山田洋一 yamada yoichi

研究者番号	30377402
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 金沢大学, 生命理工学系, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2024年度: 金沢大学, 生命理工学系, 准教授 2012年度 – 2017年度: 金沢大学, 電子情報学系, 准教授 2008年度: 金沢大学, 電子情報学系, 講師 2007年度: 金沢大学, 自然科学研究科, 助教 2004年度 – 2006年度: 金沢大学, 自然科学研究科, 助手 2004年度: 金沢大学, 大学院・自然科学研究科, 助手 2004年度: 金沢大学, 大学院自然科学研究科, 助手
審査区分/研究分野	研究代表者小区分38060:応用分子細胞生物学関連 / ゲノム生物学 / ゲノム生物学 / 基礎ゲノム科学 / 応用ゲノム科学研究代表者以外応用ゲノム科学 / 生物系
キーワード	研究代表者ヒドロキシメチル化 / HM-PCR / 出芽酵母 / グルコース抑制 / 分子シャペロン / インプリント遺伝子 / メチル化 / エピジェネティクス / ゲノム機能 / メチル化ボディマップ / DNAメチル化 … もっと見る研究代表者以外 … もっと見る視神経再生 / 視覚評価 / ゼブラフィッシュ / 遺伝子変異魚 / 画像処理 / FULL LENGTH cDNA / DNA METHYLATION / MASS SPECTROMETRY / UBIQUITIN / TAP TAG / PB1 DOMAIN / YEAST 2-HYBRID SYSTEM / PROTEIN-PROTEIN INTERACTION / 出芽酵母 / 転写開始点 / 蛋白質核酸相互作用 / 相互作用ドメイン / 1ハイブリッド法 / 蛋白質DNA相互作用 / ユビキチン化 / 質量分析法 / 2ハイブリッド法 / 蛋白質間相互作用 / 全長cDNA / DNAメチル化 / 質量分析 / ユビキチン / TAPタグ / PB1ドメイン / 酵母2ハイブリッド法 / タンパク質間相互作用 / 定量化 / 行動解析 / 視覚回復 / 行動異常 / 追尾行動隠す

出芽酵母の分子シャペロン制御因子によるグルコース抑制の制御研究代表者
- 研究代表者
  
  山田洋一
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分38060:応用分子細胞生物学関連
- 研究機関
  金沢大学
配列依存的アレル特異的ヒドロキシメチル化の普遍性の検証研究代表者
- 研究代表者
  
  山田洋一
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2017
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  ゲノム生物学
- 研究機関
  金沢大学
配列依存的アレル特異的ヒドロキシメチル化の探索研究代表者
- 研究代表者
  
  山田洋一
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2014
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  ゲノム生物学
- 研究機関
  金沢大学
転写因子遺伝子群に限定した網羅的ヒトインプリント遺伝子の探索研究代表者
- 研究代表者
  
  山田洋一
- 研究期間 (年度)
  2007 – 2008
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  基礎ゲノム科学
- 研究機関
  金沢大学
突然変異魚の表現型解析に向けた視覚性諸刺激応答行動の定量化
- 研究代表者
  
  村本健一郎
- 研究期間 (年度)
  2006 – 2007
- 研究種目
  
  萌芽研究
- 研究分野
  
  応用ゲノム科学
- 研究機関
  金沢大学
網羅的アレル別メチル化解析によるヒトメチル化ボディマップの作成研究代表者
- 研究代表者
  
  山田洋一
- 研究期間 (年度)
  2005 – 2006
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  応用ゲノム科学
- 研究機関
  金沢大学
突然変異魚の視覚性刺激応答行動の定量化によるスクリーニングと責任遺伝子の同定
- 研究代表者
  
  村本健一郎
- 研究期間 (年度)
  2004 – 2005
- 研究種目
  
  萌芽研究
- 研究分野
  
  応用ゲノム科学
- 研究機関
  金沢大学
蛋白質相互作用予測に向けた基盤情報の組織的収集
- 研究代表者
  
  伊藤隆司
- 研究期間 (年度)
  2003 – 2004
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  東京大学

すべて 2015 2013 2012 2009 2008 2006 2004

すべて雑誌論文

[雑誌論文] Factors to preserve CpG-rich sequences in methylated CpG islands2015
- 著者名/発表者名
  Hiroki Miyahara, Osamu Hirose, Kenji Satou, Yoichi Yamada
- 雑誌名
  
  BMC Genomics
  
  巻: Vol.16 号: 1 ページ: 144-144
- DOI
  10.1186/s12864-015-1286-x
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24510266
[雑誌論文] Regional DNA Methylation Differences between Humans and Chirnpanzees Are Associated with Genetic Changes, Transeriptional Divergence and Disease Genes2013
- 著者名/発表者名
  福田渓
- 雑誌名
  
  J. Hum, Genet
  
  巻: 58 号: 7 ページ: 446-54
- DOI
  10.1038/jhg.2013.55
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-13J03253, KAKENHI-PROJECT-22247037, KAKENHI-PROJECT-23249019, KAKENHI-PROJECT-23659181, KAKENHI-PUBLICLY-24113511, KAKENHI-PROJECT-24510266, KAKENHI-PROJECT-24650234, KAKENHI-PROJECT-25711027
[雑誌論文] Validation of MIMGO: a method to identify differentially expressed GO terms in a microarray dataset2012
- 著者名/発表者名
  Yoichi Yamada, Hiroki Sawada, Ken-ichi Hirotani, Masanobu Oshima, Kenji Satou
- 雑誌名
  
  BMC Research Notes
  
  巻: Vol.5:680 号: 1
- DOI
  10.1186/1756-0500-5-680
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24510266
[雑誌論文] An identification method of data-specific GO terms from a microarray data set2009
- 著者名/発表者名
  Yoichi Yamada
- 雑誌名
  
  IEICE TRANSACTIONS on Information and Systems (印刷中)
- NAID
  10026809481
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19710162
[雑誌論文] An identification method of data-specific GO terms from a microarray data set2009
- 著者名/発表者名
  Yoichi Yamada, Ken-ichi Hirotani, Kenji Satou, Ken-ichiro Muramoto
- 雑誌名
  
  IEICE TRANSACTIONS on Information and Systems Vol.E92-D No.5
  
  ページ: 1093-1102
- NAID
  10026809481
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19710162
[雑誌論文] Prediction of Genomic Methylation Status on CpG Islands Using DNA Sequence Features2008
- 著者名/発表者名
  Yoichi Yamada, Kenji Satou
- 雑誌名
  
  WSEAS Transactions on Biology and Biomedicine Vol.5
  
  ページ: 153-162
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19710162
[雑誌論文] Prediction of Genomic Methylation Status on CpG Islands Using DNA Sequence Features2008
- 著者名/発表者名
  Yoichi Yamada
- 雑誌名
  
  WSEAS Transactions on Biology and Biomedicine 5
  
  ページ: 153-162
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19710162
[雑誌論文] A comprehensive allelic methylation analysis of CpG islands on human chromosome 11q2006
- 著者名/発表者名
  Yoichi Yamada
- 雑誌名
  
  DNA SEQUENCE 17・4
  
  ページ: 300-306
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17710169
[雑誌論文] A yeast one-hybrid system to detect methylation-dependent DNA-protein interactions2004
- 著者名/発表者名
  Feng, S.-Y., Ota, K., Yamada, Y., Sawabu, N., Ito, T.
- 雑誌名
  
  Biochem. Biophys. Res. Commun. 313
  
  ページ: 922-925
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15014213
[雑誌論文] A comprehensive analysis of allelic methylation status of CpG islands on human chromosome 21q.2004
- 著者名/発表者名
  Yamada, Y. et al.
- 雑誌名
  
  Genome Res. 14
  
  ページ: 247-266
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15014213
[雑誌論文] An evolutionary scenario for genomic imprinting of Impact lying between nonimprinted neighbors2004
- 著者名/発表者名
  Okamura, K., Yamada, Y., Sakaki, Y., Ito, T.
- 雑誌名
  
  DNA Res. 11
  
  ページ: 381-390
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15014213
[雑誌論文] A comprehensive analysis of allelic methylation status of CpG islands on human chromosome 21q2004
- 著者名/発表者名
  Yamada, Y., Watanabe, H., Miura, F., Soejima, H., Uchiyama, M., Iwasaka, T., Mukai, T., Sakaki, Y., Ito, T.
- 雑誌名
  
  Genome Res. 14
  
  ページ: 247-266
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15014213
[雑誌論文] A yeast one-hybrid system to detect methylation-dependent DNA-protein interactions2004
- 著者名/発表者名
  Feng, S.-Y., Ota, K., Yamada, Y., Sawabu, N., Ito, T.
- 雑誌名
  
  Biochem.Biophys.Res.Commun 313
  
  ページ: 922-925
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15014213
[雑誌論文] An evolutionary scenario for genomic imprinting of Impact lying between nonimprinted neighbors.2004
- 著者名/発表者名
  Okamura, K., Yamada, Y., Sakaki, Y., Ito, T.
- 雑誌名
  
  DNA Res. 11
  
  ページ: 381-390
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15014213
[雑誌論文] A comprehensive analysis of allelic methylation status of CpG islands on human chromosome 21q2004
- 著者名/発表者名
  Yamada, Y. et al.
- 雑誌名
  
  Genome Res. 14
  
  ページ: 247-266
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15014213

1. 村本健一郎 (70042835)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
2. 加藤聖 (10019614)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
3. 久保守 (90249772)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
4. 伊藤隆司 (90201326)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件
5. 住本英樹 (30179303)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 太田一寿 (00322727)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
7. 秋田純一 (10303265)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 福田渓

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件

山田 洋一 yamada yoichi

研究課題

研究成果

共同研究者

出芽酵母の分子シャペロン制御因子によるグルコース抑制の制御研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

配列依存的アレル特異的ヒドロキシメチル化の普遍性の検証研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

配列依存的アレル特異的ヒドロキシメチル化の探索研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

転写因子遺伝子群に限定した網羅的ヒトインプリント遺伝子の探索研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

突然変異魚の表現型解析に向けた視覚性諸刺激応答行動の定量化

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

網羅的アレル別メチル化解析によるヒトメチル化ボディマップの作成研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

突然変異魚の視覚性刺激応答行動の定量化によるスクリーニングと責任遺伝子の同定

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

蛋白質相互作用予測に向けた基盤情報の組織的収集

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] Factors to preserve CpG-rich sequences in methylated CpG islands2015

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Regional DNA Methylation Differences between Humans and Chirnpanzees Are Associated with Genetic Changes, Transeriptional Divergence and Disease Genes2013

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Validation of MIMGO: a method to identify differentially expressed GO terms in a microarray dataset2012

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] An identification method of data-specific GO terms from a microarray data set2009

著者名/発表者名

雑誌名

NAID

データソース

[雑誌論文] An identification method of data-specific GO terms from a microarray data set2009

著者名/発表者名

雑誌名

NAID

データソース

[雑誌論文] Prediction of Genomic Methylation Status on CpG Islands Using DNA Sequence Features2008

著者名/発表者名

雑誌名

山田洋一 yamada yoichi