西田敬二 NISHIDA KEIJI

研究者番号	10620338
その他のID
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2018年度 – 2020年度: 神戸大学, 先端バイオ工学研究センター, 教授 2016年度 – 2017年度: 神戸大学, 科学技術イノベーション研究科, 教授 2015年度: 神戸大学, 学内共同利用施設等, 准教授 2014年度: 神戸大学, 自然科学系先端融合研究環重点研究部, 准教授
審査区分/研究分野	研究代表者システムゲノム科学 / 複合領域
キーワード	研究代表者合成生物 / CRISPR / Target-AID / ゲノム編集 / 合成生物学 / synthetic biology / 遺伝子 / ゲノム / バイオテクノロジー / Base editing … もっと見る / 塩基編集 / グリコシラーゼ / Cas9 / Target-G / Targegt-AID / 人工進化 / 進化 / 合成進化 / デアミナーゼ隠す

標的DNAのあらゆる塩基を自在に直接変換できる人工酵素技術の創出研究代表者
- 研究代表者
  
  西田敬二
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2020
- 研究種目
  
  若手研究(A)
- 研究分野
  
  システムゲノム科学
- 研究機関
  神戸大学
半合理的なゲノム進化デザインを可能とする自己進化型ゲノム編集システムの創成研究代表者
- 研究代表者
  
  西田敬二
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2017
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  システムゲノム科学
- 研究機関
  神戸大学
DNA 塩基置換酵素の“逆進化”誘導によるDNAを切らないゲノム編集ツールの開発研究代表者
- 研究代表者
  
  西田敬二
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2015
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  複合領域
- 研究機関
  神戸大学

すべて 2021 2020 2019 2018 2017 2016 2015 2014

すべて雑誌論文学会発表図書産業財産権

[図書] 完全版　ゲノム編集実験スタンダード2019
- 著者名/発表者名
  中井明日也，Ang Li，西田敬二
- 総ページ数
  386
- 出版者
  羊土社
- ISBN
  9784758122443
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H04994
[雑誌論文] CRISPR-derived genome editing technologies for metabolic engineering2021
- 著者名/発表者名
  Nishida Keiji、Kondo Akihiko
- 雑誌名
  
  Metabolic Engineering
  
  巻: 63 ページ: 141-147
- DOI
  10.1016/j.ymben.2020.12.002
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H04994
[雑誌論文] Efficient base editing in tomato using a highly expressed transient system2021
- 著者名/発表者名
  Yuan Shaoze、Kawasaki Shunsuke、Abdellatif Islam M. Y.、Nishida Keiji、Kondo Akihiko、Ariizumi Tohru、Ezura Hiroshi、Miura Kenji
- 雑誌名
  
  Plant Cell Reports
  
  巻: 40 号: 4 ページ: 667-676
- DOI
  10.1007/s00299-021-02662-z
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H04994, KAKENHI-PROJECT-20K21302
[雑誌論文] Base editors for simultaneous introduction of C-to-T and A-to-G mutations2020
- 著者名/発表者名
  Sakata Rina C.、Ishiguro Soh、Mori Hideto、Tanaka Mamoru、Tatsuno Kenji、Ueda Hiroki、Yamamoto Shogo、Seki Motoaki、Masuyama Nanami、Nishida Keiji、Nishimasu Hiroshi、Arakawa Kazuharu、Kondo Akihiko、Nureki Osamu、Tomita Masaru、Aburatani Hiroyuki、Yachie Nozomu
- 雑誌名
  
  Nature Biotechnology
  
  巻: na 号: 7 ページ: 865-869
- DOI
  10.1038/s41587-020-0509-0
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H02428, KAKENHI-PROJECT-18K19777, KAKENHI-PROJECT-17K07195, KAKENHI-PROJECT-17H04994
[雑誌論文] Fruit setting rewires central metabolism via gibberellin cascades2020
- 著者名/発表者名
  Shinozaki Yoshihito et al.
- 雑誌名
  
  Proceedings of the National Academy of Sciences
  
  巻: 117 号: 38 ページ: 23970-23981
- DOI
  10.1073/pnas.2011859117
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06043, KAKENHI-PROJECT-19K23672, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PROJECT-17H04994
[雑誌論文] Multiple gene substitution by Target-AID base-editing technology in tomato2020
- 著者名/発表者名
  Hunziker Johan、Nishida Keiji、Kondo Akihiko、Kishimoto Sanae、Ariizumi Tohru、Ezura Hiroshi
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 10 号: 1 ページ: 20471-20471
- DOI
  10.1038/s41598-020-77379-2
- NAID
  120007028992
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H04994
[雑誌論文] Production of Herbicide-Sensitive Strain to Prevent Volunteer Rice Infestation Using a CRISPR-Cas9 Cytidine Deaminase Fusion2020
- 著者名/発表者名
  Komatsu Akira、Ohtake Miki、Shimatani Zenpei、Nishida Keiji
- 雑誌名
  
  Frontiers in Plant Science
  
  巻: 11 ページ: 00925-00925
- DOI
  10.3389/fpls.2020.00925
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H04994
[雑誌論文] Targeted Base Editing with CRISPR-Deaminase in Tomato2019
- 著者名/発表者名
  Shimatani Zenpei、Ariizumi Tohru、Fujikura Ushio、Kondo Akihiko、Ezura Hiroshi、Nishida Keiji
- 雑誌名
  
  Methods Mol Biol.
  
  巻: 1917 ページ: 297-307
- DOI
  10.1007/978-1-4939-8991-1_22
- ISBN
  9781493989904, 9781493989911
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H04994
[雑誌論文] Mammalian synthetic biology by CRISPRs engineering and applications2019
- 著者名/発表者名
  Katayama Kenta、Mitsunobu Hitoshi、Nishida Keiji
- 雑誌名
  
  Current Opinion in Chemical Biology
  
  巻: 52 ページ: 79-84
- DOI
  10.1016/j.cbpa.2019.05.020
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H04994
[雑誌論文] A method using electroporation for the protein delivery of Cre recombinase into cultured Arabidopsis cells with an intact cell wall2019
- 著者名/発表者名
  Furuhata Yuichi、Sakai Ayako、Murakami Tomi、Morikawa Mone、Nakamura Chikashi、Yoshizumi Takeshi、Fujikura Ushio、Nishida Keiji、Kato Yoshio
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 9 号: 1 ページ: 2163-2163
- DOI
  10.1038/s41598-018-38119-9
- NAID
  120006559318
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H04994
[雑誌論文] In vivo targeted single-nucleotide editing in zebrafish.2018
- 著者名/発表者名
  Tanaka, S., Yoshioka, S., Nishida, K., Hosokawa, H., Kakizuka, A., and Maegawa, S.
- 雑誌名
  
  Sci. Rep.
  
  巻: 8 号: 1 ページ: 11423-11423
- DOI
  10.1038/s41598-018-29794-9
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18J14073, KAKENHI-PROJECT-16H05151, KAKENHI-PROJECT-17H04994
[雑誌論文] Deaminase-mediated multiplex genome editing in Escherichia coli2018
- 著者名/発表者名
  Banno S, Nishida K, Arazoe T, Mitsunobu H and Kondo A.
- 雑誌名
  
  Nature Microbiology
  
  巻: 3 号: 4 ページ: 423-429
- DOI
  10.1038/s41564-017-0102-6
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K17879, KAKENHI-PROJECT-17H05021, KAKENHI-PROJECT-16K14654, KAKENHI-PROJECT-17H04994
[雑誌論文] Genetic and physiological basis for antibody production by Kluyveromyces marxianus2018
- 著者名/発表者名
  Nambu-Nishida Yumiko、Nishida Keiji、Hasunuma Tomohisa、Kondo Akihiko
- 雑誌名
  
  AMB Express
  
  巻: 8 号: 1 ページ: 56-56
- DOI
  10.1186/s13568-018-0588-1
- NAID
  120006462314
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K14654, KAKENHI-PROJECT-17H04994
[雑誌論文] Inheritance of co-edited genes by CRISPR-based targeted nucleotide substitutions in rice2018
- 著者名/発表者名
  Shimatani Zenpei、Fujikura Ushio、Ishii Hisaki、Matsui Yusuke、Suzuki Minoru、Ueke Yuki、Taoka Ken-ichiro、Terada Rie、Nishida Keiji、Kondo Akihiko
- 雑誌名
  
  Plant Physiology and Biochemistry
  
  巻: 131 ページ: 78-83
- DOI
  10.1016/j.plaphy.2018.04.028
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H04994, KAKENHI-PROJECT-16K07560
[雑誌論文] Herbicide tolerance-assisted multiplex targeted nucleotide substitution in rice2018
- 著者名/発表者名
  Shimatani Zenpei、Fujikura Ushio、Ishii Hisaki、Terada Rie、Nishida Keiji、Kondo Akihiko
- 雑誌名
  
  Data in Brief
  
  巻: 20 ページ: 1325-1331
- DOI
  10.1016/j.dib.2018.08.124
- NAID
  120006543325
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H04994
[雑誌論文] Targeted nucleotide editing technologies for microbial metabolic engineering2018
- 著者名/発表者名
  Arazoe, T., Kondo, A., Nishida, K.
- 雑誌名
  
  Biotechnology Journal
  
  巻: 13 号: 9 ページ: 170596-170596
- DOI
  10.1002/biot.201700596
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K19218, KAKENHI-PROJECT-17H05021, KAKENHI-PROJECT-17H04994
[雑誌論文] Glycosyltransferase MDR1 assembles a dividing ring for mitochondrial proliferation comprising polyglucan nanofilaments2017
- 著者名/発表者名
  Yoshida Yamato, Kuroiwa Haruko, Shimada Takashi, Yoshida Masaki, Ohnuma Mio, Fujiwara Takayuki, Imoto Yuuta, Yagisawa Fumi, Nishida Keiji, Hirooka Shunsuke, Misumi Osami, Mogi Yuko, Akakabe Yoshihiko, Matsushita Kazunobu, Kuroiwa Tsuneyoshi
- 雑誌名
  
  Proceedings of the National Academy of Sciences
  
  巻: 114 号: 50 ページ: 13284-13289
- DOI
  10.1073/pnas.1715008114
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00676, KAKENHI-PROJECT-16H04813, KAKENHI-PROJECT-15K18588, KAKENHI-PROJECT-17H04994
[雑誌論文] Beyond Native Cas9: Manipulating Genomic Information and Function2017
- 著者名/発表者名
  Mitsunobu Hitoshi、Teramoto Jun、Nishida Keiji、Kondo Akihiko
- 雑誌名
  
  Trends in Biotechnology
  
  巻: 35 号: 10 ページ: 983-996
- DOI
  10.1016/j.tibtech.2017.06.004
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K14654, KAKENHI-PROJECT-17H04994
[雑誌論文] Targeted base editing in rice and tomato using a CRISPR-Cas9 cytidine deaminase fusion2017
- 著者名/発表者名
  Shimatani, Z., Kashojiya, S., Takayama, M., Terada, R., Arazoe, T., Ishii, H., Teramura, H., Yamamoto, T., Komatsu, H., Miura, K., Ezura, H., Nishida, K., Ariizumi, T. and Kondo A.
- 雑誌名
  
  Nature Biotechnology
  
  巻: 印刷中号: 5 ページ: 441-443
- DOI
  10.1038/nbt.3833
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K18647, KAKENHI-PROJECT-16K07560, KAKENHI-PROJECT-16K14654, KAKENHI-PUBLICLY-16H01458
[雑誌論文] Development of a comprehensive set of tools for genome engineering in a cold- and thermo-tolerant Kluyveromyces marxianus yeast strain2017
- 著者名/発表者名
  Nambu-Nishida Yumiko、Nishida Keiji、Hasunuma Tomohisa、Kondo Akihiko
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 7 号: 1 ページ: 8993-8993
- DOI
  10.1038/s41598-017-08356-5
- NAID
  120006346142
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K14654, KAKENHI-PROJECT-17H04994
[雑誌論文] Targeted nucleotide editing using hybrid prokaryotic and vertebrate adaptive immune systems2016
- 著者名/発表者名
  Nishida, K., Arazoe, T., Yachie, N., Banno, S., Kakimoto, M., Tabata, M., Mochizuki, M., Miyabe, A., Araki, M., Hara, K.Y., Shimatani, Z. and Kondo, A.
- 雑誌名
  
  Science
  
  巻: 353 号: 6305 ページ: 6305-6305
- DOI
  10.1126/science.aaf8729
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198, KAKENHI-PROJECT-15K18647, KAKENHI-PROJECT-16K14654, KAKENHI-PROJECT-15K18466, KAKENHI-PROJECT-15K14436
[雑誌論文] Evaluation of genes involved in oxidative phosphorylation in yeast by developing a simple and rapid method to measure mitochondrial ATP synthetic activity.2015
- 著者名/発表者名
  Ye X, Morikawa K, Ho SH, Araki M, Nishida K, Hasunuma T, Hara KY, Kondo A.
- 雑誌名
  
  Microbial Cell Factories
  
  巻: 14 号: 1 ページ: 56-56
- DOI
  10.1186/s12934-015-0239-z
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119710, KAKENHI-PROJECT-26430198, KAKENHI-PUBLICLY-26119711, KAKENHI-PUBLICLY-26117715
[雑誌論文] Improvement of oxidized glutathione fermentation by thiol redox metabolism engineering in Saccharomyces cerevisiae.2015
- 著者名/発表者名
  Hara KY, Aoki N, Kobayashi J, Kiriyama K, Nishida K, Araki M, Kondo A.
- 雑誌名
  
  Appl Microbiol Biotechnol.
  
  巻: Nov;99(22) ページ: 9771-8
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119710
[産業財産権] 標的化したDNA配列の核酸塩基を特異的に変換する、単子葉植物のゲノム配列の変換方法、及びそれに用いる分子複合体2015
- 発明者名
  西田敬二、島谷善平、近藤昭彦
- 権利者名
  国立大学法人神戸大学
- 産業財産権種類
  特許
- 出願年月日
  2015-11-27
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119710
[産業財産権] 標的化したＤＮＡ配列の核酸塩基を特異的に変換するゲノム配列の改変方法及びそれに用いる分子複合体2015
- 発明者名
  西田敬二、近藤昭彦、坂野聡美
- 権利者名
  神戸大学
- 産業財産権種類
  特許
- 出願年月日
  2015-03-04
- 外国
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119710
[産業財産権] 細胞内でＤＮＡを切断せずに脱塩基反応によりゲノム中の　　　　　　　狙った領域に変異を導入する技術2014
- 発明者名
  西田敬二、近藤昭彦
- 権利者名
  神戸大学
- 産業財産権種類
  特許
- 産業財産権番号
  2014-224745
- 出願年月日
  2014-11-04
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119710
[学会発表] ゲノムを切らずに書き換える新たなゲノム編集技術の開発2015
- 著者名/発表者名
  西田敬二, 坂野聡美, 近藤昭彦
- 学会等名
  第６７回日本生物工学会　大会
- 発表場所
  鹿児島県鹿児島市
- 年月日
  2015-10-26
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119710
[学会発表] Targeted base exchange-mediated genome editing2015
- 著者名/発表者名
  西田敬二, 坂野聡美, 荒添貴之、島谷善平、近藤昭彦
- 学会等名
  BMB2015
- 発表場所
  兵庫県神戸市
- 年月日
  2015-12-03
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119710
[学会発表] Pin-point genome editing without cleaving DNA2015
- 著者名/発表者名
  西田敬二
- 学会等名
  植物ゲノム編集技術に関する国際シンポジウム
- 発表場所
  茨城県つくば市
- 年月日
  2015-11-28
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119710

1. 坂野聡美

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
2. 三角修己

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
3. 荒木通啓

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
4. 大沼みお

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
5. 谷内江望

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
6. 荒添貴之

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件

西田 敬二 NISHIDA KEIJI

研究課題

研究成果

共同研究者

標的DNAのあらゆる塩基を自在に直接変換できる人工酵素技術の創出研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

半合理的なゲノム進化デザインを可能とする自己進化型ゲノム編集システムの創成研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

DNA 塩基置換酵素の“逆進化”誘導によるDNAを切らないゲノム編集ツールの開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[図書] 完全版 ゲノム編集実験スタンダード2019

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[雑誌論文] CRISPR-derived genome editing technologies for metabolic engineering2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Efficient base editing in tomato using a highly expressed transient system2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Base editors for simultaneous introduction of C-to-T and A-to-G mutations2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Fruit setting rewires central metabolism via gibberellin cascades2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Multiple gene substitution by Target-AID base-editing technology in tomato2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

データソース

[雑誌論文] Production of Herbicide-Sensitive Strain to Prevent Volunteer Rice Infestation Using a CRISPR-Cas9 Cytidine Deaminase Fusion2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Targeted Base Editing with CRISPR-Deaminase in Tomato2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

ISBN

データソース

[雑誌論文] Mammalian synthetic biology by CRISPRs engineering and applications2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] A method using electroporation for the protein delivery of Cre recombinase into cultured Arabidopsis cells with an intact cell wall2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

データソース

[雑誌論文] In vivo targeted single-nucleotide editing in zebrafish.2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

西田敬二 NISHIDA KEIJI

[図書] 完全版　ゲノム編集実験スタンダード2019