西村好史 NISHIMURA Yoshifumi

研究者番号	10778103
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 早稲田大学, 理工学術院, 次席研究員(研究院講師)
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2020年度 – 2024年度: 早稲田大学, 理工学術院, 次席研究員(研究院講師)
審査区分/研究分野	研究代表者小区分60100:計算科学関連研究代表者以外学術変革領域研究区分(Ⅱ) / 小区分32010:基礎物理化学関連
キーワード	研究代表者並列計算 / 分子シミュレーション / 分子動力学 / 量子化学 / 計算化学研究代表者以外ダイナミクス / CO2濃縮 / 高速高精密電子状態計算 / 原子～サブナノクラスター / 担持金属触媒 … もっと見る / ナノ粒子 / 動態 / CO2還元低温低圧駆動 / ダイナミクスシミュレーション / 量子化学計算 / 金属ナノ粒子 / CO2還元 / ゼオライト / 光反応サイクル / 光受容タンパク質 / プロトン移動 / cis-trans異性化 / is-trans異性化 / 円錐交差構造 / 光活性イエロータンパク質 / 密度汎関数強束縛法隠す

大規模量子化学計算に基づく階層的シミュレーションシステムの開発と応用研究代表者
- 研究代表者
  
  西村好史
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分60100:計算科学関連
- 研究機関
  早稲田大学
CO2擬高圧場を活用したCO2還元機構の低圧駆動
- 研究代表者
  
  織田晃
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(B)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅱ)
- 研究機関
  名古屋大学
大規模励起状態ダイナミクスの開発及び光活性イエロータンパク質への実践的応用
- 研究代表者
  
  吉川武司
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分32010:基礎物理化学関連
- 研究機関
  東邦大学

すべて 2023 2022 2021 2020

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Enabling large-scale quantum path integral molecular dynamics simulations through the integration of Dcdftbmd and i-PI codes2023
- 著者名/発表者名
  Nishimura Yoshifumi、Nakai Hiromi
- 雑誌名
  
  The Journal of Chemical Physics
  
  巻: 158 号: 16 ページ: 164101-164101
- DOI
  10.1063/5.0147535
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12064, KAKENHI-PROJECT-20K05436
[雑誌論文] Species-selective nanoreactor molecular dynamics simulations based on linear-scaling tight-binding quantum chemical calculations2023
- 著者名/発表者名
  Nishimura Yoshifumi、Nakai Hiromi
- 雑誌名
  
  The Journal of Chemical Physics
  
  巻: 158 号: 5 ページ: 054106-054106
- DOI
  10.1063/5.0132573
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12064, KAKENHI-PROJECT-18H05264, KAKENHI-PROJECT-20K05436
[雑誌論文] 光活性イエロータンパク質の光反応サイクルにおける<i>trans-cis</i>光異性化過程の量子的分子動力学シミュレーション解析2023
- 著者名/発表者名
  ISHIDA Kensuke、NISHIMURA Yoshifumi、NAKAI Hiromi
- 雑誌名
  
  Journal of Computer Chemistry, Japan
  
  巻: 22 号: 2 ページ: 9-11
- DOI
  10.2477/jccj.2023-0033
- ISSN
  1347-1767, 1347-3824
- 言語
  日本語
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12064
[雑誌論文] Large-Scale Molecular Dynamics Simulation for Ground and Excited States Based on Divide-and-Conquer Long-Range Corrected Density-Functional Tight-Binding Method2020
- 著者名/発表者名
  Komoto Nana、Yoshikawa Takeshi、Nishimura Yoshifumi、Nakai Hiromi
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Theory and Computation
  
  巻: 16 号: 4 ページ: 2369-2378
- DOI
  10.1021/acs.jctc.9b01268
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K05436, KAKENHI-PROJECT-18H05264
[雑誌論文] Spin-flip approach within time-dependent density functional tight-binding method: Theory and applications2020
- 著者名/発表者名
  Mayu Inamori, Takeshi Yoshikawa, Yasuhiro Ikabata, Yoshifumi Nishimura, Hiromi Nakai
- 雑誌名
  
  Journal of Computational Chemistry
  
  巻: 41 号: 16 ページ: 1538-1548
- DOI
  10.1002/jcc.26197
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14184, KAKENHI-PROJECT-20K05436, KAKENHI-PROJECT-18H05264
[雑誌論文] Hierarchical parallelization of divide‐and‐conquer density functional tight‐binding molecular dynamics and metadynamics simulations2020
- 著者名/発表者名
  Nishimura Yoshifumi、Nakai Hiromi
- 雑誌名
  
  Journal of Computational Chemistry
  
  巻: 41 号: 19 ページ: 1759-1772
- DOI
  10.1002/jcc.26217
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K05436, KAKENHI-PROJECT-18H05264
[学会発表] 全電子数保存条件と非整数占有数を用いた分割統治型時間依存結合摂動法の開発2023
- 著者名/発表者名
  西村龍星, 吉川武司, 坂田健, 中井浩巳
- 学会等名
  日本化学会第103春季年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K05436
[学会発表] Recent updates of DCDFTBMD program: Theory, implementation, and applications2023
- 著者名/発表者名
  Hiromi Nakai, Yoshifumi Nishimura
- 学会等名
  Asia Pacific Conference of Theoretical and Computational Chemistry (APATCC-10)
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12064
[学会発表] Extension and acceleration of nanoreactor molecular dynamics based on species-selective algorithm and linear-scaling tight-binding quantum chemical computations2023
- 著者名/発表者名
  Yoshifumi Nishimura, Hiromi Nakai
- 学会等名
  The 5th Conference of Theory and Applications of Computational Chemistry (TACC2023)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12064
[学会発表] Species-selective nanoreactor molecular dynamics simulations based on linear-scaling tight-binding quantum chemical calculations2023
- 著者名/発表者名
  Yoshifumi Nishimura, Hiromi Nakai
- 学会等名
  Asia Pacific Conference of Theoretical and Computational Chemistry (APATCC-10)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12064
[学会発表] Fo回転分子モーターにおけるプロトン移動機構2023
- 著者名/発表者名
  神山幸成, パーキン暖, 小野純一, 西村好史, 中井浩巳, 高野光則
- 学会等名
  第23回日本蛋白質科学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12064
[学会発表] 光活性イエロータンパク質の光反応サイクルにおけるtrans-cis光異性化過程の量子的分子動力学シミュレーション解析2023
- 著者名/発表者名
  石田賢亮, 西村好史, 中井浩巳
- 学会等名
  日本コンピュータ化学会2023年春季年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12064
[学会発表] Proton conduction mechanism in water channels of ATP synthase studied by molecular dynamics simulation2023
- 著者名/発表者名
  Yukinari Kamiyama, Dan Parkin, Junichi Ono, Yoshifumi Nishimura, Hiromi Nakai, Mitsunori Takano
- 学会等名
  CCP2023 - 34th IUPAP Conference on Computational Physics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12064
[学会発表] ゼオライトにおける金属サブナノ粒子の動態予測に向けた量子分子動力学計算の適用2023
- 著者名/発表者名
  西村好史, 織田晃, 中井浩巳
- 学会等名
  第37回分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12064
[学会発表] 量子的分子動力学計算プログラムDCDFTBMDの開発状況と最近の応用事例2023
- 著者名/発表者名
  西村好史
- 学会等名
  スーパーコンピュータワークショップ2022「複雑電子状態の理論・計算科学」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12064
[学会発表] 量子的分子動力学計算プログラムDCDFTBMDの開発状況と最近の応用事例2023
- 著者名/発表者名
  西村好史
- 学会等名
  スーパーコンピュータワークショップ2022「複雑電子状態の理論・計算科学」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K05436
[学会発表] Species-selective Quantum Chemical Nanoreactor: Accelerated Sampling of Complex Chemical Processes2023
- 著者名/発表者名
  Yoshifumi Nishimura, Hiromi Nakai
- 学会等名
  The 6th International Conference on Molecular Simulation (ICMS 2023)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12064
[学会発表] 複雑反応過程のための選択的量子ナノ反応器分子動力学法の実装と応用2022
- 著者名/発表者名
  西村好史, 中井浩巳
- 学会等名
  第16回分子科学討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12064
[学会発表] Recently added features in DCDFTBMD program2022
- 著者名/発表者名
  Yoshifumi Nishimura, Hiromi Nakai
- 学会等名
  New Horizons in Scientific Software: THE NEW COLLABORATIVE PLATFORM GOES LIFE (NHISS2022)
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12064
[学会発表] DCDFTBMDと分子シミュレーションプログラムの接続：大規模量子的経路積分分子動力学計算への展開2022
- 著者名/発表者名
  西村好史, 中井浩巳
- 学会等名
  第36回分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12064
[学会発表] 光活性イエロータンパク質の光異性化過程に対する量子的分子動力学シミュレーション2022
- 著者名/発表者名
  石田賢亮, 西村好史, 吉川武司, 中井浩巳
- 学会等名
  第36回分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K05436
[学会発表] 光活性イエロータンパク質の光異性化過程に対する量子的分子動力学シミュレーション2022
- 著者名/発表者名
  石田賢亮, 西村好史, 吉川武司, 中井浩巳
- 学会等名
  第36回分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12064
[学会発表] Recently added features in DCDFTBMD program2022
- 著者名/発表者名
  Y. Nishimura, H. Nakai
- 学会等名
  New Horizons in Scientific Software: THE NEW COLLABORATIVE PLATFORM GOES LIFE (NHISS2022)
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K05436
[学会発表] Recent developments in divide-and-conquer density functional tight-binding method2021
- 著者名/発表者名
  Yoshifumi Nishimura, Takeshi Yoshikawa, Hiromi Nakai
- 学会等名
  Pacifichem2020
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K05436
[学会発表] DCDFTBMDプログラムによる励起状態ダイナミクス研究への展開2021
- 著者名/発表者名
  中井浩巳，西村好史，吉川武司，浦谷浩輝，五十幡康弘，河本奈々，稲森真由
- 学会等名
  第23回理論化学討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K05436
[学会発表] 富岳での大規模計算に向けた量子分子動力学シミュレーションプログラムDCDFTBMDの高度化2021
- 著者名/発表者名
  西村好史，中井浩巳
- 学会等名
  第23回理論化学討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K05436
[学会発表] 分割統治型密度汎関数強束縛分子動力学・メタダイナミクス計算の階層的並列化2020
- 著者名/発表者名
  西村好史,中井浩巳
- 学会等名
  第34回分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K05436

1. 吉川武司 (10754799)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件
2. 織田晃 (80762377)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 五十幡康弘

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

西村 好史 NISHIMURA Yoshifumi

研究課題

研究成果

共同研究者

大規模量子化学計算に基づく階層的シミュレーションシステムの開発と応用研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

CO2擬高圧場を活用したCO2還元機構の低圧駆動

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

大規模励起状態ダイナミクスの開発及び光活性イエロータンパク質への実践的応用

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] Enabling large-scale quantum path integral molecular dynamics simulations through the integration of Dcdftbmd and i-PI codes2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Species-selective nanoreactor molecular dynamics simulations based on linear-scaling tight-binding quantum chemical calculations2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] 光活性イエロータンパク質の光反応サイクルにおける<i>trans-cis</i>光異性化過程の量子的分子動力学シミュレーション解析2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

ISSN

言語

データソース

[雑誌論文] Large-Scale Molecular Dynamics Simulation for Ground and Excited States Based on Divide-and-Conquer Long-Range Corrected Density-Functional Tight-Binding Method2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Spin-flip approach within time-dependent density functional tight-binding method: Theory and applications2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Hierarchical parallelization of divide‐and‐conquer density functional tight‐binding molecular dynamics and metadynamics simulations2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] 全電子数保存条件と非整数占有数を用いた分割統治型時間依存結合摂動法の開発2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Recent updates of DCDFTBMD program: Theory, implementation, and applications2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Extension and acceleration of nanoreactor molecular dynamics based on species-selective algorithm and linear-scaling tight-binding quantum chemical computations2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Species-selective nanoreactor molecular dynamics simulations based on linear-scaling tight-binding quantum chemical calculations2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Fo回転分子モーターにおけるプロトン移動機構2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 光活性イエロータンパク質の光反応サイクルにおけるtrans-cis光異性化過程の量子的分子動力学シミュレーション解析2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Proton conduction mechanism in water channels of ATP synthase studied by molecular dynamics simulation2023

著者名/発表者名

西村好史 NISHIMURA Yoshifumi