古田忠臣 Furuta Tadaomi

研究者番号	10431834
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 東京科学大学, 生命理工学院, 助教
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2016年度 – 2023年度: 東京工業大学, 生命理工学院, 助教 2012年度 – 2015年度: 東京工業大学, 生命理工学研究科, 助教 2014年度: 東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 助教 2013年度: 東京工業大学, 准教授, 助教 2011年度: 東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 助教
審査区分/研究分野	研究代表者生命・健康・医療情報学 / 生物物理学研究代表者以外生物物理学 / 中区分42:獣医学、畜産学およびその関連分野 / 小区分37010:生体関連化学 / 小区分48020:生理学関連 / 生体関連化学
キーワード	研究代表者構造機能相関 / 分子シミュレーション / 輸送 / 基質 / ATP / ABCトランスポーター / 構造ダイナミクス / ホモ・ヘテロ / CFTR / 疎水性クラスター … もっと見る / 変異 / 生物物理 / 構造変化 / カップリングヘリックス … もっと見る研究代表者以外多角体 / 細胞内結晶化 / タンパク質工学 / タンパク質結晶 / 創薬 / フェブキソスタット / 阻害剤 / 痛風治療薬 / キサンチン / 分子動力学 / 構造・機能予測 / 酸化還元酵素 / 発光センサ / 細胞機能 / 代謝 / 発光分子センサ / 自由行動動物 / 近赤外生物発光 / クリスタルエンジニアリング / 構造解析 / 結晶構造解析 / タンパク質集合体 / 嚢胞線維症 / CFTR / 高速原子間力顕微鏡 / １分子直接観察 / 分子間相互作用 / 抗原ー抗体反応 / 膜蛋白複合体 / ウイルス / 昆虫細胞 / 分子機械 / 自己集合 / 超分子化学 / BOF / ｷｻﾝﾁﾝ隠す

自由行動動物の深部臓器における細胞応答の光イメージング
- 研究代表者
  
  口丸高弘
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2025
- 研究種目
  
  挑戦的研究(開拓)
- 審査区分
  
  中区分42:獣医学、畜産学およびその関連分野
- 研究機関
  自治医科大学
１分子ゆらぎの直接観察による膜蛋白の機能発現と障害発生のメカニズムの解明
- 研究代表者
  
  相馬義郎
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分48020:生理学関連
- 研究機関
  国際医療福祉大学
機能性タンパク質結晶の細胞内合成
- 研究代表者
  
  上野隆史
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2021
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分37010:生体関連化学
- 研究機関
  東京工業大学
細胞内結晶化反応を利用した精密多層蛋白質材料の創成
- 研究代表者
  
  上野隆史
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2018
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  生体関連化学
- 研究機関
  東京工業大学
分子シミュレーションで探るヘテロ2量体ABCトランスポーターの非対称ダイナミクス研究代表者
- 研究代表者
  
  古田忠臣
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2018
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  東京工業大学
ヒトには効くがバクテリアには効かない痛風薬―酵素薬剤相互作用のダイナミクス―
- 研究代表者
  
  菊地浩人
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  日本医科大学
分子シミュレーションによるABCトランスポーターの「ジャンケン」メカニズムの解明研究代表者
- 研究代表者
  
  古田忠臣
- 研究期間 (年度)
  2013 – 2014
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  東京工業大学
キサンチン酸化還元酵素における阻害剤の作用の研究―「鍵と鍵穴」のドグマを超えて
- 研究代表者
  
  菊地浩人
- 研究期間 (年度)
  2011 – 2013
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  日本医科大学

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すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] The Role of Water in ATP Hydrolysis Energy Transduction by Protein Machinery2018
- 著者名/発表者名
  Tadaomi Furuta, Minoru Sakurai
- 総ページ数
  353
- 出版者
  Springer
- ISBN
  9789811084591
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[雑誌論文] Protein Needles Designed to Self‐Assemble through Needle Tip Engineering2022
- 著者名/発表者名
  Kikuchi Kosuke、Fukuyama Tatsuya、Uchihashi Takayuki、Furuta Tadaomi、Maeda Yusuke T.、Ueno Takafumi
- 雑誌名
  
  Small
  
  巻: 18 号: 10 ページ: 2106401-2106401
- DOI
  10.1002/smll.202106401
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21244, KAKENHI-PLANNED-18H05421, KAKENHI-PLANNED-18H05427, KAKENHI-PUBLICLY-20H04669, KAKENHI-PUBLICLY-21H00393, KAKENHI-PROJECT-19H02830, KAKENHI-PROJECT-20H01872, KAKENHI-PROJECT-21H01772
[雑誌論文] Single-molecule level dynamic observation of disassembly of the apo-ferritin cage in solution2020
- 著者名/発表者名
  Maity Basudev、Li Zhipeng、Niwase Kento、Ganser Christian、Furuta Tadaomi、Uchihashi Takayuki、Lu Diannan、Ueno Takafumi
- 雑誌名
  
  Physical Chemistry Chemical Physics
  
  巻: 22 号: 33 ページ: 18562-18572
- DOI
  10.1039/d0cp02069a
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05421, KAKENHI-PUBLICLY-19H05389, KAKENHI-PUBLICLY-20H04669, KAKENHI-PROJECT-18H01837, KAKENHI-PROJECT-19H02830, KAKENHI-PROJECT-20K21244
[雑誌論文] Dynamic behavior of an artificial protein needle contacting a membrane observed by high-speed atomic force microscopy2020
- 著者名/発表者名
  Ueno Takafumi、Niwase Kento、Tsubokawa Daisho、Kikuchi Kosuke、Takai Natsumi、Furuta Tadaomi、Kawano Ryuji、Uchihashi Takayuki
- 雑誌名
  
  Nanoscale
  
  巻: in press 号: 15 ページ: 8166-8173
- DOI
  10.1039/d0nr01121e
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05421, KAKENHI-PROJECT-18K19143, KAKENHI-PROJECT-19H02830, KAKENHI-PUBLICLY-19H05382, KAKENHI-PUBLICLY-19H05389, KAKENHI-PUBLICLY-20H04669, KAKENHI-PROJECT-18H01837
[雑誌論文] Development of an ATP force field for coarse‐grained simulation of ATPases and its application to the maltose transporter2019
- 著者名/発表者名
  Ryosuke Hirano, Tsubasa Yabuchi, Minoru Sakurai, Tadaomi Furuta
- 雑誌名
  
  J. Comput. Chem.
  
  巻: - 号: 24 ページ: 2096-2102
- DOI
  10.1002/jcc.25861
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[雑誌論文] The mechanism of nucleotide‐binding domain dimerization in the intact maltose transporter as studied by all‐atom molecular dynamics simulations2018
- 著者名/発表者名
  Wei‐Lin Hsu Tadaomi Furuta Minoru Sakurai
- 雑誌名
  
  Proteins
  
  巻: 86 号: 2 ページ: 237-247
- DOI
  10.1002/prot.25433
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400, KAKENHI-PROJECT-16K12520, KAKENHI-PUBLICLY-16H00825
[雑誌論文] Molecular dynamics simulation study on the structural instability of the most common cystic fibrosis-associated mutant ΔF508-CFTR2018
- 著者名/発表者名
  Mitsuhiko Odera, Tadaomi Furuta, Yoshiro Sohma, Minoru Sakurai
- 雑誌名
  
  Biophysics and Physicobiology
  
  巻: 15 号: 0 ページ: 33-44
- DOI
  10.2142/biophysico.15.0_33
- NAID
  130006337976
- ISSN
  2189-4779
- 言語
  英語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400, KAKENHI-PUBLICLY-16H00825, KAKENHI-PROJECT-16H05122
[雑誌論文] Probing native metal ion association sites through quenching of fluorophores in the nucleotide-binding domains of the ABC transporter MsbA2017
- 著者名/発表者名
  Daiki Tatsumi, Kei Nanatani, Yuto Koike, Kiyoto Kamagata, Satoshi Takahashi, Ayumu Konno, Tadaomi Furuta, Minoru Sakurai, Nobuyuki Uozumi
- 雑誌名
  
  Biochem. J.
  
  巻: 474 号: 12 ページ: 1993-2007
- DOI
  10.1042/bcj20161051
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400, KAKENHI-PROJECT-16K07313, KAKENHI-PUBLICLY-16H00825, KAKENHI-PLANNED-25104007, KAKENHI-PLANNED-16H06558, KAKENHI-PROJECT-16H04906
[雑誌論文] Analysis of an ATP-induced conformational transition of ABC transporter MsbA using a coarse-grained model2017
- 著者名/発表者名
  Naoki Arai, Tadaomi Furuta, Minoru Sakurai
- 雑誌名
  
  Biophysics and Physicobiology
  
  巻: 14 号: 0 ページ: 161-171
- DOI
  10.2142/biophysico.14.0_161
- NAID
  130006243558
- ISSN
  2189-4779
- 言語
  英語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400, KAKENHI-PUBLICLY-16H00825
[雑誌論文] 実験とシミュレーションを用いたABCトランスポーターによる物質輸送の機構解明2016
- 著者名/発表者名
  古田忠臣、山口知宏、加藤博章、櫻井実
- 雑誌名
  
  生物物理
  
  巻: 56 号: 1 ページ: 005-008
- DOI
  10.2142/biophys.56.005
- NAID
  130005121652
- ISSN
  0582-4052, 1347-4219
- 言語
  日本語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400, KAKENHI-PUBLICLY-26104511
[雑誌論文] Thermal fluctuations enable rapid protein-protein associations inaqueous solution by lowering the reaction barrier2016
- 著者名/発表者名
  Honami Sakaizawa, Hiroshi C. Watanabe, Tadaomi Furuta, Minoru Sakurai
- 雑誌名
  
  Chem. Phys. Lett.
  
  巻: 643 ページ: 114-118
- DOI
  10.1016/j.cplett.2015.11.014
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400, KAKENHI-PUBLICLY-26104511, KAKENHI-PROJECT-14J03041
[雑誌論文] Kirkwood-Buff integrals for aqueous urea solutions based upon the quantum chemical electrostatic potential and interaction energies2016
- 著者名/発表者名
  S Chiba, T Furuta, S Shimizu
- 雑誌名
  
  J. of Phys. Chem. B
  
  巻: 120 号: 31 ページ: 7714-7723
- DOI
  10.1021/acs.jpcb.6b05611
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26440081
[雑誌論文] Structural Dynamics of the Heterodimeric ABC Transporter TM287/ 288 Induced by ATP and Substrate Binding2016
- 著者名/発表者名
  T. Furuta, Y. Sato, M. Sakurai
- 雑誌名
  
  Biochemistry
  
  巻: 55 号: 48 ページ: 6730-6738
- DOI
  10.1021/acs.biochem.6b00947
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-16H00825, KAKENHI-PROJECT-15K00400
[雑誌論文] ATP Hydrolysis Mechanism in a Maltose Transporter Explored by QM/MM Metadynamics Simulation2016
- 著者名/発表者名
  W.-L. Hsu, T. Furuta, and M. Sakurai
- 雑誌名
  
  J. Phys. Chem. B
  
  巻: 120 号: 43 ページ: 11102-11112
- DOI
  10.1021/acs.jpcb.6b07332
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-16H00825, KAKENHI-PROJECT-15K00400
[雑誌論文] Analysis of the free energy landscapes for the opening-closing dynamics of the maltose transporter ATPase MalK2 using enhanced-sampling molecular dynamics simulation2015
- 著者名/発表者名
  Wei-Lin Hsu, Tadaomi Furuta, Minoru Sakurai
- 雑誌名
  
  J. Phys. Chem. B
  
  巻: 119 号: 30 ページ: 9717-9725
- DOI
  10.1021/acs.jpcb.5b05432
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400, KAKENHI-PUBLICLY-26104511
[雑誌論文] Analysis of the structural and functional roles of coupling helices in the ATP-binding cassette transporter MsbA through enzyme assays and molecular dynamics simulations2014
- 著者名/発表者名
  Furuta, T., Yamaguchi, T., Kato, H., Sakurai, M.
- 雑誌名
  
  Biochemistry
  
  巻: 53 号: 26 ページ: 4261-4272
- DOI
  10.1021/bi500255j
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25251006, KAKENHI-PROJECT-25870220, KAKENHI-PUBLICLY-26102724, KAKENHI-PROJECT-26670014, KAKENHI-PROJECT-26840048
[雑誌論文] The Tryptophan Residue at the Active Site Tunnel Entrance of Trichoderma reesei Cellobiohydrolase Ce17A Is Important for Initiation of Degradation of Crystalline Cellulose2013
- 著者名/発表者名
  Akihiko Nakamura, Tsukada, T., Auer, S., Furuta, T., Wada, M., Koivula, A., Igarashi, K. and Samejima M.
- 雑誌名
  
  Journal of Biological Chemistry
  
  巻: 288 号: 19 ページ: 13503-13510
- DOI
  10.1074/jbc.m113.452623
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-13J07574, KAKENHI-PROJECT-23570198, KAKENHI-PLANNED-24114008, KAKENHI-PROJECT-24380089
[雑誌論文] Dynamics and structural changes induced by ATP and/or substrate binding in the inward-facing conformation state of P-glycoprotein2013
- 著者名/発表者名
  Y. Watanabe
- 雑誌名
  
  Chem. Phys. Left
  
  巻: 557 ページ: 145-149
- DOI
  10.1016/j.cplett.2012.12.040
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-20118001, KAKENHI-PLANNED-20118006, KAKENHI-PROJECT-23570198
[雑誌論文] The Power Stroke Driven by ATP Binding in CFTR As Studied by by ATP Binding in CFTR As Studied by Molecular Dynamics Simulations2013
- 著者名/発表者名
  T. Furukawa-Hagiya
- 雑誌名
  
  J. Phys. Chem. B
  
  巻: 117 号: 1 ページ: 83-93
- DOI
  10.1021/jp308315w
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-20118001, KAKENHI-PLANNED-20118006, KAKENHI-PROJECT-22590212, KAKENHI-PUBLICLY-23118714, KAKENHI-PROJECT-23570198
[雑誌論文] The tryptophan redidue at the active site tunnel entrance of Trichoderma reesei cellobiohydrolase Cel7A is important for initiation of degradation of crystalline cellulose2013
- 著者名/発表者名
  A. Nakamura, T. Tsukada, S. Auer, T. Furuta, M. Wada, A. Koivula, K. Igarashi, M. Samejima.
- 雑誌名
  
  J. Biol. Chem.
  
  巻: 288 ページ: 13403-13510
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23570198
[雑誌論文] Minimum Free Energy Path of Ligand-Induced Transition in Adenylate Kinase2012
- 著者名/発表者名
  Y. Matsunaga, H. Fujisaki, T. Terada, T. Furuta, K. Moritsugu, and A. Kidera
- 雑誌名
  
  PLoS Comput. Biol
  
  巻: 8 号: 6 ページ: 12-12
- DOI
  10.1371/journal.pcbi.1002555
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22540421, KAKENHI-PROJECT-23247027, KAKENHI-PROJECT-23540454, KAKENHI-PROJECT-23570198, KAKENHI-PROJECT-24770159
[雑誌論文] Different inhibitory potency of febuxostat towards mammalian and bacterial xanthine oxidoreductases: insight from molecular dynamics2012
- 著者名/発表者名
  H. Kikuchi, H. Fujisaki, T. Furuta, K.Okamoto, S. Leimkuhler, and T. Nishino
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 2 号: 1 ページ: 331-331
- DOI
  10.1038/srep00331
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22540421, KAKENHI-PROJECT-23570198
[雑誌論文] 理論生物物理と生化学を組み合わせた薬物研究―キサンチン酸化還元酵素と阻害剤フェブキソスタットの結合機序―2012
- 著者名/発表者名
  藤崎弘士, 古田忠臣, 岡本研, 菊地浩人
- 雑誌名
  
  日本医科大学医学会誌
  
  巻: 8 ページ: 222-227
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23570198
[雑誌論文] 理論生物物理と生化学を組み合わせた薬効研究―キサンチン酸化還元酵素と阻害剤フェブキソスタットの結合機序―2012
- 著者名/発表者名
  藤崎弘士, 古田忠臣, 岡本研, 菊地浩人
- 雑誌名
  
  日本医科大学医学会誌
  
  巻: 8 ページ: 222-227
- NAID
  130004471511
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23570198
[学会発表] Therapeutic drugs developed for CFTR mutants found in Caucasian Cystic Fibrosis patients also succeeded to rescue CFTR mutants found in Japanese patients.2022
- 著者名/発表者名
  君島莉央、相馬光流、中川大、古田忠臣、石黒洋、中尾香菜子、相馬義郎
- 学会等名
  日本生理学会第100回記念大会　国立京都国際会館
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K07279
[学会発表] Dynamics structural analysis of miniprotein by in-cell crystal engineering2022
- 著者名/発表者名
  Mariko Kojima, Yuki Hishikawa, Satoshi Abe, Tadaomi Furuta, Duy Phuoc Tran, Akio Kitao, Takafumi Ueno
- 学会等名
  102nd CSJ Annual Meeting
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H02830
[学会発表] AbbVie 第Ⅱ相治験薬 Galicaftor の日本人型病因性CFTR変異体への効果2022
- 著者名/発表者名
  小川亜美、小川未裕、石塚柊太、大塚悠花、黒澤歩実、小林可奈、齋藤佑香、髙橋柚妃、植松咲貴、中島乃愛、君島莉央、相馬光流、中尾香菜子、中川大、古田忠臣、相馬義郎
- 学会等名
  第8回嚢胞性線維症情報交換会　名古屋大学鶴友会館
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K07279
[学会発表] タンパク質分子針の末端設計による二次元集合パターン制御2021
- 著者名/発表者名
  菊池幸祐, 福山達也, 古田忠臣, 前多裕介, 内橋貴之, 上野隆史
- 学会等名
  The 70th SPSJ Annual Meeting
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H02830
[学会発表] βヘリックスタンパク質分子針の末端設計による二次元集合制御2021
- 著者名/発表者名
  菊池幸祐, 福山達也, 古田忠臣, 内橋貴之, 前多裕介, 上野隆史
- 学会等名
  第15回バイオ関連化学シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H02830
[学会発表] Energy Analysis of Miniprotein by in Vivo Protein Crystallization2021
- 著者名/発表者名
  小島摩利子, 菱川湧輝, 安部聡, 古田忠臣, Tran Phuoc Duy, 北尾彰朗, 上野隆史
- 学会等名
  日本化学会第101春季年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H02830
[学会発表] β-ヘリックス人工分子針の動的集合設計2021
- 著者名/発表者名
  菊池幸祐, 福山達也, Maity Basudev, 古田忠臣, 前多裕介, 内橋貴之, 上野隆史
- 学会等名
  日本化学会第101春季年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H02830
[学会発表] タンパク質分子針の末端構造設計による二次元集合パターン制御2021
- 著者名/発表者名
  菊池幸祐, 福山達也, 古田忠臣, 前多裕介, 内橋貴之, 上野隆史
- 学会等名
  第１回発動分子科学研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H02830
[学会発表] Development of an ATP force field for coarse-grained simulation of ATPases and its application to the maltose transporter2019
- 著者名/発表者名
  Ryosuke Hirano, Tsubasa Yabuchi, Minoru Sakurai, Tadaomi Furuta
- 学会等名
  The 63rd Annual Meeting of the Biophysical Society
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] MDシミュレーションを用いたグルコーストランスポーター8(GLUT8)の膜貫通ヘリックス7(TM7)に関する解析2018
- 著者名/発表者名
  中田康太, 古田忠臣, 櫻井実
- 学会等名
  第18回日本蛋白質科学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] ABCトランスポーターにおけるヌクレオチドドメイン2量体化の駆動力に関する計算化学的解析2018
- 著者名/発表者名
  境澤穂波, 許維麟, 古田忠臣, 櫻井実
- 学会等名
  第18回日本蛋白質科学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] ABCトランスポーターCFTRの構造変化及び基質輸送機構の計算化学的解析2018
- 著者名/発表者名
  千葉一輝, 古田忠臣, 櫻井実
- 学会等名
  第18回日本蛋白質科学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] 転写制御因子LmrRおよびQacRにおける多剤認識メカニズムに関する分子シミュレーション研究2018
- 著者名/発表者名
  クライヤー篠塚一穂, 古田忠臣, 櫻井実
- 学会等名
  第56回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] 粗視化MDシミュレーションを用いたATP結合により誘起されるマルトーストランスポーターの構造変化の解析2018
- 著者名/発表者名
  平野諒輔, 古田忠臣, 櫻井実
- 学会等名
  第18回日本蛋白質科学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] Structural and Functional dynamics of ABC transporters explored by molecular simulations2018
- 著者名/発表者名
  Tadaomi Furuta
- 学会等名
  第56回日本生物物理学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] 親水性タンパク質ータンパク質間会合の駆動力に関するMD及び3D-RISM計算2017
- 著者名/発表者名
  境澤穂波, 古田忠臣, 櫻井実
- 学会等名
  第55回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] Martini 力場を用いた粗視化シミュレーションによるCl-チャネルCFTRのダイナミクスの解析2017
- 著者名/発表者名
  矢渕翼, 南條舜, 古田忠臣, 櫻井実
- 学会等名
  第17回日本蛋白質科学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] 多剤認識転写因子LmrRにおける薬剤分子認識機構の計算化学的解析2016
- 著者名/発表者名
  クライヤー篠塚一帆、古田忠臣、櫻井実
- 学会等名
  第54回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  つくば国際会議場（茨城県つくば市）
- 年月日
  2016-11-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] 分子シミュレーションで探るABCトランスポーターの機能的ダイナミクス2016
- 著者名/発表者名
  古田忠臣
- 学会等名
  大阪大学蛋白質研究所セミナー「膜タンパク質の構造ダイナミクス」
- 発表場所
  大阪大学蛋白質研究所（大阪府吹田市）
- 年月日
  2016-05-12
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] ヒトには効くがバクテリアには効かない痛風薬　ー酵素と阻害剤BOFとの相互作用ダイナミクスー2016
- 著者名/発表者名
  菊地浩人、藤崎弘士、古田忠臣、岡本研、西野武士
- 学会等名
  日本物理学会2016年秋季大会
- 発表場所
  金沢大学角間キャンパス
- 年月日
  2016-09-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26440081
[学会発表] MDシミュレーションによるCFTRチャネルの基質輸送機構及び変異による影響の解析2016
- 著者名/発表者名
  古田忠臣、南條舜、相馬義朗、櫻井実
- 学会等名
  第16回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  福岡国際会議場（福岡県福岡市）
- 年月日
  2016-06-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] 多剤認識転写因子LmrRにおける薬剤分子認識機構の計算化学的解析2016
- 著者名/発表者名
  クライヤー篠塚一帆、古田忠臣、櫻井実
- 学会等名
  第16回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  福岡国際会議場（福岡県福岡市）
- 年月日
  2016-06-07
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] QM/MM Metadynamicsで探るマルトーストランスポーターのATP加水分解メカニズム2016
- 著者名/発表者名
  許維麟、古田忠臣、櫻井実
- 学会等名
  第16回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  福岡国際会議場（福岡県福岡市）
- 年月日
  2016-06-07
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] キサンチン酸化還元酵素基質結合ポケットの動的解析2016
- 著者名/発表者名
  岡本研、菊地浩人、藤崎弘士、古田忠臣、西野武士
- 学会等名
  第49回日本痛風・核酸代謝学会総会
- 発表場所
  大阪
- 年月日
  2016-02-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26440081
[学会発表] Molecular dynamics investigation of the full maltose transporter with and without the maltose binding protein MalE2016
- 著者名/発表者名
  許維麟、古田忠臣、櫻井実
- 学会等名
  第54回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  つくば国際会議場（茨城県つくば市）
- 年月日
  2016-11-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] 熱ゆらぎと水和効果に着目したABCトランスポーターのNBD二量体化過程の統計熱力学的解析2015
- 著者名/発表者名
  境澤穂波、渡邉宙志、古田忠臣、櫻井実
- 学会等名
  第53回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  金沢大学角間キャンパス自然科学本館(金沢市)
- 年月日
  2015-09-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] 熱ゆらぎと水和効果に着目したABCトランスポーターのNBD二量体化過程の統計熱力学的解析2015
- 著者名/発表者名
  境澤穂波, 渡邉宙志, 古田忠臣, 櫻井実
- 学会等名
  第15回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  あわぎんホール(徳島市)
- 年月日
  2015-06-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] 3D-RISM study of water-meditated forces between the nucleotide binding domains responsible for the power stroke in an ABC transporter2015
- 著者名/発表者名
  Tomoka Furukawa-Hagiya, Norio Yoshida, Shuntaro Chiba, Tomohiko Hayashi, Tadaomi Furuta, Minoru Sakurai
- 学会等名
  The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2015 (Pacifichem 2015)
- 発表場所
  Hawaii Convention Center, Honolulu, Hawaii, U.S.A.(ホノルル)
- 年月日
  2015-12-17
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] キサンチン酸化還元酵素の基質ガイド機構の解析2015
- 著者名/発表者名
  岡本研、菊地浩人、藤崎弘士、古田忠臣、西野武士
- 学会等名
  第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会合同大会
- 発表場所
  神戸
- 年月日
  2015-12-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26440081
[学会発表] On the motion of a loop located in the entrance to the ligand-binding pocket of bacterial XOR with the inhibitor BOF2015
- 著者名/発表者名
  H. Kikuchi, H. Fujisaki, T. Furuta, K. Okamoto, T. Nishino.
- 学会等名
  53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
- 発表場所
  Kanazawa
- 年月日
  2015-09-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26440081
[学会発表] Free energy calculation for the ATP-induced dimerization of the nucleotide-binding domains in a maltose transporter: Importance of the water-mediated entropic force2015
- 著者名/発表者名
  Tomohiko Hayashi, Shuntaro Chiba, Tadaomi Furuta, Minoru Sakurai
- 学会等名
  The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2015 (Pacifichem 2015)
- 発表場所
  Hawaii Convention Center, Honolulu, Hawaii, U.S.A.(ホノルル)
- 年月日
  2015-12-17
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] Analysis of the free energy landscape for the open-close dynamics of maltose transporter ATPase, MalK, using enhanced sampling MD simulation2015
- 著者名/発表者名
  Wei-Lin Hsu, Tadaomi Furuta, Minoru Sakurai
- 学会等名
  The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2015 (Pacifichem 2015)
- 発表場所
  Hawaii Convention Center, Honolulu, Hawaii, U.S.A.(ホノルル)
- 年月日
  2015-12-17
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] Analysis of the Free Energy Landscapes for the Open-Closing Dynamics of MalK2 Using Enhanced Sampling MD Simulation2015
- 著者名/発表者名
  許維麟, 古田忠臣, 櫻井実
- 学会等名
  第53回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  金沢大学角間キャンパス自然科学本館(金沢市)
- 年月日
  2015-09-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] Structural and functional roles of coupling helices in ABC transporter MsbA: Experimental and computational studies2015
- 著者名/発表者名
  Tadaomi Furuta, Tomohiro Yamaguchi, Hiroaki Kato, Minoru Sakurai
- 学会等名
  The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2015 (Pacifichem 2015)
- 発表場所
  Hawaii Convention Center, Honolulu, Hawaii, U.S.A.(ホノルル)
- 年月日
  2015-12-17
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00400
[学会発表] Elastic Network Modelを用いたABCトランスポーターのglobal motionの解析2014
- 著者名/発表者名
  荒井直樹, 古田忠臣, 櫻井実
- 学会等名
  第52回日本生物物理学会大会
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター
- 年月日
  2014-09-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870220
[学会発表] MDシミュレーションを用いたマウスと線虫のABCB1トランスポーターの動的性質の解析2014
- 著者名/発表者名
  西本達志、古田忠臣、櫻井実
- 学会等名
  第14回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  横浜産貿ホールマリネリア
- 年月日
  2014-06-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870220
[学会発表] MDシミュレーションで探るマルトーストランスポーターATPアーゼ（MalK）のダイナミクスと構造変化2014
- 著者名/発表者名
  許維麟、古田忠臣、櫻井実
- 学会等名
  第14回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  横浜産貿ホールマリネリア
- 年月日
  2014-06-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870220
[学会発表] MDシミュレーションで探るマルトーストランスポーターATPアーゼ（MalK）のダイナミクスと構造変化2014
- 著者名/発表者名
  許維麟, 古田忠臣, 櫻井実
- 学会等名
  第52回日本生物物理学会大会
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター
- 年月日
  2014-09-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870220
[学会発表] Elastic Network Modelを用いたABCトランスポーターのglobal motionの解析2014
- 著者名/発表者名
  荒井直樹、古田忠臣、櫻井実
- 学会等名
  第14回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  横浜産貿ホールマリネリア
- 年月日
  2014-06-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870220
[学会発表] MDシミュレーションを用いたマウス・線虫ABCB1トランスポーターの構造・ダイナミクスの解析2014
- 著者名/発表者名
  西本達志, 古田忠臣, 櫻井実
- 学会等名
  第52回日本生物物理学会大会
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター
- 年月日
  2014-09-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870220
[学会発表] Molecular Dynamics and Free Energy Analysis of Xanthine Oxidoreductase-Ligand Interactions2013
- 著者名/発表者名
  K. Okamoto, H. Kikuchi, H. Fujisaki, T. Furuta, S. Leimkuhler, and T. Nishino.
- 学会等名
  2013 Molybdenum & Tungsten Enzymes Conference
- 発表場所
  Sintra (Portugal)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23570198
[学会発表] Mutation studies on the mammalian and the bacterial XORs with inhibitors2013
- 著者名/発表者名
  H. Kikuchi, H. Fujisaki, T. Furuta, K. Okamoto, T. Nishino
- 学会等名
  The 51st Annual meeting of the Biophysics Society of Japan
- 発表場所
  Kyoto
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23570198
[学会発表] Mutation studies on the mammalian and the bacterial XORs with inhibitors2013
- 著者名/発表者名
  H. Kikuchi, H. Fujisaki, T. Furuta, K. Okamoto, and T. Nishino.
- 学会等名
  The 51^<st> Annual Meeting of the Biophysics society of japan
- 発表場所
  Kyoto (Jpn)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23570198
[学会発表] Molecular dynamics simulations and binding free energy analysis of xanthine oxidoreductase-ligand complexes2012
- 著者名/発表者名
  H. Kikuchi, H. Fujisaki, T. Furuta, K. Okamoto, and T. Nishino.
- 学会等名
  The 50^<st> Annual Meeting of the Biophysics society of Japan
- 発表場所
  Nagoya (Japan)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23570198
[学会発表] Molecular dynamics and free energy analysis of xanthine oxidoreductase-ligand interactions2012
- 著者名/発表者名
  H. Kikuchi, H. Fujisaki, T. Furuta, K. Okamoto, and T. Nishino.
- 学会等名
  TACC 2012 Theory and Applications of Computational Chemistry
- 発表場所
  Pavia (Italy)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23570198
[学会発表] 抗痛風薬フェブキソスタットとキサンチン酸化還元酵素との相互作用の解析2012
- 著者名/発表者名
  岡本研, 菊地浩人, 藤崎弘士, 古田忠臣, 西野武士
- 学会等名
  第85回日本生化学会大会
- 発表場所
  福岡国際会議場
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23570198
[学会発表] キサンチン酸化還元酵素に対するファブキソスタットの阻害作用2011
- 著者名/発表者名
  菊地浩人, 藤崎弘士, 古田忠臣, 岡本研, 西野武士
- 学会等名
  日本物理学会2011年秋季大会
- 発表場所
  富山大学
- 年月日
  2011-09-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23570198
[学会発表] キサンチン酸化還元酵素に対するフェブキソスタットの阻害作用2011
- 著者名/発表者名
  菊地浩人、藤崎弘士、古田忠臣、岡本研、西野武士
- 学会等名
  日本物理学会2011年秋季大会
- 発表場所
  富山大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23570198
[学会発表] Structure-based inhibitor mechanism of febuxostat for xanthine oxidoreductase : molecular dynamics study2011
- 著者名/発表者名
  H. Kikuchi, H. Fujisaki, T. Furuta, K. Okamoto, S. Leimkuhler, and T. Nishino.
- 学会等名
  Ninth Triennial Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists
- 発表場所
  Santiago de Compostela (Spain)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23570198
[学会発表] Structure-based inhibitor mechanism of febuxostat for xanthine oxidoreductase: molecular dynamics study2011
- 著者名/発表者名
  H. Kikuchi, H. Fujisaki, T. Furuta, K. Okamoto, S. Leimkuhler, and T. Nishino
- 学会等名
  Ninth Triennial Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists
- 発表場所
  Santiago de Compostela, Spain
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23570198
[学会発表] ABCトランスポーターのヌクレオチド結合ドメイン二量体化の理論的解析―ATPと水の役割
- 著者名/発表者名
  林智彦、萩谷朋佳、千葉峻太朗、古田忠臣、吉田紀生、櫻井実
- 学会等名
  第51回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  国立京都国際会館
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870220
[学会発表] 分子動力学シミュレーションで探るCFTRにおける変異の影響
- 著者名/発表者名
  小寺充彦、萩谷朋佳、古田忠臣、相馬義郎、櫻井実
- 学会等名
  第51回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  国立京都国際会館
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870220
[学会発表] 分子動力学シミュレーションを用いたABCトランスポーターTM287/288におけるATP・基質結合による構造変化
- 著者名/発表者名
  佐藤雪子、古田忠臣、櫻井実
- 学会等名
  第13回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  とりぎん文化会館
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870220
[学会発表] The loop opening motion of the bacterial XOR with the inhibitor BOF: molecular dynamics study
- 著者名/発表者名
  H. Kikuchi, H. Fujisaki, T. Furuta, K. Okamoto, T. Nishino
- 学会等名
  10th Congress of the World Association of Theoretical and Computational Chemists
- 発表場所
  Santiago, Chile
- 年月日
  2014-10-05 – 2014-10-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26440081
[学会発表] The gate opening motion of xanthine binding pocket of XOR
- 著者名/発表者名
  K. Okamoto, H. Kikuchi, H. Fujisaki, T. Furuta, S. Leimkühler, T. Nishino
- 学会等名
  International simposium of Flavins and Flavoproteins
- 発表場所
  Phechaburi, Thailand
- 年月日
  2014-07-27 – 2014-08-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26440081

1. 菊地浩人 (00224907)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 19件
2. 岡本研 (60267143)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 18件
3. 藤崎弘士 (60573243)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 20件
4. 上野隆史 (70332179)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 9件
5. 相馬義郎 (60268183)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
6. 森肇 (80201812)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 内橋貴之 (30326300)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 中川大 (40397039)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
9. 岩本真幸 (40452122)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 大崎寿久 (50533650)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
11. 山下恵太郎 (20721690)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
12. 口丸高弘 (10570591)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
13. 岩野智 (10734832)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
14. 花岡健二郎 (70451854)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 山口知宏

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
16. 加藤博章

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
17. 桜井実

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件

古田 忠臣 Furuta Tadaomi

研究課題

研究成果

共同研究者

自由行動動物の深部臓器における細胞応答の光イメージング

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

１分子ゆらぎの直接観察による膜蛋白の機能発現と障害発生のメカニズムの解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

機能性タンパク質結晶の細胞内合成

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

細胞内結晶化反応を利用した精密多層蛋白質材料の創成

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

分子シミュレーションで探るヘテロ2量体ABCトランスポーターの非対称ダイナミクス研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ヒトには効くがバクテリアには効かない痛風薬―酵素薬剤相互作用のダイナミクス―

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

分子シミュレーションによるABCトランスポーターの「ジャンケン」メカニズムの解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

キサンチン酸化還元酵素における阻害剤の作用の研究―「鍵と鍵穴」のドグマを超えて

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[図書] The Role of Water in ATP Hydrolysis Energy Transduction by Protein Machinery2018

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[雑誌論文] Protein Needles Designed to Self‐Assemble through Needle Tip Engineering2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Single-molecule level dynamic observation of disassembly of the apo-ferritin cage in solution2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Dynamic behavior of an artificial protein needle contacting a membrane observed by high-speed atomic force microscopy2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Development of an ATP force field for coarse‐grained simulation of ATPases and its application to the maltose transporter2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] The mechanism of nucleotide‐binding domain dimerization in the intact maltose transporter as studied by all‐atom molecular dynamics simulations2018

著者名/発表者名

古田忠臣 Furuta Tadaomi