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善岡 祐輝  Yoshioka Yuki

研究者番号 20982169
その他のID
  • ORCIDhttps://orcid.org/0000-0001-6348-4629
所属 (現在) 2025年度: 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, リサーチフェロー
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2023年度 – 2025年度: 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, リサーチフェロー
2023年度: 沖縄科学技術大学院大学, マリンゲノミックスユニット, 特別研究員(PD)
2020年度 – 2021年度: 東京大学, 新領域創成科学研究科, 特別研究員(DC1)
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分45040:生態学および環境学関連 / 小区分43050:ゲノム生物学関連
研究代表者以外
学術変革領域研究区分(Ⅱ) / 小区分40030:水圏生産科学関連
キーワード
研究代表者
共生 / サンゴ / 褐虫藻 / トランスクリプトーム / 比較ゲノム解析 / ゲノム / 遺伝子
研究代表者以外
サンゴ礁 / 褐虫藻 / スナギンチャク … もっと見る / 共生体 / トランスクリプトーム解析 / 遠隔長期間観察 / 一斉産卵 / ミドリイシ属サンゴ / 幼生加入 / 受精効率 / フェノロジー / ミドリイシ 隠す
  • 研究課題

    (4件)
  • 研究成果

    (18件)
  • 共同研究者

    (7人)
  •  スマートフォンの携帯通信網を活用したサンゴ一斉産卵の同時多点観測システムの構築

    • 研究代表者
      鈴木 豪
    • 研究期間 (年度)
      2024
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分40030:水圏生産科学関連
    • 研究機関
      国立研究開発法人水産研究・教育機構
  •  共生宿主細胞を用いたサンゴ-褐虫藻共生系のモデル確立と分子機構の解明研究代表者

    • 研究代表者
      善岡 祐輝
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2025
    • 研究種目
      特別研究員奨励費
    • 審査区分
      小区分45040:生態学および環境学関連
    • 研究機関
      沖縄科学技術大学院大学
  •  共生が必要・不要な近縁種から探る共生における物質の役割

    • 研究代表者
      山下 洋
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2025
    • 研究種目
      学術変革領域研究(B)
    • 審査区分
      学術変革領域研究区分(Ⅱ)
    • 研究機関
      国立研究開発法人水産研究・教育機構
  •  比較ゲノムによるサンゴ共生系を生み出すゲノム基盤の解明研究代表者

    • 研究代表者
      善岡 祐輝
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2022
    • 研究種目
      特別研究員奨励費
    • 審査区分
      小区分43050:ゲノム生物学関連
    • 研究機関
      東京大学

すべて 2025 2024 2023 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 学会発表

  • [雑誌論文] Extensive mitochondrial genomic analyses reveal dynamic gene order rearrangements in the class Octocorallia (Cnidaria: Anthozoa)2025

    • 著者名/発表者名
      Yoshioka Yuki、Kanai Megumi、Gishitomi Shogo、Arakaki Nana、Koido Tatsuki、Shinzato Chuya、Inoue Jun、Nagata Tomofumi、Satoh Noriyuki
    • 雑誌名

      Gene Reports

      巻: 38 ページ: 102111-102111

    • DOI

      10.1016/j.genrep.2024.102111

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H04922, KAKENHI-PROJECT-23KJ2129
  • [雑誌論文] Complete mitochondrial genomes of <i>Palauastrea ramosa</i> Yabe &amp; Sugiyama, 1941 and <i>Stylocoeniella guentheri</i> (Bassett-Smith, 1890) reveal their molecular phylogenetic position2025

    • 著者名/発表者名
      Yoshioka Yuki, Kanai Megumi, Tsuhako Takeru, Satoh Noriyuki, Nagata Tomofumi
    • 雑誌名

      Galaxea, Journal of Coral Reef Studies

      巻: 27 号: 1 ページ: 7-12

    • DOI

      10.3755/galaxea.G27-4

    • ISSN
      1883-0838, 1883-3969
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23KJ2129
  • [雑誌論文] Molecular phylogenetic position of the family Fungiidae (Cnidaria: Anthozoa) based on complete mitochondrial genome sequences2024

    • 著者名/発表者名
      Yoshioka Yuki, Nagata Fumihiko, Nonaka Masanori, Satoh Noriyuki
    • 雑誌名

      Galaxea, Journal of Coral Reef Studies

      巻: 26 号: 1 ページ: 43-47

    • DOI

      10.3755/galaxea.G26N-7

    • ISSN
      1883-0838, 1883-3969
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23KJ2129
  • [雑誌論文] Azooxanthellate <i>Palythoa</i> (Cnidaria: Anthozoa) Genomes Reveal Toxin-related Gene Clusters and Loss of Neuronal Genes in Hexacorals2024

    • 著者名/発表者名
      Yoshioka Yuki、Yamashita Hiroshi、Uchida Taiga、Shinzato Chuya、Kawamitsu Mayumi、Fourreau Chloe Julie Lois、Castello Guillermo Mironenko、Fiedler Britta Katharina、van den Eeckhout Timotheus Maximilian、Borghi Stefano、Reimer James Davis、Shoguchi Eiichi
    • 雑誌名

      Genome Biology and Evolution

      巻: 16 号: 9 ページ: 1-10

    • DOI

      10.1093/gbe/evae197

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H04922, KAKENHI-PLANNED-23H03822, KAKENHI-PROJECT-24K01847, KAKENHI-PROJECT-23KJ2129
  • [雑誌論文] Genomic Data Reveal Diverse Biological Characteristics of Scleractinian Corals and Promote Effective Coral Reef Conservation2024

    • 著者名/発表者名
      Shinzato Chuya、Yoshioka Yuki
    • 雑誌名

      Genome Biology and Evolution

      巻: 16 号: 2 ページ: 1-8

    • DOI

      10.1093/gbe/evae014

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23KJ2129, KAKENHI-PROJECT-20K21860, KAKENHI-PROJECT-20H03235, KAKENHI-PROJECT-21H04922
  • [雑誌論文] Genes possibly related to symbiosis in early life stages of Acropora tenuis inoculated with Symbiodinium microadriaticum2023

    • 著者名/発表者名
      Yoshioka Yuki、Chiu Yi-Ling、Uchida Taiga、Yamashita Hiroshi、Suzuki Go、Shinzato Chuya
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 6 号: 1 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1038/s42003-023-05350-8

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23KJ2129, KAKENHI-PROJECT-20K21860, KAKENHI-PROJECT-20H03235, KAKENHI-PROJECT-21H04742, KAKENHI-PROJECT-23K20289
  • [雑誌論文] Comparative genomics highlight the importance of lineage-specific gene families in evolutionary divergence of the coral genus, Montipora2022

    • 著者名/発表者名
      Yoshioka Yuki、Suzuki Go、Zayasu Yuna、Yamashita Hiroshi、Shinzato Chuya
    • 雑誌名

      BMC Ecology and Evolution

      巻: 22 号: 1 ページ: 71-71

    • DOI

      10.1186/s12862-022-02023-8

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21860, KAKENHI-PROJECT-19K15902, KAKENHI-PROJECT-20J21301, KAKENHI-PROJECT-21H04742, KAKENHI-PROJECT-23K20289, KAKENHI-PROJECT-20H03235
  • [雑誌論文] Larval transcriptomic responses of a stony coral, Acropora tenuis, during initial contact with the native symbiont, Symbiodinium microadriaticum2022

    • 著者名/発表者名
      Yoshioka Yuki、Yamashita Hiroshi、Suzuki Go、Shinzato Chuya
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 号: 1 ページ: 2854-2854

    • DOI

      10.1038/s41598-022-06822-3

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H04742, KAKENHI-PROJECT-20J21301, KAKENHI-PROJECT-20H03235, KAKENHI-PROJECT-23K20289
  • [雑誌論文] Whole-Genome Transcriptome Analyses of Native Symbionts Reveal Host Coral Genomic Novelties for Establishing Coral?Algae Symbioses2020

    • 著者名/発表者名
      Yoshioka Yuki、Yamashita Hiroshi、Suzuki Go、Zayasu Yuna、Tada Ipputa、Kanda Miyuki、Satoh Noriyuki、Shoguchi Eiichi、Shinzato Chuya
    • 雑誌名

      Genome Biology and Evolution

      巻: 13 号: 1 ページ: 1-18

    • DOI

      10.1093/gbe/evaa240

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H02270, KAKENHI-PROJECT-20J21301, KAKENHI-PROJECT-17K07949, KAKENHI-PROJECT-20H03235, KAKENHI-PROJECT-17KT0027
  • [学会発表] 沖縄美ら海水族館で長期飼育中のクサビライシ科4種のミトコンドリアゲノム2024

    • 著者名/発表者名
      善岡祐輝、永田史彦、野中正法、佐藤 矩行
    • 学会等名
      第27回日本サンゴ礁学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23KJ2129
  • [学会発表] スマートフォンの携帯通信網を利用したミドリイシ属サンゴの産卵観測装置の開発2024

    • 著者名/発表者名
      鈴木 豪,田代 郷国, 善岡祐輝, 新里宙也, 酒井一彦
    • 学会等名
      日本サンゴ礁学会第27回大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K20289
  • [学会発表] Dynamic gene rearrangements of mitochondrial genome in the Subclass Octocorallia (Cnidaria: Anthozoa)2024

    • 著者名/発表者名
      善岡祐輝、金井恵、宜志富紹吾、新垣奈々、古井戸樹、新里宙也、井上潤、長田智史、佐藤矩行
    • 学会等名
      第26回日本進化学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23KJ2129
  • [学会発表] 洞窟に生息する無藻性イワスナギンチャク属の進化と生態2024

    • 著者名/発表者名
      James D. Reimer, 高橋 海里, Timotheus M, van den Eeckhou, Chloe JL Fourreau, 水上 伊織, Joseph Proietti, Guillermo Mironenko Castello, 恒松 雄太, 成瀬 貫, 善岡 祐輝, 將口 栄一, Julia Vilaca, 喜瀬 浩輝, 酒井 隆一, 山下 洋
    • 学会等名
      日本動物学会第95回長崎大会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-23H03822
  • [学会発表] ウスエダミドリイシの初期生活期における共生関連遺伝子2023

    • 著者名/発表者名
      善岡祐輝、Yi-Ling Chiu、内田大賀 、山下洋、鈴木豪、新里宙也
    • 学会等名
      第26回日本サンゴ礁学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23KJ2129
  • [学会発表] 共生開始時におけるウスエダミドリイシの異なる褐虫藻株に対する遺伝子発現応答の網羅的比較2022

    • 著者名/発表者名
      善岡祐輝、山下洋、鈴木豪、新里宙也
    • 学会等名
      日本サンゴ礁学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20J21301
  • [学会発表] サンゴ-褐虫藻共生系の分子機構:異なる褐虫藻に対する宿主の遺伝子応答から探る2022

    • 著者名/発表者名
      善岡祐輝、新里宙也
    • 学会等名
      日本共生生物学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20J21301
  • [学会発表] 系統特異的遺伝子群が駆動するコモンサンゴの進化2021

    • 著者名/発表者名
      善岡祐輝、鈴木豪、山下洋、座安佑奈、新里宙也
    • 学会等名
      日本サンゴ礁学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20J21301
  • [学会発表] 高精度な比較ゲノムを可能とするミドリイシ科サンゴからの遺伝子モデル構築2020

    • 著者名/発表者名
      善岡祐輝、山下洋、鈴木豪、新里宙也
    • 学会等名
      日本サンゴ礁学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20J21301
  • 1.  新里 宙也 (70524726)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 6件
  • 2.  鈴木 豪 (30533319)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 3.  竹垣 草世香 (30546106)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 4.  酒井 一彦 (50153838)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 5.  山下 洋 (00583147)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件
  • 6.  將口 栄一 (90378563)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 7.  井上 潤
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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