• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

千見寺 浄慈  Chikenji George

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 10420366
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 名古屋大学, 工学研究科, 助教
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2016年度 – 2025年度: 名古屋大学, 工学研究科, 助教
2014年度: 名古屋大学, 大学院工学研究科, 助教
2011年度 – 2014年度: 名古屋大学, 工学(系)研究科(研究院), 助教
2009年度: 名古屋大学, 工学研究科, 助教
2007年度 – 2009年度: 名古屋大学, 大学院・工学研究科, 助教
2006年度: 名古屋大学, 大学院工学研究科, 助手
審査区分/研究分野
研究代表者
生物物理学 / 小区分43020:構造生物化学関連
研究代表者以外
生物物理・化学物理 / 中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野 / 理工系
キーワード
研究代表者
タンパク質 / 立体構造予測 / フラグメントアセンブリ法 / タンパク質デザイン / 立体構造 / フォールディング / 合理デザイン / バイオインフォマティクス / 合理的設計 / 合理的デザイン … もっと見る / 生物物理 / βシート / 平行βシート / トポロジー / 疎水性相互作用 / 非局所的相互作用 / 新規フォールド構造 / ループクロス / 二次構造パッキング / 構造比較 / non-sequential / 構造アラインメント / アロステリック / 水素結合 / アロステリック転移 / 非経験的局所構造予測 / 第一原理的立体構造予測 / アロステリック変化 / 局所構造 / 計算物理 … もっと見る
研究代表者以外
国際情報交換アメリカ / 遺伝子ネットワーク / クロマチンドメイン / 相分離 / ゲノム立体構造 / ゲノムMD / 遺伝子制御ネットワーク / 非断熱揺らぎ / クロマチン構造 / 遺伝子制御ネットワーク理論 / 遺伝子スイッチの非断熱揺らぎ / ゲノム分子動力学 / 国際情報交流アメリカ / 揺らぎ / ES細胞 / 統計力学 / 分子モーター / ナノバイオ / 蛋白質 / 生物物理 隠す
  • 研究課題

    (10件)
  • 研究成果

    (119件)
  • 共同研究者

    (5人)
  •  左巻きβαβモチーフを含むタンパク質のデノボデザインによるフォールド空間の拡大研究代表者

    • 研究代表者
      千見寺 浄慈
    • 研究期間 (年度)
      2025 – 2027
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分43020:構造生物化学関連
    • 研究機関
      名古屋大学
  •  ゲノム動態の原理とDNA機能

    • 研究代表者
      笹井 理生
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2026
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 審査区分
      中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
    • 研究機関
      京都大学
  •  物理的に設計可能な蛋白質フォールド空間の解明:理論と実験的検証研究代表者

    • 研究代表者
      千見寺 浄慈
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2021
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分43020:構造生物化学関連
    • 研究機関
      名古屋大学
  •  既知フォールドの再配線による新規フォールド予測法の開発研究代表者

    • 研究代表者
      千見寺 浄慈
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2019
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      名古屋大学
  •  真核細胞の遺伝子スイッチの揺らぎと制御の理論

    • 研究代表者
      笹井 理生
    • 研究期間 (年度)
      2012 – 2014
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 研究分野
      生物物理・化学物理
    • 研究機関
      名古屋大学
  •  ES細胞における動的遷移と統計物理

    • 研究代表者
      笹井 理生
    • 研究期間 (年度)
      2011 – 2014
    • 研究種目
      挑戦的萌芽研究
    • 研究分野
      生物物理・化学物理
    • 研究機関
      名古屋大学
  •  フラグメントアセンブリ法の逆発想による新規フォールド予測法の開発研究代表者

    • 研究代表者
      千見寺 浄慈
    • 研究期間 (年度)
      2011 – 2014
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      名古屋大学
  •  局所配列の物理化学に着目したタンパク質の立体構造予測の研究研究代表者

    • 研究代表者
      千見寺 浄慈
    • 研究期間 (年度)
      2008 – 2009
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      名古屋大学
  •  蛋白質の柔らかいダイナミクスの分子論

    • 研究代表者
      笹井 理生
    • 研究期間 (年度)
      2006 – 2007
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      理工系
    • 研究機関
      名古屋大学
  •  立体構造予測からのタンパク質立体構造構築原理の探求研究代表者

    • 研究代表者
      千見寺 浄慈
    • 研究期間 (年度)
      2006 – 2007
    • 研究種目
      若手研究(スタートアップ)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      名古屋大学

すべて 2022 2020 2019 2018 2017 2016 2014 2013 2011 2009 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 学会発表 図書

  • [図書] 細胞の物理生物学(Physical Biology of the Cellの邦訳)2011

    • 著者名/発表者名
      笹井理生、伊藤一仁、千見寺浄慈、寺田智樹
    • 総ページ数
      957
    • 出版者
      共立出版
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [雑誌論文] The cavity method to protein design problem2022

    • 著者名/発表者名
      Takahashi Tomoei、Chikenji George、Tokita Kei
    • 雑誌名

      Journal of Statistical Mechanics: Theory and Experiment

      巻: 2022 号: 10 ページ: 103403-103403

    • DOI

      10.1088/1742-5468/ac9465

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [雑誌論文] The Structural Rule Distinguishing a Superfold: A Case Study of Ferredoxin Fold and the Reverse Ferredoxin Fold2022

    • 著者名/発表者名
      Nishina Takumi、Nakajima Megumi、Sasai Masaki、Chikenji George
    • 雑誌名

      Molecules

      巻: 27 号: 11 ページ: 3547-3547

    • DOI

      10.3390/molecules27113547

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166, KAKENHI-PUBLICLY-21H00248, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PROJECT-22H00406
  • [雑誌論文] A prospective compound screening contest identified broader inhibitors for Sirtuin 12019

    • 著者名/発表者名
      Chiba Shuntaro et al.
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 号: 1 ページ: 19585-19585

    • DOI

      10.1038/s41598-019-55069-y

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H01814, KAKENHI-PROJECT-19H03166, KAKENHI-PROJECT-16K07315, KAKENHI-PROJECT-18K18150
  • [雑誌論文] MICAN-SQ: A sequential protein structure alignment program that is applicable to monomers and all types of oligomers2018

    • 著者名/発表者名
      Shintaro Minami, Kengo Sawada, Motonori Ota, and George Chikenji
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 34 号: 19 ページ: 3324-3331

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/bty369

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315, KAKENHI-PROJECT-18H03331, KAKENHI-PROJECT-17J02339
  • [雑誌論文] An iterative compound screening contest method for identifying target protein inhibitors using the tyrosine-protein kinase Yes2017

    • 著者名/発表者名
      Shuntaro Chiba, 他30名 (George Chikenji は16番目の著者)
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 7 号: 1 ページ: 1-13

    • DOI

      10.1038/s41598-017-10275-4

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315, KAKENHI-PROJECT-15H02776, KAKENHI-PROJECT-17H01814, KAKENHI-PROJECT-16J09021, KAKENHI-PROJECT-17J06897
  • [雑誌論文] Rules for connectivity of secondary structure elements in protein: two-layer αβ sandwiches2017

    • 著者名/発表者名
      Shintaro Minami, George Chikenji, and Motonori Ota
    • 雑誌名

      Protein Science

      巻: 26 号: 11 ページ: 2257-2267

    • DOI

      10.1002/pro.3285

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315, KAKENHI-PROJECT-17J02339
  • [雑誌論文] Importance of consensus region of multiple-ligand templates in a virtual screening method2017

    • 著者名/発表者名
      Tatsuya Okuno, Koya Kato, Shintaro Minami, Tomoki P Terada, Masaki Sasai, George Chikenji
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 13 ページ: 49-156

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [雑誌論文] Cooperativity and modularity in protein folding2017

    • 著者名/発表者名
      Masaki Sasai, George Chikenji, Tomoki P Terada
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 13 ページ: 281-293

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [雑誌論文] How a Spatial Arrangement of Secondary Structure Elements Is Dispersed in the Universe of Protein Folds2014

    • 著者名/発表者名
      Shintaro Minami, Kengo Sawada, George Chikenji
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 9 号: 9 ページ: e107959-e107959

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0107959

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [雑誌論文] MICAN : a protein structure alignment algorithm that can handle Multiple-chains, Inverse alignments, Ca only models, Alternative alignments, and Non-sequential alignments2013

    • 著者名/発表者名
      Shintaro Minami, Kengo Sawada and George Chikenji
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 14 号: 1 ページ: 1-22

    • DOI

      10.1186/1471-2105-14-24

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-10J07855, KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [雑誌論文] Folding energy landscape and network dynamics of small globular proteins2009

    • 著者名/発表者名
      Naoto Hori, George Chikenji, R. Stephen Berry, Shoji Takada
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences USA vol.106

      ページ: 73-78

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770120
  • [雑誌論文] Folding energy landscape and network dynamics of small globular proteins2009

    • 著者名/発表者名
      Naoto Hori, George Chikenji, R. Stephen Berry, and Shoji Takada
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences USA 106

      ページ: 73-78

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770120
  • [雑誌論文] In silico chaperonin-like cycle helps folding of proteins for structure prediction2008

    • 著者名/発表者名
      T. Furuta, Y. Fujitsuka, G. Chikenji, S. Takada
    • 雑誌名

      Biophysical Journal 94

      ページ: 2558-2565

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18870011
  • [雑誌論文] What We can Learn about Protein Folding from Recent Progress in Structure Prediction2007

    • 著者名/発表者名
      George Chikenji, Yoshimi Fujitsuka, Shoji Takada
    • 雑誌名

      Frontiers of Computational Science

      ページ: 149-155

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18870011
  • [学会発表] Structural determinants for distinguishing frequently and rarely occurring psi-loop motifs2022

    • 著者名/発表者名
      Tomoki C. Terada, Takumi Nishina, George Chikenji
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] 全原子シミュレーションを用いたβαβ モチーフのレジスタシフトルールの解明2022

    • 著者名/発表者名
      Senji Mishima, Hiroto Murata, George Chikenji
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] 左巻きβαβ モチーフをもつタンパク質のデノボデザインに向けて2022

    • 著者名/発表者名
      Hiroto Murata, George Chikenji
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] ベイズ学習による格子タンパク質模型のデザイン2022

    • 著者名/発表者名
      Tomoei Takahashi, George Chikenji, Kei Tokita
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] スーパーフォールドを区別する構造ルールの探索:フェレドキシン構造とリバースフェレドキシ ン構造の解析2022

    • 著者名/発表者名
      Takumi Nishina, George Chikenji
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] タンパク質複合体における複数残基間相互作用の解析2022

    • 著者名/発表者名
      Masaki Koyama, George Chikenji
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] ラマチャンドランプロットの再分類による未知のタンパク質構造の探索2020

    • 著者名/発表者名
      村田裕斗, 千見寺浄慈
    • 学会等名
      日本物理学会第75回年次大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] Why loops connecting a β-strand and an α-helix prefer particular dihedral angles and amino acids2020

    • 著者名/発表者名
      中島 恵, 千見寺 浄慈
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] Elucidation of local structure contributing to protein stability: Structural features of loop residues of 4-strand β-sheet motif2020

    • 著者名/発表者名
      Megumi Nakajima, George Chikenji
    • 学会等名
      第20回日本蛋白質科学会年会
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] The relationship between designability of protein and preference of local structures: A lattice model study2020

    • 著者名/発表者名
      床 和真, 千見寺 浄慈
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] The Relationship between Designability of Protein and Preference of Local Structures2020

    • 著者名/発表者名
      Kazuma Toko, George Chikenji
    • 学会等名
      第20回日本蛋白質科学会年会
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] Search for Partial Structural Space of Specific Loop Residues by Hydrogen Bond and Steric Repulsion2020

    • 著者名/発表者名
      Hiroto Murata, George Chikenji
    • 学会等名
      第20回日本蛋白質科学会年会
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] 経験ベイズ推定による格子タンパク質模型のデザイン2020

    • 著者名/発表者名
      高橋智栄, 千見寺浄慈, 時田恵一郎
    • 学会等名
      日本物理学会第75回年次大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] Database analysis of protein-protein interaction2020

    • 著者名/発表者名
      佐川 航, 千見寺 浄慈
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] Database Analysis of Protein-protein Interfaces2020

    • 著者名/発表者名
      Wataru Sagawa, George Chikenji
    • 学会等名
      第20回日本蛋白質科学会年会
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] Search for Partial Structural Space of Specific Loop Residues by Hydrogen Bond and Steric Repulsion2020

    • 著者名/発表者名
      村田 裕斗, 千見寺 浄慈
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] 経験ベイズ推定による格子タンパク質模型のデザイン2020

    • 著者名/発表者名
      高橋智栄, 千見寺浄慈, 時田恵一郎
    • 学会等名
      日本物理学会第75回年次大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] ラマチャンドランプロットの再分類による未知のタンパク質構造の探索2020

    • 著者名/発表者名
      村田裕斗, 千見寺浄慈
    • 学会等名
      日本物理学会第75回年次大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] フェレドキシン構造とそのリバース構造のタンパク質デザイナビリティの決定因子2019

    • 著者名/発表者名
      中島 恵、 千見寺 浄慈
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] 物理的にデザイン可能なタンパク質フォールドの条件:立体構造データベース解析による知識抽出2019

    • 著者名/発表者名
      千見寺 浄慈
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] Asymmetry of psi-loop motifs2019

    • 著者名/発表者名
      K. Fukuda, G. Chikenji
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] Relationship between loop geometry and register shift in parallel beta-sheet proteins2019

    • 著者名/発表者名
      R. Ueda, G. Chikenji
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] Exploration of novel alpha-beta protein folds by de novo design2019

    • 著者名/発表者名
      S. Minami, R. Koga, G. Chikenji, T. Sugiki, N. Kobayashi
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] 物理的にデザイン可能なタンパク質フォールドの条件:立体構造データベース解析による知識抽出2019

    • 著者名/発表者名
      千見寺 浄慈
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] フェレドキシン構造とそのリバース構造のタンパク質デザイナビリティの決定因子2019

    • 著者名/発表者名
      中島 恵、 千見寺 浄慈
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] Reclassification of dihedral angles in protein backbone structures using machine learning2019

    • 著者名/発表者名
      H. Murata, G. Chikenji
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] Asymmetry of psi-loop motifs2019

    • 著者名/発表者名
      K. Fukuda, G. Chikenji
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] 立体構造データベース中でのψループモチーフの出現頻度の偏りの物理的要因2019

    • 著者名/発表者名
      福田 孝貴、 千見寺 浄慈
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] Reclassification of dihedral angles in protein backbone structures using machine learning2019

    • 著者名/発表者名
      H. Murata, G. Chikenji
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] Exploration of novel alpha-beta protein folds by de novo design2019

    • 著者名/発表者名
      S. Minami, R. Koga, G. Chikenji, T. Sugiki, N. Kobayashi
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] 立体構造データベース中でのψループモチーフの出現頻度の偏りの物理的要因2019

    • 著者名/発表者名
      福田 孝貴、 千見寺 浄慈
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] 機械学習を用いたタンパク質主鎖構造における2 面角の再分類2019

    • 著者名/発表者名
      村田 裕斗、 千見寺 浄慈
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03166
  • [学会発表] 機械学習を用いたタンパク質主鎖構造における2 面角の再分類2019

    • 著者名/発表者名
      村田 裕斗、 千見寺 浄慈
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] Relationship between loop geometry and register shift in parallel beta-sheet proteins2019

    • 著者名/発表者名
      R. Ueda, G. Chikenji
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] βシートタンパク質のデノボデザインにおける主鎖構造設計図の選択基準2018

    • 著者名/発表者名
      今川駿, 古賀信康, 千見寺浄慈
    • 学会等名
      第18回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] 立体構造データベース中でのψループモチーフの出現頻度の偏りの起源2018

    • 著者名/発表者名
      福田孝貴, 千見寺浄慈
    • 学会等名
      第18回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] X線結晶構造解析から得られたタンパク質立体構造データの網羅的情報解析による知識抽出2018

    • 著者名/発表者名
      千見寺浄慈
    • 学会等名
      第10回放射光学会若手研究会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] Criteria for evaluating designability of pure parallel beta sheet structures2018

    • 著者名/発表者名
      今川駿, 古賀信康, 千見寺浄慈
    • 学会等名
      第56回生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] デザイン可能なタンパク質構造の条件2018

    • 著者名/発表者名
      千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本計算数理工学会 第34回 計算数理工学フォーラム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] Diversification of P-loop protein structure simulated by imposing the functional requirement as a selection pressure2018

    • 著者名/発表者名
      犬飼耕平, 笹井理生, 千見寺浄慈
    • 学会等名
      第56回生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] A skewed distribution of psi-loop motifs in the protein structure database2018

    • 著者名/発表者名
      福田孝貴, 千見寺浄慈
    • 学会等名
      第56回生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] デザインしやすいタンパク質立体構造の条件2018

    • 著者名/発表者名
      千見寺浄慈
    • 学会等名
      学際計算物理学研究会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] β-α-βモチーフにおけるレジスタシフトの非対称性2018

    • 著者名/発表者名
      千見寺浄慈, 南慎太朗, 古賀信康
    • 学会等名
      第18回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] Revisiting a classical threading method with novel scoring function of sequence-structure compatibility2017

    • 著者名/発表者名
      共田恭輔、増山陽汰、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] What are the structural features of superfolds? a case study of beta-sheet proteins2017

    • 著者名/発表者名
      千見寺 浄慈、今川駿、南慎太朗
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] βシートタンパク質のデノボデザインでデザインしやすいβストランドの配置とはどんなものだろうか?2017

    • 著者名/発表者名
      今川駿、古賀信康、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      蛋白質科学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] 天然に存在しないフォールドを持つタンパク質の合理的デザイン2017

    • 著者名/発表者名
      南慎太朗、古賀理恵、千見寺 浄慈、古賀信康
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] Some factors that make a structure of ba beta-sheet protein more designable2017

    • 著者名/発表者名
      今川駿、古賀信康、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] 新規フォールドタンパク質の合理デザインに向けて2017

    • 著者名/発表者名
      南慎太朗、千見寺 浄慈、古賀信康
    • 学会等名
      蛋白質科学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] スーパーフォールドの決定因子:平行βシートタンパク質を例にして2017

    • 著者名/発表者名
      千見寺 浄慈、南慎太朗
    • 学会等名
      蛋白質科学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] Combining a docking software with a ligand-based virtual screening method, VS-APPLE2017

    • 著者名/発表者名
      小林大祐、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] タンパク質立体構造におけるレア構造2016

    • 著者名/発表者名
      西山 俊介、南 慎太朗、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      蛋白質科学会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] タンパク質構造を利用したバーチャルスクリーニングとその周辺2016

    • 著者名/発表者名
      千見寺 浄慈
    • 学会等名
      第5回生命医薬情報学連合大会
    • 発表場所
      東京国際交流館プラザ平成(東京都港区)
    • 年月日
      2016-09-29
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] 二次構造順序の変化によって起こる蛋白質フォールドの多様化2016

    • 著者名/発表者名
      南 慎太朗、千見寺 浄慈、太田 元規
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] New rules for beta sheet topology of protein structures2016

    • 著者名/発表者名
      西山 俊介、南 慎太朗、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      第5回生命医薬情報学連合大会
    • 発表場所
      東京国際交流館プラザ平成(東京都港区)
    • 年月日
      2016-09-29
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] New rules of protein structures2016

    • 著者名/発表者名
      西山 俊介、南 慎太朗、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] Analysis of protein complexes structures towards rational design of inhibitors of Protein-protein interactions (PPIs)2016

    • 著者名/発表者名
      小林 大祐、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] 立体構造予測において疎水効果を評価するための新しい指標: 仮想原子の周りのコンタクト数2016

    • 著者名/発表者名
      増山 陽太、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] A new threading method based on the physical characteristics of sequence-structure compatibility2016

    • 著者名/発表者名
      共田 恭輔 、 増山 陽太、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07315
  • [学会発表] Generating novel protein folds from existing folds for de novo protein structure prediction2013

    • 著者名/発表者名
      中川 裕規, 千見寺 浄慈, 南 慎太朗
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府京都市)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] 配列順序を無視したタンパク質の立体構造比較によって見えてきたこと2013

    • 著者名/発表者名
      南 慎太朗、澤田 賢吾、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      とりぎん文化会館(鳥取県鳥取市)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] Non-sequential structural alignment reveals fold change by segment shuffling during evolution2013

    • 著者名/発表者名
      南 慎太朗, 千見寺 浄慈, 太田 元規
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府京都市)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] A new homology modeling technique that utilizes the knowledge of completeness of the PDB2013

    • 著者名/発表者名
      金光 高宏, 南 慎太郎, 千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府京都市)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] Development of Ligand Based Virtual Screening considering protein-ligand interaction2013

    • 著者名/発表者名
      加藤 鉱也, 千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府京都市)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] Some features of protein pairs which have same SSEs packing arrangement but have different topology2013

    • 著者名/発表者名
      向 辰朗, 南 慎太朗, 千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府京都市)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] 配列情報と構造情報を同時に用いた超遠縁の蛋白質相同性検出法2013

    • 著者名/発表者名
      南 慎太朗、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      とりぎん文化会館(鳥取県鳥取市)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] 配列順序に依存しない相同性から示唆される蛋白質フォールド多様化のメカニズム2011

    • 著者名/発表者名
      南 慎太朗、澤田 賢吾、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪府)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] 新規GAP ペナルティーを用いた超遠縁蛋白質間の構造-配列アラインメント2011

    • 著者名/発表者名
      澤田 賢吾、南 慎太朗、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪府)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] 分子の構造揺らぎと相互作用パターンを考慮したLigand-based Virtual Screening2011

    • 著者名/発表者名
      奥野 達矢、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪府)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] Pharmacophore を考慮したLigand-Based Virtual Screening2011

    • 著者名/発表者名
      奥野 達矢、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本コンピュータ化学会
    • 発表場所
      東京工業大学(東京都)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] Simulated evolution of protein by a selective pressure on function2011

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Yamamoto, Takeshi N. Sasaki, Kengo Sawada, Shintaro Minami, George Chikenji, Tomoki P. Terada, Masaki Sasai
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] Development of a novel protein structure predicion method emphasizing non-local interaction2011

    • 著者名/発表者名
      Kota Nakamori, Shintaro Minami, Kengo Sawada, George Chikenji
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] A related location of exon boundary and structural alignment boundary reveals a mechanism of protein fold diversity2011

    • 著者名/発表者名
      Shintaro Minami, Kengo Sawada, George Chikenji
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] The evolution of protein folds and De Novo protein structure prediction2011

    • 著者名/発表者名
      南 慎太朗、中森 弘太、澤田 賢吾、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会(招待講演)
    • 発表場所
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪府)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] "ゴーストウォーター"を含む全原子モデルによる蛋白質構造予測2009

    • 著者名/発表者名
      澤藤俊平、千見寺浄慈
    • 学会等名
      生物物理学会
    • 発表場所
      アスティとくしま
    • 年月日
      2009-11-01
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770120
  • [学会発表] Template based protein structure prediction by Fragment assembly in CASP82009

    • 著者名/発表者名
      澤田賢吾, 千見寺浄慈
    • 学会等名
      第9回日本バイオインフォマティクス学会創薬インフォマティクス研究会「CASP8タンパク質立体構造予測の最前線」
    • 発表場所
      東京大学医科学研究所
    • 年月日
      2009-01-19
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770120
  • [学会発表] Template based protein structure prediction by Fragment assemblv in CASP 82009

    • 著者名/発表者名
      澤田賢吾, 千見寺浄慈
    • 学会等名
      第9回日本バイオインフォマティクス学会創薬インフォマティクス研究会「CASP8タンパク質立体構造予測の最前線」
    • 発表場所
      東京大学医科学研究所
    • 年月日
      2009-01-19
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770120
  • [学会発表] フラグメントアセンブリによるテンプレートを用いた立体構造予測2009

    • 著者名/発表者名
      澤田賢吾、千見寺浄慈
    • 学会等名
      蛋白質科学会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ
    • 年月日
      2009-05-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770120
  • [学会発表] 新規フォールドに対する立体構造予測に向けて-フラグメントアセンブリ法による予測精度のライブラリ依存性-2009

    • 著者名/発表者名
      南慎太郎、千見寺浄慈
    • 学会等名
      生物物理学会
    • 発表場所
      アスティとくしま
    • 年月日
      2009-11-01
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770120
  • [学会発表] 仮想水分子を含んだ水素結合ポテンシャルを用いたタンパク質構造の安定性評価2009

    • 著者名/発表者名
      澤藤俊平、千見寺浄慈
    • 学会等名
      蛋白質科学会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ
    • 年月日
      2009-05-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770120
  • [学会発表] フラグメントアセンブリ法による大規模蛋白質リファインメント2009

    • 著者名/発表者名
      澤田賢吾、千見寺浄慈
    • 学会等名
      生物物理学会
    • 発表場所
      アスティとくしま
    • 年月日
      2009-11-01
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770120
  • [学会発表] カルモジュリンの構造変化:構造予測の手法およびMDシミュレーションを相補的に用いた研究2009

    • 著者名/発表者名
      南慎太郎、千見寺浄慈
    • 学会等名
      蛋白質科学会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ
    • 年月日
      2009-05-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770120
  • [学会発表] タンパク質立体構造予測の現状とフリーモデリング的テンプレートモデリングの試み2009

    • 著者名/発表者名
      千見寺浄慈
    • 学会等名
      蛋白研セミナー
    • 発表場所
      大阪大学蛋白質研究所
    • 年月日
      2009-07-31
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770120
  • [学会発表] Template-based modeling and free-modeling by fragment assembly with SimFold energy function2009

    • 著者名/発表者名
      George Chikenji
    • 学会等名
      Asian Workshop for Protein Structure Prediction Methodology
    • 発表場所
      Korea Institute for Advanced Study, Seoul, Korea
    • 年月日
      2009-09-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770120
  • [学会発表] Modeling of Transcriptional Interaction in Gene Regulation2008

    • 著者名/発表者名
      N. Tokuda, M. Sasai, and G. Chikenji
    • 学会等名
      The 5th Open Workshop for"Chemistry of Biological Processes Created by Water and Biomolecules"Folding Dynamics
    • 発表場所
      奈良
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18031017
  • [学会発表] 真核生物の転写制御におけるDNAの物性研究2008

    • 著者名/発表者名
      徳田 直子, 笹井 理生, 千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本物理学会第63回年会
    • 発表場所
      近畿大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18031017
  • [学会発表] 購造予測ツールを用いたカルモジュリンの構造変化についての研究2007

    • 著者名/発表者名
      南 慎太朗、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      生物物理学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18870011
  • [学会発表] De Novoモデリングにおける非経験的フラグメント予測法にむけて-ネイティブフラグメントの物理化学的性質-2007

    • 著者名/発表者名
      山浦 雅弘、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      生物物理学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18870011
  • [学会発表] 構造予測ツールを用いたカルモジュリンの構造変化についての研究2007

    • 著者名/発表者名
      南 慎太朗, 千見寺 浄慈
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18031017
  • [学会発表] Non-empirical fragment prediction for free modeling-Toward understanding physico-chemical property of fragments of natives structures2007

    • 著者名/発表者名
      山浦 雅弘, 千見寺 浄慈
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18031017
  • [学会発表] Homologous protein pairs that share the same core packing but have different topology

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Kanemitsu, Shintaro Minami, George Chikenji
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] Template based modeling utilizing an order-made template library

    • 著者名/発表者名
      Kodai Takagi, Tatsuro Mukai, George Chikenji
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] A New Virtual Screening Method for Identifying Novel Active Compounds Based on Protein Promiscuity

    • 著者名/発表者名
      Koya Kato, Okuno Tatsuya, George Chikenji
    • 学会等名
      CBI学会2014年大会
    • 発表場所
      タワーホール船堀
    • 年月日
      2014-10-28 – 2014-10-30
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] De Novo protein structure modeling by rewiring old folds

    • 著者名/発表者名
      Shunsuke Nishiyama, Tatsuo Mukai, George Chikenji
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] 配列順序に依存しない配列ー構造アラインメントに向けて

    • 著者名/発表者名
      澤田 賢吾、南 慎太朗、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] Go モデルに最適化された Multicanonical 分子動力学法による protein folding の自由エネルギー曲面の決定

    • 著者名/発表者名
      伊藤真志保、千見寺浄慈、高田彰二
    • 学会等名
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ワークピア横浜/横浜産貿ホール マリネリア
    • 年月日
      2014-06-25 – 2014-06-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] 蛋白質構造空間を二次構造要素の空間配置パターンによって眺める

    • 著者名/発表者名
      南 慎太朗、澤田 賢吾、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] An algorithm for identifying loop crossing in protein structures

    • 著者名/発表者名
      Tatsuo Mukai, George Chikenji
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] タンパク質構造比較の専門家によるアラインメントを再現する、配列順序に依存しない 構造アラインメント法の開発

    • 著者名/発表者名
      南 慎太朗、澤田 賢吾、千見寺 浄慈
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] タンパク質のフォールドは他のフォールドとどのように二次構造の空間配置を共有しているのだろうか?

    • 著者名/発表者名
      南慎太朗、千見寺浄慈
    • 学会等名
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ワークピア横浜/横浜産貿ホール マリネリア
    • 年月日
      2014-06-25 – 2014-06-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] 三角ポリゴンの衝突判定を用いたタンパク質のループ交差を検知するアルゴリズムの開発

    • 著者名/発表者名
      向辰朗、千見寺浄慈
    • 学会等名
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ワークピア横浜/横浜産貿ホール マリネリア
    • 年月日
      2014-06-25 – 2014-06-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] A Ligand Based Virtual Screening method that takes into account of protein-ligand interactions

    • 著者名/発表者名
      Koya Kato, George Chikenji
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] 新規骨格を有する薬物候補化合物の発見に向けたリガンド情報に基づく新たなヴァーチャルスクリーニング手法の開発

    • 著者名/発表者名
      加藤鉱也、千見寺浄慈
    • 学会等名
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      ワークピア横浜/横浜産貿ホール マリネリア
    • 年月日
      2014-06-25 – 2014-06-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • [学会発表] Non-sequential structural similarity in the protein world

    • 著者名/発表者名
      Shintaro Minami, Motonori Ota, George Chikenji
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770174
  • 1.  笹井 理生 (30178628)
    共同の研究課題数: 4件
    共同の研究成果数: 2件
  • 2.  寺田 智樹 (20420367)
    共同の研究課題数: 4件
    共同の研究成果数: 0件
  • 3.  WANG Jin
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 4.  古賀 信康 (50432571)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 5.  梅名 泰史 (10468267)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件

URL: 

この研究者とORCID iDの連携を行いますか?
※ この処理は、研究者本人だけが実行できます。

Are you sure that you want to link your ORCID iD to your KAKEN Researcher profile?
* This action can be performed only by the researcher himself/herself who is listed on the KAKEN Researcher’s page. Are you sure that this KAKEN Researcher’s page is your page?

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi