鄭載運 Jung Jaewoon

研究者番号	10554701
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 開拓研究所, 専任技師
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2025年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 開拓研究所, 専任技師 2021年度 – 2024年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 開拓研究本部, 専任技師
審査区分/研究分野	研究代表者以外学術変革領域研究区分(Ⅲ)
キーワード	研究代表者以外長鎖ノンコーディングRNA / Hero蛋白質 / 液液相分離 / 天然変性蛋白質 / 分子動力学シミュレーション

非ドメイン型バイオポリマーの分子動力学計算
- 研究代表者
  
  依田隆夫
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2025
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅲ)
- 研究機関
  長浜バイオ大学

すべて 2024 2023 2022

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] GENESIS CGDYN: large-scale coarse-grained MD simulation with dynamic load balancing for heterogeneous biomolecular systems2024
- 著者名/発表者名
  Jung Jaewoon、Tan Cheng、Sugita Yuji
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 15 号: 1 ページ: 3370-3370
- DOI
  10.1038/s41467-024-47654-1
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05249, KAKENHI-PLANNED-21H05282, KAKENHI-PROJECT-19H05645
[雑誌論文] Acceleration of generalized replica exchange with solute tempering simulations of large biological systems on massively parallel supercomputer2023
- 著者名/発表者名
  Jung Jaewoon、Kobayashi Chigusa、Sugita Yuji
- 雑誌名
  
  Journal of Computational Chemistry
  
  巻: - 号: 20 ページ: 1740-1749
- DOI
  10.1002/jcc.27124
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05282, KAKENHI-PLANNED-21H05249, KAKENHI-PROJECT-19H05645
[雑誌論文] Implementation of residue-level coarse-grained models I GENESIS for large-scale molecular dynamics simulations2022
- 著者名/発表者名
  Cheng Tan, Jaewoon Jung, Chigusa Kobayashi, Diego Ugarte, Shoji Takada, Yuji Sugita
- 雑誌名
  
  PLoS Comp. Biol.
  
  巻: 18 号: 4 ページ: e1009578-e1009578
- DOI
  10.1371/journal.pcbi.1009578
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05249, KAKENHI-PLANNED-21H05282, KAKENHI-PROJECT-19H05645
[雑誌論文] Use of multistate Bennett acceptance ratio method for free-energy calculations from enhanced sampling and free-energy perturbation2022
- 著者名/発表者名
  Matsunaga Yasuhiro、Kamiya Motoshi、Oshima Hiraku、Jung Jaewoon、Ito Shingo、Sugita Yuji
- 雑誌名
  
  Biophysical Reviews
  
  巻: 14 号: 6 ページ: 1503-1512
- DOI
  10.1007/s12551-022-01030-9
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05282, KAKENHI-PROJECT-19H05645, KAKENHI-PROJECT-20K21380
[学会発表] 人工設計ペプチドイオンチャネルの構造ダイナミクス2023
- 著者名/発表者名
  新津藍, Jaewoon Jung, 杉田有治
- 学会等名
  第23回日本蛋白質科学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05282
[学会発表] Acceleration of residue-level coarse-grained molecular dynamics by efficient parallelization2023
- 著者名/発表者名
  J. Jung, C. Tan, C. Kobayashi, D. Ugarte, Y. Sugita
- 学会等名
  The 67th Biophysical Society Annual Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05282
[学会発表] Development of GENESIS on Fugaku for Large-Scale MD Simulations2023
- 著者名/発表者名
  Jaewoon Jung, Yuji Sugita
- 学会等名
  Workshop of Multi-scale Molecular Dynamics Simulation and Machine Learning of Biomolecular Systems
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05282
[学会発表] Development of GENESIS for large-scale molecular dynamics2023
- 著者名/発表者名
  Jaewoon Jung, Yuji Sugita
- 学会等名
  CJK-WTCC VI
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05282
[学会発表] Acceleration of gREST simulations of large biological systems on massively parallel computers2022
- 著者名/発表者名
  J. Jung, C. Kobayashi, S. Sugita
- 学会等名
  第36回分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05282
[学会発表] Acceleration of residue-level coarse-grained molecular dynamics by new development of parallelization2022
- 著者名/発表者名
  J. Jung, C. Tan, C. Kobayashi, D. Ugarte, Y. Sugita
- 学会等名
  第60回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05282

1. 依田隆夫 (50367900)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
2. 譚丞 (20865886)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
3. 杉田有治

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件

鄭 載運 Jung Jaewoon

研究課題

研究成果

共同研究者

非ドメイン型バイオポリマーの分子動力学計算

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] GENESIS CGDYN: large-scale coarse-grained MD simulation with dynamic load balancing for heterogeneous biomolecular systems2024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Acceleration of generalized replica exchange with solute tempering simulations of large biological systems on massively parallel supercomputer2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Implementation of residue-level coarse-grained models I GENESIS for large-scale molecular dynamics simulations2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Use of multistate Bennett acceptance ratio method for free-energy calculations from enhanced sampling and free-energy perturbation2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] 人工設計ペプチドイオンチャネルの構造ダイナミクス2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Acceleration of residue-level coarse-grained molecular dynamics by efficient parallelization2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Development of GENESIS on Fugaku for Large-Scale MD Simulations2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Development of GENESIS for large-scale molecular dynamics2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Acceleration of gREST simulations of large biological systems on massively parallel computers2022

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Acceleration of residue-level coarse-grained molecular dynamics by new development of parallelization2022

著者名/発表者名

学会等名

データソース

鄭載運 Jung Jaewoon