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石塚 良介  ISHIZUKA Ryosuke

研究者番号 30462196
その他のID
  • ORCIDhttps://orcid.org/0000-0003-2751-0660
所属 (現在) 2025年度: 大阪大学, 大学院工学研究科, 招へい研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2015年度 – 2018年度: 大阪大学, 基礎工学研究科, 助教
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分13010:数理物理および物性基礎関連
研究代表者以外
生命・健康・医療情報学 / 生物物理・化学物理・ソフトマターの物理
キーワード
研究代表者
分子動力学法 / イオン伝導度 / ナトリウムイオン液体 / MD/DFT自己無撞着法 / 古典分子動力学 / オーダーN法 / 密度汎関数理論 / 第一原理分子動力学
研究代表者以外
自由エネルギー / 分子シミュレーション … もっと見る / 排除体積効果 / コンピュータシミュレーシ ョン / 尿素 / 共溶媒効果 / タンパク質構造 / コンピュータシミュレーション / 排除体積項 / 分散引力 / 静電相互作用 / 構造エネルギー / ゆらぎ / 水 / 分子間相互作用 / 分布関数理論 / 変性 / 構造ゆらぎ / 共溶媒 / 溶媒和 / 年度 / イオン対 / 緩和弾性率 / 粘度 / Green-Kubo式 / 電気伝導度 / 空間分割 / 時間相関関数 / 輸送係数 隠す
  • 研究課題

    (3件)
  • 研究成果

    (50件)
  • 共同研究者

    (4人)
  •  MDとDFTの融合手法による電池電解液への応用に向けたナトリウムイオン液体の探索研究代表者

    • 研究代表者
      石塚 良介
    • 研究期間 (年度)
      2018
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分13010:数理物理および物性基礎関連
    • 研究機関
      大阪大学
  •  空間分割表式に基づく濃厚イオン系の輸送係数の解析

    • 研究代表者
      松林 伸幸
    • 研究期間 (年度)
      2015 – 2018
    • 研究種目
      挑戦的萌芽研究
    • 研究分野
      生物物理・化学物理・ソフトマターの物理
    • 研究機関
      大阪大学
  •  共溶媒効果の全原子型自由エネルギー解析に基づくタンパク質構造論の展開

    • 研究代表者
      松林 伸幸
    • 研究期間 (年度)
      2014 – 2017
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 研究分野
      生命・健康・医療情報学
    • 研究機関
      大阪大学

すべて 2019 2018 2017 2016 2015 2014

すべて 雑誌論文 学会発表

  • [雑誌論文] Effective charges of ionic liquid determined self-consistently through combination of molecular dynamics simulation and density-functional theory2017

    • 著者名/発表者名
      Ishizuka Ryosuke、Matubayasi Nobuyuki
    • 雑誌名

      J. Comput. Chem.

      巻: 38 号: 30 ページ: 2559-2569

    • DOI

      10.1002/jcc.24880

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550, KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [雑誌論文] Energetic Analysis of Adsorption and Absorption of Small Molecule to Nanodroplet of Water2017

    • 著者名/発表者名
      Sayou Minoru、Ishizuka Ryosuke、Matubayasi Nobuyuki
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 121 号: 24 ページ: 5995-6001

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.7b01554

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550, KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [雑誌論文] Drastic Compensation of the Electronic and Solvation Effects on the ATP Hydrolysis Revealed through a Large-Scale QM/MM Simulations Combined with a Theory of Solutions2017

    • 著者名/発表者名
      Hideaki Takahashi, Satoru Umino, Yuuji Miki, Ryosuke Ishizuka, Akihiro Morita, Makoto Suzuki, and Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 121 号: 10 ページ: 2279-2287

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.7b00637

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-25104003, KAKENHI-PROJECT-26240045, KAKENHI-PROJECT-26288003, KAKENHI-PROJECT-16K13860, KAKENHI-PROJECT-15K13550, KAKENHI-PROJECT-17K05138
  • [雑誌論文] Computing Conformational Free Energy Differences in Explicit Solvent: An Efficient Thermodynamic Cycle Using an Auxiliary Potential and a Free Energy Functional Constructed from the End Points2017

    • 著者名/発表者名
      Robert C. Harris, Nanjie Deng, Ronald M. Levy, Ryosuke Ishizuka, Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      J. Comput. Chem.

      巻: 38 号: 15 ページ: 1198-1208

    • DOI

      10.1002/jcc.24668

    • 査読あり / 謝辞記載あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26240045, KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [雑誌論文] Energetics of nonpolar and polar compounds in cationic, anionic, and nonionic micelles studied by all-atom molecular dynamics simulation combined with a theory of solutions2016

    • 著者名/発表者名
      Atsushi Date, Ryosuke Ishizuka, Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      巻: 18 号: 19 ページ: 13223-13231

    • DOI

      10.1039/c6cp01834c

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26240045, KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [雑誌論文] Interaction-component analysis of the hydration and urea effects on cytochrome c2016

    • 著者名/発表者名
      Y. Yamamori, R. Ishizuka, Y. Karino, S. Sakuraba, and N. Matubayasi
    • 雑誌名

      J. Chem. Phys.

      巻: 144 号: 8 ページ: 085102-15

    • DOI

      10.1063/1.4941945

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550, KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [雑誌論文] Correlation analysis for heat denaturation of Trp-cage miniprotein with explicit solvent2016

    • 著者名/発表者名
      F. Kamo, R. Ishizuka, and N. Matubayasi
    • 雑誌名

      Protein Sci.

      巻: 25 号: 1 ページ: 56-66

    • DOI

      10.1002/pro.2754

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550, KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [雑誌論文] Self-Consistent Determination of Atomic Charges of Ionic Liquid through a Combination of Molecular Dynamics Simulation and Density Functional Theory2016

    • 著者名/発表者名
      R. Ishizuka and N. Matubayasi
    • 雑誌名

      J. Chem. Theory Comput.

      巻: 12 号: 2 ページ: 804-811

    • DOI

      10.1021/acs.jctc.5b00885

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550, KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [雑誌論文] Effect of diffuseness of micelle boundary on the solute distribution upon solubilization2015

    • 著者名/発表者名
      Tomoko Mizuguchi, Ryosuke Ishizuka, Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      Chem. Phys. Lett.

      巻: 624 ページ: 19-23

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2015.02.001

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23651202, KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [雑誌論文] Energetic Contributions from the Cation and Anion to the Stability of Carbon Dioxide Dissolved in Imidazolium-Based Ionic Liquids2015

    • 著者名/発表者名
      Ryosuke Ishizuka, Nobuyuki Matubayasi, Kai-Min Tu, Yasuhiro Umebayashi
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 119 号: 4 ページ: 1579-1587

    • DOI

      10.1021/jp5101957

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23651202, KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [雑誌論文] Spatial-decomposition analysis of electrical conductivity in ionic liquid2014

    • 著者名/発表者名
      Kai-Min Tu , Ryosuke Ishizuka, Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      J. Chem. Phys.

      巻: 141 号: 24 ページ: 244507-244507

    • DOI

      10.1063/1.4904382

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23651202, KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [雑誌論文] Spatial-decomposition analysis of electrical conductivity in concentrated electrolyte solution2014

    • 著者名/発表者名
      Kai-Min Tu , Ryosuke Ishizuka, Nobuyuki Matubayasi
    • 雑誌名

      J. Chem. Phys.

      巻: 141 号: 4 ページ: 044126-044126

    • DOI

      10.1063/1.4890741

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23651202, KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [学会発表] 第一原理DFT計算を用いて構築したイオン液体の非分極力場:開発と輸送物性への応用2019

    • 著者名/発表者名
      石井 良樹、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      日本化学会 第99春季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] イオン液体の輸送特性解析に最適化した分子動力学モデルの開発2019

    • 著者名/発表者名
      石井 良樹、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      化学工学会 第84年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] 多元溶液系における輸送ダイナミクスの全原子解析2018

    • 著者名/発表者名
      石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      ESICB電池・電子論合同検討会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] イミダゾリウム系イオン液体における輸送係数とナノ相分離の計算評価(口頭)2018

    • 著者名/発表者名
      石井 良樹、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      電気化学会第85回大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] イミダゾリウム系イオン液体における輸送係数とナノ相分離の計算評価(口頭)2018

    • 著者名/発表者名
      石井 良樹、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      電気化学会第85回大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [学会発表] 分子動力学法による長鎖イミダゾリウムイオン液体の小分子吸収能と輸送物性解析2018

    • 著者名/発表者名
      石井 良樹、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      化学工学会 第50回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] Effective charge of ionic liquid determined through MD/DFT self-consistent scheme2018

    • 著者名/発表者名
      Ryosuke Ishizuka and Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      8th International Symposium on Molecular Thermodynamics and Molecular Simulation (MTMS '18)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] Transport properties of ionic liquids with advanced non-polarizable force fields based on first-principles calculations2018

    • 著者名/発表者名
      Yoshiki Ishii, Ryosuke Ishizuka, and Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      Joint Conference of lEMLG/JMLG Annual Meeting 2018 and 41th Symposium on Solution Chemistry of Japan "Understanding of Molecular Liquids and Its Extension to New Fields"
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] オーダーN法を用いたMD/DFT自己無撞着法による分子力場構築2018

    • 著者名/発表者名
      石塚 良介、尾崎 泰助、松林 伸幸
    • 学会等名
      第21回理論化学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] Bl_chl 電荷解析とForce Fitting 法を用いたイオン液体の非分極力場の開発2018

    • 著者名/発表者名
      石井 良樹、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第32回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] Interaction-component analysis of protein stability with regard to heat denaturation(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiko Tokunaga, Yu Yamamori, Ryosuke Ishizuka, and Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] 蛋白質の天然構造と熱変性構造の安定性に関する相互作用成分解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      徳永 好彦、山守 優、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] Interaction-component analysis of protein stability with regard to heat denaturation(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiko Tokunaga, Yu Yamamori, Ryosuke Ishizuka, and Nobuyuki Matubayasi
    • 学会等名
      第55回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [学会発表] 生体関連分子のAOT逆ミセル内への導入の自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      長尾 昌洋、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [学会発表] MD/DFT 自己無撞着法による機能性流体の物性解析2017

    • 著者名/発表者名
      石塚 良介、TU Kai-Min、松林 伸幸
    • 学会等名
      第20回理論化学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] 分子動力学を用いた固液界面における分子吸着の自由エネルギー解析(口頭)2017

    • 著者名/発表者名
      中久木 一平、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      化学工学会 第49回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [学会発表] 生体関連分子のAOT逆ミセルへの結合の自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      長尾 昌洋、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第40回溶液化学シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] 蛋白質構造の安定性と熱変性に関する相互作用成分解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      徳永 好彦、山守 優、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第40回溶液化学シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] 生体関連分子のAOT逆ミセルへの結合の自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      長尾 昌洋、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第40回溶液化学シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [学会発表] 多元溶液系における輸送ダイナミクスの全原子解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸、石塚 良介、TU Kai-Min
    • 学会等名
      ESICB電池・電子論合同検討会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] 分子動力学を用いた固液界面における分子吸着の自由エネルギー解析(口頭)2017

    • 著者名/発表者名
      中久木 一平、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      化学工学会 第49回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] 蛋白質安定性と熱変性に関する相互作用成分解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      徳永 好彦、山守 優、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第17回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [学会発表] 蛋白質の天然構造と熱変性構造の安定性に関する相互作用成分解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      徳永 好彦、山守 優、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [学会発表] 固液界面における分子吸着の分子動力学シミュレーションによる解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      中久木 一平、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第40回溶液化学シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] Bl_chl電荷解析による分極力場構築法の検討(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      石井 良樹、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] 生体関連分子のAOT逆ミセル内への導入の自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      長尾 昌洋、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] MD/DFT 自己無撞着法による機能性流体の物性解析2017

    • 著者名/発表者名
      石塚 良介、TU Kai-Min、松林 伸幸
    • 学会等名
      第20回理論化学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [学会発表] 蛋白質構造の安定性と熱変性に関する相互作用成分解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      徳永 好彦、山守 優、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第40回溶液化学シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [学会発表] 固液界面における分子吸着の分子動力学シミュレーションによる解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      中久木 一平、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第40回溶液化学シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [学会発表] Bl_chl電荷解析による分極力場構築法の検討(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      石井 良樹、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [学会発表] 蛋白質安定性と熱変性に関する相互作用成分解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      徳永 好彦、山守 優、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第17回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] アミノ酸のAOT逆ミセルへの取り込みの自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      長尾 昌洋、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      化学工学会 第49回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーションによる固液界面における分子吸着の自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      中久木 一平、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] アミノ酸のAOT逆ミセルへの取り込みの自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      長尾 昌洋、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      化学工学会 第49回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] 多元溶液系における輸送ダイナミクスの全原子解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      松林 伸幸、石塚 良介、TU Kai-Min
    • 学会等名
      ESICB電池・電子論合同検討会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [学会発表] 分子動力学シミュレーションによる固液界面における分子吸着の自由エネルギー解析(ポスター)2017

    • 著者名/発表者名
      中久木 一平、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      第31回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26240045
  • [学会発表] 分子集合体に取り込まれた物質に関する自由エネルギー解析2015

    • 著者名/発表者名
      水口 朋子、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      平成27年度 繊維学会秋季研究発表会
    • 発表場所
      京都工芸繊維大学 (京都市左京区松ヶ崎)
    • 年月日
      2015-10-22
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K13550
  • [学会発表] 分子集合体に取り込まれた物質に関する自由エネルギー解析2015

    • 著者名/発表者名
      水口 朋子、石塚 良介、松林 伸幸
    • 学会等名
      平成27年度 繊維学会秋季研究発表会
    • 発表場所
      京都工芸繊維大学 (京都市左京区松ヶ崎)
    • 年月日
      2015-10-22
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26240045
  • 1.  松林 伸幸 (20281107)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 49件
  • 2.  三本木 至宏 (10222027)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 3.  森田 明弘
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 4.  高橋 英明
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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