吉田徹 YOSHIDA Toru

研究者番号	30724546
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 日本女子大学, 理学部, 助教
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2024年度: 日本女子大学, 理学部, 助教 2020年度 – 2022年度: 日本女子大学, 理学部, 助教 2019年度: 京都産業大学, 総合生命科学部, 研究員 2017年度 – 2018年度: 京都産業大学, 総合生命科学部, 研究助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分37020:生物分子化学関連 / 小区分43040:生物物理学関連 / 機能生物化学研究代表者以外小区分43040:生物物理学関連 / 小区分38030:応用生物化学関連 / 応用生物化学 / 医化学一般
キーワード	研究代表者クライオ電子顕微鏡 / トモグラフィー / セルロース / Cryo-EM / ミニセル / Cryo-ET / バクテリアセルロース / 結晶構造解析 / 翻訳後修飾 / X線結晶構造解析 / 基質特異性 / ADPリボシル化 … もっと見る研究代表者以外 … もっと見るクライオ電子顕微鏡 / タンパク質膜透過 / 二成分毒素 / DyP / ADPリボシル化 / Komagataeibacter xylinus / セルロース生産菌 / エンカプスリン / １分子測定 / トキシン膜透過システム / 膜孔形成毒素 / フォールディング / ADPリボシルトランスフェラーゼ / 複合体構造解析 / トランスロコン / 膜孔 / アンフォールド / 膜結合 / イオタ毒素 / 超分子複合体 / 単粒子解析 / ディフィシル菌 / ウェルシュ菌 / ＤｙＰ型ペルオキシダーゼ / タンパク質機能 / 立体構造のトポロジー / タンパク質工学 / 収束進化 / 分子進化 / DyP型ペルオキシダーゼ / 構造酵素学 / 複合体 / Rac1 / CPILE-a / 基質タンパク質認識 / 細菌毒素 / アクチン / 修飾アミノ酸認識機構 / 基質タンパク質認識機構 / Ia / X線結晶構造解析 / タンパク質複合体 / Cdc42 / RhoA / C3 / 基質特異性隠す

リポソーム単粒子解析で迫るトキシン膜透過システムの理解
- 研究代表者
  
  津下英明
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分43040:生物物理学関連
- 研究機関
  京都産業大学
酢酸菌によるセルロース繊維の結晶系制御システムの解明研究代表者
- 研究代表者
  
  吉田徹
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分37020:生物分子化学関連
- 研究機関
  日本女子大学
セルロース高生産菌に見るエンカプスリンとカーゴタンパク質としてのDyPの役割とは
- 研究代表者
  
  菅野靖史
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分38030:応用生物化学関連
- 研究機関
  日本女子大学
数十個のセルロース合成酵素複合体から１本のセルロース繊維が形成される仕組み研究代表者
- 研究代表者
  
  吉田徹
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分43040:生物物理学関連
- 研究機関
  日本女子大学
クライオ電子顕微鏡とX線結晶構造解析による二成分毒素トランスロコンの構造機能解析
- 研究代表者
  
  津下英明
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2019
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分43040:生物物理学関連
- 研究機関
  京都産業大学
モノADPリボシル化毒素に不可欠な2種類の特異性を理解する研究代表者
- 研究代表者
  
  吉田徹
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2019
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  機能生物化学
- 研究機関
  京都産業大学
ADPリボシル化酵素C3のRhoGTPase認識機構の解明
- 研究代表者
  
  津下英明
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2017
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  医化学一般
- 研究機関
  京都産業大学
立体構造のトポロジーから紐解くDyP型ペルオキシダーゼの合理的改変
- 研究代表者
  
  菅野靖史
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  応用生物化学
- 研究機関
  日本女子大学

すべて 2023 2022 2020 2019 2018 2017 2016 2015

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Unexpected diversity of dye-decolorizing peroxidases2023
- 著者名/発表者名
  Yoshida Toru、Sugano Yasushi
- 雑誌名
  
  Biochemistry and Biophysics Reports
  
  巻: 33 ページ: 101401-101401
- DOI
  10.1016/j.bbrep.2022.101401
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K15763
[雑誌論文] Cryo-EM structures of the translocational binary toxin complex CDTa-bound CDTb-pore from Clostridioides difficile2022
- 著者名/発表者名
  Kawamoto Akihiro、Yamada Tomohito、Yoshida Toru、Sato Yusui、Kato Takayuki、Tsuge Hideaki
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 13 号: 1 ページ: 6119-6119
- DOI
  10.1038/s41467-022-33888-4
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21J13410, KAKENHI-PROJECT-20K15763, KAKENHI-PROJECT-21H02452
[雑誌論文] Cryo-EM structures reveal translocational unfolding in the clostridial binary iota toxin complex2020
- 著者名/発表者名
  Yamada Tomohito、Yoshida Toru、Kawamoto Akihiro、Mitsuoka Kaoru、Iwasaki Kenji、Tsuge Hideaki
- 雑誌名
  
  Nature Structural & Molecular Biology
  
  巻: 27 号: 3 ページ: 288-296
- DOI
  10.1038/s41594-020-0388-6
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06170, KAKENHI-PROJECT-18K14639
[雑誌論文] Substrate N2 atom recognition mechanism in pierisin family DNA-targeting, guanine-specific ADP-ribosyltransferase ScARP2018
- 著者名/発表者名
  Yoshida Toru、Tsuge Hideaki
- 雑誌名
  
  Journal of Biological Chemistry
  
  巻: 293 号: 36 ページ: 13768-13774
- DOI
  10.1074/jbc.ac118.004412
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15095, KAKENHI-PROJECT-18K06170
[雑誌論文] Crystal structure and structure-based mutagenesis of actin-specific ADP-ribosylating toxin CPILE-a as novel enterotoxin.2017
- 著者名/発表者名
  Toniti, W., Yoshida, T., Tsurumura, T., Irikura, D., Monma, C., Kamata, Y., and Tsuge, H.
- 雑誌名
  
  PLoS ONE
  
  巻: 12 号: 2 ページ: e0171278-e0171278
- DOI
  10.1371/journal.pone.0171278
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16J09051, KAKENHI-PROJECT-15K08289
[雑誌論文] Comparative Studies of Actin- and Rho-Specific ADP-Ribosylating Toxins: Insight from Structural Biology2017
- 著者名/発表者名
  Tsuge H, Tsurumura T, Toda A, Murata H, Toniti W, Yoshida T.
- 雑誌名
  
  Curr Top Microbiol Immunol.
  
  巻: 399 ページ: 69-86
- DOI
  10.1007/82_2016_23
- ISBN
  9783319500461, 9783319500478
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K08289
[雑誌論文] Involvement of the Arg566 residue of Aeromonas sobria serine protease in substrate specificity.2017
- 著者名/発表者名
  Kobayashi H, Otsubo T, Teraoka F, Ikeda K, Seike S, Takahashi E, Okamoto K, Yoshida T, Tsuge H, Yamanaka H
- 雑誌名
  
  PLoS One
  
  巻: - 号: 10 ページ: e0186392-e0186392
- DOI
  10.1371/journal.pone.0186392
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K08289, KAKENHI-PROJECT-16K18926
[雑誌論文] Anabaena sp. DyP-type peroxidase is a tetramer consisting of two asymmetirc dimers2016
- 著者名/発表者名
  T. Yoshida, H.J.O. Ogola, Y. Amano, T. Hisabori, H. Ashida, Y. Sawa, H. Tsuge, Y. Sugano
- 雑誌名
  
  Proteins
  
  巻: 84 号: 1 ページ: 31-42
- DOI
  10.1002/prot.24952
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26450132
[雑誌論文] Conformational plasticity is crucial for C3-RhoA complex formation by ARTT-loop2015
- 著者名/発表者名
  Tsuge H, Yoshida T, Tsurumura T
- 雑誌名
  
  Pathog Dis
  
  巻: 73 号: 9 ページ: ftv094-ftv094
- DOI
  10.1093/femspd/ftv094
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K08289
[雑誌論文] Rho GTPase Recognition by C3 Exoenzyme Based on C3-RhoA Complex Structure2015
- 著者名/発表者名
  Toda A, Tsurumura T, Yoshida T, Tsumori Y, Tsuge H.
- 雑誌名
  
  J Biol Chem
  
  巻: 290 号: 32 ページ: 19423-32
- DOI
  10.1074/jbc.m115.653220
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K08289
[学会発表] Clostridium perfringens由来二成分毒素CPILEbの膜貫通孔は、セリンで形成された最狭窄部位を持つ2022
- 著者名/発表者名
  吉田徹、内田悠斗、山田等仁、津下英明
- 学会等名
  第68回トキシンシンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K15763
[学会発表] DNAを基質とするADPリボシル基転移酵素の基質認識機構2019
- 著者名/発表者名
  吉田徹、津下英明
- 学会等名
  酵素・補酵素研究会2019
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15095
[学会発表] Cryo-EM structure of clostridial binary toxin translocon Ib-pore2019
- 著者名/発表者名
  Yamada T, Yoshida T, Kawamoto A, Mitsuoka K, Iwasaki K, and Tsuge H
- 学会等名
  European Workshops on Bacterial Protein Toxins - ETOX19
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06170
[学会発表] Cryo-EM structure of clostridial binary toxin translocation channel Ib-pore2019
- 著者名/発表者名
  山田等仁、吉田徹、川本暁大、光岡薫、岩崎憲司、津下英明
- 学会等名
  第57回日本生物物理学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06170
[学会発表] Substrate recognition and reaction mechanism of DNA-targeting guanine-specific ADP-ribosyltransferase2018
- 著者名/発表者名
  Yoshida Toru、Tsuge Hideaki
- 学会等名
  International Symposium on “Proteins; from the Cradle to the Grave”
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15095
[学会発表] Membrane transport and ADP-ribosylation mechanism of binary toxin C. perfringens iota toxin2018
- 著者名/発表者名
  Yoshida　T, Yamada T, and Tsuge H
- 学会等名
  International Symposium on “Proteins; from the Cradle to the Grave”
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06170
[学会発表] Substrate recognition and reaction mechanism of DNA-targeting guanine-specific ADP-ribosyltransferase2018
- 著者名/発表者名
  Yoshida　T, and Tsuge H
- 学会等名
  International Symposium on “Proteins; from the Cradle to the Grave”
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06170
[学会発表] Substrate and target atom recognition mechanism of guanine-specific ADP-ribosyltransferase2018
- 著者名/発表者名
  Yoshida Toru、Tsuge Hideaki
- 学会等名
  第18回日本蛋白質科学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15095
[学会発表] Cryo-EM single particle analysis of C. perfringens binary toxin2018
- 著者名/発表者名
  Yamada T, Yoshida T, and Tsuge H
- 学会等名
  International Symposium on “Proteins; from the Cradle to the Grave”
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06170
[学会発表] Structure determination of Clostridium perfringens iota-like enterotoxin by X-ray crystallography2017
- 著者名/発表者名
  Toru Yoshida, Hidetomo Kobayashi, Hiroyasu Yamanaka, Hideaki Tsuge
- 学会等名
  ETOX18
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K08289
[学会発表] Crystal structure and structure-based mutagenesis of actin-specific ADP-ribosylating toxin CPILE-a as novel enterotoxin2017
- 著者名/発表者名
  Waraphan Toniti, Toru Yoshida, Toshiharu Tsurumura, Daisuke Irikura, Chie Monma, Youichi Kamata, Hideaki Tsuge
- 学会等名
  ETOX18
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K08289
[学会発表] Characterization of Actin ADP-ribosyltransferase from Clostridium perfringens iota-like enterotoxin2016
- 著者名/発表者名
  Waraphan Toniti, Toru Yoshida, Toshiharu Tsurumura, Daisuke Irikura, Chie Monma, Yoichi Kamata, and Hideaki Tsuge
- 学会等名
  ICC05-AEM2016
- 発表場所
  宇奈月国際会館（富山）
- 年月日
  2016-09-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K08289
[学会発表] ADP-ribosylation of RhoA by C3 exoenzyme.2016
- 著者名/発表者名
  Toru Yoshida, and Hideaki Tsuge
- 学会等名
  ICC05-AEM2016
- 発表場所
  宇奈月国際会館（富山）
- 年月日
  2016-09-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K08289
[学会発表] C3 exoenzymeとRhoA複合体の結晶構造解析に基づく基質特異性2016
- 著者名/発表者名
  津下英明、戸田暁之、鶴村俊治、吉田徹
- 学会等名
  日本分子生物学会
- 発表場所
  パシフィコ横浜（横浜）
- 年月日
  2016-12-02
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K08289
[学会発表] An improved classification of DyP-type peroxidase family accelerates the research of the family2015
- 著者名/発表者名
  Y. Sugano, T. Yoshida
- 学会等名
  FEMS 2015
- 発表場所
  マーストリヒト　オランダ
- 年月日
  2015-06-07
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26450132
[学会発表] Structural basis of ADP-ribosyltransferase C3 exoenzyme with RhoA complex2015
- 著者名/発表者名
  戸田暁之、鶴村俊治、吉田徹、津守耶良、津下英明
- 学会等名
  日本生物物理学会
- 発表場所
  金沢大学（石川県、金沢市）
- 年月日
  2015-09-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K08289

1. 津下英明 (40299342)

共同の研究課題数: 5件

共同の研究成果数: 17件
2. 菅野靖史 (90282855)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 2件
3. 杉田征彦 (00734469)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. TONITI WARAPHAN

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件

吉田 徹 YOSHIDA Toru

研究課題

研究成果

共同研究者

リポソーム単粒子解析で迫るトキシン膜透過システムの理解

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

酢酸菌によるセルロース繊維の結晶系制御システムの解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

セルロース高生産菌に見るエンカプスリンとカーゴタンパク質としてのDyPの役割とは

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

数十個のセルロース合成酵素複合体から１本のセルロース繊維が形成される仕組み研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

クライオ電子顕微鏡とX線結晶構造解析による二成分毒素トランスロコンの構造機能解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

モノADPリボシル化毒素に不可欠な2種類の特異性を理解する研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ADPリボシル化酵素C3のRhoGTPase認識機構の解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

立体構造のトポロジーから紐解くDyP型ペルオキシダーゼの合理的改変

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Unexpected diversity of dye-decolorizing peroxidases2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Cryo-EM structures of the translocational binary toxin complex CDTa-bound CDTb-pore from Clostridioides difficile2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Cryo-EM structures reveal translocational unfolding in the clostridial binary iota toxin complex2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Substrate N2 atom recognition mechanism in pierisin family DNA-targeting, guanine-specific ADP-ribosyltransferase ScARP2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Crystal structure and structure-based mutagenesis of actin-specific ADP-ribosylating toxin CPILE-a as novel enterotoxin.2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Comparative Studies of Actin- and Rho-Specific ADP-Ribosylating Toxins: Insight from Structural Biology2017

著者名/発表者名

雑誌名

吉田徹 YOSHIDA Toru