山本武志 Yamamoto Takeshi

研究者番号	30397583
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 京都大学, 理学研究科, 助教
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2015年度 – 2023年度: 京都大学, 理学研究科, 助教 2011年度 – 2014年度: 京都大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 2011年度: 京都大学, 大学院・理学研究科, 助教 2010年度: 京都大学, 理学研究科, 助教 2009年度: 京都大学, 大学院・理学研究科, 助教 … もっと見る 2007年度: 京都大学, 大学院・理学研究科, 助教 2006年度: 京都大学, 大学院理学研究科, 助手 2005年度: 京都大学, 大学院・理学研究科, 助手隠す
審査区分/研究分野	研究代表者物理化学 / 小区分32010:基礎物理化学関連 / 複合領域研究代表者以外物理化学 / 理工系 / 理工系
キーワード	研究代表者統計力学 / 自由エネルギー / 酵素反応 / 化学反応 / QM/MM / 溶媒効果 / 励起状態 / 溶液反応 / 量子化学 / 物理化学 … もっと見る / 構造予測 / シミュレーション / 超分子 / 分子動力学 / 自己組織化 / ダイナミクス / 電子状態 / 溶液内反応 / MM法 / QM / 溶媒内反応 / 触媒 / QM・MM法 / タンパク質 / QM/MM法 / 生体分子 / 化学物理 / 分子シミュレーション / 加水分解 / 生物物理 / 溶媒和 / 経路積分 / 遷移状態理論 / 量子効果 / 反応速度 … もっと見る研究代表者以外自由エネルギー / 酵素反応 / 溶液 / ダイナミックス / 化学反応 / polarizable charge model / RISM-SCF method / reactions in solution / enzymatic reactions / dynamics / free energy surfaces / chemical reactions / 電荷移動 / 円錐交差 / 電子緩和 / 生体 / 分極可能電荷モデル / RISM-SCF法 / 自己集合化 / 液体の積分方程式 / 自己組織化系 / 電子状態理論 / 反応ネットワーク / 量子化学 / エネルギーランドスケープ / 粗視化モデル / 液体の積分方程式理論 / マスター方程式 / 自己集合 / 励起状態 / 理論化学隠す

超分子自己組織化系の構造予測のための計算手法開発と分子設計への応用研究代表者
- 研究代表者
  
  山本武志
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分32010:基礎物理化学関連
- 研究機関
  京都大学
分子集積と秩序形成の分子理論
- 研究代表者
  
  佐藤啓文
- 研究期間 (年度)
  2013 – 2017
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  理工系
- 研究機関
  京都大学
凝縮相励起状態ダイナミクスの新規な反応シミュレーション手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  山本武志
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2014
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  物理化学
- 研究機関
  京都大学
多中心プロトン移動を含むATP加水分解とその自由エネルギープロファイルの理論研究研究代表者
- 研究代表者
  
  山本武志
- 研究期間 (年度)
  2009 – 2010
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  複合領域
- 研究機関
  京都大学
タンパク質・溶媒場における化学反応の自由エネルギー面研究代表者
- 研究代表者
  
  山本武志, 加藤重樹
- 研究期間 (年度)
  2009 – 2011
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  物理化学
- 研究機関
  京都大学
溶液内素過程の化学反応ダイナミックス
- 研究代表者
  
  加藤重樹
- 研究期間 (年度)
  2006 – 2009
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  理工系
- 研究機関
  京都大学
第一原理的な量子反応速度理論の開発とその酵素触媒反応への応用研究代表者
- 研究代表者
  
  山本武志
- 研究期間 (年度)
  2005 – 2006
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  物理化学
- 研究機関
  京都大学
溶液内・生体内反応の自由エネルギー面とダイナミックス
- 研究代表者
  
  加藤重樹
- 研究期間 (年度)
  2005 – 2007
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  物理化学
- 研究機関
  京都大学

すべて 2020 2019 2018 2017 2015 2014 2013 2012 2011 2010 2007 2006 2005 その他

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Coarse-grained modeling of nanocube self-assembly system and transition network analyses2020
- 著者名/発表者名
  Imamura Kosuke、Yamamoto Takeshi、Sato Hirofumi
- 雑誌名
  
  Chemical Physics Letters
  
  巻: 742 ページ: 137135-137135
- DOI
  10.1016/j.cplett.2020.137135
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K05385, KAKENHI-PROJECT-17H03009
[雑誌論文] Self-Assembly of Nanocubic Molecular Capsules via Solvent-Guided Formation of Rectangular Blocks2018
- 著者名/発表者名
  Yamamoto Takeshi, Arefi Hadi, Shanker Sudhanshu, Sato Hirofumi, Hiraoka Shuichi
- 雑誌名
  
  The Journal of Physical Chemistry Letters
  
  巻: 9 号: 20 ページ: 6082-6088
- DOI
  10.1021/acs.jpclett.8b02624
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-25102002
[雑誌論文] Relating stacking structures and charge transport in crystal polymorphs of the pyrrole-based π -conjugated molecule2017
- 著者名/発表者名
  Fujita Takatoshi、Haketa Yohei、Maeda Hiromitsu、Yamamoto Takeshi
- 雑誌名
  
  Organic Electronics
  
  巻: 49 ページ: 53-63
- DOI
  10.1016/j.orgel.2017.06.028
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-25102002, KAKENHI-PROJECT-26288042, KAKENHI-ORGANIZER-25102001, KAKENHI-PLANNED-26107007
[雑誌論文] Assessing the accuracy of integral equation theories for nano-sized hydrophobic solutes in water2017
- 著者名/発表者名
  Fujita Takatoshi、Yamamoto Takeshi
- 雑誌名
  
  The Journal of Chemical Physics
  
  巻: 147 号: 1 ページ: 014110-014110
- DOI
  10.1063/1.4990502
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-25102002, KAKENHI-ORGANIZER-25102001
[雑誌論文] Critical Role of Deep Hydrogen Tunneling to Accelerate the Antioxidant Reaction of Ubiquinol and Vitamin E2014
- 著者名/発表者名
  Taichi Inagaki and Takeshi Yamamoto
- 雑誌名
  
  The Journal of Physical Chemistry B
  
  巻: 118 号: 4 ページ: 937-950
- DOI
  10.1021/jp410263f
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24550022, KAKENHI-PLANNED-25102002
[雑誌論文] Like-Charge Attraction of Molecular Cations in Water: Subtle Balance between Interionic Interactions and Ionic Solvation Effect2014
- 著者名/発表者名
  Taichi Inagaki, Hiroshi Nakano, Shinji Aono, Takeshi Yamamoto
- 雑誌名
  
  The Journal of Physical Chemistry B
  
  巻: 118 号: 20 ページ: 5499-5508
- DOI
  10.1021/jp501212y
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24550022
[雑誌論文] Accurate and Efficient Treatment of Continuous Solute Charge Density in the Mean-Field QM/MM Free Energy Calculation2013
- 著者名/発表者名
  H. Nakano, T. Yamamoto
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Theory and Computation
  
  巻: 9 号: 1 ページ: 188-203
- DOI
  10.1021/ct300831t
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010, KAKENHI-PROJECT-24550022
[雑誌論文] Variational calculation of quantum mechanical/molecular mechanical free energy with electronic polarization of solvent2012
- 著者名/発表者名
  H. Nakano, T. Yamamoto
- 雑誌名
  
  The Journal of Chemical Physics
  
  巻: 136 号: 13 ページ: 134107-134107
- DOI
  10.1063/1.3699234
- NAID
  120005439722
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010, KAKENHI-PROJECT-24550022
[雑誌論文] Including charge penetration effects into the ESP derived partial charge operator2012
- 著者名/発表者名
  H. Nakano, T. Yamamoto
- 雑誌名
  
  Chemical. Physics. Letters
  
  巻: 546 ページ: 80-85
- DOI
  10.1016/j.cplett.2012.07.046
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010, KAKENHI-PROJECT-24550022
[雑誌論文] Ab Initio Trajectory Study on Triplet Ketene Photodissociation via Statistical Sampling of the Crossing Seam2011
- 著者名/発表者名
  Y. Ogihara, T. Yamamoto, S. Kato
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Theory and Computatio
  
  巻: 7 号: 8 ページ: 2507-2519
- DOI
  10.1021/ct200367y
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[雑誌論文] Solution reaction space Hamiltonian based on an electrostatic potential representation of solvent dynamics2011
- 著者名/発表者名
  S. Aono, T. Yamamoto, S. Kato
- 雑誌名
  
  The Journal of Chemical Physics
  
  巻: 134 号: 14 ページ: 144108-144108
- DOI
  10.1063/1.3572057
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[雑誌論文] Multireference coupled cluster calculation of the dissociation energy profile of triplet ketene2011
- 著者名/発表者名
  Y. Ogihara, T. Yamamoto, S. Kato
- 雑誌名
  
  Chemical. Physics. Letters
  
  巻: 511 号: 1-3 ページ: 28-32
- DOI
  10.1016/j.cplett.2011.05.067
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[雑誌論文] Proton-Coupled Electron Transfer of the Phenoxyl/Phenol Couple: Effect of Hartree-Fock Exchange on Transition Structures2011
- 著者名/発表者名
  T. Inagaki, T. Yamamoto, S. Kato
- 雑誌名
  
  Journal of Computational Chemistry
  
  巻: 32 号: 14 ページ: 3081-3091
- DOI
  10.1002/jcc.21892
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[雑誌論文] Solution reaction space Hamiltonian based on an electrostatic potential representation of solvent dynamics2011
- 著者名/発表者名
  S.Aono, T.Yamamoto, S.Kato
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Physics
  
  巻: 134
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[雑誌論文] Solution reaction space Hamiltonian based on an electrostatic potential representation of solvent dynamics2011
- 著者名/発表者名
  S.Aono, T.Yamamoto, S.Kato
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Physics
  
  巻: 134
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-21118508
[雑誌論文] Quantum Mechanical Reaction Probability of Triplet Ketene at the Multireference Second-Order Perturbation Level of Theory2010
- 著者名/発表者名
  Y. Ogihara, T. Yamamoto, S. Kato
- 雑誌名
  
  Journal of Physical Chemistry A
  
  巻: 114 号: 37 ページ: 9981-9990
- DOI
  10.1021/jp104089m
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[雑誌論文] A wave-function based approach for polarizable charge model : Systematic comparison of polarization effects on protic, aprotic, and ionic liquids2010
- 著者名/発表者名
  H.Nakano, T.Yamamoto, S.Kato
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Physics 132
  
  ページ: 44106-44106
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-21118508
[雑誌論文] A wave-function based approach for polarizable charge model : Systematic comparison of polarization effects on protic, aprotic, and ionic liquids2010
- 著者名/発表者名
  H.Nakano, T.Yamamoto, S.Kato
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Physics 132
  
  ページ: 44106-44106
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[雑誌論文] A wave-function based approach for polarizable charge model : Systematic comparison of polarization effects on protic, aprotic, and ionic liquids2010
- 著者名/発表者名
  H.Nakano, T.Yamamoto, S.Kato
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Physics
  
  巻: 132
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-21118508
[雑誌論文] A wave-function based approach for polarizable charge model: Systematic comparison of polarization effects on protic, aprotic, and ionic liquids2010
- 著者名/発表者名
  H. Nakano, T. Yamamoto, S. Kato
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Physics 113
  
  ページ: 44106-44106
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18066008
[雑誌論文] A wave-function based approach for polarizable charge model : Systematic comparison of polarization effects on protic, aprotic, and ionic liquids2010
- 著者名/発表者名
  H.Nakano, T.Yamamoto, S.Kato
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Physics 132
  
  ページ: 44106-44106
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18066008
[雑誌論文] A wavefunction based approach for polarizable charge model : Systematic comparison of polarization effects on protic, aprotic, and ionic liquids2010
- 著者名/発表者名
  H.Nakano, T.Yamamoto, S.Kato
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Physics
  
  巻: 132
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[雑誌論文] A wave-function based approach for polarizable charge model: Systematic comparison of polarization effects on protic, aprotic, and ionic liquids2010
- 著者名/発表者名
  H. Nakano T. Yamamoto, S. Kato
- 雑誌名
  
  The Journal of Chemical Physics
  
  巻: 132 号: 7 ページ: 44106-44106
- DOI
  10.1063/1.329887
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[雑誌論文] Quantum mechanical reaction probability of triplet ketene at the multireference second-order perturbation level of theory2010
- 著者名/発表者名
  Y.Ogihara, T.Yamamoto, S.Kato
- 雑誌名
  
  Journal of Physical Chemistry A
  
  巻: 114 ページ: 9981-9990
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[雑誌論文] Proton transfer studied using a combined ab initio reactive potential energy surface with quantum path integral methodology2010
- 著者名/発表者名
  K.F.Wong, J.L.Sonnenberg, F.Paesani, T.Yamamoto, et al
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Theory and Computation
  
  巻: 6 ページ: 2566-2580
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[雑誌論文] Preferred dissociative mechanism of phosphate monoester hydrolysis in low dielectric environments2010
- 著者名/発表者名
  T.Yamamoto
- 雑誌名
  
  Chemical Physics Letters
  
  巻: 500 ページ: 263-266
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-21118508
[雑誌論文] Proton Transfer Studied Using a Combined Ab Initio Reactive Potential Energy Surface with Quantum Path Integral Methodology2010
- 著者名/発表者名
  K.F. Wong, J.L. Sonnenberg, F. Paesani, T. Yamamoto, J. Vanicek, W. Zhang, H.B. Schlegel, D.A. Case, T.E. Cheatham, W.H. Miller, G.A. Voth
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Theory and Computation
  
  巻: 6 号: 9 ページ: 2566-2580
- DOI
  10.1021/ct900579k
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[雑誌論文] Ab initio calculation of proton-coupled electron transfer rates in the external-potential representation: A ubiquinol complex in solution2007
- 著者名/発表者名
  T. Yamamoto, S. Kato
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Physics 126,15
  
  ページ: 224513-224513
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18066008
[雑誌論文] Ab initio calculation of proton-coupled electron transfer rates in the external-potential representation: A ubiquinol complex in solution2007
- 著者名/発表者名
  T. Yamamoto and S. Kato
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Physics 126
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17350007
[雑誌論文] Ab initio calculation of proton-coupled electron transfer rates in the external-potential representation: A ubiquinol complex in solution2007
- 著者名/発表者名
  T. Yamamoto and S. Kato
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Physics 126
  
  ページ: 22451415-22451415
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18066008
[雑誌論文] Ab initio calculation of proton-coupled electron transfer rates in the external-potential representation : A ubiquinol complex in solution2007
- 著者名/発表者名
  T. Yamamoto, S. Kato
- 雑誌名
  
  J. Chem. Phys. 126
  
  ページ: 224514-224528
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17350007
[雑誌論文] Ab initio calculation of proton-coupled electron transfer rates using the external-potential representation2007
- 著者名/発表者名
  T.Yamamoto, S.Kato
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Physics 126(accpted)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17750013
[雑誌論文] Path-integral virial estimator for reaction-rate calculation based on the quantum instanton approximation2006
- 著者名/発表者名
  S.Yang, T.Yamamoto, W.H.Miller
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Physics 124
  
  ページ: 84102-84102
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17750013
[雑誌論文] Connection between the direct and mapping forms of the classical propagator2006
- 著者名/発表者名
  T.Yamamoto
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Physics 124
  
  ページ: 146103-146103
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17750013
[雑誌論文] Path integral evaluation of the quantum instanton rate constant for proton transfer in a polar solvent2005
- 著者名/発表者名
  T.Yamamoto, W.H.Miller
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Physics 122
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17750013
[雑誌論文] Path-integral virial estimator based on the scaling of fluctuation coordinates : Application to quantum clusters with fourth-order propagators2005
- 著者名/発表者名
  T.M.Yamamoto
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Physics 123
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17750013
[雑誌論文] Ab initio calculation of proton-coupled electron transfer rates in the external-potential representation : A ubiquinol complex in solution
- 著者名/発表者名
  T.Yamamoto, S.Kato
- 雑誌名
  
  J. Chem. Phys (in press)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17350007
[雑誌論文] Ab initio calculation of proton-coupled electron transfer rates in the external-potential representation : A ubiquinol complex in solution
- 著者名/発表者名
  T.Yamamoto, S.Kato
- 雑誌名
  
  J.Chem.Phys. (in press)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18066008
[学会発表] 超分子自己組織化系の構造予測と溶媒・ゲスト分子による構造変化の研究2019
- 著者名/発表者名
  山本武志
- 学会等名
  第13回分子科学討論会（名古屋）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K05385
[学会発表] Molecular theories for self-asembly and order formation2018
- 著者名/発表者名
  Hirofumi Sato; Takeshi Yamamoto; Sudhanshu Shanker; Hadi Arefi
- 学会等名
  The 6th International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-25102002
[学会発表] Supramolecular polymer elongation studied by replica-exchange with solute tempering molecular dynamics simulation2018
- 著者名/発表者名
  Hadi Arefi; Takeshi Yamamoto; Hirofumi Sato
- 学会等名
  The 6th International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-25102002
[学会発表] Molecular dynamics and enhanced sampling simulation of nanocapsule formation and spontaneous shape conversion via guest molecules2018
- 著者名/発表者名
  Sudhanshu Shanker; Takeshi Yamamoto; Hirofumi Sato
- 学会等名
  The 6th International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-25102002
[学会発表] 溶液中ナノキューブ自己組織化過程の自由エネルギー解析2015
- 著者名/発表者名
  山本武志
- 学会等名
  第9回分子科学討論会
- 発表場所
  東京工業大学・大岡山キャンパス
- 年月日
  2015-09-16
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-25102002
[学会発表] Self assembly of gear-shaped amphiphiles into a molecular capsule (nanocube): computational study2015
- 著者名/発表者名
  Takeshi Yamamoto and Hirofumi Sato
- 学会等名
  The 4th International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
- 発表場所
  九州大学西新プラザ
- 年月日
  2015-11-22
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-25102002
[学会発表] Molecular theories for self-organization and order formation2015
- 著者名/発表者名
  Hirofumi Sato and Takeshi Yamamoto
- 学会等名
  The 4th International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
- 発表場所
  九州大学西新プラザ
- 年月日
  2015-11-22
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-25102002
[学会発表] 電荷密度を用いた平均場 QM/MM 自由エネルギー計算2013
- 著者名/発表者名
  中農浩史、山本武志
- 学会等名
  第16回理論化学討論会2013福岡
- 発表場所
  福岡市　健康づくりサポートセンター
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24550022
[学会発表] トンネル効果と反応物錯体形成が引き起こす抗酸化反応の活性化: ユビキノール-ビタミンE 間の水素移動反応2013
- 著者名/発表者名
  稲垣泰一、山本武志
- 学会等名
  第７回分子科学討論会2013京都
- 発表場所
  京都市　京都テルサ
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24550022
[学会発表] Large tunneling effects in hydrogen transfer reaction: Antioxidant reaction of ubiquinol and vitamin E2013
- 著者名/発表者名
  T. Inagaki and T. Yamamoto
- 学会等名
  International Symposium on "The Advent of quantum and classical dissipative theory"Institute of Molecular Science
- 発表場所
  Okazaki, Japan
- 年月日
  2013-03-07
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[学会発表] Large tunneling effects in solution-phase H transfer reaction: Antioxidant reaction of ubiquinol and vitamin E derivative2012
- 著者名/発表者名
  T. Inagaki, T. Yamamoto
- 学会等名
  14th International Congress of Quantum Chemistry
- 発表場所
  Colorado, USA
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[学会発表] MF-QM/MM 法による化学反応の自由エネルギー計算と溶液・酵素反応への応用2012
- 著者名/発表者名
  山本武志、中農浩史
- 学会等名
  第6回分子科学討論会2012
- 発表場所
  東京
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[学会発表] MF-QM/MM法による化学反応の自由エネルギー計算と溶液・酵素反応への応用2012
- 著者名/発表者名
  山本武志
- 学会等名
  分子科学討論会
- 発表場所
  東京大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[学会発表] MF-QM/MM法による化学反応の自由エネルギー計算と溶液・酵素反応への応用2012
- 著者名/発表者名
  山本武志
- 学会等名
  分子科学討論会
- 発表場所
  東京大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24550022
[学会発表] QM/MM計算における波動関数の統計揺らぎの効果と平均場近似の妥当性の検証2012
- 著者名/発表者名
  中農浩史、山本武志
- 学会等名
  第6回分子科学討論会2012
- 発表場所
  東京
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[学会発表] 溶液内水素移動反応のトンネリング効果:ユビキノール-ビタミンEの抗酸化反応2012
- 著者名/発表者名
  稲垣泰一、山本武志
- 学会等名
  第6回分子科学討論会2012
- 発表場所
  東京
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[学会発表] 平均場QM/MM法のより正確な計算手法の開発2011
- 著者名/発表者名
  中農浩史、山本武志
- 学会等名
  第5回分子科学討論会2011
- 発表場所
  札幌
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[学会発表] 溶液内におけるフェノール誘導体の電子・プロトン移動反応の理論的研究2011
- 著者名/発表者名
  稲垣泰一、山本武志
- 学会等名
  第5回分子科学討論会2011
- 発表場所
  札幌
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[学会発表] Free energy profile for the hydrogen transfer reaction of ubiquinol complex in ethanol2011
- 著者名/発表者名
  T. Inagaki, T. Yamamoto
- 学会等名
  2011 KAIST-Kyoto University Chemistry Symposium
- 発表場所
  Korea
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[学会発表] Some numerical quests for accurate quantum dynamics in gas and condensed phases2010
- 著者名/発表者名
  山本武志
- 学会等名
  The 69th Okazaki Conference on "New Frontier in Quantum Chemical Dynamics"
- 発表場所
  分子科学研究所 (名古屋)
- 年月日
  2010-02-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[学会発表] Some numerical quests for accurate quantum dynamics in gas and condensed phases2010
- 著者名/発表者名
  山本武志
- 学会等名
  The 69th Okazaki Conference on "New Frontier in Quantum Chemical Dynamics"
- 発表場所
  分子科学研究所(名古屋)
- 年月日
  2010-02-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18066008
[学会発表] 分極可能力場と組み合わせた平均場QM/MM法による化学反応の自由エネルギー計算2010
- 著者名/発表者名
  中農浩史、山本武志
- 学会等名
  第13回理論化学討論会
- 発表場所
  北海道
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[学会発表] QM/MM法に基づく化学反応の自由エネルギー計算と反応経路の探索2010
- 著者名/発表者名
  山本武志
- 学会等名
  IMSスーパーコンピュータワークショップ
- 発表場所
  分子科学研究所(名古屋)
- 年月日
  2010-01-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18066008
[学会発表] Some numerical quests for accurate quantum molecular dynamics2010
- 著者名/発表者名
  山本武志
- 学会等名
  第69回岡崎カンファレンス"New frontier in Quanturn Chemical Dynamics"
- 発表場所
  分子科学研究所(名古屋)(招待)
- 年月日
  2010-02-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[学会発表] ユビキノール-トコフェロール間における水素移動反応の理論的研究2010
- 著者名/発表者名
  稲垣泰一、山本武志、加藤重樹
- 学会等名
  第4回分子科学討論会2010
- 発表場所
  大阪
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[学会発表] 溶液中ATP加水分解の自由エネルギー変化の分子論的解釈2010
- 著者名/発表者名
  山本武志
- 学会等名
  第48回(2010年度)日本生物物理学会年会
- 発表場所
  東北大学(招待講演)
- 年月日
  2010-09-21
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-21118508
[学会発表] QM/MM法に基づく化学反応の自由エネルギー計算と反応経路の探索2010
- 著者名/発表者名
  山本武志
- 学会等名
  IMSスーパーコンピュータワークショップ
- 発表場所
  分子科学研究所(名古屋)
- 年月日
  2010-01-13
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-21118508
[学会発表] 溶液中ATP加水分解エネルギーの分子論的解釈2010
- 著者名/発表者名
  山本武志
- 学会等名
  日本生物物理学会年会
- 発表場所
  東北大学(仙台)(招待)
- 年月日
  2010-09-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[学会発表] Some numerical quests for accurate quantum dynamics in gas and condensed phases2010
- 著者名/発表者名
  山本武志
- 学会等名
  The 69th Okazaki Conference on "New Frontier in Quantum Chemical Dynamics"
- 発表場所
  分子科学研究所(名古屋)
- 年月日
  2010-02-21
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-21118508
[学会発表] 分極可能力場と組み合わせた平均場QM/MM法による化学反応の自由エネルギー計算2010
- 著者名/発表者名
  中農浩史、山本武志
- 学会等名
  第4回分子科学討論会2010
- 発表場所
  大阪
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[学会発表] QM/MM法に基づく化学反応の自由エネルギー計算と反応経路の探索2010
- 著者名/発表者名
  山本武志
- 学会等名
  IMSスーパーコンピュータワークショップ
- 発表場所
  分子科学研究所 (名古屋)
- 年月日
  2010-01-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[学会発表] QM/MM法による反応自由エネルギーの計算と反応経路の探索2010
- 著者名/発表者名
  山本武志
- 学会等名
  スーパーコンピュータワークショップ2010
- 発表場所
  分子科学研究所(名古屋)(招待)
- 年月日
  2010-01-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21350010
[学会発表] Supramolecular binding thermodynamics of a gear-shaped nanocube
- 著者名/発表者名
  Takeshi Yamamoto, Ryohei Kirihara, Taichi Inagaki, Hirofumi Sato
- 学会等名
  Computational Science Workshop 2014
- 発表場所
  AIST, Tsukuba
- 年月日
  2014-08-20 – 2014-08-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24550022

1. 加藤重樹 (20113425)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 19件
2. 佐藤啓文 (70290905)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 6件

山本 武志 Yamamoto Takeshi

研究課題

研究成果

共同研究者

超分子自己組織化系の構造予測のための計算手法開発と分子設計への応用研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

分子集積と秩序形成の分子理論

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

凝縮相励起状態ダイナミクスの新規な反応シミュレーション手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

多中心プロトン移動を含むATP加水分解とその自由エネルギープロファイルの理論研究研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

タンパク質・溶媒場における化学反応の自由エネルギー面研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

溶液内素過程の化学反応ダイナミックス

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

第一原理的な量子反応速度理論の開発とその酵素触媒反応への応用研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

溶液内・生体内反応の自由エネルギー面とダイナミックス

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Coarse-grained modeling of nanocube self-assembly system and transition network analyses2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Self-Assembly of Nanocubic Molecular Capsules via Solvent-Guided Formation of Rectangular Blocks2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Relating stacking structures and charge transport in crystal polymorphs of the pyrrole-based π -conjugated molecule2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Assessing the accuracy of integral equation theories for nano-sized hydrophobic solutes in water2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Critical Role of Deep Hydrogen Tunneling to Accelerate the Antioxidant Reaction of Ubiquinol and Vitamin E2014

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Like-Charge Attraction of Molecular Cations in Water: Subtle Balance between Interionic Interactions and Ionic Solvation Effect2014

著者名/発表者名

雑誌名

山本武志 Yamamoto Takeshi