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松井 求  Matsui Motomu

研究者番号 10803728
その他のID
  • ORCIDhttps://orcid.org/0000-0001-5077-4977
所属 (現在) 2025年度: 京都大学, 化学研究所, 助教
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2022年度 – 2024年度: 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 特任助教
2019年度 – 2021年度: 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教
審査区分/研究分野
研究代表者
複合領域
研究代表者以外
中区分41:社会経済農学、農業工学およびその関連分野 / 小区分41050:環境農学関連 / 複合領域
キーワード
研究代表者
微生物相互作用 / 微生物形態 / 窒素循環 / 微生物生態学 / ポストコッホ生態 / ネットワーク / メタゲノム解析 / 微生物生態 / ネットワーク解析 / 機能インフォマティクス … もっと見る / データベース / ポストコッホ生態系 / 微生物ダークマター / バイオインフォマティクス … もっと見る
研究代表者以外
深層土 / 微生物群集 / 持続可能性 / 窒素・リン・水循環 / 混作 / 熱帯農業生態系 / 生態系サービス / 土壌微生物機能 / 土壌炭素隔離 / 微生物生態 隠す
  • 研究課題

    (4件)
  • 研究成果

    (33件)
  • 共同研究者

    (19人)
  •  熱帯農地における生物的炭素隔離の実現に必要な機序解明と活用

    • 研究代表者
      杉原 創
    • 研究期間 (年度)
      2024 – 2027
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分41050:環境農学関連
    • 研究機関
      東京農工大学
  •  半乾燥熱帯畑作地における混作技術革新:根圏微生物機能と深層土水の活用

    • 研究代表者
      杉原 創
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2026
    • 研究種目
      国際共同研究加速基金(海外連携研究)
    • 審査区分
      中区分41:社会経済農学、農業工学およびその関連分野
    • 研究機関
      東京農工大学
  •  超地球生命体を解き明かすポストコッホ生態学

    • 研究代表者
      高谷 直樹
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2023
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      筑波大学
  •  機能インフォマティクスが解き明かすポストコッホ生態系研究代表者

    • 研究代表者
      松井 求
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2023
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      東京大学

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 学会発表

  • [雑誌論文] NeTaGFT: A similarity network‐based method for trait analysis2023

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto Hirotaka、Matsui Motomu
    • 雑誌名

      Methods in Ecology and Evolution

      巻: 15 号: 1 ページ: 153-163

    • DOI

      10.1111/2041-210x.14251

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K17858, KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [雑誌論文] バイオインフォマティクスでポストコッホ生態系を解き明かす2022

    • 著者名/発表者名
      松井 求
    • 雑誌名

      日本微生物生態学会誌

      巻: 37 号: 1 ページ: 37-39

    • DOI

      10.20709/jsmeja.37.1_37

    • ISSN
      2424-1989
    • 年月日
      2022-03-01
    • 言語
      日本語
    • オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [雑誌論文] Lifestyle Evolution Analysis by Binary-State Speciation and Extinction (BiSSE) Model2022

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Takao K.、Matsui Motomu、Sriswasdi Sira、Iwasaki Wataru
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 2569 ページ: 327-342

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2691-7_16

    • ISBN
      9781071626900, 9781071626917
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [雑誌論文] Nondestructive microbial discrimination using single-cell Raman spectra and random forest machine learning algorithm2022

    • 著者名/発表者名
      Kanno Nanako、Kato Shingo、Ohkuma Moriya、Matsui Motomu、Iwasaki Wataru、Shigeto Shinsuke
    • 雑誌名

      STAR Protocols

      巻: 3 号: 4 ページ: 101812-101812

    • DOI

      10.1016/j.xpro.2022.101812

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05681, KAKENHI-PLANNED-19H05688, KAKENHI-PLANNED-19H05689
  • [雑誌論文] Machine learning-assisted single-cell Raman fingerprinting for in situ and nondestructive classification of prokaryotes2021

    • 著者名/発表者名
      Nanako Kanno、Shingo Kato、Moriya Ohkuma、Motomu Matsui、Wataru Iwasaki、Shinsuke Shigeto
    • 雑誌名

      iScience

      巻: 24 号: 9 ページ: 102975-102975

    • DOI

      10.1016/j.isci.2021.102975

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05681, KAKENHI-PLANNED-19H05688, KAKENHI-PLANNED-19H05689
  • [雑誌論文] 分子系統解析の最前線2021

    • 著者名/発表者名
      松井 求
    • 雑誌名

      JSBi Bioinformatics Review

      巻: 2 号: 1 ページ: 30-57

    • DOI

      10.11234/jsbibr.2021.7

    • NAID

      130008101617

    • ISSN
      2435-7022
    • 言語
      日本語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [雑誌論文] Graph Splitting: A Graph-Based Approach for Superfamily-Scale Phylogenetic Tree Reconstruction2019

    • 著者名/発表者名
      Matsui Motomu、Iwasaki Wataru
    • 雑誌名

      Systematic Biology

      巻: 69 ページ: 265-279

    • DOI

      10.1093/sysbio/syz049

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H06154, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] Reconstructing Phylogenetic Reconstruction2024

    • 著者名/発表者名
      Motomu Matsui
    • 学会等名
      DATA SCIENCE FOR GENOME DYNAMICS
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] Tree of Lifeは完成できるか?2023

    • 著者名/発表者名
      松井求
    • 学会等名
      IIBMP2023
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] 環境微生物研究におけるバイオインフォマティクス活用法2023

    • 著者名/発表者名
      松井求
    • 学会等名
      アグリバイオ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] バイオインフォマティクスが駆動する微生物科学2023

    • 著者名/発表者名
      松井求
    • 学会等名
      微生物科学イノベーション特論II
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] 分子系統学の進化可能性を考える2023

    • 著者名/発表者名
      松井求
    • 学会等名
      Intelligence and Cultural Evolution Theoryワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] ポストコッホ生態学が解き明かす輪作に呼応した微生物動態2022

    • 著者名/発表者名
      松井求、明石基洋、鈴木誉保、藤吉真生、土肥裕希、森ヶ崎進、林久喜、高谷直樹、岩崎渉
    • 学会等名
      第35回日本微生物生態学会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] シン・近隣結合法:PANJEP法が問い直す系統解析の常識2022

    • 著者名/発表者名
      松井求、岩崎渉
    • 学会等名
      第24回日本進化学会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] ポストコッホ機能生態学が目指すもの2022

    • 著者名/発表者名
      松井求
    • 学会等名
      ポストコッホ生態研究集会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] 系統樹推定の常識を問い直す2022

    • 著者名/発表者名
      松井求
    • 学会等名
      国立遺伝学研究所研究集会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] Bac2Feature:系統情報を利用した微生物の形質推定パイプライン2022

    • 著者名/発表者名
      藤吉真生、鈴木誉保、松井求、岩崎渉
    • 学会等名
      第24回日本進化学会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] 未培養微生物研究におけるバイオインフォマティクスの役割2022

    • 著者名/発表者名
      松井求
    • 学会等名
      日本生物工学会バイオインフォマティクス相談部会第五回講演会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] Trait-based アプローチでせまる 細菌の群集構造とその安定性2022

    • 著者名/発表者名
      鈴木誉保、松井求、森ヶ崎進、大津厳生、土肥裕希、河野祐介、林久喜、高谷直樹、岩崎渉
    • 学会等名
      第35回日本微生物生態学会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] 微生物群集は普遍的に極めて安定な形質組成を持つ2022

    • 著者名/発表者名
      鈴木誉保、松井求、森ヶ崎進、大津厳生、土肥裕希、林久喜、高谷直樹、岩崎渉
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] 機能インフォマティクスが解き明かすポストコッホ生態系2022

    • 著者名/発表者名
      松井求、岩崎渉
    • 学会等名
      新学術領域「ポストコッホ生態」第4回領域会議
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] Bac2Feature による微生物群集の表現型解析2022

    • 著者名/発表者名
      藤吉真生、鈴木誉保、松井求、岩崎渉
    • 学会等名
      第35回日本微生物生態学会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] 施肥条件の異なる農地土壌の時系列ショットガンメタゲノム解析2021

    • 著者名/発表者名
      Motohiro Akashi, Motomu Matsui, Susumu Morigasaki, Hisayoshi Hayashi, Naoki Takaya, and Wataru Iwasaki
    • 学会等名
      日本微生物生態学会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] バイオインフォマティクスが解き明かすポストコッホ生態系2021

    • 著者名/発表者名
      Motomu Matsui
    • 学会等名
      IIBMP2021
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] Metabolite analysis and machine learning-assisted discrimination of archaea and bacteria using minimally invasive single-cell Raman microspectroscopy2021

    • 著者名/発表者名
      Shinsuke Shigeto, Nanako Kanno, Shingo Kato, Motomu Matsui
    • 学会等名
      Japan Geoscience Union Meeting 2021
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-19H05679
  • [学会発表] 機能インフォマティクスが解き明かすポストコッホ生態系2021

    • 著者名/発表者名
      Motomu Matsui and Wataru Iwasaki
    • 学会等名
      新学術領域「ポストコッホ生態」第3回領域会議
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] Nondestructive prokaryotic species discrimination using single-cell Raman spectroscopy and machine learning2021

    • 著者名/発表者名
      Nanako Kanno, Shingo Kato, Motomu Matsui and Shinsuke Shigeto
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] Machine learning-assisted single-cell Raman microspectroscopy for in situ prokaryotic classification in complex microbial populations2021

    • 著者名/発表者名
      Shinsuke Shigeto, Nanako Kanno, Shingo Kato, Motomu Matsui
    • 学会等名
      11th International Conference on Advanced Vibrational Spectroscopy
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-19H05679
  • [学会発表] アラインメントで問い直す系統樹推定の常識:GS法とNJ法2021

    • 著者名/発表者名
      Motomu Matsui
    • 学会等名
      第23回日本進化学会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] Graph Splitting: A Graph-Based Approach for Superfamily-Scale Phylogenetic Tree Reconstruction2020

    • 著者名/発表者名
      Motomu Matsui and Wataru Iwasaki
    • 学会等名
      IIBMP2020
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] ウイルスの初期進化と高速進化を解き明かす2020

    • 著者名/発表者名
      Motomu Matsui
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] 機能インフォマティクスが解き明かすポストコッホ生態系2020

    • 著者名/発表者名
      Motomu Matsui and Wataru Iwasaki
    • 学会等名
      新学術領域「ポストコッホ生態」第2回領域会議
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • [学会発表] グラフに基づく新たな系統解析手法で隠れた遠距離進化を発掘する2019

    • 著者名/発表者名
      Motomu Matsui and Wataru Iwasaki
    • 学会等名
      第21回日本進化学会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05688
  • 1.  杉原 創 (30594238)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 2.  高谷 直樹 (50282322)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 3.  大熊 盛也 (10270597)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 4.  重藤 真介 (10756696)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件
  • 5.  佐々 文洋 (30722681)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 6.  野村 暢彦 (60292520)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 7.  跡見 晴幸 (90243047)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 8.  野尻 秀昭 (90272468)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 9.  大西 康夫 (90292789)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 10.  中井 亮佑 (90637802)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 11.  大津 厳生 (60395655)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 12.  岩崎 渉 (50545019)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 14件
  • 13.  梅澤 有 (50442538)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 14.  LYU HAN (20945349)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 15.  安野 秀瑛 (80993138)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 16.  斎藤 広隆 (70447514)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 17.  柴田 誠 (40799607)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 18.  関 真由子 (70963453)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 19.  松本 拡高
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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