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北尾 彰朗  Kitao Akio

… 別表記

北尾 彰郎  KITAO Akio

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研究者番号 30252422
その他のID
  • ORCIDhttps://orcid.org/0000-0002-5221-0806
外部サイト
所属 (現在) 2026年度: 東京科学大学, 生命理工学院, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2024年度 – 2026年度: 東京科学大学, 生命理工学院, 教授
2017年度 – 2023年度: 東京工業大学, 生命理工学院, 教授
2007年度 – 2017年度: 東京大学, 分子細胞生物学研究所, 准教授
2009年度: 東京大学, 分子細胞生物研究所, 准教授
2003年度 – 2006年度: 東京大学, 分子細胞生物学研究所, 助教授 … もっと見る
2003年度 – 2004年度: 東京大学, 分子細胞生物研究所, 助教授
2002年度: 日本原子力研究所, 計算科学技術推進センター, 研究員
1999年度 – 2001年度: 京都大学, 大学院・理学研究科, 助手
1998年度: 京大, 理学(系)研究科, 助手
1997年度: 京都大学, 大学院・理学研究科, 助手
1995年度: 京都大学, 大学院・理学研究科, 助手
1994年度: 京都大学, 理学部, 助手 隠す
審査区分/研究分野
研究代表者
生物物理学 / 学術変革領域研究区分(Ⅱ) / 複合領域 / 小区分43040:生物物理学関連 / 生物物理学 / 理工系 / 生物系 / 学術変革領域研究区分(Ⅲ) / 生体生命情報学 / 理工系 / 物性一般(含基礎論) … もっと見る
研究代表者以外
… もっと見る 生物系 / 理工系 / 学術変革領域研究区分(Ⅱ) / 小区分43020:構造生物化学関連 / 構成的システム生物学 / 生物物理学 / 理工系 隠す
キーワード
研究代表者
PaCS-MD/MSM / エネルギー地形 / ダイナミクス / CD2 / タンパク質 / evERdock / ColDock / 結合親和性予測 / 複合体立体構造予測 / 流量 … もっと見る / 経路 / アンサンブル / NMR / CD58 / 構造変化 / 機能 / シミュレーション / 蛋白質 / 階層性 / 分子動力学 / FUS / p53 / ハブタンパク質 / ユビキチン化 / メチル化 / リン酸化 / 分子認識機能 / 細胞表面受容体 / 活性化 / 構造変化活性化 / キネティックス / PaCS-MD / GPCR / 分子シミュレーション / 協働性 / フレキシビリティ / ドメイン / Torque / Conformational transition / Supercoil / Flagellar filament / Salmonella / bacterial flagella / Bio-nano-machine / Massive molecular dynamics / サヌモネラ菌 / 回転力 / 構造遷移 / 超らせん構造 / べん毛繊維 / サルモネラ菌 / 細菌べん毛 / バイオナノマシン / 大規模分子動力学 / Molecular dynamics / Dynamics / Binding free energy / Structural refinement / Complex formation / 結合自由エネルギー / 構造精密化 / 複合体形成 / Cytocrhome c / Cytochrome b5 / Tanford-Kirkwood Model / Solvent Effect / Normal Mode / Frank-Condon Factor / Electronic Coupling Factor / Non-Adiabatic Electron Transfer Reaction / 規準振動解析 / Frank・Condon因子 / 反応速度定数 / チトクロームc / チトクロームb5 / Tanford-Kirkwood理論 / 溶媒効果 / 規準振動モード / Frank-Condon因子 / 電子カップリング因子 / 非断熱電子伝達反応 / ダイナイミクス / 分子集合体 / 巨大分子 / 柔らかさ / チャンネル / 立体構造モデリング / チャネル / 受容体 / 生体膜 / 動態. / フラストレーション / 動態 / 超異方性 / 生物物理 / 生体超分子 / 分子機械 / ナノバイオ / 水和構造 / 分子認識 / CDR / TCR / イムノグロブリン / ダイナミックドメイン / パターン / ゆらぎ / 2次モーメント / JAMモデル / エネルギー面 / ダイナミックス / ヒト・リゾチーム … もっと見る
研究代表者以外
蛋白質 / 立体構造 / 分子科学 / 機能創成 / 先端計測 / 理論・計算 / 分子シミュレーション / 生物物理 / タンパク質立体構造 / タンパク質 / ダイナミックス / 構造予測 / 安定性 / 複雑分子系 / 分子複雑系 / 結晶構造解析 / 中性子散乱 / X線結晶構造解析 / 機能 / Gタンパク質結合型受容体 / 人工酵素タンパク質 / チャネルロドプシン / 酵素改変 / ハイブリッド法 / デザイナーリガンド膜受容体 / 光受容イオン膜輸送体 / デザイナーリガンド / 酵素 / バイオセンサー / 光受容イオン輸送体 / 味覚受容体 / MD計算 / 光学顕微鏡 / タンパク質間相互作用 / 蛋白質間相互作用 / モーター制御 / コレラ菌 / 大腸菌 / 細菌 / MD / 蛋白質構造 / 圧力 / 二成分制御系 / 回転制御 / 走化性 / べん毛モーター / aquaporin / molecular dynamics simulation / linear response theory / probabilistic alignment / neutron scattering / protein function / protein structure / protein complex / イムノグロブリン / 糖 / モノヌクレオチド / 結合部位 / 構造変化 / NMR / 線形応答 / 分子機能 / ダイナミックプログラミング / ダイナミクス / 確率的アライメント法 / ダイナミクプログラミング / タンパク質複合体 / アクアポリン / 分子動力学計 / 線形応答理論 / 確率的アラインメント法 / タンパク質機能 / タンパク合体 / myoglobin / Fermi resonance / mode coupling / vibrational reluxation / anharmonic vibration / proteins / ミオグロビンL / フレルミ共鳴 / 非線型振動 / ミオグロビン / フェルミ共鳴 / モードカップリング / 振動緩和 / 非線形振動 / X-ray crystal analyses / Calorimetry / Lysozyme / Protein Folding / Dynamics of Protein / Stability of Protein / Protein Conformation / 熱測定 / 折れたたみ機構 / X線結晶解析 / カロリメトリー / リゾチーム / タンパク質の折れたたみ機構 / タンパク質のダイナミックス / タンパク質の安定性 / Principle of architecture / Dynamics / Design / Structural prediction / Stability / Folding / Three-dimensional structure / Protein / 比較分類 / 比較・分類 / 折れたたみ / 進化 / 公開講演会 / 出版 / 構築原理 / デザイン / おれたたみ / 温度因子 / 基準振動解析 / 分子動力学計算 / 蛋白質分子の協奏的揺らぎ / 実験データ解析 / 計算機シミュレーション / X線散漫散乱 / エネルギー地形 / 立体構造ダイナミクス / ABC蛋白質 / 立体構造変化 / 溶媒効果 / X 線結晶構造解析 / 構造機能理論計算 / 電子顕微鏡 / 電子線構造解析 / 構造 / 生体超分子 隠す
  • 研究課題

    (33件)
  • 研究成果

    (772件)
  • 共同研究者

    (59人)
  •  味覚受容体による「多対多」の化学物質認識メカニズムの構造生物学的究明

    • 研究代表者
      山下 敦子
    • 研究期間 (年度)
      2024 – 2025
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分43020:構造生物化学関連
    • 研究機関
      大阪大学
      岡山大学
  •  翻訳後修飾と天然変性領域が制御するp53の分子相互作用を先端シミュレーションで探る研究代表者

    • 研究代表者
      北尾 彰朗
    • 研究期間 (年度)
      2024 – 2026
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分43040:生物物理学関連
    • 研究機関
      東京科学大学
  •  高効率分子シミュレーションで調べる非ドメイン型バイオポリマーの分子作動機構研究代表者

    • 研究代表者
      北尾 彰朗
    • 研究期間 (年度)
      2024 – 2025
    • 研究種目
      学術変革領域研究(A)
    • 審査区分
      学術変革領域研究区分(Ⅲ)
    • 研究機関
      東京科学大学
  •  分子シミュレーションを用いたタンパク質分子機能の生成的デザイン

    • 研究代表者
      林 重彦
    • 研究期間 (年度)
      2024 – 2028
    • 研究種目
      学術変革領域研究(A)
    • 審査区分
      学術変革領域研究区分(Ⅱ)
    • 研究機関
      京都大学
  •  最先端シミュレーションによる物質共生に関わる相互作用の定量的予測研究代表者

    • 研究代表者
      北尾 彰朗
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2024
    • 研究種目
      学術変革領域研究(A)
    • 審査区分
      学術変革領域研究区分(Ⅱ)
    • 研究機関
      東京科学大学
  •  高速分子動画を補完する構造変化の自由エネルギー地形と経路・流量の解析研究代表者

    • 研究代表者
      北尾 彰朗
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2023
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      東京工業大学
  •  最先端シミュレーションによる「弱い相互作用」がもたらす効果の定量的予測研究代表者

    • 研究代表者
      北尾 彰朗
    • 研究期間 (年度)
      2021 – 2022
    • 研究種目
      学術変革領域研究(A)
    • 審査区分
      学術変革領域研究区分(Ⅱ)
    • 研究機関
      東京工業大学
  •  高速分子動画を補完する構造変化の自由エネルギー地形と経路・流量の解析研究代表者

    • 研究代表者
      北尾 彰朗
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2021
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      東京工業大学
  •  先端シミュレーションで低分子結合が制御するGPCR活性化のメカニズムを探る研究代表者

    • 研究代表者
      北尾 彰朗
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2022
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分43040:生物物理学関連
    • 研究機関
      東京工業大学
  •  理論と実験の協奏による柔らかな分子系の機能の科学

    • 研究代表者
      田原 太平
    • 研究期間 (年度)
      2018
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 研究機関
      国立研究開発法人理化学研究所
  •  回転分子モーター制御機構解明への再構成的アプローチ

    • 研究代表者
      川岸 郁朗
    • 研究期間 (年度)
      2017 – 2019
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      構成的システム生物学
    • 研究機関
      法政大学
  •  理論と実験の協奏による柔らかな分子系の機能の科学の国際活動支援

    • 研究代表者
      田原 太平
    • 研究期間 (年度)
      2015 – 2017
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      理工系
    • 研究機関
      国立研究開発法人理化学研究所
  •  マルチドメインタンパク質のフレキシビリティ・相互作用と機能制御機構研究代表者

    • 研究代表者
      北尾 彰朗
    • 研究期間 (年度)
      2015 – 2018
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      東京工業大学
      東京大学
  •  理論と実験の協奏による柔らかな分子系の機能の科学

    • 研究代表者
      田原 太平
    • 研究期間 (年度)
      2013 – 2017
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      理工系
    • 研究機関
      国立研究開発法人理化学研究所
  •  原子解像度で探る巨大分子・分子集合体の柔らかさと機能の関係研究代表者

    • 研究代表者
      北尾 彰朗
    • 研究期間 (年度)
      2013 – 2017
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      理工系
    • 研究機関
      東京工業大学
      東京大学
  •  タンパク質複合体形成・解離に関わるモードカップリング解析法開発研究代表者

    • 研究代表者
      北尾 彰朗
    • 研究期間 (年度)
      2011 – 2012
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      理工系
    • 研究機関
      東京大学
  •  変異体情報に基づく回転モーター固定子タンパク質の立体構造モデリングと機能解析研究代表者

    • 研究代表者
      北尾 彰朗
    • 研究期間 (年度)
      2011 – 2014
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      東京大学
  •  X線散漫散乱による生体分子の動的構造決定に向けた理論基盤の構築

    • 研究代表者
      城地 保昌
    • 研究期間 (年度)
      2009 – 2010
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      独立行政法人理化学研究所
  •  分子シミュレーションで探るABCトランスポーターの膜輸送動力発生機構

    • 研究代表者
      城地 保昌
    • 研究期間 (年度)
      2007 – 2008
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      東京大学
  •  サブミリ秒領域で探る超異方的ダイナミクスとフラストレーションの蛋白質機能への役割研究代表者

    • 研究代表者
      北尾 彰朗
    • 研究期間 (年度)
      2007 – 2010
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      東京大学
  •  構造変化における蛋白質のエネルギー地形階層性と水和の役割

    • 研究代表者
      城地 保昌
    • 研究期間 (年度)
      2006 – 2007
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      理工系
    • 研究機関
      東京大学
  •  分子認識における蛋白質のエネルギー地形階層性と水和構造変化の役割研究代表者

    • 研究代表者
      北尾 彰朗
    • 研究期間 (年度)
      2004 – 2005
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      理工系
    • 研究機関
      東京大学
  •  生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構

    • 研究代表者
      月原 冨武
    • 研究期間 (年度)
      2004 – 2009
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      大阪大学
  •  生体超分子立体構造・機能解析のためのシミュレーション法開発研究代表者

    • 研究代表者
      北尾 彰朗
    • 研究期間 (年度)
      2004 – 2009
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      東京大学
  •  大規模分子動力学法で探るバイオナノマシンの作動原理研究代表者

    • 研究代表者
      北尾 彰朗
    • 研究期間 (年度)
      2003 – 2006
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生体生命情報学
    • 研究機関
      東京大学
  •  タンパク質複合体の立体構造と機能の予測

    • 研究代表者
      木寺 詔紀
    • 研究期間 (年度)
      2001 – 2004
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      横浜市立大学
  •  構造ゲノム情報からの蛋白質のやわらかさと機能の関係を探る研究代表者

    • 研究代表者
      北尾 彰朗
    • 研究期間 (年度)
      2000
    • 研究種目
      特定領域研究(C)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      京都大学
  •  蛋白質中の化学反応はどのように構造変化を引き起こすエネルギーに変換されるか

    • 研究代表者
      木寺 詔紀
    • 研究期間 (年度)
      1999 – 2001
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      横浜市立大学
      京都大学
  •  免疫系におけるCD2/CD58複合体形成の分子メカニズム研究代表者

    • 研究代表者
      北尾 彰朗
    • 研究期間 (年度)
      1999 – 2001
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      京都大学
  •  タンパク質のエネルギー面階層性とモードカップリング研究代表者

    • 研究代表者
      北尾 彰朗
    • 研究期間 (年度)
      1997 – 1999
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      物性一般(含基礎論)
    • 研究機関
      京都大学
  •  タンパク質立体構造の構築原理研究の総括

    • 研究代表者
      郷 信広
    • 研究期間 (年度)
      1995 – 1999
    • 研究種目
      重点領域研究
    • 研究機関
      京都大学
  •  タンパク質立体構造の安定性・ダイナミックス・折れたたみ機構

    • 研究代表者
      油谷 克英
    • 研究期間 (年度)
      1995 – 1998
    • 研究種目
      重点領域研究
    • 研究機関
      大阪大学
  •  チトクロームb5における電子伝達反応のダイナミックス研究代表者

    • 研究代表者
      北尾 彰朗
    • 研究期間 (年度)
      1994 – 1995
    • 研究種目
      一般研究(C)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      京都大学

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すべて 雑誌論文 学会発表 図書

  • [図書] Bacterial and Archaeal Motility, Chapter 3 Molecular Simulation to Investigate Open-Close Motion of a Flagellar Export Apparatus Protein FlhAC2023

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 総ページ数
      402
    • 出版者
      Springer
    • ISBN
      9781071630600
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [図書] Bacterial and Archaeal Motility, Chapter 3 Molecular Simulation to Investigate Open-Close Motion of a Flagellar Export Apparatus Protein FlhAC2023

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 総ページ数
      402
    • 出版者
      Springer
    • ISBN
      9781071630600
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [図書] Bacterial and Archaeal Motility, Chapter 3 Molecular Simulation to Investigate Open-Close Motion of a Flagellar Export Apparatus Protein FlhAC2023

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 総ページ数
      402
    • 出版者
      Springer
    • ISBN
      9781071630600
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [図書] PLASMA MEMBRANE SHAPING, Section 5 Chapter 27 Molecular dynamics2022

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Takemura, Akio Kitao
    • 総ページ数
      451
    • 出版者
      Academic Press
    • ISBN
      9780323899116
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [図書] PLASMA MEMBRANE SHAPING, Section 5 Chapter 27 Molecular dynamics2022

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Takemura, Akio Kitao
    • 総ページ数
      451
    • 出版者
      Academic Press
    • ISBN
      9780323899116
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [図書] PLASMA MEMBRANE SHAPING, Section 5 Chapter 27 Molecular dynamics2022

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Takemura, Akio Kitao
    • 総ページ数
      451
    • 出版者
      Academic Press
    • ISBN
      9780323899116
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [図書] In Silico創薬におけるスクリーニングの高速化、高精度化技術2018

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗、畑宏明(第2章第2節著)
    • 総ページ数
      540
    • 出版者
      技術情報協会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [図書] In Silico創薬におけるスクリーニングの高速化、高精度化技術2018

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗、畑宏明(第2章第2節著)
    • 総ページ数
      540
    • 出版者
      技術情報協会
    • ISBN
      9784861046889
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [図書] Extension of the Normal Mode Concept: Principal Component Analysis, Jumping-Among-Minima Model and their Applicaions to Experimental Data Analysis(edited by Qiang Cui & lvet Bahar, in Normal Mode Analysis: Theory and Applications to Biological and Chemical Systems, Chapter 12)2006

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [図書] Normal Mode Analysis : Theory and Applications to Biological and Chemical Systems, Chapter 122006

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 総ページ数
      406
    • 出版者
      Chapman & Hall/CRC
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [図書] Normal Mode Analysis : Theory and Applications to Biological and Chemical Systems, Chapter 122006

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 総ページ数
      406
    • 出版者
      Chapman & Hall/CRC
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [図書] Normal Mode Analysis : Theory and Applications to Biological and Chemical Systems, Chapter 122006

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 総ページ数
      406
    • 出版者
      Chapman & Hall/CRC
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [図書] Normal Mode Analysis : Theory and Applications to Biological and Chemical Systems, Chapter 122006

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 総ページ数
      406
    • 出版者
      Chapman & Hall/CRC
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16041208
  • [雑誌論文] The strategy used by naive anti-PEG antibodies to capture flexible and featureless PEG chains2025

    • 著者名/発表者名
      Liu Yiwei、Mori Takahiro、Ito Yusei、Kuroki Kimiko、Hayashi Seiichiro、Kohda Daisuke、Shimizu Taro、Ishida Tatsuhiro、Roffler Steve R.、Kaneko Mika K.、Kato Yukinari、Arimori Takao、Teramoto Takamasa、Takemura Kazuhiro、Ishibashi Kenta、Katayama Yoshiki、Maenaka Katsumi、Kakuta Yoshimitsu、Kitao Akio、Mori Takeshi
    • 雑誌名

      Journal of Controlled Release

      巻: 380 ページ: 396-403

    • DOI

      10.1016/j.jconrel.2025.02.001

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-20H05876, KAKENHI-PUBLICLY-23H04058, KAKENHI-PUBLICLY-24H01357, KAKENHI-PROJECT-23K21290, KAKENHI-PROJECT-23K21298, KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [雑誌論文] 最先端シミュレーションによる「弱い相互作用」の定量的予測2025

    • 著者名/発表者名
      北尾 彰朗
    • 雑誌名

      ファルマシア

      巻: 61 号: 3 ページ: 195-199

    • DOI

      10.14894/faruawpsj.61.3_195

    • ISSN
      0014-8601, 2189-7026
    • 言語
      日本語
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058, KAKENHI-PUBLICLY-24H01357, KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [雑誌論文] Precision spatiotemporal analysis of large-scale compound-protein interactions through molecular dynamics simulation2025

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto Shigeyuki、Isaka Yuta、Kanada Ryo、Ma Biao、Araki Mitsugu、Chiba Shuntaro、Tokuhisa Atsushi、Iwata Hiroaki、Ishida Shoichi、Akinaga Yoshinobu、Terayama Kei、Kojima Ryosuke、Harada Yohei、Takemura Kazuhiro、Honma Teruki、Kitao Akio、Okuno Yasushi
    • 雑誌名

      PNAS Nexus

      巻: 4 号: 3 ページ: 1-14

    • DOI

      10.1093/pnasnexus/pgaf094

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058, KAKENHI-PUBLICLY-24H01357, KAKENHI-PROJECT-23K27138, KAKENHI-PROJECT-22K06112
  • [雑誌論文] Balancing G protein selectivity and efficacy in the adenosine A2A receptor2024

    • 著者名/発表者名
      Picard Louis-Philippe、Orazietti Alexander、Tran Duy Phuoc、Tucs Andrejs、Hagimoto Sari、Qi Zhenzhou、Huang Shuya Kate、Tsuda Koji、Kitao Akio、Sljoka Adnan、Prosser R. Scott
    • 雑誌名

      Nature Chemical Biology

      巻: 21 号: 1 ページ: 71-79

    • DOI

      10.1038/s41589-024-01682-6

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058, KAKENHI-PUBLICLY-24H01357, KAKENHI-PROJECT-23K14154, KAKENHI-PROJECT-23K27138, KAKENHI-PROJECT-23K28040
  • [雑誌論文] PaCS-Toolkit: Optimized Software Utilities for Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics (PaCS-MD) Simulations and Subsequent Analyses2024

    • 著者名/発表者名
      Ikizawa Shinji、Hori Tatsuki、Wijaya Tegar Nurwahyu、Kono Hiroshi、Bai Zhen、Kimizono Tatsuhiro、Lu Wenbo、Tran Duy Phuoc、Kitao Akio
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 128 号: 15 ページ: 3631-3642

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.4c01271

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K14154, KAKENHI-PUBLICLY-22H04745, KAKENHI-PUBLICLY-23H04058, KAKENHI-PUBLICLY-24H01357, KAKENHI-PROJECT-23K27117, KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [雑誌論文] Engineering of an in-cell protein crystal for fastening a metastable conformation of a target miniprotein2023

    • 著者名/発表者名
      Mariko Kojima, Satoshi Abe, Tadaomi Furuta, Duy Phuoc Tran, Kunio Hirata, Keitaro Yamashita, Yuki Hishikawa, Akio Kitao, Takafumi Ueno
    • 雑誌名

      Biomaterial Science

      巻: 11 号: 4 ページ: 1350-1357

    • DOI

      10.1039/d2bm01759h

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510, KAKENHI-PROJECT-22H00347, KAKENHI-PROJECT-19H03191, KAKENHI-PLANNED-18H05421, KAKENHI-PUBLICLY-22H04745, KAKENHI-PROJECT-22K06107
  • [雑誌論文] 高圧力による細菌べん毛モーターの回転制御2023

    • 著者名/発表者名
      畑 宏明、北尾彰朗
    • 雑誌名

      高圧力の科学と技術

      巻: 33 号: 2 ページ: 69-75

    • DOI

      10.4131/jshpreview.33.69

    • ISSN
      0917-639X, 1348-1940
    • 年月日
      2023-06-01
    • 言語
      日本語
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745, KAKENHI-PUBLICLY-23H04058, KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [雑誌論文] Structure of MotA, a flagellar stator protein, from hyperthermophile2023

    • 著者名/発表者名
      Tatsuro Nishikino, Norihiro Takekawa, Duy Phuoc Tran, Jun-ichi Kishikawa, Mika Hirose, Sakura Onoe, Seiji Kojima, Michio Homma, Akio Kitao, Takayuki Kato and Katsumi Imada
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 631 ページ: 78-85

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.09.072

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510, KAKENHI-PROJECT-19H03191, KAKENHI-PROJECT-20H03220, KAKENHI-PROJECT-21H02443, KAKENHI-PROJECT-20J00329, KAKENHI-PROJECT-20K06514, KAKENHI-PROJECT-20K15732, KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [雑誌論文] Energetic and Kinetic Origin of CALB Interfacial Activation Revealed by PaCS-MD/MSM2023

    • 著者名/発表者名
      Tegar Wijaya and Akio Kitao
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 127 号: 34 ページ: 7431-7441

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.3c02041

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745, KAKENHI-PUBLICLY-23H04058, KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [雑誌論文] Dependence of Vibrational Energy Transfer on Distance in a Four-helix Bundle Protein: Equidistant Increments with the Periodicity of α Helices2022

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Yamashita,Misao Mizuno, Kazuhiro Takemura, Akio Kitao, and Yasuhisa Mizutani
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: - 号: 17 ページ: 3283-3290

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.2c00956

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19J20486, KAKENHI-PUBLICLY-21H05510, KAKENHI-PLANNED-20H05756, KAKENHI-PROJECT-19H03191, KAKENHI-PROJECT-20H02695, KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [雑誌論文] Inhibition of the hexamerization of SARS-CoV-2 endoribonuclease and modeling of RNA structures bound to the hexamer2022

    • 著者名/発表者名
      Tran Duy Phuoc、Taira Yuta、Ogawa Takumi、Misu Ryoga、Miyazawa Yoshiki、Kitao Akio
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 号: 1

    • DOI

      10.1038/s41598-022-07792-2

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439, KAKENHI-PUBLICLY-21H05510, KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [雑誌論文] Conserved GYXLI Motif of FlhA Is Involved in Dynamic Domain Motions of FlhA Required for Flagellar Protein Export2022

    • 著者名/発表者名
      Minamino Tohru、Kinoshita Miki、Inoue Yumi、Kitao Akio、Namba Keiichi
    • 雑誌名

      Microbiology Spectrum

      巻: 10 号: 4

    • DOI

      10.1128/spectrum.01110-22

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K06162, KAKENHI-PUBLICLY-21H05510, KAKENHI-PROJECT-19H03191, KAKENHI-PUBLICLY-22H04745, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PROJECT-23K23837
  • [雑誌論文] Principal Component Analysis and Related Methods for Investigating the Dynamics of Biological Macromolecules2022

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 雑誌名

      J Multidisciplinary Scientific Journal

      巻: 5 号: 2 ページ: 298-317

    • DOI

      10.3390/j5020021

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510, KAKENHI-PROJECT-19H03191, KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [雑誌論文] Dissociation Pathways of the p53 DNA Binding Domain from DNA and Critical Roles of Key Residues Elucidated by dPaCS-MD/MSM2022

    • 著者名/発表者名
      Sobeh Mohamed Marzouk、Kitao Akio
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Information and Modeling

      巻: 62 号: 5 ページ: 1294-1307

    • DOI

      10.1021/acs.jcim.1c01508

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439, KAKENHI-PUBLICLY-21H05510, KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [雑誌論文] Delineating the conformational landscape of the adenosine A2A receptor during G protein coupling2021

    • 著者名/発表者名
      Huang, S. K., Pandey, A., Tran, D. P., Villanueva, N. L., Kitao, A., Sunahara, R. K., Sljoka, A. and Prosser, R. S.
    • 雑誌名

      Cell

      巻: 184 号: 7 ページ: 1884-1894.e14

    • DOI

      10.1016/j.cell.2021.02.041

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439, KAKENHI-PROJECT-19H03191, KAKENHI-PROJECT-19K23721
  • [雑誌論文] The role of the half-turn in determining structures of Alzheimer’s Aβ wild-type and mutants2021

    • 著者名/発表者名
      Hayward Steven、Kitao Akio
    • 雑誌名

      Journal of Structural Biology

      巻: 213 号: 4 ページ: 107792-107792

    • DOI

      10.1016/j.jsb.2021.107792

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439, KAKENHI-PUBLICLY-21H05510, KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [雑誌論文] Using molecular dynamics simulations to prioritize and understand AI-generated cell penetrating peptides2021

    • 著者名/発表者名
      Tran Duy Phuoc、Tada Seiichi、Yumoto Akiko、Kitao Akio、Ito Yoshihiro、Uzawa Takanori、Tsuda Koji
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 11 号: 1

    • DOI

      10.1038/s41598-021-90245-z

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439, KAKENHI-PUBLICLY-21H05510, KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [雑誌論文] Regulatory Switching by Concerted Motions on the Microsecond Time Scale of the Oxygen Sensor Protein FixL2021

    • 著者名/発表者名
      Yamawaki Takeo、Mizuno Misao、Ishikawa Haruto、Takemura Kazuhiro、Kitao Akio、Shiro Yoshitsugu、Mizutani Yasuhisa
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 125 号: 25 ページ: 6847-6856

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.1c01885

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05761, KAKENHI-PUBLICLY-20H05439, KAKENHI-PUBLICLY-21H05510, KAKENHI-PROJECT-19H00926, KAKENHI-PROJECT-19H03191, KAKENHI-PROJECT-20H02693
  • [雑誌論文] Binding free energy of protein/ligand complexes calculated using dissociation Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics and Markov state model2021

    • 著者名/発表者名
      Hata Hiroaki、Phuoc Tran Duy、Marzouk Sobeh Mohamed、Kitao Akio
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 18 号: 0 ページ: 305-316

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v18.037

    • NAID

      130008132038

    • ISSN
      2189-4779
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439, KAKENHI-PUBLICLY-21H05510, KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [雑誌論文] バイオ分野での量子コンピュータへの期待2020

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 雑誌名

      現代化学

      巻: 6 ページ: 50-51

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [雑誌論文] PaCS-MD/MSM: Parallel Cascade Selection Molecular Dynamic Simulation in Combination with Markov State Model as an Efficient non-Bias Sampling Method2020

    • 著者名/発表者名
      PT Duy, H Hata, T Ogawa, Y Taira, A Kitao
    • 雑誌名

      アンサンブル: 分子シミュレーション研究会会誌

      巻: 22 ページ: 151-156

    • NAID

      130008031955

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [雑誌論文] Edge expansion parallel cascade selection molecular dynamics simulation for investigating large-amplitude collective motions of proteins2020

    • 著者名/発表者名
      Kenichiro Takaba, Duy Phuoc Tran and Akio Kitao
    • 雑誌名

      J. Chem. Phys.

      巻: 152 号: 22 ページ: 225101-225101

    • DOI

      10.1063/5.0004654

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439, KAKENHI-PROJECT-19H03191, KAKENHI-PROJECT-19K23721
  • [雑誌論文] バイオ分野での量子コンピュータへの期待2020

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 雑誌名

      現代化学

      巻: 6 ページ: 50-51

    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [雑誌論文] High pressure inhibits signaling protein binding to the flagellar motor and bacterial chemotaxis through enhanced hydration2020

    • 著者名/発表者名
      Hata H., Nishihara Y., Nishiyama M., Sowa Y., Kawagishi I. & Kitao A.
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 10 号: 1 ページ: 2351-2351

    • DOI

      10.1038/s41598-020-59172-3

    • NAID

      120006811771

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-19H04679, KAKENHI-PUBLICLY-19H05404, KAKENHI-PROJECT-19H03191, KAKENHI-PROJECT-17KT0026, KAKENHI-PROJECT-16K04908, KAKENHI-PROJECT-19H02566
  • [雑誌論文] Molecular dynamics simulation of proteins under high pressure: Structure, function and thermodynamics2020

    • 著者名/発表者名
      Hata Hiroaki、Nishiyama Masayoshi、Kitao Akio
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - General Subjects

      巻: 1864 号: 2 ページ: 129395-129395

    • DOI

      10.1016/j.bbagen.2019.07.004

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191, KAKENHI-PROJECT-16K04908, KAKENHI-PROJECT-19H02566
  • [雑誌論文] Regulation of caveolae through cholesterol-depletion-dependent tubulation mediated by PACSIN22020

    • 著者名/発表者名
      Gusmira Aini、Takemura Kazuhiro、Lee Shin Yong、Inaba Takehiko、Hanawa-Suetsugu Kyoko、Oono-Yakura Kayoko、Yasuhara Kazuma、Kitao Akio、Suetsugu Shiro
    • 雑誌名

      Journal of Cell Science

      巻: 133 号: 19 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1242/jcs.246785

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K06639, KAKENHI-PUBLICLY-20H05439, KAKENHI-PROJECT-18H03533, KAKENHI-PROJECT-19H03191, KAKENHI-PROJECT-20H03252
  • [雑誌論文] Kinetic Selection and Relaxation of the Intrinsically Disordered Region of a Protein upon Binding2020

    • 著者名/発表者名
      Tran Duy Phuoc、Kitao Akio
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Theory and Computation

      巻: 16 号: 4 ページ: 2835-2845

    • DOI

      10.1021/acs.jctc.9b01203

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K23721, KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [雑誌論文] PaCS-MD/MSM: Parallel Cascade Selection Molecular Dynamic Simulation in Combination with Markov State Model as an Efficient non-Bias Sampling Method2020

    • 著者名/発表者名
      PT Duy, H Hata, T Ogawa, Y Taira, A Kitao
    • 雑誌名

      アンサンブル: 分子シミュレーション研究会会誌

      巻: 22 ページ: 151-156

    • NAID

      130008031955

    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [雑誌論文] An Efficient Timer and Sizer of Biomacromolecular Motions2019

    • 著者名/発表者名
      Chan Justin、Takemura Kazuhiro、Lin Hong-Rui、Chang Kai-Chun、Chang Yuan-Yu、Joti Yasumasa、Kitao Akio、Yang Lee-Wei
    • 雑誌名

      Structure

      巻: 28 号: 2 ページ: 259-269.e8

    • DOI

      10.1016/j.str.2019.10.020

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [雑誌論文] タンパク質複合体構造の形成・解離メカニズムと予測2019

    • 著者名/発表者名
      竹村 和浩、畑 宏明、北尾 彰朗
    • 雑誌名

      日本物理学会誌

      巻: 74 号: 8 ページ: 533-541

    • DOI

      10.11316/butsuri.74.8_533

    • NAID

      130007793043

    • ISSN
      0029-0181, 2423-8872
    • 年月日
      2019-08-05
    • 言語
      日本語
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [雑誌論文] Haptic-Assisted Interactive Molecular Docking Incorporating Receptor Flexibility2019

    • 著者名/発表者名
      Matthews Nick、Kitao Akio、Laycock Stephen、Hayward Steven
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Information and Modeling

      巻: 印刷中 号: 6 ページ: 2900-2912

    • DOI

      10.1021/acs.jcim.9b00112

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357, KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [雑誌論文] More efficient screening of protein-protein complex model structures for reducing the number of candidates2019

    • 著者名/発表者名
      Takemura Kazuhiro、Kitao Akio
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 16 号: 0 ページ: 295-303

    • DOI

      10.2142/biophysico.16.0_295

    • NAID

      130007752767

    • ISSN
      2189-4779
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [雑誌論文] Universality and Structural Implications of the Boson Peak in Proteins2019

    • 著者名/発表者名
      Nakagawa Hiroshi、Joti Yasumasa、Kitao Akio、Yamamuro Osamu、Kataoka Mikio
    • 雑誌名

      Biophysical Journal

      巻: 117 号: 2 ページ: 229-238

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2019.06.007

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05229, KAKENHI-PROJECT-16H04928, KAKENHI-PROJECT-19H03191, KAKENHI-PROJECT-18K18828
  • [雑誌論文] Impact of key residues within chloroplast thioredoxin-f on recognition for reduction and oxidation of target proteins2019

    • 著者名/発表者名
      Yokochi Yuichi、Sugiura Kazunori、Takemura Kazuhiro、Yoshida Keisuke、Hara Satoshi、Wakabayashi Ken-ichi、Kitao Akio、Hisabori Toru
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 294 号: 46 ページ: 17437-17450

    • DOI

      10.1074/jbc.ra119.010401

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06556, KAKENHI-PROJECT-19H03191, KAKENHI-PROJECT-19H03241
  • [雑誌論文] Dissociation Process of a MDM2/p53 Complex Investigated by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics and the Markov State Model2019

    • 著者名/発表者名
      Tran Duy Phuoc、Kitao Akio
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 123 号: 11 ページ: 2469-2478

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.8b10309

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [雑誌論文] Enhancing Biomolecular Sampling with Reinforcement Learning: A Tree Search Molecular Dynamics Simulation Method2019

    • 著者名/発表者名
      Shin Kento、Tran Duy Phuoc、Takemura Kazuhiro、Kitao Akio、Terayama Kei、Tsuda Koji
    • 雑誌名

      ACS Omega

      巻: 4 号: 9 ページ: 13853-13862

    • DOI

      10.1021/acsomega.9b01480

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [雑誌論文] Structural insights into the substrate specificity switch mechanism of the type III protein export apparatus2019

    • 著者名/発表者名
      Y., Y. Ogawa, M. Kinoshita, N. Terahara, M. Shimada, N. Kodera, T. Ando, K. Namba, A. Kitao, K. Imada, T. Minamino
    • 雑誌名

      Structure

      巻: 印刷中 号: 6 ページ: 965-976

    • DOI

      10.1016/j.str.2019.03.017

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-26119003, KAKENHI-PROJECT-15H04357, KAKENHI-PROJECT-18K06085, KAKENHI-PROJECT-17H06121, KAKENHI-PROJECT-19H03191, KAKENHI-PROJECT-17K19345, KAKENHI-PROJECT-18K14638
  • [雑誌論文] Phagocytosis is mediated by two-dimensional assemblies of the F-BAR protein GAS72019

    • 著者名/発表者名
      Hanawa-Suetsugu Kyoko et al.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 10 号: 1 ページ: 4763-4763

    • DOI

      10.1038/s41467-019-12738-w

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K06639, KAKENHI-PUBLICLY-18H04768, KAKENHI-PUBLICLY-18H04874, KAKENHI-PROJECT-19H03191, KAKENHI-PROJECT-17K07309, KAKENHI-PROJECT-17K19529, KAKENHI-PLANNED-15H05902, KAKENHI-PROJECT-17K07427, KAKENHI-PROJECT-17H03674
  • [雑誌論文] Cancellation between auto- and mutual correlation contributions of protein/water dynamics in terahertz time-domain spectra2019

    • 著者名/発表者名
      Joti Yasumasa、Kitao Akio
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 16 号: 0 ページ: 240-247

    • DOI

      10.2142/biophysico.16.0_240

    • NAID

      130007752764

    • ISSN
      2189-4779
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [雑誌論文] Essential ion binding residues for Na+ flow in stator complex of the Vibrio flagellar motor2019

    • 著者名/発表者名
      Y. Onoue, M. Iwaki, A. Shinobu, Y. Nishihara, H. Iwatsuki, H. Terashima, A. Kitao, H. Kandori*, M. Homma*
    • 雑誌名

      Sci. Rep.

      巻: 9 号: 1 ページ: 11216-11216

    • DOI

      10.1038/s41598-019-46038-6

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-19H04959, KAKENHI-PROJECT-18H03986, KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [雑誌論文] I-BARドメインの細胞膜結合と細胞膜変形 (特集 実験と分子シミュレーションのインタープレイ)2019

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩, 塙(末次) 京子, 末次志郎, 北尾彰朗
    • 雑誌名

      アンサンブル : 分子シミュレーション研究会会誌

      巻: 21 ページ: 204-207

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [雑誌論文] evERdock BAI: Machine-learning-guided selection of protein-protein complex structure2019

    • 著者名/発表者名
      Terayama Kei、Shinobu Ai、Tsuda Koji、Takemura Kazuhiro、Kitao Akio
    • 雑誌名

      The Journal of Chemical Physics

      巻: 151 号: 21

    • DOI

      10.1063/1.5129551

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [雑誌論文] Similarities and Differences between Thymine(6?4)Thymine/Cytosine DNA Lesion Repairs by Photolyases2018

    • 著者名/発表者名
      Dokainish Hisham M.、Kitao Akio
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 122 号: 36 ページ: 8537-8547

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.8b07048

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [雑誌論文] Molecular dynamics simulation of bacterial flagella2018

    • 著者名/発表者名
      Kitao Akio、Hata Hiroaki
    • 雑誌名

      Biophysical Reviews

      巻: 10 号: 2 ページ: 203-208

    • DOI

      10.1007/s12551-017-0338-7

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [雑誌論文] Complex molecular systems: a frontier of molecular science2018

    • 著者名/発表者名
      Tahei TAHARA, Akio KITAO, Yasuhisa MIZUTANI, Hideki KANDORI, and Masaaki FUJII
    • 雑誌名

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      巻: 20 号: 5 ページ: 2945-2946

    • DOI

      10.1039/c8cp90010h

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-25104001, KAKENHI-PLANNED-25104005, KAKENHI-PROJECT-18H03986
  • [雑誌論文] Binding free energy analysis of protein-protein docking model structures by evERdock2018

    • 著者名/発表者名
      Takemura Kazuhiro、Matubayasi Nobuyuki、Kitao Akio
    • 雑誌名

      J. Chem. Phys.

      巻: 148 号: 10 ページ: 105101-105101

    • DOI

      10.1063/1.5019864

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550, KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PROJECT-26240045, KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [雑誌論文] Multi-strand β-sheet of Alzheimer Aβ(1-40) folds to β-strip helix: implication for protofilament formation2018

    • 著者名/発表者名
      Hayward Steven、Kitao Akio
    • 雑誌名

      Journal of Biomolecular Structure and Dynamics

      巻: 37 号: 8 ページ: 2143-2153

    • DOI

      10.1080/07391102.2018.1477626

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [雑誌論文] Vibrational Energy Transfer from Heme through Atomic Contacts in Proteins2018

    • 著者名/発表者名
      Yamashita Satoshi、Mizuno Misao、Tran Duy Phuoc、Dokainish Hisham、Kitao Akio、Mizutani Yasuhisa
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 122 号: 22 ページ: 5877-5884

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.8b03518

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357, KAKENHI-PROJECT-16K13933
  • [雑誌論文] Refining evERdock: Improved selection of good protein-protein complex models achieved by MD optimization and use of multiple conformations2018

    • 著者名/発表者名
      Shinobu Ai、Takemura Kazuhiro、Matubayasi Nobuyuki、Kitao Akio
    • 雑誌名

      The Journal of Chemical Physics

      巻: 149 号: 19 ページ: 195101-195101

    • DOI

      10.1063/1.5055799

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357, KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [雑誌論文] Multi-strand β-sheet of Alzheimer Aβ(1-40) folds to β-strip helix: Implication for protofilament formation2018

    • 著者名/発表者名
      Steven Hayward, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Journal of Biomolecular Structure and Dynamics

      巻: 印刷中

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [雑誌論文] ColDock: Concentrated Ligand Docking with All-Atom Molecular Dynamics Simulation2018

    • 著者名/発表者名
      Takemura Kazuhiro、Sato Chika、Kitao Akio
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 122 号: 29 ページ: 7191-7200

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.8b02756

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [雑誌論文] Origins of biological function in DNA and RNA hairpin loop motifs from replica exchange molecular dynamics simulation2018

    • 著者名/発表者名
      Jacob B. Swadling, Kunihiko Ishii, Tahei Tahara and Akio Kitao
    • 雑誌名

      Physical Chemistry Chemical Physics

      巻: 20 号: 5 ページ: 2990-3001

    • DOI

      10.1039/c7cp06355e

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [雑誌論文] Salt Bridge Formation between the I-BAR Domain and Lipids Increases Lipid Density and Membrane Curvature.2017

    • 著者名/発表者名
      Takemura K, Hanawa-Suetsugu K, Suetsugu S, Kitao A.
    • 雑誌名

      Sci Rep.

      巻: 28 号: 1 ページ: 1-10

    • DOI

      10.1038/s41598-017-06334-5

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K07351, KAKENHI-PROJECT-17K19529, KAKENHI-PLANNED-15H05902, KAKENHI-PUBLICLY-17H06006, KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [雑誌論文] Electron Fate and Mutational Robustness in the Mechanism of (6-4)Photolyase-Mediated DNA Repair2017

    • 著者名/発表者名
      Dokainish Hisham M.、Yamada Daichi、Iwata Tatsuya、Kandori Hideki、Kitao Akio
    • 雑誌名

      ACS Catalysis

      巻: 7 号: 7 ページ: 4835-4845

    • DOI

      10.1021/acscatal.7b00751

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K15103, KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PLANNED-25104009, KAKENHI-PROJECT-15H02391, KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [雑誌論文] Molecular Dynamics Study of Nitrogen-Pyramidalized Bicyclic β-Proline Oligomers: Length-Dependent Convergence to Organized Structure2017

    • 著者名/発表者名
      Yuko Otani, Satoshi Watanabe, Tomohiko Ohwada, Akio Kitao
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 121 号: 1 ページ: 100-109

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.6b10668

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-16H00822, KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PROJECT-26293002, KAKENHI-PROJECT-16K08157
  • [雑誌論文] Structure of the MotA/B Proton Channel2017

    • 著者名/発表者名
      Kitao Akio、Nishihara Yasutaka
    • 雑誌名

      Methods in molecular biology

      巻: 1593 ページ: 133-145

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-6927-2_10

    • ISBN
      9781493969265, 9781493969272
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [雑誌論文] Protein-Ligand Dissociation Simulated by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics2017

    • 著者名/発表者名
      Tran Duy Phuoc、Takemura Kazuhiro、Kuwata Kazuo、Kitao Akio
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Theory and Computation

      巻: 14 号: 1 ページ: 404-417

    • DOI

      10.1021/acs.jctc.7b00504

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [雑誌論文] High quality rendering of protein dynamics in space filling mode2017

    • 著者名/発表者名
      Matthews Nick、Easdon Robert、Kitao Akio、Hayward Steven、Laycock Stephen
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Graphics & Modellin

      巻: 78 ページ: 158-167

    • DOI

      10.1016/j.jmgm.2017.09.017

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [雑誌論文] Functional Conversion of CPD and (6-4) Photolyases by Mutation2016

    • 著者名/発表者名
      Daichi Yamada, Hisham M. Dokainish, Tatsuya Iwata, Junpei Yamamoto, Tomoko Ishikawa, Takeshi Todo, Shigenori Iwai, Elizabeth D. Getzoff, Akio Kitao, and Hideki Kandori
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 55 号: 30 ページ: 4173-4183

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.6b00361

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PLANNED-25104009, KAKENHI-PROJECT-15H05713, KAKENHI-PROJECT-15H02391, KAKENHI-PROJECT-15H04357, KAKENHI-PROJECT-16K07318, KAKENHI-PROJECT-16K07321
  • [雑誌論文] Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics for Efficient Conformational Sampling and Free Energy Calculation of Proteins2016

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao, Tyuhei Harada, Yasutaka Nishihara and Duy Phuoc Tran
    • 雑誌名

      AIP Conference Proceedings

      巻: 1790 ページ: 020013-020013

    • DOI

      10.1063/1.4968639

    • 査読あり / 謝辞記載あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PROJECT-15H04357, KAKENHI-PROJECT-15J03797
  • [雑誌論文] Computational Assignment of the Histidine Protonation State in (6-4) Photolyase Enzyme and Its Effect on the Protonation Step2016

    • 著者名/発表者名
      Hisham MM Dokainish and Akio Kitao
    • 雑誌名

      ACS Catalysis

      巻: 6 号: 8 ページ: 5500-5507

    • DOI

      10.1021/acscatal.6b01094

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [雑誌論文] High anisotropy and frustration: the keys to regulating protein function efficiently in crowded environments2016

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao and Kazuhiro Takemura
    • 雑誌名

      Curr Opin Struct Biol

      巻: 42 ページ: 50-58

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2016.10.014

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [雑誌論文] Eritoran inhibits S100A8-mediated TLR4/MD-2 activation and tumor growth by changing the immune microenvironment.2016

    • 著者名/発表者名
      Deguchi A, Tomita T, Ohto U, Takemura K, Kitao A, Akashi-Takamura, S, Miyake K, and Maru Y.
    • 雑誌名

      Oncogene

      巻: 35 号: 11 ページ: 1445-1456

    • DOI

      10.1038/onc.2015.211

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K06842, KAKENHI-PROJECT-26440063, KAKENHI-PROJECT-15K14471, KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PROJECT-15H04357, KAKENHI-PROJECT-26711002, KAKENHI-PROJECT-15K09491
  • [雑誌論文] Non-targeted parallel cascade selection molecular dynamics (nt-PaCS-MD) for enhancement of the conformational sampling of proteins2015

    • 著者名/発表者名
      Ryuhei Harada and Akio Kitao
    • 雑誌名

      J. Chem. Theor. Comput.

      巻: 11 号: 11 ページ: 5493-5502

    • DOI

      10.1021/acs.jctc.5b00723

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PROJECT-15H04357, KAKENHI-PROJECT-15J03797, KAKENHI-PROJECT-26840056
  • [雑誌論文] Design, synthesis and structure-activity relationship studies of novel sirtuin 2 (SIRT2) inhibitors with a benzamide skeleton.2015

    • 著者名/発表者名
      Taki Sakai, Yotaro Matsumoto, Minoru Ishikawa, Kazuyuki Sugita, Yuichi Hashimoto, Nobuhiko Wakai, Akio Kitao, Era Morishita, Chikashi Toyoshima, Tomoatsu Hayashi, Tetsu Akiyama
    • 雑誌名

      Bioorg Med Chem.

      巻: 23 号: 2 ページ: 328-339

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2014.11.027

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22112004, KAKENHI-PROJECT-23370066, KAKENHI-PROJECT-24590136, KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PROJECT-25293027, KAKENHI-PROJECT-26293025
  • [雑誌論文] Drug Targeting Based on a New Concept-Targeting Against TLR4 as an Example2015

    • 著者名/発表者名
      Yoshiro Maru, Takeshi Tomita, Atsuko Deguchi, Katsuaki Ieguchi, Morichuka Takita, Fujiko Tsukahara, Kazuhiro Takemura, Akio Kitao, and Fabian Gusovsky
    • 雑誌名

      Endocrine Metabolic & Immune Disorders-Drug Targets

      巻: 15 号: 2 ページ: 83-87

    • DOI

      10.2174/187153031502150522123746

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [雑誌論文] Gate-controlled proton diffusion and protonation-induced ratchet motion in the stator of the bacterial flagellar motor2015

    • 著者名/発表者名
      Yasutaka Nishihara and Akio Kitao
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.

      巻: 112 号: 25 ページ: 7737-7742

    • DOI

      10.1073/pnas.1502991112

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [雑誌論文] Monte Carlo Sampling with Linear Inverse Kinematics for Simulation of Proteins Flexible Regions2015

    • 著者名/発表者名
      Steven Hayward and Akio Kitao
    • 雑誌名

      J. Chem. Theor. Comput.

      巻: 11 号: 8 ページ: 3895-3905

    • DOI

      10.1021/acs.jctc.5b00215

    • 査読あり / 謝辞記載あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [雑誌論文] Ligand-Induced Protein Responses and Mechanical Signal Propagation Described by Linear Response Theories2014

    • 著者名/発表者名
      Lee-Wei Yang, Akio Kitao, Bang-chieh Huang and Nobuhiro Go
    • 雑誌名

      Biophysical Journal

      巻: 107 号: 6 ページ: 1415-1425

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2014.07.049

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066, KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [雑誌論文] カスケード型超並列シミュレーションによるタンパク質構造遷移のパスウェイ探索2014

    • 著者名/発表者名
      西原泰孝, 原田隆平, 北尾彰朗
    • 雑誌名

      統計数理

      巻: 62 ページ: 273-284

    • NAID

      120006020818

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [雑誌論文] Mechanism of Deep-sea Fish α-Actin Pressure Tolerance Investigated by Molecular Dynamics Simulations2014

    • 著者名/発表者名
      Nobuyuki Wakai and Akio Kitao
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 9 号: 1 ページ: e85852-e85852

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0085852

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066, KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [雑誌論文] Conformational transition pathway and free energy analyses of proteins by parallel cascade selection molecular dynamics (PaCS-MD)2014

    • 著者名/発表者名
      Ryuhei Harada, Yasutaka Nishihara, Nobuhiko Wakai, and Akio Kitao
    • 雑誌名

      AIP Conference Proceedings

      巻: 1618 ページ: 86-86

    • DOI

      10.1063/1.4897682

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066, KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PROJECT-26840056
  • [雑誌論文] カスケード型超並列シミュレーションによるタンパク質構造遷移のパスウェイ探索2014

    • 著者名/発表者名
      西原泰孝, 原田隆平, 北尾彰朗
    • 雑誌名

      統計数理

      巻: 62 ページ: 273-284

    • NAID

      120006020818

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [雑誌論文] タンパク質の柔らかな運動を誘起する分子シミュレーション2014

    • 著者名/発表者名
      原田隆平,北尾彰朗
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 54 号: 3 ページ: 167-171

    • DOI

      10.2142/biophys.54.167

    • NAID

      130004719369

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • 言語
      日本語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066, KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PROJECT-26840056
  • [雑誌論文] TRPV4 channel activity is modulated by direct interaction of the ankyrin domain to PI(4,5)P22014

    • 著者名/発表者名
      Nobuaki Takahashi, Sayaka Hamada-Nakahara, Yuzuru Itoh, Kazuhiro Takemura, Atsushi Shimada,Yoshifumi Ueda, Manabu Kitamata, Rei Matsuoka, Kyoko Hanawa-Suetsugu, Yosuke Senju, Masayuki X. Mori, Shigeki Kiyonaka, Daisuke Kohda, Akio Kitao, Yasuo Mori and Shiro Suetsugu
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 5 号: 1 ページ: 4994-4994

    • DOI

      10.1038/ncomms5994

    • NAID

      130005100825

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066, KAKENHI-PROJECT-24249017, KAKENHI-PROJECT-24687014, KAKENHI-PLANNED-25104002, KAKENHI-PUBLICLY-25121726, KAKENHI-ORGANIZER-26111001, KAKENHI-PLANNED-26111004, KAKENHI-PROJECT-26291037, KAKENHI-PROJECT-26460296
  • [雑誌論文] MuSTAR MD: Multi-scale sampling using temperature accelerated and replica exchange molecular dynamics2013

    • 著者名/発表者名
      Yu Yamamori and Akio Kitao
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Physics

      巻: 139 号: 14

    • DOI

      10.1063/1.4823743

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066, KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [雑誌論文] 分子シミュレーションによるタンパク質ダイナミクスとテラヘルツ分光2013

    • 著者名/発表者名
      城地保昌,北尾彰朗
    • 雑誌名

      化学工業

      巻: 64 ページ: 7-13

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [雑誌論文] Inhibition of a type III secretion system by the deletion of a short loop in one of its membrane proteins2013

    • 著者名/発表者名
      Vladimir A. Meshcheryakov, Akio Kitao, Hideyuki Matsunami and Fadel A. Samatey
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section D-Biological Crystallography

      巻: D69 号: 5 ページ: 812-820

    • DOI

      10.1107/s0907444913002102

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [雑誌論文] Free-energy analysis of lysozyme-triNAG binding modes with all-atom molecular dynamics simulation combined with the solution theory in the energy representation2013

    • 著者名/発表者名
      K. Takemura, R. R. Burri, T. Ishikawa, T. Ishikura, S. Sakuraba, N. Matubayasi, K. Kuwata, and A. Kitao
    • 雑誌名

      Chem. Phys. Lett

      巻: 559 ページ: 94-98

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2012.12.063

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-20118002, KAKENHI-PROJECT-21300111, KAKENHI-PROJECT-23370066, KAKENHI-PROJECT-23370068, KAKENHI-PROJECT-23651202, KAKENHI-ORGANIZER-20118001, KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [雑誌論文] A theoretical study of the two binding modes between lysozyme and tri-NAG with an explicit solvent model based on the fragment molecular orbital method2013

    • 著者名/発表者名
      T. Ishikawa, R. R. Burri, Y. O. Kamatari, S. Sakuraba, N. Matubayasi, A. Kitao, and K. Kuwata
    • 雑誌名

      Phys. Chem. Chem. Phys

      巻: 15 号: 10 ページ: 3646-3654

    • DOI

      10.1039/c3cp42761g

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-20118002, KAKENHI-PROJECT-21300111, KAKENHI-PROJECT-23370066, KAKENHI-PROJECT-23370068, KAKENHI-PROJECT-23651202, KAKENHI-PROJECT-24570180, KAKENHI-ORGANIZER-20118001, KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [雑誌論文] 分子シミュレーションによるタンパク質ダイナミクスとテラヘルツ分光2013

    • 著者名/発表者名
      城地保昌,北尾彰朗
    • 雑誌名

      化学工業

      巻: 64 ページ: 7-13

    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [雑誌論文] CyClus: A fast, comprehensive cylindrical interface approximation clustering/reranking method for rigid-body protein-protein docking decoys2013

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Omori and Akio Kitao
    • 雑誌名

      Proteins

      巻: 81 号: 6 ページ: 1005-1016

    • DOI

      10.1002/prot.24252

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066, KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [雑誌論文] Parallel cascade selection molecular dynamics (PaCS-MD) to generate conformational transition pathway2013

    • 著者名/発表者名
      Ryuhei Harada and Akio Kitao
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Physics

      巻: 139 号: 3

    • DOI

      10.1063/1.4813023

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066, KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [雑誌論文] Evaluation of protein-protein docking model structures using all-atom molecular dynamics simulations combined with the solution theory in the energy representation2012

    • 著者名/発表者名
      K. Takemura, H. Guo, S. Sakuraba, N. Matubayasi, and A. Kitao
    • 雑誌名

      J. Chem. Phys

      巻: 137 号: 21

    • DOI

      10.1063/1.4768901

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-20118002, KAKENHI-PROJECT-21300111, KAKENHI-PROJECT-23370066, KAKENHI-PROJECT-23651202, KAKENHI-ORGANIZER-20118001, KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [雑誌論文] Water model tuning for improved reproduction of rotational diffusion and NMR spectral density2012

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Takemura and Akio Kitao
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 116 号: 22 ページ: 6279-6287

    • DOI

      10.1021/jp301100g

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066, KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [雑誌論文] The fast-folding mechanism of villin headpiece subdomain studied by multi-scale distributed computing2012

    • 著者名/発表者名
      Ryuhei Harada, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Theory and Computation

      巻: 8(1) 号: 1 ページ: 290-299

    • DOI

      10.1021/ct200363h

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705, KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [雑誌論文] Multi-scale free energy landscape calculation method by combination of coarse-grained and all-atom models2011

    • 著者名/発表者名
      Ryuhei Harada, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters 503(1-3)

      ページ: 145-152

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Exploring the Folding Free Energy Landscape of a β-Hairpin Miniprotein, Chignolin, Using Multiscale Free Energy Landscape Calculation Method2011

    • 著者名/発表者名
      Ryuhei Harada, Akio Kitao
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 115(27) 号: 27 ページ: 8806-8812

    • DOI

      10.1021/jp2008623

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705, KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [雑誌論文] Transform and relax sampling for highly anisotropic systems : Application to protein domain motion and folding2011

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 雑誌名

      The Journal of Chemical Physics

      巻: 135(4) 号: 4 ページ: 45101-45114

    • DOI

      10.1063/1.3613676

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705, KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [雑誌論文] Enhanced resolution of molecular recognition to distinguish structurally similar molecules by different conformational responses of a protein upon ligand binding2011

    • 著者名/発表者名
      Mariko Higuchi, Jumpei Fujii, Yoshiteru, Yonetani, Akio Kitao, Nobuhiro Go
    • 雑誌名

      Journal of Structural Biology 173

      ページ: 20-28

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Screw motion regulates multiple functions of T4 phage protein gene product 5 during cell puncturing2011

    • 著者名/発表者名
      Nishima W, Kanamaru S, Arisaka F, Kitao A
    • 雑誌名

      J Am Chem Soc

      巻: 133(34) 号: 34 ページ: 13571-13576

    • DOI

      10.1021/ja204451g

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21770164, KAKENHI-PUBLICLY-23107705, KAKENHI-PUBLICLY-23121538, KAKENHI-PROJECT-23370066, KAKENHI-PROJECT-23570190
  • [雑誌論文] Mechanical unfolding of bacterial flagellar filament protein by molecular dynamics simulation2010

    • 著者名/発表者名
      Choon-Peng Chng, Akio Kitao
    • 雑誌名

      J.Mol.Graph.Model. 28

      ページ: 548-554

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [雑誌論文] Structure of the cytoplasmic domain of FlhA and implication for flagellar type III protein export2010

    • 著者名/発表者名
      Yumiko Saijo-Hamamoto, Katsumi Imada, Tohru Minamino, May Kihara, Masafumi Shimada, Akio Kitao, Keiichi Namba
    • 雑誌名

      Mol.Microbiol. V76(1)

      ページ: 260-268

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Structure of the cytoplasmic domain of FlhA and implication for flagellar type III protein export2010

    • 著者名/発表者名
      Yumiko Saijo-Hamamoto, Katsumi Imada, Tohru Minamino, May Kihara, Masafumi Shimada, Akio Kitao, Keiichi Namba
    • 雑誌名

      Mol. Microbiol 76(1)

      ページ: 260-268

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] The Effect of End Constraints on Protein Loop Kinematics2010

    • 著者名/発表者名
      Steven Hayward, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Biophys.J. 98(9)

      ページ: 1976-1985

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Structure of the cytoplasmic domain of FlhA and implication for flagellar type III protein export2010

    • 著者名/発表者名
      Yumiko Saijo-Hamamoto, Katsumi Imada, Tohru Minamino, May Kihara, Masafumi Shimada, Akio Kitao, Keiichi Namba
    • 雑誌名

      Mol.Microbiol. 76(1)

      ページ: 260-268

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Mechanical unfolding of bacterial flagellar filament protein by molecular dynamics simulation2010

    • 著者名/発表者名
      Choon-Peng Chng, Akio Kitao
    • 雑誌名

      J. Mol. Graph. Model 28

      ページ: 548-554

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Detecting coupled collective motions in protein by independent subspace analysis2010

    • 著者名/発表者名
      Shun Sakuraba, Yasumasa Joti, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Physics 133(18)

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Mechanical unfolding of bacterial flagellar filament protein by molecular dynamics simulation2010

    • 著者名/発表者名
      Choon-Peng Chng, Akio Kitao
    • 雑誌名

      J.Mol.Graph.Model. 28

      ページ: 548-554

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] The Effect of End Constraints on Protein Loop Conformations2010

    • 著者名/発表者名
      Steven Hayward, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Biophys. J. 98

      ページ: 1976-1985

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Detecting coupled collective motions in protein by independent subspace analysis2010

    • 著者名/発表者名
      S.Sakuraba, Y.Joti, A.Kitao
    • 雑誌名

      J.Chem.Phys.

      巻: 133

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21023006
  • [雑誌論文] Collective Dynamics of Periplasmic Glutamine Binding Protein upon Domain Closure2009

    • 著者名/発表者名
      Hannes H. Loeffler, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Biophys.J. Vol.97

      ページ: 2541-2549

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Multiple Markov transition matrix method: Obtaining the stationary probability distribution from multiple simulations2009

    • 著者名/発表者名
      Shun Sakuraba, Akio Kitao
    • 雑誌名

      J.Comp.Chem. 30

      ページ: 1850-1858

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Collective Dynamics of Periplasmic Glutamine Binding Protein upon Domain Closure2009

    • 著者名/発表者名
      Hannes H.Loeffler, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Biophys J. 97

      ページ: 2541-2549

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [雑誌論文] Collective Dynamics of Periplasmic Glutamine Binding Protein upon Domain Closure2009

    • 著者名/発表者名
      Hannes H. Loeffler, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Biophys.J. V97

      ページ: 2541-2549

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] DTA: Dihedral transition analysis for characterization of the effects of large main-chain dihedral changes in proteins2009

    • 著者名/発表者名
      Wataru Nishima, Guoying Qi, Steven Hayward, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Bioinformatics 25(5)

      ページ: 628-635

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] DTA: Dihedral transition analysis for characterization of the effects of large main-chain dihedral changes in proteins2009

    • 著者名/発表者名
      Wataru Nishima, Guoying Qi, Steven Hayward, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Bioinformatics 25(5)

      ページ: 628-635

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Principal Component Analysis of Native Ensembles of Biomolecular Structures (PCA_NEST) : Insights into Functional Dynamics2009

    • 著者名/発表者名
      Lee-Wei Yang, Eran Eyal, Ivet Bahar, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Bioinformatics 25(5)

      ページ: 606-614

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Multiple Markov transition matrix method: Obtaining the stationary probability distribution from multiple simulations2009

    • 著者名/発表者名
      Shun Sakuraba, Akio Kitao
    • 雑誌名

      J. Comp. Chem 30

      ページ: 1850-1858

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Multiple Markov transition matrix method : Obtaining the stationary probability distribution from multiple simulations2009

    • 著者名/発表者名
      Shun Sakuraba, Akio Kitao
    • 雑誌名

      J.Comp.Chem. 30

      ページ: 1850-1858

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [雑誌論文] Collective Dynamics of Periplasmic Glutamine Binding Protein upon Domain Closure2009

    • 著者名/発表者名
      Hannes H. Loeffler, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Biophys. J 97

      ページ: 2541-2549

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Principal Component Analysis of Native Ensembles of Biomolecular Structures (PCA_NEST): Insights into Functional Dynamics2009

    • 著者名/発表者名
      Lee-Wei Yang, Eran Eyal, Ivet Bahar, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Bioinformatics 25(5)

      ページ: 606-614

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Multiple Markov transition matrix method : Obtaining the stationary probability distribution from multiple simulations2009

    • 著者名/発表者名
      Shun Sakuraba, Akio Kitao
    • 雑誌名

      J.Comp.Chem. V30

      ページ: 1850-1858

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Hydration effects on low-frequency protein dynamics observed in simulated neutron scattering spectra2008

    • 著者名/発表者名
      Yasumasa Joti, Hiroshi Nakagawa, Mikio Kataoka, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Biophys.J. 94

      ページ: 4435-4443

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Hydration-Dependent Protein Dynamics Revealed by Molecular Dynamics Simulation of Crystalline Staphylococcal Nuclease2008

    • 著者名/発表者名
      Yasumasa Joti, Hiroshi Nakagawa, Mikio Kataoka, and Akio Kitao
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B Vol.112

      ページ: 3522-3528

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] 【総説】細菌べん毛繊維は分子間相互作用とフラストレーションを利用して超らせん構造の変化を制御する2008

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗,今田勝巳,難波啓一
    • 雑誌名

      生物物理 40(1)

      ページ: 11-17

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Hydration effect on low-frequency protein dynamics observed in simulated neutron scattering spectra2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Joti, H. Nakagawa, M. Kataoka and A. Kitao
    • 雑誌名

      Biophysical Journal 94(掲載確定)

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18031006
  • [雑誌論文] Thermal Unfolding Simulations of Bacterial Flagellin: Insight into its Refolding before Assembly2008

    • 著者名/発表者名
      Choon-Peng Chng and Akio Kitao
    • 雑誌名

      Biophys. J (in press)

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Hydration effects on low-frequency protein dynamics observed in simulated neutron scattering spectra2008

    • 著者名/発表者名
      Yasumasa Joti, Hiroshi Nakagawa, Mikio Kataoka, and Akio Kitao
    • 雑誌名

      Biophys. J (in press)

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Hydration effects on low-frequency protein dynamics observed in simulated neutron scattering spectra2008

    • 著者名/発表者名
      Yasumasa Joti, Hiroshi Nakagawa, Mikio Kataoka, and Akio Kitao
    • 雑誌名

      Biophys. J. (In press)

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Hydration-Dependent Protein Dynamics Revealed by Molecular Dynamics Simulation of Crystalline Staphylococcal Nuclease2008

    • 著者名/発表者名
      Yasumasa Joti, Hiroshi Nakagawa, Mikio Kataoka, Akio Kitao
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B 112

      ページ: 3522-3528

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Hydration-Dependent Protein Dynamics Revealed by Molecular Dynamics Simulation of Crystalline Staphylococcal Nuclease2008

    • 著者名/発表者名
      Yasumasa Joti, Hiroshi Nakagawa, Mikio Kataoka, Akio Kitao
    • 雑誌名

      J.Phys.Chem.B 112

      ページ: 3522-3528

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Thermal Unfolding Simulations of Bacterial Flagellin: Insight into its Refolding before Assembly2008

    • 著者名/発表者名
      Choon-Peng Chng, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Biophys. J 94

      ページ: 3858-3871

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] 【総説】細菌べん毛繊維は分子間相互作用とフラストレーションを利用して超らせん構造の変化を制御する2008

    • 著者名/発表者名
      北尾 彰朗, 今田 勝巳, 難波 啓一
    • 雑誌名

      生物物理 Vol.40,No.1

      ページ: 11-17

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Hydration affects both harmonic and anharmonic nature of protein dynamics2008

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Nakagawa, Yasumasa Joti, Akio Kitao, Mikio Kataoka
    • 雑誌名

      Biophys. J 95

      ページ: 2916-2923

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Hydration-dependent protein dynamics revealed by molecular dynamics simuiation of crystalline Staphylococcal nuclease2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Joti, H. Nakagawa, M. Kataoka and A. Kitao
    • 雑誌名

      Journal of Physical Chemistry B 112

      ページ: 3522-3528

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18031006
  • [雑誌論文] Hydration effects on low-frequency protein dynamics observed in simulated neutron scattering spectra2008

    • 著者名/発表者名
      Yasumasa Joti, Hiroshi Nakagawa, Mikio Kataoka, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Biophys. J 94

      ページ: 4435-4443

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] 【総説】細菌べん毛繊維は分子間相互作用とフラストレーションを利用して超らせん構造の変化を制御する2008

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗, 今田勝巳, 難波啓一
    • 雑誌名

      生物物理 Vol.40,(1)

      ページ: 11-17

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Hydration-Dependent Protein Dynamics Revealed by Molecular Dynamics Simulation of Crystalline Staphylococcal Nuclease2008

    • 著者名/発表者名
      Yasumasa Joti, Hiroshi Nakagawa, Mikio Kataoka, and Akio Kitao
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B 112

      ページ: 3522-3528

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Hydration effect on low-frequency protein dynamics observed in simulated neutron scattering spectra2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Joti, H. Nakagawa, M. Kataoka and A. Kitao
    • 雑誌名

      Biophysical Journal 94

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19042005
  • [雑誌論文] Hydration-dependent protein dynamics revealed by molecular dynamics simulation of crystalline Staphylococcal nuclease2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Joti, H. Nakagawa, M. Kataoka and A. Kitao
    • 雑誌名

      Journal of Physical Chemistry B 112

      ページ: 3522-3528

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19042005
  • [雑誌論文] Hydration affects both harmonic and anharmonic nature of protein dynamics2008

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Nakagawa, Yasumasa Joti, Akio Kitao, Mikio Kataoka
    • 雑誌名

      Biophys.J. 95

      ページ: 2916-2923

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Thermal Unfolding Simulations of Bacterial Flagellin: Insight into its Refolding before Assembly2008

    • 著者名/発表者名
      Choon-Peng Chng and Akio Kitao
    • 雑誌名

      Biophys. J. (In press)

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] 【総説】細菌べん毛繊維は分子間相互作用とフラストレーションを利用して超らせん構造の変化を制御する2008

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗, 今田勝巳, 難波啓一
    • 雑誌名

      生物物理 40(1)

      ページ: 11-17

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Thermal Unfolding Simulations of Bacterial Flagellin : Insight into its Refolding before Assembly2008

    • 著者名/発表者名
      Choon-Peng Chng, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Biophys.J. 94

      ページ: 3858-3871

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Gap compression/extension mechanism of bacterial flagellar hook as the molecular universal joint.2007

    • 著者名/発表者名
      Tadaomi Furuta, Fadel A.Samatey, Hideyuki Matsunami, Katsumi Imada, Keiichi Namba, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Journal of Structural Biology 157

      ページ: 481-499

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] Picosecond fluctuating protein energy landscape mapped by pressure-temperaturer molecular dynamics simulation2007

    • 著者名/発表者名
      Lars Meinhold, Jeremy C. Smith, Akio Kitao, Ahmed H. Zewail
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 104(44)

      ページ: 17261-17265

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Non-Gaussian behavior of elastic incoherent neutron scattering profiles of proteins studied by molecular dynamics simulation2007

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Tokuhisa, Yasumasa Joti, Hiroshi Nakagawa, Akio Kitao, Kaoru Shibata, Mikio Kataoka
    • 雑誌名

      Phys. Rev. E 75

      ページ: 41912-41912

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Non-Gaussian behavior of elastic incoherent neutron scattering profiles of proteins studied by molecular dynamics simulation.2007

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Tokuhisa, Yasumasa Joti, Hiroshi Nakagawa, Akio Kitao, Kaoru Shibata, Mikio Kataoka
    • 雑誌名

      Phys. Rev. E Vol.75

      ページ: 41912-41912

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Gap compression/extension mechanism of bacterial flagellar hook as the molecular universal joint2007

    • 著者名/発表者名
      Tadaomi Furuta, Fadel A.Samatey, Hideyuki Matsunami, Katsumi Imada, Keiichi Namba, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Journal of Structural Biology 157

      ページ: 481-490

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] Picosecond fluctuating protein energy landscape mapped by pressure-temperature molecular dynamics simulation Lars Meinhold. S2007

    • 著者名/発表者名
      Lars Meinhold, Jeremy C. Smith, Akio Kitao, Ahmed H.Zewail
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 104(44)

      ページ: 17261-17265

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Picosecond fluctuating protein energy landscape mapped by pressure-temperature molecular dynamics simulation.2007

    • 著者名/発表者名
      Meinhold, L., Smith, J.C., Kitao, A., *Zewail, A.H.
    • 雑誌名

      PNAS. 104(44)

      ページ: 17261-17265

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [雑誌論文] Non-Gaussian behavior of elastic incoherent neutron scattering profiles of proteins studied by molecular dynamics simulation2007

    • 著者名/発表者名
      Tokuhisa, A., Joti, Y., Nakagawa, H., Kitao, A., & Kataoka, M.
    • 雑誌名

      Physical Review E 75

      ページ: 41912-41912

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19042005
  • [雑誌論文] Non-Gaussian behavior of elastic incoherent neutron scattering profiles of proteins studied by molecular dynamics simulation2007

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Tokuhisa, Yasumasa Joti, Hiroshi Nakagawa, Akio Kitao, Kaoru Shibata, Mikio Kataoka
    • 雑誌名

      Phys.Rev.E 75

      ページ: 41912-41912

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Effects of Water Model and Simulation Box Size on Protein Diffusional Motions2007

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Takemura, Akio Kitao
    • 雑誌名

      J.Phys.Chem.B 111

      ページ: 11870-11872

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Gap compression/extension mechanism of bacterial flagellar hook as the molecular universal joint2007

    • 著者名/発表者名
      Taaomi Furuta, Hieyuki Matsunami, Katsumi Imada, Keiichi Namba and Akio Kitao
    • 雑誌名

      Fadel A. Samatey, J. Struct. Biol Vol.l57

      ページ: 481-491

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Gap compression/extension mechanism of bacterial flagellar hook as the molecular universal joint2007

    • 著者名/発表者名
      Tadaomi Furuta, Hideyuki Matsunami, Katsumi Imada, Keiichi Namba, and Akio Kitao
    • 雑誌名

      Fadel A. Samatey, J. Struct. Biol. Vol.157

      ページ: 481-491

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Effects of Water Model and Simulation Box Size on Protein Diffusional Motions2007

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Takemura, Akio Kitao
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B 111

      ページ: 11870-11872

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Picosecond fluctuating protein energy landscape mapped by pressure-temperaturer molecular dynamics simulation Lars Meillhold. S2007

    • 著者名/発表者名
      Jeremy C. Smith, Akio Kitao and Ahmed H. Zewail
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA Vol.104,No.4

      ページ: 17261-17265

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Picosecond fluctuating protein energy landscape mapped by pressure-temperaturer molecular dynamics simulation Lars Meinhold. S2007

    • 著者名/発表者名
      Lars Meinhold, Jeremy C. Smith, Akio Kitao, Ahmed H. Zewail
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104(44)

      ページ: 17261-17265

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Non-Gaussian behavior of elasticincoherent neutron scattering profiles of proteins studied by molecular dynamics simulation2007

    • 著者名/発表者名
      Atsusi Tokuhisa, Yasumasa Joti, Hiroshi Nakagawa, Akio Kitao, Kaoru Shibata Mikio Kataoka
    • 雑誌名

      Phys. Rev. E Vol.75

      ページ: 41912-41912

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Non-Gaussian behavior of elastic incoherent neutron scattering profiles of proteins studied by molecular dynamics simulation2007

    • 著者名/発表者名
      Tokuhisa, A., Joti, Y., Nakagawa, H. Kitao, A., & Kataoka, M.
    • 雑誌名

      Physical Review E 75

      ページ: 41912-41912

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18031006
  • [雑誌論文] Gap compression/extension mechanism of bacterial flagellar hook as the molecular universal joint2007

    • 著者名/発表者名
      Tadaomi Furuta, Fadel A.Samatey, Hideyuki Matsunami, Katsumi Imada, Keiichi Namba, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Journal of Structural Biology 157

      ページ: 481-490

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Effects of Water Model and Simulation Box Size on Protein Diffusional Motions2007

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Takemura and Akio Kitao
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B Voll.111

      ページ: 11870-11872

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Effects of Water Model and Simulation Box Size on Protein Diffusional Motions2007

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Takemura and Akio Kitao
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B Vol.111

      ページ: 11870-11872

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [雑誌論文] Gap compression/extension mechanism of bacterial flagellar hook as the molecular universal joint2007

    • 著者名/発表者名
      Tadaomi Furuta, Hideyuki Matsunami, Katsumi Imada, Keiichi Namba, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Fadel A. Samatey, J. Struct. Biol 157

      ページ: 481-491

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Picosecond fluctuating protein energy landscape mapped by pressure-temperaturer molecular dynamics simulation Lars Meinhold. S2007

    • 著者名/発表者名
      Jeremy C. Smith, Akio Kitao and Ahmed H. Zewail
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA Vol.104(44)

      ページ: 17261-17265

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Dynamical heterogeneity of protein dynamics studied by elastic incoherent neutron scattering and molecular simulations2006

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Nakagawa, Atsushi Tokuhisa,, H. Kamikubo, Yasumasa Joti, Akio Kitao, Kaoru Shibata, Mikio Kataoka
    • 雑誌名

      Material Science and Engineering A 442

      ページ: 356-360

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Switch interactions control energy frustration and multiple flagellar filament structures2006

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao, Koji Yonekura, Saori Maki-Yonekura, Fadel A. Samatey, Katsumi Imada, Keiichi Namba, Nobuhiro Go
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci 103

      ページ: 4894-4899

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Dynamical heterogeneity of protein dynamics studied by elastic incoherent neutron scattering and molecular simulations2006

    • 著者名/発表者名
      Nakagawa, H., Tokuhisa, A., Kamikubo, H., Joti, Y., Kitao, A., Kataoka, M.
    • 雑誌名

      Materials Science and Engineering : A 442

      ページ: 356-360

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18031006
  • [雑誌論文] Switch interactions control energy frustration and multiple flagellar filament structures.2006

    • 著者名/発表者名
      *Kitao, A., Yonekura, K., Maki-Yonekura, S., Samatey, F.A., Imada, K., Namba, K., Go, N.
    • 雑誌名

      Proc. Nat'l. Acad. Sci. U.S.A. 103

      ページ: 4894-4899

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [雑誌論文] Molecular Dynamics Simulations of NAD+-induced Domain Closure in Horse Liver Alcohol Dehydrogenase_2006

    • 著者名/発表者名
      Steven Hayward, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Biophysical Journa1 91

      ページ: 1823-1831

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] Amplitudes and directions of internal protein motions from a JAM analysis of 15N relaxation data2006

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao, Gerhard Wagner
    • 雑誌名

      Magnetic Resonance in Chemistry 44

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] Amplitudes and directions of internal protein motions from a JAM analysis of ^<15>N relaxation data2006

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao, Gerhard Wagner
    • 雑誌名

      Magnetic Resonance in Chemistry (In press)

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] Amplitudes and directions of internal protein motions from a JAM analysis of 15N relaxation data2006

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao, Gerhard Wagner
    • 雑誌名

      Magn. Reson. Chem 44

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Amplitudes and directions of internal protein motions from a JAM analysis of 15N relaxation data2006

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao, Gerhard Wagner
    • 雑誌名

      Magnetic Resonance in Chemistry 44

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Hydration-coupled protein boson peak measured by incoherent neutron scattering2006

    • 著者名/発表者名
      H.Nakagawa, M.Kataoka, Y.Joti, A.Kitao, K.Shibata, A.Tokuhisa, I.Tsukushi, N.Go
    • 雑誌名

      Physica B 385-385

      ページ: 871-873

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] 分子シミュレーションと中性子散乱による蛋白質ダイナミクスの研究2006

    • 著者名/発表者名
      城地保昌, 北尾彰朗
    • 雑誌名

      分子シミュレーション研究会会誌「アンサンブル」 8

      ページ: 44-47

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] 蛋白質の効率的機能を支えるメカニズム2006

    • 著者名/発表者名
      城地 保昌, 北尾 彰朗
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 51

      ページ: 972-978

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18031006
  • [雑誌論文] Switch interactions control energy frustration and multiple flagellar filament structures2006

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao, Koji Yonekura, Saori Maki-Yonekura, Fadel A.Samatey, Katsumi Imada, Keiichi Namba, Nobuhiro Go
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci. 103(13)

      ページ: 4894-4899

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] Dynamical heterogeneity of protein dynamics studied by elastic incoherent neutron scattering and molecular simulations2006

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Nakagawa, Atsushi Tokuhisa, H.Kamikubo, Yasumasa Joti, Akio Kitao, Kaoru Shibata, Mikio Kataoka
    • 雑誌名

      Material Science and Engineering A 442

      ページ: 356-360

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Hydration-coupled protein boson peak measured by incoherent neutron scattering2006

    • 著者名/発表者名
      Nakagawa, H., Kataoka, M., Joti, Y., Kitao, A., Shibata, K., Tokuhisa, A., Tsukushi, I., Go, N
    • 雑誌名

      Physica B 385-386

      ページ: 871-873

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18031006
  • [雑誌論文] Molecular Dynamics Simulations of NAD+-induced Domain Closure in Horse Liver Alcohol Dehydrogenase2006

    • 著者名/発表者名
      Steven Hayward, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Biophysical Journal 91

      ページ: 1823-1831

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Amplitudes and directions of internal protein motions from a JAM analysis of ^<15>N relaxation data2006

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao, Gerhard Wagner
    • 雑誌名

      Magnetic Resonance in Chemistry (In press)

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16041208
  • [雑誌論文] 分子シミュレーションと中性子散乱による蛋白質ダイナミクスの研究2006

    • 著者名/発表者名
      城地 保昌, 北尾 彰朗
    • 雑誌名

      分子シミュレーション研究会会誌「アンサンブル」 8

      ページ: 44-47

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18031006
  • [雑誌論文] Switch interactions control energy frustration and multiple flagellar filament structures2006

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao, Koji Yonekura, Saori Maki-Yonekura, Fadel A.Samatey, Katsumi Imada, Keiichi Namba, Nobuhiro Go
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. 103(13)

      ページ: 4893-4899

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] Switch interactions control energy frustration and multiple flagellar filament structures.2006

    • 著者名/発表者名
      *Kitao, A., Yonekura, K., Maki-Yonekura, S., Samatey, F.A., Imada, K., Namba, K., Go, N
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103

      ページ: 4894-4899

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [雑誌論文] Dynamical heterogeneity of protein dynamics studied by elastic incoherent neutron scattering and molecular simulations2006

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Nakagawa, Atsushi Tokuhisa, H.Kamikubo, Yasumasa Joti, Akio Kitao, Kaoru Shibata, Mikio Kataoka
    • 雑誌名

      Material Science and Engineering A 442

      ページ: 356-360

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] Switch interactions control energy frustration and multiple flagellar filament structures2006

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao, Koji Yonekura, Saori Maki-Yonekura, Fadel A. Samatey, Katsumi Imada, Keiichi Namba, Nobuhiro Go
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. 103 (13)

      ページ: 4894-4899

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] Switch interactions control energy frustration and multiple flagellar filament structures2006

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao, Koji Yonekura, Saori Maki-Yonekura, Fadel A.Samatey, Katsumi Imada, Keiichi Namba, Nobuhiro Go
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci. 103(13)

      ページ: 4894-4899

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Switch interactions control energy frustration and multiple flagellar filament structures.2006

    • 著者名/発表者名
      A.Kitao
    • 雑誌名

      Proc. Nat'l. Acad. Sci. U.S.A. 103

      ページ: 4894-4899

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [雑誌論文] 蛋白質の効率的機能を支えるメカニズム2006

    • 著者名/発表者名
      城地保昌, 北尾彰朗
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 51(8)

      ページ: 972-978

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Hydration-coupled protein boson peak measured by incoherent neutron scattering2006

    • 著者名/発表者名
      H.Nakagawa, M.Kataoka, Y.Joti, A.Kitao, K.Shibata, A.Tokuhisa, I.Tsukushi, N.Go
    • 雑誌名

      Physica B 385-386

      ページ: 871-873

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] 蛋白質の効率的機能を支えるメカニズム2006

    • 著者名/発表者名
      城地保昌, 北尾彰朗
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 51 (8)

      ページ: 972-978

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Switch interactions control energy frustration and multiple flagellar filament structures2006

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao, Koji Yonekura, Saori Maki-Yonekura, Fadel A.Samatey, Katsumi Imada, Keiichi Namba, Nobuhiro Go
    • 雑誌名

      Proc.Natl.Acad.Sci. 103(13)

      ページ: 4894-4899

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16041208
  • [雑誌論文] Amplitudes and directions of intemal protein motions from a JAM analysis of 15N relaxation data2006

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao, Gerhard Wagner
    • 雑誌名

      Magnetic Resonance in Chemistry 44

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] Hydration-coupled protein boson peak measured by incoherent neutron scattering2006

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Nakagawa, Mikio Kataoka, Yasumasa Joti, Akio Kitao, Kaoru Shibata, Atsushi Tokuhisa, I. Tsukushi, Nobuhiro Go
    • 雑誌名

      Physica B 385-6

      ページ: 871-873

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Amplitudes and directions of internal protein motions from a JAM analysis of ^<15>N relaxation data2006

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao, Gerhard Wagner
    • 雑誌名

      Magnetic Resonance in Chemistry (In prees)

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Molecular Dynamics Simulations of NAD+-induced Domain Closure in Horse Liver Alcohol Dehydrogenase2006

    • 著者名/発表者名
      Steven Hayward, Akio Kitao
    • 雑誌名

      Biophysical Journal 91

      ページ: 1823-1831

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] Molecular Dynamics Simulations of NAD+-Induced Domain Closure in Horse Liver Alcohol Dehydrogenase2006

    • 著者名/発表者名
      Hayward, S., Kitao, A
    • 雑誌名

      Biophysical Journal 91

      ページ: 1823-1831

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18031006
  • [雑誌論文] 生体超分子のユニバーサルジョイント-in silicoで探る細菌べん毛フックのメカニズム,2005

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗, Fadel A.Samatey, 松波秀行, 今田勝巳, 難波啓一
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 50(10)

      ページ: 1335-1340

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] 生体超分子のユニバーサルジョイント-in silicoで探る細菌べん毛フックのメカニズム,2005

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗, Fadel A.Samatey, 松波秀行, 今田勝巳, 難波啓一
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 50(10)

      ページ: 1335-1340

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16041208
  • [雑誌論文] Protein Boson Peak Originated from Hydration-Related Multiple Minima Energy Landscape2005

    • 著者名/発表者名
      Yasumasa Joti, Akio Kitao, Nobuhiro Go
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc 127

      ページ: 8705-8709

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] べん毛による細菌の泳ぎ方と方向転換の分子機構2005

    • 著者名/発表者名
      今田勝巳, Fadel A.Samatey, 松波秀行, 長島重広, 北尾彰朗, 米倉功治, 眞木さおり, 難波啓一
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 50(10)

      ページ: 1328-1334

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] べん毛による細菌の泳ぎ方と方向転換の分子機構2005

    • 著者名/発表者名
      今田勝巳, Fadel A. Samatey, 松波秀行, 長島重広, 北尾彰朗, 米倉功治, 眞木さおり, 難波啓一
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 50(10)

      ページ: 1328-1334

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Universal joint mechanism of Biological Supramolecule2005

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao, Fadel A.Samatey, Hideyuki Matsunami, Katsumi Imada, Keiichi Namba
    • 雑誌名

      Protein, Nucreic Acid and Enzyme 50(10)

      ページ: 1335-1340

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] べん毛による細菌の泳ぎ方と方向転換の分子機構2005

    • 著者名/発表者名
      今田勝巳, Fadel A.Samatey, 松波秀行, 長島重広, 北尾彰朗, 米倉功治, 眞木さおり, 難波啓一
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 50(10)

      ページ: 1328-1334

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] 生体超分子のユニバーサルジョイント-in silicoで探る細菌べん毛フックのメカニズム2005

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗, Fadel A.Samatey, 松波秀行, 今田勝巳, 難波啓一
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 50(10)

      ページ: 1335-1340

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] 蛋白質の効率的機能を支えるメカニズム2005

    • 著者名/発表者名
      城地保昌, 北尾彰朗
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 51(8)

      ページ: 972-978

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] 生体超分子のユニバーサルジョイント-in silicoで探る細菌べん毛フックのメカニズム2005

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗, Fadel A.Samatey, 松波秀行, 今田勝巳, 難波啓一
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 50(10)

      ページ: 1335-1340

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] 生体超分子のユニバーサルジョイント-in silicoで探る細菌べん毛フックのメカニズム2005

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗, Fadel A. Samatey, 松波秀行, 今田勝巳, 難波啓一
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 50(10)

      ページ: 1335-1340

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Protein Boson Peak Originated from Hydration-RelatedMultiple Minima Energy Landscape2005

    • 著者名/発表者名
      Yasumasa Joti, Akio Kitao, Nobuhiro Go
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc 127

      ページ: 8705-8709

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] 生体超分子のユニバーサルジョイント.In silicoで探る細菌べん毛フックのメカニズム2005

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 雑誌名

      蛋白質 核酸 酵素 50

      ページ: 1335-1340

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [雑誌論文] Protein Boson Peak Originated from Hydration-Related Multiple Minima Energy Landscape2005

    • 著者名/発表者名
      asumasa Joti, Akio Kitao, Nobuhiro Go
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc 127

      ページ: 8705-8709

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Protein Boson Peak Originated from Hydration-Related Multiple Minima Energy Landscape2005

    • 著者名/発表者名
      Yasumasa Joti, Akio Kitao, Nobuhiro Go
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc 127

      ページ: 8705-8709

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16041208
  • [雑誌論文] べん毛による細菌の泳ぎ方と方向転換の分子機構2005

    • 著者名/発表者名
      今田勝巳, Fadel A.Samatey, 松波秀行, 長島重広, 北尾彰朗, 米倉功治, 眞木さおり, 難波啓一
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 50(10)

      ページ: 1328-1334

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16041208
  • [雑誌論文] Molecular simulation study to examine the possibility of detecting collective motion in protein by inelastic neutron scattering2004

    • 著者名/発表者名
      Y.Joti, A.Kitao, N.Go
    • 雑誌名

      Physica B 350

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-13208010
  • [雑誌論文] Structure of the bacterial flagellar hook and implication for the molecular universal joint mechanism2004

    • 著者名/発表者名
      Fadel A.Samatey, Hideyuki Matsunami, Katsumi Imada, Shigehiro Nagashima, Tanvir R.Shaikh, Dennis R.Thomas, James Z.Chen, David J.De Rosier, Akio Kitao, Keiichi Namba
    • 雑誌名

      Nature 431

      ページ: 1062-1068

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] Structure of the bacterial flagellar hook and implication for the molecular universal joint mechanism2004

    • 著者名/発表者名
      TR Shaikh, DR Thomas, JZ Chen, DJ De Rosier, A Kitao, K Namba
    • 雑誌名

      Nature 431

      ページ: 1062-1068

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-13208010
  • [雑誌論文] Molecular simulation study to examine the possibility of detecting collective motion in protein by inelastic neutron scattering2004

    • 著者名/発表者名
      Yasumasa Joti, Akio Kitao, Nobuhiro Go
    • 雑誌名

      Physica B 350

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Slow Protein Dynamics to be detected in Inelastic Neutron Scattering Spectra Studied by Molecular Simulations", Proceedings of 3rd International Symposium on Slow Dynamics in Complex Systems2004

    • 著者名/発表者名
      Yasumasa Joti, Akio Kitao, Nobuhiro Go
    • 雑誌名

      edited by M. Tokuyama & I. Oppenheim

      ページ: 358-359

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Structure of the bacterial flagellar hook and implication for the molecular universal joint mechanism2004

    • 著者名/発表者名
      Fadel A. Samatey, Hideyuki Matsunami, Katsumi Imada, Shigehiro Nagashima, Tanvir R. Shaikh, Dennis R. Thomas, James Z. Chen, David J. De Rosier, Akio Kitao, Keiichi Namba
    • 雑誌名

      Nature 431

      ページ: 1062-1068

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [雑誌論文] Structure of the bacterial flagellar hook and implication for the molecular universal joint mechanism2004

    • 著者名/発表者名
      Fadel A.Samatey, Hideyuki Matsunami, Katsumi Imada, Shigehiro Nagashima, Tanvir R.Shaikh, Dennis R.Thomas, James Z.Chen, David J.De Rosier, Akio Kitao, Keiichi Namba
    • 雑誌名

      NATURE 431

      ページ: 1062-1068

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15300103
  • [雑誌論文] Structure of the bacterial flagellar hook and implication for the molecular universal joint mechanism.2004

    • 著者名/発表者名
      Samatey, F.A., Matsunami, H., Imada, K., Nagashima, S., Shaikh, T.R., Thomas, D., Chen, J.Z., DeRosier, D.J., Kitao, A., *Namba K.
    • 雑誌名

      Nature 431

      ページ: 1062-1068

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [雑誌論文] The Effects of solvent and anharmonicity on incoherent inelastic neutron scattering spectra of proteins2002

    • 著者名/発表者名
      Kitao A
    • 雑誌名

      Journal of Neutron Research 10

      ページ: 143-147

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-13208010
  • [雑誌論文] The Effects of solvent and anharmonicity on incoherent inelastic neutron scattering spectra of proteins2002

    • 著者名/発表者名
      Kitao A.
    • 雑誌名

      Journal of Neutron Research 10

      ページ: 143-147

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-13208010
  • [学会発表] Mechanisms of Conformational Change, Association, and Dissociation of Proteins investigated by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics2024

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      JCUP XII 2024
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] 芳香族環相互作用に注目した変異型アデノ シン A2A 受容体とリガンドの結合と解離 の分子動力学計算2024

    • 著者名/発表者名
      堀 立樹、Tran Phuoc Duy、松岡佑真、堂浦智裕、荒谷剛史、浅田秀基、岩田想、清中茂 樹、北尾彰朗
    • 学会等名
      第38回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] Study the binding characteristic of Glutathione S-transferase to Anthocyanins Based on Molecular Dynamics Simulation2024

    • 著者名/発表者名
      Wenbo Lu and Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] Conformational dynamics and function of membrane proteins regulated by ligand binding2024

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      7th International Symposium of JSPS Core-to-Core Program on “Molecular Recognition Mechanism between Flexible Molecules”
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] Mechanisms of Conformational Change, Association, and Dissociation of Proteins investigated by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics2024

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      JCUP XII 2024
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] べん毛LPリング・ロッド系の回転シミュレーション2024

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗、山口智子、牧野文信、宮田知子、南野徹、加藤貴之、難波啓一
    • 学会等名
      生体運動研究合同班会議2024
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] べん毛LPリング・ロッド系の回転シミュレーション2024

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗、山口智子、牧野文信、宮田知子、南野徹、加藤貴之、難波啓一
    • 学会等名
      生体運動研究合同班会議2024
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Mechanisms of Conformational Change, Association, and Dissociation of Proteins investigated by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics2024

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      NanoBioCoM2024
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] Specific and non-specific interactions of intrinsically disordered regions of proteins2024

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      UNDERSTANDING SURFACES AND INTERFACES: A SYMPOSIUM CELEBRATING 7 DECADES OF SERVICE
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] FlhB/FliPQR複合体のMDシミュレーションMD simulation of the FlhB/FliPQ complex2024

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      2024年度べん毛研究交流会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Phate PaCS-MD: graph 理論を用いた並列 カスケード選択分子動力学2024

    • 著者名/発表者名
      向山雅輝、北尾彰朗
    • 学会等名
      第38回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] 芳香族環相互作用に注目した変異型アデノ シン A2A 受容体とリガンドの結合と解離 の分子動力学計算2024

    • 著者名/発表者名
      堀 立樹、Tran Phuoc Duy、松岡佑真、堂浦智裕、荒谷剛史、浅田秀基、岩田想、清中茂 樹、北尾彰朗
    • 学会等名
      第38回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Gタンパク質アデノシンA2a受容体複合体活性化ダイナミクスの解明2024

    • 著者名/発表者名
      萩本紗理、北尾彰朗
    • 学会等名
      第13回日本生物物理学会関東支部会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Specific and non-specific interactions of intrinsically disordered regions of proteins2024

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      UNDERSTANDING SURFACES AND INTERFACES: A SYMPOSIUM CELEBRATING 7 DECADES OF SERVICE
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] LPリング内のロッドの回転シミュレーション2024

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      2023年度べん毛研究交流会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Decoupling processes of the Adenosine A2A receptor from G-proteins through the lens of dPaCS-MD simulations2024

    • 著者名/発表者名
      Tran Phuoc Duy、Louis-Philippe Picard、Alexander Orazietti、Sari Hagimoto、Adnan Sljoka、R. Scott Prosser and Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] PaCS-MD によるアクトミオシンの解離予測2024

    • 著者名/発表者名
      林怜矢、北尾彰朗、難波啓一
    • 学会等名
      第38回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] Molecular mechanisms for smooth rotation of the flagellar rod within the LP ring2024

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao、Tomoko Yamaguchi、Fumiaki Makino、 Tomoko Miyata、Tohru Minamino、Takayuki Kato and Keiichi Namba
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] FlhB/FliPQR複合体のMDシミュレーションMD simulation of the FlhB/FliPQ complex2024

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      2024年度べん毛研究交流会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] Interactive flexible receptor docking using DockIT2024

    • 著者名/発表者名
      Steven Hayward, Stephn Laycock, Georgios Lakovou, Akio Kitao
    • 学会等名
      NanoBioCoM2024
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] Different behavior of dissociation pathways of glutamine and glutamate in complex with Medaka Taste Receptor T1R2024

    • 著者名/発表者名
      Vi Toan Lam、Duy Phuoc Tran、Hao Thai Nguyen、Atsuko Yamashita and Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Conformational dynamics and function of membrane proteins regulated by ligand binding2024

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      7th International Symposium of JSPS Core-to-Core Program on “Molecular Recognition Mechanism between Flexible Molecules”
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] PEG と抗 PEG 抗体の動的立体構造解析に よる薬物送達システムの発展2024

    • 著者名/発表者名
      伊藤悠世、森健、Yiwei Liu、竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第38回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Molecular Dynamics Simulation on Amyloid β(1-40) Heterodimerization2024

    • 著者名/発表者名
      君園辰弘、北尾彰朗、TRAN Phuoc Duy
    • 学会等名
      第24回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] Unveiling dynamics of Adenosine A2a receptor coupled to G proteins2024

    • 著者名/発表者名
      Sari Hagimoto、Duy Tran And Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Conformational dynamics and function of membrane proteins regulated by ligand binding2024

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      7th International Symposium of JSPS Core-to-Core Program on “Molecular Recognition Mechanism between Flexible Molecules”
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] PEG と抗 PEG 抗体の動的立体構造解析に よる薬物送達システムの発展2024

    • 著者名/発表者名
      伊藤悠世、森健、Yiwei Liu、竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第38回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] PaCS-MD/MSM を用いた糖輸送体 SGLT の糖選択性の原理に関する研究2024

    • 著者名/発表者名
      河野弘士、竹村和浩、藤原祐一郎、北尾彰朗
    • 学会等名
      第38回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] 先端分子シミュレーションで探る生体分子の出会いと別れ2024

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      東工大 物質・情報卓越教育院 第5回最先端研究セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] PaCS-MD/MSM を用いた糖輸送体 SGLT の糖選択性の原理に関する研究2024

    • 著者名/発表者名
      河野弘士、竹村和浩、藤原祐一郎、北尾彰朗
    • 学会等名
      第38回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] 先端分子シミュレーションで探る生体分子の出会いと別れ2024

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      東工大 物質・情報卓越教育院 第5回最先端研究セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Mechanisms of Conformational Change, Association, and Dissociation of Proteins investigated by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics2024

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      JCUP XII 2024
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Gタンパク質アデノシンA2a受容体複合体活性化ダイナミクスの解明2024

    • 著者名/発表者名
      萩本紗理、北尾彰朗
    • 学会等名
      第13回日本生物物理学会関東支部会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Molecular Dynamics Simulation on Amyloid β(1-40) Heterodimerization2024

    • 著者名/発表者名
      Tatsuhiro Kimizono、Duy Tran and Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Molecular mechanisms for smooth rotation of the flagellar rod within the LP ring2024

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao、Tomoko Yamaguchi、Fumiaki Makino、 Tomoko Miyata、Tohru Minamino、Takayuki Kato and Keiichi Namba
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] The Regulatory Role of p53 C-Terminal Domain Acetylation in Modulating the Dynamics of SIR2’s NAD+ Binding Pocket2024

    • 著者名/発表者名
      Zhen Bai、Tatsuhiro Kimizono and Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Different behavior of dissociation pathways of glutamine and glutamate in complex with Medaka Taste Receptor T1R2024

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Vi Toan Lam, Hao Thai Nguyen, Atsuko Yamashita, Akio Kitao
    • 学会等名
      21st IUPAB Congress 2024 (IUPAB2024)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27117
  • [学会発表] SMDを用いたPomAB複合体のナトリウムイオン透過経路の同定Identification of sodium ion penetration pathways through the PomAB stator using SMD2024

    • 著者名/発表者名
      Tran Phuoc Duy, Akio Kitao
    • 学会等名
      2024年度べん毛研究交流会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Ions Permeation through the Stators of Bacterial Flagellar Motors2024

    • 著者名/発表者名
      Tran Phuoc Duy, Akio Kitao
    • 学会等名
      NanoBioCoM2024
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] Ions Permeation through the Stators of Bacterial Flagellar Motors2024

    • 著者名/発表者名
      Tran Phuoc Duy, Akio Kitao
    • 学会等名
      NanoBioCoM2024
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Study the binding characteristic of Glutathione S-transferase to Anthocyanins Based on Molecular Dynamics Simulation2024

    • 著者名/発表者名
      Wenbo Lu and Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] PaCS-MD によるアクトミオシンの解離予測2024

    • 著者名/発表者名
      林怜矢、北尾彰朗、難波啓一
    • 学会等名
      第38回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Molecular Dynamics Simulation on Amyloid β(1-40) Heterodimerization2024

    • 著者名/発表者名
      Tatsuhiro Kimizono、Duy Tran and Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] PaCS-MD/MSM を用いた糖輸送体 SGLT の糖選択性の原理に関する研究2024

    • 著者名/発表者名
      河野弘士、竹村和浩、藤原祐一郎、北尾彰朗
    • 学会等名
      第38回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] FlhB/FliPQR複合体のMDシミュレーションMD simulation of the FlhB/FliPQ complex2024

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      2024年度べん毛研究交流会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Specific and non-specific interactions of intrinsically disordered regions of proteins2024

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      UNDERSTANDING SURFACES AND INTERFACES: A SYMPOSIUM CELEBRATING 7 DECADES OF SERVICE
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Interactive flexible receptor docking using DockIT2024

    • 著者名/発表者名
      Steven Hayward, Stephn Laycock, Georgios Lakovou, Akio Kitao
    • 学会等名
      NanoBioCoM2024
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Unveiling dynamics of Adenosine A2a receptor coupled to G proteins2024

    • 著者名/発表者名
      Sari Hagimoto、Duy Tran And Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] Different behavior of dissociation pathways of glutamine and glutamate in complex with Medaka Taste Receptor T1R2024

    • 著者名/発表者名
      Vi Toan Lam、Duy Phuoc Tran、Hao Thai Nguyen、Atsuko Yamashita and Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] 芳香族環相互作用に注目した変異型アデノ シン A2A 受容体とリガンドの結合と解離 の分子動力学計算2024

    • 著者名/発表者名
      堀 立樹、Tran Phuoc Duy、松岡佑真、堂浦智裕、荒谷剛史、浅田秀基、岩田想、清中茂 樹、北尾彰朗
    • 学会等名
      第38回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Phate PaCS-MD: graph 理論を用いた並列 カスケード選択分子動力学2024

    • 著者名/発表者名
      向山雅輝、北尾彰朗
    • 学会等名
      第38回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Unveiling dynamics of Adenosine A2a receptor coupled to G proteins2024

    • 著者名/発表者名
      Sari Hagimoto、Duy Tran And Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] LPリング内のロッドの回転シミュレーション2024

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      2023年度べん毛研究交流会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Phate PaCS-MD: graph 理論を用いた並列 カスケード選択分子動力学2024

    • 著者名/発表者名
      向山雅輝、北尾彰朗
    • 学会等名
      第38回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Mechanisms of Conformational Change, Association, and Dissociation of Proteins investigated by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics2024

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      NanoBioCoM2024
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Study the binding characteristic of Glutathione S-transferase to Anthocyanins Based on Molecular Dynamics Simulation2024

    • 著者名/発表者名
      Wenbo Lu and Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Different behavior of dissociation pathways of glutamine and glutamate in complex with Medaka Taste Receptor T1R2024

    • 著者名/発表者名
      Vi Toan Lam、Duy Phuoc Tran、Hao Thai Nguyen、Atsuko Yamashita and Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] 先端分子シミュレーションで探る生体分子の出会いと別れ2024

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      東工大 物質・情報卓越教育院 第5回最先端研究セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] The Regulatory Role of p53 C-Terminal Domain Acetylation in Modulating the Dynamics of SIR2’s NAD+ Binding Pocket2024

    • 著者名/発表者名
      Zhen Bai、Tatsuhiro Kimizono and Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] Molecular Dynamics Simulation on Amyloid β(1-40) Heterodimerization2024

    • 著者名/発表者名
      Tatsuhiro Kimizono、Duy Tran and Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] LPリング内のロッドの回転シミュレーション2024

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      2023年度べん毛研究交流会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Molecular Dynamics Simulation on Amyloid β(1-40) Heterodimerization2024

    • 著者名/発表者名
      君園辰弘、北尾彰朗、TRAN Phuoc Duy
    • 学会等名
      第24回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Gタンパク質アデノシンA2a受容体複合体活性化ダイナミクスの解明2024

    • 著者名/発表者名
      萩本紗理、北尾彰朗
    • 学会等名
      第13回日本生物物理学会関東支部会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] The Effect of Tricaprylin Surface on The Lid Region Dynamics of Candida antarctica Lipase B2024

    • 著者名/発表者名
      Tegar Nurwahyu Wijaya and Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Molecular mechanisms for smooth rotation of the flagellar rod within the LP ring2024

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao、Tomoko Yamaguchi、Fumiaki Makino、 Tomoko Miyata、Tohru Minamino、Takayuki Kato and Keiichi Namba
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Decoupling processes of the Adenosine A2A receptor from G-proteins through the lens of dPaCS-MD simulations2024

    • 著者名/発表者名
      Tran Phuoc Duy、Louis-Philippe Picard、Alexander Orazietti、Sari Hagimoto、Adnan Sljoka、R. Scott Prosser and Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Molecular Dynamics Simulation on Amyloid β(1-40) Heterodimerization2024

    • 著者名/発表者名
      君園辰弘、北尾彰朗、TRAN Phuoc Duy
    • 学会等名
      第24回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Mechanisms of Conformational Change, Association, and Dissociation of Proteins investigated by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics2024

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      NanoBioCoM2024
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] The Effect of Tricaprylin Surface on The Lid Region Dynamics of Candida antarctica Lipase B2024

    • 著者名/発表者名
      Tegar Nurwahyu Wijaya and Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] The Regulatory Role of p53 C-Terminal Domain Acetylation in Modulating the Dynamics of SIR2’s NAD+ Binding Pocket2024

    • 著者名/発表者名
      Zhen Bai、Tatsuhiro Kimizono and Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Interactive flexible receptor docking using DockIT2024

    • 著者名/発表者名
      Steven Hayward, Stephn Laycock, Georgios Lakovou, Akio Kitao
    • 学会等名
      NanoBioCoM2024
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] The Effect of Tricaprylin Surface on The Lid Region Dynamics of Candida antarctica Lipase B2024

    • 著者名/発表者名
      Tegar Nurwahyu Wijaya and Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] Decoupling processes of the Adenosine A2A receptor from G-proteins through the lens of dPaCS-MD simulations2024

    • 著者名/発表者名
      Tran Phuoc Duy、Louis-Philippe Picard、Alexander Orazietti、Sari Hagimoto、Adnan Sljoka、R. Scott Prosser and Akio Kitao
    • 学会等名
      IUPAB2024
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-24H01357
  • [学会発表] べん毛LPリング・ロッド系の回転シミュレーション2024

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗、山口智子、牧野文信、宮田知子、南野徹、加藤貴之、難波啓一
    • 学会等名
      生体運動研究合同班会議2024
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] PEG と抗 PEG 抗体の動的立体構造解析に よる薬物送達システムの発展2024

    • 著者名/発表者名
      伊藤悠世、森健、Yiwei Liu、竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第38回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] PaCS-MD によるアクトミオシンの解離予測2024

    • 著者名/発表者名
      林怜矢、北尾彰朗、難波啓一
    • 学会等名
      第38回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Sampling the conformational transition of the monomer of Nsp15 of the SARS-nCoV2 gives a hint to inhibit its hexamer2023

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran and Akio Kitao
    • 学会等名
      NanoBioCoM2023
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] LPリング中のロッドの回転シミュレーション Simulating the rod rotation in LP-ring2023

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      2022年度べん毛研究交流会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] An efficient screening, an accurate evaluation, and a simple prediction of protein complex structures2023

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Takemura and Akio Kitao
    • 学会等名
      ICMS2023
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] LPリング中のロッドの回転シミュレーション Simulating the rod rotation in LP-ring2023

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      2022年度べん毛研究交流会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Unveiling the mGLU1 dimer dynamics during partially-active to inactive state transition2023

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran、Kitao Akio
    • 学会等名
      令和5年度 新学術領域研究「高速分子動画」シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] How the bacterial Flagellar Motor stator works: an insight from molecular dynamics simulation2023

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran、Akio Kitao
    • 学会等名
      CCP2023
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Mechanisms of Bacterial flagellar rotation and roles of water as lubricant2023

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      理研研究会「Multi-scale Molecular Dynamics Simulation and Machine Learning of Biomolecular Systems」
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Unveiling the mGLU1 dimer dynamics during partially-active to inactive state transition2023

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran、Kitao Akio
    • 学会等名
      令和5年度 新学術領域研究「高速分子動画」シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Conformational Dynamics and Association/Dissociation Processes of Biological Macromolecules Investigated by Advanced Molecular Simulation2023

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      ICMS2023
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] How the bacterial Flagellar Motor stator works: an insight from molecular dynamics simulation2023

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran、Akio Kitao
    • 学会等名
      CCP2023
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] The Effect of Tricaprylin Surface on The Lid Region Dynamics of Candida antarctica Lipase B2023

    • 著者名/発表者名
      Tegar Nurwahyu Wijaya and Akio Kitao
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Rotational mechanisms of bacterial flagellumand roles of water2023

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      TSRC Workshop [Protein Dynamics]
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Mechanisms of Bacterial flagellar rotation and roles of water as lubricant2023

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      理研研究会「Multi-scale Molecular Dynamics Simulation and Machine Learning of Biomolecular Systems」
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Conformational Change and Association/Dissociation of Proteins investigated by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics2023

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Core-to-core international symposium
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Molecular mechanisms of structure support and smooth rotation in the bushing/rod complex of bacterial flagella2023

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      高速分子動画 国際シンポジウム2023
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Unveiling the dynamics of Adenosine A2a receptor coupling to the G proteins: a molecular dynamics simulation study(アデノシンA2a受容体とGタンパク質との結合のダイナミクスの解明: 分子動力学シミュレーション研究による)2023

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Sari Hagimoto and Akio Kitao
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] An efficient screening, an accurate evaluation, and a simple prediction of protein complex structures2023

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Takemura and Akio Kitao
    • 学会等名
      ICMS2023
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] An efficient screening, an accurate evaluation, and a simple prediction of protein complex structures2023

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Takemura and Akio Kitao
    • 学会等名
      ICMS2023
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] How the bacterial Flagellar Motor stator works: an insight from molecular dynamics simulation2023

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran、Akio Kitao
    • 学会等名
      CCP2023
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] The Effect of Tricaprylin Surface on The Lid Region Dynamics of Candida antarctica Lipase B2023

    • 著者名/発表者名
      Tegar Nurwahyu Wijaya and Akio Kitao
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Rotational mechanisms of bacterial flagellumand roles of water2023

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      TSRC Workshop [Protein Dynamics]
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] タンパク質で構築された軸と軸受け:ロッドとLPリングが働く仕組み2023

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      山田科学振興財団2023年度研究交歓会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Molecular mechanisms of structure support and smooth rotation in the bushing/rod complex of bacterial flagella2023

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      高速分子動画 国際シンポジウム2023
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] Rotational mechanisms of bacterial flagellumand roles of water2023

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      TSRC Workshop [Protein Dynamics]
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Revealing the complex formation / deformation process of anti-tumor suppressor p53 protein complexes in functioning2023

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      APATCC-10(Asia Pacific Conference of Theoretical and Computational Chemistry
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Conformational Dynamics and Association/Dissociation Processes of Biological Macromolecules Investigated by Advanced Molecular Simulation2023

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      ICMS2023
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Conformational Change and Association/Dissociation of Proteins investigated by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics2023

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Core-to-core international symposium
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Mechanisms of Bacterial flagellar rotation and roles of water as lubricant2023

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      理研研究会「Multi-scale Molecular Dynamics Simulation and Machine Learning of Biomolecular Systems」
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Revealing the complex formation / deformation process of anti-tumor suppressor p53 protein complexes in functioning2023

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      APATCC-10(Asia Pacific Conference of Theoretical and Computational Chemistry
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] タンパク質で構築された軸と軸受け:ロッドとLPリングが働く仕組み2023

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      山田科学振興財団2023年度研究交歓会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Sampling the conformational transition of the monomer of Nsp15 of the SARS-nCoV2 gives a hint to inhibit its hexamer2023

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran and Akio Kitao
    • 学会等名
      NanoBioCoM2023
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Conformational Change and Association/Dissociation of Proteins investigated by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics2023

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Core-to-core international symposium
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Revealing the complex formation / deformation process of anti-tumor suppressor p53 protein complexes in functioning2023

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      APATCC-10(Asia Pacific Conference of Theoretical and Computational Chemistry
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] LPリング中のロッドの回転シミュレーション Simulating the rod rotation in LP-ring2023

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      2022年度べん毛研究交流会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] タンパク質で構築された軸と軸受け:ロッドとLPリングが働く仕組み2023

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      山田科学振興財団2023年度研究交歓会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Conformational Dynamics and Association/Dissociation Processes of Biological Macromolecules Investigated by Advanced Molecular Simulation2023

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      ICMS2023
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Unveiling the dynamics of Adenosine A2a receptor coupling to the G proteins: a molecular dynamics simulation study(アデノシンA2a受容体とGタンパク質との結合のダイナミクスの解明: 分子動力学シミュレーション研究による)2023

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Sari Hagimoto and Akio Kitao
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] The Effect of Tricaprylin Surface on The Lid Region Dynamics of Candida antarctica Lipase B2023

    • 著者名/発表者名
      Tegar Nurwahyu Wijaya and Akio Kitao
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Sampling the conformational transition of the monomer of Nsp15 of the SARS-nCoV2 gives a hint to inhibit its hexamer2023

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran and Akio Kitao
    • 学会等名
      NanoBioCoM2023
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Unveiling the dynamics of Adenosine A2a receptor coupling to the G proteins: a molecular dynamics simulation study(アデノシンA2a受容体とGタンパク質との結合のダイナミクスの解明: 分子動力学シミュレーション研究による)2023

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Sari Hagimoto and Akio Kitao
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Molecular mechanisms of structure support and smooth rotation in the bushing/rod complex of bacterial flagella2023

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      高速分子動画 国際シンポジウム2023
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04058
  • [学会発表] Unveiling the mGLU1 dimer dynamics during partially-active to inactive state transition2023

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran、Kitao Akio
    • 学会等名
      令和5年度 新学術領域研究「高速分子動画」シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K27138
  • [学会発表] 線形応答理論を応用した効率的な分子動 力学シミュレーションに基づく自由エネル ギー解析2022

    • 著者名/発表者名
      生澤真司, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] The relative motion of MotA around MotB in bacterial flagellar stator2022

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] The relative motion of MotA around MotB in bacterial flagellar stator2022

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] 並列カスケード選択分子動力学法を用いた生体分子の解離課程解析2022

    • 著者名/発表者名
      中矢光, チャンフズイ, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第16回分子科学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Molecular Dynamics investigation of binding affinities between amino acid and taste receptor2022

    • 著者名/発表者名
      Thai-Hao Nguyen, Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] How EGCG pertubates the interaction between MDM2 and N-terminal domain of p532022

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      第22回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Protein conformational change, association and dissociation observed using Fugaku and massively parallel molecular dynamics simulations2022

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] The relative motion of MotA around MotB in bacterial flagellar stator2022

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] 高速分子動画を補完する構造変化の自由エネルギー地形と経路・流量の解析2022

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      令和4年度新学術領域研究「高速分子動画」シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Substrate Unbinding Mechanism of Candida rugosa Lipase Explored by Parallel Cascade Selections Molecular Dynamics and Markov State Model2022

    • 著者名/発表者名
      Darin Flamandita, Akio Kitao
    • 学会等名
      第22回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Molecular Dynamics investigation of binding affinities between amino acid and taste receptor2022

    • 著者名/発表者名
      Thai-Hao Nguyen, Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] How different glycopeptide affects the binding of glycoprotein B to paired immunoglobulin-like type 2 receptor2022

    • 著者名/発表者名
      Ting-Yi Chu, Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Substrate Unbinding Mechanism of Candida rugosa Lipase Explored by Parallel Cascade Selections Molecular Dynamics and Markov State Model2022

    • 著者名/発表者名
      Darin Flamandita, Akio Kitao
    • 学会等名
      第22回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Conformational Change and Dissociation/Association of Biological Macromolecules Investigated by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics and Markov State Model2022

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      ABA, APPA&TBS Joint Congress2022
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] The Effect of Tricaprylin-Water Interface on the Conformational Dynamics of Candida antarctica Lipase B2022

    • 著者名/発表者名
      Tegar Wijaya, Akio Kitao
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] How different glycopeptide affects the binding of glycoprotein B to paired immunoglobulin-like type 2 receptor2022

    • 著者名/発表者名
      Ting-Yi Chu, Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] 柔らかな分子の複合体形成と解離2022

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      シンポジウム「柔らかな分子系研究の発展」
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] PaCS-MD/MSM法を用いたキナーゼ複合体の結合速度論解析2022

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第22回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] 分子動力学計算におけるタンパク質の二面角遷移の解析2022

    • 著者名/発表者名
      吉岡美月, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第16回分子科学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] How EGCG pertubates the interaction between MDM2 and N-terminal domain of p532022

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      第22回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] 線形応答理論を応用した効率的な分子動 力学シミュレーションに基づく自由エネル ギー解析2022

    • 著者名/発表者名
      生澤真司, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Conformational Change and Dissociation/Association of Biological Macromolecules Investigated by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics and Markov State Model2022

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      ABA, APPA&TBS Joint Congress2022
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] The Effect of Tricaprylin-Water Interface on the Conformational Dynamics of Candida antarctica Lipase B2022

    • 著者名/発表者名
      Tegar Wijaya, Akio Kitao
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] PaCS-MD/MSM法を用いたキナーゼ複合体の結合速度論解析2022

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第22回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] How EGCG pertubates the interaction between MDM2 and N-terminal domain of p532022

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      第22回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] 線形応答理論を応用した効率的な分子動 力学シミュレーションに基づく自由エネル ギー解析2022

    • 著者名/発表者名
      生澤真司, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] The Effect of Tricaprylin-Water Interface on the Conformational Dynamics of Candida antarctica Lipase B2022

    • 著者名/発表者名
      Tegar Wijaya, Akio Kitao
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Protein conformational change, association and dissociation observed using Fugaku and massively parallel molecular dynamics simulations2022

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] How partial agonist ligands induce the conformational changes of Adenosine A2a receptor2022

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] 高速分子動画を補完する構造変化の自由エネルギー地形と経路・流量の解析2022

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      令和4年度新学術領域研究「高速分子動画」シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] FlhAcの高速原子間力顕微鏡画像の解析2022

    • 著者名/発表者名
      大沢陸輝, 寺原直矢, 古寺哲幸, 今田勝巳, 南野徹, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] How different glycopeptide affects the binding of glycoprotein B to paired immunoglobulin-like type 2 receptor2022

    • 著者名/発表者名
      Ting-Yi Chu, Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] 並列カスケード選択分子動力学法を用いた生体分子の解離課程解析2022

    • 著者名/発表者名
      中矢光, チャンフズイ, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第16回分子科学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] Conformational Change and Dissociation/Association of Biological Macromolecules Investigated by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics and Markov State Model2022

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      ABA, APPA&TBS Joint Congress2022
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] FlhAcの高速原子間力顕微鏡画像の解析2022

    • 著者名/発表者名
      大沢陸輝, 寺原直矢, 古寺哲幸, 今田勝巳, 南野徹, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Analysis of High Speed Atomic Force Microscopy Image of FlhAc(FlhAcの高速原子間力顕微鏡画像の解析)2022

    • 著者名/発表者名
      大沢陸輝, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] 柔らかな分子の複合体形成と解離2022

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      シンポジウム「柔らかな分子系研究の発展」
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] Molecular Dynamics investigation of binding affinities between amino acid and taste receptor2022

    • 著者名/発表者名
      Thai-Hao Nguyen, Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] How partial agonist ligands induce the conformational changes of Adenosine A2a receptor2022

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] Substrate Unbinding Mechanism of Candida rugosa Lipase Explored by Parallel Cascade Selections Molecular Dynamics and Markov State Model2022

    • 著者名/発表者名
      Darin Flamandita, Akio Kitao
    • 学会等名
      第22回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] Analysis of High Speed Atomic Force Microscopy Image of FlhAc(FlhAcの高速原子間力顕微鏡画像の解析)2022

    • 著者名/発表者名
      大沢陸輝, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Binding Kinetics of Kinase Complexes by PaCS-MD/MSM2022

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Binding Kinetics of Kinase Complexes by PaCS-MD/MSM2022

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] 柔らかな分子の複合体形成と解離2022

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      シンポジウム「柔らかな分子系研究の発展」
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Protein conformational change, association and dissociation observed using Fugaku and massively parallel molecular dynamics simulations2022

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] 高速分子動画を補完する構造変化の自由エネルギー地形と経路・流量の解析2022

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      令和4年度新学術領域研究「高速分子動画」シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] PaCS-MD/MSM法を用いたキナーゼ複合体の結合速度論解析2022

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第22回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] Analysis of High Speed Atomic Force Microscopy Image of FlhAc(FlhAcの高速原子間力顕微鏡画像の解析)2022

    • 著者名/発表者名
      大沢陸輝, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] How partial agonist ligands induce the conformational changes of Adenosine A2a receptor2022

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] 並列カスケード選択分子動力学法を用いた生体分子の解離課程解析2022

    • 著者名/発表者名
      中矢光, チャンフズイ, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第16回分子科学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] 分子動力学計算におけるタンパク質の二面角遷移の解析2022

    • 著者名/発表者名
      吉岡美月, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第16回分子科学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] FlhAcの高速原子間力顕微鏡画像の解析2022

    • 著者名/発表者名
      大沢陸輝, 寺原直矢, 古寺哲幸, 今田勝巳, 南野徹, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] 分子動力学計算におけるタンパク質の二面角遷移の解析2022

    • 著者名/発表者名
      吉岡美月, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第16回分子科学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04745
  • [学会発表] Binding Kinetics of Kinase Complexes by PaCS-MD/MSM2022

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] Observing biomolecules through a lens of computer simulation2021

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗, TRAN Phuoc Duy
    • 学会等名
      C2C Program Kick off symposium
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Roles of hydration/dehydration for dissociation, association and stabilization of protein complexes2021

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Pacific Chem 2021
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Unguided Binding MD of Protein-Protein Complexes by PPI-ColDock2021

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Takemura, Akio Kitao
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] Atomic mechanism of the complete association of intrinsically disordered peptide to protein2021

    • 著者名/発表者名
      Duy Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      XXXII IUPAP Conference on Computational Physics(ccp2021)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] Benchmarking the free energy calculation of PaCS-MD/MSM2021

    • 著者名/発表者名
      チャン フ ズイ, 畑 宏明,中矢 光, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Dynamics of Close-Open State of Candida antarctica Lipase B Obtained by Parallel Cascade Molecular Dynamics Simulation and The Markov State Model2021

    • 著者名/発表者名
      Wijaya Tegar Nurwahyu、北尾彰朗
    • 学会等名
      第10回日本生物物理学会関東支部会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Roles of hydration/dehydration for dissociation, association and stabilization of protein complexes2021

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Pacific Chem 2021
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] Simulated dissociation/association dynamics between proteins and other molecules2021

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      TSRC WS「Protein Dynamics」
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Molecular movie of protein association/dissociation dynamics2021

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会シンポジウム(原子レベルの動的構造解析が拓く生体分子機能の理解)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] SARS-CoV-2 エンドリボヌクレアーゼのオリゴマー化阻害2021

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      新学術領域「高速分子動画」Web セミナー「構造生物学・化学・計算科学を融合させたウイルス・パンデミックに対する取り組み」
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] Observing biomolecules through a lens of computer simulation2021

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗, TRAN Phuoc Duy
    • 学会等名
      C2C Program Kick off symposium
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Transport mechanisms of ions, peptides and proteins through the biological membrane2021

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Pacific Chem 2021
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Atomic mechanism of the complete association of intrinsically disordered peptide to protein2021

    • 著者名/発表者名
      Duy Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      XXXII IUPAP Conference on Computational Physics(ccp2021)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Dynamics of Close-Open State of CALB Obtained by Parallel Cascade Molecular Dynamics Simulation and The Markov State Model2021

    • 著者名/発表者名
      Wijaya Tegar N., 北尾彰朗
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Dynamics of Close-Open State of CALB Obtained by Parallel Cascade Molecular Dynamics Simulation and The Markov State Model2021

    • 著者名/発表者名
      Wijaya Tegar N., 北尾彰朗
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] Investigating the dissociation process and kinetic rates of DBD-p53/DNA complex by PaCS-MD and MSM2021

    • 著者名/発表者名
      マルゾーク モハメド, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Benchmarking the free energy calculation of PaCS-MD/MSM2021

    • 著者名/発表者名
      チャン フ ズイ, 畑 宏明,中矢 光, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Simulated dissociation/association dynamics between proteins and other molecules2021

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      TSRC WS「Protein Dynamics」
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] Observing biomolecules through a lens of computer simulation2021

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗, TRAN Phuoc Duy
    • 学会等名
      C2C Program Kick off symposium
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] Application of ColDock to docking of cryptic pockets2021

    • 著者名/発表者名
      Ryunosuke Kiuchi, Kazuhiro Takemura, Akio Kitao
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Roles of hydration/dehydration for dissociation, association and stabilization of protein complexes2021

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Pacific Chem 2021
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Unguided Binding MD of Protein-Protein Complexes by PPI-ColDock2021

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Takemura, Akio Kitao
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Predicting the complex conformations of protein/intrinsically disordered peptide complexes using a method termed a/dPaCS-MD2021

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      The Protein Society-35th Anniversary Symposium
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] Benchmarking the free energy calculation of PaCS-MD/MSM2021

    • 著者名/発表者名
      チャン フ ズイ, 畑 宏明,中矢 光, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] Investigating the dissociation process and kinetic rates of DBD-p53/DNA complex by PaCS-MD and MSM2021

    • 著者名/発表者名
      マルゾーク モハメド, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] DNA bending enhances the dissociation of tetrameric p53’s coredomains2021

    • 著者名/発表者名
      Duy Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Binding free energy calculation with dPaCS-MD/MSM2021

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      C2C Program Kick off symposium
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] Transport mechanisms of ions, peptides and proteins through the biological membrane2021

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Pacific Chem 2021
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] インシリコシミュレーションで探るタンパク質複合体の結合親和性とキネティックス2021

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      日本薬学会構造活性相関部門構造活性フォーラム2021「次期スーパーコンピュータ「富岳」時代の計算創薬」
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] DNA bending enhances the dissociation of tetrameric p53’s coredomains2021

    • 著者名/発表者名
      Duy Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] Unguided Binding MD of Protein-Protein Complexes by PPI-ColDock2021

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Takemura, Akio Kitao
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Simulated dissociation/association dynamics between proteins and other molecules2021

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      TSRC WS「Protein Dynamics」
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Predicting the complex conformations of protein/intrinsically disordered peptide complexes using a method termed a/dPaCS-MD2021

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      The Protein Society-35th Anniversary Symposium
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Transport mechanisms of ions, peptides and proteins through the biological membrane2021

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Pacific Chem 2021
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] インシリコシミュレーションで探るタンパク質複合体の結合親和性とキネティックス2021

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      日本薬学会構造活性相関部門構造活性フォーラム2021「次期スーパーコンピュータ「富岳」時代の計算創薬」
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Molecular movie of protein association/dissociation dynamics2021

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会シンポジウム(原子レベルの動的構造解析が拓く生体分子機能の理解)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Atomic mechanism of the complete association of intrinsically disordered peptide to protein2021

    • 著者名/発表者名
      Duy Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      XXXII IUPAP Conference on Computational Physics(ccp2021)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Unguided Binding MD of Protein-Protein Complexes by PPI-ColDock2021

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Dynamics of Close-Open State of Candida antarctica Lipase B Obtained by Parallel Cascade Molecular Dynamics Simulation and The Markov State Model2021

    • 著者名/発表者名
      Wijaya Tegar Nurwahyu、北尾彰朗
    • 学会等名
      第10回日本生物物理学会関東支部会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Binding free energy calculation with dPaCS-MD/MSM2021

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      C2C Program Kick off symposium
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] 結合速度論解析2021

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      「富岳」2021ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] Molecular movie of protein association/dissociation dynamics2021

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会シンポジウム(原子レベルの動的構造解析が拓く生体分子機能の理解)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] 結合速度論解析2021

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      「富岳」2021ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] 結合速度論解析2021

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      「富岳」2021ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] PaCS-MD/MSM to investigate protein motions and association/dissociation of protein complexes2021

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Symposium on Computer Simulations and Cryo-ET/EM of Complex Biomolecular Systems
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Unguided Binding MD of Protein-Protein Complexes by PPI-ColDock2021

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] インシリコシミュレーションで探るタンパク質複合体の結合親和性とキネティックス2021

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      日本薬学会構造活性相関部門構造活性フォーラム2021「次期スーパーコンピュータ「富岳」時代の計算創薬」
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Dynamics of Close-Open State of CALB Obtained by Parallel Cascade Molecular Dynamics Simulation and The Markov State Model2021

    • 著者名/発表者名
      Wijaya Tegar N., 北尾彰朗
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Predicting the complex conformations of protein/intrinsically disordered peptide complexes using a method termed a/dPaCS-MD2021

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      The Protein Society-35th Anniversary Symposium
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Binding free energy calculation with dPaCS-MD/MSM2021

    • 著者名/発表者名
      Duy Phuoc Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      C2C Program Kick off symposium
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] PaCS-MD/MSM to investigate protein motions and association/dissociation of protein complexes2021

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Symposium on Computer Simulations and Cryo-ET/EM of Complex Biomolecular Systems
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] SARS-CoV-2 エンドリボヌクレアーゼのオリゴマー化阻害2021

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      新学術領域「高速分子動画」Web セミナー「構造生物学・化学・計算科学を融合させたウイルス・パンデミックに対する取り組み」
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Application of ColDock to docking of cryptic pockets2021

    • 著者名/発表者名
      Ryunosuke Kiuchi, Kazuhiro Takemura, Akio Kitao
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] PaCS-MD/MSM to investigate protein motions and association/dissociation of protein complexes2021

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Symposium on Computer Simulations and Cryo-ET/EM of Complex Biomolecular Systems
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] Investigating the dissociation process and kinetic rates of DBD-p53/DNA complex by PaCS-MD and MSM2021

    • 著者名/発表者名
      マルゾーク モハメド, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] DNA bending enhances the dissociation of tetrameric p53’s coredomains2021

    • 著者名/発表者名
      Duy Tran, Akio Kitao
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Unguided Binding MD of Protein-Protein Complexes by PPI-ColDock2021

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05510
  • [学会発表] SARS-CoV-2 エンドリボヌクレアーゼのオリゴマー化阻害2021

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      新学術領域「高速分子動画」Web セミナー「構造生物学・化学・計算科学を融合させたウイルス・パンデミックに対する取り組み」
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Application of ColDock to docking of cryptic pockets2021

    • 著者名/発表者名
      Ryunosuke Kiuchi, Kazuhiro Takemura, Akio Kitao
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Unguided Binding MD of Protein-Protein Complexes by PPI-ColDock2020

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Protein-protein complex dissociation simulated by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics2020

    • 著者名/発表者名
      宮澤佳希、Duy Phuoc Tran、竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第20回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Investigating the dissociation process of DBD-p53/DNA complex by PaCS-MD and MSM2020

    • 著者名/発表者名
      Sobeh Mohamed Marzouk、北尾彰朗
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] 分子動力学計算によるp53-C 末端部位のDNA 結合機構の解明(DNA binding mechanisms of the p53 C-terminal domain elucidated by MD simulation)2020

    • 著者名/発表者名
      平悠太、Duy Tran、北尾彰朗
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] PaCS-MD/MSM を用いたタンパク質-タンパク質複合体の結合親和性評価2020

    • 著者名/発表者名
      宮澤佳希、Tran Phuoc Duy、竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第34回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] PaCS-MD/MSM を用いたタンパク質複合体の速度定数評価(Kinetic rate evaluation for protein complexes by PaCS-MD/MSM)2020

    • 著者名/発表者名
      宮澤佳希、Phuoc Duy Tran、竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Unguided Binding MD of Protein-Protein Complexes by PPI-ColDock2020

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Simulating the association/dissociation process of flexible protein complexes2020

    • 著者名/発表者名
      Tran P. Duy、Akio Kitao
    • 学会等名
      第20回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] PaCS-MDによるアクトミオシンの結合解離予測2020

    • 著者名/発表者名
      尾川拓巳、Tran Phuoc Duy、藤井高志、難波啓一、北尾彰朗
    • 学会等名
      第9回日本生物物理学会関東支部会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Unguided Binding MD of Protein-Protein Complexes by PPI-ColDock2020

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第20回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Simulating the association/dissociation process of flexible protein complexes2020

    • 著者名/発表者名
      Tran P. Duy、Akio Kitao
    • 学会等名
      第20回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] PaCS-MDによるアクトミオシンの結合解離予測2020

    • 著者名/発表者名
      尾川拓巳、Tran Duy、藤井高志、難波啓一、北尾彰朗
    • 学会等名
      第34回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Protein-protein complex dissociation simulated by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics2020

    • 著者名/発表者名
      宮澤佳希、Duy Phuoc Tran、竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第20回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] Investigating the dissociation process of DBD-p53/DNA complex by PaCS-MD and MSM2020

    • 著者名/発表者名
      Sobeh Mohamed Marzouk、北尾彰朗
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] PaCS-MD/MSM を用いたタンパク質-タンパク質複合体の結合親和性評価2020

    • 著者名/発表者名
      宮澤佳希、Tran Phuoc Duy、竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第34回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Unguided Binding MD of Protein-Protein Complexes by PPI-ColDock2020

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第20回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] PaCS-MD/MSM を用いたタンパク質複合体の速度定数評価(Kinetic rate evaluation for protein complexes by PaCS-MD/MSM)2020

    • 著者名/発表者名
      宮澤佳希、Phuoc Duy Tran、竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] 分子動力学計算によるp53-C 末端部位のDNA 結合機構の解明2020

    • 著者名/発表者名
      平悠太、Tran Duy、北尾彰朗
    • 学会等名
      第34回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05439
  • [学会発表] PaCS-MDによるアクトミオシンの結合解離予測2020

    • 著者名/発表者名
      尾川拓巳、Tran Duy、藤井高志、難波啓一、北尾彰朗
    • 学会等名
      第34回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] PaCS-MDによるタンパク質-タンパク質複合体の解離シミュレーション2020

    • 著者名/発表者名
      宮澤佳希、Tran Phuoc Duy、竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第9回日本生物物理学会関東支部会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] 分子動力学計算によるp53-C 末端部位のDNA 結合機構の解明(DNA binding mechanisms of the p53 C-terminal domain elucidated by MD simulation)2020

    • 著者名/発表者名
      平悠太、Duy Tran、北尾彰朗
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] 分子動力学計算によるp53-C 末端部位のDNA 結合機構の解明2020

    • 著者名/発表者名
      平悠太、Tran Duy、北尾彰朗
    • 学会等名
      第34回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] 高圧力下でのバクテリア運動観察2019

    • 著者名/発表者名
      畑宏明,西原泰孝,西山雅祥,曽和義幸,川岸郁朗,北尾彰朗
    • 学会等名
      2018年度べん毛研究交流会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17KT0026
  • [学会発表] 深層学習を用いたタンパク質の天然変性領域の予測2019

    • 著者名/発表者名
      三栖涼雅、北尾彰朗、Tran Duy
    • 学会等名
      4.  三栖涼雅、北尾彰朗、Tran Duy、“深層学習を用いたタンパク質の天然変性領域の予測”, 日本バイオインフォマティクス学会2019年年会・第8回生命医薬情報学連合大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Simulating Protein Complex Formation and Dissociation2019

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第10回豊田理研国際WS「Science of Life Phenomena Woven by Water and Biomolecules」
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Calculation of binding free energy and kinetic rates with flexible protein docking(フレキシブルドッキングによる結合自由エネルギーと速度定数計算)2019

    • 著者名/発表者名
      Tran Duy、北尾彰朗
    • 学会等名
      第57日本生物物理学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] An efficient screening, an accurate evaluation, and a simple prediction of protein complex structures2019

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第57日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] 計算で予測するタンパク質複合体立体構造と結合親和性2019

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第7回 生命理工オープンイノベーションハブ(LiHub)フォーラム ―メゾスケール分子と創薬―
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Structural basis of pressure response of a pressure sensitive YFP variant protein(圧力感受性変異YFPの圧力応答の構造基盤)2019

    • 著者名/発表者名
      今田勝巳、辻井美香、永江峰幸、畑 宏明、渡邉朋信、西山雅祥、北尾彰朗、渡邉信久
    • 学会等名
      第57日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] クラスタリングを用いた蛋白質―蛋白質ドッキング複合体候補構造の効率的絞り込み(A clustering approach to reduce the number of protein-protein docking model candidates2019

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第59回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] 圧力による蛋白質の水和を利用した細胞機能の制御(Control of cellular functions through pressure-induced hydration of proteins)2019

    • 著者名/発表者名
      畑 宏明、西原泰孝、西山雅祥、川岸郁朗、北尾彰朗
    • 学会等名
      第59回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] 計算から予測するタンパク質複合体2019

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      2019年度日本生化学会関東支部例会内シンポジウム「生化学と先端技術」
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Simulating dissociation and association processes of protein complexes2019

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      TSRC workshop on ‘The Role of Fluctuations and Dynamics in Biomolecular Function’
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Association and dissociation mechanisms of proteins and peptides2019

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      WRHI国際ワークショップ
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] タンパク質複合体の構造予測と結合・解離過程の解明2019

    • 著者名/発表者名
      畑 宏明、北尾彰朗
    • 学会等名
      ポスト「京」重点課題1×重点課題2連携シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] PaCS-MDによるタンパク質-タンパク質複合体の解離シミュレーション2019

    • 著者名/発表者名
      宮澤佳希、Tran Phuoc Duy、竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      スーパーコンピュータワークショップ
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Simulating protein complex formation and dissociation2019

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      TSRC workshop on ‘Protein Dynamics’
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Structural basis of pressure response of a pressure sensitive YFP variant protein2019

    • 著者名/発表者名
      今田勝巳, 辻井美香, 永江峰幸, 畑宏明, 渡邉朋信, 西山雅祥, 北尾彰朗, 渡邉信久
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会 シンポジウム1SHA 「静水圧刺激により生命機能を操作する」
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17KT0026
  • [学会発表] DNA recognition mechanisms of the p53 C-terminal domain Investigated by MD simulation(分子動力学計算で探るp53のC末端部位のDNA結合機構)2019

    • 著者名/発表者名
      平 悠太、Tran Phuoc Duy、Swadling Jacob、北尾彰朗
    • 学会等名
      第57日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Pressure effects on protein-protein interactions studied by molecular dynamics simulations2019

    • 著者名/発表者名
      畑 宏明、西原泰孝、西山雅祥、川岸郁朗、北尾彰朗
    • 学会等名
      第57日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Protein-protein complexes dissociation simulated by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics(PaCS-MDによるタンパク質-タンパク質複合体の解離シミュレーション2019

    • 著者名/発表者名
      宮澤佳希、Tran Phuoc Duy、竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第57日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] Binding Energy Calculation of Protein-Peptide Complex Using Unbiased MD Simulations and MSM Analysis2019

    • 著者名/発表者名
      Hiroaki Hata, Yasutaka Nishihara, Masayoshi Nishiyama, Ikuro Kawagishi, Akio Kitao
    • 学会等名
      CBI学会2019年大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H03191
  • [学会発表] PaCS-MDによるタンパク質のダイナミクスと離合集散2018

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      物性研究所スパコン共同利用・CCMS合同研究会「計算物質科学の今と未来」
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] PaCS-MDによるタンパク質のダイナミクスと離合集散2018

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      物性研究所スパコン共同利用・CCMS合同研究会「計算物質科学の今と未来」
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Na+駆動型べん毛モーターPomA/PomBのThr残基のイオン透過における役割:MDシミュレーション結果2018

    • 著者名/発表者名
      尾上靖宏、岩城雅代、信夫愛、西原泰孝、岩月哲人、寺島浩行、北尾彰朗、神取秀樹、本間道夫
    • 学会等名
      第56回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] カスケード型超並列シミュレーションで見るタンパク質間結合の圧力依存性2018

    • 著者名/発表者名
      畑宏明,西原泰孝,西山雅祥,川岸郁朗,北尾彰朗
    • 学会等名
      第18回蛋白質科学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17KT0026
  • [学会発表] Na+駆動型べん毛モーターPomA/PomBのThr残基のイオン透過における役割MDシミュレーション結果2018

    • 著者名/発表者名
      尾上靖宏, 岩城雅代,信夫愛、西原泰孝、岩月哲人、寺島浩行、北尾 彰朗、神取秀樹、本間道夫
    • 学会等名
      2017年度べん毛研究交流会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] カスケード型超並列シミュレーションでみるCheY-FliM複合体解離に対する圧力の影響2018

    • 著者名/発表者名
      畑宏明, 西原泰孝, 西山雅祥, 川岸郁朗, 北尾彰朗
    • 学会等名
      2017年度べん毛研究交流会(第23回)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17KT0026
  • [学会発表] Refining binding free energies of docked protein-protein complexes by sampling conformations during molecular dynamics simulations2018

    • 著者名/発表者名
      信夫愛、竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第18回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] カスケード型超並列シミュレーションでみるCheY-FliM複合体解離に対する圧力の影響2018

    • 著者名/発表者名
      畑宏明、北尾彰朗
    • 学会等名
      2017年度べん毛研究交流会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] ColDock : 高濃度リガンド条件での全原子 MD シミュレーョンを用いた蛋白質-リガンド複合体構造の効率的な探索手法2018

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第18回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Investigate protein complex formation and dissociation in silico2018

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      WRHI International Workshop on Advanced Laser Spectroscopy for Soft Molecular Systems
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] ColDock: Concentrated ligand Docking method for an efficient protein-ligand complex structure prediction using all-atom MD2018

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第56回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] カスケード型超並列シミュレーションで見るタンパク質間結合の圧力依存性2018

    • 著者名/発表者名
      畑宏明、西原泰孝、西山雅祥、川岸郁朗、北尾彰朗
    • 学会等名
      第18回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Differences and similarities in (6-4) Photolyase DNA repair pathways2018

    • 著者名/発表者名
      Dokainish Hisham, Yamada Daichi, Kandori Hideki, Kitao Akio
    • 学会等名
      第56回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Computational approach to investigate protein complex formation and dissociation2018

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      14th Rencontres du Vietnam Computational Biophysics at the Molecular and Mesoscales
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Investigating dissociation and association mechanisms of protein complexes2018

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      The 2nd workshop on ‘Advances in Theory and Computation of Complex Systems --- Biological Systems
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] MD シミュレーションを用いた構造サンプリングによるドッキングタンパク質ータンパク質複合体結合自由エネルギー評価の精密化2017

    • 著者名/発表者名
      信夫愛, 竹村和浩, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Protein-peptide dissociation at high pressure studied by parallel cascade selection molecular dynamics simulations2017

    • 著者名/発表者名
      畑宏明, 西原泰孝, 西山雅祥, 川 郁朗, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Refining binding free energies of docked protein-protein complexes by sampling conformations during molecular dynamics simulations2017

    • 著者名/発表者名
      Ai Shinobu Kazuhiro Takemura Akio Kitao
    • 学会等名
      第56回日本生物物理学会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Refining binding free energies of docked complexes by sampling configurations during molecular dynamics simulations2017

    • 著者名/発表者名
      Ai Shinobu Kazuhiro Takemura Akio Kitao
    • 学会等名
      Conformational Ensembles from Experimental Data and Computer Simulations
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] 分子シミュレーションによる細菌べん毛モーターの分子機構2017

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      日本物理学会第72回年次大会
    • 発表場所
      大阪大学豊中キャンパス(大阪市豊中市)
    • 年月日
      2017-03-17
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] MD シミュレーションを用いた構造サンプリングによるドッキングタンパク質ータンパク質複合体結合自由エネルギー評価の精密化2017

    • 著者名/発表者名
      信夫愛, 竹村和浩, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Protein-protein complex structure prediction using the solution theory in the energy representation2017

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩, 松林伸幸, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Protein-protein complex structure prediction using the solution theory in the energy representation2017

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩, 松林伸幸, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Dynamic structure of bacterial flagellar proteins observed in silico2017

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Bacterial Flagella, Injectisome and Type III Secretion Systems
    • 発表場所
      沖縄科学技術大学院大学(沖縄県恩納村)
    • 年月日
      2017-03-01
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Improvement of PaCS-MD based Flexible Docking Methods2017

    • 著者名/発表者名
      Phuoc Duy Tran and Akio Kitao
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Dynamic structure of bacterial flagellar proteins observed in silico2017

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Bacterial Flagella, Injectisome and Type III Secretion Systems
    • 発表場所
      沖縄科学技術大学院大学(沖縄県恩納村)
    • 年月日
      2017-03-01
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Dissociation and Association Dynamics of Proteins2017

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      TSCR Workshop on Protein Dynamics
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] 分子シミュレーションによる細菌べん毛モーターの分子機構2017

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      日本物理学会第72回年次大会
    • 発表場所
      大阪大学豊中キャンパス(大阪市豊中市)
    • 年月日
      2017-03-17
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Electron fate and mutational robustness in the mechanism of (6-4) photolyase-mediated DNA repair2017

    • 著者名/発表者名
      Hisham M. Dokainish, Daichi Yamada, Tatsuya Iwata, Hideki Kandori and Akio Kitao
    • 学会等名
      5th AWEST 2017 the 5th Awaji International Workshop on “Electron Spin Science & Technology: Biological and Materials Science Oriented Applications”
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] 実験と計算によるp53 の標的DNA 配列探索機能(1)2017

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      日本化学会第97春季年会
    • 発表場所
      慶應義塾大学日吉キャンパス(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2017-03-16
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Improvement of PaCS-MD based Flexible Docking Methods2017

    • 著者名/発表者名
      Phuoc Duy Tran and Akio Kitao
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] 生体高分子の離合集散ダイナミクス2017

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第66回高分子討論会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Protein-peptide dissociation at high pressure studied by parallel cascade selection molecular dynamics simulations2017

    • 著者名/発表者名
      H. Hata, Y. Nishihara, M. Nishiyama, I. Kawagishi, A. Kitao
    • 学会等名
      日本生物物理学会第55回年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17KT0026
  • [学会発表] PaCS-MDでみる蛋白質の柔らかさ・離合集散と機能2017

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第17回日本蛋白質科学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Electron fate and mutational robustness in the mechanism of (6-4) photolyase-mediated DNA repair2017

    • 著者名/発表者名
      Hisham M. Dokainish, Daichi Yamada, Tatsuya Iwata, Hideki Kandori and Akio Kitao
    • 学会等名
      5th AWEST 2017 the 5th Awaji International Workshop on “Electron Spin Science & Technology: Biological and Materials Science Oriented Applications”
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] PaCS-MDでみる蛋白質の柔らかさ・離合集散と機能2017

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第17回日本蛋白質科学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] 生体高分子の離合集散ダイナミクス2017

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第66回高分子討論会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] 実験と計算によるp53 の標的DNA 配列探索機能(1)2017

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      日本化学会第97春季年会
    • 発表場所
      慶應義塾大学日吉キャンパス(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2017-03-16
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Electron fate and mutational robustness in the mechanism of (6-4) photolyase-mediated DNA repair2017

    • 著者名/発表者名
      Dokainish Hisham M.、Yamada Daichi、Iwata Tatsuya、Kandori Hideki、Kitao Akio
    • 学会等名
      WATOC2017-World Association of Theoretical and Computational Chemists
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Protein-peptide dissociation at high pressure studied by parallel cascade selection molecular dynamics simulations2017

    • 著者名/発表者名
      畑宏明, 西原泰孝, 西山雅祥, 川岸 郁朗, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Dissociation and Association Dynamics of Proteins2017

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      TSRC Workshop on Protein Dynamics
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Simulating biomolecular interactions and functions2016

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      1st International Symposium on Research and Education of Computational Science (RECS)
    • 発表場所
      東京大学小柴ホール(東京都文京区)
    • 年月日
      2016-11-29
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Parallel cascade selection molecular dynamics for efficient conformational sampling of biomolecular systems2016

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      International Conference on Molecular Simulation 2016
    • 発表場所
      上海交通大学(中国上海市)
    • 年月日
      2016-10-23
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] DNA光回復酵素の機能発現メカニズム2016

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗、神取秀樹
    • 学会等名
      「柔らかな分子系」第4回公開シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋工業大学(愛知県名古屋市)
    • 年月日
      2016-10-27
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Simulating biomolecular interactions and functions2016

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      1st International Symposium on Research and Education of Computational Science (RECS)
    • 発表場所
      東京大学小柴ホール(東京都文京区)
    • 年月日
      2016-11-29
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] タンパク質との相互作用による脂質膜の構造変化ダイナミクス2016

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第89回日本生化学会大会
    • 発表場所
      仙台国際センター(宮城県仙台市)
    • 年月日
      2016-09-25
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] タンパク質との相互作用による脂質膜の構造変化ダイナミクス2016

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第89回日本生化学会大会
    • 発表場所
      仙台国際センター(宮城県仙台市)
    • 年月日
      2016-09-25
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] DNA光回復酵素の機能発現メカニズム2016

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗、神取秀樹
    • 学会等名
      「柔らかな分子系」第4回公開シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋工業大学(愛知県名古屋市)
    • 年月日
      2016-10-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Parallel cascade selection molecular dynamics for efficient conformational sampling of biomolecular systems2016

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      International Conference on Molecular Simulation 2016
    • 発表場所
      上海交通大学(中国上海市)
    • 年月日
      2016-10-23
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Structure, dynamics, and function of bacterial flagella investigated by molecular dynamics simulation2015

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2015
    • 発表場所
      Honolulu, HI, USA
    • 年月日
      2015-12-15
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Dynamics and Function of Bacterial Flagella Investigated by Molecular Simulation2015

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      The 20th Biophysics Conference
    • 発表場所
      Academia Sinica, 台北、台湾
    • 年月日
      2015-05-12
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Structure, dynamics, and function of bacterial flagella investigated by molecular dynamics simulation2015

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies 2015
    • 発表場所
      Honolulu, HI, USA
    • 年月日
      2015-12-15
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Solvation effects on protein interaction with other molecules2015

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Symposium of 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(石川県・金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Dynamics and Function of Bacterial Flagella Investigated by Molecular Simulation2015

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      The 20th Biophysics Conference
    • 発表場所
      Academia Sinica, 台北、台湾
    • 年月日
      2015-05-12
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics (PaCS-MD) to explore conformational spaces of proteins efficiently2015

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Workshop on Kinetics of Enzymes and Molecular Machines
    • 発表場所
      Beijing, China
    • 年月日
      2015-08-18
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Proton permeation mechanisms in the stator of bacterial flagellar motor2015

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Telluride Research Center Workshop on Protein Dynamics
    • 発表場所
      Telluride, CO, USA
    • 年月日
      2015-08-03
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Solvation effects on protein interaction with other molecules2015

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Symposium of 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      金沢大学角間キャンパス(石川県・金沢市)
    • 年月日
      2015-09-13
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics (PaCS-MD) to explore conformational spaces of proteins efficiently2015

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Workshop on Kinetics of Enzymes and Molecular Machines
    • 発表場所
      Beijing, China
    • 年月日
      2015-08-18
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Proton permeation mechanisms in the stator of bacterial flagellar motor2015

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Telluride Research Center Workshop on Protein Dynamics
    • 発表場所
      Telluride, CO, USA
    • 年月日
      2015-08-03
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04357
  • [学会発表] 柔らかさを利用したタンパク質とその集合体の機能制御2014

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      日本化学会 第94春季年会 シンポジウム
    • 発表場所
      愛知県名古屋市/名古屋大学東山キャンパス
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Molecular simulation of proteins: Pressure tolerance of deep-sea fish actin and membrane deformation induced by I-BAR domain2014

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      1st SPIRITS Workshop“Manipulation of Integrated Molecular Reaction Processes in living cell
    • 発表場所
      Kyoto/Campus Plaza Kyoto
    • 年月日
      2014-09-02
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Molecular simulation of proteins: Pressure tolerance of deep-sea fish actin and membrane deformation induced by I-BAR domain2014

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      1st SPIRITS Workshop“Manipulation of Integrated Molecular Reaction Processes in living cell
    • 発表場所
      Kyoto/Campus Plaza Kyoto
    • 年月日
      2014-09-02
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] バイオ分子が働く様子をコンピュータでみてみよう2014

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      化学への招待-講演会;コンピュータ化学で物質の振舞いや生命現象を「見る」
    • 発表場所
      東京都目黒区/東大生産技術研究所コンベンションホール
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] 柔らかさを利用したタンパク質とその集合体の機能制御2014

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      日本化学会 第94春季年会 シンポジウム
    • 発表場所
      愛知県名古屋市/名古屋大学東山キャンパス
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] バイオ分子が働く様子をコンピュータでみてみよう2014

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      化学への招待-講演会;コンピュータ化学で物質の振舞いや生命現象を「見る」
    • 発表場所
      東京都目黒区/東大生産技術研究所コンベンションホール
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] How Can Soft Molecular Machinery Be Well-Regulated? Structure and Function of Bacterial Flagella2013

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      第15回日韓分子科学シンポジウム
    • 発表場所
      兵庫県神戸市/ホテル北野プラザ六甲荘
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] Structure modeling of the stator in bacterial flagellar motor and implication for selective permeation mechanism of proton2013

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      JSPS二国間交流事業 第4回日仏セミナー『細胞内の時間・空間階層構造のイメージング-分子から細胞に至るダイナミクス俯瞰-』
    • 発表場所
      Spring8 及びSACLA (兵庫県)
    • 年月日
      2013-01-07
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] 細菌べん毛モーター固定子複合体MotA/Bへのイオン透過機構2013

    • 著者名/発表者名
      西原泰孝,北尾彰朗
    • 学会等名
      2012年度べん毛交流会
    • 発表場所
      喜びの宿しん喜 (群馬県)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] 蛋白質構造ダイナミクスと機能の関係を探るより効率的な分子シミュレーション2013

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第13回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      鳥取県鳥取市/とりぎん文化会館
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] 分子シミュレーションによる大腸菌べん毛モーター固定子MotA/Bの立体構造モデリングとプロトン透過メカニズム2013

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第3回分子モーター討論会
    • 発表場所
      東京都文京区/東京大学フードサイエンス棟中島董一郎記念ホール
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Structure modeling of the stator in bacterial flagellar motor and implication for selective permeation mechanism of proton2013

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      JSPS二国間交流事業 第4回日仏セミナー『細胞内の時間・空間階層構造のイメージング-分子から細胞に至るダイナミクス俯瞰-』
    • 発表場所
      Spring8 及びSACLA (兵庫県)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] Exploring protein conformational transition pathways with efficient molecular simulation method2013

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Telluride Science Research Center Protein Dynamics Workshop on Protein Dynamics
    • 発表場所
      Telluride, CO, USA
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] 集団座標による分子シミュレーションの解析2013

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第7回分子シミュレーションスクール」「TCCIウィンターカレッジ」
    • 発表場所
      愛知県岡崎市/岡崎コンファレンスセンター
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] 分子シミュレーションによる大腸菌べん毛モーター固定子MotA/Bの立体構造モデリングとプロトン透過メカニズム2013

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第3回分子モーター討論会
    • 発表場所
      東京都文京区/東京大学フードサイエンス棟中島董一郎記念ホール
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] 巨大生体超分子の構造転移制御メカニズム2013

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      HPCI戦略プログラム 分野1×分野2 シンポジウムin 名大「生体分子複合システムを計算する-相互作用は何をもたらすのか-」
    • 発表場所
      愛知県名古屋市/名古屋大学IB電子情報館
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] 集団座標による分子シミュレーションの解析2013

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第7回分子シミュレーションスクール」「TCCIウィンターカレッジ」
    • 発表場所
      愛知県岡崎市/岡崎コンファレンスセンター
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] Exploring protein conformational transition pathways with efficient molecular simulation method2013

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Telluride Science Research Center Protein Dynamics Workshop on Protein Dynamics
    • 発表場所
      Telluride, CO, USA
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] How Can Soft Molecular Machinery Be Well-Regulated? Structure and Function of Bacterial Flagella2013

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      第15回日韓分子科学シンポジウム
    • 発表場所
      兵庫県神戸市/ホテル北野プラザ六甲荘
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] 巨大生体超分子の構造転移制御メカニズム2013

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      HPCI戦略プログラム 分野1×分野2 シンポジウムin 名大「生体分子複合システムを計算する-相互作用は何をもたらすのか-」
    • 発表場所
      愛知県名古屋市/名古屋大学IB電子情報館
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] 水とタンパク質の構造揺らぎの理論解析2012

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      新学術合同交際シンポジウム「ゆらぎと水―生命のエネルギーと機能の分子機構を探る
    • 発表場所
      大阪ガーデンパレス (大阪府)
    • 年月日
      2012-09-14
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] タンパク質ソフトモードのサンプリングと相関解析2012

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      研究会「高次元のサンプリングとデータ解析からみたシミュレーション科学」
    • 発表場所
      東京都立川市/統計数理研究所(招待講演)
    • 年月日
      2012-03-07
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] タンパク質ソフトモードのサンプリングと相関解析2012

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      研究会「高次元のサンプリングとデータ解析からみたシミュレーション科学」
    • 発表場所
      統計数理研究所 (東京都)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] Finding Function-relevant Dynamics in Proteins2012

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      揺らぎと生体機能・第5回公開シンポジウム
    • 発表場所
      奈良県奈良市/東大寺総合文化センター(招待講演)(at1/8)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] Water Model Tuning toward Better Reproduction of Rotational Diffusion and NMR Spectral Density2012

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩, 北尾彰朗
    • 学会等名
      揺らぎと生体機能・第5回公開シンポジウム
    • 発表場所
      奈良県奈良市/東大寺総合文化センター(at1/8)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] Molecular Dynamics Simulation of Protein Using Robot Dynamics Algorithm2012

    • 著者名/発表者名
      山守優,竹村和浩,北尾彰朗
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学東山キャンパス (愛知県)
    • 年月日
      2012-09-22
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] Multi-scale modeling of protein complex structures2012

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Mini-Symposium on Modeling, Simulation and Function of Biomolecular Assemblies
    • 発表場所
      東京大学伊藤国際学術センター (東京都)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] ウィルスT4ゲノムパッケージングモーターの分子ダイナミクス2012

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第2回計算物質科学イニシアティブ(CMSI)研究会
    • 発表場所
      宮城県仙台市/東北大学・金属材料研究所・講堂(at1/30)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] 細菌べん毛モーター固定子MotA/MotBの構造モデリング2012

    • 著者名/発表者名
      西原泰孝, 北尾彰朗
    • 学会等名
      2011年度べん毛研究交流会
    • 発表場所
      静岡県伊豆市/ラフォーレ修善寺(at3/10)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] 細菌べん毛モーター固定子複合体MotA/Bチャネルの選択的透過メカニズム2012

    • 著者名/発表者名
      西原泰孝,北尾彰朗
    • 学会等名
      第12回東京大学生命科学シンポジウム
    • 発表場所
      東京大学山上会館 (東京都)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] 大規模分子動力学によるウィルス感染初期過程シミュレーション2012

    • 著者名/発表者名
      二島渉, 金丸周司, 有坂文雄, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第5回次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発(ナノ統合)
    • 発表場所
      兵庫県神戸市/ニチイ学館神戸ポートアイランドセンター(at3/5)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] 細菌べん毛モーター固定子複合体MotA/B チャネルの選択的透過メカニズム2012

    • 著者名/発表者名
      西原泰孝,北尾彰朗
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学東山キャンパス (愛知県)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] ウィルスT4ゲノムパッケージングモーターの分子ダイナミクス2012

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第5回次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発(ナノ統合)
    • 発表場所
      兵庫県神戸市/ニチイ学館神戸ポートアイランドセンター(at3/5)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] 水とタンパク質の構造揺らぎの理論解析2012

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      新学術合同交際シンポジウム「ゆらぎと水―生命のエネルギーと機能の分子機構を探る」
    • 発表場所
      大阪ガーデンパレス (大阪府)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] 高圧下におけるαアクチン構造安定性の理論的解析(Theoretical Analysis of alpha-Actin Stability at High Pressure)2012

    • 著者名/発表者名
      若井信彦,竹村和浩,森田貴己,北尾彰朗
    • 学会等名
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場 (愛知県)
    • 年月日
      2012-06-20
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] Multi-scale modeling of protein complex structures2012

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Mini-Symposium on Modeling, Simulation and Function of Biomolecular Assemblies
    • 発表場所
      東京大学伊藤国際学術センター (東京都)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] Finding Function-relevant Dynamics in Proteins2012

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      揺らぎと生体機能・第5回公開シンポジウム
    • 発表場所
      東大寺総合文化センター (奈良県)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] Docking study to investigate the interaction of p53 domains with Mdm2 and Azurin2011

    • 著者名/発表者名
      Raghunadha Reddy Burri, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会
    • 発表場所
      兵庫県姫路市/兵庫県立大学姫路書写キャンパス(at9/18)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] T4ファージタンパク質gp5の脂質2重膜貫通シミューレーション2011

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第3回バイオスーパーコンピューティングシンポジウム
    • 発表場所
      兵庫県神戸市/甲南大学ポートアイランドキャンパス
    • 年月日
      2011-02-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] Expectation to detect correlated dynamics in protein2011

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      nDDB Workshop Grenoble
    • 発表場所
      Grenobel/France
    • 年月日
      2011-01-11
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 高圧下におけるαアクチン構造安定性の理論的解析2011

    • 著者名/発表者名
      若井信彦, 竹村和浩, 森田貴己, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      大阪府吹田市/ホテル阪急エキスポパーク(at6/7)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] 生体超分子の構造変化を制御する分子メカニズム2011

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      分子研研究会「実験と理論による高次分子システムの機能発現の分子論的理解」
    • 発表場所
      愛知県岡崎市/岡崎コンファレンスセンター(招待講演)(at11/2)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] 構造変化が生みだすタンパク質機能:理論からのアプローチ2011

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      日本化学会第9春季年会(2011年)
    • 発表場所
      神奈川県横浜市/神奈川大学横浜キャンパス
    • 年月日
      2011-03-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] Solvation Free Energy of Complex : a potential tool for improving scoring function in protein-protein docking2011

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩, 郭皓, 桜庭俊, 松林伸幸, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会
    • 発表場所
      兵庫県姫路市/兵庫県立大学姫路書写キャンパス(at9/18)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] Clustering method for rigid-body docking prediction based on complex decoy interface2011

    • 著者名/発表者名
      大森聡, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会
    • 発表場所
      兵庫県姫路市/兵庫県立大学姫路書写キャンパス(招待講演)(at9/16)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] Structural modeling of the stator complex MotA/MotB in bacterial flagellar motor2011

    • 著者名/発表者名
      西原泰孝, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会
    • 発表場所
      兵庫県姫路市/兵庫県立大学姫路書写キャンパス(at9/18)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] Transform and relax sampling to enhance slow protein dynamics2011

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会
    • 発表場所
      兵庫県姫路市/兵庫県立大学姫路書写キャンパス(at9/18)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] 異方性の高いシステムのためのTransforn and Relax Sampling2011

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第66回日本物理学会年次大会(2011年)
    • 発表場所
      新潟県新潟市/新潟大学五十嵐北キャンパス
    • 年月日
      2011-03-28
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 分子シミュレーションによるタンパク質ダイナミクスとテラヘルツ分光2011

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      日本分光学会テラヘルツ分光部会シンポジウムテラヘルツ分光法の最先端V~バイオテラヘルツ分光~
    • 発表場所
      神奈川県横浜市/パシフィコ横浜(招待講演)(at9/28)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] Theoretical Analysis of α-Actin Stability at High Pressure2011

    • 著者名/発表者名
      若井信彦, 竹村和浩, 森田貴己, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会
    • 発表場所
      兵庫県姫路市/兵庫県立大学姫路書写キャンパス(at9/18)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] Enhancement of soft protein dynamics and efficient free energy calculation by molecular dynamics simulation2011

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Telluride Science Research Center Workshop on Protein Dynamics
    • 発表場所
      USA/CO/Telluride(招待講演)(at8/1)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] 細菌べん毛モーター固定子MotA/MotB複合体の分子モデリング2011

    • 著者名/発表者名
      西原泰孝, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      大阪府吹田市/ホテル阪急エキスポパーク(at6/8)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] 超並列マルチスケールシミュレーションMSFELで探る生体分子の自由エネルギー地形2011

    • 著者名/発表者名
      原田隆平, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      大阪府吹田市/ホテル阪急エキスポパーク(at6/8)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] 生体超分子の構造変化を制御する分子メカニズム2011

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      分子研研究会「実験と理論による高次分子システムの機能発現の分子論的理解」
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター (愛知県)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] 機能を生み出すタンパク質の異方的ダイナミクス2011

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      日本物理学会2011年秋季大会
    • 発表場所
      富山県富山市/富山大学五福キャンパス(招待講演)(at9/23)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] Transform and Relax Samplingによるタンパク質の構造変化解析2011

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      日本物理学会2011年秋季大会
    • 発表場所
      富山県富山市/富山大学五福キャンパス(at9/23)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] 分子シミュレーションによるタンパク質ダイナミクスとテラヘルツ分光2011

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      日本分光学会 テラヘルツ分光部会 シンポジウム テラヘルツ分光法の最先端V ~バイオテラヘルツ分光~
    • 発表場所
      パシフィコ横浜 (神奈川県)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] 機能を生み出すタンパク質の異方的ダイナミクス2011

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      日本物理学会2011年秋季大会
    • 発表場所
      富山大学五福キャンパス (富山県)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] 独立部分空間分析を用いたタンパク質運動の解析2011

    • 著者名/発表者名
      桜庭俊・松林伸幸・城地保昌, 北尾彰朗
    • 学会等名
      次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発 第5回公開シンポジウム
    • 発表場所
      甲南大学、神戸市
    • 年月日
      2011-02-23
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21023006
  • [学会発表] ウイルスT4ファージの膜貫通メカニズム2011

    • 著者名/発表者名
      二島渉, 金丸周司, 有坂文雄, 北尾彰朗
    • 学会等名
      計算分子科学研究拠点第2回研究会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市/理化学研究所計算科学研究機構(at8/12)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] Enhancement of soft protein dynamics and efficient2011

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Telluride Science Research Center Workshop
    • 発表場所
      Telluride (USA)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] 溶媒和自由エネルギーを用いた蛋白質-蛋白質ドッキング複合体の評価2011

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩, Hao Guo, 桜庭俊, 松林伸幸, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      大阪府吹田市/ホテル阪急エキスポパーク(at6/8)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] Molecular Dynamics Simulation of Protein Using Robot Dynamics Algorithm2011

    • 著者名/発表者名
      山守優, 竹村和浩, 北尾彰朗
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会
    • 発表場所
      兵庫県姫路市/兵庫県立大学姫路書写キャンパス(at9/18)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23107705
  • [学会発表] Detecting coupled motions in protein with Molecular dynamics simulation2010

    • 著者名/発表者名
      S.Sakuraba, Y.Joti, A.Kitao
    • 学会等名
      新学術領域研究「揺らぎと生体機能」第4回公開シンポジウム
    • 発表場所
      ピアザ淡海、大津市
    • 年月日
      2010-12-01
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21023006
  • [学会発表] いくつかの蛋白質でのリガンド結合に伴う構造変化の詳細メカニズム2010

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      量子生命フロンティア研究特定ユニット第8回勉強会
    • 発表場所
      日本原子力研究機構システム計算科学センター(東京都)
    • 年月日
      2010-03-17
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [学会発表] タンパク質が引き起こす生体膜変形のダイナミクス(注:シンポジウムの概略説明含む)2010

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      日本物理学会第65回年次大会
    • 発表場所
      岡山大学 津島キャンパス(岡山県)
    • 年月日
      2010-03-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 大規模分子動力学によるバイオナノマシンの機能シミュレーション2010

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      スーパーコンピューターワークショップ2010「大規模並列分子シミュレーションの最前線」
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
    • 年月日
      2010-01-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 分子シミュレーションによるテラヘルツ領域での蛋白質ダイナミクス-計算による中性子散乱・テラヘルツ分光スペクトル-2010

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第1回テラヘルツーバイオ研究会
    • 発表場所
      情報通信研究機構神戸研究所未来ICT研究センター(兵庫県)
    • 年月日
      2010-02-08
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [学会発表] タンパク質が引き起こす生体膜変形のダイナミクス(注:シンポジウムの概略説明含む)2010

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      日本物理学会第65回年次大会
    • 発表場所
      岡山大学 津島キャンパス(岡山県)
    • 年月日
      2010-03-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] いくつかの蛋白質でのリガンド結合に伴う構造変化の詳細メカニズム2010

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      量子生命フロンティア研究特定ユニット第8回勉強会
    • 発表場所
      日本原子力研究機構システム計算科学センター(東京都)
    • 年月日
      2010-03-17
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 可塑性を巧緻に利用するタンパク質の構造機能制御2010

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第10回生命・情報セミナー
    • 発表場所
      東京都文京区/東京大学理学部
    • 年月日
      2010-11-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] タンパク質が引き起こす生体膜変形のダイナミクス(注:シンポジウムの概略説明含む)2010

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      日本物理学会第65回年次大会
    • 発表場所
      岡山大学 津島キャンパス(岡山県)
    • 年月日
      2010-03-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [学会発表] タンパク質が引き起こす膜変形のダイナミクス2010

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      日本物理学会 第65回年次大会 シンポジウム
    • 発表場所
      岡山大学津山キャンパス
    • 年月日
      2010-03-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [学会発表] 生体超分子の立体構造変化と機能2010

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      分野間連携プロジェクト「巨大計算の新手法の開発と分子・物質シミュレーション中核拠点の形成」第6回連携研究会及成果報告
    • 発表場所
      分子科学研究所研究棟301(愛知県)
    • 年月日
      2010-02-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 分子シミュレーションによるテラヘルツ領域での蛋白質ダイナミクス-計算による中性子散乱・テラヘルツ分光スペクトル-2010

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第1回テラヘルツーバイオ研究会
    • 発表場所
      情報通信研究機構神戸研究所未来ICT研究センター(兵庫県)
    • 年月日
      2010-02-08
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 大規模分子動力学によるバイオナノマシンの機能シミュレーション2010

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      スーパーコンピューターワークショップ2010「大規模並列分子シミュレーションの最前線」
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
    • 年月日
      2010-01-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 生体超分子の立体構造変化と機能2010

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      分野間連携プロジェクト「巨大計算の新手法の開発と分子・物質シミュレーション中核拠点の形成」第6回連携研究会及成果報告
    • 発表場所
      分子科学研究所研究棟301(愛知県)
    • 年月日
      2010-02-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [学会発表] 大規模分子動力学によるバイオナノマシンの機能シミュレーション2010

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      スーパーコンピューターワークショップ2010「大規模並列分子シミュレーションの最前線」
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
    • 年月日
      2010-01-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [学会発表] 分子シミュレーションによるテラヘルツ領域での蛋白質ダイナミクス-計算による中性子散乱・テラヘルツ分光スペクトル-2010

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第1回テラールレツーバイオ研究会
    • 発表場所
      情報通信研究機構神戸研究所未来ICT研究センター(兵庫県)
    • 年月日
      2010-02-08
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 生体超分子の立体構造変化と機能2010

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      分野間連携プロジェクト「巨大計算の新手法の開発と分子・物質シミュレーション中核拠点の形成」第6回連携研究会及成果報告
    • 発表場所
      分子科学研究所 研究棟301(愛知県)
    • 年月日
      2010-02-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 蛋白質界面と分子間相互作用のダイナミクス2010

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      ワークショソプ「ソフト界面と水」
    • 発表場所
      福岡県福岡市/九州大学箱崎キャンパス
    • 年月日
      2010-08-11
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] いくつかの蛋白質でのリガンド結合に伴う構造変化の詳細メカニズム2010

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      量子生命フロンティア研究特定ユニット第8回勉強会
    • 発表場所
      日本原子力研究機構システム計算科学センター(東京都)
    • 年月日
      2010-03-17
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 中性子散乱と分子シミュレーションによる蛋白質の立体構造ダイナミクス-現状と今後への期待-2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      JSNS2009-中性子科学会/第9回年会
    • 発表場所
      いばらき量子ビーム研究センター(茨城県)
    • 年月日
      2009-12-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] タンパク質ダイナミクスと機能における水和の役割2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      理研シンポジウム「動的水和構造と分子過程研究会III」
    • 発表場所
      理化学研究所Spring8上坪講堂(兵庫県)
    • 年月日
      2009-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] Motional correlation in protein dynamics2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      Telluride Science Research Center Workshop on Protein Dynamics
    • 発表場所
      Telluride/CO(USA)
    • 年月日
      2009-08-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 大規模分子シミュレーションの現状と細菌べん毛系の機能研究2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      連続研究会「イオンチャンネル」
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター / 愛知県岡崎市
    • 年月日
      2009-02-17
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] タンパク質ダイナミクスと機能における水和の役割2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      理研シンポジウム「動的水和構造と分子過程研究会III」
    • 発表場所
      理化学研究所 Spring8 上坪講堂(兵庫県)
    • 年月日
      2009-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] Seeing is believing : コンピューターでみてわかるバイオ分子2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      夏の学校2009「日本バイオインフォマティクス学会」
    • 発表場所
      時の栖(静周県)
    • 年月日
      2009-09-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] Seeing is believing:コンピューターでみてわかるバイオ分子2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      夏の学校2009「日本バイオインフォマティクス学会」
    • 発表場所
      時の栖(静岡県)
    • 年月日
      2009-09-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 生体超分子機能解明のための大規模分子シミュレーション2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構 第6回公開シンポジウム
    • 発表場所
      千里ライフサイエンスセンター(大阪府)
    • 年月日
      2009-12-01
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] Characterization of the effects of large main-chain dihedral changes in proteins2009

    • 著者名/発表者名
      Kitao, Akio
    • 学会等名
      Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences-Experi ments and Simulations
    • 発表場所
      KIAS / KOREA. Soul
    • 年月日
      2009-02-28
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 中性子散乱と分子シミュレーションによる蛋白質の立体構造ダイナミクス-現状と今後への期待-2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      JSNS2009-中性子科学会/第9回年会
    • 発表場所
      いばらき量子ビーム研究センター(茨城県)
    • 年月日
      2009-12-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [学会発表] 生体超分子機能解明のための大規模分子シミュレーション2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構 第6回公開シンポジウム
    • 発表場所
      千里ライフサイエンスセンター(大阪府)
    • 年月日
      2009-12-01
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] Motional correlation in protein dynamics2009

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Telluride Science Research Center Workshop on Protein Dynamics
    • 発表場所
      Telluride/CO (USA)
    • 年月日
      2009-08-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [学会発表] バイオ分子間相互作用形態の階層的モデリング2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      JST-CREST「マルチスケール・マルチフィジックス現象の統合シミュレーション」研究領域 平成21年度 公開シンポジウム
    • 発表場所
      東洋大学(東京都)
    • 年月日
      2009-11-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 中性子散乱と分子シミュレーションによる蛋白質の立体構造ダイナミクス-現状と今後への期待-2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      JSNS2009-中性子科学会/第9回年会
    • 発表場所
      いばらき量子ビーム研究センター(茨城県)
    • 年月日
      2009-12-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] Seeing is believing:コンピューターでみてわかるバイオ分子2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      夏の学校2009「日本バイオインフォマティクス学会」
    • 発表場所
      時の栖(静岡県)
    • 年月日
      2009-09-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [学会発表] Motional correlation in protein dynamics2009

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Telluride Science Research Center Workshop on Protein Dynamics
    • 発表場所
      Telluride/CO(USA)
    • 年月日
      2009-08-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 分子シミュレーションで探るバイオの世界:蛋白質から生体超分子まで2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      公開セミナー「第19回バイオインフォマティクスーの招待」
    • 発表場所
      お茶の水女子大学理学部 2号館(東京都)
    • 年月日
      2009-06-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] バイオ分子間相互作用形態の階層的モデリング2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      JST-CREST「マルチスケール・マルチフィジックス現象の統合シミュレーション」研究領域 平成21年度 公開シンポジウム
    • 発表場所
      東洋大学(東京都)
    • 年月日
      2009-11-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 大規模分子シミュレーションの現状と細菌べん毛系の機能研究2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      連続研究会「イオンチャンネル」
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター/愛知県岡崎市
    • 年月日
      2009-02-17
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 生体超分子機能解明のための大規模分子シミュレーション2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構 第6回公開シンポジウム
    • 発表場所
      千里ライフサイエンスセンター(大阪府)
    • 年月日
      2009-12-01
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [学会発表] Characterization of the effects of large main-chain dihedral changes in proteins2009

    • 著者名/発表者名
      Kitao, Akio
    • 学会等名
      Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences-Experi ments and Simulations
    • 発表場所
      KIAS / KOREA, Soul
    • 年月日
      2009-02-28
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] Multi-scale dynamics of protein complex formation2009

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      International Symposium on Multi-Scale Dynamics of Protein Complex Formation and Function
    • 発表場所
      The Univ.of Tokyo ; Sanjo Conference Hall(Tokyo)
    • 年月日
      2009-07-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] Multi-scale dynamics of protein complex formation2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      International Symposium on Multi-Scale Dynamics of Protein Complex Formation and Function
    • 発表場所
      The Univ.of Tokyo ; Sanjo Conference Hall(Tokyo)
    • 年月日
      2009-07-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 集団座標による分子シミュレーションの解析2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第5回分子・物質シミュレーション中核拠点形成事業人材育成講座「第3回 分子シミュレーションスクール」
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
    • 年月日
      2009-12-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [学会発表] Multi-scale dynamics of protein complex formation2009

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      International Symposium on Multi-Scale Dynamics of Protein Complex Formation and Function
    • 発表場所
      The Univ.of Tokyo ; Sanjo Conference Hall (Tokyo)
    • 年月日
      2009-07-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [学会発表] 分子シミュレーションで探るバイオの世界:蛋白質から生体超分子まで2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      公開セミナー「第19回バイオインフォマティクスへの招待」
    • 発表場所
      お茶の水女子大学理学部 2号館(東京都)
    • 年月日
      2009-06-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 分子シミュレーションで探るバイオの世界:蛋白質から生体超分子まで2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      公開セミナー「第19回バイオインフォマティクスへの招待」
    • 発表場所
      お茶の水女子大学理学部 2号館(東京都)
    • 年月日
      2009-06-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [学会発表] T4ファージ蛋白質gp5の脂質2重膜貫通シミュレーション2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      次世代スパコン「ナノ統合拠点」連続研究会-ウイルス分子科学-
    • 発表場所
      東京大学 / 東京都文京区
    • 年月日
      2009-01-06
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 集団座標による分子シミュレーションの解析2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第5回分子・物質シミュレーション中核拠点形成事業人材育成講座「第3回 分子シミュレーションスクール」
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
    • 年月日
      2009-12-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 集団座標による分子シミュレーションの解析2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第5回分子・物質シミュレーション中核拠点形成事業人材育成講座「第3回分子シミュレーションスクール」
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
    • 年月日
      2009-12-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] タンパク質ダイナミクスと機能における水和の役割2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      理研シンポジウム「動的水和構造と分子過程研究会III」
    • 発表場所
      理化学研究所Spring8上坪講堂(兵庫県)
    • 年月日
      2009-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [学会発表] T4ファージ蛋白質gp5の脂質2重膜貫通シミュレーション2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      次世代スパコン「ナノ統合拠点」連続研究会-ウイルス分子科学-
    • 発表場所
      東京大学/東京都文京区
    • 年月日
      2009-01-06
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] バイオ分子間相互作用形態の階層的モデリング2009

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      JST-CREST「マルチスケール・マルチフィジックス現象の統合シミュレーション」研究領域 平成21年度 公開シンポジウム
    • 発表場所
      東洋大学(東京都)
    • 年月日
      2009-11-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087101
  • [学会発表] 分子シミュレーションと溶液散乱で探る蛋白質の立体構造変化2008

    • 著者名/発表者名
      城地 保昌, 北尾 彰朗
    • 学会等名
      次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発第2回公開シンポジウム
    • 発表場所
      岡崎カンファレンスセンター
    • 年月日
      2008-03-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18031006
  • [学会発表] 【ポスター】バクテリオファージT4の感染初期過程2008

    • 著者名/発表者名
      二島 渉、金丸 周司、有坂 文雄、北尾 彰朗
    • 学会等名
      文部科学省「最先端・高性能汎用スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト第2回公開シンポジウム
    • 発表場所
      愛知県 岡崎市 岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2008-03-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【ポスター】マルコフ遷移行列から決定する生体分子の自由エネルギー面2008

    • 著者名/発表者名
      櫻庭 俊、北尾彰朗
    • 学会等名
      日本物理学会2008春季大会
    • 発表場所
      大阪府 東大阪市 近畿大学
    • 年月日
      2008-03-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】分子シミュレーションと溶液散乱で探る蛋白質の立体構造変化2008

    • 著者名/発表者名
      城地保昌、北尾彰朗
    • 学会等名
      文部科学省「最先端・高性能汎用スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト第2回公開シンポジウム
    • 発表場所
      愛知県 岡崎市 岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2008-03-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] Molecular Mechanisms That Control Structure of Flexible Bio-nanomachines2008

    • 著者名/発表者名
      Kitao, Akio
    • 学会等名
      The 1st International Conference of the Grand Challen ge to Next-Generation Integrated Nanoscience
    • 発表場所
      日本科学未来館 / 東京都江東区
    • 年月日
      2008-06-04
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【招待講演】大規模計算機シミュレーションで探る生体超分子構造形成から分子機能まで2008

    • 著者名/発表者名
      北尾 彰朗
    • 学会等名
      ナノタク研究会;平成19年度シンポジウム「近未来ナノテクノロジ技術シーズ」
    • 発表場所
      群馬県桐生市群馬大学工学部
    • 年月日
      2008-03-19
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【ポスター】全原子モデルと粗視化モデルを組み合わせた生体高分子系のマルチスケールシミュレーション2008

    • 著者名/発表者名
      原田 隆平、北尾 彰朗
    • 学会等名
      文部科学省「最先端・高性能汎用スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト第2回公開シンポジウム
    • 発表場所
      愛知県 岡崎市 岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2008-03-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【ポスター】マルコフ遷移行列から決定する生体分子の自由エネルギー面2008

    • 著者名/発表者名
      櫻庭 俊、北尾彰朗
    • 学会等名
      文部科学省「最先端・高性能汎用スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト第2回公開シンポジウム
    • 発表場所
      愛知県 岡崎市 岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2008-03-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] Hydration effects on protein dynamics studied by molecular dynamics simulation of a crystalline protein2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Joti, H. Nakagawa, M. Kataoka and A. Kitao
    • 学会等名
      5th Open Workshop for "Chemistry of Biological Processes Created by Water and Biomolecules"
    • 発表場所
      奈良県新公会堂
    • 年月日
      2008-01-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18031006
  • [学会発表] レア・イベントとしてのタンパク質ダイナミクスと複合体形成2008

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第46回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場 / 福岡県博多市
    • 年月日
      2008-12-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【ポスター】タンパク質拡散における水モデルとシミュレーションボックスサイズ2008

    • 著者名/発表者名
      竹村 和浩、北尾 彰朗
    • 学会等名
      スーパーコンピューターワークショップ2008大規模計算と分子のダイナミクス
    • 発表場所
      愛知県 岡崎市 岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2008-02-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【ポスター】Effects of water model and simulation box size on protein diffusional motions2008

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第5回「水と生体分子」公開ワークショップ
    • 発表場所
      奈良県 奈良市 奈良県新公会堂
    • 年月日
      2008-01-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 蛋白質gp5三量体の脂質2重膜貫通シミュレーション2008

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第4回ワークショップ
    • 発表場所
      淡路夢舞台国際会議場/兵庫県淡路市
    • 年月日
      2008-06-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 蛋白質gp5三量体の脂質2重膜貫通シミュレーション2008

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第4回ワークショップ
    • 発表場所
      淡路夢舞台国際会議場/兵庫県淡路市
    • 年月日
      2008-06-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【招待講演】大規模分子動力学シミュレーションで探るべん毛繊維とフックの構造多型2008

    • 著者名/発表者名
      北尾 彰朗
    • 学会等名
      2008べん毛研究交流会ICORP超分子ナノマシンプロジェクト終了報告会
    • 発表場所
      京都府京都市関西セミナーハウス
    • 年月日
      2008-03-04
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] Effect of hydration, temperature and pressure on protein dynamics2008

    • 著者名/発表者名
      Kitao, Akio
    • 学会等名
      5th International HPBB 2008
    • 発表場所
      Scripps Inst.of Oceanography / California, USA
    • 年月日
      2008-09-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【招待講演】 分子シミュレーションで探る生体高分子系のダイナミクス2008

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      応用物理学関係連合講演会
    • 発表場所
      千葉県 船橋市日本大学理工学部
    • 年月日
      2008-03-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】タンパク質拡散運動における水モデルとシミュレーションボックスサイズの影響2008

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      文部科学省「最先端・高性能汎用スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト第2回公開シンポジウム
    • 発表場所
      愛知県 岡崎市 岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2008-03-04
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】タンパク質拡散運動における水モデルとシミュレーションボックスサイズの影響2008

    • 著者名/発表者名
      竹村 和浩、北尾 彰朗
    • 学会等名
      文部科学省「最先端・高性能汎用スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト第2回公開シンポジウム
    • 発表場所
      愛知県 岡崎市 岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2008-03-04
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【口頭】生体超分子の立体構造変化と機能2008

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第4回連携研究会;分野間連携プロジェクト「巨大計算新手法の開発と分子・物質シミュレーション中核拠点の形成
    • 発表場所
      愛知県 岡崎市自然科学研究機構
    • 年月日
      2008-02-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] Effect of hydration, temperature and pressure on protein dynamics2008

    • 著者名/発表者名
      Kitao, Akio
    • 学会等名
      5^<th> International HPBB 2008
    • 発表場所
      Scripps Inst.of Oceanography/ California, USA
    • 年月日
      2008-09-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】マルコフ遷移行列から決定する生体分子の自由エネルギー面2008

    • 著者名/発表者名
      櫻庭 俊、北尾 彰朗
    • 学会等名
      日本物理学会2008春季大会
    • 発表場所
      大阪府東大阪市近畿大学
    • 年月日
      2008-03-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【ポスター】Hydration effects on protein dynamics studied by moleculardynamics simulation of a crystalline2008

    • 著者名/発表者名
      城地保昌、北尾彰朗
    • 学会等名
      第5回「水と生体分子」公開ワークショップ
    • 発表場所
      奈良県 奈良市 奈良県新公会堂
    • 年月日
      2008-01-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 超並列計算機に適した生体分子シミュレーション法の開発2008

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構1第5回公開シンポジウム
    • 発表場所
      つくば国際会議場/茨城県つくば市
    • 年月日
      2008-12-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】Effects of water model and simulation box size on protein diffusional motions2008

    • 著者名/発表者名
      竹村 和浩、北尾 彰朗
    • 学会等名
      第5回「水と生体分子」公開ワークショップ
    • 発表場所
      奈良県 奈良市奈良県新公会堂
    • 年月日
      2008-01-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] やわらかい生体分子が形を制御する仕組み2008

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      東大/駒場/2008年度物性セミナー
    • 発表場所
      東京大学 / 東京都文京区
    • 年月日
      2008-05-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【ポスター】タンパク質拡散における水モデルとシミュレーションボックスサイズ2008

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      スーパーコンピューターワークショップ2008大規模計算と分子のダイナミクス
    • 発表場所
      愛知県 岡崎市 岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2008-02-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【招待講演】大規模計算機シミュレーションで探る生体超分子構造形成から分子機能まで2008

    • 著者名/発表者名
      北尾 彰朗
    • 学会等名
      第24回ライフサイエンス&HPC天城セミナー
    • 発表場所
      静岡県伊豆市天城ホームステッド
    • 年月日
      2008-03-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【招待溝演】大規模計算機シミュレーションで探る生体超分子構造形成から分子機能まで2008

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第24回ライフサイエンス&HPC天城セミナー
    • 発表場所
      静岡県 伊豆市天城ホームステッド
    • 年月日
      2008-03-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】バクテリオファージT4の感染初期過程2008

    • 著者名/発表者名
      二島 渉、金丸周司、有坂文雄、北尾彰朗
    • 学会等名
      文部科学省「最先端・高性能汎用スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト第2回公開シンポジウム
    • 発表場所
      愛知県 岡崎市 岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2008-03-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] バイオ分子間相互作用形態の階層的モデリング2008

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      戦略的創造研究推進事業CREST平成20年度公開シンポジウム
    • 発表場所
      東洋大学 / 東京都文京区
    • 年月日
      2008-10-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【ポスター】Molecular Dynamics Simulations of the Periplasmic Glutamine Binding Protein2008

    • 著者名/発表者名
      Hannes H. Loeffler、北尾彰朗
    • 学会等名
      Biomolecular Simulation 2008:frontiers of biomolecular
    • 発表場所
      Bristrol Zoo, UK
    • 年月日
      2008-01-07
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】Molecular Dynamics Simulations of the Periplasmic Glutamine Binding Protein2008

    • 著者名/発表者名
      Hannes H. Loeffler、北尾 彰朗
    • 学会等名
      Biomolecular Simulation2008:frontiers of biomolecular
    • 発表場所
      Bristrol Zoo,UK
    • 年月日
      2008-01-07
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] やわらかい生体分子が形を制御する仕組み2008

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      東大/駒場/2008年度物性セミナー
    • 発表場所
      東京大学/東京都文京区
    • 年月日
      2008-05-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】マルコフ遷移行列から決定する生体分子の自由エネルギー面2008

    • 著者名/発表者名
      櫻庭 俊、北尾 彰朗
    • 学会等名
      文部科学省「最先端・高性能汎用スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト第2回公開シンポジウム
    • 発表場所
      愛知県 岡崎市 岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2008-03-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] レア・イベントとしてのタンパク質ダイナミクスと複合体形成2008

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第46回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場/福岡県博多市
    • 年月日
      2008-12-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【招待講演】大規模分子動力学法による生体超分子の立体構造変化と機能2008

    • 著者名/発表者名
      北尾 彰朗
    • 学会等名
      スーパーコンピューターワークショップ2008大規模計算と分子のダイナミクス
    • 発表場所
      愛知県 岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2008-02-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] Hydration effects on protein dynamics studied by molecular dynamics simulation of a crystalline protein2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Joti, H. Nakagawa, M. Kataoka and A. Kitao
    • 学会等名
      5th Open Workshop for "Chemistry of Biological Processes Created by Water and Biomolecules"
    • 発表場所
      奈良県新公会堂
    • 年月日
      2008-01-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19042005
  • [学会発表] バイオ分子間相互作用形態の階層的モデリング2008

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      戦略的創造研究推進事業CREST平成20年度公開シンポジウム
    • 発表場所
      東洋大学/東京都文京区
    • 年月日
      2008-10-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【口頭】生体超分子の立体構造変化と機能2008

    • 著者名/発表者名
      北尾 彰朗
    • 学会等名
      第4回連携研究会;分野間連携プロジェクト「巨大計算新手法の開発と分子・物質シミュレーション中核拠点の形成
    • 発表場所
      愛知県岡崎市自然科学研究機構
    • 年月日
      2008-02-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【招待溝演】大規模計算機シミュレーションで探る生体超分子構造形成から分子機能まで2008

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      ナノテク研究会;平成19年度シンポジウム「近未来ナノテクノロジ技術シーズ」
    • 発表場所
      群馬県 桐生市群馬大学工学部
    • 年月日
      2008-03-19
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 超並列計算機に適した生体分子シミュレーション法の開発2008

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第5回公開シンポジウム
    • 発表場所
      つくば国際会議場 / 茨城県つくば市
    • 年月日
      2008-12-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【招待講演】分子シミュレーションで探る生体高分子系のダイナミクス2008

    • 著者名/発表者名
      北尾 彰朗
    • 学会等名
      応用物理学関係連合講演会
    • 発表場所
      千葉県船橋市日本大学理工学部
    • 年月日
      2008-03-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【ポスター】全原子モデルと粗視化モデルを組み合わせた生体高分子系のマルチスケールシミュレーション2008

    • 著者名/発表者名
      原田隆平、北尾彰朗
    • 学会等名
      文部科学省「最先端・高性能汎用スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト第2回公開シンポジウム
    • 発表場所
      愛知県 岡崎市 岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2008-03-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【招待講演】大規模分子動力学シミュレーションで探るべん毛繊維とフックの構造多型2008

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      2008べん毛研究流会ICORP超分子ナノマシンプロジェクト終了報告会
    • 発表場所
      京都府 京都市関西セミナーハウス
    • 年月日
      2008-03-04
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】Hydration effects on protein dynamics studied by molecular dynamics simulation of a crystalline2008

    • 著者名/発表者名
      城地 保昌、北尾 彰朗
    • 学会等名
      第5回「水と生体分子」公開ワークショップ
    • 発表場所
      奈良県奈良市奈良県新公会堂
    • 年月日
      2008-01-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【招待講演】大規模分子動力学法による生体超分子の立体構造変化と機能2008

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      スーパーコンピューターワークショップ2008大規模計算と分子のダイナミクス
    • 発表場所
      愛知県 岡崎市岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2008-02-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] Molecular Mechanisms That Control Structure of Flexible Bio-nanomachines2008

    • 著者名/発表者名
      Kitao, Akio
    • 学会等名
      The 1st International Conference of the Grand Challen ge to Next-Generation Integrated Nanoscience
    • 発表場所
      日本科学未来館/東京都江東区
    • 年月日
      2008-06-04
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】分子シミュレーションと溶液散乱で探る蛋白質の立体構造変化2008

    • 著者名/発表者名
      城地 保昌、北尾 彰朗
    • 学会等名
      文部科学省「最先端・高性能汎用スーパーコンピュータの開発利用」プロジェクト第2回公開シンポジウム
    • 発表場所
      愛知県 岡崎市 岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2008-03-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 分子シミュレーションと溶液散乱で探る蛋白質の立体構造変化2008

    • 著者名/発表者名
      城地 保昌, 北尾 彰朗
    • 学会等名
      次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発第2回公開シンポジウム
    • 発表場所
      岡崎カンファレンスセンター
    • 年月日
      2008-03-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19042005
  • [学会発表] 【口頭】生体分子の自由エネルギー地形の解析2007

    • 著者名/発表者名
      櫻庭 俊、北尾彰朗
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      神奈川県 横浜市パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】細菌べん毛蛋白質flagellinのアンフォールディングシミュレーション:繊維形成過程の理解を目指して2007

    • 著者名/発表者名
      Chng Choon-peng、北尾 彰朗
    • 学会等名
      特定領域研究「生体超分子構造」第4回公開シンポジウム
    • 発表場所
      大阪府豊中市千里ライフサイエンスセンター
    • 年月日
      2007-12-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【ポスター】分子シミュレーションによるタンパク質分子間ドッキング計算手法の開発2007

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      宮城県 仙台市仙台国際センター
    • 年月日
      2007-05-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】バクテリオファージT4の感染初期過程シミュレーション2007

    • 著者名/発表者名
      二島 渉、金丸周司、有坂文雄、北尾彰朗
    • 学会等名
      特定領域研究「生体超分子構造」第4回公開シンポジウム
    • 発表場所
      大阪府 豊中市千里ライフサイエンスセンター
    • 年月日
      2007-12-08
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】細菌べん毛蛋白質flagellinのアンフォールディングシミュレーション:繊維形成過程の理解を目指して2007

    • 著者名/発表者名
      Chng Choon-peng、北尾彰朗
    • 学会等名
      特定領域研究「生体超分子構造」第4回公開シンポジウム
    • 発表場所
      大阪府 豊中市 千里ライフサイエンスセンター
    • 年月日
      2007-12-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【招待講演】サブマイクロ秒領域での蛋白質に揺らぎと機能2007

    • 著者名/発表者名
      北尾 彰朗
    • 学会等名
      一回論理創薬研究会
    • 発表場所
      岐阜県岐阜市岐阜大学医学部
    • 年月日
      2007-12-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【ポスター】分子シミュレーションによるタンパク質分子間ドッキング計算手法の開発2007

    • 著者名/発表者名
      竹村 和浩、北尾 彰朗
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      宮城県仙台市仙台国際センター
    • 年月日
      2007-05-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【招待講演】Role of energy frustration in function of protein and supramolecule2007

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      The 7th KIAS-Soongsil Conference on Protein Structure and Function
    • 発表場所
      Soongsil University,Seoul,KOREA
    • 年月日
      2007-11-04
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【ポスター】粗視化シミュレーションと並列全原子シミュレーションを組み合わせた生体高分子系の効率的構造空間探索2007

    • 著者名/発表者名
      原田 隆平、北尾 彰朗
    • 学会等名
      特定領域研究「生体超分子構造」第4回公開シンポジウム
    • 発表場所
      大阪府豊中市千里ライフサイエンスセンター
    • 年月日
      2007-12-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【招待講演】Conformational changes in proteins and nucleic acids which constitute biological macro-molecules2007

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Japan-UK Symposium
    • 発表場所
      神奈川県横浜市パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【口頭】タンパク質ユビキチンのNMR緩和と分子シミュレーション2007

    • 著者名/発表者名
      竹村和浩、北尾彰朗
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      神奈川県 横浜市パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【招待講演】Conformational changes inproteins and nucleic acids which constitute biological macro-molecules2007

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Japan-UK Symposium
    • 発表場所
      神奈川県 横浜市パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【口頭】生体分子の自由エネルギー地形の解析2007

    • 著者名/発表者名
      櫻庭 俊、北尾 彰朗
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      神奈川県横浜市パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 分子シミュレーションと中性子散乱で探る蛋白質の協奏的運動2007

    • 著者名/発表者名
      城地 保昌, 北尾 彰朗
    • 学会等名
      第45回生物物理学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18031006
  • [学会発表] 【口頭】バクテリオファージT4の感染初期過程2007

    • 著者名/発表者名
      二島 渉、金丸周司、有坂文雄、北尾彰朗
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      神奈川県 横浜市パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【招待講演】サブマイクロ秒領域での蛋白質に揺らぎと機能2007

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      第一回論理創薬研究会
    • 発表場所
      岐阜県 岐阜市岐阜大学医学部
    • 年月日
      2007-12-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】バクテリオファージT4尾部の膜貫通機構2007

    • 著者名/発表者名
      二島 渉、金丸周司、有坂文雄、北尾彰朗
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      宮城県 仙台市仙台国際センター
    • 年月日
      2007-05-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】粗視化シミュレーションと並列全原子シミュレーションを組み合わせた生体高分子系の効率的構造空間探索2007

    • 著者名/発表者名
      原田隆平、北尾彰朗
    • 学会等名
      特定領域研究「生体超分子構造」第4回公開シンポジウム
    • 発表場所
      大阪府 豊中市千里ライフサイエンスセンター
    • 年月日
      2007-12-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【口頭】バクテリオファージT4の感染初期過程2007

    • 著者名/発表者名
      二島 渉、金丸 周司、有坂 文雄、北尾 彰朗
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      神奈川県横浜市パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【ポスター】分子シミュレーションと中性子干渉性散乱で探る蛋白質の協奏的運動2007

    • 著者名/発表者名
      城地保昌、北尾彰朗
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      神奈川県 横浜市 パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】バクテリオファージT4尾部の膜貫通機構2007

    • 著者名/発表者名
      二島 渉、金丸 周司、有坂 文雄、北尾 彰朗
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      宮城県仙台市仙台国際センター
    • 年月日
      2007-05-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【招待講演】Polymorphic Supercoiling Mechanism of Bacterial Flagellar Filament and Hook2007

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Theoretical Colloquia Series
    • 発表場所
      Los Alamos, USA
    • 年月日
      2007-06-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【口頭】aPCA analysis of NMR on ubiquitin proteins and the webserver tool2007

    • 著者名/発表者名
      Yang Lee-Wei、Eran Eyal、Ivet Bahar、北尾 彰朗
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      神奈川県横浜市パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【ポスター】分子シミュレーションと中性子干渉性散乱で探る蛋白質の協奏的運動2007

    • 著者名/発表者名
      城地 保昌、北尾 彰朗
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      神奈川県横浜市パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【口頭】aPCA analysis of NMR on ubiquitin proteins and the webserver tool2007

    • 著者名/発表者名
      Yang Lee-Wei、Eran Eyal、Lvet Bahar、北尾彰朗
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      神奈川県 横浜市パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】The dynamic predisposition of (the location of) enzyme active sites2007

    • 著者名/発表者名
      Yang Lee-Wei, Akio Kitao, Ivet Bahar
    • 学会等名
      AFP/Biosapien
    • 発表場所
      Vienna, Austria
    • 年月日
      2007-07-19
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】バクテリオファージT4の感染機構2007

    • 著者名/発表者名
      二島 渉、金丸周司、有坂文雄、北尾彰朗
    • 学会等名
      第3回生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構
    • 発表場所
      静岡県 熱海市ホテルニューアカオ
    • 年月日
      2007-07-11
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【口頭】タンパク質ユビキチンのNMR緩和と分子シミュレーション2007

    • 著者名/発表者名
      竹村 和浩、北尾 彰朗
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      神奈川県横浜市パシフイコ横浜)
    • 年月日
      2007-12-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【ポスター】The dynamic predisisposision of(the location of)enzyme active sites2007

    • 著者名/発表者名
      Yang Lee-Wei, Akio Kitao, Lvet Bahar
    • 学会等名
      AFP/Biosapien
    • 発表場所
      Vienna,Austria
    • 年月日
      2007-07-19
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【ポスター】バクテリオファージT4の感染初期過程シミュレーション2007

    • 著者名/発表者名
      二島 渉、金丸 周司、有坂 文雄、北尾 彰朗
    • 学会等名
      特定領域研究「生体超分子構造」第4回公開シンポジウム
    • 発表場所
      大阪府豊中市千里ライフサイエンスセンター
    • 年月日
      2007-12-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【招待講演】Polyrnorphic Supercoiling Mechanism of Bacterial Flagellar Fllamentand Hook2007

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      Theoretical Colloquia Series
    • 発表場所
      Los Alamos,USA
    • 年月日
      2007-06-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【招待講演】Role of energy frustration in function of protein and supramolecule2007

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      The 7th KIAS-Soongsil Conference on Protein Structure and Function
    • 発表場所
      Soongsil University, Seoul, KOREA
    • 年月日
      2007-10-04
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】生体分子の自由エネルギー地形の解析2007

    • 著者名/発表者名
      櫻庭 俊、北尾 彰朗、有坂 文雄
    • 学会等名
      第3回生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構
    • 発表場所
      静岡県熱海市ホテルニューアカオ
    • 年月日
      2007-07-11
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【ポスター】バクテリオファージT4の感染機構2007

    • 著者名/発表者名
      二島 渉、金丸 周司、有坂 文雄、北尾 彰朗
    • 学会等名
      第3回生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構
    • 発表場所
      静岡県熱海市ホテルニューアカオ
    • 年月日
      2007-07-11
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 【口頭】Dynomics portal-An integral effort on developing and organizing dynamics web servers/databases2007

    • 著者名/発表者名
      Yang Lee-Wei、二島 渉、北尾彰朗
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      神奈川県 横浜市パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【ポスター】生体分子の自由エネルギー地形の解析2007

    • 著者名/発表者名
      櫻庭 俊、北尾彰朗、有坂文雄
    • 学会等名
      第3回生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構
    • 発表場所
      静岡県 熱海市ホテルニューアカオ
    • 年月日
      2007-07-11
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16087202
  • [学会発表] 【口頭】Dynomics portal-An integral effort ond eveloping and organizing dynamics webservers/databases2007

    • 著者名/発表者名
      Yang Lee-Wei、二島 渉、北尾 彰朗
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      神奈川県横浜市パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19370062
  • [学会発表] 分子シミュレーションと中性子散乱で探る蛋白質の協奏的運動2007

    • 著者名/発表者名
      城地 保昌, 北尾 彰朗
    • 学会等名
      第45回生物物理学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19042005
  • [学会発表] Observing soft functional motion of proteins in silico

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会シンポジウム
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] 高度な分子動力学によるタンパク質の機能シミュレーション

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      スーパーコンピュータワークショップ2015
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県・岡崎市)
    • 年月日
      2015-01-29 – 2015-01-30
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] Conformational Transition Pathway and Free Energy Analyses of Proteins by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics (PaCS-MD)

    • 著者名/発表者名
      Ryuhei Harada, Yasutaka Nishihara, Nobuhiko Wakai and Akio Kitao
    • 学会等名
      International Conference of Computational Methods in Sciences and Engineering (ICCMSE 2014)
    • 発表場所
      Athens, Greece/Metropolitan Hotel
    • 年月日
      2014-04-04 – 2014-04-07
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] 高度な分子動力学によるタンパク質の機能シミュレーション

    • 著者名/発表者名
      北尾彰朗
    • 学会等名
      スーパーコンピュータワークショップ2015
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県・岡崎市)
    • 年月日
      2015-01-29 – 2015-01-30
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Conformational Transition Pathway and Free Energy Analyses of Proteins by Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics (PaCS-MD)

    • 著者名/発表者名
      Ryuhei Harada, Yasutaka Nishihara, Nobuhiko Wakai and Akio Kitao
    • 学会等名
      International Conference of Computational Methods in Sciences and Engineering (ICCMSE 2014)
    • 発表場所
      Athens, Greece/Metropolitan Hotel
    • 年月日
      2014-04-04 – 2014-04-07
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Membrane deformation induced by proteins

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      分子研研究会「生体分子の構造、ダイナッミクス、機能」「Architecture, dynamics, and functionality of molecular biosystems」
    • 発表場所
      自然科学研究機構 分子研 研究棟201セミナー室(愛知県・岡崎市)
    • 年月日
      2015-03-30 – 2015-03-31
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • [学会発表] Membrane deformation induced by proteins

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      分子研研究会「生体分子の構造、ダイナッミクス、機能」「Architecture, dynamics, and functionality of molecular biosystems」
    • 発表場所
      自然科学研究機構 分子研 研究棟201セミナー室(愛知県・岡崎市)
    • 年月日
      2015-03-30 – 2015-03-31
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104002
  • [学会発表] Observing soft functional motion of proteins in silico

    • 著者名/発表者名
      Akio Kitao
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会シンポジウム
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23370066
  • 1.  城地 保昌 (30360415)
    共同の研究課題数: 6件
    共同の研究成果数: 35件
  • 2.  木寺 詔紀 (00186280)
    共同の研究課題数: 4件
    共同の研究成果数: 0件
  • 3.  田原 太平 (60217164)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 1件
  • 4.  藤井 正明 (60181319)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 1件
  • 5.  水谷 泰久 (60270469)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 1件
  • 6.  神取 秀樹 (70202033)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 2件
  • 7.  郷 信広 (50011549)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 8.  油谷 克英 (90089889)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 9.  林 重彦 (70402758)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 10.  月原 冨武 (00032277)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 11.  難波 啓一 (30346142)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 12.  福森 義宏 (60135655)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 13.  有坂 文雄 (80133768)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 14.  吉川 信也 (40068119)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 15.  大村 敏博 (20355499)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 16.  佐藤 主税 (00357146)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 17.  永田 宏次 (30280788)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 18.  神谷 信夫 (60152865)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 19.  桑嶋 邦博 (70091444)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 20.  輪湖 博 (60158607)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 21.  片岡 幹雄 (30150254)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 22.  櫛田 孝司 (00013516)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 23.  山縣 ゆり子 (40183678)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 24.  木下 賢吾 (60332293)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 25.  池口 満徳 (60261955)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 26.  森田 明弘 (70252418)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 27.  高橋 聡 (30283641)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 28.  村橋 哲郎 (40314380)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 29.  中西 尚志 (40391221)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 30.  川岸 郁朗 (80234037)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件
  • 31.  大島 泰郎 (60167301)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 32.  阿久津 秀雄 (60029965)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 33.  郷 通子 (70037290)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 34.  野口 俊之 (90172775)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 35.  熊谷 泉 (10161689)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 36.  伊倉 貞吉 (50251393)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 37.  後藤 祐児 (40153770)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 38.  西山 雅祥 (10346075)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 6件
  • 39.  今田 勝巳 (40346143)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 40.  山下 敦子 (10321738)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 41.  TRAN PHUOC・DUY (50848546)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 13件
  • 42.  城所 俊一
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 43.  中村 春木
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 44.  石田 恒
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 45.  末次 京子
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 3件
  • 46.  末次 志郎
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 47.  吉田 啓亮
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 48.  尾谷 優子
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 49.  出口 敦子
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 50.  松林 伸幸
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 4件
  • 51.  中川 洋
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 52.  久堀 徹
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 53.  山田 大智
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 54.  森 健
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 55.  安藤 敏夫
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 56.  城 宜嗣
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 57.  木下 実紀
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 58.  秋山 徹
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 59.  金丸 周司
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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