千田美紀 Senda Miki

研究者番号	10707467
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 特任助教
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2024年度: 大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 特任助教 2018年度 – 2020年度: 大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 特任助教 2014年度 – 2015年度: 大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 特任助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分47010:薬系化学および創薬科学関連 / 小区分43020:構造生物化学関連 / 構造生物化学
キーワード	研究代表者 X線結晶構造解析 / タンパク質の結晶化 / LTTR / LysRタイプ転写調節因子 / 全長LTTR-DNA複合体のX線結晶構造解析 / 転写 / LysRタイプ転写因子 / DNA複合体 / 結晶構造 / タンパク質ーDNA複合体 … もっと見る / 転写調節因子 / 結晶化スクリーニング / タンパク質結晶化 / 結晶化の再現性向上 / 嫌気チャンバー / 嫌気条件下での結晶化隠す

カルモジュリン依存型キナーゼの活性化機構の構造学的解明と心不全治療薬への応用研究代表者
- 研究代表者
  
  千田美紀
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分47010:薬系化学および創薬科学関連
- 研究機関
  大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構
全長の転写調節因子LTTR-DNA複合体の結晶構造解析と転写活性化機構の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  千田美紀
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2020
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分43020:構造生物化学関連
- 研究機関
  大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構
嫌気条件下で結晶化の成功率を高める手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  千田美紀
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2015
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  構造生物化学
- 研究機関
  大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構

すべて 2021 2020 2019 2018 2016 2015 2014

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Crystal structure of the full-length LysR-type transcription regulator2021
- 著者名/発表者名
  Giannopoulou EA, Senda M, Koentjoro MP, Adachi N, Ogawa N, Senda T.
- 雑誌名
  
  FEBS J.
  
  巻: －号: 15 ページ: 4560-4575
- DOI
  10.1111/febs.15764
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03197, KAKENHI-PROJECT-18K06098
[雑誌論文] 長波長X線を利用したタンパク質結晶構造解析2020
- 著者名/発表者名
  松垣直宏, 山田悠介, 引田理英, 平木雅彦, 千田美紀, 千田俊哉
- 雑誌名
  
  日本結晶学会誌
  
  巻: 62 号: 1 ページ: 56-61
- DOI
  10.5940/jcrsj.62.56
- NAID
  130007806198
- ISSN
  0369-4585, 1884-5576
- 年月日
  2020-02-29
- 言語
  日本語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06098
[雑誌論文] Structural basis for highly (S)-enantioselective reductase towards aliphatic ketones with only one carbon difference between side chain2019
- 著者名/発表者名
  Koesoema, A., Sugiyama, Y., Xu, Z., Standley, D. M., Senda, M., Senda, T. & Matsuda, T.
- 雑誌名
  
  Applied Microbiology and Biotechnology
  
  巻: 103 号: 23-24 ページ: 9543-9553
- DOI
  10.1007/s00253-019-10093-w
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06098
[雑誌論文] Reversible control of enantioselectivity by the length of ketone substituent in biocatalytic reduction2019
- 著者名/発表者名
  Koesoema, A., Sugiyama, Y., Sriwong, K. T. Xu, Z., Verina, S. Standley, D. M., Senda, M., Senda, T. & Matsuda, T.
- 雑誌名
  
  Applied Microbiology and Biotechnology
  
  巻: 103 号: 23-24 ページ: 9529-9541
- DOI
  10.1007/s00253-019-10206-5
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06098
[雑誌論文] LysRタイプ転写調節因子CbnRのDNA結合ドメインとDNAとの複合体構造2018
- 著者名/発表者名
  千田美紀, 安達成彦, 千田俊哉, Maharani Pertiwi Koentjoro, 小川直人
- 雑誌名
  
  日本結晶学会誌
  
  巻: 60 号: 2-3 ページ: 135-141
- DOI
  10.5940/jcrsj.60.135
- NAID
  130007383391
- ISSN
  0369-4585, 1884-5576
- 年月日
  2018-05-31
- 言語
  日本語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06098
[雑誌論文] Structural and computational bases for dramatic skeletal rearrangement in anditomin biosynthesis2018
- 著者名/発表者名
  Nakashima, Y., Mitsuhashi, T., Matsuda, Y., Senda, M., Sato, H., Yamazaki, M., Uchiyama, M., Senda, T. & Abe, I.
- 雑誌名
  
  JACS
  
  巻: 140 号: 30 ページ: 9743-9750
- DOI
  10.1021/jacs.8b06084
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06098, KAKENHI-PLANNED-16H06443, KAKENHI-PLANNED-16H06454, KAKENHI-PUBLICLY-17H05430, KAKENHI-PROJECT-17H06264, KAKENHI-PROJECT-17J09712
[雑誌論文] Crystal structure of the DNA-binding domain of the LysR-type transcriptional regulator CbnR in complex with a DNA fragment of the recognition-binding site in the promoter region.2018
- 著者名/発表者名
  Koentjoro MP, Adachi N, Senda M, Ogawa N, Senda T.
- 雑誌名
  
  FEBS J.
  
  巻: 285(5) 号: 5 ページ: 977-989
- DOI
  10.1111/febs.14380
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07321, KAKENHI-PROJECT-18K06098, KAKENHI-PROJECT-17H06264
[雑誌論文] The Lipid Kinase PI5P4Kβ Is an Intracellular GTP Sensor for Metabolism and Tumorigenesis.2016
- 著者名/発表者名
  Sumita, K., Lo, Y., Takeuchi, K., Senda, M., Kofuji, S., Ikeda, Y., Terakawa, J., Sasaki, M., Yoshino, H., Majd, N., Zheng, Y., Kahoud, E. R., Yokota, T., Emerling, B. M., Asara, J. M., Ishida, T., Locasale, J. W., Daikoku, T., Anastasiou, D., Senda & T., Sasaki, A. T.
- 雑誌名
  
  Molecular Cell
  
  巻: 61 号: 2 ページ: 1-12
- DOI
  10.1016/j.molcel.2015.12.011
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26650026
[雑誌論文] Improvement of Helicobacter pylori CagA crystals by the multi-step soaking method2016
- 著者名/発表者名
  Senda, M.
- 雑誌名
  
  Cryst. Growth Des.
  
  巻: 16 号: 3 ページ: 1565-1571
- DOI
  10.1021/acs.cgd.5b01692
- 査読あり / 謝辞記載あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-22114001, KAKENHI-PROJECT-25250016, KAKENHI-PROJECT-26650026, KAKENHI-PROJECT-26860284, KAKENHI-PROJECT-16H06373, KAKENHI-PROJECT-16K15273
[雑誌論文] Crystallization and preliminary crystallographic analysis of acetophenone reductase from Geotrichum candidum NBRC 45972015
- 著者名/発表者名
  Y. Sugiyama, M. Senda, T. Senda, T. Matsuda
- 雑誌名
  
  Acta Crystallogr.
  
  巻: F71 号: 3 ページ: 320-323
- DOI
  10.1107/s2053230x15002265
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25410189, KAKENHI-PROJECT-26650026
[雑誌論文] Molecular mechanism of strict substrate specificity of an extradiol dioxygenase, DesB, derived from Sphingobium sp. SYK-6.2014
- 著者名/発表者名
  K. Sugimoto, M. Senda, D. Kasai, E. Masai, M. Fukuda and T. Senda
- 雑誌名
  
  PLoS One
  
  巻: 9
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26650026
[雑誌論文] Complete pyridine-nucleotide-specific conversion of an NADH-dependent ferredoxin reductase2014
- 著者名/発表者名
  Nishizawa A, Harada A, Senda M, Tachihara Y, Muramatsu D, Kishigami S, Mori S, Sugiyama K, Senda T, Kimura S
- 雑誌名
  
  Biochemical Journal
  
  巻: 462 号: 2 ページ: 257-265
- DOI
  10.1042/bj20140384
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-14J04356, KAKENHI-PROJECT-26650026
[学会発表] 良質なタンパク質結晶と回折データを効率的に得るための戦略2020
- 著者名/発表者名
  千田美紀
- 学会等名
  日本結晶学会令和2年度年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06098
[学会発表] Comprehensive strategy for quick determination of protein structures.2020
- 著者名/発表者名
  Miki Senda
- 学会等名
  American Crystallographic Association (ACA) 2020
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06098
[学会発表] 良質なタンパク質結晶を得るための戦略2019
- 著者名/発表者名
  千田美紀
- 学会等名
  平成30年度第2回構造生物学研究会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06098
[学会発表] タンパク質結晶化の総合戦略2019
- 著者名/発表者名
  千田美紀、千田俊哉
- 学会等名
  第19回蛋白質科学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06098
[学会発表] Comprehensive strategy for efficient generation of well-diffracted crystals2019
- 著者名/発表者名
  Miki Senda, Toshiya Senda
- 学会等名
  ACA2019
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06098
[学会発表] Crystallization strategy when no crystals are obtained in the initial screening,2018
- 著者名/発表者名
  Miki Senda, Toshiya Senda
- 学会等名
  Structural Biology 2018
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06098
[学会発表] Crystallization strategy when no well-diffracted crystals are obtained in the crystallization screening.2018
- 著者名/発表者名
  Miki Senda, Toshiya Senda
- 学会等名
  American Crystallographic Association (ACA) 2018
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06098
[学会発表] 良質なタンパク質結晶と回折データを効率的に得るための戦略2018
- 著者名/発表者名
  千田美紀、千田俊哉
- 学会等名
  結晶学会平成30年度年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06098
[学会発表] A comprehensive strategy to obtain high quality crystals.2015
- 著者名/発表者名
  Miki Senda, Toshiya Senda
- 学会等名
  American Crystallographic Association (ACA) 2015
- 発表場所
  フィラデルフィア（米国）
- 年月日
  2015-07-29
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26650026
[学会発表] 嫌気条件下で結晶化の成功率を高める手法2015
- 著者名/発表者名
  千田美紀、千田俊哉
- 学会等名
  BMB2015
- 発表場所
  神戸国際会議場（兵庫県神戸市）
- 年月日
  2015-12-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26650026
[学会発表] タンパク質結晶の質を効率良く改善するための結晶工学的処理の手法2015
- 著者名/発表者名
  千田美紀, 千田俊哉
- 学会等名
  第15回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  あわぎんホール（徳島県徳島市）
- 年月日
  2015-06-26
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26650026
[学会発表] Anaerobic crystallization for protein crystallography.2014
- 著者名/発表者名
  千田美紀
- 学会等名
  23rd Congress of the IUCr
- 発表場所
  Palais des Congres de Montreal (カナダ、モントリオール）
- 年月日
  2014-08-11
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26650026
[学会発表] 嫌気条件下でのタンパク質結晶化2014
- 著者名/発表者名
  千田美紀
- 学会等名
  第14回日本蛋白質科学会
- 発表場所
  ワークピア横浜（神奈川県横浜市）
- 年月日
  2014-06-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26650026
[学会発表] フェレドキシン還元酵素BphA4の酸化還元状態依存的な構造変化と親和性調節の解明2014
- 著者名/発表者名
  千田美紀
- 学会等名
  日本結晶学会平成26年度年会
- 発表場所
  東京大学農学部（東京都文京区）
- 年月日
  2014-11-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26650026

1. 松田知子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
2. 安達成彦

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件

千田 美紀 Senda Miki

研究課題

研究成果

共同研究者

カルモジュリン依存型キナーゼの活性化機構の構造学的解明と心不全治療薬への応用研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

全長の転写調節因子LTTR-DNA複合体の結晶構造解析と転写活性化機構の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

嫌気条件下で結晶化の成功率を高める手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Crystal structure of the full-length LysR-type transcription regulator2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] 長波長X線を利用したタンパク質結晶構造解析2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

ISSN

年月日

言語

データソース

[雑誌論文] Structural basis for highly (S)-enantioselective reductase towards aliphatic ketones with only one carbon difference between side chain2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Reversible control of enantioselectivity by the length of ketone substituent in biocatalytic reduction2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] LysRタイプ転写調節因子CbnRのDNA結合ドメインとDNAとの複合体構造2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

ISSN

年月日

言語

データソース

[雑誌論文] Structural and computational bases for dramatic skeletal rearrangement in anditomin biosynthesis2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Crystal structure of the DNA-binding domain of the LysR-type transcriptional regulator CbnR in complex with a DNA fragment of the recognition-binding site in the promoter region.2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] The Lipid Kinase PI5P4Kβ Is an Intracellular GTP Sensor for Metabolism and Tumorigenesis.2016

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Improvement of Helicobacter pylori CagA crystals by the multi-step soaking method2016

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Crystallization and preliminary crystallographic analysis of acetophenone reductase from Geotrichum candidum NBRC 45972015

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

千田美紀 Senda Miki