• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

清水 敏之  Shimizu Toshiyuki

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 30273858
その他のID
外部サイト
所属 (現在) 2025年度: 東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2016年度 – 2024年度: 東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 教授
2015年度: 東京大学, 薬学系研究科, 教授
2012年度 – 2015年度: 東京大学, 薬学研究科(研究院), 教授
2010年度 – 2012年度: 東京大学, 大学院・薬学系研究科, 教授
2009年度: 横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 准教授 … もっと見る
2006年度 – 2008年度: 横浜市立大学, 国際総合科学研究科, 准教授
2005年度 – 2006年度: 横浜市立大学, 国際総合科学研究科, 準教授
2003年度 – 2004年度: 横浜市立大学, 大学院・総合理学研究科, 助教授
2001年度 – 2002年度: 横浜市立大学, 総合理学研究科, 助教授
1996年度 – 2000年度: 奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 助手
1996年度: 奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンズ研究科, 助手 隠す
審査区分/研究分野
研究代表者
構造生物化学 / 生物物理学 / 生物系 / 生物系 / 中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野 / 中区分47:薬学およびその関連分野
研究代表者以外
広領域 / 中区分39:生産環境農学およびその関連分野 / 学術変革領域研究区分(Ⅲ) / 生物系 / 生物物理学 / 構造生物化学 / 生物系
キーワード
研究代表者
X線結晶解析 / X線結晶構造解析 / Toll様受容体 / EF-hand / 自然免疫 / X-ray analysis / カルシウム / ヒストン / クライオ電子顕微鏡 / 構造生物学 … もっと見る / 構造生物 / TLR / Nod様受容体 / DRAK2 / NHE1 / CHP / calcineurin / calcium / カルシニューリン / CIPK / CBL2 / Merlin / X線結晶構造解析 / X線結晶解析 / リコンビナーゼ / メディエーター / 相同組み換え / EFハンド / Nucleomethylin / βターン / アルギニン / PAD4 / 立体構造 / 転写因子 / X線解析 / CryoEM / トランスポーター / リソソーム / 糖鎖 / Orientation bias / NLR / plant / カルシウムセンサー / 植物 / FERM domain / ERM protein / tertiary structure / auto-inhibition / Rho-signalling / Rho-kinase / Rho / DHドメイン / コイルドコイル / Rho-キナーゼ / FERMドメイン / ERMタンパク質 / 自己阻害 / Rhoシグナリング / Rhoキナーゼ / 1本鎖核酸 / 一本鎖核酸 / Swi5-Sfr1 / p53 / Mybbpla / X線小角散乱 / Smad / ビタミンDレセプター / X線小角散乱 / 核内受容体 / Roquin / アルギニンメチル化酵素 / SAM / 翻訳後修飾 / PRMT / アルギニンメチル化 / Rac1 / Rboh / 活性酸素 / methyltransferase / rRNA / 天然変性 / eNoSC / 核小体 / シトルリン / シトルリン化 / 制御因子 / リン酸化 / 蛋白キナーゼ / CK2 / 蛋白質核酸複合体 / 蛋白質.核酸複合体 / 分子認識 / bHLH / Pho4 / 結晶 / ヘリックスループヘリックス / 出芽酵母 / 三次元構造 / 核酸蛋白質相互作用 … もっと見る
研究代表者以外
DNA / 構造生物学 / X線 / 分子認識 / ICAM-2 / Rho / structural biology / X-ray / molecular complex / protein / G protein / signal transduction / transcription / 結晶 / 複合体 / 蛋白質 / 転写因子 / シグナル伝達 / エフェクター / 病原体 / 受容体 / 植物免疫 / 自然免疫 / Toll様受容体 / 転写環境 / エネルギー代謝 / hub metabolite / エピジェネティクス / クロマチン / 翻訳後修飾 / 生命素子 / 代謝 / 転写 / adhesion molecules / cytoskeleton / PTP2 / 細胞接着 / 細胞骨格 / PIP2 / イメージングプレート / ミラー / 光学系 / 回折 / 微小結晶 / 二成分系 / G蛋白質 / 蛋白質-DNA / DNA修復 / メディエーター / DNA 修復 / 相同組換え / アロステリック / ジストニア / 金属 / 塩基配列 / DNA結合モチーフ / bHLH / bZIP / 融合蛋白質 / DNA複製 / 結晶化 隠す
  • 研究課題

    (28件)
  • 研究成果

    (92件)
  • 共同研究者

    (34人)
  •  植物NLRによる免疫活性化とそれに対抗した病原菌エフェクターの進化の解明

    • 研究代表者
      川崎 努
    • 研究期間 (年度)
      2024 – 2027
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 審査区分
      中区分39:生産環境農学およびその関連分野
    • 研究機関
      近畿大学
  •  自然免疫応答の起点となるリソソーム ーリソソーム環境場の重要性ー研究代表者

    • 研究代表者
      清水 敏之
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2026
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 審査区分
      中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
    • 研究機関
      東京大学
  •  リソソームにおける自己指向性核酸認識の分子構造基盤解明

    • 研究代表者
      三宅 健介
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2026
    • 研究種目
      学術変革領域研究(A)
    • 審査区分
      学術変革領域研究区分(Ⅲ)
    • 研究機関
      東京大学
  •  糖鎖を利用したクライオ電子顕微鏡解析の問題克服と自然免疫受容体TLRへの応用研究代表者

    • 研究代表者
      清水 敏之
    • 研究期間 (年度)
      2021 – 2022
    • 研究種目
      挑戦的研究(萌芽)
    • 審査区分
      中区分47:薬学およびその関連分野
    • 研究機関
      東京大学
  •  自然免疫センサーの動作機構と新規制御機構の解明研究代表者

    • 研究代表者
      清水 敏之
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2021
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 審査区分
      中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
    • 研究機関
      東京大学
  •  自然免疫に関わる分子群の構造基盤の構築研究代表者

    • 研究代表者
      清水 敏之
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2018
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 研究分野
      構造生物化学
    • 研究機関
      東京大学
  •  核酸を認識するToll様受容体の構造科学的解明研究代表者

    • 研究代表者
      清水 敏之
    • 研究期間 (年度)
      2013 – 2015
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      構造生物化学
    • 研究機関
      東京大学
  •  代謝とクロストークする転写環境形成因子の構造科学的な解明研究代表者

    • 研究代表者
      清水 敏之
    • 研究期間 (年度)
      2011 – 2015
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      東京大学
  •  リコンビナーゼとその活性化因子との複合体構造を通した鎖交換反応の構造基盤の確立研究代表者

    • 研究代表者
      清水 敏之
    • 研究期間 (年度)
      2011
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      東京大学
  •  相同組換えに関わる分裂酵母Rad51‐Swi5‐Sfr1複合体の構造生物学的研究

    • 研究代表者
      桑原 直之
    • 研究期間 (年度)
      2011 – 2012
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      構造生物化学
    • 研究機関
      大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構
      東京大学
  •  生命素子による転写環境とエネルギー代謝のクロストーク

    • 研究代表者
      深水 昭吉
    • 研究期間 (年度)
      2011 – 2015
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      筑波大学
  •  相同組み換えを制御する新規メディエーターの構造科学的研究研究代表者

    • 研究代表者
      清水 敏之
    • 研究期間 (年度)
      2010 – 2012
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      構造生物化学
    • 研究機関
      東京大学
  •  植物自然免疫を担う活性酸素生成酵素の制御機構の構造生物学的解明研究代表者

    • 研究代表者
      清水 敏之
    • 研究期間 (年度)
      2009 – 2010
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      東京大学
      横浜市立大学
  •  メチル基転移領域を有する新規核小体蛋白質とその複合体の構造基盤の確立研究代表者

    • 研究代表者
      清水 敏之
    • 研究期間 (年度)
      2008 – 2010
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      横浜市立大学
  •  立体構造を基にしたヒストン修飾酵素の認識機構の解明研究代表者

    • 研究代表者
      清水 敏之
    • 研究期間 (年度)
      2006 – 2007
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      横浜市立大学
  •  ヒストン修飾酵素によるヒストン認識機構の構造的基盤研究代表者

    • 研究代表者
      清水 敏之
    • 研究期間 (年度)
      2005
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      横浜市立大学
  •  新規カルシウムセンサーによる標的分子の認識機構の解明研究代表者

    • 研究代表者
      清水 敏之
    • 研究期間 (年度)
      2005 – 2006
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      構造生物化学
    • 研究機関
      横浜市立大学
  •  カルシウムによる新規活性制御機構の構造的基盤研究代表者

    • 研究代表者
      清水 敏之
    • 研究期間 (年度)
      2003 – 2004
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      構造生物化学
    • 研究機関
      横浜市立大学
  •  Rhoキナーゼの自己阻害機構の構造的基盤研究代表者

    • 研究代表者
      清水 敏之
    • 研究期間 (年度)
      2001 – 2002
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      横浜市立大学
  •  X線結晶解析による金属蛋白質の構造生物化学

    • 研究代表者
      箱嶋 敏雄
    • 研究期間 (年度)
      2000 – 2004
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      奈良先端科学技術大学院大学
  •  分子複合体のX線解析による低分子量G蛋白質Rhoの構造生物学

    • 研究代表者
      箱嶋 敏雄
    • 研究期間 (年度)
      2000 – 2001
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      広領域
    • 研究機関
      奈良先端科学技術大学院大学
  •  制御因子が機能をコントロールする蛋白キナーゼCK2の構造的基盤研究代表者

    • 研究代表者
      清水 敏之
    • 研究期間 (年度)
      1999 – 2000
    • 研究種目
      奨励研究(A)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      奈良先端科学技術大学院大学
  •  分子複合体用結晶の実験室X腺光学系の開発と適用

    • 研究代表者
      箱嶋 敏雄
    • 研究期間 (年度)
      1998 – 2000
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 研究分野
      広領域
    • 研究機関
      奈良先端科学技術大学院大学
  •  L-Mafを中心とした転写因子のX線構造生物学的研究

    • 研究代表者
      箱嶋 敏雄
    • 研究期間 (年度)
      1997
    • 研究種目
      重点領域研究
    • 研究機関
      奈良先端科学技術大学院大学
  •  立体構造をもとにした酵母由来の転写因子Pho4による分子認識機構の解明研究代表者

    • 研究代表者
      清水 敏之
    • 研究期間 (年度)
      1997 – 1998
    • 研究種目
      奨励研究(A)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      奈良先端科学技術大学院大学
  •  分子複合体のX線解析による蛋白質の分子認識機構の研究

    • 研究代表者
      箱嶋 敏雄
    • 研究期間 (年度)
      1997 – 1999
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      奈良先端科学技術大学院大学
  •  複製関連調節因子DREF・DNA複合体のX線構造解析

    • 研究代表者
      箱嶋 敏雄
    • 研究期間 (年度)
      1996
    • 研究種目
      重点領域研究
    • 研究機関
      奈良先端科学技術大学院大学
  •  酵母由来の転写因子PHO4の全体構造の解明研究代表者

    • 研究代表者
      清水 敏之
    • 研究期間 (年度)
      1996
    • 研究種目
      奨励研究(A)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      奈良先端科学技術大学院大学

すべて 2023 2022 2021 2020 2019 2018 2017 2016 2015 2014 2013 2012 2011 2010 2009 2008 2007 2005 2003 その他

すべて 雑誌論文 学会発表 図書 産業財産権

  • [図書] 「入門構造生物学」(「転写)部分を担当)2010

    • 著者名/発表者名
      清水敏之
    • 総ページ数
      199
    • 出版者
      共立出版
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22370045
  • [図書] タンパク質核酸相互作用 タンパク質科学 構造・物性・機能2005

    • 著者名/発表者名
      清水敏之, 箱嶋敏雄
    • 総ページ数
      579
    • 出版者
      化学同人
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17054035
  • [図書] 「タンパク質核酸相互作用」タンパク質科学 構造・物性・機能2005

    • 著者名/発表者名
      清水敏之, 箱嶋敏雄
    • 総ページ数
      579
    • 出版者
      化学同人
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17570095
  • [雑誌論文] TLR3 forms a laterally aligned multimeric complex along double-stranded RNA for efficient signal transduction2023

    • 著者名/発表者名
      Sakaniwa Kentaro、Fujimura Akiko、Shibata Takuma、Shigematsu Hideki、Ekimoto Toru、Yamamoto Masaki、Ikeguchi Mitsunori、Miyake Kensuke、Ohto Umeharu、Shimizu Toshiyuki
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 14 号: 1 ページ: 164-164

    • DOI

      10.1038/s41467-023-35844-2

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19207, KAKENHI-PROJECT-23K23820, KAKENHI-PROJECT-22K19424, KAKENHI-PLANNED-22H05184, KAKENHI-PROJECT-21H04800, KAKENHI-PROJECT-23H00366
  • [雑誌論文] Structural basis for thioredoxin-mediated suppression of NLRP1 inflammasome2023

    • 著者名/発表者名
      Zhang Zhikuan、Shibata Takuma、Fujimura Akiko、Kitaura Jiro、Miyake Kensuke、Ohto Umeharu、Shimizu Toshiyuki
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 622 号: 7981 ページ: 188-194

    • DOI

      10.1038/s41586-023-06532-4

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K18211, KAKENHI-PROJECT-22K19424, KAKENHI-PROJECT-22K15046, KAKENHI-PLANNED-22H05184, KAKENHI-PROJECT-21H04800, KAKENHI-PROJECT-23K23820, KAKENHI-PROJECT-23K27637
  • [雑誌論文] TLR7/8 stress response drives histiocytosis in SLC29A3 disorders2023

    • 著者名/発表者名
      Shibata Takuma、Sato Ryota、Taoka Masato、Saitoh Shin-Ichiroh、Komine Mayumi、(他16人)、Ohto Umeharu、Shimizu Toshiyuki、Ozawa Manabu、Yoshida Nobuaki、Isobe Toshiaki、Latz Eicke、Mukai Kojiro、Taguchi Tomohiko、Hemmi Hiroaki、Akira Shizuo、Miyake Kensuke
    • 雑誌名

      Journal of Experimental Medicine

      巻: 220 号: 9 ページ: 320230054-320230054

    • DOI

      10.1084/jem.20230054

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K18211, KAKENHI-PROJECT-21K06956, KAKENHI-PROJECT-22K19424, KAKENHI-PROJECT-20H03162, KAKENHI-PLANNED-22H05184, KAKENHI-PROJECT-22H04922, KAKENHI-PROJECT-21H04800, KAKENHI-PROJECT-23H00366, KAKENHI-PROJECT-23K23820, KAKENHI-PROJECT-23K27084, KAKENHI-PROJECT-23K27637
  • [雑誌論文] A novel Toll-like receptor 7/8-specific antagonist E6742 ameliorates clinically relevant disease parameters in murine models of lupus2023

    • 著者名/発表者名
      Ishizaka Sally T.、Hawkins Lynn、Chen Qian、Tago Fumitoshi、Yagi Takuya、Sakaniwa Kentaro、Zhang Zhikuan、Shimizu Toshiyuki、Shirato Manabu
    • 雑誌名

      European Journal of Pharmacology

      巻: 957 ページ: 175962-175962

    • DOI

      10.1016/j.ejphar.2023.175962

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K15046, KAKENHI-PROJECT-23H00366
  • [雑誌論文] Role of the orphan transporter SLC35E1 in the nuclear egress of herpes simplex virus 12022

    • 著者名/発表者名
      Fumio Maeda, Akihisa Kato, Kosuke Takeshima, Misato Shibazaki, Ryota Sato, Takuma Shibata, Kensuke Miyake, Hiroko Kozuka-Hata, Masaaki Oyama, Eigo Shimizu, Seiya Imoto, Satoru Miyano, Shungo Adachi, Tohru Natsume, Koh Takeuchi, Yuhei Maruzuru, Naoto Koyanagi, Jun Arii, Yasushi Kawaguchi
    • 雑誌名

      Journal of Virology

      巻: - 号: 10 ページ: 10-10

    • DOI

      10.1128/jvi.00306-22

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K22524, KAKENHI-PROJECT-20K07511, KAKENHI-PROJECT-21K19370, KAKENHI-PROJECT-21K19498, KAKENHI-PROJECT-22K15468, KAKENHI-PLANNED-21H05280, KAKENHI-PLANNED-22H05184, KAKENHI-PUBLICLY-22H05584, KAKENHI-PROJECT-21H04800, KAKENHI-PROJECT-20H03496, KAKENHI-PROJECT-21K15464, KAKENHI-PROJECT-20H05692, KAKENHI-PROJECT-20H03492, KAKENHI-PUBLICLY-21H00338, KAKENHI-PUBLICLY-21H00417, KAKENHI-WRAPUP-22H04899, KAKENHI-PROJECT-20H03378
  • [雑誌論文] Cryo-EM structures of Toll-like receptors in complex with UNC93B12021

    • 著者名/発表者名
      Ishida Hanako、Asami Jinta、Zhang Zhikuan、Nishizawa Tomohiro、Shigematsu Hideki、Ohto Umeharu、Shimizu Toshiyuki
    • 雑誌名

      Nature Structural & Molecular Biology

      巻: 28 号: 2 ページ: 173-180

    • DOI

      10.1038/s41594-020-00542-w

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15730, KAKENHI-PROJECT-20K16274, KAKENHI-PUBLICLY-19H04950, KAKENHI-PROJECT-19H03164, KAKENHI-PROJECT-18K06172, KAKENHI-PROJECT-19H00976
  • [雑誌論文] Improving particle quality in cryo-EM analysis using a PEGylation method2021

    • 著者名/発表者名
      Zhang Zhikuan、Shigematsu Hideki、Shimizu Toshiyuki、Ohto Umeharu
    • 雑誌名

      Structure

      巻: 29 号: 10 ページ: 1192-1199.e4

    • DOI

      10.1016/j.str.2021.05.004

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15730, KAKENHI-PROJECT-19H03164, KAKENHI-PROJECT-21K19207, KAKENHI-PROJECT-21K19328
  • [雑誌論文] Tetrasubstituted imidazoles as incognito Toll-like receptor 8 a(nta)gonists2021

    • 著者名/発表者名
      Yang Yi、Csakai Adam、Jiang Shuangshuang、Smith Christina、Tanji Hiromi、Huang Jian、Jones Torey、Sakaniwa Kentaro、Broadwell Lindsey、Shi Chengrui、Soti Subada、Ohto Umeharu、Fang Yaohui、Shen Shu、Deng Fei、Shimizu Toshiyuki、Yin Hang
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 12 号: 1 ページ: 4351-4351

    • DOI

      10.1038/s41467-021-24536-4

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H00976, KAKENHI-PROJECT-19H03164, KAKENHI-PROJECT-19J21830, KAKENHI-PROJECT-21K19207
  • [雑誌論文] Structural and functional understanding of the toll‐like receptors2021

    • 著者名/発表者名
      Asami Jinta、Shimizu Toshiyuki
    • 雑誌名

      Protein Science

      巻: 30 号: 4 ページ: 761-772

    • DOI

      10.1002/pro.4043

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H00976
  • [雑誌論文] Structural analysis reveals TLR7 dynamics underlying antagonism2020

    • 著者名/発表者名
      Tojo Shingo、Zhang Zhikuan、Matsui Hiroyuki、Tahara Masahiro、Ikeguchi Mitsunori、Kochi Mami、Kamada Mami、Shigematsu Hideki、Tsutsumi Akihisa、Adachi Naruhiko、Shibata Takuma、Yamamoto Masaki、Kikkawa Masahide、Senda Toshiya、Isobe Yoshiaki、Ohto Umeharu、Shimizu Toshiyuki
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 11 号: 1 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1038/s41467-020-19025-z

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15730, KAKENHI-PUBLICLY-19H04950, KAKENHI-PROJECT-19H00976, KAKENHI-PROJECT-19H03164, KAKENHI-PROJECT-19H03197, KAKENHI-PROJECT-18K06172, KAKENHI-PROJECT-19H03451
  • [雑誌論文] Discovery of Novel Small Molecule Dual Inhibitors Targeting Toll-like Receptor 7 and 82019

    • 著者名/発表者名
      Padilla-Salinas, R., Anderson, R., Sakaniwa, K., Zhang, S., Nordeen, P., Lu, C., Shimizu, T., Yin, H.
    • 雑誌名

      J.Med.Chem.

      巻: 62 号: 22 ページ: 10221-20244

    • DOI

      10.1021/acs.jmedchem.9b01201

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H00976, KAKENHI-PROJECT-19J21830
  • [雑誌論文] Structural Insights into the Regulation Mechanism of Small GTPases by GEFs.2019

    • 著者名/発表者名
      Toma-Fukai S, Shimizu T
    • 雑誌名

      Molecules

      巻: 24 号: 18 ページ: 3308-3308

    • DOI

      10.3390/molecules24183308

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H00976
  • [雑誌論文] Mechanisms controlling nucleic acid-sensing Toll-like receptors2018

    • 著者名/発表者名
      Miyake Kensuke、Shibata Takuma、Ohto Umeharu、Shimizu Toshiyuki、Saitoh Shin-Ichiroh、Fukui Ryutaro、Murakami Yusuke
    • 雑誌名

      International Immunology

      巻: 30 号: 2 ページ: 43-51

    • DOI

      10.1093/intimm/dxy016

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26293083, KAKENHI-PUBLICLY-17H05991, KAKENHI-PROJECT-16K15253, KAKENHI-PUBLICLY-18H04666, KAKENHI-PUBLICLY-18H04856, KAKENHI-PROJECT-16H06388, KAKENHI-PROJECT-16H02494, KAKENHI-PROJECT-17K19548, KAKENHI-PROJECT-16K08827
  • [雑誌論文] Structural basis for species-specific activation of mouse Toll-like receptor 92018

    • 著者名/発表者名
      Ishida Hanako、Ohto Umeharu、Shibata Takuma、Miyake Kensuke、Shimizu Toshiyuki
    • 雑誌名

      FEBS Letters

      巻: 592 号: 15 ページ: 2636-2646

    • DOI

      10.1002/1873-3468.13176

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-17H05991, KAKENHI-PUBLICLY-18H04669, KAKENHI-PROJECT-16H02494, KAKENHI-PROJECT-16H06276, KAKENHI-PROJECT-16K08827
  • [雑誌論文] Toll-like Receptor 9 Contains Two DNA Binding Sites that Function Cooperatively to Promote Receptor Dimerization and Activation2018

    • 著者名/発表者名
      Ohto Umeharu、Ishida Hanako、Shibata Takuma、Sato Ryota、Miyake Kensuke、Shimizu Toshiyuki
    • 雑誌名

      Immunity

      巻: 48 号: 4 ページ: 649-658

    • DOI

      10.1016/j.immuni.2018.03.013

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-17H05991, KAKENHI-PUBLICLY-18H04669, KAKENHI-PROJECT-16H02494, KAKENHI-PROJECT-16H06276, KAKENHI-PROJECT-16K08827
  • [雑誌論文] Small-Molecule TLR8 Antagonists via Structure-Based Rational Design2018

    • 著者名/発表者名
      Hu Zhenyi、Tanji Hiromi、Jiang Shuangshuang、Zhang Shuting、Koo Kyoin、Chan Jean、Sakaniwa Kentaro、Ohto Umeharu、Candia Albert、Shimizu Toshiyuki、Yin Hang
    • 雑誌名

      Cell Chemical Biology

      巻: 25 号: 10 ページ: 1286-1291

    • DOI

      10.1016/j.chembiol.2018.07.004

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-17H05991, KAKENHI-PUBLICLY-18H04669, KAKENHI-PROJECT-16H02494
  • [雑誌論文] Structural Analyses of Toll-like Receptor 7 Reveal Detailed RNA Sequence Specificity and Recognition Mechanism of Agonistic Ligands2018

    • 著者名/発表者名
      Zhang Zhikuan、Ohto Umeharu、Shibata Takuma、Taoka Masato、Yamauchi Yoshio、Sato Ryota、Shukla Nikunj M.、David Sunil A.、Isobe Toshiaki、Miyake Kensuke、Shimizu Toshiyuki
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 25 号: 12 ページ: 3371-3381

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2018.11.081

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-17H05991, KAKENHI-PUBLICLY-18H04669, KAKENHI-PROJECT-16H02494, KAKENHI-PROJECT-18J14570, KAKENHI-PROJECT-16H06276, KAKENHI-PROJECT-16K08827
  • [雑誌論文] Small-molecule inhibition of TLR8 through stabilization of its resting state2018

    • 著者名/発表者名
      Zhang, S., Hu, Z., Tanji, H., Jiang, S., Das, N, Li, J., Sakaniwa, K., Jin, J., Bian, Y., Ohto, U., Shimizu, T., Yin, H.
    • 雑誌名

      Nature Chem. Biol.

      巻: 14 号: 1 ページ: 58-64

    • DOI

      10.1038/nchembio.2518

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-17H05991, KAKENHI-PROJECT-16H02494, KAKENHI-PROJECT-15J12485
  • [雑誌論文] Towards a structural understanding of nucleic acid-sensing Toll-like receptors in the innate immune system2017

    • 著者名/発表者名
      Zhang Z, Ohto U, Shimizu T
    • 雑誌名

      FEBS letters

      巻: 591 ページ: 3167-3181

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02494
  • [雑誌論文] Emerging roles of the processing of nucleic acids and Toll-like receptors in innate immune responses to nucleic acids2017

    • 著者名/発表者名
      Miyake K, Shibata T, Ohto U, Shimizu T
    • 雑誌名

      J Leukoc Biol

      巻: 101 号: 1 ページ: 135-142

    • DOI

      10.1189/jlb.4mr0316-108r

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H06388, KAKENHI-PROJECT-26711002, KAKENHI-PROJECT-15K14471, KAKENHI-PROJECT-16H02494, KAKENHI-PROJECT-16K08827
  • [雑誌論文] The crystal structure of the AhRR-ARNT heterodimer reveals the structural basis of the repression of AhR-mediated transcription2017

    • 著者名/発表者名
      Sakurai, S., Shimizu, T., & *Ohto, U.
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 292 号: 43 ページ: 17609-17616

    • DOI

      10.1074/jbc.m117.812974

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-17H05991, KAKENHI-PROJECT-16H02494, KAKENHI-PROJECT-17J10586
  • [雑誌論文] Structural insights into ligand recognition and regulation of nucleic acid-sensing Toll-like receptors2017

    • 著者名/発表者名
      Shimizu T
    • 雑誌名

      Curr. Opi. Struc. Biol.

      巻: 47 ページ: 52-59

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2017.05.010

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02494
  • [雑誌論文] Identification of a Human Toll-Like Receptor (TLR) 8-Specific Agonist and a Functional Pan-TLR Inhibitor in 2-Aminoimidazoles.2016

    • 著者名/発表者名
      Beesu, M., Caruso, G., Salyer, A. C., Shukla, N. M., Khetani, K. K., Smith, L. J., Fox, L. M., Tanji, H., Ohto, U., Shimizu, T., & David, S. A.
    • 雑誌名

      J. Med. Chem.

      巻: 59 号: 7 ページ: 3311-3330

    • DOI

      10.1021/acs.jmedchem.6b00023

    • 査読あり / 謝辞記載あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K14471, KAKENHI-PROJECT-26711002, KAKENHI-PROJECT-16H02494
  • [雑誌論文] Novel helical assembly in arginine methyltransferase 82016

    • 著者名/発表者名
      Toma-Fukai S, Kim JD, Park KE, Kuwabara N, Shimizu N, Krayukhina E, Uchiyama S, Fukamizu A, Shimizu T
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology

      巻: 428 号: 6 ページ: 1197-1208

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2016.02.007

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K14707, KAKENHI-ORGANIZER-23116001, KAKENHI-PLANNED-23116004, KAKENHI-PLANNED-23116007, KAKENHI-PROJECT-25252062, KAKENHI-PROJECT-26840029, KAKENHI-WRAPUP-16H01688
  • [雑誌論文] Autoinhibition and relief mechanism by the proteolytic processing of Toll-like receptor 8.2016

    • 著者名/発表者名
      Tanji, H., Ohto, U., Motoi, Y., Shibata, T., Miyake, K., & Shimizu, T.
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. U S A

      巻: 113 号: 11 ページ: 3012-3017

    • DOI

      10.1073/pnas.1516000113

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K14471, KAKENHI-PROJECT-26711002, KAKENHI-PROJECT-16H06388, KAKENHI-PROJECT-16H02494, KAKENHI-PROJECT-15J12485, KAKENHI-PROJECT-16K08827
  • [雑誌論文] Guanosine and its modified derivatives are endogenous ligands for TLR72016

    • 著者名/発表者名
      Shibata T, Ohto U, Nomura S, Kibata K, Motoi Y, Zhang Y, Murakami Y, Fukui R, Ishimoto T, Sano S, Ito T, Shimizu T, Miyake K.
    • 雑誌名

      Int Immunol

      巻: - 号: 5 ページ: 211-222

    • DOI

      10.1093/intimm/dxv062

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K15148, KAKENHI-PROJECT-16H06388, KAKENHI-PROJECT-16H02494, KAKENHI-PROJECT-16H02629, KAKENHI-PROJECT-16K08827
  • [雑誌論文] Crystal structure of NOD2 and its implications in human disease.2016

    • 著者名/発表者名
      Maekawa S, Ohto U, Shibata T, Miyake K, Shimizu T
    • 雑誌名

      Nat Commun

      巻: 7 号: 1 ページ: 11813-11813

    • DOI

      10.1038/ncomms11813

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H06388, KAKENHI-PROJECT-16H02494, KAKENHI-PROJECT-26711002, KAKENHI-PROJECT-15K14471
  • [雑誌論文] Structural Analysis Reveals that Toll-like Receptor 7 Is a Dual Receptor for Guanosine and Single-Stranded RNA2016

    • 著者名/発表者名
      Zhang Z, Ohto U, Shibata T, Krayukhina E, Taoka M, Yamauchi Y, Tanji H, Isobe T, Uchiyama S, Miyake K, Shimizu T
    • 雑誌名

      Immunity

      巻: 45 号: 4 ページ: 737-748

    • DOI

      10.1016/j.immuni.2016.09.011

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H06388, KAKENHI-PROJECT-16H02494, KAKENHI-PROJECT-15J12485, KAKENHI-PROJECT-26711002, KAKENHI-PROJECT-15K14471, KAKENHI-PROJECT-16K08827
  • [雑誌論文] Structure-based Design of Human TLR8-specific Agonists with Augmented Potency and Adjuvanticity.2015

    • 著者名/発表者名
      Beesu, M., Caruso, G., Salyer, A., Khetani, K., Sil, D., Weerasinghe, M., Tanji, H., Ohto, U., Shimizu, T., & David, S. A.
    • 雑誌名

      J. Med. Chem.

      巻: 58 号: 19 ページ: 7833-7849

    • DOI

      10.1021/acs.jmedchem.5b01087

    • 査読あり / 謝辞記載あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K14471, KAKENHI-PROJECT-15J12485, KAKENHI-PROJECT-25291010, KAKENHI-PROJECT-26711002
  • [雑誌論文] DNase II-dependent DNA digestion is required for DNA sensing by TLR92015

    • 著者名/発表者名
      Chan MP, Onji M, Fukui R, Kawane K, Shibata T, Saitoh SI, Ohto U, Shimizu T, Barber GN, *Miyake K
    • 雑誌名

      Nat Commun

      巻: 6 号: 1 ページ: 5853-5853

    • DOI

      10.1038/ncomms6853

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25253032, KAKENHI-PROJECT-25460585, KAKENHI-PROJECT-25670189, KAKENHI-PROJECT-26293083, KAKENHI-PROJECT-26670235, KAKENHI-PROJECT-26713011, KAKENHI-PROJECT-25291010
  • [雑誌論文] Structure of human Roquin-2 and its complex with constitutive-decay element RNA.2015

    • 著者名/発表者名
      Sakurai, S., Ohto, U., & Shimizu, T.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr. Sect. F

      巻: 71 号: 8 ページ: 1048-1054

    • DOI

      10.1107/s2053230x15011887

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K14471, KAKENHI-PLANNED-23116007, KAKENHI-PROJECT-26711002
  • [雑誌論文] Toll-like receptor 8 senses degradation products of single-stranded RNA.2015

    • 著者名/発表者名
      Tanji H, Ohto U, Shibata T, Taoka M, Yamauchi Y, Isobe T, Miyake K,
    • 雑誌名

      Nat Struct Mol Biol.

      巻: 22 号: 2 ページ: 109-115

    • DOI

      10.1038/nsmb.2943

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-25115504, KAKENHI-PUBLICLY-25121709, KAKENHI-PROJECT-25291010, KAKENHI-PROJECT-25650029, KAKENHI-PROJECT-26670235, KAKENHI-PROJECT-26711002, KAKENHI-PROJECT-25253032, KAKENHI-PROJECT-15J12485
  • [雑誌論文] Structural basis of CpG and inhibitory DNA recognition by Toll-like receptor 9.2015

    • 著者名/発表者名
      Ohto, U., Shibata, T., Tanji, H., Krayukhina, E., Uchiyama, S., Miyake, K., and Shimizu, T.
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 520 号: 7549 ページ: 702-705

    • DOI

      10.1038/nature14138

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-25121722, KAKENHI-PUBLICLY-26102530, KAKENHI-PROJECT-25253032, KAKENHI-PROJECT-25291010
  • [雑誌論文] Targeting cell surface TLR7 for therapeutic intervention in autoimmune diseases2015

    • 著者名/発表者名
      Kanno A, Tanimura N, Ishizaki M, Ohko K, Motoi Y, Onji M, Fukui R, Shimozato T, Yamamoto K, Shibata T, Sano S, Sugahara-Tobinai A, Takai T, Ohto U, Shimizu T, Saitoh S, Miyake K.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 6 号: 1 ページ: 6119-6119

    • DOI

      10.1038/ncomms7119

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-13J40043, KAKENHI-PROJECT-25253032, KAKENHI-PROJECT-25460585, KAKENHI-PROJECT-25670189, KAKENHI-PROJECT-26293083, KAKENHI-PROJECT-26670235, KAKENHI-PROJECT-26461597, KAKENHI-PROJECT-25291010
  • [雑誌論文] Structure and function of toll-like receptor 8.2014

    • 著者名/発表者名
      Ohto, U., Tanji, H., & Shimizu, T.
    • 雑誌名

      Microbes Infect.

      巻: 16 号: 4 ページ: 273-282

    • DOI

      10.1016/j.micinf.2014.01.007

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-25115504, KAKENHI-PUBLICLY-25121709, KAKENHI-PROJECT-25291010, KAKENHI-PROJECT-25650029
  • [雑誌論文] Determinants of activity at human Toll-like receptors 7 and 8: quantitative structure-activity2014

    • 著者名/発表者名
      Yoo E, Salunke DB, Sil D, Guo X, Salyer AC, Hermanson AR, Kumar M,
    • 雑誌名

      J Med Chem.

      巻: 57 号: 19 ページ: 7955-7970

    • DOI

      10.1021/jm500744f

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-25115504, KAKENHI-PUBLICLY-25121709, KAKENHI-PROJECT-25291010, KAKENHI-PROJECT-25650029, KAKENHI-PROJECT-26711002
  • [雑誌論文] Characterisation of an intrinsically disordered protein complex of Swi5-Sfr1 by ion mobility mass spectrometry and small-angle X-ray scattering2013

    • 著者名/発表者名
      Saikusa K, Kuwabara N, Kokabu Y, Inoue Y, Sato M, Iwasaki H, Shimizu T, Ikeguchi M, Akashi S
    • 雑誌名

      Analyst

      巻: 138 ページ: 1441-1449

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22370045
  • [雑誌論文] Mechanistic insights into the activation of Rad51-mediated strand exchange from the structure of a recombination activator, the Swi5-Sfr1 complex2013

    • 著者名/発表者名
      N.Kuwabara, Y.Murayama, H.Hashimoto, Y.Kokabu, M.Ikeguchi, M.Sato, K.Mayanagi, Y.Tsutsui, H.Iwasaki,and T.Shimizu
    • 雑誌名

      Structure

      巻: 20 号: 3 ページ: 440-449

    • DOI

      10.1016/j.str.2012.01.005

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-21113002, KAKENHI-PROJECT-21370048, KAKENHI-PROJECT-21570114, KAKENHI-PROJECT-22370045, KAKENHI-PROJECT-22770109, KAKENHI-PUBLICLY-23118713, KAKENHI-PUBLICLY-23121524, KAKENHI-PROJECT-23770105, KAKENHI-PROJECT-24247033, KAKENHI-PROJECT-24657076, KAKENHI-PLANNED-22125003, KAKENHI-PUBLICLY-24114506
  • [雑誌論文] Characterisation of an intrinsically disordered protein complex of Swi5-Sfr1 by ion mobility mass spectrometry and small-angle X-ray scattering2013

    • 著者名/発表者名
      Saikusa K, Kuwabara N, Kokabu Y, Inoue Y, Sato M, Iwasaki H, Shimizu T, Ikeguchi M, Akashi S
    • 雑誌名

      Analys

      巻: 138 号: 5 ページ: 1441-14499

    • DOI

      10.1039/c2an35878f

    • NAID

      120006557136

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20227009, KAKENHI-PLANNED-21113002, KAKENHI-PLANNED-21113003, KAKENHI-PLANNED-22125003, KAKENHI-PROJECT-22570120, KAKENHI-PLANNED-23116007, KAKENHI-PROJECT-23770105, KAKENHI-PROJECT-24247033
  • [雑誌論文] Structural basis for vitamin D receptor agonism by novel non-secosteroidal ligands2013

    • 著者名/発表者名
      Lisa Asano, Ichiaki Ito, Naoyuki Kuwabara, Tsuyoshi Waku, Junn Yanagisawa, Hiroyuki Miyachi, Toshiyuki Shimizu
    • 雑誌名

      FEBS lettters

      巻: 587 号: 7 ページ: 957-963

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2013.02.028

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-10J00300, KAKENHI-PROJECT-12J00646, KAKENHI-PLANNED-23116007, KAKENHI-PROJECT-23770105
  • [雑誌論文] Peroxisome proliferator-activated receptors (PPARs) have multiple binding points2012

    • 著者名/発表者名
      Kuwabara N, Oyama T, Tomioka D, Ohashi M, Yanagisawa J, Shimizu T, Miyachi H.
    • 雑誌名

      J. Med.Chem.

      巻: 55 号: 2 ページ: 893-902

    • DOI

      10.1021/jm2014293

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23590128, KAKENHI-PROJECT-23770105, KAKENHI-PLANNED-23116007
  • [雑誌論文] Crystal Structure of Human β-Galactosidase: The Structural Basis of GM1 Gangliosidosis and Morquio B Diseases2012

    • 著者名/発表者名
      Ohto U, Usui K, , Ochi T, ,Yuki K, Satow Y andShimizu T
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem

      巻: 287 ページ: 1801-1812

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22370045
  • [雑誌論文] Mechanistic insights into the activation of rad51-mediated strand exchange from the structure of a recombination activator, the swi5-sfr1 complex2012

    • 著者名/発表者名
      Kuwabara N, Murayama Y, Hashimoto H, Kokabu Y, Ikeguchi M, Sato M, Mayanagi K, Tsutsui Y, Iwasaki H, Shimizu T
    • 雑誌名

      Structure

      巻: 20 ページ: 440-449

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22370045
  • [雑誌論文] The fission yeast Swi5-Sfr1 complex, an activator of Rad51 recombinase, forms an extremely elongated Dogleg-shaped structure2011

    • 著者名/発表者名
      Kokabu Y, Murayama Y, Kuwabara N, Oroguchi T, Hashimoto H, Tsutsui Y, Nozaki N, Akashi S, Unzai S, Shimizu T, Iwasaki H, Sato M, Ikeguchi M
    • 雑誌名

      J Biol Chem

      巻: 286 ページ: 43569-76

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22370045
  • [雑誌論文] Crystal Structures of Mouse and Human RP105/MD-1 Complexes Reveal Unique Dimer Organization of the Toll-Like Receptor Family2011

    • 著者名/発表者名
      Ohto U, Miyake K, Shimizu T
    • 雑誌名

      J Mol Biol

      巻: 413 ページ: 815-825

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22370045
  • [雑誌論文] Fission yeast Swi5-Sfr1 protein complex, an activator of Rad51 recombinase, forms an extremely elongated dogleg-shaped structure2011

    • 著者名/発表者名
      Kokabu Y, Murayama Y, Kuwabara N, Oroguchi T, Hashimoto H, Tsutsui Y, Nozaki N, Akashi S, Unzai S, Shimizu T, Iwasaki H, Sato M, Ikeguchi M
    • 雑誌名

      J Biol Chem

      巻: 286 号: 50 ページ: 43569-43576

    • DOI

      10.1074/jbc.m111.303339

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20227009, KAKENHI-PLANNED-21113002, KAKENHI-PLANNED-21113003, KAKENHI-PROJECT-21370048, KAKENHI-PROJECT-22370045, KAKENHI-PROJECT-22570120, KAKENHI-PROJECT-22770109, KAKENHI-PLANNED-23116007, KAKENHI-PUBLICLY-23118713, KAKENHI-PUBLICLY-23121524, KAKENHI-PROJECT-23570145, KAKENHI-PROJECT-23770105
  • [雑誌論文] The structure of the N-terminal regulatory domain of a plant NADPH oxidase and its functional implications2010

    • 著者名/発表者名
      Kuwabara, N., Hashimoto, H., Yamada, N., Unzai, S., Ikeguchi, M., Sato, M., Murayama, Y., Iwasaki, H. and Shimizu, T.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr

      巻: F66 ページ: 1124-1126

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22370045
  • [雑誌論文] Expression, Purification and crystallization of Swi5 and the Swi5-Sfr1 complex from fission yeast2010

    • 著者名/発表者名
      Kokabu Y, Murayama Y, Kuwabara N, Oroguchi T, Hashimoto H, Tsutsui Y, Nozaki N, Akashi S, Unzai S, Shimizu T, Iwasaki H, Sato M, Ikeguchi M
    • 雑誌名

      J Biol Chem

      巻: 286 ページ: 43569-76

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22370045
  • [雑誌論文] 創薬を指向した関節リウマチ関連遺伝子PAD4の構造科学研究2007

    • 著者名/発表者名
      清水
    • 雑誌名

      Pharma VISION NEWS 9

      ページ: 21-23

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055027
  • [雑誌論文] X線結晶構造解析?タンパク質の結晶構造解析?2007

    • 著者名/発表者名
      清水
    • 雑誌名

      実験医学(生命科学のための機器分析実験ハンドブック)

      ページ: 198-202

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055027
  • [雑誌論文] Parallel coiled-coil association of the RhoA-binding domain in Rho-kinase2003

    • 著者名/発表者名
      Shimizu, T., et. al.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem 278

      ページ: 46046-46051

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15570101
  • [雑誌論文] Parallel coiled-coil association of the RhoA-binding domain in Rho-kinase2003

    • 著者名/発表者名
      Shimizu, et. al.
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem 278

      ページ: 46046-46051

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15570101
  • [雑誌論文]

    • 著者名/発表者名
      Oda, T., Hashimoto, H., Kuwabara, N., Akashi, S., Hayashi, K., Kojima, C., Wong, H.L., Kawasaki, T., Shimamoto, K., Sato, M., and Shimizu, T
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem

      巻: 285 ページ: 1435-1445

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22370045
  • [産業財産権] カルシニューリンサブユニットB様蛋白質の結晶その製造方法、探索方法2003

    • 発明者名
      清水 敏之
    • 権利者名
      横浜市
    • 産業財産権番号
      2003-305216
    • 出願年月日
      2003-09-01
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15570101
  • [学会発表] 病原体感染を感知するToll様受容体の構造基盤2018

    • 著者名/発表者名
      清水敏之
    • 学会等名
      日本薬学会 第138年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02494
  • [学会発表] 構造解析から見えた自然免疫における一本鎖核酸認識 Toll様受容体の共通性およびその創薬への展開2018

    • 著者名/発表者名
      清水敏之
    • 学会等名
      ゲノム創薬・医療フォーラム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02494
  • [学会発表] Structural study of ssRNA sensing TLRs in innate immune system2017

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Shimizu
    • 学会等名
      24th Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02494
  • [学会発表] Structural basis of CpG and inhibitory DNA recognition by Toll-like receptor 92016

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Shimizu
    • 学会等名
      12th Annual Meeting of the Oligonucleotide Therapeutics Society
    • 発表場所
      Centre Mont-Royal (Montreal, Canada)
    • 年月日
      2016-09-25
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02494
  • [学会発表] Structural study of TLRs sensing single stranded RNA in innate immune system2016

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Shimizu
    • 学会等名
      Naito Conference
    • 発表場所
      Chateraise Gateaux Kingdom Sapporo(北海道、札幌市)
    • 年月日
      2016-10-04
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02494
  • [学会発表] hPRMT8の結晶-溶液構造相関解析をもとにした機能解明2015

    • 著者名/発表者名
      藤間祥子、Kim, JD.、Park, KE.、清水伸隆、桑原直之、Krayukhina, E.、内山進、深水昭吉、清水敏之
    • 学会等名
      日本結晶学会年会
    • 発表場所
      大阪府堺市 大阪府立大学中百舌鳥キャンパス、103講義室
    • 年月日
      2015-10-18
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-23116001
  • [学会発表] Structural studies of single-stranded RNA receptor TLR82015

    • 著者名/発表者名
      Hiromi Tanji, Umeharu Ohto, Takuma Shibata, Kensuke Miyake, Toshiyuki Shimizu
    • 学会等名
      Toll meeting 2015
    • 発表場所
      Palacio de Congresos de Mabella(SPAIN)
    • 年月日
      2015-10-02
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25291010
  • [学会発表] 自然免疫系一本鎖RNA受容体TLR8の構造基盤2015

    • 著者名/発表者名
      丹治裕美、大戸梅治、柴田琢磨、田岡万悟、山内芳雄、礒邉俊明、三宅健介、清水敏之
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島県徳島市)
    • 年月日
      2015-06-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25291010
  • [学会発表] Toll 様受容体 8(TLR8)の構造科学的研究2013

    • 著者名/発表者名
      清水敏之
    • 学会等名
      日本生化学大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25291010
  • [学会発表] 創薬を指向した構造生物学の最前線 (オーガナイザー)2013

    • 著者名/発表者名
      清水敏之
    • 学会等名
      日本薬学会第133年会シンポジウム
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2013-03-28
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-23116001
  • [学会発表] Structural basis for vitamin D receptor antagonistic mechanism by 1α, 25-dihydroxyvitamin D3-26, 23-lactams (DLAMs)2013

    • 著者名/発表者名
      浅野理沙、伊藤一明、和久剛、長澤和夫、柳澤純、清水敏之
    • 学会等名
      ICSG2013-SLS
    • 発表場所
      北海道 京王プラザホテル
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-23116001
  • [学会発表] Structural basis for vitamin D receptor antagonistic mechanism by 1α, 25-dihydroxyvitamin D3-26, 23-lactams (DLAMs)2013

    • 著者名/発表者名
      Asano L, Ito I, Waku T, Nagasawa K, Yanagisawa J, Shimizu T
    • 学会等名
      ICSG2013-SLS
    • 発表場所
      札幌(北海道)
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-23116007
  • [学会発表] Structural study of recombination activator, Swi5-Sfr1 complex2012

    • 著者名/発表者名
      Shimizu T
    • 学会等名
      New frontier of the research in RecAfamily recombinases and their accessory proteins (RecA family 2012)
    • 発表場所
      Kyoto Royal Hotel & Spa, Kyoto, Japan
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22370045
  • [学会発表] Structural basis for vitamin D receptor agonism by novel nonsecosteroidal ligands2012

    • 著者名/発表者名
      Lisa Asano, Ichiaki Ito, Naoyuki Kuwabara, Junn Yanagisawa, Hiroyuki Miyachi, Toshiyuki Shimizu
    • 学会等名
      AsCA 12
    • 発表場所
      オーストラリア アデレード
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770105
  • [学会発表] New frontier of the research in RecAfamily recombinases and their accessory proteins (RecA family 2012)2012

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Shimizu
    • 学会等名
      Structural study of recombination activator, Swi5-Sfr1 complex
    • 発表場所
      Kyoto Royal Hotel & Spa, Kyoto, Japan
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22370045
  • [学会発表] 自然免疫系受容体TLR4とその関連タンパク質の構造生物学的研究2012

    • 著者名/発表者名
      Shimizu T
    • 学会等名
      第22回WSフォーラム
    • 発表場所
      九州大学
    • 年月日
      2012-11-17
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-23116007
  • [学会発表] Program for Young Researcher Symposium inEurope'SGC Oxford2012

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Shimizu
    • 学会等名
      Mechanistic insights into the activation of the Rad51-mediated strand exchange from the structure of recombination activator, Swi5-Sfr1 complex
    • 発表場所
      Oxford, UK
    • 年月日
      2012-06-08
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22370045
  • [学会発表] Mechanistic insights into the activation of the Rad51-mediated strand exchange from the structure of a recombination activator, the Swi5-Sfr1 complex2011

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Shimizu
    • 学会等名
      Symposium on Structure and Folding of Disease Related Proteins
    • 発表場所
      ソウル大学、韓国
    • 年月日
      2011-07-08
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23121508
  • [学会発表] Symposium on Structure and Folding of Disease Related Proteins2011

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Shimizu
    • 学会等名
      Mechanistic insights into the activation of the Rad51-mediated strand exchange from the structure of a recombination activator, the Swi5-Sfr1 complex
    • 発表場所
      Seoul National University, Korea
    • 年月日
      2011-07-08
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22370045
  • [学会発表] Structural analysis of Swi5-Sfr1 complex, mediators for homologous recombination2011

    • 著者名/発表者名
      Naoyuki Kuwabara, Hiroshi Hashimoto, Yuichi Kokabu, Mitsunori Ikeguchi, Mamoru Sato, Kouta Mayanagi, Yasuto Murayama, Hiroshi Iwasaki, Toshiyuki Shimizu
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      大阪府
    • 年月日
      2011-06-08
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770105
  • [学会発表] Mechanistic insights into the activation of the Rad51-mediated strand exchange from the structure of a recombination activator, the Swi5-Sfr1 comple2011

    • 著者名/発表者名
      Shimizu T
    • 学会等名
      Symposium on Structure and Folding of Disease Related Proteins
    • 発表場所
      Seoul National University, Korea(招待講演)
    • 年月日
      2011-07-08
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22370045
  • [学会発表] New frontier of the research in Rad51 recombinase and its accessory proteinsInstitut de Biologie Physico Chimique2011

    • 著者名/発表者名
      Toshiyuki Shimizu
    • 学会等名
      Crystal structure of recombination activator, Swi5-Sfr1 complex, from fission yeast
    • 発表場所
      France
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22370045
  • [学会発表] Strucutual analysis of Swi5-Sfr1 complex, mediators for homologous recombination.2011

    • 著者名/発表者名
      N. Kuwabara, H. Hashimoto, Y. Kokabu, M. Ikeguchi, M. Sato, K. Mayanagi, Y. Murayama, H. Iwasaki, T. Shimizu
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科 学会年会
    • 発表場所
      大阪
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770105
  • [学会発表] 代謝とクロストークする転写環境形成因子の構造科学的な解明2011

    • 著者名/発表者名
      清水敏之
    • 学会等名
      Wakoつくばフォーラム
    • 発表場所
      筑波和光ホール(招待講演)
    • 年月日
      2011-11-29
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-23116007
  • [学会発表] 細胞質から核内へのタンパク質輸送機構-核内輸送受容体(トランスポーチン)の構造生物学-2010

    • 著者名/発表者名
      清水敏之
    • 学会等名
      九州大学研究拠点形成プロジェクトP&P
    • 発表場所
      九州大学
    • 年月日
      2010-01-28
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21117513
  • [学会発表] 関節リウマチ関連タンパク質PAD4の構造科学的研究2010

    • 著者名/発表者名
      清水敏之
    • 学会等名
      構造生物社会連携シンポジウム
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2010-11-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22370045
  • [学会発表] Structural Studies of Chromatin-related Proteins PAD4 and NML Recognizing Intrinsically Disordered Region2009

    • 著者名/発表者名
      Shimizu T
    • 学会等名
      Yokohama NMR workshop
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      2009-11-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052023
  • [学会発表] Structural Studies of Chromatin-related Proteins PAD4 and NML Recognizing Intrinsically Disordered Region2009

    • 著者名/発表者名
      Shimizu T
    • 学会等名
      Yokohama NMR workshop
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      2009-11-12
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21117513
  • [学会発表] Structural study of rheumatoid arthritis related protein, PAD42008

    • 著者名/発表者名
      Shimizu
    • 学会等名
      International Forum co-sponsored by YCU & FDA
    • 発表場所
      Yokohama
    • 年月日
      2008-01-30
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052023
  • [学会発表] シロイヌナズナ由来AtCBL2とAtCIPK14の複合体構造2007

    • 著者名/発表者名
      清水, et. al.
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      仙台国際センター
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055027
  • [学会発表] 線虫由来タンパク質アルギニンメチル基転移酵素7 の結晶構造解析

    • 著者名/発表者名
      長谷川森雄,藤間‐深井祥子,金俊達,深水昭吉,清水敏之
    • 学会等名
      日本結晶学会
    • 発表場所
      東京都文京区 東京大学
    • 年月日
      2014-11-01 – 2014-11-03
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-23116001
  • [学会発表] Mechanistic insights into the activation of the Rad51-mediated strand exchange from the structure of recombination activator, Swi5-Sfr1 complex

    • 著者名/発表者名
      Shimizu T
    • 学会等名
      Program for Young Researcher Symposium in Europe
    • 発表場所
      Oxford, UK
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22370045
  • [学会発表] Structural study of innate immune receptor, TLR

    • 著者名/発表者名
      Shimizu T
    • 学会等名
      FAOBMB Mini-Symposium 2013
    • 発表場所
      岩手医科大学(岩手県)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25291010
  • [学会発表] Structural study of TLR8 sensing single stranded RNA in innate immune system

    • 著者名/発表者名
      Shimizu T
    • 学会等名
      The 4th Asia Pacific Protein Association (APPA) Conference
    • 発表場所
      Jeju, Korea
    • 年月日
      2014-05-17 – 2014-05-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25291010
  • [学会発表] Structural study of TLR8 sensing single stranded RNA in innate immune system

    • 著者名/発表者名
      Shimizu T
    • 学会等名
      The Cold Spring Harbor Asia conference
    • 発表場所
      Suzhou Dushu Lake Conference Center, Suzhou, China
    • 年月日
      2014-10-27 – 2014-10-31
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25291010
  • 1.  箱嶋 敏雄 (00164773)
    共同の研究課題数: 7件
    共同の研究成果数: 0件
  • 2.  岡田 健吾 (60304169)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 3.  佐藤 衛 (60170784)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 3件
  • 4.  柴田 琢磨 (30554505)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 5.  藤間 祥子 (40363535)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 6.  仲島 由佳 (40399499)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 7.  桑原 直之 (70506253)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 8.  池口 満徳 (60261955)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 2件
  • 9.  岩崎 博史 (60232659)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 2件
  • 10.  橋本 博 (40336590)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 11.  深水 昭吉 (60199172)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 12.  五十嵐 和彦 (00250738)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 13.  中尾 光善 (00217663)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 14.  菅澤 薫 (70202124)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 15.  本橋 ほづみ (00282351)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 16.  矢作 直也 (60420246)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 17.  北野 健 (40346309)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 18.  三宅 健介 (60229812)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 5件
  • 19.  淺原 弘嗣 (70294460)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 20.  田岡 万悟 (60271160)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 21.  川崎 努 (90283936)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 22.  清水 元樹 (90734343)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 23.  東 常行
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 24.  佐々木 裕之
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 25.  米田 悦啓
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 26.  春日 雅人
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 27.  大戸 梅治
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 15件
  • 28.  斉藤 伸一郎
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 29.  宮地 弘幸
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 30.  張 志寛
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 4件
  • 31.  金 俊達
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 32.  明石 知子
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 33.  内山 進
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 34.  川口 寧
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

URL: 

この研究者とORCID iDの連携を行いますか?
※ この処理は、研究者本人だけが実行できます。

Are you sure that you want to link your ORCID iD to your KAKEN Researcher profile?
* This action can be performed only by the researcher himself/herself who is listed on the KAKEN Researcher’s page. Are you sure that this KAKEN Researcher’s page is your page?

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi