山田和範 Yamada Kazunori

研究者番号	20756217
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 東北大学, 未踏スケールデータアナリティクスセンター, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2018年度 – 2020年度: 東北大学, 情報科学研究科, 准教授 2016年度 – 2017年度: 東北大学, 情報科学研究科, 助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分62010:生命、健康および医療情報学関連研究代表者以外進化生物学
キーワード	研究代表者機械学習 / 配列アライメント / 生物学的配列 / 配列類似性検索 / 文字列 / 生物学的文字列 / 配列解析 / 人工知能研究代表者以外相同性検索 / 立体構造 … もっと見る / SARS-CoV-2 / FFT / ロングリードシーケンサー / 巨大アラインメント / タンパク質立体構造 / ウイルスゲノム / 塩基配列 / タンパク質 / 配列解析 / 計算プログラム / 多重配列アラインメント隠す

人工知能で目指すアミノ酸配列類似性検索法の高速化および高感度化研究研究代表者
- 研究代表者
  
  山田和範
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2020
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  東北大学
MAFFT多重アラインメントプログラムの大量配列データへの対応と機能拡張
- 研究代表者
  
  加藤和貴
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2020
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  進化生物学
- 研究機関
  大阪大学

すべて 2021 2018 2017 2016

すべて雑誌論文

[雑誌論文] Developing a Novel Recurrent Neural Network Architecture with Fewer Parameters and Good Learning Performance2021
- 著者名/発表者名
  YAMADA Kazunori D、LIN Fangzhou、NAKAMURA Tsukasa
- 雑誌名
  
  Interdisciplinary Information Sciences
  
  巻: 27 号: 1 ページ: 25-40
- DOI
  10.4036/iis.2020.R.01
- NAID
  130008009391
- ISSN
  1340-9050, 1347-6157
- 言語
  英語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19J00950, KAKENHI-PROJECT-18K18143
[雑誌論文] De novo profile generation based on sequence context specificity with the long short-term memory network2018
- 著者名/発表者名
  Yamada KD, Kinoshita K
- 雑誌名
  
  BMC Bioinformatics
  
  巻: 19 号: 1 ページ: 272-272
- DOI
  10.1186/s12859-018-2284-1
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18143
[雑誌論文] Parallelization of MAFFT for large-scale multiple sequence alignments2018
- 著者名/発表者名
  Nakamura Tsukasa、Yamada Kazunori D、Tomii Kentaro、Katoh Kazutaka
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 印刷中号: 14 ページ: 2490-2492
- DOI
  10.1093/bioinformatics/bty121
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07464, KAKENHI-PROJECT-17J06457
[雑誌論文] MAFFT online service: multiple sequence alignment, interactive sequence choice and visualization2017
- 著者名/発表者名
  Katoh Kazutaka、Rozewicki John、Yamada Kazunori D.
- 雑誌名
  
  Briefings in Bioinformatics
  
  巻: 印刷中号: 4 ページ: 1160-1166
- DOI
  10.1093/bib/bbx108
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07464
[雑誌論文] Application of the MAFFT sequence alignment program to large data―reexamination of the usefulness of chained guide trees2016
- 著者名/発表者名
  Yamada KD, Tomii K, Katoh K
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 32 号: 21 ページ: 3246-3251
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btw412
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07464

1. 加藤和貴 (70378868)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
2. 富井健太郎 (40357570)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件

山田 和範 Yamada Kazunori

研究課題

研究成果

共同研究者

人工知能で目指すアミノ酸配列類似性検索法の高速化および高感度化研究研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

MAFFT多重アラインメントプログラムの大量配列データへの対応と機能拡張

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Developing a Novel Recurrent Neural Network Architecture with Fewer Parameters and Good Learning Performance2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

ISSN

言語

データソース

[雑誌論文] De novo profile generation based on sequence context specificity with the long short-term memory network2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Parallelization of MAFFT for large-scale multiple sequence alignments2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] MAFFT online service: multiple sequence alignment, interactive sequence choice and visualization2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Application of the MAFFT sequence alignment program to large data―reexamination of the usefulness of chained guide trees2016

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

山田和範 Yamada Kazunori