曹纓 CAO Ying

研究者番号	20370091
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2012年度: 統計数理研究所, データ科学研究系, 助教 2012年度: 統計数理研究所, 大学共同利用機関等の部局等, 助教 2011年度: 統計数理研究所, データ科学系, 助教 2007年度 – 2010年度: 統計数理研究所, モデリング研究系, 助教 2005年度 – 2006年度: 統計数理研究所, モデリング研究系, 助手 2004年度: 統計数理研究所, 予測制御研究系, 助手
審査区分/研究分野	研究代表者生物多様性・分類研究代表者以外統計科学 / 生物多様性・分類
キーワード	研究代表者コドンモデル / 最尤法 / トポロジー探索 / クジラ目内部系統 / SARS解析 / multiple references / MCMC法 / カワイルカの系統関係 / ミトコンドリア・ゲノム / SARSの伝播機構 … もっと見る / ペンギン目の系統関係 / 分岐年代推定 / コドン置換モデル / ベイズMCMC法 / 最適なトポロジー探索 / ミトコンドリアDNA / 揚子江カワイルカ … もっと見る研究代表者以外最尤法 / 分子進化 / モデル / ミトコンドリア / モデル選択 / 分子系統樹 / ゲノム系統学 / Model selection / Codon-substitution model / Maximum likelihood / Molecular phylogeny / Molecular evolution / Modeling / 真核生物 / ハクジラ / ヒゲクジラ / 分子進化のモデル / ゲノムデータ / 推定の偏り / 真獣類 / ゲノム統計学 / ミススペシフィケーション / 分子系統樹推定 / コドン置換モデル / モデリング / AIC / グネツム / 機能的制約 / 分子系統学 / アラインメント / UCA仮説 / 家畜化 / 中立的進化 / 適応的進化 / 種サンプリング / ミトコンドリア系統樹 / 遺伝子系統樹 / 集団系統樹 / 種系統樹 / 連結配列 / ゲノム / モデル比較 / 系統樹推定隠す

ゲノム系統学の方法と実践
- 研究代表者
  
  長谷川政美
- 研究期間 (年度)
  2010 – 2012
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生物多様性・分類
- 研究機関
  統計数理研究所
ポストゲノム時代における分子系統樹推定法の研究
- 研究代表者
  
  足立淳
- 研究期間 (年度)
  2007 – 2009
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  統計科学
- 研究機関
  統計数理研究所
分子系統樹推定に用いるモデルの開発-哺乳類の多様性解明への応用-研究代表者
- 研究代表者
  
  曹纓
- 研究期間 (年度)
  2004 – 2006
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生物多様性・分類
- 研究機関
  統計数理研究所
分子進化のモデリングと分子系統樹推定法の開発
- 研究代表者
  
  長谷川政美
- 研究期間 (年度)
  2004 – 2006
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  統計科学
- 研究機関
  統計数理研究所

すべて 2009 2007 2006 2005 その他

すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] Our Ancestor : A Saga, Gene Tells听基因〓祖先的故事(中国語)2005
- 著者名/発表者名
  長谷川政美, 任文偉, 楊莉琴著, 曹纓, 鍾陽編集
- 総ページ数
  143
- 出版者
  上海科技教育出版社
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16770068
[雑誌論文] Complete nucleotide sequence and gene arrangement of the mitochondrial genome of the crab-eating frog Fejervarya cancrivora and evolutionary implications2009
- 著者名/発表者名
  Z. Ren, B. Zhu, E. Ma, J. Wen, T. Tu, Y. Cao, M. Hasegawa, Y. Zhong
- 雑誌名
  
  Gene 441
  
  ページ: 148-155
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19300099
[雑誌論文] Computational simulation of interactions between SARS coronavirus spike mutants and host species-specific receptors2007
- 著者名/発表者名
  Zhang, Y., Zheng, N., Nan, P., Cao, Y., Hasegawa, M., Zhong Y.
- 雑誌名
  
  Computational Biology and Chemistry 31
  
  ページ: 134-137
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16770068
[雑誌論文] Balaenoptera omurai is a newly discovered baleen whale that represents an ancient evolutionary lineage2006
- 著者名/発表者名
  Sasaki, T., Nikaido, M., Wada, S., Yamada, T., Cao, Y., Hasegawa, M., Okada, N.
- 雑誌名
  
  Molecular Phylogenetics and Evolution 41
  
  ページ: 40-52
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16770068
[雑誌論文] New candidate species most closely related to penguins2006
- 著者名/発表者名
  M.Watanabe, M.Nikaido, T.T.Tsuda, T.Kobayashi, D.Mindell, Y.Cao, N.Okada, M.Hasegawa
- 雑誌名
  
  Gene 378
  
  ページ: 65-73
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16300089
[雑誌論文] Balaenoptera omurai is a newly discovered baleen whale that represents an ancient evolutionary lineage2006
- 著者名/発表者名
  Sasaki, T., Nikaido, M., Wada, S., Yamada, T., Cao, Y., Hasegawa, M., Okada, N.
- 雑誌名
  
  Molecular Phylogenetics and Evolution in press
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16770068
[雑誌論文] Balaenoptera omurai is a newly discovered baleen whale that represents an ancient evolutionary lineage2006
- 著者名/発表者名
  Sasaki T., Nikaido M., Wada S., Yamada T.K., Cao Y., Hasegawa M., Okada N
- 雑誌名
  
  Mol. Phylogenet. Evol. 41
  
  ページ: 40-52
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16300089
[雑誌論文] New candidate species most closely related to penguins2006
- 著者名/発表者名
  Watanabe, M., Nikaido, M., Tsuda, T.T., Kobayashi, T., Mindell, D., Cao, Y., Okada, N., Hasegawa, M.
- 雑誌名
  
  Gene 378
  
  ページ: 65-73
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16770068
[雑誌論文] Mitochondrial phylogenetics and evolution of Mysticete whales2005
- 著者名/発表者名
  T.Sasaki, M.Nikaido, H.Hamilton, M.Goto, H.Kato, N.Kanda, L.A.Pastene, Y.Cao, R.E.Fordyce, M.Hasegawa, N.Okada
- 雑誌名
  
  Systematic Biology 54
  
  ページ: 77-90
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16300089
[雑誌論文] Detecting correlation between sequence and expression divergences in a comparative analysis of human serpin genes2005
- 著者名/発表者名
  Li, Z., Liu, Q., Song, M., Zheng, Y., Nan, P., Cao, Y., Chen, G., Li, Y., Zhong Y.
- 雑誌名
  
  BioSystems (in press)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16770068
[雑誌論文] Detecting correlation between sequence and expression divergences in a comparative analysis of human serpin genes2005
- 著者名/発表者名
  Li, Z., Liu, Q., Song, M., Zheng, Y., Nan, P., Cao, Y., Chen, G., Li, Y., Zhong Y.
- 雑誌名
  
  BioSystems 82
  
  ページ: 223-226
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16770068
[雑誌論文] Mitochondrial Phylogenetics and Evolution of Mysticete Whales2005
- 著者名/発表者名
  Sasaki, T., Nikaido, M., Hamilton, H., Goto, M., Kato, H., Kanda, N., Pastene, L.A., Cao, Y., Fordyce, R., Hasegawa, M., Okada, N.
- 雑誌名
  
  Systematic Biologists 54・1
  
  ページ: 1-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16770068
[雑誌論文] A molecular docking model of SARS-CoV S1 protein in complex with its receptor, human ACE22005
- 著者名/発表者名
  Zhang, Y., Zheng, N., Hao, P., Cao, Y., Zhong Y.
- 雑誌名
  
  Computational Biology and Chemistry 29
  
  ページ: 254-257
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16770068
[雑誌論文] Mitochondrial phylogenetics and evolution of Mysticete whales
- 著者名/発表者名
  T.Sasaki, M.Nikaido, H.Hamilton, M.Goto, H.Kato, N.Kanda, L.A.Pastene, Y.Cao, R.E.Fordyce, M.Hasegawa, N.Okada
- 雑誌名
  
  Syst.Biol. 54
  
  ページ: 77-90
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16300089
[学会発表] Molecular phylogeny and evolution of river dolphins: integration of mitochondrial DNA and SINE flanking sequences2007
- 著者名/発表者名
  Y. Cao
- 学会等名
  Evolution 2007 Conference
- 発表場所
  Christchurch, New Zealand
- 年月日
  2007-06-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19300099

1. 足立淳 (30370092)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
2. 長谷川政美 (60011657)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 5件
3. 米澤隆弘

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
4. 西原秀典 (10450727)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 松井淳

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件

曹 纓 CAO Ying

研究課題

研究成果

共同研究者

ゲノム系統学の方法と実践

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ポストゲノム時代における分子系統樹推定法の研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

分子系統樹推定に用いるモデルの開発-哺乳類の多様性解明への応用-研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

分子進化のモデリングと分子系統樹推定法の開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[図書] Our Ancestor : A Saga, Gene Tells听基因〓祖先的故事(中国語)2005

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[雑誌論文] Complete nucleotide sequence and gene arrangement of the mitochondrial genome of the crab-eating frog Fejervarya cancrivora and evolutionary implications2009

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Computational simulation of interactions between SARS coronavirus spike mutants and host species-specific receptors2007

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Balaenoptera omurai is a newly discovered baleen whale that represents an ancient evolutionary lineage2006

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] New candidate species most closely related to penguins2006

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Balaenoptera omurai is a newly discovered baleen whale that represents an ancient evolutionary lineage2006

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Balaenoptera omurai is a newly discovered baleen whale that represents an ancient evolutionary lineage2006

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] New candidate species most closely related to penguins2006

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Mitochondrial phylogenetics and evolution of Mysticete whales2005

著者名/発表者名

雑誌名

説明

データソース

[雑誌論文] Detecting correlation between sequence and expression divergences in a comparative analysis of human serpin genes2005

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Detecting correlation between sequence and expression divergences in a comparative analysis of human serpin genes2005

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Mitochondrial Phylogenetics and Evolution of Mysticete Whales2005

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] A molecular docking model of SARS-CoV S1 protein in complex with its receptor, human ACE22005

著者名/発表者名

曹纓 CAO Ying