• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

河村 大輔  Komura Daisuke

研究者番号 10776082
その他のID
  • ORCIDhttps://orcid.org/0000-0002-0038-728X
所属 (現在) 2025年度: 東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 講師
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2021年度 – 2024年度: 東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 助教
2018年度 – 2019年度: 東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 助教
2016年度 – 2018年度: 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 助教
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分90130:医用システム関連 / ゲノム医科学 / 腫瘍診断学
研究代表者以外
小区分42040:実験動物学関連 / 実験動物学
キーワード
研究代表者
癌 / がん / ゲノム / デジタル病理画像 / 深層学習 / 病理組織画像 / がん間質相互作用 / シングルセルトランスクリプトーム / がん-間質細胞間相互作用 / 治療標的 / 病理学 / 機械学習 / 遺伝子変異 … もっと見る
研究代表者以外
… もっと見る 上皮間葉転換 / インタラクトーム / インタラクト―ム / PDX / 膵癌 / ZNF185 隠す
  • 研究課題

    (5件)
  • 研究成果

    (35件)
  • 共同研究者

    (9人)
  •  深層テクスチャを用いたがん病理組織像の大規模解析基盤の構築と検証研究代表者

    • 研究代表者
      河村 大輔
    • 研究期間 (年度)
      2021 – 2024
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分90130:医用システム関連
    • 研究機関
      東京大学
  •  胸腔系浸潤肺癌PDXのCASTIN解析によるがん幹細胞いかり分子機構の解明

    • 研究代表者
      千々和 剛
    • 研究期間 (年度)
      2018 – 2020
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分42040:実験動物学関連
    • 研究機関
      自治医科大学
  •  1細胞がんー間質相互作用解析による抗癌剤耐性克服ターゲットの探索研究代表者

    • 研究代表者
      河村 大輔
    • 研究期間 (年度)
      2017 – 2019
    • 研究種目
      若手研究(A)
    • 研究分野
      ゲノム医科学
    • 研究機関
      東京大学
      東京医科歯科大学
  •  Deep Learningを用いたデジタル病理画像からの遺伝子変異推定研究代表者

    • 研究代表者
      河村 大輔
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2017
    • 研究種目
      研究活動スタート支援
    • 研究分野
      腫瘍診断学
    • 研究機関
      東京医科歯科大学
  •  LIM蛋白ZNF185-上皮間葉転換機構のヒト膵癌肝転移マウスモデルを用いた解析

    • 研究代表者
      古川 大輔
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2018
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      実験動物学
    • 研究機関
      東海大学

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2019 2018 2017 2016

すべて 雑誌論文 学会発表 図書

  • [図書] 遺伝統計学と疾患ゲノムデータ解析 : 病態解明から個別化医療, ゲノム創薬まで2018

    • 著者名/発表者名
      岡田 随象(編集)、河村大輔ら
    • 総ページ数
      264
    • 出版者
      メディカルドゥ
    • ISBN
      9784944157631
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04992
  • [図書] 遺伝統計学と疾患ゲノムデータ解析2018

    • 著者名/発表者名
      岡田随象(編集)、河村大輔、石川俊平ら
    • 総ページ数
      272
    • 出版者
      メディカルドゥ
    • ISBN
      4944157630
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04992
  • [雑誌論文] SegRep: Mask-Based Self-Supervised Learning for Segment Representation in Pathology Images2024

    • 著者名/発表者名
      Yang Chichun、Komura Daisuke、Kakiuchi Miwako、Ochi Mieko、Katoh Hiroto、Ushiku Tetsuo、Ishikawa Shumpei
    • 雑誌名

      TechRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.36227/techrxiv.170775482.23404242/v1

    • オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23KJ0439, KAKENHI-PROJECT-23K21859
  • [雑誌論文] Restaining-based annotation for cancer histology segmentation to overcome annotation-related limitations among pathologists.2023

    • 著者名/発表者名
      Komura D, Onoyama T, Shinbo K, Odaka H, Hayakawa M, Ochi M, Herdiantoputri RR, Endo H, Katoh H, Ikeda T, Ushiku T, Ishikawa S.
    • 雑誌名

      Patterns

      巻: 4(2) 号: 2 ページ: 100688-100688

    • DOI

      10.1016/j.patter.2023.100688

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04990, KAKENHI-PROJECT-23K21859
  • [雑誌論文] Deep texture representation analysis for histopathological images2023

    • 著者名/発表者名
      Herdiantoputri Ranny Rahaningrum、Komura Daisuke、Fujisaka Kei、Ikeda Tohru、Ishikawa Shumpei
    • 雑誌名

      STAR Protocols

      巻: 4 号: 2 ページ: 102161-102161

    • DOI

      10.1016/j.xpro.2023.102161

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K21859
  • [雑誌論文] Head and Neck Tumor Histopathological Image Representation with Pr with Pre- Trained Conv ained Convolutional Neur olutional Neural Network and Vision al Network and Vision Transformer2023

    • 著者名/発表者名
      Rahaningrum Herdiantoputri Ranny、Komura Daisuke、Ikeda Tohru、Ishikawa Shumpei
    • 雑誌名

      Journal of Dentistry Indonesia

      巻: 30 号: 1 ページ: 41-47

    • DOI

      10.14693/jdi.v30i1.1501

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K21859
  • [雑誌論文] Universal encoding of pan-cancer histology by deep texture representations2022

    • 著者名/発表者名
      Komura Daisuke、Kawabe Akihiro、Fukuta Keisuke、et al.
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 38 号: 9 ページ: 110424-110424

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.110424

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K21859
  • [雑誌論文] Advanced deep learning applications in diagnostic pathology2021

    • 著者名/発表者名
      KOMURA Daisuke、ISHIKAWA Shumpei
    • 雑誌名

      Translational and Regulatory Sciences

      巻: 3 号: 2 ページ: 36-42

    • DOI

      10.33611/trs.2021-005

    • NAID

      130008066894

    • ISSN
      2434-4974
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K21859
  • [雑誌論文] Novel targets identified by integrated cancer-stromal interactome analysis of pancreatic adenocarcinoma.2020

    • 著者名/発表者名
      Hiroshima Y, Kasajima R, Kimura Y, Komura D, Ishikawa S, Ichikawa Y, Bouvet M, Yamamoto N, Oshima T, Morinaga S, Singh SR, Hoffman RM, Endo I, Miyagi Y.
    • 雑誌名

      Cancer Lett.

      巻: 469 ページ: 217-227

    • DOI

      10.1016/j.canlet.2019.10.031

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02481, KAKENHI-PROJECT-17H04992, KAKENHI-PROJECT-19K09181, KAKENHI-PROJECT-19H03774
  • [雑誌論文] High expression of olfactomedin-4 is correlated with chemoresistance and poor prognosis in pancreatic cancer.2020

    • 著者名/発表者名
      Ohkuma R, Yada E, Ishikawa S, Komura D, Ishizaki H, Tamada K, Kubota Y, Hamada K, Ishida H, Hirasawa Y, Ariizumi H, Satoh E, Shida M, Watanabe M, Onoue R, Ando K, Tsurutani J, Yoshimura K, Yokobori T, Sasada T, Aoki T, Murakami M, Norose T, Ohike N, Takimoto M, Izumizaki M, Kobayashi S, Tsunoda T, Wada S.
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 10 号: 1 ページ: e0226707-e0226707

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0226707

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K08610, KAKENHI-PROJECT-19K07320, KAKENHI-PROJECT-19K12848, KAKENHI-PROJECT-17H04278, KAKENHI-PROJECT-17H04992, KAKENHI-PROJECT-18K19490, KAKENHI-PROJECT-20K17001
  • [学会発表] Subtype-level Segmentation Model for Inflammatory Cells in H&E images2024

    • 著者名/発表者名
      Mieko Ochi, Daisuke Komura, Shumpei Ishikawa
    • 学会等名
      USCAP 113th Annual Meeting
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K21859
  • [学会発表] H&E染色組織画像における腫瘍微小環境解析のためのセグメンテーションモデル2024

    • 著者名/発表者名
      越智三枝子、河村大輔、石川俊平
    • 学会等名
      第113回日本病理学会総会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K21859
  • [学会発表] Large-scale histological image dataset with various H&E stain conditions and devices including smartphone for the robust model development2023

    • 著者名/発表者名
      Mieko Ochi, Daisuke Komura, Shumpei Ishikawa
    • 学会等名
      19th European Congress on Digital Pathology
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K21859
  • [学会発表] 同一標本に対するH&E染色と免疫染色を利用した細胞セグメンテーションのための癌病理組織像データセットの開発2022

    • 著者名/発表者名
      河村大輔; 斧山匠; 新保幸輝; 小高滉人; 遠藤春哉; 越智三枝子; 加藤洋人; 牛久哲男; 石川俊平
    • 学会等名
      第68回日本病理学会 秋季特別総会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K21859
  • [学会発表] ディープラーニングを用いた細胞セグメンテーションのための癌病理組織画像データセット2022

    • 著者名/発表者名
      河村大輔; 斧山巧; 新保幸輝; 小高滉人; 遠藤春哉; 越智三枝子; 加藤洋人; 牛久哲男; 石川俊平
    • 学会等名
      The 81st Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K21859
  • [学会発表] 深層ニューラルネットワークによるがん病理組織形態の数値化2022

    • 著者名/発表者名
      河村大輔
    • 学会等名
      第47回レーザ顕微鏡研究会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K21859
  • [学会発表] Large-scale histological image dataset with various stain conditions and scanners for the robust machine learning model development2022

    • 著者名/発表者名
      Ochi, Mieko; Komura, Daisuke; Ishikawa, Shumpei
    • 学会等名
      The First Workshop on Applications of Medical AI in MICCAI
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K21859
  • [学会発表] 深層学習を用いた腫瘍組織の網羅的細胞セグメンテーション2022

    • 著者名/発表者名
      河村大輔; 斧山巧; 新保幸輝; 小高滉人; 遠藤春哉; 越智美恵子; 加藤洋人; 牛久哲男; 石川俊平
    • 学会等名
      第111回日本病理学会総会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K21859
  • [学会発表] 頭頸部腫瘍の病理画像解析とAI病理診断補助システムの構築2021

    • 著者名/発表者名
      河村大輔、石川俊平
    • 学会等名
      第110回日本病理学会総会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K21859
  • [学会発表] The genomic profile of metastatic diffuse-type gastric cancer in Cdh1loxP/loxP; Trp53loxP/loxP double conditional knockout mice2020

    • 著者名/発表者名
      Menghua Zhang, Itsuki Sugita, Daisuke Komura, Shunpei Ishikawa
    • 学会等名
      第90回 日本衛生学会学術総会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04992
  • [学会発表] Single-cell transcriptomics of a model mouse for diffuse-type gastric cancer reveal ligand-receptor interactions potentially important for the cancer development2020

    • 著者名/発表者名
      古久保宙希、河村大輔、加藤洋人、石川俊平
    • 学会等名
      第20回 東京大学生命科学シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04992
  • [学会発表] The genomic profile of metastatic diffuse-type gastric cancer in Cdh1loxP/loxP; Trp53loxP/loxP double conditional knockout mice2019

    • 著者名/発表者名
      Menghua Zhang, Itsuki Sugita, Daisuke Komura, Shunpei Ishikawa
    • 学会等名
      第42回 日本分子生物学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04992
  • [学会発表] 膵癌における包括的癌-間質インタラクトーム解析2019

    • 著者名/発表者名
      廣島, 幸彦; 笠島, 理加; 木村, 弥生; 河村, 大輔; 石川, 俊平; 市川, 靖史; 遠藤, 格; 宮城, 洋平
    • 学会等名
      日本癌学会学術総会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04992
  • [学会発表] Visualizing ligand-receptor-mediated interactome in single cell transcriptome data2019

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Komura, Ryohei Suzuki, Shumpei Ishikawa
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory Meeting, Systems Immunology
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04992
  • [学会発表] Interactome analysis of gastric cancer microenvironment by single-cell transcriptome sequencing2019

    • 著者名/発表者名
      Shumpei Ishikawa, Daisuke Komura, Ryohei Suzuki, Hiroto Katoh
    • 学会等名
      Cell Symbosia. Single Cells: Technology to Biology
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04992
  • [学会発表] Lymphotoxin-alpha plays key roles in lymphoproliferative lesions arising in patient-derived cancer2018

    • 著者名/発表者名
      TSUYOSHI CHIJIWA, DAISUKE KOMURA, MIZUHA HARAGUCHI, HARUO HASHIMOTO, HIROSHI SUEMIZU, MAKOTO KATAYAMA, YOSHIYASU NAKAMURA, DAISUKE FURUKAWA, TAKAYUKI ISAGAWA, HIROTO KATO, TAKASHI MORIYA, SHUMPEI ISHIKAWA, MASATO NAKAMURA, YOHEI MIYAGI
    • 学会等名
      AACR Annual Meeting 2018
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07096
  • [学会発表] 治療標的探索のためのがん-間質細胞間相互作用解析システム2017

    • 著者名/発表者名
      河村大輔, 砂河孝行, 鈴木良平, 佐藤玲子, 加藤洋人, 田中麻理子, 山本尚吾, 深山正久, 油谷浩幸, 石川俊平
    • 学会等名
      第106回 日本病理学会総会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04992
  • [学会発表] CASTIN: a system for comprehensive analysis of cancer-stromal interactome.2017

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Komura, Takayuki Isagawa, Ryohei Suzuki, Reiko Sato, Mariko Tanaka, Shogo Yamamoto, Masashi Fukayama, Hiroyuki Aburatani, Shumpei Ishikawa.
    • 学会等名
      The 12th International Workshop on Advanced Genomics
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04992
  • [学会発表] Single cell analysis for the human gastric cancer environments2017

    • 著者名/発表者名
      Hiroto Katoh, Daisuke Komura, Shumpei Ishikawa.
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory Meeting, Single Cell Analyses
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04992
  • [学会発表] An interactome analysis for personalized chemotherapy using PDX/NOG models of non-small cell lung cancer2017

    • 著者名/発表者名
      Chijiwa T, Komura D, Haraguchi M, Noguchi A, Sato H, Ito H, Nakayama H, Katayama M, Miyao N, Matsui N, Tateishi Y, Suemizu H, Nakamura Y, Furukawa D, Isagawa T, Katoh H, Moriya T, Ishikawa S, Nakamura M, Miyagi Y
    • 学会等名
      AACR Annual Meeting 2017
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07096
  • [学会発表] 治療標的探索のためのがんー間質細胞間相互作用の網羅的解析2017

    • 著者名/発表者名
      河村大輔, 鈴木良平, 加藤洋人, 山本尚吾, 油谷浩幸, 石川俊平
    • 学会等名
      第76回日本癌学会学術総会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04992
  • [学会発表] The possibility of personalized chemotherapy for non-small cell lung cancer using interactome analyses of PDX/NOG models2017

    • 著者名/発表者名
      Chijiwa T, Komura D, Haraguchi M, Noguchi A, Sato H, Ito H, Nakayama H, Katayama M, Miyao N, Suemizu H, Nakamura Y, Furukawa D, Moriya T, Isagawa T, Katoh H, Ishikawa S, Nakamura M, Miyagi Y
    • 学会等名
      ESMO Asia 2017
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07096
  • [学会発表] The prevention of lymphoproliferative lesions arising in patient-derived cancer enografts by anti-graft-versus-host-disease agents2017

    • 著者名/発表者名
      Chijiwa T, Noguchi A, Komura D, Katayama M, Haraguchi M, Hashimoto H, Suemizu H, Nakamura Y, Furukawa D, Isagawa T, Katoh H, Moriya T, Ishikawa S, Nakamura M, Miyagi Y
    • 学会等名
      AACR Advances in Modeling Cancer in Mice: Technology, Biology, and Beyond
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07096
  • [学会発表] Pathology Map: an Effective GUI Annotation System for Classification of Digital Pathological Images in Deep Learning2016

    • 著者名/発表者名
      Ken Tominaga, Daisuke Komura, Shumpei Ishikawa
    • 学会等名
      15th European Conference on Computational Biology
    • 発表場所
      Hague, Netherlands
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H06766
  • [学会発表] Learning High-level Features of Pathology Images using Multi-Resolution Convolutional Auto-Encoders.2016

    • 著者名/発表者名
      Ryohei Suzuki, Daisuke Komura, Shumpei Ishikawa
    • 学会等名
      15th European Conference on Computational Biology
    • 発表場所
      Hague, Netherlands
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H06766
  • 1.  千々和 剛 (70642180)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 4件
  • 2.  古川 大輔 (70459478)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件
  • 3.  中村 雅登 (00164335)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件
  • 4.  平岡 伸介 (40276217)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 5.  鈴木 涼平 (30621809)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 6.  宮城 洋平 (00254194)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 7.  牛久 哲男
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 8.  石川 俊平
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 9.  和田 聡
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

URL: 

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi