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竹田 一旗  Takeda Kazuki

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 30332290
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 京都大学, 理学研究科, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2024年度 – 2025年度: 京都大学, 理学研究科, 准教授
2017年度 – 2021年度: 京都大学, 理学研究科, 准教授
2014年度 – 2015年度: 京都大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授
2011年度 – 2013年度: 京都大学, 理学(系)研究科(研究院), 講師
2012年度: 京都大学, 大学院・理学研究科, 講師 … もっと見る
2008年度 – 2011年度: 京都大学, 理学研究科, 講師
2010年度: 京都大学, 大学院・理学研究科, 講師
2005年度: 独立行政法人理化学研究所, 物質・エネルギー代謝系蛋白質研究チーム, 連携研究員
2004年度: 独立行政法人理化学研究所, 三木生物超分子結晶学研究室, 協力研究員
2002年度: 理化学研究所, 播磨研究所, 協力研究員 隠す
審査区分/研究分野
研究代表者
構造生物化学 / 小区分37010:生体関連化学 / 理工系 / 生物分子科学
研究代表者以外
中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野 / 生物系 / 生物物理学
キーワード
研究代表者
タンパク質 / 結晶 / 電荷密度解析 / 超高速分光 / 光反応 / X線結晶構造解析 / 配向 / 内部結合水 / 水分子 / 生体高分子 … もっと見る / 中性子線解析 / エックス線 / 蛍光 / X線 / 界面活性剤 / 異常分散効果 / 金属 / 異常分散 / スペクトル / サブユニット / 呼吸鎖複合体I / 結晶構造 / NQO-5 / NADH-キノン酸化還元酵素 … もっと見る
研究代表者以外
接触バブル2重膜法 / 膜張力 / 膜物性 / イオンチャネル / 脂質2重膜 / 生合成 / リポタンパク質 / βバレル型タンパク質 / 細胞表層 / 膜局在化 / 分子シャペロン / ABCトランスポーター / 蛋白質輸送 / Secトランスロコン / Lolシステム / 外膜形成 / エンベロープストレス / リポ多糖 / Lol 因子 / βバレル型蛋白質 / リポ蛋白質 / 細胞質膜 / 外膜 / Xe / SPring-8 / K吸収端 / I / Cs / ニワトリ卵白リゾチーム / 多波長異常分散法 / 高エネルギーX線 隠す
  • 研究課題

    (10件)
  • 研究成果

    (34件)
  • 共同研究者

    (14人)
  •  緑色蛍光タンパク質におけるプロトン移動メカニズムの解明研究代表者

    • 研究代表者
      竹田 一旗
    • 研究期間 (年度)
      2025 – 2027
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分37010:生体関連化学
    • 研究機関
      京都大学
  •  電位依存性チャネルの膜電位負荷構造:膜電位負荷合成膜と単粒子構造解析法の開拓

    • 研究代表者
      老木 成稔
    • 研究期間 (年度)
      2024 – 2026
    • 研究種目
      挑戦的研究(開拓)
    • 審査区分
      中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
    • 研究機関
      福井大学
  •  タンパク質による水分子の配位状態制御研究代表者

    • 研究代表者
      竹田 一旗
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2021
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      理工系
    • 研究機関
      京都大学
  •  緑色蛍光タンパク質の超精密構造解析研究代表者

    • 研究代表者
      竹田 一旗
    • 研究期間 (年度)
      2017 – 2019
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      構造生物化学
    • 研究機関
      京都大学
  •  超高精度結晶構造解析によるプロトン輸送タンパク質の全水素原子位置決定研究代表者

    • 研究代表者
      竹田 一旗
    • 研究期間 (年度)
      2013 – 2015
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      構造生物化学
    • 研究機関
      京都大学
  •  金属含有タンパク質における原子別酸化還元状態決定法の開発研究代表者

    • 研究代表者
      竹田 一旗
    • 研究期間 (年度)
      2011 – 2012
    • 研究種目
      挑戦的萌芽研究
    • 研究分野
      構造生物化学
    • 研究機関
      京都大学
  •  結晶中における生体高分子ダイナミクスの精密計測研究代表者

    • 研究代表者
      竹田 一旗
    • 研究期間 (年度)
      2008 – 2010
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      生物分子科学
    • 研究機関
      京都大学
  •  大腸菌エンベロープ形成機構の解明

    • 研究代表者
      徳田 元
    • 研究期間 (年度)
      2007 – 2011
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      盛岡大学
      東京大学
  •  NADH-キノン酸化還元酵素(呼吸鎖複合体I)の構造プロテオミクス研究代表者

    • 研究代表者
      竹田 一旗
    • 研究期間 (年度)
      2004 – 2005
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      構造生物化学
    • 研究機関
      独立行政法人理化学研究所
  •  高エネルギーX線によるXe,Csを用いた多波長異常分散(MAD)法

    • 研究代表者
      三木 邦夫
    • 研究期間 (年度)
      2002
    • 研究種目
      萌芽研究
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      京都大学

すべて 2022 2021 2020 2019 2018 2017 2012 2011 2010 2009 2008 2007 2005

すべて 雑誌論文 学会発表 図書

  • [図書] 膜タンパク質の結晶化, タンパク質の結晶化2005

    • 著者名/発表者名
      竹田 一旗, 三木 邦夫
    • 総ページ数
      14
    • 出版者
      京都大学学術出版会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16770085
  • [雑誌論文] 生命科学の飛躍のために一層深まるタンパク質結晶学の役割-タンパク質の超高分解能電荷密度解析2020

    • 著者名/発表者名
      高場圭章、長谷川和也、竹田一旗
    • 雑誌名

      日本結晶学会誌

      巻: 62

    • NAID

      130007849708

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H03643
  • [雑誌論文] X-ray crystallographic studies on the hydrogen isotope effects of green fluorescent protein at sub-angstrom resolutions2019

    • 著者名/発表者名
      Tai Yang、Takaba Kiyofumi、Hanazono Yuya、Dao Hoang-Anh、Miki Kunio、Takeda Kazuki
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section D Structural Biology

      巻: 75 号: 12 ページ: 1096-1106

    • DOI

      10.1107/s2059798319014608

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H03643
  • [雑誌論文] Subatomic resolution X-ray structures of green fluorescent protein2019

    • 著者名/発表者名
      Takaba Kiyofumi、Tai Yang、Eki Haruhiko、Dao Hoang-Anh、Hanazono Yuya、Hasegawa Kazuya、Miki Kunio、Takeda Kazuki
    • 雑誌名

      IUCrJ

      巻: 6 号: 3 ページ: 387-400

    • DOI

      10.1107/s205225251900246x

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H03643
  • [雑誌論文] Structure of a thermophilic cyanobacterial b6f-type Rieske protein2012

    • 著者名/発表者名
      Veit, S., Takeda, K., Tsunoyama, Y., Rexroth, D., Roegner, M. and Miki, K.
    • 雑誌名

      Acta cryst.

      巻: D68 号: 10 ページ: 1400-1408

    • DOI

      10.1107/s0907444912034129

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657073
  • [雑誌論文] Dimer structure and conformational variability in the N-terminal region of an archeal small heat shock protein2011

    • 著者名/発表者名
      K.Takeda, T.Hayashi, T.Abe, Y.Hirano, Y.Hanazono, M.Yohda, K.Miki
    • 雑誌名

      J.Struct.Biol.

      巻: 174 ページ: 92-99

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20510199
  • [雑誌論文] Dimer structure and conformational variability in the N-terminal region of an archeal small heat shock protein.2011

    • 著者名/発表者名
      K.Takeda, T.Hayashi, T.Abe, Y.Hirano, Y.Hanazono, M.Yohda, K.Miki
    • 雑誌名

      J.Struct. Biol. 174

      ページ: 92-99

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20510199
  • [雑誌論文] 超高分解能・超高精度のタンパク質結晶構造解析2011

    • 著者名/発表者名
      竹田一旗, 三木邦夫
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 51 ページ: 96-99

    • NAID

      10028105855

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20510199
  • [雑誌論文] 超高分解能・超高精度のタンパク質結晶構造解析2011

    • 著者名/発表者名
      竹田一旗、三木邦夫
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 51 号: 2 ページ: 096-097

    • DOI

      10.2142/biophys.51.096

    • NAID

      10028105855

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • 言語
      日本語
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657073
  • [雑誌論文] Dimer structure and conformational variability in the N-terminal region of an archaeal small heat shock protein, StHsp14.02011

    • 著者名/発表者名
      K. Takeda, T. Hayashi, T. Abe, Y. Hirano, Y. Hanazono, M. Yohda, K. Miki
    • 雑誌名

      J. Struct. Biol.

      巻: 174 ページ: 92-99

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23657073
  • [雑誌論文] 超高分解能・超高精度のタンパク質結晶構造解析2011

    • 著者名/発表者名
      竹田一旗、三木邦夫
    • 雑誌名

      生物物理 51

      ページ: 96-99

    • NAID

      10028105855

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20510199
  • [雑誌論文] Dimer structure and conformational variability in the N-terminal region of an archaeal small heat shock protein, StHsp14.02011

    • 著者名/発表者名
      Takeda K, Hayashi T, Abe T, Hirano Y Hanazono Y, Yohda M, Miki K.
    • 雑誌名

      J Struct Biol

      巻: 174 号: 1 ページ: 92-99

    • DOI

      10.1016/j.jsb.2010.12.006

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21370067, KAKENHI-PUBLICLY-22020011, KAKENHI-PROJECT-23657073
  • [雑誌論文] タンパク質における超高分解能X線結晶構造解析2010

    • 著者名/発表者名
      竹田一旗、平野優、三木邦夫
    • 雑誌名

      日本結晶学会誌 52

      ページ: 14-18

    • NAID

      10026107733

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20510199
  • [雑誌論文] Detailed assessment of X-ray induced structural perturbation in a crystalline state protein.2010

    • 著者名/発表者名
      K.Takeda, K.Kusumoto, Y.Hirano, K.Miki
    • 雑誌名

      J.Struct.Biol. 169

      ページ: 135-144

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20510199
  • [雑誌論文] Detailed assessment of X-ray induced structural perturbation in a crystalline state protein.2010

    • 著者名/発表者名
      K.Takeda, K.Kusumoto, Y.Hirano, K.Miki
    • 雑誌名

      J.Struct. Biol. 169

      ページ: 135-144

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20510199
  • [雑誌論文] Crystal structure of a periplasmic substrate-binding protein in complex with calcium lactate.2009

    • 著者名/発表者名
      N.Akiyama, K.Takeda, K.Miki
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 192

      ページ: 559-565

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20510199
  • [雑誌論文] Crystal structure of a periplasmic substrate-binding protein in complex with calcium lactate.2009

    • 著者名/発表者名
      N.Akiyama, K.Takeda, K.Miki
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 392

      ページ: 559-565

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20510199
  • [雑誌論文] Introduction of a lethal redox switch that controls the opening and closing of the hydrophobic cavity in LolA.2008

    • 著者名/発表者名
      Watanabe, S., Oguchi, Y., Takeda, K., Miki, K., and Tokuda, H.
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 283 号: 37 ページ: 25421-25427

    • DOI

      10.1074/jbc.m804737200

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19058003
  • [雑誌論文] タンパク質研究を躍進させたX線結晶構造解析2008

    • 著者名/発表者名
      竹田一旗, 三木邦夫
    • 雑誌名

      化学 63

      ページ: 25-28

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20510199
  • [雑誌論文] Introduction of a lethal redox switch that controls the opening and closing of the hydrophobic cavity in LolA.2008

    • 著者名/発表者名
      Watanabe, S., Oguchi, Y., Takeda, K., Miki, K., Tokuda, H.
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 283

      ページ: 25421-25427

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19058003
  • [雑誌論文] Opening and closing of the hydrophobic cavity of LolA coupled to lipoprotein binding and release.2008

    • 著者名/発表者名
      Oguchi, Y., Takeda, K., Watanabe, S., Yokota, N., Miki, K., Tokuda, H.
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 283

      ページ: 25414-25420

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19058003
  • [雑誌論文] Opening and closing of the hydrophobic cavity of LolA coupled to lipoprotein binding and release.2008

    • 著者名/発表者名
      Oguchi, Y., Takeda, K., Watanabe, S., Yokota, N., Miki, K., and Tokuda, H.
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 283 号: 37 ページ: 25414-25420

    • DOI

      10.1074/jbc.m804736200

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19058003
  • [雑誌論文] Structural studies of the Cpx pathway activator NlpE on the outer membrane of Escherichia coli.2007

    • 著者名/発表者名
      Hirano, Y., Hossain, Md. M., Takeda, K., Tokuda, H., and Miki, K.
    • 雑誌名

      Structure

      巻: 15 号: 8 ページ: 963-976

    • DOI

      10.1016/j.str.2007.06.014

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19058003
  • [学会発表] 緑色蛍光タンパク質における発色団-周辺残基間相互作用の量子化学的検証2022

    • 著者名/発表者名
      武田遼太,ダオ ホアンアン, 竹田 一旗
    • 学会等名
      日本物理学会第77回年次大会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05220
  • [学会発表] 高輝度紫外線レーザー照射によるDNA 構造変化の結晶学的研究2022

    • 著者名/発表者名
      田中賀丈, 丹羽智美, 竹田一旗
    • 学会等名
      日本物理学会第77回年次大会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05220
  • [学会発表] バクテリオロドプシンK中間体におけるレチナール-周辺残基間相互作用の量子化学的検証2022

    • 著者名/発表者名
      ダオ ホアンアン,丹羽 智美,竹田 一旗
    • 学会等名
      日本物理学会第77回年次大会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05220
  • [学会発表] Quantum chemistry analysis of the high-resolution crystal structure of GFP in the A state2021

    • 著者名/発表者名
      Hoang-Anh Dao, Kazuki Takeda
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05220
  • [学会発表] Sensitivity to the radiation dose of buried waters in Green Fluorescent Protein2018

    • 著者名/発表者名
      Dao Hoang Anh, Takaba Kiyofumi, Tai Yang, Hasegawa Nagayuki, Takeda Kazuki
    • 学会等名
      第56回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H03643
  • [学会発表] TOF-Laue法中性子線回折データのスケーリング方法の開発2017

    • 著者名/発表者名
      花園祐矢、竹田一旗、平野 優、玉田太郎、日下勝弘、三木邦夫
    • 学会等名
      日本中性子学会第17回年会(福岡)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H03643
  • [学会発表] 完全重水素化GFPのX線結晶構造解析及び中性子線データ測定2017

    • 著者名/発表者名
      タイ ヨウ、花園祐矢、高場圭章、三木邦夫、竹田一旗
    • 学会等名
      日本中性子学会第17回年会(福岡)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H03643
  • [学会発表] タンパク質の価電子を見る2010

    • 著者名/発表者名
      竹田一旗
    • 学会等名
      第10回 日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌市(招待講演)
    • 年月日
      2010-06-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20510199
  • [学会発表] タンパク質の価電子を見る2010

    • 著者名/発表者名
      竹田一旗
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌市
    • 年月日
      2010-06-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20510199
  • [学会発表] 超高分解能構造解析---タンパク質における電子軌道形状の可視化をめざして2009

    • 著者名/発表者名
      竹田一旗
    • 学会等名
      第9回 日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      熊本市
    • 年月日
      2009-05-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20510199
  • [学会発表] 超高分解能構造解析---タンパク質における電子軌道形状の可視化をめざして2009

    • 著者名/発表者名
      竹田一旗
    • 学会等名
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      熊本市
    • 年月日
      2009-05-29
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20510199
  • 1.  徳田 元 (40125943)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 5件
  • 2.  松山 伸一 (50183108)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 3.  西山 賢一 (80291334)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 4.  成田 新一郎 (30338751)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 5.  垰 和之 (00211996)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 6.  三木 邦夫 (10116105)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 7.  宮武 秀行 (50291935)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 8.  喜田 昭子 (70273430)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 9.  老木 成稔 (10185176)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 10.  鈴木 宏明 (20372427)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 11.  岩本 真幸 (40452122)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 12.  米倉 功治 (50346144)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 13.  小澄 大輔 (70613149)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 14.  養王田 正文
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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