譚丞 Tan Cheng

研究者番号	20865886
その他のID	https://orcid.org/0000-0002-8957-4267
所属 (現在)	2025年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 計算科学研究センター, 研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2023年度 – 2025年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 計算科学研究センター, 研究員 2021年度 – 2022年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 計算科学研究センター, 特別研究員
審査区分/研究分野	研究代表者小区分43040:生物物理学関連研究代表者以外学術変革領域研究区分(Ⅲ)
キーワード	研究代表者 molecular dynamics / biomolecular condensate 研究代表者以外長鎖ノンコーディングRNA / Hero蛋白質 / 液液相分離 / 天然変性蛋白質 / 分子動力学シミュレーション

Multiphase biomolecular condensation studied with large-scale molecular dynamics simulations研究代表者
- 研究代表者
  
  譚丞
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2027
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分43040:生物物理学関連
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
非ドメイン型バイオポリマーの分子動力学計算
- 研究代表者
  
  依田隆夫
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2025
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅲ)
- 研究機関
  長浜バイオ大学

すべて 2024 2023 2022

すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] 分子シミュレーションで理解する相分離のメカニズム（「フロントランナー直伝　相分離解析プロトコール（加藤・白木・中川編）」の p.235-2412022
- 著者名/発表者名
  Cheng Tan，新津　藍，依田隆夫，杉田有治
- 総ページ数
  7
- 出版者
  羊土社
- ISBN
  9784758122597
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05282
[雑誌論文] GENESIS CGDYN: large-scale coarse-grained MD simulation with dynamic load balancing for heterogeneous biomolecular systems2024
- 著者名/発表者名
  Jung Jaewoon、Tan Cheng、Sugita Yuji
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 15 号: 1 ページ: 3370-3370
- DOI
  10.1038/s41467-024-47654-1
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05249, KAKENHI-PLANNED-21H05282, KAKENHI-PROJECT-19H05645
[雑誌論文] Highly charged proteins and their repulsive interactions antagonize biomolecular condensation2023
- 著者名/発表者名
  Cheng Tan, Ai Niitsu, Yuji Sugita
- 雑誌名
  
  JACS Au
  
  巻: 3 号: 3 ページ: 834-848
- DOI
  10.1021/jacsau.2c00646
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05249, KAKENHI-PLANNED-21H05282, KAKENHI-PROJECT-19H05645, KAKENHI-PROJECT-21J40162
[雑誌論文] Micelle-like clusters in phase-separated Nanog condensates: A molecular simulation study2023
- 著者名/発表者名
  Mizutani Azuki、Tan Cheng、Sugita Yuji、Takada Shoji
- 雑誌名
  
  PLOS Computational Biology
  
  巻: 19 号: 7 ページ: e1011321-e1011321
- DOI
  10.1371/journal.pcbi.1011321
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05282
[雑誌論文] Implementation of residue-level coarse-grained models I GENESIS for large-scale molecular dynamics simulations2022
- 著者名/発表者名
  Cheng Tan, Jaewoon Jung, Chigusa Kobayashi, Diego Ugarte, Shoji Takada, Yuji Sugita
- 雑誌名
  
  PLoS Comp. Biol.
  
  巻: 18 号: 4 ページ: e1009578-e1009578
- DOI
  10.1371/journal.pcbi.1009578
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05249, KAKENHI-PLANNED-21H05282, KAKENHI-PROJECT-19H05645
[学会発表] Acceleration of residue-level coarse-grained molecular dynamics by efficient parallelization2023
- 著者名/発表者名
  J. Jung, C. Tan, C. Kobayashi, D. Ugarte, Y. Sugita
- 学会等名
  The 67th Biophysical Society Annual Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05282
[学会発表] Repulsive interaction and secondary structure of highly charged proteins in regulating biomolecular condensation2023
- 著者名/発表者名
  Cheng Tan, Ai Niitsu, Yuji Sugita
- 学会等名
  The 67th Biophysical Society Annual Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05282
[学会発表] Regulation of Biomolecular Condensation Studied with Large-Scale Coarse-Grained Molecular Dynamics Simulations in GENESIS2023
- 著者名/発表者名
  Cheng Tan
- 学会等名
  第61回日本生物物理学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05282
[学会発表] Developments and Applications in Multiscale Molecular Dynamics Simulations for Biomolecular Condensation Using GENESIS2023
- 著者名/発表者名
  Cheng Tan
- 学会等名
  2023年度第2回計算科学フォーラム
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05282
[学会発表] Acceleration of residue-level coarse-grained molecular dynamics by new development of parallelization2022
- 著者名/発表者名
  J. Jung, C. Tan, C. Kobayashi, D. Ugarte, Y. Sugita
- 学会等名
  第60回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05282
[学会発表] Multi-scale molecular dynamics study of repulsive interactions in regulating biomolecular condensation.2022
- 著者名/発表者名
  Cheng Tan, Ai Niitsu, Yuji Sugita
- 学会等名
  The 32nd Tokyo RNA Club, RIKEN Symposium
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05282
[学会発表] Molecular dynamics study of phase behaviors of heat-resistant obscure proteins and their anti-aggregation functions.2022
- 著者名/発表者名
  Cheng Tan, Ai Niitsu, Yuji Sugita
- 学会等名
  第60回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05282

1. 依田隆夫 (50367900)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
2. 鄭載運 (10554701)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
3. 杉田有治

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 3件

譚 丞 Tan Cheng

研究課題

研究成果

共同研究者

Multiphase biomolecular condensation studied with large-scale molecular dynamics simulations研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

非ドメイン型バイオポリマーの分子動力学計算

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[図書] 分子シミュレーションで理解する相分離のメカニズム（「フロントランナー直伝 相分離解析プロトコール（加藤・白木・中川 編）」の p.235-2412022

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[雑誌論文] GENESIS CGDYN: large-scale coarse-grained MD simulation with dynamic load balancing for heterogeneous biomolecular systems2024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Highly charged proteins and their repulsive interactions antagonize biomolecular condensation2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Micelle-like clusters in phase-separated Nanog condensates: A molecular simulation study2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Implementation of residue-level coarse-grained models I GENESIS for large-scale molecular dynamics simulations2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] Acceleration of residue-level coarse-grained molecular dynamics by efficient parallelization2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Repulsive interaction and secondary structure of highly charged proteins in regulating biomolecular condensation2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Regulation of Biomolecular Condensation Studied with Large-Scale Coarse-Grained Molecular Dynamics Simulations in GENESIS2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Developments and Applications in Multiscale Molecular Dynamics Simulations for Biomolecular Condensation Using GENESIS2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Acceleration of residue-level coarse-grained molecular dynamics by new development of parallelization2022

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Multi-scale molecular dynamics study of repulsive interactions in regulating biomolecular condensation.2022

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Molecular dynamics study of phase behaviors of heat-resistant obscure proteins and their anti-aggregation functions.2022

著者名/発表者名

学会等名

データソース

譚丞 Tan Cheng

[図書] 分子シミュレーションで理解する相分離のメカニズム（「フロントランナー直伝　相分離解析プロトコール（加藤・白木・中川編）」の p.235-2412022