
- DOI
  10.3390/molecules25030705
- NAID
  120006811187
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06351, KAKENHI-PLANNED-17H06353, KAKENHI-ORGANIZER-18H05418, KAKENHI-PROJECT-19H00928, KAKENHI-PROJECT-17K05941, KAKENHI-PROJECT-18K19152, KAKENHI-PLANNED-18H05419, KAKENHI-PROJECT-19H02831
[雑誌論文] Effective Static Approximation: A Fast and Reliable Tool for Warm-Dense Matter Theory2020
- 著者名/発表者名
  Dornheim Tobias、Cangi Attila、Ramakrishna Kushal、B?hme Maximilian、Tanaka Shigenori、Vorberger Jan
- 雑誌名
  
  Physical Review Letters
  
  巻: 125 号: 23 ページ: 235001-235001
- DOI
  10.1103/physrevlett.125.235001
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Machine learning prediction of inter-fragment interaction energies between ligand and amino-acid residues on the fragment molecular orbital calculations for Janus kinase ? inhibitor complex2020
- 著者名/発表者名
  Tokutomi Shusuke、Shimamura Kohei、Fukuzawa Kaori、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  Chemical Physics Letters
  
  巻: 757 ページ: 137883-137883
- DOI
  10.1016/j.cplett.2020.137883
- NAID
  120006890795
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Comparative study on model parameter evaluations for the energy transfer dynamics in Fenna?Matthews?Olson complex2020
- 著者名/発表者名
  Suzuki Yosuke、Watanabe Hirofumi、Okiyama Yoshio、Ebina Kuniyoshi、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  Chemical Physics
  
  巻: 539 ページ: 110903-110903
- DOI
  10.1016/j.chemphys.2020.110903
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Nanoscale Quantum Thermal Conductance at Water Interface: Green’s Function Approach Based on One-Dimensional Phonon Model2020
- 著者名/発表者名
  Umegaki Toshihito、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  Molecules
  
  巻: 25 号: 5 ページ: 1185-1185
- DOI
  10.3390/molecules25051185
- NAID
  120006844958
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825
[雑誌論文] Temperature relaxation in binary hard-sphere mixture system: Molecular dynamics and kinetic theory study2020
- 著者名/発表者名
  Tanaka Shigenori、Shimamura Kohei
- 雑誌名
  
  The Journal of Chemical Physics
  
  巻: 153 号: 3 ページ: 034114-034114
- DOI
  10.1063/5.0011181
- NAID
  120006879543
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Strongly Coupled Electron Liquid: Ab Initio Path Integral Monte Carlo Simulations and Dielectric Theories2020
- 著者名/発表者名
  T. Dornheim, T. Sjostrom, S. Tanaka, and J. Vorberger
- 雑誌名
  
  Phys. Rev. B
  
  巻: 101 号: 4 ページ: 045129-045129
- DOI
  10.1103/physrevb.101.045129
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Non-Equilibrium Quantum Electrodynamics in Open Systems as a Realizable Representation of Quantum Field Theory of the Brain2020
- 著者名/発表者名
  A. Nishiyama, S. Tanaka, and J.A. Tuszynski
- 雑誌名
  
  Entropy
  
  巻: 22 号: 1 ページ: 43-43
- DOI
  10.3390/e22010043
- NAID
  120006823996
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353, KAKENHI-PROJECT-18K03825
[雑誌論文] Identification of correlated inter-residue interactions in protein complex based on the fragment molecular orbital method2020
- 著者名/発表者名
  Tanaka Shigenori、Watanabe Chiduru、Honma Teruki、Fukuzawa Kaori、Ohishi Kazue、Maruyama Tadashi
- 雑誌名
  
  Journal of Molecular Graphics and Modelling
  
  巻: 100 ページ: 107650-107650
- DOI
  10.1016/j.jmgm.2020.107650
- NAID
  120006890786
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Fragment Molecular Orbital Based Interaction Analyses on COVID-19 Main Protease ? Inhibitor N3 Complex (PDB ID: 6LU7)2020
- 著者名/発表者名
  Hatada Ryo、Okuwaki Koji、Mochizuki Yuji、Handa Yuma、Fukuzawa Kaori、Komeiji Yuto、Okiyama Yoshio、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Information and Modeling
  
  巻: 60 号: 7 ページ: 3593-3602
- DOI
  10.1021/acs.jcim.0c00283
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12010, KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] ATP Converts Aβ42 Oligomer into Off-Pathway Species by Making Contact with Its Backbone Atoms Using Hydrophobic Adenosine2019
- 著者名/発表者名
  I. Kurisaki and S. Tanaka
- 雑誌名
  
  J. Phys. Chem. B
  
  巻: 123 号: 46 ページ: 9922-9933
- DOI
  10.1021/acs.jpcb.9b07984
- NAID
  120006775976
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Fragment Molecular Orbital Calculations with Implicit Solvent Based on the Poisson-Boltzmann Equation: II. Protein and Its Ligand-Binding System Studies2019
- 著者名/発表者名
  Y. Okiyama, C. Watanabe, K. Fukuzawa, Y. Mochizuki, T. Nakano, S. Tanaka
- 雑誌名
  
  J. Phys. Chem. B
  
  巻: 123 号: 5 ページ: 957-973
- DOI
  10.1021/acs.jpcb.8b09326
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Ab Initio Molecular Dynamics Study of Prebiotic Production Processes of Organic Compounds at Meteorite Impacts on Ocean2019
- 著者名/発表者名
  K. Shimamura, F. Shimojo, A. Nakano, and S. Tanaka
- 雑誌名
  
  Journal of Computational Chemistry
  
  巻: 40 号: 2 ページ: 349-359
- DOI
  10.1002/jcc.25606
- NAID
  120006734928
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K05478, KAKENHI-PROJECT-16K17782, KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Non-Equilibrium Quantum Brain Dynamics: Super-Radiance and Equilibration in 2+1 Dimensions2019
- 著者名/発表者名
  A. Nishiyama, S. Tanaka, and J.A. Tuszynski
- 雑誌名
  
  Entropy
  
  巻: 21 号: 11 ページ: 1066-1066
- DOI
  10.3390/e21111066
- NAID
  120006777079
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Guidelines for Creating Artificial Neural Network Empirical Interatomic Potential from First-Principles Molecular Dynamics Data under Specific Conditions and Its Application to α-Ag2Se2019
- 著者名/発表者名
  K. Shimamura, S. Fukushima, A. Koura, F. Shimojo, M. Misawa, R.K. Kalia, A. Nakano, P. Vashishta, T. Matsubara, and S. Tanaka
- 雑誌名
  
  J. Chem. Phys.
  
  巻: 151 号: 12 ページ: 124303-124303
- DOI
  10.1063/1.5116420
- NAID
  120006734929
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PROJECT-19K14676, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Development of an automated fragment molecular orbital (FMO) calculation protocol toward construction of quantum mechanical calculation database for large biomolecules 2019
- 著者名/発表者名
 Watanabe Chiduru、Watanabe Hirofumi、Okiyama Yoshio、Takaya Daisuke、Fukuzawa Kaori、Tanaka Shigenori、Honma Teruki
- 雑誌名
 
 ＣＢＩジャーナル
 
 巻: 19 号: 0 ページ: 5-18
- DOI
 10.1273/cbij.19.5
- NAID
 130007618360
- ISSN
 1347-0442, 1347-6297
- 年月日
 2019-03-22
- 言語
 英語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
 KAKENHI-PROJECT-18K06619, KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Fragment Molecular Orbital Calculations with Implicit Solvent Based on the Poisson?Boltzmann Equation: Implementation and DNA Study2018
- 著者名/発表者名
  Okiyama Yoshio、Nakano Tatsuya、Watanabe Chiduru、Fukuzawa Kaori、Mochizuki Yuji、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  The Journal of Physical Chemistry B
  
  巻: 122 号: 16 ページ: 4457-4471
- DOI
  10.1021/acs.jpcb.8b01172
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K05397, KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Pursuing origins of (poly)ethylene glycol-induced G-quadruplex structural modulations2018
- 著者名/発表者名
  M. Trajkovski, T. Endoh, H. Tateishi-Karimata, T. Ohyama, S. Tanaka, J. Plavec, N. Sugimoto
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research
  
  巻: 46 号: 8 ページ: 4301-4315
- DOI
  10.1093/nar/gky250
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K05941, KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PROJECT-18K19152, KAKENHI-PLANNED-17H06351, KAKENHI-PLANNED-17H06353, KAKENHI-PROJECT-16H02283
[雑誌論文] Computational Analysis of the Interaction Energies between Amino Acid Residues of the Measles Virus Hemagglutinin and Its Receptors2018
- 著者名/発表者名
  F. Xu, S. Tanaka, H. Watanabe, Y. Shimane, M. Iwasawa, K. Ohishi, T. Maruyama
- 雑誌名
  
  Viruses
  
  巻: 10 号: 5 ページ: 236-236
- DOI
  10.3390/v10050236
- NAID
  120006488447
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Towards Good Correlation between Fragment Molecular Orbital Interaction Energies and Experimental IC50 for Ligand Binding: A Case Study of p38 MAP Kinase2018
- 著者名/発表者名
  Y. Sheng, H. Watanabe, K. Maruyama, C. Watanabe, Y. Okiyama, T. Honma, K. Fukuzawa, S. Tanaka
- 雑誌名
  
  Comput. Struct. Biotech. J.
  
  巻: 16 ページ: 421-434
- DOI
  10.1016/j.csbj.2018.10.003
- NAID
  120006549198
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Application of singular value decomposition to the inter-fragment interaction energy analysis for ligand screening2018
- 著者名/発表者名
  Maruyama Keiya、Sheng Yinglei、Watanabe Hirofumi、Fukuzawa Kaori、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  Computational and Theoretical Chemistry
  
  巻: 1132 ページ: 23-34
- DOI
  10.1016/j.comptc.2018.04.001
- NAID
  120006482609
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K05397, KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Meteorite impacts on ancient oceans opened up multiple NH3 production pathways2017
- 著者名/発表者名
  Kohei Shimamura, Fuyuki Shimojo, Aiichiro Nakano, and Shigenori Tanaka
- 雑誌名
  
  Physical Chemistry Chemical Physics
  
  巻: 印刷中号: 18 ページ: 11655-11667
- DOI
  10.1039/c7cp00870h
- NAID
  120006318803
- 査読あり / 謝辞記載あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K17782, KAKENHI-PROJECT-16K05478, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Newly characterized interaction stabilizes DNA structure: oligoethylene glycols stabilize G-quadruplexes CH?π interactions2017
- 著者名/発表者名
  Tateishi-Karimata Hisae、Ohyama Tatsuya、Muraoka Takahiro、Podbevsek Peter、Wawro Adam M.、Tanaka Shigenori、Nakano Shu-ichi、Kinbara Kazushi、Plavec Janez、Sugimoto Naoki
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research
  
  巻: 45 号: 12 ページ: 7021-7030
- DOI
  10.1093/nar/gkx299
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K05941, KAKENHI-PROJECT-26410170, KAKENHI-PLANNED-17H06353, KAKENHI-PROJECT-16H02283, KAKENHI-PROJECT-17H04885, KAKENHI-PROJECT-16H04129
[雑誌論文] An Effective Microscopic Index Associated with Cell Survival and DNA Lesions for Estimating Radiation Risk2017
- 著者名/発表者名
  K. Yoshinari, S. Tanaka, K. Ebina
- 雑誌名
  
  J. Environ. Health Sci.
  
  巻: 3 号: 1 ページ: 1-5
- DOI
  10.15436/2378-6841.17.1187
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Theoretical Analysis of Activity Cliffs among Benzofuranone Class Pim1 Inhibitors Using the Fragment Molecular Orbital Method with Molecular Mechanics Poisson-Boltzmann Surface Area (FMO+MM-PBSA) Approach2017
- 著者名/発表者名
  C. Watanabe, H. Watanabe, K. Fukuzawa, L. Parker, Y. Okiyama, H. Yuki, S. Yokoyama, H. Nakano, S. Tanaka, T. Honma
- 雑誌名
  
  J. Chem. Inf. Model.
  
  巻: 57 号: 12 ページ: 2996-3010
- DOI
  10.1021/acs.jcim.7b00110
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353, KAKENHI-PROJECT-15K05397
[雑誌論文] Information Geometrical Characterization of the Onsager-Machlup Process2017
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 雑誌名
  
  Chem. Phys. Lett.
  
  巻: 689 ページ: 152-155
- DOI
  10.1016/j.cplett.2017.10.005
- NAID
  120006375911
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Structural transition of solvated H-Ras/GTP revealed by molecular dynamics simulation and local network entropy2017
- 著者名/発表者名
  Matsunaga Shota、Hano Yuta、Saito Yuta、Fujimoto Kazuhiro J.、Kumasaka Takashi、Matsumoto Shigeyuki、Kataoka Tohru、Shima Fumi、Tanaka Shigenori
- 雑誌名
  
  Journal of Molecular Graphics and Modelling
  
  巻: 77 ページ: 51-63
- DOI
  10.1016/j.jmgm.2017.07.028
- NAID
  120006406708
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15106, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Improved Equation of State for Finite-Temperature Spin-Polarized Electron Liquids on the Basis of Singwi-Tosi-Land-Sjolander Approximation2017
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 雑誌名
  
  Contrib. Plasma Phys.
  
  巻: 57 号: 3 ページ: 126-136
- DOI
  10.1002/ctpp.201600096
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] FMO創薬を加速する大規模データ解析2017
- 著者名/発表者名
  田中成典、福澤薫、本間光貴
- 雑誌名
  
  日本化学会情報化学部会誌
  
  巻: 35 号: 3 ページ: 205
- DOI
  10.11546/cicsj.35.205
- NAID
  130006792848
- ISSN
  0913-3747, 1347-2283
- 言語
  日本語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K05397
[雑誌論文] Cosolvent-Based Molecular Dynamics for Ensemble Docking: Practical Method for Generating Druggable Protein Conformations2017
- 著者名/発表者名
  S. Uehara, S. Tanaka
- 雑誌名
  
  J. Chem. Inf. Model.
  
  巻: 57 号: 4 ページ: 742-756
- DOI
  10.1021/acs.jcim.6b00791
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035, KAKENHI-PLANNED-17H06353
[雑誌論文] Four-Electron Model for Singlet and Triplet Excitation Energy Transfers with Inclusion of Coherence Memory, Inelastic Tunneling and Nuclear Quantum Effects2016
- 著者名/発表者名
  Y. Suzuki, K. Ebina, S. Tanaka
- 雑誌名
  
  Chem. Phys.
  
  巻: 474 ページ: 18-24
- DOI
  10.1016/j.chemphys.2016.05.001
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[雑誌論文] Local thermodynamics of the water molecules around single- and double-stranded DNA studied by grid inhomogeneous solvation theory2016
- 著者名/発表者名
  Nakano M, Tateishi-Karimata H, Tanaka S, Tama F, Miyashita O, Nakano S, and Sugimoto N
- 雑誌名
  
  CHEMICAL PHYSICS LETTERS
  
  巻: 660 ページ: 250-255
- DOI
  10.1016/j.cplett.2016.08.032
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-26119006, KAKENHI-PROJECT-16H02283, KAKENHI-PROJECT-26460035, KAKENHI-PROJECT-26810094
[雑誌論文] Meteorite Impact-Induced Rapid NH3 Production on Early Earth: Ab Initio Molecular Dynamics Simulation2016
- 著者名/発表者名
  K. Shimamura, F. Shimojo, A. Nakano, S. Tanaka
- 雑誌名
  
  Sci. Rep.
  
  巻: 6 号: 1 ページ: 38953-38953
- DOI
  10.1038/srep38953
- NAID
  120005950966
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035, KAKENHI-PROJECT-16K05478, KAKENHI-PROJECT-16K17782
[雑誌論文] Diffusion Monte Carlo Study on Temporal Evolution of Entropy and Free Energy in Nonequilibrium Processes2016
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 雑誌名
  
  J. Chem. Phys.
  
  巻: 144 号: 9 ページ: 094103-094103
- DOI
  10.1063/1.4942861
- NAID
  120005842522
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[雑誌論文] Reduced Minimum Model for the Photosynthetic Induction Processes in Photosystem I2016
- 著者名/発表者名
  T. Matsuoka, S. Tanaka, K. Ebina
- 雑誌名
  
  J. Photochem. Photobiol. B: Biology
  
  巻: 160 ページ: 364-375
- DOI
  10.1016/j.jphotobiol.2016.04.009
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[雑誌論文] Correlational and Thermodynamic Properties of Finite-Temperature Electron Liquids in the Hypernetted-Chain Approximation2016
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 雑誌名
  
  J. Chem. Phys.
  
  巻: 145 号: 21 ページ: 214104-214104
- DOI
  10.1063/1.4969071
- NAID
  120005970764
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[雑誌論文] AutoDock-GIST: Incorporating Thermodynamics of Active-Site Water into Scoring Function for Accurate Protein-Ligand Docking2016
- 著者名/発表者名
  S. Uehara, S. Tanaka
- 雑誌名
  
  Molecules
  
  巻: 21 号: 11 ページ: 1604-1604
- DOI
  10.3390/molecules21111604
- NAID
  120005950958
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[雑誌論文] Thermodynamic Properties of Water Molecules in the Presence of Cosolute Depend on DNA Structure: A Study Using Grid Inhomogeneous Solvation Theory2015
- 著者名/発表者名
  M. Nakano, H. Tateishi-Karimata, S. Tanaka, F. Tama, O. Miyashita, S. Nakano, N. Sugimoto
- 雑誌名
  
  Nucl. Acids Res.
  
  巻: 43 ページ: 10114-10125
- DOI
  10.1093/nar/gkv1133
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035, KAKENHI-PROJECT-26810094, KAKENHI-PLANNED-26119006, KAKENHI-PROJECT-26620138
[雑誌論文] Theoretical prediction and experimental verification on enantioselectivity of haloacid dehalogenase L-DEX YL with chloropropionate2015
- 著者名/発表者名
  Hirotaka Kondo, Kazuhiro J. Fujimoto, Shigenori Tanaka, Hiroyuki Deki, and Takashi Nakamura
- 雑誌名
  
  Chem. Phys. Lett.
  
  巻: 623 ページ: 101-107
- DOI
  10.1016/j.cplett.2015.01.053
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25810004, KAKENHI-PROJECT-26460035
[雑誌論文] Explicit Solvation Modulates Intra- and Inter-Molecular Interactions within DNA: Electronic Aspects Revealed by the Ab Initio Fragment Molecular Orbital (FMO) Method2015
- 著者名/発表者名
  K. Fukuzawa, I. Kurisaki, C. Watanabe, Y. Okiyama, Y. Mochizuki, S. Tanaka, Y. Komeiji
- 雑誌名
  
  Comput. Theor. Chem.
  
  巻: 1054 ページ: 29-37
- DOI
  10.1016/j.comptc.2014.11.020
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[雑誌論文] Protein-Ligand Docking Using Fitness Learning-Based Artificial Bee Colony with Proximity Stimuli2015
- 著者名/発表者名
  S. Uehara, K. J. Fujimoto, S. Tanaka
- 雑誌名
  
  Phys. Chem. Chem. Phys.
  
  巻: 17 号: 25 ページ: 16412-16417
- DOI
  10.1039/c5cp01394a
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[雑誌論文] Novel Type of Virtual Ligand Screening on the Basis of Quantum-Chemical Calculations for Protein-Ligand Complexes and Extended Clustering Techniques2015
- 著者名/発表者名
  R. Kurauchi, C. Watanabe, K. Fukuzawa, S. Tanaka
- 雑誌名
  
  Comput. Theor. Chem.
  
  巻: 1061 ページ: 12-22
- DOI
  10.1016/j.comptc.2015.02.016
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[雑誌論文] i-Motifs Are More Stable than G-Quadruplexes in a Hydrated Ionic Liquid2015
- 著者名/発表者名
  H. Tateishi-Karimata, M. Nakano, S. Pramanik, S. Tanaka, N. Sugimoto
- 雑誌名
  
  Chem. Commun.
  
  巻: 51 号: 32 ページ: 6909-6912
- DOI
  10.1039/c5cc00666j
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035, KAKENHI-PROJECT-26810094, KAKENHI-PROJECT-26620138
[雑誌論文] Systems Approach to Excitation-Energy and Electron Transfer Reaction Networks in Photosystem II Complex: Model Studies for Chlorophyll a Fluorescence Induction Kinetics2015
- 著者名/発表者名
  T. Matsuoka, S. Tanaka, K. Ebina
- 雑誌名
  
  J. Theor. Biol.
  
  巻: 380 ページ: 220-237
- DOI
  10.1016/j.jtbi.2015.05.006
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[雑誌論文] Effects of Bridge Functions on Radial Distribution Functions of Liquid Water2015
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka, M. Nakano
- 雑誌名
  
  Interdiscip. Sci. Comput. Life Sci.
  
  巻: 7 号: 2 ページ: 152-156
- DOI
  10.1007/s12539-015-0013-2
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[雑誌論文] Classical Density Functional Calculation of Radial Distribution Functions of Liquid Water2014
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka and M. Nakano
- 雑誌名
  
  Chem. Phys
  
  巻: 430 ページ: 18-22
- DOI
  10.1016/j.chemphys.2013.12.007
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451, KAKENHI-PROJECT-26460035
[雑誌論文] Interaction Energy Analysis on Specific Binding of Influenza Virus Hemagglutinin to Avian and Human Sialosaccharide Receptors: Importance of Mutation-Induced Structural Change2014
- 著者名/発表者名
  S. Anzaki, C. Watanabe, K. Fukuzawa, Y. Mochizuki, S. Tanaka
- 雑誌名
  
  J. Mol. Graph. Model.
  
  巻: 53 ページ: 48-58
- DOI
  10.1016/j.jmgm.2014.07.004
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[雑誌論文] Charge Clamps of Lysines and Hydrogen Bonds Play Key Roles in the Mechanism to Fix Helix 12 in the Agonist and Antagonist Positions of Estrogen Receptor α: Intramolecular Interactions Studied by the Ab Initio Fragment Molecular Orbital Method2014
- 著者名/発表者名
  C. Watanabe, K. Fukuzawa, S. Tanaka, and S. Aida-Hyugaji
- 雑誌名
  
  J. Phys. Chem
  
  巻: B118 号: 19 ページ: 4993-5008
- DOI
  10.1021/jp411627y
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451, KAKENHI-PROJECT-26460035
[雑誌論文] Choline Ion Interactions with DNA Atoms Explain Unique Stabilization of A-T Base Pairs in DNA Duplexes: A Microscopic View2014
- 著者名/発表者名
  M. Nakano, H. Tateishi-Karimata, S. Tanaka, N. Sugimoto
- 雑誌名
  
  J. Phys. Chem. B
  
  巻: 118 号: 2 ページ: 379-389
- DOI
  10.1021/jp406647b
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451, KAKENHI-PROJECT-24245033, KAKENHI-PROJECT-24655161, KAKENHI-PROJECT-24750168, KAKENHI-PROJECT-26460035
[雑誌論文] The affinity of molecular ions for DNA structures is determined by solvent accessible surface area2014
- 著者名/発表者名
  M. Nakano, H. Tateishi-Karimata, S. Tanaka, and N. Sugimoto
- 雑誌名
  
  J. Phys. Chem. B
  
  巻: 118 号: 32 ページ: 9583-9594
- DOI
  10.1021/jp505107g
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24245033, KAKENHI-PROJECT-26460035, KAKENHI-PROJECT-26620138, KAKENHI-PROJECT-26810094
[雑誌論文] Accuracy of the Fragment Molecular Orbital (FMO) Calculations for DNA: Total Energy, Molecular Orbital, and Inter-Fragment Interaction Energy2014
- 著者名/発表者名
  K. Fukuzawa, C. Watanabe, I. Kurisaki, N. Taguchi, Y. Mochizuki, T. Nakano, S. Tanaka, Y. Komeiji
- 雑誌名
  
  Computational and Theoretical Chemistry
  
  巻: 1034 ページ: 7-16
- DOI
  10.1016/j.comptc.2014.02.002
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22350023, KAKENHI-PROJECT-23540451, KAKENHI-PROJECT-26460035
[雑誌論文] Electron- Correlated Fragment-Molecular-Orbital Calculations for Biomolecular and Nano Systems2014
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka, Y. Mochizuki, Y. Komeiji, Y. Okiyama, K. Fukuzawa
- 雑誌名
  
  Phys. Chem. Chem. Phys
  
  巻: 16 号: 22 ページ: 10310-10344
- DOI
  10.1039/c4cp00316k
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22350023, KAKENHI-PROJECT-23540451, KAKENHI-PROJECT-26460035
[雑誌論文] Hierarchical Coarse-Graining Model for Photosystem II Including Electron and Excitation-Energy Transfer Processes2014
- 著者名/発表者名
  T. Matsuoka, S. Tanaka, K. Ebina
- 雑誌名
  
  BioSystems
  
  巻: 117 ページ: 15-29
- DOI
  10.1016/j.biosystems.2013.12.008
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[雑誌論文] A Significant Role of Arg41 Residue in the Enzymatic Reaction of Haloacid Dehalogenase L-DEX YL Studied by QM/MM Method2014
- 著者名/発表者名
  H. Kondo, T. Nakamura, S. Tanaka
- 雑誌名
  
  J. Mol. Catal. B
  
  巻: 110 ページ: 23-31
- DOI
  10.1016/j.molcatb.2014.09.006
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[雑誌論文] Statistical Correction to Effective Interactions in the Fragment Molecular Orbital Method2013
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka, C. Watanabe, and Y. Okiyama
- 雑誌名
  
  Chem. Phys. Lett
  
  巻: 556 ページ: 272-277
- DOI
  10.1016/j.cplett.2012.11.085
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[雑誌論文] Triplet Correlations and Bridge Functions in Classical Density Functional Theory for Liquid Water2013
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka and M. Nakano
- 雑誌名
  
  Chem. Phys. Lett
  
  巻: 572 ページ: 38-43
- DOI
  10.1016/j.cplett.2013.04.005
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[雑誌論文] Modeling of peptide - silica interaction based on four-body corrected fragment molecular orbital (FMO4) calculations2013
- 著者名/発表者名
  Y. Okiyama
- 雑誌名
  
  Chemical Physics Letters
  
  巻: 566 ページ: 25-31
- DOI
  10.1016/j.cplett.2013.02.020
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22350023, KAKENHI-PROJECT-23540451
[雑誌論文] Three- and Four-body Corrected Fragment Molecular Orbital Calculations with a Novel Subdividing Fragmentation Method Applicable to Structure-Based Drug Design2013
- 著者名/発表者名
  C. Watanabe, K. Fukuzawa, Y. Okiyama, T. Tsukamoto, A. Kato, S. Tanaka, Y. Mochizuki, T. Nakano
- 雑誌名
  
  Journal of Molecular Graphics and Modelling
  
  巻: 41 ページ: 31-42
- DOI
  10.1016/j.jmgm.2013.01.006
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22350023, KAKENHI-PROJECT-23540451
[雑誌論文] Variational Quantum Monte Carlo with Inclusion of Orbital Correlations2013
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 雑誌名
  
  J. Phys. Soc. Jpn
  
  巻: 82 号: 7 ページ: 75001-75001
- DOI
  10.7566/jpsj.82.075001
- NAID
  210000132670
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[雑誌論文] Development of the Four-Body Corrected Fragment Molecular Orbital (FMO4) Method2012
- 著者名/発表者名
  T.Nakano, Y.Mochizuki, K.Yamashita, C.Watanabe, K.Fukuzawa, K.Segawa, Y.Okiyama, T.Tsukamoto, S.Tanaka
- 雑誌名
  
  Chemical Physics Letters
  
  巻: 523 ページ: 128-133
- DOI
  10.1016/j.cplett.2011.12.004
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22350023, KAKENHI-PROJECT-23540451
[雑誌論文] Ab initio path integral Monte Carlo simulations for water trimer with electron correlation effects2012
- 著者名/発表者名
  T. Fujita
- 雑誌名
  
  Computational and Theoretical Chemistry
  
  巻: 997 ページ: 7-13
- DOI
  10.1016/j.comptc.2012.07.029
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22350023, KAKENHI-PROJECT-23540451
[雑誌論文] 量子モンテカルロ法による分子系のシミュレーション2011
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 雑誌名
  
  信学技報 IEICE Technical Report
  
  巻: 111, No. 255 ページ: 47-48
- NAID
  110008900034
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[雑誌論文] Fragment Molecular Orbital Calculations under Periodic Boundary Condition2011
- 著者名/発表者名
  T. Fujita, T. Nakano, S. Tanaka
- 雑誌名
  
  Chem. Phys. Lett.
  
  巻: 506 号: 1-3 ページ: 112-116
- DOI
  10.1016/j.cplett.2011.02.055
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[雑誌論文] Charge transfer through double-strand DNA and its base-mismatched ones : theoretical analysis based on semiempirical molecular orbital calculations2005
- 著者名/発表者名
  Natsume, T., Dedachi, K., Tanaka, S., Higuchi, T.Kurita, N.
- 雑誌名
  
  Chemical Physics Letters 408
  
  ページ: 381-388
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15310088
[雑誌論文] Investigation of a Kubo-formula-based approach to estimate DNA conductance in an atomistic model2005
- 著者名/発表者名
  Starikov, E., Tanaka, S., Kurita, N., Sengoku, Y., Natsume, T., Wenzel, W.
- 雑誌名
  
  The European Physical Journal E 18
  
  ページ: 437-445
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15310088
[雑誌論文] Charge Transfer through Double-strand DNA and its Base-mismatched Ones : Theoretical Analysis Based on Semiempirical Molecular Orbital Calculations2005
- 著者名/発表者名
  Natsume, T., Dedachi, K., Tanaka, S., Higuchi, T., Kurita, N.
- 雑誌名
  
  Chemical Physics Letters 408
  
  ページ: 381-388
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15310088
[雑誌論文] 密度汎関数法に基づくフラグメント分子軌道法を用いたDNA電子状態計算2004
- 著者名/発表者名
  仙石康雄, 松岡誠, 杉木真一郎, 田中成典, 栗田典之, 関野秀男
- 雑誌名
  
  J. Comput. Aided Chem. 5
  
  ページ: 1-8
- NAID
  130004428053
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15310088
[雑誌論文] 1重鎖及び2重鎖DNAの電流電圧特性の理論的解析2004
- 著者名/発表者名
  出立兼一, 夏目貴行, 田中成典, 樋口高年, 栗田典之
- 雑誌名
  
  J. Comput. Aided Chem. 5
  
  ページ: 52-61
- NAID
  130004428057
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15310088
[雑誌論文] DFT-FMO calculations on electronic states of DNA2004
- 著者名/発表者名
  Sengoku, Y., Matsuoka, M., Sugiki, S., Tanaka, S., Kurita, N., Sekino, H.
- 雑誌名
  
  J.Comput.Aided Chem. 5
  
  ページ: 1-8
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15310088
[雑誌論文] Charge transfer through single and double-strabd DNAs : theoretical analysis based on molecular orbital calculations2004
- 著者名/発表者名
  Dedachi, K., Natsume, T., Tanaka, S., Higuchi, T., Kurita, N.
- 雑誌名
  
  J.Comput.Aided Chem. 5
  
  ページ: 52-61
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15310088
[雑誌論文] DNA鎖の第一原理計算の現状と将来2003
- 著者名/発表者名
  田中成典, 福澤薫, 中野達也, 栗田典之
- 雑誌名
  
  表面科学 24
  
  ページ: 664-670
- NAID
  10012433680
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15310088
[雑誌論文] Charge Transfer in Duplex DNA Containing Mismatch2003
- 著者名/発表者名
  Okada, A., Yokojima, S., Kurita, N., Sengoku, Y., Tanaka, S.
- 雑誌名
  
  Journal of Molecular Structure 630
  
  ページ: 283-290
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15310088
[雑誌論文] Hydrogen Bonding of DNA Base Pairs by Consistent Charge Equilibration Method Combined with Universal Force Field2003
- 著者名/発表者名
  Ogawa, T., Kurita, N., Sekino, H., Kitao, O., Tanaka, S.
- 雑誌名
  
  Chemical Physics Letters 374
  
  ページ: 271-278
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15310088
[学会発表] 量子散逸系に対する準古典マッピング動力学法の精度検証2023
- 著者名/発表者名
  鬼頭宏任、梅垣俊仁、西山陽大、田中成典
- 学会等名
  日本物理学会2023年春季大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06098
[学会発表] Quantum Brain Dynamics and Holography2022
- 著者名/発表者名
  Akihiro Nishiyama, Shigenori Tanaka, Jack A. Tuszynski
- 学会等名
  The Science of Consciousness 2022
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06098
[学会発表] Dynamical Association/Dissociation Processes of Biomolecules in Crowding Conditions2022
- 著者名/発表者名
  Shigenori Tanaka
- 学会等名
  2nd International Symposium on Chemistry for Multimolecular Crowding Biosystems (CMCB2022)
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[学会発表] Dynamical Association/Dissociation Processes of Biomolecules in Crowding Conditions2022
- 著者名/発表者名
  Shigenori Tanaka
- 学会等名
  2nd International Symposium on Chemistry for Multimolecular Crowding Biosystems (CMCB2022)
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06098
[学会発表] 量子意思決定の自由エネルギーモデル2022
- 著者名/発表者名
  田中成典、梅垣俊仁、西山陽大、鬼頭宏任
- 学会等名
  量子生命科学会第4回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06098
[学会発表] 量子認知と意思決定の自由エネルギー理論2022
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  CBI学会2022年大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06098
[学会発表] Non-equilibrium φ4 Theory in a Hierarchy: Towards Manipulating Holograms in Quantum Brain Dynamics2022
- 著者名/発表者名
  Akihiro Nishiyama, Shigenori Tanaka, Jack A. Tuszynski
- 学会等名
  The 5th International Forum on Quantum Metrology and Sensing
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06098
[学会発表] Fragment Molecular Orbital Calculations for SARS-CoV-2 Proteins2021
- 著者名/発表者名
  Shigenori Tanaka
- 学会等名
  The 3rd R-CCS International Symposium
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825
[学会発表] Fragment Molecular Orbital Calculations for SARS-CoV-2 Proteins2021
- 著者名/発表者名
  Shigenori Tanaka
- 学会等名
  The 3rd R-CCS International Symposium
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[学会発表] ナノ空間での熱伝導・温度緩和：温度生物学の基礎として2020
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  Biothermology Workshop 2020
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[学会発表] ナノ空間での熱伝導・温度緩和：温度生物学の基礎として2020
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  Biothermology Workshop 2020
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825
[学会発表] FMOデータベースの情報科学的な活用2019
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  日本薬学会第139年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[学会発表] Quantum Brain Dynamics from a Viewpoint of Field Theory2019
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka and A. Nishiyama
- 学会等名
  The 2nd Workshop on Quantum Cognition
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[学会発表] Perspectives of Computational Drug Discovery: AMED-BINDS Activities in Japan2019
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 学会等名
  AHeDD2019/IPAB2019 Joint Symposium
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825
[学会発表] 多体問題と生命2019
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  研究会「計算生命科学：多体問題から生命システムへ」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[学会発表] FMOデータベースの情報科学的な活用2019
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  日本薬学会第139年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825
[学会発表] 生命と量子2019
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  JST-CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」研究領域・第12回数理デザイン道場
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[学会発表] Perspectives of Computational Drug Discovery: AMED-BINDS Activities in Japan2019
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 学会等名
  AHeDD2019/IPAB2019 Joint Symposium
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[学会発表] 多体問題と生命2019
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  研究会「計算生命科学：多体問題から生命システムへ」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825
[学会発表] 生命と量子2019
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  JST-CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」研究領域・第12回数理デザイン道場
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825
[学会発表] Quantum Brain Dynamics from a Viewpoint of Field Theory2019
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka and A. Nishiyama
- 学会等名
  The 2nd Workshop on Quantum Cognition
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825
[学会発表] ハロ酸デハロゲナーゼL-DEX YLの触媒する脱ハロゲン化反応の量子化学計算による反応経路特定2019
- 著者名/発表者名
  田中　悠介、中村　卓、近藤　洋隆、渡邉　博文、田中　成典
- 学会等名
  日本化学会　第99春季年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16KT0166
[学会発表] ライフサイエンスと量子コンピューティング2018
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  第25回バイオメディカル研究会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[学会発表] インシリコ創薬の展望2018
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  第56回日本生物物理学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[学会発表] ライフサイエンスと量子コンピューティング2018
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  第25回バイオメディカル研究会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825
[学会発表] BINDSインシリコユニットの紹介2018
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  CBI学会2018年大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[学会発表] QM/MM法によるハロ酸脱ハロゲン化酵素L-DEX YLのフルオロ酢酸分解反応の機構解析2018
- 著者名/発表者名
  中村　卓、近藤　洋隆、渡邉　博文、田中　成典
- 学会等名
  日本化学会　第12回バイオ関連化学シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16KT0166
[学会発表] インシリコ創薬の展望2018
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  第56回日本生物物理学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825
[学会発表] BINDSインシリコユニットの紹介2018
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  CBI学会2018年大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03825
[学会発表] 量子生命科学の展望2017
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  第1回量子生命科学研究会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[学会発表] 水溶液中の生体分子の構造変化に伴う自由エネルギー解析2017
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  FIBER未来大学・第2回研究成果報告会
- 発表場所
  甲南大学（兵庫県・神戸市）
- 年月日
  2017-01-10
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[学会発表] 量子生命科学の展望2017
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  科学基礎論学会2017年度秋の研究例会シンポジウム「生命科学および認知科学における量子論的アプローチ」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[学会発表] バイオシミュレーションにおける分子夾雑効果2017
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  日本化学会第97春季年会・特別企画「分子夾雑の生命化学」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[学会発表] バイオシミュレーションにおける分子夾雑効果2017
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  日本化学会第97春季年会・特別企画「分子夾雑の生命化学」
- 発表場所
  慶応義塾大学（神奈川県・横浜市）
- 年月日
  2017-03-16
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[学会発表] Charge and Energy Transfer Dynamics in Biological Systems2017
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 学会等名
  1st QST International Symposium “Quantum Life Science”
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06353
[学会発表] 水和生体分子系の熱力学2017
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  公開シンポジウム「気候変動の中での（植物）生態系へのマクロ、ミクロからの考察：光合成、植物進化までを視座に置いて」
- 発表場所
  酪農学園大学（北海道・江別市）
- 年月日
  2017-02-20
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[学会発表] 量子生命科学の展望2017
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  第1回量子生命科学研究会
- 発表場所
  東京大学山上会館（東京都・文京区）
- 年月日
  2017-04-12
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[学会発表] Theoretical Study on Dynamics and Functions of Solvated Biomolecules2016
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 学会等名
  FIBER Future College: FIBER国際核酸サミット2016
- 発表場所
  甲南大学（兵庫県・神戸市）
- 年月日
  2016-07-06
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[学会発表] 機械学習を援用したUbiquitin のアミノ酸残基間の相互作用解析2016
- 著者名/発表者名
  望月祐志，藤本真悠，古明地勇人，飯島潤，齊藤天菜，土居英男，奥沢明，牧村健，中西貴哉，福澤薫，田中成典
- 学会等名
  第77回応用物理学会秋季学術講演会
- 発表場所
  新潟
- 年月日
  2016-09-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K05397
[学会発表] Singular Value Decomposition in the FMO-IFIE Analysis for Ligand Screening2016
- 著者名/発表者名
  Keiya Maruyama, Yinglei Sheng, Hirofumi Watanabe, Kaori Fukuzawa, Shigenori Tanaka
- 学会等名
  CBI学会2016年次大会
- 発表場所
  東京
- 年月日
  2016-10-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K05397
[学会発表] タンパク質の量子化学計算の現状2015
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  第15回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  あわぎんホール（徳島県・徳島市）
- 年月日
  2015-06-24
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[学会発表] 大規模シミュレーションによる生体分子機能デザインの試み2015
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  甲南大学先端生命工学研究所（FIBER）私立大学研究基盤形成支援事業第1回研究成果報告会（FIBER未来大学シリーズ Series 10）
- 発表場所
  甲南大学（兵庫県神戸市）
- 年月日
  2015-01-07
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[学会発表] フラグメント分子軌道法に基づくアカデミア創薬2015
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  CBI学会2015年大会
- 発表場所
  タワーホール船堀（東京都・江東区）
- 年月日
  2015-10-28
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[学会発表] Nonequilibrium Processes in Biomolecular Systems2015
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 学会等名
  Workshop on "Current Topics in Nano Simulations" (CT-NanoSim2015)
- 発表場所
  Tsukuba University (Ibaraki, Tsukuba)
- 年月日
  2015-09-17
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[学会発表] 生体分子ダイナミクスにおける階層性と粗視化2015
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  神戸大学先端融合科学シンポジウム「生体分子のダイナミクスを眺める」
- 発表場所
  神戸大学（兵庫県神戸市）
- 年月日
  2015-01-20
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[学会発表] 生体分子系における非平衡過程2015
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  バイオスーパーコンピューティング神戸2015
- 発表場所
  神戸大学（兵庫県・神戸市）
- 年月日
  2015-11-30
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[学会発表] 生体分子系のボトムアップ・マルチスケールシミュレーションに向けて2015
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  High Performance Computing Chemistry 2015ワークショップ
- 発表場所
  理化学研究所・計算科学研究機構（兵庫県・神戸市）
- 年月日
  2015-12-01
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[学会発表] FMO Pharmaceutical Applications2015
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 学会等名
  Workshop on Innovation and Pioneering Technology – Innovation by Synergy of Computational & Synchrotron Radiation Sciences (WINTech 2015)
- 発表場所
  神戸大学（兵庫県神戸市）
- 年月日
  2015-03-12
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[学会発表] Toward First-Principles Simulations for the Origin of Life2015
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 学会等名
  Mini-Symposium on Functional and Biogenous Materials II
- 発表場所
  岡山大学（岡山県岡山市）
- 年月日
  2015-03-20
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[学会発表] Multi-Scale Simulations for Complex Biomolecular Systems2014
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 学会等名
  Workshop on Current Topics in Nano Simulations (CT-NanoSim2014)
- 発表場所
  University of Tsukuba, Tsukuba, Japan
- 年月日
  2014-03-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] 大規模分子シミュレーション技術の医療・創薬への応用2014
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  探索医療薬物研究会第2回合同シンポジウム「創薬と医療－基礎と臨床の架け橋」
- 発表場所
  大阪薬科大学（大阪府高槻市）
- 年月日
  2014-09-13
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26460035
[学会発表] Large-Scale Biomolecular Simulations on the Basis of Fragment Molecular Orbital Method2014
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 学会等名
  International Workshop on Eigenvalue Problems : Algorithms, Software and Applications in Petascale Computing (EPASA2014)
- 発表場所
  Tsukuba International Congress Center, Tsukuba, Japan
- 年月日
  2014-03-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] Exploring Theoretical Models for Water2013
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 学会等名
  The 5th JCS International Symposium on Theoretical Chemistry
- 発表場所
  Todai-ji Culture Center, Nara, Japan
- 年月日
  2013-12-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] 第一原理シミュレーションによる生体高分子の電子状態・ダイナミクス・輸送特性の解析2013
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  日本磁気学会第190回研究会「生体物質の物理」
- 発表場所
  中央大学駿河台記念館, 東京
- 年月日
  2013-05-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] フラグメント分子軌道法を用いた薬剤耐性メカニズムの解析2013
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  平成24年度地球シミュレータ利用報告会
- 発表場所
  海洋研究開発機構横浜研究所三好記念講堂, 横浜
- 年月日
  2013-01-31
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] 第一原理シミュレーションと創薬2013
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  HPCI ワークショップ2013
- 発表場所
  産業技術総合研究所臨海副都心センター, 東京
- 年月日
  2013-09-11
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] 大規模分子シミュレーションと創薬2013
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  VINAS Users Conference 2013
- 発表場所
  東京コンファレンスセンター品川, 東京
- 年月日
  2013-10-11
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] Structure-Based Drug Design with the Fragment Molecular Orbital Method2013
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 学会等名
  Workshop on Innovation and Pioneering Technology - Recent Development in Drug Discovery Sciences (WINPTech 2012)
- 発表場所
  Kobe University, Kobe, Japan
- 年月日
  2013-02-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] 大規模シミュレーションの意義2013
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  科学基礎論学会2013年度講演会ワークショップ「High Performance Computing の哲学」
- 発表場所
  大阪大学大学院人間科学研究科(吹田キャンパス), 大阪
- 年月日
  2013-06-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] フラグメント分子軌道（FMO）計算の現状と今後2012
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  日本機械学会第25回計算力学講演会
- 発表場所
  甲南大学
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] FMO 計算の今後2012
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  第4回「イノベーション基盤シミュレーションソフトウェアの研究開発」シンポジウム
- 発表場所
  東京大学生産技術研究所, 東京
- 年月日
  2012-07-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] フラグメント分子軌道(FMO)計算の現状と今後2012
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  日本機械学会第25回計算力学講演会
- 発表場所
  甲南大学, 神戸
- 年月日
  2012-10-06
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] Towards the First-Principles and Coarse-Grained Descriptions for Charge and Energy Transfers in Biomolecular Systems2012
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 学会等名
  Joint Dresden-Japan Workshop on Molecular Scale and Organic Electronic Materials
- 発表場所
  Max Planck Institute for the Physics of Complex Systems (MPIPKS), Dresden, Germany
- 年月日
  2012-12-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] Towards the First-Principles and Coarse-Grained Descriptions for Charge and Energy Transfers in Biomolecular Systems2012
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 学会等名
  Indo-Japan Workshop on "Recent Advances in Spectroscopy and Microscopy : Fundamentals and Applications to Materials and Biology"
- 発表場所
  University of Hyderabad, Hyderabad, India
- 年月日
  2012-11-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] Charge and Energy Transfers in Biomolecular Systems2012
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 学会等名
  NRI-TUD Joint Workshop for Organic Nanomaterials 2012
- 発表場所
  AIST, Tsukuba, Japan
- 年月日
  2012-03-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] Multi-Scale Simulations for Biomolecular Functions2012
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 学会等名
  2nd AICS International Symposium - Computer and Computational Sciences for Exascale Computing -
- 発表場所
  RIKEN Advanced Institute for Computational Science, Kobe, Japan
- 年月日
  2012-03-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] フラグメント分子軌道法を用いた薬剤耐性メカニズムの解析2012
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  平成23年度地球シミュレータ利用報告会
- 発表場所
  海洋研究開発機構横浜研究所三好記念講堂, 横浜
- 年月日
  2012-02-07
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] Multi-Scale Simulations for Complex Biomolecular Systems
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 学会等名
  Workshop on Current Topics in Nano Simulations (CT-NanoSim2014)
- 発表場所
  University of Tsukuba (Tsukuba)
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] Large-Scale Biomolecular Simulations on the Basis of Fragment Molecular Orbital Method
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 学会等名
  International Workshop on Eigenvalue Problems: Algorithms, Software and Applications in Petascale Computing (EPASA2014)
- 発表場所
  Tsukuba International Congress Center (Tsukuba)
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] 第一原理シミュレーションによる生体高分子の電子状態・ダイナミクス・輸送特性の解析
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  日本磁気学会第190回研究会「生体物質の物理」
- 発表場所
  中央大学駿河台記念館（東京）
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] 第一原理シミュレーションと創薬
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  HPCIワークショップ2013
- 発表場所
  産業技術総合研究所臨海副都心センター（東京）
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] 大規模シミュレーションの意義
- 著者名/発表者名
  田中成典
- 学会等名
  科学基礎論学会2013年度講演会ワークショップ「High Performance Computingの哲学」
- 発表場所
  大阪大学大学院人間科学研究科（吹田キャンパス、大阪）
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451
[学会発表] Exploring Theoretical Models for Water
- 著者名/発表者名
  S. Tanaka
- 学会等名
  The 5th JCS International Symposium on Theoretical Chemistry
- 発表場所
  Todai-ji Culture Center (Nara)
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23540451

1. 鶴田宏樹 (20346282)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
2. 島扶美 (60335445)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 北原亮 (70512284)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 栗田典之 (40283501)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 10件
5. 中村卓 (80344050)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
6. 福澤薫 (50718244)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
7. 本間光貴 (10466039)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 熊坂崇 (30291066)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 片岡徹 (40144472)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 松本篤幸 (00753906)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
11. 藤本和宏 (00511255)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
12. 渡邉千鶴

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
13. 伊藤聡

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
14. 古明地勇人

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 8件
15. 建石寿枝

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 3件
16. 島村孝平

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
17. 望月祐志

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 4件
18. 下條冬樹

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
19. 川下理日人

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
20. TAMA FLORENCE

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
21. 杉本直己

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

田中 成典 TANAKA SHIGENORI

研究課題

研究成果

共同研究者

生体分子系におけるミクロな熱緩和現象の理論・シミュレーション解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

生命の起源物質生成の計算機シミュレーション：アミノ酸・核酸とその重合化研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

水を通して見る生体分子夾雑系の情報熱力学研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

酵素の機能改良のための遷移状態解析法の開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

量子化学計算に基づく生体高分子の超分解能構造解析技術の開発と創薬への応用

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

創薬への応用に向けたrasがん遺伝子産物の構造ダイナミクスの分子機構の解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

計算創薬のための蛋白質複合系の精密構造・相互作用解析手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

量子モンテカルロ－フラグメント分子軌道法による水の第一原理シミュレーション研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

量子化学計算による電流検出型DNAチップの特性解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[図書] Recent Advances of the Fragment Molecular Orbital Method: Enhanced Performance and Applicability2021

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] Recent Advances of the Fragment Molecular Orbital Method: Enhanced Performance and Applicability2021

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[図書] Entropy-Enthalpy Compensation: Finding a Methodological Common Denominator through Probability, Statistics, and Physics2021

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] Entropy-Enthalpy Compensation: Finding a Methodological Common Denominator through Probability, Statistics, and Physics2021

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

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データソース

田中成典 TANAKA SHIGENORI