藤木克則 FUJIKI KATSUNORI

研究者番号	10646730
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 東京大学, 定量生命科学研究所, 助教
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2025年度: 東京大学, 定量生命科学研究所, 助教 2018年度 – 2021年度: 東京大学, 定量生命科学研究所, 助教 2016年度 – 2017年度: 東京大学, 分子細胞生物学研究所, 助教
審査区分/研究分野	研究代表者中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野 / ゲノム生物学研究代表者以外中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野 / 応用生物化学
キーワード	研究代表者ゲノム / クロマチン高次構造 / Hi-C / ChIA-PET / ChIA-drop / 次世代シーケンサー / クロマチン相互作用 / ゲノム高次構造 / 多領域間クロマチン相互作用 / クロマチン構造 … もっと見る / HiChIP / 多点間相互作用 / Pore-C / ロングリードシーケンサー / 転写調節 / １細胞解析 / PAR化 … もっと見る研究代表者以外希少疾患 / RNAクオリティ / 転写 / コヒーシン / グルタミン / TORC1 / TOR / シグナル伝達隠す

コヒーシンによる転写伸長反応制御の実態解明に向けて
- 研究代表者
  
  白髭克彦
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2027
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 審査区分
  
  中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
- 研究機関
  東京大学
多領域間クロマチン相互作用を１分子の解像度で網羅的に解析できる新たな手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  藤木克則
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2021
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
- 研究機関
  東京大学
TORC1新規in vitroアッセイ系を用いたアミノ酸感知と活性制御機構の解析
- 研究代表者
  
  前田達哉
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2019
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  応用生物化学
- 研究機関
  浜松医科大学
   東京大学
PAR化修飾によるクロマチン高次構造制御・遺伝子転写調節機構の包括的解析研究代表者
- 研究代表者
  
  藤木克則
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2018
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  ゲノム生物学
- 研究機関
  東京大学

すべて 2022 2021 2020 2018 2016

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Highly rigid H3.1/H3.2-H3K9me3 domains set a barrier for cell fate reprogramming in trophoblast stem cells2022
- 著者名/発表者名
  Hada M, Miura H, Tanigawa A, Matoba S, Inoue K, Ogonuki N, Hirose M, Watanabe N, Nakato R, Fujiki K, Hasegawa A, Sakashita A, Okae H, Miura K, Shikata D, Arima T, Shirahige K, Hiratani I, Ogura A.
- 雑誌名
  
  Genes Dev
  
  巻: 36 号: 1-2 ページ: 84-102
- DOI
  10.1101/gad.348782.121
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21384, KAKENHI-PLANNED-18H05530, KAKENHI-PLANNED-19H05758, KAKENHI-PUBLICLY-20H04934, KAKENHI-PLANNED-20H05940, KAKENHI-PROJECT-20K20582, KAKENHI-PROJECT-19K16017, KAKENHI-PROJECT-20K15705, KAKENHI-PROJECT-21K15108, KAKENHI-PROJECT-20H05686, KAKENHI-PROJECT-21H04834, KAKENHI-PROJECT-21K19546, KAKENHI-PROJECT-23K20298
[雑誌論文] Codependency and mutual exclusivity for gene community detection from sparse single-cell transcriptome data2021
- 著者名/発表者名
  Nakajima N, Hayashi T, Fujiki K, Shirahige K, Akiyama T, Akutsu T, Nakato R.
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Res
  
  巻: 49 号: 18 ページ: e104-e104
- DOI
  10.1093/nar/gkab601
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21384, KAKENHI-PLANNED-17H06325, KAKENHI-PLANNED-17H06331, KAKENHI-PLANNED-20H05940, KAKENHI-PROJECT-21H02693
[雑誌論文] Single-cell transcriptional analysis reveals developmental stage-dependent changes in retinal progenitors in the murine early optic vesicle2021
- 著者名/発表者名
  Yamada R, Oguri A, Fujiki K, Shirahige K, Takezoe H, Takahashi N, Kanai Y.
- 雑誌名
  
  Biochem Biophys Res Commun
  
  巻: 543 ページ: 80-86
- DOI
  10.1016/j.bbrc.2021.01.043
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21384, KAKENHI-PLANNED-20H05940, KAKENHI-PROJECT-17H01501
[雑誌論文] Small extracellular vesicles derived from interferon-γ pre-conditioned mesenchymal stromal cells effectively treat liver fibrosis2021
- 著者名/発表者名
  Takeuchi S, Tsuchiya A, Iwasawa T、Nojiri S、Watanabe T、Ogawa M、Yoshida T、Fujiki K、Koui Y、Kido T、Yoshioka Y、Fujita M、Kikuta J、Itoh T、Takamura M、Shirahige K、Ishii M、Ochiya T、Miyajima A、Terai S
- 雑誌名
  
  npj Regenerative Medicine
  
  巻: 6 号: 1
- DOI
  10.1038/s41536-021-00132-4
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21384, KAKENHI-PROJECT-18K07903, KAKENHI-PROJECT-19H03636, KAKENHI-PROJECT-21H02710
[雑誌論文] MAB21L1 modulates gene expression and DNA metabolic processes in the lens placode2021
- 著者名/発表者名
  Yamada R, Oguri A, Fujiki K, Shirahige K, Hirate Y, Kanai-Azuma M, Takezoe H, Akimoto Y, Takahashi N, Kanai Y.
- 雑誌名
  
  Dis Model Mech
  
  巻: 14 号: 12
- DOI
  10.1242/dmm.049251
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21384, KAKENHI-PROJECT-17H01501
[雑誌論文] Age-Dependent Ribosomal DNA Variations in Mice2020
- 著者名/発表者名
  Watada Eriko、Li Sihan、Hori Yutaro、Fujiki Katsunori、Shirahige Katsuhiko、Inada Toshifumi、Kobayashi Takehiko
- 雑誌名
  
  Molecular and Cellular Biology
  
  巻: 40 号: 22
- DOI
  10.1128/mcb.00368-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21384
[雑誌論文] Tet2 and Tet3 in B cells are required to repress CD86 and prevent autoimmunity2020
- 著者名/発表者名
  Tanaka, S. Ise, W. Inoue, T. Ito, A. Ono, C. Shima, Y. Sakakibara, S. Nakayama, M. Fujii, K. Miura, I. Sharif, J. Koseki, H. Koni, P. A. Raman, I. Li, Q. Z. Kubo, M. Fujiki, K. Nakato, R. Shirahige, K. Araki, H. Miura, F. Ito, T. Kawakami, E. Baba, Y. Kurosaki, T.
- 雑誌名
  
  Nature Immunology
  
  巻: 21 号: 8 ページ: 950-961
- DOI
  10.1038/s41590-020-0700-y
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K08883, KAKENHI-PROJECT-20K21384, KAKENHI-PLANNED-17H06331, KAKENHI-PLANNED-19H05745, KAKENHI-PROJECT-16H02622, KAKENHI-PROJECT-18H02626, KAKENHI-PROJECT-19H03491, KAKENHI-PROJECT-19K22537, KAKENHI-PROJECT-20H03503
[雑誌論文] ARCN1 Mutations Cause a Recognizable Craniofacial Syndrome Due to COPI-Mediated Transport Defects.2016
- 著者名/発表者名
  Izumi K, Brett M, Nishi E, Drunat S, Tan ES, Fujiki K, Lebon S, Cham B, Masuda K, Arakawa M, Jacquinet A, Yamazumi Y, Chen ST, Verloes A, Okada Y, Katou Y, Nakamura T, Akiyama T, Gressens P, Foo R, Passemard S, Tan EC, El Ghouzzi V, Shirahige K.
- 雑誌名
  
  Am J Hum Genet.
  
  巻: 99(2) 号: 2 ページ: 451-9
- DOI
  10.1016/j.ajhg.2016.06.011
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02369, KAKENHI-PROJECT-16K18469
[学会発表] シングルセルレベルにおける黒髪と白髪の発現変動解析2021
- 著者名/発表者名
  渡邉紘介、藤木克則、須谷尚史、白髭克彦
- 学会等名
  第44回日本分子生物学会年会
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21384
[学会発表] 多点間クロマチン相互作用検出技術によるゲノム高次構造の解析2020
- 著者名/発表者名
  藤木克則、白髭克彦
- 学会等名
  第48回日本臨床免疫学会総会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21384
[学会発表] Development of a New Research Method for Multi-contact Genomic Interaction Analysis.2018
- 著者名/発表者名
  藤木克則, 細川正人, 竹山春子, 白髭克彦
- 学会等名
  第41回日本分子生物学会年会
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K18469

1. 前田達哉 (90280627)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
2. 白髭克彦 (90273854)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
3. 須谷尚史 (30401524)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 坂田豊典 (40795530)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. ヤポセンクリスチャン (70985580)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 中川優里 (80772152)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 坂東優篤 (90360627)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 田中伸弥

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

藤木 克則 FUJIKI KATSUNORI

研究課題

研究成果

共同研究者

コヒーシンによる転写伸長反応制御の実態解明に向けて

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

多領域間クロマチン相互作用を１分子の解像度で網羅的に解析できる新たな手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

TORC1新規in vitroアッセイ系を用いたアミノ酸感知と活性制御機構の解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

PAR化修飾によるクロマチン高次構造制御・遺伝子転写調節機構の包括的解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Highly rigid H3.1/H3.2-H3K9me3 domains set a barrier for cell fate reprogramming in trophoblast stem cells2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Codependency and mutual exclusivity for gene community detection from sparse single-cell transcriptome data2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Single-cell transcriptional analysis reveals developmental stage-dependent changes in retinal progenitors in the murine early optic vesicle2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Small extracellular vesicles derived from interferon-γ pre-conditioned mesenchymal stromal cells effectively treat liver fibrosis2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] MAB21L1 modulates gene expression and DNA metabolic processes in the lens placode2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Age-Dependent Ribosomal DNA Variations in Mice2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Tet2 and Tet3 in B cells are required to repress CD86 and prevent autoimmunity2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] ARCN1 Mutations Cause a Recognizable Craniofacial Syndrome Due to COPI-Mediated Transport Defects.2016

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] シングルセルレベルにおける黒髪と白髪の発現変動解析2021

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 多点間クロマチン相互作用検出技術によるゲノム高次構造の解析2020

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Development of a New Research Method for Multi-contact Genomic Interaction Analysis.2018

著者名/発表者名

学会等名

データソース

藤木克則 FUJIKI KATSUNORI