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山田 悠介  Yamada Yusuke

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 20391708
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 東北大学, 国際放射光イノベーション・スマート研究センター, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2016年度 – 2018年度: 大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 助教
2017年度: 高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 助教
2009年度 – 2011年度: 大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 助教
2010年度: 高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 助教
2008年度: 高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 助教
2007年度: 大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 助教
2006年度: 大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 助手
審査区分/研究分野
研究代表者
構造生物化学
研究代表者以外
構造生物化学 / 知能機械学・機械システム
キーワード
研究代表者
X線結晶構造解析 / 低エネルギーSAD法 / 構造生物学 / 放射光 / 蛋白質 / 量子ビーム / 放射光ビームライン / 自動化 / タンパク質X線結晶構造解析 / タンパク質結晶構造解析 … もっと見る / X線結晶解析 / SAD法 / 低エネルギーX線 / 位相決定 / X線結晶学 / 放射線損傷 … もっと見る
研究代表者以外
X線結晶構造解析 / POMT2 / POMT1 / 結晶構造解析 / 膜タンパク質 / ジストログリカン / 筋ジストロフィー / 測定の自動化技術 / 可視化 / 蛋白質 / 校正 / 知能機械 / ロボティクス / タンパク質 / X線結晶析 / 分子認識 / DNA修復 / 転写制御 / ユビキチン / X線結晶解析 隠す
  • 研究課題

    (7件)
  • 研究成果

    (38件)
  • 共同研究者

    (11人)
  •  回折イメージング法による結晶化ドロップ評価および最適結晶化条件探索の自動化研究代表者

    • 研究代表者
      山田 悠介
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2018
    • 研究種目
      挑戦的萌芽研究
    • 研究分野
      構造生物化学
    • 研究機関
      大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構
  •  膜タンパク質複合体のS-SAD法による構造解析

    • 研究代表者
      加藤 龍一
    • 研究期間 (年度)
      2015 – 2017
    • 研究種目
      挑戦的萌芽研究
    • 研究分野
      構造生物化学
    • 研究機関
      大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構
  •  超微小タンパク質結晶試料可視化技術の開発による全自動データ収集の実現

    • 研究代表者
      五十嵐 教之
    • 研究期間 (年度)
      2009 – 2011
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      構造生物化学
    • 研究機関
      大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構
  •  低エネルギーSAD法における回折データの高シグナル低ノイズ化に向けた技術開発研究代表者

    • 研究代表者
      山田 悠介
    • 研究期間 (年度)
      2009 – 2011
    • 研究種目
      若手研究(A)
    • 研究分野
      構造生物化学
    • 研究機関
      大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構
  •  タンパク質X線結晶構造解析を加速する結晶装填システムの高度化

    • 研究代表者
      平木 雅彦
    • 研究期間 (年度)
      2008 – 2010
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      知能機械学・機械システム
    • 研究機関
      大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構
  •  転写制御とDNA修復に関わるLys63結合ユビキチン認識機構の解明

    • 研究代表者
      川崎 政人
    • 研究期間 (年度)
      2007 – 2008
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      構造生物化学
    • 研究機関
      大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構
  •  放射光低エネルギーX線を用いた蛋白質結晶構造解析手法の開発研究代表者

    • 研究代表者
      山田 悠介
    • 研究期間 (年度)
      2006 – 2007
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      構造生物化学
    • 研究機関
      大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構

すべて 2018 2017 2016 2012 2011 2010 2009 2008 2007

すべて 雑誌論文 学会発表

  • [雑誌論文] In-situ data collection at the photon factory macromolecular crystallography beamlines.2016

    • 著者名/発表者名
      Yamada, Y., Hiraki, M., Matsugaki, N., Kato, R., Senda, T.
    • 雑誌名

      AIP Conf. Proc.

      巻: 1741 ページ: 050023-050023

    • DOI

      10.1063/1.4952943

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24112009, KAKENHI-PROJECT-16H02282, KAKENHI-PROJECT-15K14468
  • [雑誌論文] Fully Automated Data Collection Using PAM and the Development of PAM/SPACE Reversible Cassettes2010

    • 著者名/発表者名
      Masahiko Hiraki, Shokei Watanabe, Leonard M.G.Chavas, Yusuke Yamada, Naohiro Matsugaki, Noriyuki Igarashi, Soichi Wakatsuki, Masahiro Fujihashi, Kunio Miki, Seiki Baba, Go Ueno, Masaki Yamamoto, Mamoru Suzuki, Atsushi Nakagawa, Nobuhisa Watanabe, Isao Tanaka
    • 雑誌名

      American Institute of Physics Vol.1234

      ページ: 673-676

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20560251
  • [学会発表] Integrated database for structural biology experiments at the Photon Factory2018

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Yamada
    • 学会等名
      SRI2018
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14686
  • [学会発表] Photon Factoryにおける膜タンパク質結晶構造解析パイプライン2018

    • 著者名/発表者名
      山田悠介・田辺幹雄・尾関雅弘・菅原隆広・千田俊哉・加藤龍一
    • 学会等名
      日本結晶学会 2018年度年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14686
  • [学会発表] Fully automated data collection system at the Photon Factory macromolecular crystallography beamlines2018

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Yamada, Akira Shinoda, Masahiko Hiraki, Masahide Hikita, Naohiro Matsugaki, Toshiya Senda
    • 学会等名
      AsCA2018
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14686
  • [学会発表] PFタンパク質X線結晶構造解析ビームラインにおける自動化の現状と将来2018

    • 著者名/発表者名
      山田悠介
    • 学会等名
      PF研究会「X線とクライオ電子顕微鏡で挑む生命の機能とかたち」
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14686
  • [学会発表] PFタンパク質結晶構造解析ビームラインによる構造生物学研究支援2018

    • 著者名/発表者名
      山田悠介、松垣直宏、引田理英、平木雅彦、田辺幹雄、加藤龍一、千田俊哉
    • 学会等名
      第91回生化学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14686
  • [学会発表] BINDSにおけるPFタンパク質結晶構造解析ビームラインの支援と高度化2017

    • 著者名/発表者名
      山田悠介、引田理英、松垣直宏、平木雅彦、田辺幹雄、湯本史明、加藤龍一、千田俊哉
    • 学会等名
      日本結晶学会平成29年度年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K14468
  • [学会発表] PFタンパク質結晶構造解析ビームラインによる構造生物学研究支援2017

    • 著者名/発表者名
      山田 悠介、松垣 直宏、引田 理英、平木 雅彦、加藤 龍一、千田 俊哉
    • 学会等名
      ConBio2017
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K14468
  • [学会発表] ヒトタンパク質の哺乳動物を用いた細胞内結晶化2017

    • 著者名/発表者名
      小祝孝太郎、月本準、東哲也、真板宣夫、山田悠介、平木雅彦、加藤龍一、Leonard M. G. Chavas、千田俊哉、伊藤孝司、湯本史明
    • 学会等名
      第17回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K14468
  • [学会発表] ヒトタンパク質の哺乳動物細胞を用いた細胞内結晶化2017

    • 著者名/発表者名
      小祝 孝太郎、月本 準、東 哲也、真板 宣夫、山田 悠介、平木 雅彦、加藤 龍一、千田 俊哉、Chavas Leonard、伊藤 孝司、湯本 史明
    • 学会等名
      ConBio2017
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K14468
  • [学会発表] 146.Upgrade of a macromolecular crystallography beamline, BL-17A, at the Photon Factory2016

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Yamada
    • 学会等名
      12th International Conference on Biology and Synchrotron Radiation
    • 発表場所
      サンフランシスコ(アメリカ合衆国)
    • 年月日
      2016-08-23
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K14686
  • [学会発表] PF構造生物ビームラインにおける全自動回折実験システムの高度化と汎用化2012

    • 著者名/発表者名
      山田悠介
    • 学会等名
      第25回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
    • 発表場所
      鳥栖(佐賀)
    • 年月日
      2012-01-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21687010
  • [学会発表] PF構造生物ビームラインにおける全自動回折実験システムの高度化と汎用化2012

    • 著者名/発表者名
      山田悠介、松垣直宏、平木雅彦、Leonard M. G. Chavas、五十嵐教之、若槻壮市
    • 学会等名
      第25回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
    • 発表場所
      鳥栖市
    • 年月日
      2012-01-08
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21570124
  • [学会発表] PF構造生物ビームラインにおけるデータ管理2012

    • 著者名/発表者名
      山田悠介
    • 学会等名
      第29回PFシンポジウム
    • 発表場所
      つくば国際会議場
    • 年月日
      2012-03-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21687010
  • [学会発表] PF構造生物ビームラインにおけるデータ管理2012

    • 著者名/発表者名
      山田悠介
    • 学会等名
      第29回PFシンポジウム
    • 発表場所
      つくば(茨城県)
    • 年月日
      2012-03-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21687010
  • [学会発表] PF構造生物ビームラインにおける全自動回折実験システムの高度化と汎用化2012

    • 著者名/発表者名
      山田悠介
    • 学会等名
      第25回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
    • 発表場所
      鳥栖
    • 年月日
      2012-01-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21687010
  • [学会発表] PF構造生物学ビームラインにおける回折データセットの収集と解析の自動化2011

    • 著者名/発表者名
      山田悠介
    • 学会等名
      第28回PFシンポジウム
    • 発表場所
      つくば国際会議場
    • 年月日
      2011-07-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21687010
  • [学会発表] タンパク質結晶自動交換ロボットPAM2011

    • 著者名/発表者名
      平木雅彦、Leonard M.G.Chavas、山田悠介、松垣直宏、五十嵐教之、若槻壮市
    • 学会等名
      日本結晶学会年会
    • 発表場所
      大阪大学コンベンションセンター、大阪
    • 年月日
      2011-12-03
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20560251
  • [学会発表] PF構造生物ビームラインにおける高度化への取り組み2011

    • 著者名/発表者名
      山田悠介
    • 学会等名
      平成23年度日本結晶学会年会及び総会
    • 発表場所
      北海道大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21687010
  • [学会発表] Automation of data collection and processing at the Photon Factory macromolecular crystallography beamlines2011

    • 著者名/発表者名
      Yusuke Yamada, Masahiko Hiraki, Naohiro Matsugaki, Leonard M. G. Chavas, Noriyuki Igarashi and Soichi Wakatsuki
    • 学会等名
      A Special Symposium Celebrating the 40th Anniversary of the Protein Data Bank(PDB40)、Cold Spring Harbor
    • 発表場所
      NY(US)
    • 年月日
      2011-10-29
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21570124
  • [学会発表] PF構造生物学ビームラインにおける回折データセットの収集と解析の自動化2011

    • 著者名/発表者名
      山田悠介
    • 学会等名
      第28回PFシンポジウム
    • 発表場所
      つくば(茨城県)
    • 年月日
      2011-07-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21687010
  • [学会発表] タンパク質結晶自動交換ロボットPAM2011

    • 著者名/発表者名
      平木雅彦、Leonard M.G.Chavas、山田悠介、松垣直宏、五十嵐教之、若槻壮市
    • 学会等名
      第24回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
    • 発表場所
      つくば国際会議場、茨城
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20560251
  • [学会発表] PF構造生物ビームラインにおける高度化への取り組み2011

    • 著者名/発表者名
      山田悠介
    • 学会等名
      平成23年度日本結晶学会年会及び総会
    • 発表場所
      札幌(北海道)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21687010
  • [学会発表] タンパク質結晶交換ロボットPAM2010

    • 著者名/発表者名
      平木雅彦、Chavas Leonard M.G.、山田悠介、松垣直宏、五十嵐教之、若槻壮市
    • 学会等名
      PF研究会「放射光利用による構造生物の将来像」
    • 発表場所
      KEK小林ホール、茨城
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20560251
  • [学会発表] Upgrade of High-throughput Sample Exchange Robots PAM and Development of PAM/SPACE Reversible Cassettes2010

    • 著者名/発表者名
      Masahiko Hiraki, Shokei Watanabe, Leonard M.G.Chavas, Yusuke Yamada, Naohiro Matsugaki, Noriyuki Igarashi, Soichi Wakatsuki, Masahiro Fujihashi, Kunio Miki, Seiki Baba, Go Ueno, Masaki Yamamoto, Mamoru Suzuki, Atsushi Nakagawa, Nobuhisa Watanabe, Isao Tanaka
    • 学会等名
      回折構造生物学に関する国際シンポジウムISDSB2010
    • 発表場所
      パリSUD大学、フランス
    • 年月日
      2010-05-28
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20560251
  • [学会発表] PF構造生物ビームラインの高度化と自動化2010

    • 著者名/発表者名
      山田悠介
    • 学会等名
      平成22年度日本結晶学会年会
    • 発表場所
      大阪大学コンベンションセンター
    • 年月日
      2010-12-03
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21687010
  • [学会発表] 高エネ研フォトンファクトリーにおける生体高分子X線結晶構造解析ビームラインの高度化2010

    • 著者名/発表者名
      山田悠介
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会第83回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2010-12-08
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21687010
  • [学会発表] より高度なタンパク質X線結晶構造解析のための回折データ処理の自動化2010

    • 著者名/発表者名
      山田悠介
    • 学会等名
      第24回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
    • 発表場所
      つくば国際会議場
    • 年月日
      2010-01-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21687010
  • [学会発表] 結晶交換システムPAMの高度化2010

    • 著者名/発表者名
      平木雅彦、山田悠介、松垣直宏、Leonard M.G.Chavas、五十嵐教之、若槻壮市
    • 学会等名
      第23回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
    • 発表場所
      イーグレ姫路、兵庫
    • 年月日
      2010-01-08
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20560251
  • [学会発表] 蛋白質結晶自動交換ロボットの現状と今後の予定2010

    • 著者名/発表者名
      平木雅彦、Leonard M.G.Chavas、山田悠介、松垣直宏、五十嵐教之、若槻壮市
    • 学会等名
      第27回PFシンポジウム
    • 発表場所
      つくば国際会議場、茨城
    • 年月日
      2010-03-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20560251
  • [学会発表] PF構造生物ビームラインにおける全自動解説データ収集の実現への取り組み2009

    • 著者名/発表者名
      平木雅彦、山田悠介、松垣直宏、五十嵐教之、若槻壮市
    • 学会等名
      第26回PFシンポジウム
    • 発表場所
      つくば国際会議場、茨城
    • 年月日
      2009-03-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20560251
  • [学会発表] タンパク質結晶交換ロボットによる測定の自動化とサンプル用カセットの共通化2009

    • 著者名/発表者名
      平木雅彦、山田悠介、松垣直宏、五十嵐教之、若槻壮市、藤橋雅宏、上野剛、馬場清喜、鈴木守
    • 学会等名
      第22回PF日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
    • 発表場所
      東京大学山上会館、東京
    • 年月日
      2009-01-11
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20560251
  • [学会発表] Current status and developments of macromolecular crystallography beamlines at the Photon Factory2009

    • 著者名/発表者名
      Masahiko Hiraki, Leonard Chavas, Yusuke Yamada, Naohiro Matsugaki, Noriyuki Igarashi, Soichi Wakatsuki
    • 学会等名
      アジア結晶学会AsCA2009
    • 発表場所
      北京Jing Yi Hotel,中国
    • 年月日
      2009-10-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20560251
  • [学会発表] Fully-automated data collection using PAM and development of PAM/SPACE reversible cassettes2009

    • 著者名/発表者名
      Masahiko Hiraki, Shokei Watanabe, Leonard M.G.Chavas, Yusuke Yamada, Naohiro Matsugaki, Noriyuki Igarashi, Soichi Wakatsuki, Masahiro Fujihashi, Kunio Miki, Seiki Baba, Go Ueno, Masaki Yamamoto, 鈴木守, Atsushi Nakagawa, Nobuhisa Watanabe, Isao Tanaka
    • 学会等名
      放射光装置に関する国際会議SRI2009
    • 発表場所
      メルボルン国際会議場,オーストラリア
    • 年月日
      2009-10-01
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20560251
  • [学会発表] Approach for auto-mated data collection at the Photon Factory macromolecular crystal-lography beamlines2008

    • 著者名/発表者名
      Masahiko Hiraki, Naohiro Matsugaki, Yusuke Yamada, Noriyuki Igarashi, Yurii Gaponov, Shokei Watanabe, Wataru Uda, Kumiko Sasajima, Nobuo pHonda, Soichi Wakatsuki
    • 学会等名
      国際結晶学会IUCr2008
    • 発表場所
      グランキューブ大阪国際会議場、大阪
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20560251
  • [学会発表] フォトンファクトリーにおける低エネルギー利用実験の実践と今後の展開2008

    • 著者名/発表者名
      山田 悠介
    • 学会等名
      第21回日本放射光学会年会 放射光科学合同シンポジウム
    • 発表場所
      立命館大学びわこ草津キャンパス
    • 年月日
      2008-01-14
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18770098
  • [学会発表] Recent developments for lower energy SAD phasing in the Photon Factory macromolecular crystallography beamline2007

    • 著者名/発表者名
      Y. Yamada, N. Igarashi, N. Matsugaki, M. Hiraki, M. Kawasaki, R. Kato and S. Wakatsuki
    • 学会等名
      Second Asia-Oceania Forum for Synchrotron Radiation Research
    • 発表場所
      新竹(台湾)
    • 年月日
      2007-11-02
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18770098
  • 1.  松垣 直宏 (50342598)
    共同の研究課題数: 4件
    共同の研究成果数: 16件
  • 2.  若槻 壮市 (00332114)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 14件
  • 3.  加藤 龍一 (50240833)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 5件
  • 4.  五十嵐 教之 (80300672)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 14件
  • 5.  平木 雅彦 (20282676)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 14件
  • 6.  川崎 政人 (00342600)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 7.  牧尾 尚能 (00467474)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 8.  萬谷 博 (20321870)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 9.  鈴木 喜大
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 10.  RAHIGHI Simin
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 11.  ROHAIM Ahmed
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件

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