尾崎遼 OZAKI HARUKA

研究者番号	10743346
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 筑波大学, 医学医療系, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2019年度 – 2024年度: 筑波大学, 医学医療系, 准教授
審査区分/研究分野	研究代表者小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / 学術変革領域研究区分(Ⅲ) 研究代表者以外小区分58020:衛生学および公衆衛生学分野関連:実験系を含む / 小区分57040:口腔再生医学および歯科医用工学関連 / 中区分55:恒常性維持器官の外科学およびその関連分野 / 学術変革領域研究区分(Ⅲ) / 生物系 / 小区分54020:膠原病およびアレルギー内科学関連
キーワード	研究代表者機械学習 / シングルセル解析 / バイオインフォマティクス / 深層生成モデル / プロモーター配列 / シングルセルRNA-seq / ゲノム配列 / 表現型予測 / 深層学習 / 遺伝子発現 … もっと見る研究代表者以外 … もっと見るアレルギー / 発症予測 / 全ゲノム関連解析 / 間葉系幹細胞 / 骨髄間質細胞 / シングルセル解析 / 細胞系譜追跡 / 骨再生 / 骨格幹細胞 / 血管平滑筋細胞 / 平滑筋細胞 / 大動脈解離 / 大動脈瘤 / ECM / 細胞外マトリクス / ナノパーティクル / 内皮細胞 / 血管平滑筋 / 胸部大動脈 / 細胞外マトリックス / 細胞分化 / 単一細胞トランスクリプトーム解析 / 適応回路 / バイオインフォマティクス / 光遺伝学 / シングルセルトランスクリプトーム / 神経回路 / ホヤ / マルチオミクス / システム生物学 / 代謝アダプテーション / ２型糖尿病 / 2型糖尿病 / トランスオミクス / RNA-seq / アレルゲン免疫療法 / single-cell RNA-seq / bulk RNA-seq / TCRシークエンス / RNA-Seq / アレルギー疾患 / シングルセルRNA-Seq / 遺伝子発現 / 免疫療法 / 花粉症 / シングルセル隠す

グリアブラストによる機能未知グリア細胞の機能予測研究代表者
- 研究代表者
  
  尾崎遼
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2024
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅲ)
- 研究機関
  筑波大学
細胞外マトリクスを基軸とした胸部大動脈疾患の発生機序の解明と新規治療法の開発
- 研究代表者
  
  柳沢裕美
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 審査区分
  
  中区分55:恒常性維持器官の外科学およびその関連分野
- 研究機関
  筑波大学
ゲノムデータに基づくアレルギー疾患発症予測法の開発
- 研究代表者
  
  野口恵美子
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分58020:衛生学および公衆衛生学分野関連:実験系を含む
- 研究機関
  筑波大学
敵対的生成ネットワークによる自在な発現特異性を有するプロモータ塩基配列の設計研究代表者
- 研究代表者
  
  尾崎遼
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  筑波大学
適応回路の基本設計の構築メカニズム
- 研究代表者
  
  堀江健生
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2025
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅲ)
- 研究機関
  大阪大学
   筑波大学
多階層シングルセル解析を応用した骨再生機構の解明と新規再生療法の基盤構築
- 研究代表者
  
  松下祐樹
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分57040:口腔再生医学および歯科医用工学関連
- 研究機関
  長崎大学
大人数の遺伝子発現データ無しで表現型と遺伝子発現の個人差の関連を調べる手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  尾崎遼
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2022
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  筑波大学
アレルゲン免疫療法のシングルセルおよびbulk遺伝子発現情報による病態解明
- 研究代表者
  
  野口恵美子
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2021
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分54020:膠原病およびアレルギー内科学関連
- 研究機関
  筑波大学
2型糖尿病の代謝アダプテーション
- 研究代表者
  
  黒田真也
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2021
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  東京大学

すべて 2024 2023 2022 2021 2020

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Neuronal subtype-specific transcriptomic changes in the cerebral neocortex associated with sleep pressure2024
- 著者名/発表者名
  Nakata Shinya、Iwasaki Kanako、Funato Hiromasa、Yanagisawa Masashi、Ozaki Haruka
- 雑誌名
  
  Neuroscience Research
  
  巻: －ページ: 13-25
- DOI
  10.1016/j.neures.2024.03.004
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K17992, KAKENHI-PROJECT-22H04918, KAKENHI-PUBLICLY-23H04149
[雑誌論文] Transcription factor-binding k-mer analysis clarifies the cell type dependency of binding specificities and cis-regulatory SNPs in humans2023
- 著者名/発表者名
  Tahara Saeko、Tsuchiya Takaho、Matsumoto Hirotaka、Ozaki Haruka
- 雑誌名
  
  BMC Genomics
  
  巻: 24 号: 1
- DOI
  10.1186/s12864-023-09692-9
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K17992, KAKENHI-PROJECT-20K19915
[雑誌論文] DNA hypomethylation characterizes genes encoding tissue-dominant functional proteins in liver and skeletal muscle2023
- 著者名/発表者名
  Maehara H.、Kokaji T.、Hatano A.、Suzuki Y.、Matsumoto M.、Nakayama K. I.、Egami R.、Tsuchiya T.、Ozaki H.、Morita K.、Shirai M.、Li D.、Terakawa A.、Uematsu S.、Hironaka K.、Ohno S.、Kubota H.、Araki H.、Miura F.、Ito T.、Kuroda S.
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 13 号: 1 ページ: 19118-19118
- DOI
  10.1038/s41598-023-46393-5
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K17992, KAKENHI-PROJECT-20K19915, KAKENHI-PROJECT-21K16349, KAKENHI-PROJECT-21H04759, KAKENHI-PROJECT-23K23870
[雑誌論文] CCPLS reveals cell-type-specific spatial dependence of transcriptomes in single cells2022
- 著者名/発表者名
  Tsuchiya Takaho、Hori Hiroki、Ozaki Haruka
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 38 号: 21 ページ: 4868-4877
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btac599
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K19915, KAKENHI-PROJECT-19K20394
[雑誌論文] In vivo transomic analyses of glucose-responsive metabolism in skeletal muscle reveal core differences between the healthy and obese states.2022
- 著者名/発表者名
  Kokaji T, Eto M, Hatano A, Yugi K, Morita K, Ohno S, Fujii M, Hironaka KI, Ito Y, Egami R, Uematsu S, Terakawa A, Pan Y, Maehara H, Li D, Bai Y, Tsuchiya T, Ozaki H, Inoue H, Kubota H, Suzuki Y, Hirayama A, Soga T, Kuroda S.
- 雑誌名
  
  Sci Rep
  
  巻: 12 号: 1 ページ: 13719-13719
- DOI
  10.1038/s41598-022-17964-9
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K19545, KAKENHI-PROJECT-20K19915, KAKENHI-PROJECT-21K14467, KAKENHI-PROJECT-21K16349, KAKENHI-PROJECT-20H03237, KAKENHI-PROJECT-20H04102, KAKENHI-PROJECT-19K20382, KAKENHI-PROJECT-19K20394, KAKENHI-PROJECT-18H03979, KAKENHI-PLANNED-18H05431, KAKENHI-ORGANIZER-17H06299, KAKENHI-PLANNED-17H06300
[雑誌論文] Integrated analysis of glycan and RNA in single cells2021
- 著者名/発表者名
  Minoshima Fumi、Ozaki Haruka、Odaka Haruki、Tateno Hiroaki
- 雑誌名
  
  iScience
  
  巻: 24 号: 8 ページ: 102882-102882
- DOI
  10.1016/j.isci.2021.102882
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16263, KAKENHI-PROJECT-19K20394
[雑誌論文] Trans-omic analysis reveals obesity-associated dysregulation of inter-organ metabolic cycles between the liver and skeletal muscle2021
- 著者名/発表者名
  Egami Riku、Kokaji Toshiya、Hatano Atsushi、et al.
- 雑誌名
  
  iScience
  
  巻: 24 号: 3 ページ: 102217-102217
- DOI
  10.1016/j.isci.2021.102217
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21386, KAKENHI-PROJECT-19K20382, KAKENHI-PROJECT-19K20394, KAKENHI-PROJECT-20K19915, KAKENHI-PLANNED-17H06300, KAKENHI-PROJECT-18H05215, KAKENHI-PUBLICLY-20H04943, KAKENHI-PROJECT-20H04102, KAKENHI-PROJECT-19J10234, KAKENHI-PROJECT-19J22134, KAKENHI-PROJECT-19K24361, KAKENHI-ORGANIZER-17H06299, KAKENHI-PROJECT-18H03979, KAKENHI-PLANNED-16H06577, KAKENHI-PLANNED-20H05930, KAKENHI-PROJECT-18KT0020, KAKENHI-PLANNED-18H05431, KAKENHI-PROJECT-20H03237
[雑誌論文] Cell-to-cell interaction analysis of prognostic ligand-receptor pairs in human pancreatic ductal adenocarcinoma2021
- 著者名/発表者名
  Suzuki Sayaka R.、Kuno Akihiro、Ozaki Haruka
- 雑誌名
  
  Biochemistry and Biophysics Reports
  
  巻: 28 ページ: 101126-101126
- DOI
  10.1016/j.bbrep.2021.101126
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K20394
[雑誌論文] Transomics analysis reveals allosteric and gene regulation axes for altered hepatic glucose-responsive metabolism in obesity2020
- 著者名/発表者名
  Kokaji Toshiya、Hatano Atsushi、Ito Yuki、et al.
- 雑誌名
  
  Science Signaling
  
  巻: 13 号: 660 ページ: 1236-1236
- DOI
  10.1126/scisignal.aaz1236
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21386, KAKENHI-PROJECT-19K20382, KAKENHI-PROJECT-19K20394, KAKENHI-PROJECT-20K19915, KAKENHI-PLANNED-17H06300, KAKENHI-PROJECT-18H05215, KAKENHI-PUBLICLY-19H04969, KAKENHI-PUBLICLY-19H05243, KAKENHI-PUBLICLY-20H04847, KAKENHI-PUBLICLY-20H04943, KAKENHI-PROJECT-18H02431, KAKENHI-PROJECT-20H04102, KAKENHI-PROJECT-19K24361, KAKENHI-ORGANIZER-17H06299, KAKENHI-PROJECT-18H03979, KAKENHI-PLANNED-16H06577, KAKENHI-PLANNED-18H05431, KAKENHI-PLANNED-20H05930, KAKENHI-PROJECT-18KT0020, KAKENHI-PROJECT-20H03237
[雑誌論文] Stability of RNA sequences derived from the coronavirus genome in human cells2020
- 著者名/発表者名
  Wakida Hiroyasu、Kawata Kentaro、Yamaji Yuta、Hattori Emi、Tsuchiya Takaho、Wada Youichiro、Ozaki Haruka、Akimitsu Nobuyoshi
- 雑誌名
  
  Biochemical and Biophysical Research Communications
  
  巻: 527 号: 4 ページ: 993-999
- DOI
  10.1016/j.bbrc.2020.05.008
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16635, KAKENHI-PROJECT-19K20394, KAKENHI-PROJECT-20K19915, KAKENHI-PROJECT-19K22679, KAKENHI-PROJECT-19K24361
[学会発表] Prediction of the function of functionally unknown glial cells using GLIA-BLAST2023
- 著者名/発表者名
  Haruka Ozaki
- 学会等名
  グリアデコード第6回領域会議
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-23H04149
[学会発表] Glioneuronal mechanisms underlying the regulation of sleep in nucleus accumbens2023
- 著者名/発表者名
  Haruto Ijiri, Koustav Roy, Haruka Ozaki, Masashi Yanagisawa, Michael Lazarus
- 学会等名
  グリアデコード第6回領域会議
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-23H04149
[学会発表] RNA tomographyによる空間遺伝子発現分布推定結果の評価方法の検討2023
- 著者名/発表者名
  松澤亮輔, 尾崎遼
- 学会等名
  第147回MPS・第77回BIO合同研究発表会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K17992
[学会発表] MOCCS-DB: ヒト転写因子認識配列の多様性データベース2022
- 著者名/発表者名
  田原沙絵子, 土屋貴穂, 松澤亮輔, 尾崎遼
- 学会等名
  トーゴーの日シンポジウム2022
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K20394
[学会発表] MOCCS profile analysis clarifies the cell type dependency of transcription factor-binding sequences and cis-regulatory SNPs in humans2022
- 著者名/発表者名
  Saeko Tahara, Takaho Tsuchiya, Hirotaka Matsumoto, Haruka Ozaki
- 学会等名
  2022年日本バイオインフォマティクス学会年会・第11回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2022）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K20394
[学会発表] 敵対的生成ネットワークによる自在な発現特異性を有するプロモータ配列の設計2022
- 著者名/発表者名
  Yukai Takagi, Haruka Ozaki, Akihiro Kuno, Kotaro Sakamoto
- 学会等名
  2022年日本バイオインフォマティクス学会年会・第11回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2022）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K17992
[学会発表] Predicting SNPs' effects on transcriptional factor binding and cell-type specificity using a crowd of ChIP-seq data2022
- 著者名/発表者名
  田原沙絵子, 土屋貴穂, 松本拡高, 尾崎遼
- 学会等名
  日本人類遺伝学会第67回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K20394
[学会発表] NGSデータ解析における生命現象のモデル化と自動化2021
- 著者名/発表者名
  尾崎遼
- 学会等名
  バイオDXの最前線　- JST戦略的創造研究推進事業 CREST「データ駆動・AI駆動を中心としたデジタルトランスフォーメーションによる生命科学研究の革新[バイオDX]」キックオフシンポジウム
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K20394

1. 野口恵美子 (40344882)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
2. 黒田真也 (50273850)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 渋谷彰 (80216027)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 稲葉有香 (20571970)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 土屋貴穂 (70853167)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
6. 小林大樹 (20448517)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 幡野敦 (30755533)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 堀江健生 (10455925)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 佐藤ゆたか (40314174)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 柳沢裕美 (40746301)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
11. 荏原充宏 (10452393)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
12. 平松祐司 (30302417)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
13. 徳永千穂 (30451701)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
14. 臼杵豊展 (50514535)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 木村健一 (50633153)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
16. 松下祐樹 (00713827)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
17. 住田吉慶 (50456654)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
18. 松下雅樹 (60721115)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
19. 小高陽樹

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
20. 川田健太郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
21. 井上啓

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

尾崎 遼 OZAKI HARUKA

研究課題

研究成果

共同研究者

グリアブラストによる機能未知グリア細胞の機能予測研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

細胞外マトリクスを基軸とした胸部大動脈疾患の発生機序の解明と新規治療法の開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

ゲノムデータに基づくアレルギー疾患発症予測法の開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

敵対的生成ネットワークによる自在な発現特異性を有するプロモータ塩基配列の設計研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

適応回路の基本設計の構築メカニズム

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

多階層シングルセル解析を応用した骨再生機構の解明と新規再生療法の基盤構築

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

大人数の遺伝子発現データ無しで表現型と遺伝子発現の個人差の関連を調べる手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

アレルゲン免疫療法のシングルセルおよびbulk遺伝子発現情報による病態解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

2型糖尿病の代謝アダプテーション

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] Neuronal subtype-specific transcriptomic changes in the cerebral neocortex associated with sleep pressure2024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Transcription factor-binding k-mer analysis clarifies the cell type dependency of binding specificities and cis-regulatory SNPs in humans2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] DNA hypomethylation characterizes genes encoding tissue-dominant functional proteins in liver and skeletal muscle2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] CCPLS reveals cell-type-specific spatial dependence of transcriptomes in single cells2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] In vivo transomic analyses of glucose-responsive metabolism in skeletal muscle reveal core differences between the healthy and obese states.2022

著者名/発表者名

尾崎遼 OZAKI HARUKA