杉田昌岳 Sugita Masatake

研究者番号	30737523
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 東京科学大学, 情報理工学院, 研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2019年度 – 2024年度: 東京工業大学, 情報理工学院, 研究員 2018年度: 立命館大学, 生命科学部, 助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / 小区分43040:生物物理学関連
キーワード	研究代表者創薬 / 分子動力学シミュレーション / 3D-RISM理論 / 揺らぎ / 機械学習 / 膜透過 / 環状ペプチド / アンサンブルドッキング / ゆらぎ / フラグメントベースドッキング … もっと見る / 分子間相互作用 / 溶媒和 / 3D-RISM / ドッキング / インシリコ創薬 / 生物物理 / 3D－RISM / 統計力学理論 / 生物物理学 / 統計力学隠す

研究課題
(3件)
研究成果
(9件)

シミュレーションと学習による環状ペプチド膜透過性の汎用的・低コストな予測法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  杉田昌岳
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  東京工業大学
液体の統計力学理論を応用したフラグメントベースドッキング法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  杉田昌岳
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  東京工業大学
3D－RISM理論を応用した解析的な揺らぎ計算手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  杉田昌岳
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2020
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分43040:生物物理学関連
- 研究機関
  東京工業大学
   立命館大学

すべて 2023 2021 2020 2019 2018

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Computational Screening of a Functional Cyclodextrin Derivative for Suppressing a Side Effect of Doxorubicin2021
- 著者名/発表者名
  Sugita Masatake、Kuwano Izumi、Higashi Taishi、Motoyama Keiichi、Arima Hidetoshi、Hirata Fumio
- 雑誌名
  
  The Journal of Physical Chemistry B
  
  巻: 125 号: 9 ページ: 2308-2316
- DOI
  10.1021/acs.jpcb.1c00373
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14666
[雑誌論文] Molecular Recognition and Self-Organization in Life Phenomena Studied by a Statistical Mechanics of Molecular Liquids, the RISM/3D-RISM Theory2021
- 著者名/発表者名
  Sugita Masatake、Onishi Itaru、Irisa Masayuki、Yoshida Norio、Hirata Fumio
- 雑誌名
  
  Molecules
  
  巻: 26 号: 2 ページ: 271-271
- DOI
  10.3390/molecules26020271
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14666
[雑誌論文] New Protocol for Predicting the Ligand-Binding Site and Mode Based on the 3D-RISM/KH Theory2020
- 著者名/発表者名
  Sugita Masatake、Hamano Masataka、Kasahara Kota、Kikuchi Takeshi、Hirata Fumio
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Theory and Computation
  
  巻: 16 号: 4 ページ: 2864-2876
- DOI
  10.1021/acs.jctc.9b01069
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14666
[学会発表] Evaluation of the ability of 3D-RISM theory to identify the correct binding mode of small molecule ligands2023
- 著者名/発表者名
  Masatake Sugita
- 学会等名
  CBI学会2023年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K12106
[学会発表] 3D－RISM理論を応用した溶液中におけるペプチドの構造揺らぎの解析2020
- 著者名/発表者名
  杉田昌岳
- 学会等名
  第58回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14666
[学会発表] Developing a semi-analytical method for analyzing structural fluctuations of a molecule in solution phase by means of 3D-RISM theory2019
- 著者名/発表者名
  Masatake Sugita
- 学会等名
  The 10th TOYOTA RIKEN International Workshop
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14666
[学会発表] Analysis of structural fluctuations of Met-enkephalin in the solution phase by means of 3D-RISM theory2019
- 著者名/発表者名
  Masatake Sugita and Fumio Hirata
- 学会等名
  第57回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14666
[学会発表] 3D-RISM理論を応用した溶液中におけるMet-enkephalinの構造揺らぎの解析2018
- 著者名/発表者名
  杉田昌岳、平田文男
- 学会等名
  第 56 回生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14666
[学会発表] 3D-RISM理論を応用した生体高分子の機能解析法の開発2018
- 著者名/発表者名
  杉田昌岳
- 学会等名
  第 1 回松山道後・分子論セミナー
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14666

杉田 昌岳 Sugita Masatake

研究課題

研究成果

シミュレーションと学習による環状ペプチド膜透過性の汎用的・低コストな予測法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

液体の統計力学理論を応用したフラグメントベースドッキング法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

3D－RISM理論を応用した解析的な揺らぎ計算手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] Computational Screening of a Functional Cyclodextrin Derivative for Suppressing a Side Effect of Doxorubicin2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Molecular Recognition and Self-Organization in Life Phenomena Studied by a Statistical Mechanics of Molecular Liquids, the RISM/3D-RISM Theory2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] New Protocol for Predicting the Ligand-Binding Site and Mode Based on the 3D-RISM/KH Theory2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] Evaluation of the ability of 3D-RISM theory to identify the correct binding mode of small molecule ligands2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 3D－RISM理論を応用した溶液中におけるペプチドの構造揺らぎの解析2020

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Developing a semi-analytical method for analyzing structural fluctuations of a molecule in solution phase by means of 3D-RISM theory2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Analysis of structural fluctuations of Met-enkephalin in the solution phase by means of 3D-RISM theory2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 3D-RISM理論を応用した溶液中におけるMet-enkephalinの構造揺らぎの解析2018

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 3D-RISM理論を応用した生体高分子の機能解析法の開発2018

著者名/発表者名

学会等名

データソース

杉田昌岳 Sugita Masatake