岡田崇 Okada Takashi

研究者番号	10741043
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 京都大学, 医生物学研究所, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2025年度: 京都大学, 医生物学研究所, 准教授 2022年度 – 2023年度: 京都大学, 医生物学研究所, 准教授 2022年度: 京都大学, 医生物学研究所, 特定准教授 2019年度 – 2021年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 数理創造プログラム, 上級研究員
審査区分/研究分野	研究代表者小区分45020:進化生物学関連研究代表者以外小区分13010:数理物理および物性基礎関連
キーワード	研究代表者季節性インフルエンザ / 子孫数分布 / コロナウイルス / 進化 / 領域拡大 / クローン干渉 / ウイルス進化 / 集団遺伝学研究代表者以外情報流 / 複雑ネットワーク … もっと見る / 全脳イメージング / 摂動論 / 神経回路 / 環境適応 / 数理生物学 / ブーリアンネットワーク隠す

過分散を伴う遺伝的浮動の進化理論と集団遺伝学的統計手法の革新研究代表者
- 研究代表者
  
  岡田崇
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2027
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分45020:進化生物学関連
- 研究機関
  京都大学
情報流のパス展開理論と神経ネットワーク活動計測に基づく生物の行動決定機構の解明
- 研究代表者
  
  森史
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分13010:数理物理および物性基礎関連
- 研究機関
  九州大学
適応度進行波モデルと集団遺伝学に基づくクローン干渉を伴う適応進化の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  岡田崇
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分45020:進化生物学関連
- 研究機関
  京都大学
複雑ネットワーク上の情報の流れの理論構築と生物の環境適応機構の解明
- 研究代表者
  
  森史
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2022
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分13010:数理物理および物性基礎関連
- 研究機関
  九州大学
   電気通信大学

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2019

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Stable States of a Microbial Community Are Formed by Dynamic Metabolic Networks with Members Functioning to Achieve Both Robustness and Plasticity2024
- 著者名/発表者名
  Masahiro Honjo, Kenshi Suzuki, Junya Katai, Yosuke Tashiro, Tomo Aoyagi, Tomoyuki Hori, Takashi Okada, Yasuhisa Saito, Hiroyuki Futamata
- 雑誌名
  
  Ｍｉｃｒｏｂｅｓ　ａｎｄ　ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ
  
  巻: 39 号: 1 ページ: n/a
- DOI
  10.1264/jsme2.ME23091
- ISSN
  1342-6311, 1347-4405
- 言語
  英語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K03750, KAKENHI-PROJECT-22K06347, KAKENHI-PROJECT-22K14906, KAKENHI-PLANNED-19H05686, KAKENHI-PROJECT-21H03633
[雑誌論文] Lineage frequency time series reveal elevated levels of genetic drift in SARS-CoV-2 transmission in England2024
- 著者名/発表者名
  Yu QinQin、Ascensao Joao A.、Okada Takashi、Boyd Olivia、Volz Erik、Hallatschek Oskar、The COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium
- 雑誌名
  
  PLOS Pathogens
  
  巻: 20 号: 4 ページ: e1012090-e1012090
- DOI
  10.1371/journal.ppat.1012090
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K06347
[雑誌論文] Patterns of change in regulatory modules of chemical reaction systems induced by network modification2023
- 著者名/発表者名
  Hishida Atsuki、Okada Takashi、Mochizuki Atsushi
- 雑誌名
  
  PNAS Nexus
  
  巻: 3 号: 1
- DOI
  10.1093/pnasnexus/pgad441
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23KJ1324, KAKENHI-PROJECT-22K03453, KAKENHI-PROJECT-22K06347, KAKENHI-PLANNED-19H05678
[雑誌論文] Information-transfer characteristics in network motifs2023
- 著者名/発表者名
  Mori Fumito、Okada Takashi
- 雑誌名
  
  Physical Review Research
  
  巻: 5 号: 1 ページ: 013037-013037
- DOI
  10.1103/physrevresearch.5.013037
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K03453, KAKENHI-PROJECT-19K03663
[雑誌論文] Origin of diverse phosphorylation patterns in the ERBB system2022
- 著者名/発表者名
  Okada Takashi、Miyagi Hiraku、Sako Yasushi、Hiroshima Michio、Mochizuki Atsushi
- 雑誌名
  
  Biophysical Journal
  
  巻: 121 号: 3 ページ: 470-480
- DOI
  10.1016/j.bpj.2021.12.031
- NAID
  120007187502
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H05647, KAKENHI-PROJECT-19K03663, KAKENHI-PROJECT-22K18363, KAKENHI-PLANNED-18H05414, KAKENHI-PROJECT-23K23856
[雑誌論文] Structural reduction of chemical reaction networks based on topology2021
- 著者名/発表者名
  Hirono Yuji、Okada Takashi、Miyazaki Hiroyasu、Hidaka Yoshimasa
- 雑誌名
  
  Physical Review Research
  
  巻: 3 号: 4 ページ: 043123-043123
- DOI
  10.1103/physrevresearch.3.043123
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K03663, KAKENHI-PROJECT-19K23413
[雑誌論文] Flux-augmented bifurcation analysis in chemical reaction network systems2021
- 著者名/発表者名
  Okada Takashi、Mochizuki Atsushi、Furuta Mikio、Tsai Je-Chiang
- 雑誌名
  
  Physical Review E
  
  巻: 103 号: 6 ページ: 062212-062212
- DOI
  10.1103/physreve.103.062212
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K03663, KAKENHI-PROJECT-19H03196, KAKENHI-PLANNED-19H05678
[雑誌論文] Dynamic sampling bias and overdispersion induced by skewed offspring distributions2021
- 著者名/発表者名
  Okada Takashi、Hallatschek Oskar
- 雑誌名
  
  Genetics
  
  巻: 219 号: 4
- DOI
  10.1093/genetics/iyab135
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K03663
[雑誌論文] Diagrammatic expansion of information flows in stochastic Boolean networks2020
- 著者名/発表者名
  Mori Fumito、Okada Takashi
- 雑誌名
  
  Physical Review Research
  
  巻: 2 号: 4
- DOI
  10.1103/physrevresearch.2.043432
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K03663
[学会発表] Lineage frequency fluctuations reveal the spatial dynamics of disease transmission in SARS-CoV-22023
- 著者名/発表者名
  Takashi Okada
- 学会等名
  APS March Meeting 2023
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K03663
[学会発表] Lineage frequency fluctuations reveal the spatial dynamics of disease transmission in SARS-CoV-22023
- 著者名/発表者名
  Takashi Okada
- 学会等名
  APS March Meeting 2023
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K06347
[学会発表] Lineage frequency fluctuations reveal the spatial dynamics of disease transmission in SARS-CoV-22023
- 著者名/発表者名
  Takashi Okada
- 学会等名
  APS March Meeting 2023
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K03453
[学会発表] Network topology determines robustness and flexibility of chemical reaction systems2023
- 著者名/発表者名
  Takashi Okada
- 学会等名
  ICIAM 2023
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K03453
[学会発表] Network topology determines robustness and flexibility of chemical reaction sys- tems2023
- 著者名/発表者名
  Takashi OKada
- 学会等名
  ICIAM
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K06347
[学会発表] Determining regulations of biochemical reaction systems from network topology2023
- 著者名/発表者名
  Takashi Okada
- 学会等名
  The 29th East Asia Joint Symposium
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K03453
[学会発表] Determining regulations of biochemical reaction systems from network topology2023
- 著者名/発表者名
  Takashi Okada
- 学会等名
  The 29th East Asia Joint Symposium
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K06347
[学会発表] ネットワークモチーフの情報転送の特性2023
- 著者名/発表者名
  森史、岡田崇
- 学会等名
  第129回日本物理学会九州支部例会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K03453
[学会発表] ネットワークモチーフ上の情報の流れ2023
- 著者名/発表者名
  森史、岡田崇
- 学会等名
  日本物理学会第78回年次大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K03453
[学会発表] ブーリアンネットワークにおける移動エントロピーのダイアグラム展開2021
- 著者名/発表者名
  森史, 岡田崇
- 学会等名
  日本物理学会第76回年次大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K03663
[学会発表] Time-Dependent Effective Sampling Bias in Populations with Broad Offspring Numbers2020
- 著者名/発表者名
  Takashi Okada
- 学会等名
  APS March Meeting 2020
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K03663
[学会発表] ブーリアンネットワーク上の情報流をダイアグラムで展開する理論2020
- 著者名/発表者名
  森史, 岡田崇
- 学会等名
  第126回日本物理学会九州支部例会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K03663
[学会発表] 変動する環境における子孫数分布と進化ダイナミクス2020
- 著者名/発表者名
  岡田崇
- 学会等名
  2020年度日本数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K03663
[学会発表] Emergent bias in population models with broad offspring number distributions2019
- 著者名/発表者名
  Takashi Okada, Oskar Hallatschek
- 学会等名
  7th China-India-Japan-Korea International Conference on Mathematical Biology
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K03663
[学会発表] 子孫数に偏りをもつ集団に自発的に生じる見かけの自然淘汰2019
- 著者名/発表者名
  岡田崇, Oskar Hallatschek
- 学会等名
  日本数理生物学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K03663

1. 森史 (90525891)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 6件
2. 杉拓磨 (70571305)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 佐甲靖志

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

岡田 崇 Okada Takashi

研究課題

研究成果

共同研究者

過分散を伴う遺伝的浮動の進化理論と集団遺伝学的統計手法の革新研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

情報流のパス展開理論と神経ネットワーク活動計測に基づく生物の行動決定機構の解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

適応度進行波モデルと集団遺伝学に基づくクローン干渉を伴う適応進化の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

複雑ネットワーク上の情報の流れの理論構築と生物の環境適応機構の解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] Stable States of a Microbial Community Are Formed by Dynamic Metabolic Networks with Members Functioning to Achieve Both Robustness and Plasticity2024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

ISSN

言語

データソース

[雑誌論文] Lineage frequency time series reveal elevated levels of genetic drift in SARS-CoV-2 transmission in England2024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Patterns of change in regulatory modules of chemical reaction systems induced by network modification2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Information-transfer characteristics in network motifs2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Origin of diverse phosphorylation patterns in the ERBB system2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

データソース

[雑誌論文] Structural reduction of chemical reaction networks based on topology2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Flux-augmented bifurcation analysis in chemical reaction network systems2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Dynamic sampling bias and overdispersion induced by skewed offspring distributions2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Diagrammatic expansion of information flows in stochastic Boolean networks2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] Lineage frequency fluctuations reveal the spatial dynamics of disease transmission in SARS-CoV-22023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

岡田崇 Okada Takashi