大塚教雄 OTSUKA TAKAO

研究者番号	30465968
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 京都大学, 医学研究科, 特定准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2018年度 – 2021年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 研究員 2015年度 – 2017年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命システム研究センター, 研究員 2015年度: 理化学研究所, 生命システム研究センター, 研究員 2014年度: 独立行政法人理化学研究所, 生命システム研究センター, 研究員 2010年度 – 2012年度: 独立行政法人理化学研究所, 計算分子設計研究グループ, 研究員 … もっと見る 2010年度: 独立行政法人理化学研究所, 計算分子設計グループ, 研究員 2009年度: 独立行政法人理化学研究所, 高速分子シミュレーション研究チーム, 研究員 2008年度: 独立行政法人物質・材料研究機構, 計算科学センター, NIMSポスドク研究員隠す
審査区分/研究分野	研究代表者創薬化学 / 遷移状態制御研究代表者以外機能物性化学 / 数理物理・物性基礎 / 生物物理・化学物理
キーワード	研究代表者インシリコ創薬 / 大規模電子状態計算 / フラグメント分子軌道法 / 分子間相互作用 / 分子設計 / 反応部位予測 / 反応性部位 / 大規模電子状態 / 遷移状態探索 / シトクロムP450 … もっと見る / ヒストン / order-N / Nudged Elastic Band法 / 遷移状態アナログ / フラグメント分子軌道 / 1電子軌道 / 計算分子設計 / 分子軌道法 / 結合親和性 / 密度汎関数法 / 第一原理計算 / オーダーN法 … もっと見る研究代表者以外制約密度汎関数法 / 光機能性化合物 / 分子間電子移動 / TDDFT / ナフタルイミド誘導体 / 励起電子状態 / CDFT / TD-DFT / 光誘起電子移動 / MNEI / アニオンセンサー / イオンチャネル / 計算手法、プログラム開発 / 計算物理 / 生物物理 / 第一原理分子動力学 / プログラム開発 / 大規模第一原理計算 / 構造最適化 / 密度汎関数法 / 溶媒効果 / DNA / 第一原理計算 / オーダーN法隠す

新奇光機能ナフタルイミド誘導体の理論・実験融合型基盤研究
- 研究代表者
  
  守橋健二
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2020
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  機能物性化学
- 研究機関
  筑波大学
大規模電子状態計算を基軸とした遷移状態アナログ分子設計法の技術構築研究代表者
- 研究代表者
  
  大塚教雄
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2019
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  遷移状態制御
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
大規模分子系１電子軌道計算法を活用したインシリコ医薬分子設計の理論と技術開発研究代表者
- 研究代表者
  
  大塚教雄
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2017
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  創薬化学
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
超大規模第一原理計算に基づいた複雑生体系の環境依存力場の作成
- 研究代表者
  
  宮崎剛
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2015
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  数理物理・物性基礎
- 研究機関
  国立研究開発法人物質・材料研究機構
オーダーN法第一原理計算手法を導入したタンパク質機能制御分子最適化手法の基盤構築研究代表者
- 研究代表者
  
  大塚教雄
- 研究期間 (年度)
  2010 – 2012
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  創薬化学
- 研究機関
  独立行政法人理化学研究所
オーダーN法第一原理計算による水溶液中DNAの構造安定性に対する研究
- 研究代表者
  
  宮崎剛
- 研究期間 (年度)
  2008 – 2010
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生物物理・化学物理
- 研究機関
  独立行政法人物質・材料研究機構

すべて 2020 2019 2018 2017 2016 2015 2013 2012 2011 2010 2009 2008 その他

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Quantum chemical analysis of reaction indices and reaction path for drug molecules2019
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka, Noriaki Okimoto, Hiroaki Saito, Makoto Taiji
- 雑誌名
  
  Journal of Physics: Conference Series
  
  巻: 印刷中
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16KT0168
[雑誌論文] Quantum chemical analysis of reaction indices and reaction path for drug molecules2019
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka、Noriaki Okimoto、Hiroaki Saito、Makoto Taiji
- 雑誌名
  
  Journal of Physics: Conference Series
  
  巻: 1290 号: 1 ページ: 012021-012021
- DOI
  10.1088/1742-6596/1290/1/012021
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16KT0168
[雑誌論文] Application of order-N first-principles DFT calculations with temperature controlled molecular dynamics to biomolecular system2018
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka, Makoto Taiji
- 雑誌名
  
  Journal of Physics: Conference Series
  
  巻: 1136 ページ: 012025-012025
- DOI
  10.1088/1742-6596/1136/1/012025
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16KT0168
[雑誌論文] Theoretical study on photo-induced processes of 1-methyl-3-(N-(1,8-naphthalimidyl)ethyl)imidazolium halide species: an application of constrained density functional theory2018
- 著者名/発表者名
  Otsuka Takao、Sumita Masato、Izawa Hironori、Morihashi Kenji
- 雑誌名
  
  Phys.Chem.Chem.Phys. (Back Cover)
  
  巻: 20 号: 6 ページ: 3911-3917
- DOI
  10.1039/c7cp07877c
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H03034
[雑誌論文] Use of the Multilayer Fragment Molecular Orbital Method to Predict the Rank Order of Protein-Ligand Binding Affinities: A Case Study Using Tankyrase 2 Inhibitors2018
- 著者名/発表者名
  Noriaki Okimoto, Takao Otsuka, Yoshinori Hirano, Makoto Taiji
- 雑誌名
  
  ACS Omega
  
  巻: 3 号: 4 ページ: 4475-4485
- DOI
  10.1021/acsomega.8b00175
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860084
[雑誌論文] Linear-scaling first-principles molecular dynamics of complex biological systems with the CONQUEST code2016
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka, Makoto Taiji, David R. Bowler, Tsuyoshi Miyazaki
- 雑誌名
  
  Japanese Journal of Applied Physics
  
  巻: 55
- NAID
  210000147203
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16KT0168
[雑誌論文] Assessment and Acceleration of Binding Energy Calculations for Protein-Ligand Complexes by the Fragment Molecular Orbital Method2015
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka, Noriaki Okimoto, Makoto Taiji
- 雑誌名
  
  Journal of Computational Chemistry
  
  巻: 36 号: 30 ページ: 2209-2218
- DOI
  10.1002/jcc.24055
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860084
[雑誌論文] Structural relaxation and binding energy calculations of FK506 binding protein complexes using the large-scale DFT code CONQUEST2013
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka
- 雑誌名
  
  IOP Journal of Physics: Conference Series
  
  巻: 掲載確定
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[雑誌論文] A quantum chemistry study of Ds-Pa unnatural DNA base pair2013
- 著者名/発表者名
  T. Otsuka, T. Miyazaki
- 雑誌名
  
  Int. J. Quantum Chem
  
  巻: 113 ページ: 504-509
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[雑誌論文] A quantum chemistry study of Ds-Pa unnatural DNA base pair2012
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka, Tsuyoshi Miyazaki
- 雑誌名
  
  Int.Journal of Quantum Chemistry
  
  巻: (in press)
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[雑誌論文] Accuracy of order-N density-functional theory calculations on DNA systems using CONQUEST2008
- 著者名/発表者名
  T. Otsuka
- 雑誌名
  
  J. Phys. : Condens. Matter 20
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[雑誌論文] DNA系に対する大規模第一原理計算2008
- 著者名/発表者名
  宮崎剛、大塚教雄
- 雑誌名
  
  固体物理(アグネ技術センター) 43
  
  ページ: 849-858
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[雑誌論文] Accuracy of order-N density-functional theory calculations on DNA systems using CONQUEST2008
- 著者名/発表者名
  T.Otsuka, T.Miyazaki, T.Ohno, D.R.Bowler, M.J.Gillan
- 雑誌名
  
  J.Phys.: Condens.Matter 20
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[雑誌論文] Structural relaxation and binding energy calculations of FK506 inding protein complexes using the large-scale DFT code CONQUEST
- 著者名/発表者名
  T. Otsuka, N. Okimoto, M. Taiji, D. R. Bowler, T. Miyazaki
- 雑誌名
  
  Journal of Physics : Conference Series
  
  巻: (in press)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] A computational approach to the intercalation of naphthal imido derivative into DNA2020
- 著者名/発表者名
  IWAI, Yudai; MATSUI, Toru; OTSUKA, Takao; SUMITA, Masato; IZAWA, Hironori; MORIHASHI, Kenji
- 学会等名
  日本化学会第100回春季年会　（東京理科大学　野田キャンパス）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H03034
[学会発表] A theoretical study on molecular cluster of citric acid2020
- 著者名/発表者名
  TANAKA, Yoshihiro; MATSUI, Toru; OTSUKA, Takao; SUMITA, Masato; IZAWA, Hironori; MORIHASHI, Kenji
- 学会等名
  日本化学会第100回春季年会　（東京理科大学　野田キャンパス）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H03034
[学会発表] 量子化学計算による薬物分子の代謝反応性部位と初期反応過程に関する考察2019
- 著者名/発表者名
  大塚教雄、沖本憲明、齋藤大明、泰地真弘人
- 学会等名
  第13回分子科学討論会2019名古屋
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16KT0168
[学会発表] カルボン酸塩・ナフタルイミド化合物の光誘起過程の理論的解析2018
- 著者名/発表者名
  大高秀仁、大塚教雄、隅田真人、井澤浩則、松井亨、守橋健二
- 学会等名
  第98回日本化学会春季年会（日本大学理工学部　船橋キャンパス）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H03034
[学会発表] Quantum chemical analysis of reaction indices and reaction path for drug molecules2018
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka, Noriaki Okimoto, Hiroaki Saito, Makoto Taiji
- 学会等名
  XXX IUPAP Conference on Computational Physics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16KT0168
[学会発表] ナフタルイミド化合物-ハロゲン系の光誘起過程に関する理論的研究2017
- 著者名/発表者名
  大塚教雄、隅田真人、井澤浩則,、守橋健二
- 学会等名
  第３１回　分子シミュレーション討論会　金沢商工会議所
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H03034
[学会発表] カルボン酸塩・ナフタルイミド化合物錯体の光誘起過程の理論的解析2017
- 著者名/発表者名
  大高秀仁、大塚教雄、隅田真人、井澤浩則、松井亨、守橋健二
- 学会等名
  第３１回　分子シミュレーション討論会　金沢商工会議所
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H03034
[学会発表] Application of order-N first-principles DFT calculations with temperature controlled molecular dynamics to biomolecular system2017
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka, Makoto Taiji, David R. Bowler, Tsuyoshi Miyazaki
- 学会等名
  XXIX IUPAP Conference on Computational Physics, CCP2017, Paris
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16KT0168
[学会発表] 創薬における大規模電子状態計算法の技術化2016
- 著者名/発表者名
  大塚教雄
- 学会等名
  筑波大学量子化学セミナー
- 発表場所
  筑波大学, つくば
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860084
[学会発表] フラグメント分子軌道法を活用したタンパク-リガンド系の大規模分子軌道解析2016
- 著者名/発表者名
  大塚教雄、沖本憲明、泰地真弘人、常行真司
- 学会等名
  第30回分子シミュレーション討論会
- 発表場所
  大阪大学, 大阪
- 年月日
  2016-11-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860084
[学会発表] Constant temperature order-N first-principles molecular dynamics calculations of biomolecular system and short-time behavior2016
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka, Makoto Taiji, David R. Bowler, Tsuyoshi Miyazaki
- 学会等名
  第54回日本生物物理学会大会
- 発表場所
  つくば国際会議場、つくば
- 年月日
  2016-11-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16KT0168
[学会発表] Application of FMO-LCMO method to Protein-Ligand system2016
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka, Noriaki Okimoto, Makoto Taiji, Shinji Tsuneyuki
- 学会等名
  CBI Annual Meeting 2016
- 発表場所
  Tower Hall Funabori, Tokyo
- 年月日
  2016-10-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860084
[学会発表] 大規模電子状態計算の基礎と生命科学分野での応用研究事例2016
- 著者名/発表者名
  大塚教雄
- 学会等名
  京都大学医学部奥野研究室セミナー
- 発表場所
  京都大学, 京都, 日本
- 年月日
  2016-01-06
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860084
[学会発表] 大規模電子状態計算手法の生体分子系への応用2015
- 著者名/発表者名
  大塚教雄
- 学会等名
  和歌山大学第八回紀州吉宗セミナー
- 発表場所
  和歌山, 日本
- 年月日
  2015-03-04
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860084
[学会発表] Acceleration of Protein-ligand Binding Energy Calculation Using Fragment Molecular Orbital Method2015
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka, Noriaki Okimoto, Makoto Taiji
- 学会等名
  CBI学会2015年大会
- 発表場所
  タワーホール船堀, 東京, 日本
- 年月日
  2015-10-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860084
[学会発表] 多層フラグメント分子軌道法を利用した効率的なタンパク-リガンド間相互作用の計算2015
- 著者名/発表者名
  大塚教雄, 沖本憲明, 泰地真弘人
- 学会等名
  第29回分子シミュレーション討論会
- 発表場所
  朱鷺メッセ, 新潟, 日本
- 年月日
  2015-11-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860084
[学会発表] インシリコ創薬における電子状態計算手法の基盤技術化への取り組み2015
- 著者名/発表者名
  大塚教雄
- 学会等名
  量子系分子科学セミナー
- 発表場所
  計算科学研究機構, 神戸, 日本
- 年月日
  2015-06-05
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860084
[学会発表] Development of new molecular design technique by large-scale electronic structure calculations2015
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka, Noriaki Okimoto, Makoto Taiji
- 学会等名
  第１回理化学研究所・産業技術総合研究所共同シンポジウム
- 発表場所
  産業技術総合研究所, 東京, 日本
- 年月日
  2015-06-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860084
[学会発表] 大規模電子状態計算手法のインシリコ創薬への基盤技術化2015
- 著者名/発表者名
  大塚教雄
- 学会等名
  第2回電子状態理論シンポジウム
- 発表場所
  早稲田大学, 東京, 日本
- 年月日
  2015-11-07
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860084
[学会発表] 人工塩基対を含んだDNA 系に対する塩基対間相互作用の評価と超大規模計算に向けた試み2012
- 著者名/発表者名
  大塚教雄, 有田通明, D. R. Bowler, 宮崎剛
- 学会等名
  第6回分子科学討論会
- 発表場所
  東京大学, 東京
- 年月日
  2012-09-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] Structure relaxation and binding energy calculations of FKBP complexes using linear-scaling DFT code CONQUEST2012
- 著者名/発表者名
  T. Otsuka, N. Okimoto, M. Taiji, D. R. Bowler, T. Miyazaki
- 学会等名
  Theory and Applications of Computational Chemistry
- 発表場所
  Pavia, Italy
- 年月日
  2012-09-02
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] Structure relaxation and binding energy calculations of FKBP complexes using linear-scaling DFT code CONQUEST2012
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka
- 学会等名
  Theory and Applications of Computational Chemistry (TACC-2012)
- 発表場所
  University of Pavia, Pavia, Italy
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] Structure relaxation and binding energy calculations of FK506 binding protein complexes using order-N DFT code CONQUEST2012
- 著者名/発表者名
  T. Otsuka, N. Okimoto, M. Taiji, D. R. Bowler, T. Miyazaki
- 学会等名
  Conference on Computational Physics
- 発表場所
  神戸
- 年月日
  2012-10-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] 人工塩基対を含んだDNA系に対する塩基対間相互作用の評価と超大規模計算に向けた試み2012
- 著者名/発表者名
  大塚教雄
- 学会等名
  第6回分子科学討論会
- 発表場所
  東京大学，東京，日本
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] Structure relaxation and binding energy calculations of FK506 binding protein complexes using order-N DFT code CONQUEST2012
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka
- 学会等名
  Conference on Computational Physics (CCP2012)
- 発表場所
  Nichii Gakkan conference center, Kobe, Japan
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] Theoretical study on hydrated DNA systems by linear-scaling DFT code CONQUEST2011
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka, Tsuyoshi Miyazaki, David R.Bowler, Michael J.Gillan
- 学会等名
  The Seventh Congress of the International Society for Theoretical Chemical Physics (ISTCP-VII)
- 発表場所
  東京,日本
- 年月日
  2011-09-04
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] Binding energy calculations of FKBP complexes using the order-N DFT code CONQUEST2011
- 著者名/発表者名
  大塚教雄, 宮崎剛, 沖本憲明, 泰地真弘人, David R. Bowler, Michael J. Gillan
- 学会等名
  第3回バイオスーパーコンピューティングシンポジウム
- 発表場所
  神戸
- 年月日
  2011-02-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] 大規模電子状態計算によるタンパク質-薬物候補分子間の相互作用評価2011
- 著者名/発表者名
  大塚教雄
- 学会等名
  Nano-System Computational Science (NSCS) Group Seminar
- 発表場所
  つくば,日本(招待講演)
- 年月日
  2011-06-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] オーダーN法DFT計算プログラムの開発とDNA系に対する適用2011
- 著者名/発表者名
  大塚教雄, 宮崎剛, David R.Bowler, Michael J.Gillan
- 学会等名
  次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発第5回公開シンポジウム
- 発表場所
  甲南大学(兵庫県)
- 年月日
  2011-02-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] Binding energy calculations of FKBP complexes using the order-N DFT code CONQUEST2011
- 著者名/発表者名
  大塚教雄, 宮崎剛, 沖本憲明, 泰地真弘人, David R.Bowler, Michael J.Gillan
- 学会等名
  第3回バイオスーパーコンピューティングシンポジウム
- 発表場所
  計算科学研究機構(兵庫県)
- 年月日
  2011-02-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] オーダーN 法DFT 計算プログラムの開発とDNA 系に対する適用2011
- 著者名/発表者名
  大塚教雄, 宮崎剛, D. R. Bowler, M. J. Gillan
- 学会等名
  次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発第5回公開シンポジウム
- 発表場所
  神戸
- 年月日
  2011-02-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] Binding energy calculations of FKBP complexes using linear-scaling DFT code CONQUEST2011
- 著者名/発表者名
  T. Otsuka, T. Miyazaki, N. Okimoto, M. Taiji, D. R. Bowler, M. J. Gillan
- 学会等名
  Quantum Systems for Chemistry and Physics
- 発表場所
  金沢
- 年月日
  2011-09-15
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] Development of computational drug discovery by order-N first principles calculations2011
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka
- 学会等名
  CONQUEST Discussion Meeting
- 発表場所
  ロンドン,イギリス
- 年月日
  2011-09-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] Theoretical study on hydrated DNA systems by linear-scaling DFT code CONQUEST2011
- 著者名/発表者名
  T. Otsuka, T. Miyazaki, D. R. Bowler, M. J. Gillan
- 学会等名
  The Seventh Congress of the International Society for Theoretical Chemical Physics
- 発表場所
  東京
- 年月日
  2011-09-04
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] Binding energy calculations of FKBP complexes using the order-N DFT code CONQUEST2011
- 著者名/発表者名
  大塚教雄, 宮崎剛, 沖本憲明, 泰地真弘人, David R.Bowler, Michael J.Gillan
- 学会等名
  第3回バイオスーパーコンピューティングシンポジウム
- 発表場所
  神戸,兵庫
- 年月日
  2011-02-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] オーダーN法DFT計算プログラムの開発とDNA系に対する適用2011
- 著者名/発表者名
  大塚教雄, 宮崎剛, David R.Bowler, Michael J.Gillan
- 学会等名
  次世代ナノ統合シミュレーションソフトウェアの研究開発第5回公開シンポジウム
- 発表場所
  神戸,兵庫
- 年月日
  2011-02-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] Binding energy calculations of FKBP complexes using linear-scaling DFT code CONQUEST2011
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka, Tsuyoshi Miyazaki, Noriaki Okimoto, Makoto Taiji, David R.Bowler, Michael J.Gillan
- 学会等名
  Quantum Systems for Chemistry and Physics (QSCP16)
- 発表場所
  金沢,日本
- 年月日
  2011-09-15
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] オーダーN法第一原理計算を用いたDNA系の全エネルギーと力計算 -古典力場計算との比較-2010
- 著者名/発表者名
  大塚教雄, 宮崎剛, D. R. Bowler, M. J. Gillan
- 学会等名
  第24回分子シミュレーション討論会
- 発表場所
  福井
- 年月日
  2010-11-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] オーダーN法第一原理計算を用いたDNA系の全エネルギーと力の計算2010
- 著者名/発表者名
  大塚教雄, 宮崎剛, David R.Bowler, Michael J.Gillan
- 学会等名
  シンポジウム「電子状態理論の新機軸」
- 発表場所
  岡崎,日本
- 年月日
  2010-08-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] オーダーN法第一原理計算によるDNA系の大規模計算2010
- 著者名/発表者名
  大塚教雄
- 学会等名
  日本化学会第4回関東支部大会
- 発表場所
  筑波大学(茨城県)
- 年月日
  2010-08-31
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] Structure relaxation of FKBP(FK506 binding protein) complexes using the order-N DFT code CONQUEST2010
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka, Tsuyoshi Miyazaki, Noriaki Okimoto, Makoto Taiji, David R.Bowler, Michael J.Gillan
- 学会等名
  Psi_k Conference 2010
- 発表場所
  ベルリン(ドイツ)
- 年月日
  2010-09-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] Enzyme-induced polarization calculations of dihydrofolate reductase ligands using the linear scaling DFT code Conquest2010
- 著者名/発表者名
  A.S.Torralba、大塚教雄、Milica Todorovic, D.R.Bowler, 宮崎剛
- 学会等名
  Psi-k Conference 2010
- 発表場所
  ベルリン(ドイツ)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] O(N) DFT Study of biological systems using the Conquest code2010
- 著者名/発表者名
  宮崎剛、大塚教雄、Milica Todorovic, D.R.Bowler, M.J.Gillan
- 学会等名
  Psi-k Conference 2010
- 発表場所
  ベルリン(ドイツ)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] オーダーN法第一原理計算を用いたDNA系の全エネルギーと力計算-古典力場計算との比較-2010
- 著者名/発表者名
  大塚教雄, 宮崎剛, David R.Bowler, Michael J.Gillan
- 学会等名
  第24回分子シミュレーション討論会
- 発表場所
  福井県民ホール(福井県)
- 年月日
  2010-11-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] オーダーN法第一原理計算を用いたDNA系の全エネルギーと力の計算2010
- 著者名/発表者名
  大塚教雄, 宮崎剛, D. R. Bowler, M. J. Gillan
- 学会等名
  シンポジウム「電子状態の新機軸」
- 発表場所
  分子科学研究所(岡崎)
- 年月日
  2010-08-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] オーダーN法第一原理計算によるDNA系の大規模計算2010
- 著者名/発表者名
  大塚教雄
- 学会等名
  日本化学会第4回関東支部大会
- 発表場所
  筑波大学(つくば市)
- 年月日
  2010-08-31
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] オーダーN法第一原理計算によるDNA系の大規模計算2010
- 著者名/発表者名
  大塚教雄
- 学会等名
  日本化学会第4回関東支部大会
- 発表場所
  筑波大学(つくば)
- 年月日
  2010-08-31
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] オーダーN法第一原理計算によるDNA系の大規模計算2010
- 著者名/発表者名
  大塚教雄
- 学会等名
  日本化学会第4回関東支部大会
- 発表場所
  つくば,日本
- 年月日
  2010-08-31
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] オーダーN法第一原理計算を用いたDNA系の全エネルギーと力計算-古典力場計算との比較-2010
- 著者名/発表者名
  大塚教雄, 宮崎剛, David R.Bowler, Michael J.Gillan
- 学会等名
  第24回分子シミュレーション討論会
- 発表場所
  福井,福井
- 年月日
  2010-11-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] Structure relaxation of FKBP(FK506 binding protein) complexes using the order-N DFT code CONQUEST2010
- 著者名/発表者名
  T. Otsuka, T. Miyazaki, N. Okimoto, M. Taiji, D. R. Bowler, M. J. Gillan
- 学会等名
  Psi_k Conference 2010
- 発表場所
  Berlin, Germany
- 年月日
  2010-09-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790122
[学会発表] オーダーN法第一原理計算を用いたDNA系の全エネルギーと力の計算2010
- 著者名/発表者名
  大塚教雄, 宮崎剛, David R.Bowler, Michael J.Gillan
- 学会等名
  シンポジウム「電子状態理論の新機軸」
- 発表場所
  岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
- 年月日
  2010-08-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] gramicidin Aの構造と電子状態に対する第一原理計算2010
- 著者名/発表者名
  宮崎剛、大塚教雄、Milica Todorovic, D.R.Bowler, M.J.Gillan
- 学会等名
  日本物理学会 2010年秋季大会
- 発表場所
  大阪府立大学(大阪府)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] O(N) DFT Study of biological systems using the Conquest code2010
- 著者名/発表者名
  宮崎剛、大塚教雄、Milica Todorovic, D.R. Bowler, M.J. Gillan,
- 学会等名
  Psi-K Conference 2010
- 発表場所
  ベルリン(ドイツ)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] オーダーN法を用いたDNA系に対する大規模DFT計算-全エネルギーと力の検証-2009
- 著者名/発表者名
  大塚教雄
- 学会等名
  分子科学討論会
- 発表場所
  名古屋
- 年月日
  2009-09-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] DNAの構造と電子状態に対するオーダーN法第一原理計算32009
- 著者名/発表者名
  大塚教雄, 宮崎剛, 大野隆央, D. R. Bowler, M. J. Gillan
- 学会等名
  日本物理学会第64回年次大会
- 発表場所
  立教大学東京
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] Large-scale DFT calculations on DNA systems with the order-N DFT program CONQUEST2009
- 著者名/発表者名
  T. Otsuka, T. Miyazaki, T. Ohno, D. R. Bowler, M. J. Gillan
- 学会等名
  14th International Workshop on Computational Physics and Material Science
- 発表場所
  The Abdus Salam Internatioanl Centre for Theoretical Physics トリエステ(イタリア)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] Large-scale DFT calculations of DNA systems with the linear-scaling DFT program CONQUEST2009
- 著者名/発表者名
  大塚教雄
- 学会等名
  Joint Computational Science Workshop 2009
- 発表場所
  理化学研究所横浜研究所(横浜市)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] オーダーN法を用いたDNA系に対する大規模DFT計算-全エネルギーと力の検証-2009
- 著者名/発表者名
  大塚教雄
- 学会等名
  分子科学討論会
- 発表場所
  名古屋大学東山キャンパス(名古屋市)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] Theoretical study on total energy and atomic forces of hydrated DNA systems by CONQUEST code2009
- 著者名/発表者名
  大塚教雄
- 学会等名
  International Symposium of Electronic Structure Calculations-Theory, Correlated and Large Scale Systems and Numerical Methods-
- 発表場所
  東京大学(東京都)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] DNAの構造と電子状態に対するオーダーN法DFT計算22008
- 著者名/発表者名
  大塚教雄, 宮崎剛, 大野隆央, D. R. Bowler, M. J. Gillan
- 学会等名
  第2回分子科学討論会
- 発表場所
  福岡国際会議場福岡
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] Large-scale DFT calculations on biological systems with the CONQUEST code2008
- 著者名/発表者名
  T.Miyazaki, T.Otsuka, M.Todorovic, T.Ohno, D.R.Bowler, M.J.Gillan
- 学会等名
  The 11th Asian Workshop on First-Principles Electronic Structure Calculations
- 発表場所
  高雄(台湾)
- 年月日
  2008-11-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] DNAの構造と電子状態に対するオーダーN法第一原理計算22008
- 著者名/発表者名
  大塚教雄、宮崎剛、大野隆央、D.R.Bowler、M.J.Gillan
- 学会等名
  日本物理学会2008年秋季大会
- 発表場所
  岩手
- 年月日
  2008-09-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] Large-scale DFT calculations on biological systems with the CONQUEST code2008
- 著者名/発表者名
  T. Miyazaki, T. Otsuka, M. Todorovic, T. Ohno, D. R. Bowler, M. J. Gillan
- 学会等名
  The 11th Asian Workshop on First-Principles Electronic Structure Calculations
- 発表場所
  National Sun Yat-sen University 高雄(台湾)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] Large-scale DFT calculations on biological systems using a linear-scaling DFT code CONQUEST2008
- 著者名/発表者名
  T. Miyazaki, T. Otsuka, M. Todorovic, T. Ohno, D. R. Bowler, M. J. Gillan
- 学会等名
  1st International Conference of the Grand Challenge to Next-Generation Integrated Nanoscience
- 発表場所
  日本科学未来館東京
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] Large-scale DFT calculations with the CONQUEST code2008
- 著者名/発表者名
  T. Miyazaki, D. R. Bowler, M. J. Gillan, T. Otsuka, T. Ohno
- 学会等名
  International Conference of Computational Methods in Sciences and Engineering 2008
- 発表場所
  Hotel Belvedere Imperial クレタ(ギリシャ)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] DNAの構造と電子状態に対するオーダーN法第一原理計算22008
- 著者名/発表者名
  大塚教雄, 宮崎剛, 大野隆央, D. R. Bowler, M. J. Gillan
- 学会等名
  日本物理学会2008年秋季大会
- 発表場所
  岩手大学上田キャンパス岩手
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20540401
[学会発表] Assessment of Protein-ligand Binding Energy Calculation Using Fragment Molecular Orbital Method
- 著者名/発表者名
  Takao Otsuka, Noriaki Okimoto, Makoto Taiji
- 学会等名
  CBI Annual Meeting 2014
- 発表場所
  Funabori, Tokyo, Japan
- 年月日
  2014-10-28 – 2014-10-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26860084

1. 宮崎剛 (50354147)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 20件
2. 大野隆央 (30344435)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 10件
3. 篠田渉 (70357193)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 守橋健二 (90182261)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 6件
5. 井澤浩則 (50643235)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 6件
6. 松井亨 (70716076)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件

大塚 教雄 OTSUKA TAKAO

研究課題

研究成果

共同研究者

新奇光機能ナフタルイミド誘導体の理論・実験融合型基盤研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

大規模電子状態計算を基軸とした遷移状態アナログ分子設計法の技術構築研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

大規模分子系１電子軌道計算法を活用したインシリコ医薬分子設計の理論と技術開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

超大規模第一原理計算に基づいた複雑生体系の環境依存力場の作成

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

オーダーN法第一原理計算手法を導入したタンパク質機能制御分子最適化手法の基盤構築研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

オーダーN法第一原理計算による水溶液中DNAの構造安定性に対する研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Quantum chemical analysis of reaction indices and reaction path for drug molecules2019

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Quantum chemical analysis of reaction indices and reaction path for drug molecules2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Application of order-N first-principles DFT calculations with temperature controlled molecular dynamics to biomolecular system2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Theoretical study on photo-induced processes of 1-methyl-3-(N-(1,8-naphthalimidyl)ethyl)imidazolium halide species: an application of constrained density functional theory2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Use of the Multilayer Fragment Molecular Orbital Method to Predict the Rank Order of Protein-Ligand Binding Affinities: A Case Study Using Tankyrase 2 Inhibitors2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Linear-scaling first-principles molecular dynamics of complex biological systems with the CONQUEST code2016

著者名/発表者名

雑誌名

NAID

データソース

[雑誌論文] Assessment and Acceleration of Binding Energy Calculations for Protein-Ligand Complexes by the Fragment Molecular Orbital Method2015

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Structural relaxation and binding energy calculations of FK506 binding protein complexes using the large-scale DFT code CONQUEST2013

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] A quantum chemistry study of Ds-Pa unnatural DNA base pair2013

著者名/発表者名

大塚教雄 OTSUKA TAKAO