上坂将弘 Uesaka Masahiro

研究者番号	20756499
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 東北大学, 生命科学研究科, 助教
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2025年度: 東北大学, 生命科学研究科, 助教 2022年度 – 2023年度: 東北大学, 生命科学研究科, 助教 2018年度 – 2022年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 研究員
審査区分/研究分野	研究代表者小区分44020:発生生物学関連 / 学術変革領域研究区分(Ⅲ) 研究代表者以外学術変革領域研究区分(Ⅲ) / 生物系
キーワード	研究代表者遺伝子発現制御 / バイオインフォマティクス / EvoDevo / エピジェネティクス / 反復説 / 進化発生学 / 深層学習 / 進化可能性 / 進化発生 / 発生学 / 比較エピゲノム / 発生 / 進化 … もっと見る研究代表者以外 … もっと見る進化発生学 / 進化可能性 / 動物 / 古生物学 / 生物情報学 / エピジェネティクス / ゲノム / 比較発生 / 砂時計モデル / 反復説 / EvoDevo / バイオインフォマティクス / 発生 / 安定性 / 発生生物学 / 進化生物学 / 頑健性 / 発生安定性 / ゆらぎ / 発生拘束 / 進化発生生物学 / 進化隠す

進化可能性の変動史を観測する科学の創成：生物情報学・進化発生学・古生物学の統合
- 研究代表者
  
  平沢達矢
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2027
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(B)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅲ)
- 研究機関
  東京大学
深層学習による形態予測から迫る鳥類の翼の進化可能性変動史研究代表者
- 研究代表者
  
  上坂将弘
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2027
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(B)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅲ)
- 研究機関
  東北大学
脊椎動物器官発生における遺伝子制御活性解析による進化と発生の反復傾向の実体解明研究代表者
- 研究代表者
  
  上坂将弘
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分44020:発生生物学関連
- 研究機関
  東北大学
脊椎動物における進化と発生の反復傾向の検証に向けた発生時系列の遺伝子制御動態解析研究代表者
- 研究代表者
  
  上坂将弘
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2020
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分44020:発生生物学関連
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
脊索動物胚発生の分子発生システムゆらぎ測定と進化的保存性
- 研究代表者
  
  入江直樹
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2021
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  東京大学

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2019 2018 2017

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Genomic screening of fish‐specific genes in gnathostomes and their functions in fin development2024
- 著者名/発表者名
  Kudoh Hidehiro、Yonei‐Tamura Sayuri、Abe Gembu、Iwakiri Junichi、Uesaka Masahiro、Makino Takashi、Tamura Koji
- 雑誌名
  
  Development, Growth & Differentiation
  
  巻: 66 号: 3 ページ: 235-247
- DOI
  10.1111/dgd.12918
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15133, KAKENHI-PROJECT-22K06232, KAKENHI-PROJECT-21K19202, KAKENHI-PROJECT-22KJ0186, KAKENHI-PUBLICLY-21H05768, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-23K23890, KAKENHI-PROJECT-23K28183
[雑誌論文] Hagfish genome elucidates vertebrate whole-genome duplication events and their evolutionary consequences2024
- 著者名/発表者名
  Yu Daqi, Ren Yandong, Uesaka Masahiro, Beavan Alan J. S., Muffato Matthieu, et al.
- 雑誌名
  
  Nature Ecology & Evolution
  
  巻: 8 号: 3 ページ: 519-535
- DOI
  10.1038/s41559-023-02299-z
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15133, KAKENHI-PROJECT-23K05881
[雑誌論文] Distinguishing Evolutionary Conservation from Derivedness.2022
- 著者名/発表者名
  Jason Cheok Kuan Leong*, Masahiro Uesaka, Naoki Irie*
- 雑誌名
  
  Life
  
  巻: 12(3), 440 号: 3 ページ: 440-440
- DOI
  10.3390/life12030440
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06387
[雑誌論文] Derivedness Index for Estimating Degree of Phenotypic Evolution of Embryos: A Study of Comparative Transcriptomic Analyses of Chordates and Echinoderms2021
- 著者名/発表者名
  Jason Cheok Kuan Leong*, Yongxin Li, Masahiro Uesaka, Yui Uchida, Akihito Omori, Meng Hao, Wenting Wan, Yang Dong, Yandong RenSi Zhang, Tao Zeng, Fayou Wang, Luonan Chen, Gary Wessel, Brian T. Livingston, Cynthia Bradham, Wen Wang, Naoki Irie*
- 雑誌名
  
  Front. Cell Dev. Biol.
  
  巻: 26
- DOI
  10.3389/fcell.2021.749963
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06387
[雑誌論文] The developmental hourglass model and recapitulation: An attempt to integrate the two models.2021
- 著者名/発表者名
  Uesaka, M., Kuratani, S., and Irie, N.
- 雑誌名
  
  J Exp Zool B Mol Dev Evol.
  
  巻: in press 号: 1-2 ページ: 1-11
- DOI
  10.1002/jez.b.23027
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06385, KAKENHI-PROJECT-18K14711, KAKENHI-PLANNED-17H06387
[雑誌論文] How can recapitulation be reconciled with modern concepts of evolution?2021
- 著者名/発表者名
  Kuratani S, Uesaka M, Irie N.
- 雑誌名
  
  J Exp Zool B Mol Dev Evol.
  
  巻: in press 号: 1-2 ページ: 1-8
- DOI
  10.1002/jez.b.23020
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06385, KAKENHI-PROJECT-18K14711, KAKENHI-PLANNED-17H06387
[雑誌論文] Genomic insights of body plan transitions from bilateral to pentameric symmetry in Echinoderms2020
- 著者名/発表者名
  Yongxin Li, et al. (35名中 35番目 Naoki Irie*)
- 雑誌名
  
  Communications Biology
  
  巻: 3:371 号: 1 ページ: 371-371
- DOI
  10.1038/s42003-020-1091-1
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06387, KAKENHI-PROJECT-18K14711
[雑誌論文] Recapitulation-like developmental transitions of chromatin accessibility in vertebrates2019
- 著者名/発表者名
  Uesaka Masahiro、Kuratani Shigeru、Takeda Hiroyuki、Irie Naoki
- 雑誌名
  
  Zoological Letters
  
  巻: 5 号: 1 ページ: 33-33
- DOI
  10.1186/s40851-019-0148-9
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14711, KAKENHI-PLANNED-17H06387, KAKENHI-PLANNED-17H06385
[雑誌論文] Evolutionary transition in accessible chromatin landscapes during vertebrate embryogenesis2018
- 著者名/発表者名
  Uesaka Masahiro、Kuratani Shigeru、Takeda Hiroyuki、Irie Naoki
- 雑誌名
  
  bioRxiv
  
  巻: - ページ: 1-20
- DOI
  10.1101/481309
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14711
[雑誌論文] Embryonic lethality is not sufficient to explain hourglass-like conservation of vertebrate embryos2018
- 著者名/発表者名
  Yui Uchida, Masahiro Uesaka, Takayoshi Yamamoto, Hiroyuki Takeda and Naoki Irie
- 雑誌名
  
  EvoDevo
  
  巻: 9:7 号: 1 ページ: 1-11
- DOI
  10.1186/s13227-018-0095-0
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H05603, KAKENHI-PROJECT-15J06414, KAKENHI-PROJECT-17J06225, KAKENHI-PLANNED-17H06387
[雑誌論文] Constrained vertebrate evolution by pleiotropic genes.2017
- 著者名/発表者名
  Hu H, Uesaka M, Guo S, Shimai K, Lu TM, Li F, Fujimoto S, Ishikawa M, Liu S, Sasagawa Y, Zhang G, Kuratani S, Yu JK, Kusakabe TG, Khaitovich P, Irie N; EXPANDE Consortium.
- 雑誌名
  
  Nat Ecol Evol
  
  巻: 1 号: 11 ページ: 1722-1730
- DOI
  10.1038/s41559-017-0318-0
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06385, KAKENHI-PLANNED-17H06387, KAKENHI-PROJECT-15H02416, KAKENHI-PROJECT-16H04724, KAKENHI-PROJECT-15H05603, KAKENHI-PROJECT-15J06414
[学会発表] The developmental hourglass model and the vertebrate body plan conservation: insights from single-cell level transcriptome analysis2023
- 著者名/発表者名
  Masahiro Uesaka, Jason Cheok Kuan Leong, Shigeru Kuratani, Naoki Irie
- 学会等名
  The 3rd AsiaEvo Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15133
[学会発表] 比較オミクス解析から迫る個体発生と進化の関係性2023
- 著者名/発表者名
  上坂将弘、倉谷滋、入江直樹
- 学会等名
  NGS EXPO 2023
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15133
[学会発表] Testing the recapitulative pattern in vertebrate embryogenesis from the perspective of gene regulation2020
- 著者名/発表者名
  Masahiro Uesaka
- 学会等名
  JSDB Online Trial Meeting 2020
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14711
[学会発表] Testing the recapitulative pattern in vertebrate embryogenesis from the perspective of gene regulation2020
- 著者名/発表者名
  Masahiro Uesaka
- 学会等名
  The 53rd JSDB/APDBN Meeting
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14711
[学会発表] 脊椎動物の発生過程は進化を反復するのか？2019
- 著者名/発表者名
  上坂将弘、倉谷滋、武田洋幸、入江直樹
- 学会等名
  日本進化学会第21回大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14711
[学会発表] 脊椎動物の胚発生における反復説の検証2019
- 著者名/発表者名
  上坂将弘、倉谷滋、武田洋幸、入江直樹
- 学会等名
  日本動物学会第90回大阪大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14711
[学会発表] 脊椎動物発生のオープンクロマチン動態に見られた系統進化の反復的パターン2019
- 著者名/発表者名
  上坂将弘、倉谷滋、武田洋幸、入江直樹
- 学会等名
  第42回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14711

1. 入江直樹 (10536121)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
2. 平沢達矢 (60585793)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 安藤俊哉 (10709744)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 木村由莉 (50759446)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 倉谷滋

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 3件

上坂 将弘 Uesaka Masahiro

研究課題

研究成果

共同研究者

進化可能性の変動史を観測する科学の創成：生物情報学・進化発生学・古生物学の統合

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

深層学習による形態予測から迫る鳥類の翼の進化可能性変動史研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

脊椎動物器官発生における遺伝子制御活性解析による進化と発生の反復傾向の実体解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

脊椎動物における進化と発生の反復傾向の検証に向けた発生時系列の遺伝子制御動態解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

脊索動物胚発生の分子発生システムゆらぎ測定と進化的保存性

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] Genomic screening of fish‐specific genes in gnathostomes and their functions in fin development2024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Hagfish genome elucidates vertebrate whole-genome duplication events and their evolutionary consequences2024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Distinguishing Evolutionary Conservation from Derivedness.2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Derivedness Index for Estimating Degree of Phenotypic Evolution of Embryos: A Study of Comparative Transcriptomic Analyses of Chordates and Echinoderms2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] The developmental hourglass model and recapitulation: An attempt to integrate the two models.2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] How can recapitulation be reconciled with modern concepts of evolution?2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Genomic insights of body plan transitions from bilateral to pentameric symmetry in Echinoderms2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Recapitulation-like developmental transitions of chromatin accessibility in vertebrates2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Evolutionary transition in accessible chromatin landscapes during vertebrate embryogenesis2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Embryonic lethality is not sufficient to explain hourglass-like conservation of vertebrate embryos2018

上坂将弘 Uesaka Masahiro