土屋裕子 Tsuchiya Yuko

研究者番号	30557773
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 情報・人間工学領域, 主任研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2018年度 – 2025年度: 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 情報・人間工学領域, 主任研究員 2017年度: 大阪大学, たんぱく質研究所, 助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / 生命・健康・医療情報学研究代表者以外学術変革領域研究区分(Ⅲ)
キーワード	研究代表者オートエンコーダー / 創薬 / 深層学習 / シミュレーション / 疾病発症機構 / 分子動力学シミュレーション / 創薬スクリーニング / スクリーニング / 天然変性領域 / コンピューターシミュレーション / 構造バイオインフォマティクス … もっと見る研究代表者以外 … もっと見る祖先型遺伝子 / 機械学習 / 分子進化 / 光合成 / 生命分子計算隠す

祖先型超分子の機械学習による光合成環境適応戦略の解読
- 研究代表者
  
  白井剛
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2027
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅲ)
- 研究機関
  長浜バイオ大学
オートエンコーダーを用いたSTINGの恒常的活性化メカニズムの解明研究代表者
- 研究代表者
  
  土屋裕子
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  国立研究開発法人産業技術総合研究所
天然変性領域の動態を考慮したヒトSTINGの新規リガンド探索と活性化機構の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  土屋裕子
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2022
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  国立研究開発法人産業技術総合研究所
   大阪大学

すべて 2022 2021 2020 2019 2018 2017

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Structure-based analyses of gut microbiome-related proteins by neural networks and molecular dynamics simulations2022
- 著者名/発表者名
  Taneishi Kei、Tsuchiya Yuko
- 雑誌名
  
  Current Opinion in Structural Biology
  
  巻: 73 ページ: 102336-102336
- DOI
  10.1016/j.sbi.2022.102336
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00405, KAKENHI-PROJECT-21K12134
[雑誌論文] Autoencoder-based detection of the residues involved in G protein-coupled receptor signaling2021
- 著者名/発表者名
  Tsuchiya Yuko、Taneishi Kei、Yonezawa Yasushige
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 11 号: 1 ページ: 19867-19867
- DOI
  10.1038/s41598-021-99019-z
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K05620, KAKENHI-PROJECT-17K00405
[雑誌論文] Autoencoder-Based Detection of Dynamic Allostery Triggered by Ligand Binding Based on Molecular Dynamics2019
- 著者名/発表者名
  Yuko Tsuchiya, Kei Taneishi, Yasushige Yonezawa
- 雑誌名
  
  J. Chem. Inf. Model.
  
  巻: 59 号: 9 ページ: 4043-4051
- DOI
  10.1021/acs.jcim.9b00426
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00405, KAKENHI-PROJECT-17K05620
[雑誌論文] 生物学研究の仮説生成のためのシミュレーション：学際研究への応用に向けて2017
- 著者名/発表者名
  土屋裕子、水口賢司
- 雑誌名
  
  シミュレーション
  
  巻: 36 ページ: 139-144
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00405
[学会発表] オートエンコーダーに基づくGPCRシグナル伝達経路解析2021
- 著者名/発表者名
  土屋裕子、種石慶、米澤康滋
- 学会等名
  第21回日本蛋白質科学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K12134
[学会発表] オートエンコーダーに基づくGPCRシグナル伝達経路解析2021
- 著者名/発表者名
  土屋裕子、種石慶、米澤康滋
- 学会等名
  第21回日本蛋白質科学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00405
[学会発表] Autoencoder-based analyses of dynamic allostery on GPCR2020
- 著者名/発表者名
  Tsuchiya Y, Taneishi K, Yonezawa Y
- 学会等名
  第58回日本生物物理学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00405
[学会発表] Autoencoder-based Analyses of Dynamic Allostery on Proteins by Regulator Binding2019
- 著者名/発表者名
  Tsuchiya Y, Taneishi K, Yonezawa Y
- 学会等名
  CBI学会2019年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00405
[学会発表] Autoencoder-based analyses of dynamic allostery on proteins by regulator binding2019
- 著者名/発表者名
  Tsuchiya Y, Taneishi K, Yonezawa Y
- 学会等名
  第57回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00405
[学会発表] Effects of single mutations on STING activation2018
- 著者名/発表者名
  土屋裕子、種石慶、米澤康滋
- 学会等名
  CBI学会2018年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00405
[学会発表] 分子動力学シミュレーションによる化合物活性の評価法の構築2017
- 著者名/発表者名
  土屋裕子、水口賢司
- 学会等名
  第17回日本蛋白質科学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00405

1. 白井剛 (00262890)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
2. 嶺井隆平 (20872451)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 土方敦司 (80415273)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 米澤康滋

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

土屋 裕子 Tsuchiya Yuko

研究課題

研究成果

共同研究者

祖先型超分子の機械学習による光合成環境適応戦略の解読

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

オートエンコーダーを用いたSTINGの恒常的活性化メカニズムの解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

天然変性領域の動態を考慮したヒトSTINGの新規リガンド探索と活性化機構の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Structure-based analyses of gut microbiome-related proteins by neural networks and molecular dynamics simulations2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Autoencoder-based detection of the residues involved in G protein-coupled receptor signaling2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Autoencoder-Based Detection of Dynamic Allostery Triggered by Ligand Binding Based on Molecular Dynamics2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] 生物学研究の仮説生成のためのシミュレーション：学際研究への応用に向けて2017

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[学会発表] オートエンコーダーに基づくGPCRシグナル伝達経路解析2021

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] オートエンコーダーに基づくGPCRシグナル伝達経路解析2021

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Autoencoder-based analyses of dynamic allostery on GPCR2020

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Autoencoder-based Analyses of Dynamic Allostery on Proteins by Regulator Binding2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Autoencoder-based analyses of dynamic allostery on proteins by regulator binding2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Effects of single mutations on STING activation2018

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 分子動力学シミュレーションによる化合物活性の評価法の構築2017

著者名/発表者名

学会等名

データソース

土屋裕子 Tsuchiya Yuko