久保進太郎 Kubo Shintaroh

研究者番号	20874902
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 開拓研究所, 基礎科学特別研究員 2025年度: 東京大学, 大学院工学系研究科(工学部), 特任研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2022年度 – 2023年度: 東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 特別研究員
審査区分/研究分野	研究代表者小区分43040:生物物理学関連
キーワード	研究代表者翻訳語修飾 / キネシン / 低温電子顕微鏡 / 微小管 / 分子モーター / ダイニン / 分子動力学計算

研究課題
(1件)
研究成果
(13件)

微小管の翻訳後修飾による軸糸内輸送網の制御方法に関する分子シミュレーション研究研究代表者
- 研究代表者
  
  久保進太郎
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2026
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分43040:生物物理学関連
- 研究機関
  東京大学

すべて 2024 2023 2022

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Identification of OPTN p.(Asn51Thr): A novel pathogenic variant in primary open-angle glaucoma2024
- 著者名/発表者名
  Shiga Yukihiro、Hashimoto Kazuki、Fujita Kosuke、Maekawa Shigeto、Sato Kota、Kubo Shintaroh、Kawase Kazuhide、Tokumo Kana、Kiuchi Yoshiaki、Mori Sotaro、Nakamura Makoto、Iwata Takeshi、Nishiguchi Koji M.、Nakazawa Toru
- 雑誌名
  
  Genetics in Medicine Open
  
  巻: 2 ページ: 100839-100839
- DOI
  10.1016/j.gimo.2023.100839
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15070, KAKENHI-PROJECT-22KJ0505
[雑誌論文] The ATPase asymmetry: Novel computational insight into coupling diverse FO motors with tripartite F12024
- 著者名/発表者名
  Kubo Shintaroh、Okada Yasushi
- 雑誌名
  
  Biophysical Journal
  
  巻: - 号: 6 ページ: 891-900
- DOI
  10.1016/j.bpj.2024.03.013
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15070, KAKENHI-PROJECT-22KJ0505, KAKENHI-PROJECT-22H04926
[雑誌論文] Native doublet microtubules from Tetrahymena thermophila reveal the importance of outer junction proteins2023
- 著者名/発表者名
  Kubo Shintaroh、Black Corbin S.、Joachimiak Ewa、Yang Shun Kai、Legal Thibault、Peri Katya、Khalifa Ahmad Abdelzaher Zaki、Ghanaeian Avrin、McCafferty Caitlyn L.、Valente-Paterno Melissa、De Bellis Chelsea、Huynh Phuong M.、Fan Zhe、Marcotte Edward M.、Wloga Dorota、Bui Khanh Huy
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 14 号: 1
- DOI
  10.1038/s41467-023-37868-0
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15070, KAKENHI-PROJECT-22KJ0505
[雑誌論文] FO-F1 coupling and symmetry mismatch in ATP synthase resolved in every FO rotation step2023
- 著者名/発表者名
  Kubo Shintaroh、Niina Toru、Takada Shoji
- 雑誌名
  
  Biophysical Journal
  
  巻: 122 号: 14 ページ: 2898-2909
- DOI
  10.1016/j.bpj.2022.09.034
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15070, KAKENHI-PROJECT-22KJ0505, KAKENHI-PLANNED-20H05934, KAKENHI-PROJECT-21H02441
[雑誌論文] Regulatory mechanisms of the dynein-2 motility by post-translational modification revealed by MD simulation2023
- 著者名/発表者名
  Kubo Shintaroh、Bui Khanh Huy
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 13 号: 1 ページ: 1-11
- DOI
  10.1038/s41598-023-28026-z
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15070, KAKENHI-PROJECT-22KJ0505
[学会発表] Native doublet microtubules from Tetrahymena thermophila reveal the importance of outer junction proteins2023
- 著者名/発表者名
  Shintaroh Kubo
- 学会等名
  EBSA2023
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15070
[学会発表] Molecular dynamics simulation of proton-transfer coupled rotations in ATP synthase Fo motor2023
- 著者名/発表者名
  Shintaroh Kubo
- 学会等名
  TACC2023
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15070
[学会発表] 粗視化MD計算を用いたFOF1 ATPaseのFOモーターとF1モーターの回転対称性のミスマッチに関する理論研究2023
- 著者名/発表者名
  久保進太郎
- 学会等名
  第61回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15070
[学会発表] MD simulations revealed how post-translational modification regulates dynein-2 motility2023
- 著者名/発表者名
  Shintaroh Kubo
- 学会等名
  第49回内藤カンファレンス
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15070
[学会発表] 鞭毛内輸送を行うダイニンがどのように歩行する微小管を選択するのかに関する粗視化MD研究2022
- 著者名/発表者名
  久保進太郎, カーンフイブイ
- 学会等名
  第60回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15070
[学会発表] POST-TRANSLATIONAL MODIFICATION OF MICROTUBULES CAN CONTROL DYNEIN-2'S ABILITY TO WALK ON A-TUBULES2022
- 著者名/発表者名
  Shintaroh Kubo, Khanh Huy Bui
- 学会等名
  Biophysics at the Dawn of Exascale Computers thematic meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15070
[学会発表] How post-translational modification of tubulins controlled dynein-2 (IFT train) motility revealed by coarse-grained MD simulation2022
- 著者名/発表者名
  Shintaroh Kubo, Khanh Huy Bui
- 学会等名
  Cytoskeletal Motors, Gordon Research Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15070
[学会発表] THE THEORETICAL STUDY OF DYNEIN MOTILITY REGULATED BY TUBULIN POST TRANSLATIONAL MODIFICATION2022
- 著者名/発表者名
  Shintaroh Kubo, Khanh Huy Bui
- 学会等名
  Biophysical Society 66th Annual Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15070

久保 進太郎 Kubo Shintaroh

研究課題

研究成果

微小管の翻訳後修飾による軸糸内輸送網の制御方法に関する分子シミュレーション研究研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] Identification of OPTN p.(Asn51Thr): A novel pathogenic variant in primary open-angle glaucoma2024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] The ATPase asymmetry: Novel computational insight into coupling diverse FO motors with tripartite F12024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Native doublet microtubules from Tetrahymena thermophila reveal the importance of outer junction proteins2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] FO-F1 coupling and symmetry mismatch in ATP synthase resolved in every FO rotation step2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Regulatory mechanisms of the dynein-2 motility by post-translational modification revealed by MD simulation2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] Native doublet microtubules from Tetrahymena thermophila reveal the importance of outer junction proteins2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Molecular dynamics simulation of proton-transfer coupled rotations in ATP synthase Fo motor2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 粗視化MD計算を用いたFOF1 ATPaseのFOモーターとF1モーターの回転対称性のミスマッチに関する理論研究2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] MD simulations revealed how post-translational modification regulates dynein-2 motility2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 鞭毛内輸送を行うダイニンがどのように歩行する微小管を選択するのかに関する粗視化MD研究2022

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] POST-TRANSLATIONAL MODIFICATION OF MICROTUBULES CAN CONTROL DYNEIN-2'S ABILITY TO WALK ON A-TUBULES2022

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] How post-translational modification of tubulins controlled dynein-2 (IFT train) motility revealed by coarse-grained MD simulation2022

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] THE THEORETICAL STUDY OF DYNEIN MOTILITY REGULATED BY TUBULIN POST TRANSLATIONAL MODIFICATION2022

著者名/発表者名

学会等名

データソース

久保進太郎 Kubo Shintaroh