坊農秀雅 BONO Hidemasa

研究者番号	20364789
その他のID	https://orcid.org/0000-0003-4413-0651
外部サイト
所属 (現在)	2025年度: 広島大学, 統合生命科学研究科(理), 教授 2025年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等), データサイエンス共同利用基盤施設, 特任准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2023年度 – 2024年度: 広島大学, 統合生命科学研究科(理), 教授 2020年度 – 2023年度: 広島大学, 統合生命科学研究科(理), 特任教授 2020年度: 広島大学, 大学院統合生命科学研究科, 特任教授 2019年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等), データサイエンス共同利用基盤施設, 特任准教授 2017年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等), 大学共同利用機関等の部局等, 准教授 … もっと見る 2016年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(新領域融合研究センター及びライフサイエンス統合データベースセンター), ライフサイエンス統合データベースセンター, 准教授 2016年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(新領域融合研究センター及びライフサイエンス統合データベースセンター), 統合データベースセンター, 准教授 2016年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等), 統合データベースセンター, 准教授 2015年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構, (新領域融合研究センター及びライフサイエンス統合データベースセンター, 准教授 2014年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構, ライフサイエンス統合データベースセンター, 准教授 2007年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(新領域融合研究センター及びライフサイエンス統合データベースセンター), ライフサイエンス統合データベースセンター, 特任准教授 2004年度 – 2006年度: 埼玉医科大学, 医学部, 助教授 2004年度: 埼玉医科大学, 医学部, 講師 2003年度 – 2004年度: 埼玉医科大学, ゲノム医学研究センター, 講師隠す
審査区分/研究分野	研究代表者中区分39:生産環境農学およびその関連分野 / 応用ゲノム科学研究代表者以外中区分42:獣医学、畜産学およびその関連分野 / 生物系 / 中区分50:腫瘍学およびその関連分野 / 中区分59:スポーツ科学、体育、健康科学およびその関連分野 / 小区分55050:麻酔科学関連 / 小区分42040:実験動物学関連 / 腫瘍生物学 / 昆虫科学
キーワード	研究代表者ゲノム配列 / 遺伝子発現 / 塩基配列解析 / 新規モデル生物 / バイオDX / データ駆動型 / 機能アノテーション / ゲノム育種 / マイクロアレイ / 転写因子 / 遺伝子 / バイオインフォマティクス / ゲノム … もっと見る研究代表者以外 … もっと見るハダカデバネズミ / マイクロアレイ / 異物認識 / 組織擬態 / 異物識別 / 騙されない仕組み / 騙す仕組み / 多胚性寄生蜂 / Copidosoma floridanum / 組織親和的侵入 / 生活習慣病 / 新規小タンパク質 / 脂肪蓄積 / 生活習慣病脂肪 / 新規脳因子 / エピゲノム / 抗体産生 / B細胞 / 麻酔薬 / エピゲノム変化 / 代謝リプログラミング / HIF / 酸素代謝 / 免疫 / 長期予後 / 麻酔 / Naked mole-rat / ARF / 細胞老化 / がん / naked mole rat / Gene Regulatory Network / Transcription Factor Binding Site / Transcription Factor / Metabolic Pathway / Microarray / 代謝パスウェイ / モチーフ / cDNA / 機能注釈 / ゲノム情報解析 / 配列モチーフ / DNAチップ / クラスタリング / 遺伝子配列解析 / 遺伝子制御ネットワーク / 転写因子結合配列 / 転写因子 / 代謝経路 / ポジショナルクローニング / 変異体 / B.mori / 定量RT-PCR / 酸化ストレス / RNA-seq / RNA干渉 / 尿酸合成 / 個体機能低下 / miRNA / カイコガ / 尿酸 / DJ-1 / パーキンソン病 / 遺伝子 / 遺伝学 / 脂質 / ゲノム隠す

ハダカデバネズミの「健康長寿」システムを構成する分子基盤の解明
- 研究代表者
  
  三浦恭子
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 審査区分
  
  中区分42:獣医学、畜産学およびその関連分野
- 研究機関
  熊本大学
組織擬態を成立させる識別制御の仕組みの解明
- 研究代表者
  
  天竺桂弘子
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2026
- 研究種目
  
  挑戦的研究(開拓)
- 審査区分
  
  中区分50:腫瘍学およびその関連分野
- 研究機関
  東京農工大学
新規脳内小タンパク質NPGLによる生活習慣病発症防止メカニズムの解明
- 研究代表者
  
  浮穴和義
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 審査区分
  
  中区分59:スポーツ科学、体育、健康科学およびその関連分野
- 研究機関
  広島大学
最長寿・がん化耐性ハダカデバネズミにおける生体内発がん抑制機構の解明
- 研究代表者
  
  三浦恭子
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分42040:実験動物学関連
- 研究機関
  熊本大学
データ駆動型ゲノム育種を実現するデータ解析基盤技術の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  坊農秀雅
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2022
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分39:生産環境農学およびその関連分野
- 研究機関
  広島大学
酸素ホメオスターシス制御を切り口とした麻酔に伴う免疫応答変容の分子基盤解明
- 研究代表者
  
  広田喜一
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分55050:麻酔科学関連
- 研究機関
  関西医科大学
ハダカデバネズミの低代謝・変温性・長寿を制御する特異な細胞配置の仕組み
- 研究代表者
  
  三浦恭子
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2020
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分42:獣医学、畜産学およびその関連分野
- 研究機関
  熊本大学
がん化耐性齧歯類ハダカデバネズミ特異的ながん化抑制バリアの形成メカニズム
- 研究代表者
  
  三浦恭子
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2017
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  腫瘍生物学
- 研究機関
  北海道大学
パーキンソン病原因遺伝子DJ-1が関与する尿酸合成系路の解明
- 研究代表者
  
  天竺桂弘子
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  昆虫科学
- 研究機関
  東京農工大学
ゲノムスケールの転写因子結合サイトと遺伝子発現データの統合解析環境の構築研究代表者
- 研究代表者
  
  坊農秀雅
- 研究期間 (年度)
  2005 – 2007
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  応用ゲノム科学
- 研究機関
  大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(新領域融合研究センター)
  埼玉医科大学
遺伝学とトランスクリプトームの統合による高脂血症の遺伝子ネットワークの解明
- 研究代表者
  
  岡崎康司
- 研究期間 (年度)
  2004
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  埼玉医科大学
ゲノムレベルでの遺伝子機能情報の統合化と遺伝子システム解明への応用
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2003 – 2004
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  大阪大学

[図書] 今日から使えるデータベース・ウェブツール”GOLD様々な生物種のゲノム配列解読情報を集めたデータベース”2014
- 著者名/発表者名
  内藤雄樹、高木利久、中村保一、片山俊明、粕川雄也、坊農秀雅、岩崎歩、伊藤真和吏、天竺桂弘子、小野浩雅、小笠原理ほか55名
- 総ページ数
  246
- 出版者
  羊土社
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26450465
[図書] マイクロアレイデ「タ統計解析プロトコール2008
- 著者名/発表者名
  坊農秀雅
- 出版者
  羊土社
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17710170
[図書] バイオデータベースとウェブツールの手とり足とり活用法第二版2007
- 著者名/発表者名
  坊農秀雅
- 出版者
  羊土社
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17710170
[図書] ゲノム情報はこう活かせ!2005
- 著者名/発表者名
  坊農秀雅
- 総ページ数
  220
- 出版者
  羊土社
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17710170
[雑誌論文] GEM: Genome Editing Meta-database, a dataset of genome editing related metadata systematically extracted from PubMed literatures2023
- 著者名/発表者名
  Suzuki Takayuki、Bono Hidemasa
- 雑誌名
  
  Gene and Genome Editing
  
  巻: 5 ページ: 100024-100024
- DOI
  10.1016/j.ggedit.2022.100024
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K19118
[雑誌論文] An extract from the frass of swallowtail butterfly (Papilio machaon) larvae inhibits HCT116 colon cancer cell proliferation but not other cancer cell types.2023
- 著者名/発表者名
  Nakano M, Sakamoto T, Kitano Y, Bono H, Simpson RJ, Tabunoki H.
- 雑誌名
  
  BMC Genomics.
  
  巻: 24 号: 1 ページ: 735-735
- DOI
  10.1186/s12864-023-09841-0
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K17418, KAKENHI-PROJECT-20K20571, KAKENHI-PROJECT-22KJ1228, KAKENHI-PROJECT-23K21343
[雑誌論文] Exploratory meta-analysis of hypoxic transcriptomes using a precise transcript reference sequence set2022
- 著者名/発表者名
  Ono Yoko、Bono Hidemasa
- 雑誌名
  
  Life Science Alliance
  
  巻: 6 号: 1 ページ: e202201518-e202201518
- DOI
  10.26508/lsa.202201518
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H03776, KAKENHI-PROJECT-21K19118
[雑誌論文] Systematic functional annotation workflow for insects2022
- 著者名/発表者名
  Bono, H., Sakamoto, T., Kasukawa, T., & Tabunoki, H.
- 雑誌名
  
  Insects
  
  巻: 13 号: 7 ページ: 586-586
- DOI
  10.3390/insects13070586
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K20571, KAKENHI-PROJECT-21KK0111, KAKENHI-PROJECT-21K19118, KAKENHI-PROJECT-23K21343
[雑誌論文] Meta-Analysis of the Public RNA-Seq Data of the Western Honeybee Apis mellifera to Construct Reference Transcriptome Data2022
- 著者名/発表者名
  Yokoi Kakeru、Wakamiya Takeshi、Bono Hidemasa
- 雑誌名
  
  Insects
  
  巻: 13 号: 10 ページ: 931-931
- DOI
  10.3390/insects13100931
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K19118
[雑誌論文] A highly contiguous genome assembly of red perilla (Perilla frutescens) domesticated in Japan2022
- 著者名/発表者名
  Tamura Keita、Sakamoto Mika、Tanizawa Yasuhiro、Mochizuki Takako、Matsushita Shuji、Kato Yoshihiro、Ishikawa Takeshi、Okuhara Keisuke、Nakamura Yasukazu、Bono Hidemasa
- 雑誌名
  
  DNA Research
  
  巻: 30 号: 1
- DOI
  10.1093/dnares/dsac044
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K19118
[雑誌論文] Reference Genome Sequences of the Oriental Armyworm, Mythimna separata (Lepidoptera: Noctuidae)2022
- 著者名/発表者名
  Kakeru Yokoi、Seiichi Furukawa、Rui Zhou、Akiya Jouraku、Hidemasa Bono
- 雑誌名
  
  Insects
  
  巻: 13 号: 12 ページ: 1172-1172
- DOI
  10.3390/insects13121172
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-21K19118
[雑誌論文] Exploratory Meta-Analysis of Hypoxic Transcriptomes Using a Precise Transcript Reference Sequence Set2022
- 著者名/発表者名
  Ono Yoko、Bono Hidemasa
- 雑誌名
  
  bioRxiv
  
  巻: NA
- DOI
  10.1101/2022.05.01.489280
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K19118
[雑誌論文] Cigarette Smoke Extract Activates Hypoxia-Inducible Factors in a Reactive Oxygen Species-Dependent Manner in Stroma Cells from Human Endometrium2021
- 著者名/発表者名
  Kida Naoko、Matsuo Yoshiyuki、Hashimoto Yoshiko、Nishi Kenichiro、Tsuzuki-Nakao Tomoko、Bono Hidemasa、Maruyama Tetsuo、Hirota Kiichi、Okada Hidetaka
- 雑誌名
  
  Antioxidants
  
  巻: 10 号: 1 ページ: 48-48
- DOI
  10.3390/antiox10010048
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K09339, KAKENHI-PROJECT-20H03776, KAKENHI-PROJECT-18K08877, KAKENHI-PROJECT-20H03826, KAKENHI-PROJECT-20K09210, KAKENHI-PROJECT-21K09480
[雑誌論文] Polysulfide inhibits hypoxia-elicited hypoxia-inducible factor activation in a mitochondria-dependent manner2021
- 著者名/発表者名
  Uba Takeo、Matsuo Yoshiyuki、Sumi Chisato、Shoji Tomohiro、Nishi Kenichiro、Kusunoki Munenori、Harada Hiroshi、Kimura Hideo、Bono Hidemasa、Hirota Kiichi
- 雑誌名
  
  Mitochondrion
  
  巻: 59 ページ: 255-266
- DOI
  10.1016/j.mito.2021.06.007
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H03776
[雑誌論文] De novo transcriptome analysis for examination of the nutrition metabolic system related to the evolutionary process through which stick insects gain the ability of flight (Phasmatodea)2021
- 著者名/発表者名
  Sakamoto Takuma、Sasaki Shunya、Yamaguchi Nobuki、Nakano Miho、Sato Hiroki、Iwabuchi Kikuo、Tabunoki Hiroko、Simpson Richard J.、Bono Hidemasa
- 雑誌名
  
  BMC Research Notes
  
  巻: 14 号: 1 ページ: 182-182
- DOI
  10.1186/s13104-021-05600-0
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H03776, KAKENHI-PROJECT-20K20571
[雑誌論文] Multi-Omic Meta-Analysis of Transcriptomes and the Bibliome Uncovers Novel Hypoxia-Inducible Genes2021
- 著者名/発表者名
  Ono Yoko、Bono Hidemasa
- 雑誌名
  
  Biomedicines
  
  巻: 9 号: 5 ページ: 582-582
- DOI
  10.3390/biomedicines9050582
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H03776
[雑誌論文] Diversification of mineralocorticoid receptor genes in a subterranean rodent, the naked mole-rat2021
- 著者名/発表者名
  Oka Kaori、Bono Hidemasa、Kuroiwa Asato、Fujioka Shusuke、Shimizu Atsushi、Katsu Yoshinao、Miura Kyoko
- 雑誌名
  
  Journal of Molecular Endocrinology
  
  巻: 66 ページ: 299-311
- DOI
  10.1530/jme-20-0325
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14601, KAKENHI-PROJECT-19K06734, KAKENHI-PROJECT-20H03776, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] A chromosome-level genome sequence of Chrysanthemum seticuspe, a model species for hexaploid cultivated chrysanthemum2021
- 著者名/発表者名
  Nakano Michiharu、Hirakawa Hideki、Fukai Eigo、Toyoda Atsushi、Kajitani Rei、Minakuchi Yohei、Itoh Takehiko、Higuchi Yohei、Kozuka Toshiaki、Bono Hidemasa、Shirasawa Kenta、Shiraiwa Ippei、Sumitomo Katsuhiko、Hisamatsu Tamotsu、Shibata Michio、Isobe Sachiko、Taniguchi Kenji、Kusaba Makoto
- 雑誌名
  
  Communications Biology
  
  巻: 4 号: 1 ページ: 1167-1167
- DOI
  10.1038/s42003-021-02704-y
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H03776, KAKENHI-PROJECT-21K05564
[雑誌論文] Comparison of Oxidative and Hypoxic Stress Responsive Genes from Meta-Analysis of Public Transcriptomes2021
- 著者名/発表者名
  Suzuki Takayuki、Ono Yoko、Bono Hidemasa
- 雑誌名
  
  Biomedicines
  
  巻: 9 号: 12 ページ: 1830-1830
- DOI
  10.3390/biomedicines9121830
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H03776, KAKENHI-PROJECT-21K19118
[雑誌論文] Reference Transcriptome Data in Silkworm Bombyx mori2021
- 著者名/発表者名
  Yokoi Kakeru、Tsubota Takuya、Jouraku Akiya、Sezutsu Hideki、Bono Hidemasa
- 雑誌名
  
  Insects
  
  巻: 12 号: 6 ページ: 519-519
- DOI
  10.3390/insects12060519
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H03776
[雑誌論文] Inhibiting SARS-CoV-2 infection in vitro by suppressing its receptor, angiotensin-converting enzyme 2, via aryl-hydrocarbon receptor signal2021
- 著者名/発表者名
  Tanimoto Keiji、Hirota Kiichi、Fukazawa Takahiro、Matsuo Yoshiyuki、Nomura Toshihito、Tanuza Nazmul、Hirohashi Nobuyuki、Bono Hidemasa、Sakaguchi Takemasa
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 11 号: 1 ページ: 16629-16629
- DOI
  10.1038/s41598-021-96109-w
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K09339, KAKENHI-PROJECT-20H03776, KAKENHI-PROJECT-20K09210, KAKENHI-PROJECT-21K10073
[雑誌論文] Meta-Analysis of Hypoxic Transcriptomes from Public Databases.2020
- 著者名/発表者名
  Bono H, Hirota K
- 雑誌名
  
  Biomedicines
  
  巻: 8 号: 1 ページ: 1-1
- DOI
  10.3390/biomedicines8010010
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K08874, KAKENHI-PROJECT-18K08877, KAKENHI-PROJECT-20K09210, KAKENHI-PROJECT-20H03776
[雑誌論文] Identification of functional enolase genes of the silkworm Bombyx mori from public databases with a combination of dry and wet bench processes.2017
- 著者名/発表者名
  Kikuchi A, Nakazato T, Ito K, Nojima Y, Yokoyama T, Iwabuchi K, Bono H, Toyoda A, Fujiyama A, Sato R, Tabunoki H.
- 雑誌名
  
  BMC Genomics.
  
  巻: 18(1)
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26450465
[雑誌論文] Can the silkworm (<i>Bombyx mori</i>) be used as a human disease model?2016
- 著者名/発表者名
  Tabunoki H, Bono H, Ito K, Yokoyama T.
- 雑誌名
  
  Drug Discoveries & Therapeutics
  
  巻: 10 号: 1 ページ: 3-8
- DOI
  10.5582/ddt.2016.01011
- NAID
  130005133324
- ISSN
  1881-7831, 1881-784X
- 言語
  英語
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26450465
[雑誌論文] Can the silkworm (Bombyx mori) be used as a human disease model?2016
- 著者名/発表者名
  Tabunoki H, Bono H, Ito K, Yokoyama T.
- 雑誌名
  
  Drug Discov Ther.
  
  巻: 10(1) ページ: 3-8
- NAID
  130005133324
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26450465
[雑誌論文] Superoxide Dismutases, SOD1 and SOD2, Play a Distinct Role in the Fat Body during Pupation in Silkworm Bombyx mori.2015
- 著者名/発表者名
  Nojima Y, Ito K, Ono H, Nakazato T, Bono H, Yokoyama T, Sato R, Suetsugu Y, Nakamura Y, Yamamoto K, Satoh J, Tabunoki H, Fugo H.
- 雑誌名
  
  PLOS ONE
  
  巻: 10
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26450465
[雑誌論文] ライフサイエンス分野のデータベースの現状と統合データベースプロジェクト2008
- 著者名/発表者名
  坊農秀雅
- 雑誌名
  
  日本化学会情報化学部会誌 26
  
  ページ: 5-7
- NAID
  130000091030
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17710170
[雑誌論文] SayaMatcher : genome scale organization and systematic analysis of nuclear receptor response elements2005
- 著者名/発表者名
  Bono, H.
- 雑誌名
  
  Gene 364
  
  ページ: 74-78
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] The study of metabolic pathways in tumors based on the transcriptome2005
- 著者名/発表者名
  Bono H
- 雑誌名
  
  Seminars in Cancer Biology 15
  
  ページ: 290-299
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17710170
[雑誌論文] SayaMatcher : genome scale organization and systematic analysis of nuclear receptor response elements2005
- 著者名/発表者名
  Bono H
- 雑誌名
  
  Gene 364
  
  ページ: 74-78
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] The study of metabolic pathways in tumors based on the transcriptome2005
- 著者名/発表者名
  Bono, H., Okazaki, Y.
- 雑誌名
  
  Seminars in Cancer Biology 15(4)
  
  ページ: 290-299
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] SayaMatcher : genome scale organization and systematic analysis of nuclear receptor response elements2005
- 著者名/発表者名
  Bono H
- 雑誌名
  
  Gene 364
  
  ページ: 74-78
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17710170
[雑誌論文] The study of metabolic pathways in tumors based on the transcriptome2005
- 著者名/発表者名
  Bono H
- 雑誌名
  
  Seminars in Cancer Biology 15
  
  ページ: 290-299
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] Identification and functional analysis of consensus androgen response elements in human prostate cancer cells.2004
- 著者名/発表者名
  Horie-Inoue, K., Bono, H., Okazaki, Y., Inoue, S.
- 雑誌名
  
  Biochem Biophys Res Commun. 325(4)
  
  ページ: 1312-1317
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] MaXML : Mouse Annotation XML2004
- 著者名/発表者名
  Kasukawa, T., Bono, H., Hayashizaki, Y., Okazaki, Y., Matsuda, H.
- 雑誌名
  
  In Silico Biology 4(3)
  
  ページ: 7-15
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] Identification and functional analysis of consensus androgen response elements in human prostate cancer cells2004
- 著者名/発表者名
  K.Horie-Inoue, H.Bono, Y.Okazaki, S.Inoue
- 雑誌名
  
  Biochem Biophys Res Commun. 325・4
  
  ページ: 1312-1317
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] Systematic expression profiling of the mouse transcriptome using RIKEN cDNA microarrays2003
- 著者名/発表者名
  Bono, H., Yagi, K., Kasukawa, T., Nikaido, I., Tominaga, N., Miki, R., Mizuno, Y., Tomaru, Y., Goto, Nitanda, H., Shimizu, D., Makino, H., Morita, T., Fujiyama, J., Sakai, T., Shimoji, T., Hume, D.A., Hayashizaki, Y., Okazaki, Y., RIKEN GER Group ; GSL Members
- 雑誌名
  
  Genome Research 13(6b)
  
  ページ: 1318-1323
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] Introduction to the practical analysis of DNA microarray data2003
- 著者名/発表者名
  Bono H, Nakao MC.
- 雑誌名
  
  Tanpakushitsu Kakusan Koso. 48(2)
  
  ページ: 167-172
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] Comprehensive analysis of the mouse metabolome based on the transcriptome.2003
- 著者名/発表者名
  Bono, H., Nikaido, I., Kasukawa, T., Hayashizaki, Y., Okazaki, Y., RIKEN GER Group ; GSL Members
- 雑誌名
  
  Genome Research 13(6b)
  
  ページ: 1345-1349
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] FANTOM-DB : database of functional annotation of RIKEN mouse cDNA clones2003
- 著者名/発表者名
  Bono H, Kasukawa T, Furuno M, Hayashizaki Y, Okazaki Y.
- 雑誌名
  
  Seikagaku 75(2)
  
  ページ: 149-152
- NAID
  10010528069
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] Systematic expression profiling of the mouse transcriptome using RIKEN cDNA microarrays2003
- 著者名/発表者名
  Bono H
- 雑誌名
  
  Genome Research 13
  
  ページ: 1318-1323
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] マイクロアレイ・DANチップデータを活用する2003
- 著者名/発表者名
  坊農秀雅
- 雑誌名
  
  蛋白質核酸酵素 48
  
  ページ: 167-172
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] Comprehensive analysis of the mouse metabolome based on the transcriptome2003
- 著者名/発表者名
  Bono H
- 雑誌名
  
  Genome Research 13
  
  ページ: 1345-1349
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] FANTOM-DB : マウスcDNA機能アノテーションデータベース2003
- 著者名/発表者名
  坊農秀雅
- 雑誌名
  
  生化学 75
  
  ページ: 149-152
- NAID
  10010528069
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] Functional transcriptomes : comparative analysis of biological pathways and processes in eukaryotes to infer genetic networks among transcripts2002
- 著者名/発表者名
  Bono H
- 雑誌名
  
  Current Opinion in Structural Biology 12
  
  ページ: 355-361
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] Functional transcriptomes comparative analysis of biological pathways and processes in eukaryotes to infer genetic networks among transcripts2002
- 著者名/発表者名
  Bono, H., Okazaki Y.
- 雑誌名
  
  Current Opinion in Structural Biology 12
  
  ページ: 355-361
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] READ : RIKEN Expression Array Database2002
- 著者名/発表者名
  Bono H
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research 30
  
  ページ: 211-213
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] FANTOM DB : database of Functional Annotation of RIKEN Mouse cDNA Clones2002
- 著者名/発表者名
  Bono, H., Kasukawa, T., Furuno, M., Hayashizaki, Y., Okazaki, Y.
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research 30
  
  ページ: 116-118
- NAID
  10010528069
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] READ : RIKEN Expression Array Database Nucleic2002
- 著者名/発表者名
  Bono, H., Kasukawa, T., Hayashizaki, Y., Okazaki, Y.
- 雑誌名
  
  Acids Research 30
  
  ページ: 211-213
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] FANTOM DB : database of Functional Annotation of RIKEN Mouse cDNA Clones2002
- 著者名/発表者名
  Bono H
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research 30
  
  ページ: 116-118
- NAID
  10010528069
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[学会発表] Genome Editing Meta-Database By Computationally Automated Knowledge Extraction from Literatures2023
- 著者名/発表者名
  Takayuki Suzuki, Hidemasa Bono
- 学会等名
  Plant & Animal Genome Conference (PAG30)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K19118
[学会発表] Meta-Analysis of Public Apis Genomes and Transcriptomes2023
- 著者名/発表者名
  Hidemasa Bono, Kakeru Yokoi
- 学会等名
  Plant & Animal Genome Conference (PAG30)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K19118
[学会発表] バイオDX産学共創拠点におけるデータ解析基盤技術開発2023
- 著者名/発表者名
  坊農秀雅
- 学会等名
  第67回日本応用動物昆虫学会大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K19118
[学会発表] ゲノム編集のための昆虫遺伝子機能アノテーションワークフロー2022
- 著者名/発表者名
  坊農秀雅, 坂本卓磨, 粕川雄也, 天竺桂弘子
- 学会等名
  第45回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K19118
[学会発表] ゲノム編集ターゲット遺伝子のデータベースの構築とその解析2022
- 著者名/発表者名
  鈴木貴之, 坊農秀雅
- 学会等名
  日本ゲノム編集学会第7回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K19118
[学会発表] ゲノム編集メタデータベースの構築 ~文献情報からの知識抽出~2022
- 著者名/発表者名
  鈴木貴之, 坊農秀雅
- 学会等名
  第45回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K19118
[学会発表] ゲノム編集メタデータベースの開発 -文献からの情報抽出-2022
- 著者名/発表者名
  鈴木貴之, 坊農秀雅
- 学会等名
  トーゴーの日シンポジウム2022
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K19118
[学会発表] デバアノテーションのひみつ2017
- 著者名/発表者名
  坊農秀雅
- 学会等名
  2017年度国立遺伝学研究所研究集会 Annotathon2017
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K14602
[学会発表] ハダカデバネズミのトランスクリプトームデータの再解析2017
- 著者名/発表者名
  坊農秀雅
- 学会等名
  第76回日本癌学会学術総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K14602
[学会発表] Can the silkworm (Bombyx mori) be used as a human disease model?2016
- 著者名/発表者名
  Tabunoki T, Ito K, Bono H and Yokoyama T
- 学会等名
  ICE 2016 XXV International Congress of Entomology
- 発表場所
  フロリダ・オーランド・アメリカ合衆国
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26450465
[学会発表] 公共データベースを利用したカイコガエノラーゼ配列の抽出と特性解析2016
- 著者名/発表者名
  菊池晃、伊藤克彦、横山岳、坊農秀雅、天竺桂弘子
- 学会等名
  第2回蚕糸・昆虫機能利用関東地区学術講演会
- 発表場所
  宇都宮大学・栃木県・宇都宮市
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26450465
[学会発表] 公共データベースを使い倒した知のめぐりのよい研究―Kaiko Functional Annotation Pipelineを例に2016
- 著者名/発表者名
  坊農秀雅、天竺桂弘子
- 学会等名
  第1回オモロイ生き物研究会
- 発表場所
  北海道・札幌市・定山渓
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26450465
[学会発表] カイコガエノラーゼのcDNAクローニングおよび特性解析2015
- 著者名/発表者名
  菊地晃・伊藤克彦・坊農秀雅・横山岳・天竺桂弘子
- 学会等名
  第３８回日本分子生物学会年会・第８８回日本生化学会大会合同大会
- 発表場所
  神戸ポートアイランド
- 年月日
  2015-12-02
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26450465
[学会発表] カイコガABCトランスポーターABCB,ABCCのmRNA発現解析2015
- 著者名/発表者名
  市野史佳・伊藤克彦・横山岳・坊農秀雅・天竺桂弘子
- 学会等名
  第３８回日本分子生物学会年会・第８８回日本生化学会大会合同大会
- 発表場所
  神戸ポートアイランド
- 年月日
  2015-12-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26450465
[学会発表] カイコガの新規SOD予測遺伝子の配列およびmRNA発現解析2015
- 著者名/発表者名
  小林祐太・野島陽水・伊藤克彦・坊農秀雅・横山岳・天竺桂弘子
- 学会等名
  第３８回日本分子生物学会年会・第８８回日本生化学会大会合同大会
- 発表場所
  神戸ポートアイランド
- 年月日
  2015-12-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26450465
[学会発表] ゲノムセントラルな遺伝子発現情報融通システムYUZ(柚子)2007
- 著者名/発表者名
  坊農秀雅
- 学会等名
  第30回日本分子生物学会年会(BMB2007)
- 発表場所
  横浜
- 年月日
  2007-12-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17710170
[学会発表] YUZ: an environment for integration and analysis of gene regulatory networks2007
- 著者名/発表者名
  Bono H.
- 学会等名
  Genome Informatics
- 発表場所
  Cold Spring Harbor, NYUSA
- 年月日
  2007-11-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17710170
[学会発表] Identification of key uric acid synthesis pathway in a unique mutant silkworm Bombyx mori.，
- 著者名/発表者名
  Hiroko Tabunoki, Katsuhiko Ito, Takeshi Yokoyama, Hidemasa Bono and Hajime Fugo
- 学会等名
  Seventh international symposium on molecular insect science
- 発表場所
  アムステルダム、オランダ
- 年月日
  2014-07-13 – 2014-07-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26450465

1. 三浦恭子 (80583062)

共同の研究課題数: 4件

共同の研究成果数: 0件
2. 天竺桂弘子 (80434190)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 13件
3. 坂井祐介 (60615722)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
4. 横山岳 (20210635)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 9件
5. 松田秀雄 (50183950)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
6. 清水厚志 (30327655)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 広田喜一 (00283606)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 岡崎康司 (80280733)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 八木研 (60323482)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 二階堂愛 (00383290)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
11. 松田達志 (00286444)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
12. 松尾禎之 (50447926)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
13. 粕川雄也 (10304031)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
14. 浮穴和義 (10304370)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 岩越栄子 (50311296)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
16. 成松勇樹 (50994696)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
17. 井川武 (00507197)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
18. 中條岳志 (50788578)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
19. 山本拓也 (60546993)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
20. 伊藤克彦

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 10件
21. 大岩祐基

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
22. 廣田喜一

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 4件
23. 岡香織

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

坊農 秀雅 BONO Hidemasa

研究課題

研究成果

共同研究者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

データ駆動型ゲノム育種を実現するデータ解析基盤技術の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ゲノムスケールの転写因子結合サイトと遺伝子発現データの統合解析環境の構築研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[図書] 今日から使えるデータベース・ウェブツール”GOLD様々な生物種のゲノム配列解読情報を集めたデータベース”2014

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] マイクロアレイデ「タ統計解析プロトコール2008

著者名/発表者名

出版者

データソース

[図書] バイオデータベースとウェブツールの手とり足とり活用法 第二版2007

著者名/発表者名

出版者

データソース

[図書] ゲノム情報はこう活かせ!2005

坊農秀雅 BONO Hidemasa

[図書] バイオデータベースとウェブツールの手とり足とり活用法第二版2007