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新海 暁男  SHINKAI Akeo

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 10391989
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 開拓研究所, 特別嘱託研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2025年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 開拓研究本部, 上級研究員
2018年度 – 2019年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 開拓研究本部, 先任研究員
2015年度 – 2017年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 横山構造生物学研究室, 先任研究員
2013年度 – 2014年度: 独立行政法人理化学研究所, 横山構造生物学研究室, 先任研究員
2010年度 – 2012年度: 独立行政法人理化学研究所, 機能解析第1研究チーム, チームリーダー
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分43010:分子生物学関連 / 構造生物化学 / 分子生物学 / ゲノム生物学
キーワード
研究代表者
リボヌクレアーゼ / 低分子RNA / 超分子複合体 / CRISPR-Cas / Thermus thermophilus / 細菌 / 機能未知タンパク質 / 構造生物学 / 無細胞タンパク質合成法 / リボヌクレオタンパク質 … もっと見る / Cmr複合体 / CRISPR-Casシステム / 国際情報交換(オランダ、アメリカ) / タンパク質 / 電子顕微鏡構造 / 獲得免疫 / mRNA / 機能未知遺伝子 / 転写制御 / 機能ゲノム科学 / 転写因子 / TetRファミリー / 蛋白質 / 高度好熱菌 / 機能発見 / X線結晶構造 / 遺伝子発現調節 隠す
  • 研究課題

    (4件)
  • 研究成果

    (34件)
  • 共同研究者

    (3人)
  •  DNA維持メチル化制御因子HELLS-CDCA7の新規機能の探求研究代表者

    • 研究代表者
      新海 暁男
    • 研究期間 (年度)
      2025 – 2027
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分43010:分子生物学関連
    • 研究機関
      国立研究開発法人理化学研究所
  •  高分解能な立体構造解析による、高度好熱菌獲得免疫システムの解明研究代表者

    • 研究代表者
      新海 暁男
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2019
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      構造生物化学
    • 研究機関
      国立研究開発法人理化学研究所
  •  1つの細胞が持つ新奇なウイルス防御システムの体系的理解研究代表者

    • 研究代表者
      新海 暁男
    • 研究期間 (年度)
      2013 – 2015
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      分子生物学
    • 研究機関
      国立研究開発法人理化学研究所
  •  mRNA発現解析に基づいた、機能未知遺伝子の分類研究代表者

    • 研究代表者
      新海 暁男
    • 研究期間 (年度)
      2010 – 2012
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      ゲノム生物学
    • 研究機関
      独立行政法人理化学研究所

すべて 2016 2015 2014 2013 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 学会発表

  • [雑誌論文] Structures of the CRISPR-Cmr complex reveal mode of RNA target positioning.2015

    • 著者名/発表者名
      Taylor D.W., Zhu Y., Staals R.H.J., Kornfeld J.E., Shinkai A., van der Oost J., Nogales E., Doudna J.A.
    • 雑誌名

      Science

      巻: 348 号: 6234 ページ: 581-585

    • DOI

      10.1126/science.aaa4535

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25440013
  • [雑誌論文] 高度好熱菌Thermus thermophilus由来Type III-B CRISPR-Cmr複合体の構造と機能2015

    • 著者名/発表者名
      新海 暁男
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 87 号: 4 ページ: 454-458

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2015.870454

    • ISSN
      0037-1017
    • 年月日
      2015-08-25
    • 言語
      日本語
    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25440013
  • [雑誌論文] CRISPR-Casシステムの構造と機能2014

    • 著者名/発表者名
      新海 暁男
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 54 号: 5 ページ: 247-252

    • DOI

      10.2142/biophys.54.247

    • NAID

      130004693950

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • 言語
      日本語
    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25440013
  • [雑誌論文] RNA-targeting by the Type III-A CRISPR-Cas complex of Thermus thermophilus.2014

    • 著者名/発表者名
      Staals R.H.J., Zhu Y., Taylor D.W., Kornfeld J.E., Sharma K., Barendregt A., Koehorst J.J., Vlot M., Varossieau K., Neupane N., Sakamoto K., Suzuki T., Dohmae N., Yokoyama S., Schaap P.J., Urlaub H., Heck A.J.R., Nogales E., Doudna J.A., Shinkai A., van der Oost J.
    • 雑誌名

      Molecular Cell

      巻: 56 号: 4 ページ: 518-530

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2014.10.005

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25440013
  • [雑誌論文] LdrP, a cAMP receptor protein/FNR family transcriptional regulator, serves as a positive regulator for the light-inducible gene cluster in the megaplasmid of Thermus thermophilus2014

    • 著者名/発表者名
      Hideaki Takano, Yoshihiro Agari, Kenta Hagiwara, Ren Watanabe, Ryuta Yamazaki, Teruhiko Beppu, Akeo Shinkai, Kenji Ueda
    • 雑誌名

      Microbiology

      巻: 160 号: 12 ページ: 2650-2660

    • DOI

      10.1099/mic.0.082263-0

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208, KAKENHI-PROJECT-25450113
  • [雑誌論文] Structure and activity of the RNA-targeting Type III-B CRISPR-Cas complex of Thermus thermophilus2013

    • 著者名/発表者名
      Staals, R. H. J., Agari, Y., Maki-Yonekura, S., Zhu, Y., Taylor, D. W., van Duijn, E., Barendregt, A., Vlot, M., Koehorst, J. J., Sakamoto, K., Masuda, A., Dohmae, N., Schaap, P. J., Doudna, J. A., Heck, A. J. R., Yonekura, K., van der Oost, J. and Shinkai, A.
    • 雑誌名

      Molecular Cell

      巻: 52 号: 1 ページ: 135-145

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2013.09.013

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24657111, KAKENHI-PROJECT-25440013
  • [雑誌論文] Structure and function of a TetR family transcriptional regulator, SbtR, from Thermus thermophilus HB82013

    • 著者名/発表者名
      Agari Y, Sakamoto K, Yutani K, Kuramitsu S, Shinkai A.
    • 雑誌名

      Proteins

      巻: (in press) 号: 7 ページ: 1166-1178

    • DOI

      10.1002/prot.24266

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208, KAKENHI-PROJECT-22570166
  • [雑誌論文] Transcriptional repression mediated by a TetR family protein, PfmR, from Thermus thermophilus HB82012

    • 著者名/発表者名
      Agari Y, Sakamoto K, Kuramitsu S, Shinkai A.
    • 雑誌名

      J. Bacteriol

      巻: 194(17) 号: 17 ページ: 4630-4641

    • DOI

      10.1128/jb.00668-12

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [雑誌論文] Phenylacetyl-coenzyme A is an effector molecule of TetR family transcriptional repressor PaaR from Thermus thermophilus HB82011

    • 著者名/発表者名
      Sakamoto K, Agari Y, Kuramitsu S, Shinkai A
    • 雑誌名

      J. Bacteriol

      巻: 193(17) 号: 17 ページ: 4388-4395

    • DOI

      10.1128/jb.05203-11

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [雑誌論文] TetR family transcriptional repressor Thermus thermophilus FadR controls fatty acid degradation2011

    • 著者名/発表者名
      Agari Y, Agari K, Sakamoto K, Kuramitsu S, Shinkai A
    • 雑誌名

      Microbiology

      巻: 157(Pt 6) 号: 6 ページ: 1589-1601

    • DOI

      10.1099/mic.0.048017-0

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [学会発表] 大腸菌無細胞タンパク質合成法を用いた、Thermus thermophilus CRISPR-Cmr複合体の再構成2016

    • 著者名/発表者名
      新海 暁男、横山 茂之
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2016-11-30
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07285
  • [学会発表] 大腸菌無細胞タンパク質合成法を利用した、Thermus thermophilus CRISPR-Cmr複合体の再構成2016

    • 著者名/発表者名
      新海 暁男、横山 茂之
    • 学会等名
      第89回日本生化学会大会
    • 発表場所
      仙台国際センター・東北大学(宮城県仙台市)
    • 年月日
      2016-09-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07285
  • [学会発表] 高度好熱菌Thermus thermophilus由来Type III-B CRISPR-Casシステムを構成するCmr複合体の構造と機能2015

    • 著者名/発表者名
      新海 暁男
    • 学会等名
      第17回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      ホテルライフォート札幌、北海道札幌市
    • 年月日
      2015-07-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25440013
  • [学会発表] 高度好熱菌Thermus thermophilusのType III CRISPR-Casシステムを構成しているリボヌクレオタンパク質複合体の構造と機能2015

    • 著者名/発表者名
      新海 暁男
    • 学会等名
      BMB2015
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド、兵庫県神戸市
    • 年月日
      2015-12-03
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25440013
  • [学会発表] 高度好熱菌Thermus thermophilus HB8株における転写因子の機能解析と機能未知遺伝子の分類2013

    • 著者名/発表者名
      新海暁男
    • 学会等名
      第13回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      とりぎん文化会館、鳥取
    • 年月日
      2013-06-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [学会発表] Functional identification of transcriptional regulators from T. thermophilus HB82012

    • 著者名/発表者名
      新海暁男
    • 学会等名
      第2回モデル生物丸ごと一匹学会
    • 発表場所
      SPring-8、兵庫
    • 年月日
      2012-09-29
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [学会発表] Structural and functional analysis of TetR family transcriptional regulator PfmR from Thermus thermophilus HB82012

    • 著者名/発表者名
      上利佳弘、坂本恵子、新海暁男
    • 学会等名
      第2回モデル生物丸ごと一匹学会
    • 発表場所
      Spring-8、兵庫
    • 年月日
      2012-09-29
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [学会発表] 分子間ジスルフィド結合を持つThermus thermophilus HB8由来TetRファミリー転写因子TTHA0167の構造と機能2012

    • 著者名/発表者名
      坂本恵子、上利佳弘、倉光成紀、新海暁男
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      マリンメッセ福岡、福岡
    • 年月日
      2012-12-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [学会発表] Thermus thermophilus HB8由来TetRファミリー転写調節因子 PfmRによる転写抑制2012

    • 著者名/発表者名
      上利佳弘、坂本恵子、倉光成紀、新海暁男
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      マリンメッセ福岡、福岡
    • 年月日
      2012-12-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [学会発表] Structural and functional analysis of TetR family transcriptional regulator TTHA0167 from T. thermophilus HB82012

    • 著者名/発表者名
      坂本恵子、上利佳弘、新海暁男
    • 学会等名
      第2回モデル生物丸ごと一匹学会
    • 発表場所
      SPring-8、兵庫
    • 年月日
      2012-09-29
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [学会発表] Functional and structural characterization of the TetR family transcriptional repressor PaaR from Thermus thermophilus HB82011

    • 著者名/発表者名
      Keiko Sakamoto, Yoshihiro Agari, Seiki Kuramitsu, Akeo Shinkai
    • 学会等名
      第1回モデル生物丸ごと一匹学会(高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第10回連携研究会共催)
    • 発表場所
      スプリング-8(兵庫県)
    • 年月日
      2011-08-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [学会発表] Thermus thermophilus PaaR, a TetR family transcriptional repressor, is involved in phenylacetic acid degradation2011

    • 著者名/発表者名
      Keiko Sakamoto, Yoshihiro Agari, Seiki Kuramitsu, Akeo Shinkai
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      2011-12-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [学会発表] Study of transcriptional regulatory system of T.thermophilus HB8 : Structure and function of two TetR family proteins2011

    • 著者名/発表者名
      Akeo Shinkai, Yoshihiro Agari, Keiko Sakamoto
    • 学会等名
      第1回モデル生物丸ごと一匹学会(高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第10回連携研究会共催)
    • 発表場所
      スプリング-8(兵庫県)(招待講演)
    • 年月日
      2011-08-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [学会発表] Structural and functional genomics of a model organism Thermus thermophilus HB8: toward functional discovery of functionally unknown proteins2011

    • 著者名/発表者名
      Shinkai A, Bessho Y, Agari Y, Iino H, Fukui K, Kitamura A, Sakamoto K, Kim K, Masui R, Yokoyama S, Kuramitsu S
    • 学会等名
      International Conference on Structural Genomics
    • 発表場所
      Chestnut Conference Centre、トロント、カナダ
    • 年月日
      2011-05-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [学会発表] 高度好熱菌Thermus thermophilus HB8株をモデル生物とし、転写制御の観点から機能未知遺伝子を分類する:転写因子の機能発見研究と機能未知遺伝子の分類2011

    • 著者名/発表者名
      新海暁男、上利佳弘、坂本恵子
    • 学会等名
      第84回日本生化学大会
    • 発表場所
      京都国際会館、京都
    • 年月日
      2011-09-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [学会発表] Functional and structural characterization of the TetR family transcriptional repressor PaaR from Thermus thermophilus HB82011

    • 著者名/発表者名
      坂本恵子、上利佳弘、倉光成紀、新海暁男
    • 学会等名
      第1回モデル生物丸ごと一匹学会
    • 発表場所
      SPring-8、兵庫
    • 年月日
      2011-08-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [学会発表] Study of transcriptional regulatory system of T. thermophilus HB8: Structure and function of two TetR family proteins2011

    • 著者名/発表者名
      新海暁男、上利佳弘、坂本恵子
    • 学会等名
      第1回モデル生物丸ごと一匹学会
    • 発表場所
      SPring-8、兵庫
    • 年月日
      2011-08-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [学会発表] 高度好熱菌Thermus thermophilus HB8株をモデル生物とし、転写制御の観点から機能未知遺伝子を分類する:転写因子の機能発見研究と機能未知遺伝子の分類2011

    • 著者名/発表者名
      新海暁男、上利佳弘、坂本恵子
    • 学会等名
      第84回日本生化学大会シンポジウム
    • 発表場所
      京都国際会館(京都府)(招待講演)
    • 年月日
      2011-09-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [学会発表] Thermus thermophilus PaaR, a TetR family transcriptional repressor, is involved in phenylacetic acid degradation2011

    • 著者名/発表者名
      坂本恵子、上利佳弘、倉光成紀、新海暁男
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜、横浜
    • 年月日
      2011-12-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [学会発表] 脂肪酸の分解を制御する、高度好熱菌Thermus thermophilus HB8 由来TetR ファミリー転写因子FadR の構造と機能"BMB20102010

    • 著者名/発表者名
      上利佳弘、上利和子、坂本恵子、倉光成紀、新海暁男
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会・第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド、神戸
    • 年月日
      2010-12-07
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [学会発表] 脂肪酸分解を制御する、高度好熱菌Thermus thermophilus HB8由来TetRファミリー転写因子FadRの構造と機能2010

    • 著者名/発表者名
      上利佳弘、上利和子、坂本恵子、倉光成紀、新海暁男
    • 学会等名
      BMB2010
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2010-12-07
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [学会発表] The Cmr complex of Thermus thermophilus

    • 著者名/発表者名
      Raymond H.J. Staals, Yoshihiro Agari, John van der Oost, Akeo Shinkai
    • 学会等名
      CRISPR: evolution, mechanisms and infection
    • 発表場所
      University of St Andrews, United Kingdom
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25440013
  • [学会発表] 高度好熱菌Thermus thermophilus HB8株における転写因子の機能解析と機能未知遺伝子の分類

    • 著者名/発表者名
      新海暁男
    • 学会等名
      第13回日本蛋白質科学会年会ワークショップ
    • 発表場所
      とりぎん文化会館、鳥取
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22510208
  • [学会発表] Functional and structural genomics studies on Thermus thermophilus CRISPR-Cas systems

    • 著者名/発表者名
      Akeo Shinkai
    • 学会等名
      The 65th Fujihara Seminar, Internal Symposium on Synthetic Biology of Unnatural Base Pairs and Amino Acids, The Fujihara Foundation of Science
    • 発表場所
      グランドホテルニュー王子、北海道苫小牧市
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25440013
  • 1.  上利 佳弘 (50469889)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 21件
  • 2.  米倉 功治
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 3.  眞木 さおり
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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