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小野 純一  Ono Junichi

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 30777991
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 量子生命科学研究所, 主任研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2024年度: 早稲田大学, 理工学術院総合研究所(理工学研究所), その他(招聘研究員)
2022年度 – 2023年度: 早稲田大学, 理工学術院総合研究所(理工学研究所), 次席研究員
2020年度 – 2022年度: 京都大学, 実験と理論計算科学のインタープレイによる触媒・電池の元素戦略研究拠点ユニット, 特定研究員
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分32010:基礎物理化学関連 / 複合領域
研究代表者以外
大区分E
キーワード
研究代表者
自由エネルギー解析 / インシリコ創薬 / 量子分子動力学法 / バクテリオロドプシン / 微生物型ロドプシン / 光受容膜タンパク質 / 生体内プロトン輸送 / 大規模量子分子動力学法 / 高速分子動画 / 仮想スクリーニング … もっと見る / アロステリック共有結合阻害 / RASタンパク質 / 光生命化学 / 励起状態分子動力学 / 大規模量子分子動力学 / アニオンポンプ / NM-R3 / 異性化反応 / 酵素反応分子動力学法 / 共有結合阻害剤 / メインプロテアーゼ / SARS-CoV-2 / COVID-19 / 新型コロナウイルス / プロトン化状態 … もっと見る
研究代表者以外
GPUアクセラレータ / 励起状態ダイナミクス / 分割統治型密度汎関数強束縛法 / 励起状態 / 光活性イエロータンパク質(PYP) / バクテリオロドプシン(BR) / 量子的分子動力学(QMD)法 / 非断熱遷移 / 励起状 態 / 光活性イエロータンパク質 / FoF1-ATP合成酵素 / バクテリオロドプシン / 遍在プロトン / 量子的分子動力学法 / 光受容タンパク質 隠す
  • 研究課題

    (5件)
  • 研究成果

    (88件)
  • 共同研究者

    (5人)
  •  がん遺伝子産物RASのアロステリック共有結合阻害に向けた次世代型インシリコ創薬研究代表者

    • 研究代表者
      小野 純一
    • 研究期間 (年度)
      2024 – 2026
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分32010:基礎物理化学関連
    • 研究機関
      早稲田大学
  •  高速分子動画と大規模励起状態分子動力学の共創が拓く光生命化学現象の解明研究代表者

    • 研究代表者
      小野 純一
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2023
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      早稲田大学
  •  新型コロナ標的タンパク質の共有結合阻害に向けた酵素反応分子動力学シミュレーション研究代表者

    • 研究代表者
      小野 純一
    • 研究期間 (年度)
      2021 – 2023
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分32010:基礎物理化学関連
    • 研究機関
      早稲田大学
      京都大学
  •  分子動画に基づく大規模量子分子動力学法による生体内プロトン輸送機構の解明研究代表者

    • 研究代表者
      小野 純一
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2021
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      京都大学
  •  光受容タンパク質の量子的分子動力学シミュレーションによる遍在プロトンの機能解明

    • 研究代表者
      中井 浩巳
    • 研究期間 (年度)
      2018 – 2022
    • 研究種目
      基盤研究(S)
    • 審査区分
      大区分E
    • 研究機関
      早稲田大学

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2019 2018

すべて 雑誌論文 学会発表

  • [雑誌論文] Exploring multiple reaction pathways in the proteolysis of SARS-CoV-2 main protease through large-scale quantum molecular dynamics2024

    • 著者名/発表者名
      J. Ono, U. Koshimizu, Y. Fukunishi, H. Nakai
    • 雑誌名

      Research Square

      巻: -

    • DOI

      10.21203/rs.3.rs-4036418/v1

    • オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04993, KAKENHI-PUBLICLY-22H04749
  • [雑誌論文] Conformational Dynamics in Proteins: Entangled Slow Fluctuations and Nonequilibrium Reaction Events2023

    • 著者名/発表者名
      Ono Junichi、Matsumura Yoshihiro、Mori Toshifumi、Saito Shinji
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 128 号: 1 ページ: 20-32

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.3c05307

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K17361, KAKENHI-PUBLICLY-22H04749, KAKENHI-PROJECT-21H04676, KAKENHI-PROJECT-23K23303
  • [雑誌論文] Updating view of membrane transport proteins by simulation studies2023

    • 著者名/発表者名
      T. Sumikama, B. Corry, J. Ono, C. Kobayashi, K. Okazaki
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 20 号: 4 ページ: n/a

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v20.0041

    • ISSN
      2189-4779
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04749
  • [雑誌論文] 分子動力学シミュレーションによる生体分子中での化学反応機構と構造変化ダイナミクスの解明2023

    • 著者名/発表者名
      小野 純一
    • 雑誌名

      理論化学会誌「フロンティア」

      巻: 5 ページ: 62-72

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04749
  • [雑誌論文] COVID-19の経口治療薬開発に向けたハイブリッド型<i>in Silico</i>創薬2022

    • 著者名/発表者名
      U. Koshimizu, J. Ono, Y. Fukunishi, H. Nakai
    • 雑誌名

      Journal of Computer Chemistry, Japan

      巻: 21 号: 2 ページ: 48-51

    • DOI

      10.2477/jccj.2022-0029

    • ISSN
      1347-1767, 1347-3824
    • 言語
      日本語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04993, KAKENHI-PROJECT-18H05264, KAKENHI-PUBLICLY-22H04749
  • [雑誌論文] Hydroxide Ion Mechanism for Long‐Range Proton Pumping in the Third Proton Transfer of Bacteriorhodopsin2022

    • 著者名/発表者名
      Ono Junichi、Okada Chika、Nakai Hiromi
    • 雑誌名

      ChemPhysChem

      巻: 23 号: 22

    • DOI

      10.1002/cphc.202200109

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264, KAKENHI-PUBLICLY-22H04749
  • [雑誌論文] Multiple protonation states in ligand-free SARS-CoV-2 main protease revealed by large-scale quantum molecular dynamics simulations2022

    • 著者名/発表者名
      Ono Junichi、Koshimizu Uika、Fukunishi Yoshifumi、Nakai Hiromi
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 794 ページ: 139489-139489

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2022.139489

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05447, KAKENHI-PROJECT-18H05264, KAKENHI-PROJECT-21K04993
  • [雑誌論文] Analysis of the behavior of Zn atoms with a Pb additive on the surface during Zn electrodeposition2022

    • 著者名/発表者名
      Onabuta Yusuke、Kunimoto Masahiro、Ono Fumimasa、Fukunaka Yasuhiro、Nakai Hiromi、Zangari Giovanni、Homma Takayuki
    • 雑誌名

      Electrochemistry Communications

      巻: 138 ページ: 107291-107291

    • DOI

      10.1016/j.elecom.2022.107291

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264, KAKENHI-PROJECT-23K21041, KAKENHI-PROJECT-20J23239
  • [雑誌論文] Quantum-Mechanical Molecular Dynamics Simulations on Secondary Proton Transfer in Bacteriorhodopsin Using Realistic Models2021

    • 著者名/発表者名
      Nakai Hiromi、Takemura Toshiaki、Ono Junichi、Nishimura Yoshifumi
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 125 号: 39 ページ: 10947-10963

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.1c06231

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05447, KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [雑誌論文] バクテリオロドプシンの分子動画に基づく大規模量子分子動力学法によるプロトン移動反応の解析2021

    • 著者名/発表者名
      小野 純一,今井 みの莉,西村 好史,中井 浩巳
    • 雑誌名

      分子シミュレーション学会誌アンサンブル

      巻: 23 ページ: 171-175

    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05447
  • [雑誌論文] Weighted histogram analysis method for multiple short-time metadynamics simulations2020

    • 著者名/発表者名
      Ono Junichi、Nakai Hiromi
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 751 ページ: 137384-137384

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2020.137384

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [雑誌論文] Hydroxide Ion Carrier for Proton Pumps in Bacteriorhodopsin: Primary Proton Transfer2020

    • 著者名/発表者名
      Ono Junichi、Imai Minori、Nishimura Yoshifumi、Nakai Hiromi
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 124 号: 39 ページ: 8524-8539

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.0c05507

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05447, KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [雑誌論文] Catalytic Dehydrogenation of Ethane over Doped Perovskite via the Mars?van Krevelen Mechanism2020

    • 著者名/発表者名
      Toko Kenta、Ito Kazuharu、Saito Hikaru、Hosono Yukiko、Murakami Kota、Misaki Satoshi、Higo Takuma、Ogo Shuhei、Tsuneki Hideaki、Maeda Shun、Hashimoto Kunihide、Nakai Hiromi、Sekine Yasushi
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry C

      巻: 124 号: 19 ページ: 10462-10469

    • DOI

      10.1021/acs.jpcc.0c00138

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H01344, KAKENHI-PROJECT-19J10015, KAKENHI-PROJECT-18K04839, KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [雑誌論文] Development of Large-Scale Excited-State Calculations Based on the Divide-and-Conquer Time-Dependent Density Functional Tight-Binding Method2019

    • 著者名/発表者名
      Komoto Nana、Yoshikawa Takeshi、Ono Junichi、Nishimura Yoshifumi、Nakai Hiromi
    • 雑誌名

      Journal of Chemical Theory and Computation

      巻: 15 号: 3 ページ: 1719-1727

    • DOI

      10.1021/acs.jctc.8b01214

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [雑誌論文] 光受容タンパク質の機構解明に向けた分割統治型時間依存密度汎関数強束縛法の開発2018

    • 著者名/発表者名
      KOMOTO Nana、YOSHIKAWA Takeshi、ONO Junichi、NAKAI Hiromi
    • 雑誌名

      Journal of Computer Chemistry, Japan

      巻: 17 号: 3 ページ: 127-129

    • DOI

      10.2477/jccj.2018-0032

    • NAID

      130007498426

    • ISSN
      1347-1767, 1347-3824
    • 言語
      日本語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] 量子分子動力学法による生体化学反応機構の解明2024

    • 著者名/発表者名
      小野 純一
    • 学会等名
      スーパーコンピュータワークショップ2023「シミュレーション、インフォマティクス、AIによる生体分子科学の最前線」
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04993
  • [学会発表] 発がん性KRAS(G12D)を標的とした共有結合阻害剤のインシリコ創薬研究2024

    • 著者名/発表者名
      小野 純一
    • 学会等名
      第36回新学術領域「高速分子動画」オンラインセミナー
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04749
  • [学会発表] 量子分子動力学法による生体化学反応機構の解明2024

    • 著者名/発表者名
      小野 純一
    • 学会等名
      スーパーコンピュータワークショップ2023「シミュレーション、インフォマティクス、AIによる生体分子科学の最前線」
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04749
  • [学会発表] Discovery of potent covalent inhibitors against SARS-CoV-2 main protease by hybrid in silico drug study2023

    • 著者名/発表者名
      Uika Koshimizu, Junichi Ono, Yoshifumi Fukunishi, Hiromi Nakai
    • 学会等名
      The 61st Annual Meeting of Biophysical Society of Japan
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04993
  • [学会発表] がん遺伝子産物RASのアロステリック共有結合阻害剤の開発に向けたハイブリッド型in silico創薬2023

    • 著者名/発表者名
      橋本 拓也,小野 純一,小清水 初花,中井 浩巳
    • 学会等名
      第37回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04993
  • [学会発表] Unification of molecular movies and quantum molecular dynamics2023

    • 著者名/発表者名
      Junichi Ono
    • 学会等名
      “Molecular Movies” International Symposium 2023
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04749
  • [学会発表] Proton transfer reactions in proteins revealed by quantum molecular dynamics2023

    • 著者名/発表者名
      Junichi Ono
    • 学会等名
      The 6th China-Japan-Korea tripartite Workshop on Theoretical and Computational Chemistry (CJK-WTCC-VI)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04993
  • [学会発表] Discovery and evaluation of potent covalent inhibitors targeting SARS-CoV-2 main protease by hybrid in silico drug study2023

    • 著者名/発表者名
      Uika Koshimizu, Junichi Ono, Yoshifumi Fukunishi, Hiromi Nakai
    • 学会等名
      Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2023
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04993
  • [学会発表] 量子分子動力学計算による塩化物イオンポンプロドプシンNM-R3の異性化反応の解明2023

    • 著者名/発表者名
      小野 純一
    • 学会等名
      令和5年度新学術領域研究「高速分子動画」シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04749
  • [学会発表] Discovery of potent covalent inhibitors against SARS-CoV-2 main protease by hybrid in silico drug study2023

    • 著者名/発表者名
      Uika Koshimizu, Junichi Ono, Yoshifumi Fukunishi, Hiromi Nakai
    • 学会等名
      The 61st Annual Meeting of Biophysical Society of Japan
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04749
  • [学会発表] がん遺伝子産物RASのアロステリック共有結合阻害剤の開発に向けたハイブリッド型in silico創薬2023

    • 著者名/発表者名
      橋本 拓也,小野 純一,小清水 初花,中井 浩巳
    • 学会等名
      第37回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04749
  • [学会発表] Proton transfer reactions in proteins revealed by quantum molecular dynamics2023

    • 著者名/発表者名
      Junichi Ono
    • 学会等名
      The 6th China-Japan-Korea tripartite Workshop on Theoretical and Computational Chemistry (CJK-WTCC-VI)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04749
  • [学会発表] Discovery and evaluation of potent covalent inhibitors targeting SARS-CoV-2 main protease by hybrid in silico drug study2023

    • 著者名/発表者名
      Uika Koshimizu, Junichi Ono, Yoshifumi Fukunishi, Hiromi Nakai
    • 学会等名
      Chem-Bio Informatics Society (CBI) Annual Meeting 2023
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04749
  • [学会発表] Hybrid in silico drug study based on quantum molecular dynamics with virtual screening and docking2023

    • 著者名/発表者名
      Junichi Ono
    • 学会等名
      “Molecular Movies” International Symposium 2023
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04749
  • [学会発表] SARS-CoV-2メインプロテアーゼを対象としたハイブリッド型in-silico創薬研究2022

    • 著者名/発表者名
      小清水初花,小野純一,福西快文,中井浩巳
    • 学会等名
      日本コンピュータ化学会2022年春季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] 量子分子動力学法によるSARS-CoV-2メインプロテアーゼ阻害薬の反応機構の解明2022

    • 著者名/発表者名
      小野 純一,小清水 初花,福西 快文,中井 浩巳
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04993
  • [学会発表] Unification of molecular movies and large-scale quantum molecular dynamics2022

    • 著者名/発表者名
      Junichi Ono
    • 学会等名
      International symposium “The molecular movies and beyond”
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04749
  • [学会発表] 非在来型反応場のシミュレーションに基づく理論設計~相互理解のための過去研究の紹介~2022

    • 著者名/発表者名
      中井浩巳,小野純一,藤波美起登,藤澤遼
    • 学会等名
      環境省PJ 第1回A2-BC1合同研究会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] SARS-CoV-2メインプロテアーゼに対する量子分子動力学法に基づくin silico創薬研究2022

    • 著者名/発表者名
      小野 純一,小清水 初花,福西 快文,中井 浩巳
    • 学会等名
      第16回分子科学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04993
  • [学会発表] 汎用原子レベルシミュレータMatlantisを用いた動力学計算による溶液系における動的物性の検証2022

    • 著者名/発表者名
      森 直輝,小野純一,小島隆嗣,中井浩巳
    • 学会等名
      日本コンピュータ化学会2022年秋季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] Unification of molecular movies and large-scale quantum molecular dynamics2022

    • 著者名/発表者名
      Junichi Ono
    • 学会等名
      International symposium “The molecular movies and beyond”
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04993
  • [学会発表] SARS-CoV-2メインプロテアーゼの共有結合阻害剤開発に向けたハイブリッド型in-silico創薬研究2022

    • 著者名/発表者名
      小清水 初花,小野 純一,福西 快文,中井 浩巳
    • 学会等名
      第24回理論化学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] Fo回転分子モーターにおけるプロトン伝導機構解明に向けた量子的分子動力学計算の適用2022

    • 著者名/発表者名
      広本拓麻,パーキン暖,神山幸成,大貫隼,小野純一,西村好史,中井浩巳,高野光則
    • 学会等名
      日本物理学会 第77回年次大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] SARS-CoV-2メインプロテアーゼの新規共有結合阻害剤の開発に向けたハイブリッド型in silico創薬2022

    • 著者名/発表者名
      小清水初花,小野純一,福西快文,中井浩巳
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] SARS-CoV-2メインプロテアーゼの新規共有結合阻害剤の開発に向けたハイブリッド型in silico創薬2022

    • 著者名/発表者名
      小清水 初花,小野 純一,福西 快文,中井 浩巳
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04993
  • [学会発表] 汎用原子レベルシミュレータMatlantisを用いた動力学計算による溶液系における動的物性の検証2022

    • 著者名/発表者名
      森 直輝, 小野 純一, 小島 隆嗣, 中井 浩巳
    • 学会等名
      日本コンピュータ化学会2022年秋季年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04749
  • [学会発表] SARS-CoV-2メインプロテアーゼの共有結合阻害剤開発に向けたハイブリッド型in-silico創薬研究2022

    • 著者名/発表者名
      小清水 初花,小野 純一,福西 快文,中井 浩巳
    • 学会等名
      第24回理論化学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04993
  • [学会発表] SARS-CoV-2メインプロテアーゼを対象としたハイブリッド型in-silico創薬研究2022

    • 著者名/発表者名
      小清水 初花,小野 純一,福西 快文,中井 浩巳
    • 学会等名
      日本コンピュータ化学会2022年春季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04993
  • [学会発表] Bacteriorhodopsin utilizes hydronium and hydroxide ions for proton pumping2022

    • 著者名/発表者名
      Junichi Ono, Minori Imai, Toshiaki Takemura, Chika Okada, Hiromi Nakai
    • 学会等名
      19th International Conference on Retinal Proteins
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04749
  • [学会発表] SARS-CoV-2メインプロテアーゼに対する量子分子動力学法に基づくin silico創薬研究2022

    • 著者名/発表者名
      小野純一,小清水初花,福西快文,中井浩巳
    • 学会等名
      第16回分子科学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] 大規模量子分子動力学法による塩化物イオンポンプロドプシンのイオン輸送機構の解明2022

    • 著者名/発表者名
      小野 純一
    • 学会等名
      令和4年度新学術領域研究「高速分子動画」シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04749
  • [学会発表] Bacteriorhodopsin utilizes hydronium and hydroxide ions for proton pumping2022

    • 著者名/発表者名
      Junichi Ono, Minori Imai, Toshiaki Takemura, Chika Okada, Hiromi Nakai
    • 学会等名
      19th International Conference on Retinal Proteins (ICRP19)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] 量子分子動力学法によるSARS-CoV-2メインプロテアーゼ阻害薬の反応機構の解明2022

    • 著者名/発表者名
      小野純一,小清水初花,福西快文,中井浩巳
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] 大規模量子メタダイナミクス法によるSARS-CoV-2メインプロテアーゼの酵素反応機構の解明2021

    • 著者名/発表者名
      小清水 初花,小野 純一,福西 快文,中井 浩巳
    • 学会等名
      第35回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04993
  • [学会発表] バクテリオロドプシンのプロトン輸送ダイナミクスに関する理論的研究 (3)2021

    • 著者名/発表者名
      竹村俊晃,小野純一,西村好史,中井浩巳
    • 学会等名
      第8回HPCIシステム利用研究課題 成果報告会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] SARS-CoV-2メインプロテアーゼのプロトン化状態に関する量子分子動力学シミュレーション2021

    • 著者名/発表者名
      小野 純一,中井 浩巳
    • 学会等名
      第23回理論化学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05447
  • [学会発表] CeO2表面におけるNO-CO反応に対する遷移金属置換効果の理論的解析2021

    • 著者名/発表者名
      藤代天佑, 小野純一, 中井浩巳
    • 学会等名
      日本化学会第101春季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] SARS-CoV-2メインプロテアーゼのプロトン化状態に関する量子分子動力学シミュレーション2021

    • 著者名/発表者名
      小野 純一,中井 浩巳
    • 学会等名
      第23回理論化学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04993
  • [学会発表] 分割統治型密度汎関数強束縛メタダイナミクスによるSARS-CoV-2メインプロテアーゼの切断反応機構の解明2021

    • 著者名/発表者名
      小清水初花,小野純一,福西快文,中井浩巳
    • 学会等名
      日本コンピュータ化学会2021年秋季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] 大規模量子メタダイナミクス法によるSARS-CoV-2メインプロテアーゼの酵素反応機構の解明2021

    • 著者名/発表者名
      小清水初花,小野純一,福西快文,中井浩巳
    • 学会等名
      第35回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] SARS-CoV-2メインプロテアーゼのプロトン化状態に関する量子分子動力学シミュレーション2021

    • 著者名/発表者名
      小野純一,中井浩巳
    • 学会等名
      第23回理論化学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] Quantum molecular dynamics simulations for diffusion processes in concentrated electrolyte solutions for sodium-ion batteries2021

    • 著者名/発表者名
      Junichi Ono, Yuta Tsuchiya, Hiromi Nakai
    • 学会等名
      Materials Research Meeting 2021 (MRM2021)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] 分割統治型密度汎関数強束縛メタダイナミクスによるSARS-CoV-2メインプロテアーゼの切断反応機構の解明2021

    • 著者名/発表者名
      小清水 初花,小野 純一,福西 快文,中井 浩巳
    • 学会等名
      日本コンピュータ化学会2021年秋季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04993
  • [学会発表] 大規模量子メタダイナミクス法によるSARS-CoV-2メインプロテアーゼの酵素反応機構の解明2021

    • 著者名/発表者名
      小清水 初花,小野 純一,福西 快文,中井 浩巳
    • 学会等名
      第35回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05447
  • [学会発表] 分割統治型密度汎関数強束縛メタダイナミクスによるSARS-CoV-2メインプロテアーゼの切断反応機構の解明2021

    • 著者名/発表者名
      小清水 初花,小野 純一,福西 快文,中井 浩巳
    • 学会等名
      日本コンピュータ化学会2021年秋季年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05447
  • [学会発表] Microscopic mechanisms of proton transfers in bacteriorhodopsin revealed by quantum molecular dynamics method based on molecular movies2020

    • 著者名/発表者名
      Junichi Ono
    • 学会等名
      The 58th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05447
  • [学会発表] バクテリオロドプシンの分子動画に基づく全量子分子動力学シミュレーションを用いたプロトン放出機構の解明2020

    • 著者名/発表者名
      竹村 俊晃,小野 純一,西村 好史,中井 浩巳
    • 学会等名
      第10回CSJ化学フェスタ2020
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05447
  • [学会発表] 分割統治型密度汎関数強束縛メタダイナミクス計算の高効率化とバクテリオロドプシンのプロトン輸送への応用2020

    • 著者名/発表者名
      小野 純一,竹村 俊晃,西村 好史,中井 浩巳
    • 学会等名
      第34回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05447
  • [学会発表] 分割統治型密度汎関数強束縛メタダイナミクス計算の高効率化とバクテリオロドプシンのプロトン輸送への応用2020

    • 著者名/発表者名
      小野純一, 竹村俊晃, 西村好史, 中井浩巳
    • 学会等名
      第34回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] 分子動画に基づく全量子分子動力学法によるバクテリオロドプシンのプロトン貯蔵、放出および拡散過程に関する理論的研究2020

    • 著者名/発表者名
      竹村俊晃, 小野純一, 西村好史, 中井浩巳
    • 学会等名
      分子科学会 オンライン討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] バクテリオロドプシンの分子動画に基づく全量子分子動力学シミュレーションを用いたプロトン放出機構の解明2020

    • 著者名/発表者名
      竹村俊晃, 小野純一, 西村好史, 中井浩巳
    • 学会等名
      第10回CSJ化学フェスタ2020
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] 分子動画に基づく全量子分子動力学法によるバクテリオロドプシンのプロトン貯蔵,放出および拡散過程に関する理論的研究2020

    • 著者名/発表者名
      竹村 俊晃,小野 純一,西村 好史,中井 浩巳
    • 学会等名
      分子科学会オンライン討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05447
  • [学会発表] 難燃性濃厚電解液におけるNaイオン拡散の理論的解析2020

    • 著者名/発表者名
      土屋佑太, 小野純一, 中井浩巳
    • 学会等名
      第34回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] バクテリオロドプシンのプロトン貯蔵・放出過程に関する大規模量子的分子動力学シミュレーション2019

    • 著者名/発表者名
      竹村俊晃、小野純一、西村好史、中井浩巳
    • 学会等名
      第9回CSJ化学フェスタ2019
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] Practical excited-state simulation of thousands of atoms2019

    • 著者名/発表者名
      Nana Komoto, Takeshi Yoshikawa, Junichi Ono, Yoshifumi Nishimura, Hiromi Nakai
    • 学会等名
      The Ninth Conference of the Asia-Pacific Association of Theoretical and Computational Chemists(APATCC2019)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] Long-time quantum molecular dynamics simulations based on divide-and-conquer density-functional tight-binding method for sodium-ion transport in electrolyte solutions2019

    • 著者名/発表者名
      Junichi Ono, Chien-Pin Chou, Hiromi Nakai
    • 学会等名
      CECAM-Workshop ”Thinking outside the box-beyond machine learning for quantum chemistry”
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] バクテリオロドプシンのプロトン貯蔵・放出過程に関するDC-DFTB-MDシミュレーション2019

    • 著者名/発表者名
      竹村俊晃、小野純一、西村好史、中井浩巳
    • 学会等名
      第33回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] Clarification of proton transfer reactions in photoreceptive proteins using large-scale quantum molecular dynamics simulations2019

    • 著者名/発表者名
      Junichi Ono, Chika Okada, Yoshifumi Nishimura, Hiromi Nakai
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] DC-DFTB-MD法によるバクテリオロドプシンの長距離プロトン移動反応の理論的解析2019

    • 著者名/発表者名
      小野純一、岡田千果、西村好史、中井浩巳
    • 学会等名
      第22回理論化学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] 光受容タンパク質の光励起プロトンダイナミクスの研究2019

    • 著者名/発表者名
      吉川武司、河本奈々、小野純一、今井みの莉、中井浩巳
    • 学会等名
      第6回「京」を中核とするHPCIシステム利用研究課題成果報告会ースーパーコンピュータ「富岳」の胎動、計算科学、AIの融合に向けてー
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] バクテリオロドプシンの高速分子動画に基づく全量子MDシミュレーション2019

    • 著者名/発表者名
      小野純一、今井みの莉、岡田千果、西村好史、中井浩巳
    • 学会等名
      新学術領域研究「高速分子動画」キックオフミーティング・膜タンパク質研究会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] Large-scale quantum-mechanical molecular dynamics simulations for the long-distance proton transfer in bacteriorhodopsin2019

    • 著者名/発表者名
      Junichi Ono, Chika Okada, Yoshifumi Nishimura, Hiromi Nakai
    • 学会等名
      The Ninth Conference of the Asia-Pacific Association of Theoretical and Computational Chemists(APATCC2019)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] 密度汎関数強束縛法によるPhナノクラスター上のNO解離過程の理論的解析2019

    • 著者名/発表者名
      中村崇玖、周健斌、吉川武司、大越昌樹、小野純一、Aditya Wibawa Sakti、中井浩巳
    • 学会等名
      第13回分子科学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] Development of large-scale excited-state calculation method and applied research on photoactive yellow protein2018

    • 著者名/発表者名
      Nana Komoto, Takeshi Yoshikawa, Junichi Ono, Hiromi Nakai
    • 学会等名
      第56回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] バクテリオロドプシンの長距離プロトン移動過程に対するDC-DFTB-MDシミュレーション2018

    • 著者名/発表者名
      岡田 千果,小野 純一,西村 好史,中井 浩巳
    • 学会等名
      第32回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] メタダイナミクスに基づく重み付きヒストグラム解析法の開発とシクロファン異性化反応への応用2018

    • 著者名/発表者名
      小野純一,西村好史,黄毅聰,鹿又宣弘,中井浩巳
    • 学会等名
      日本コンピュータ化学会2018春季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] バクテリオロドプシンのプロトン輸送ダイナミクスに関する理論的研究2018

    • 著者名/発表者名
      小野純一,今井みの莉,西村好史,中井浩巳
    • 学会等名
      第5回「京」を中核とするHPCIシステム利用研究課題 成果報告会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] Large-scale quantum-mechanical molecular dynamics simulations for the primary proton transfer in bacteriorhodopsin2018

    • 著者名/発表者名
      Junichi Ono, Minori Imai, Yoshifumi Nishimura, Hiromi Nakai
    • 学会等名
      第56回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] 分割統治型時間依存密度汎関数強束縛法に基づく大規模励起状態ダイナミクス2018

    • 著者名/発表者名
      河本奈々,吉川武司,小野純一,中井浩巳
    • 学会等名
      第21回理論化学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] 重み付きヒストグラム解析法のメタダイナミクスへの拡張とシクロファン異性化反応への応用2018

    • 著者名/発表者名
      小野純一,西村好史,黄毅聰,鹿又宣弘,中井浩巳
    • 学会等名
      第21回理論化学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] 光受容タンパク質の機構解明に向けた分割統治型時間依存密度汎関数強束縛法の開発2018

    • 著者名/発表者名
      河本奈々,吉川武司,小野純一,中井浩巳
    • 学会等名
      日本コンピュータ化学会2018春季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] バクテリオロドプシンの1段階目のプロトン移動過程に対するDC-DFTB-MDシミュレーション2018

    • 著者名/発表者名
      小野 純一,今井 みの莉,西村 好史,中井 浩巳
    • 学会等名
      第32回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • [学会発表] Divide-and-Conquer density-functional tight-binding molecular dynamics simulations for the primary proton transfer in bacteriorhodopsin2018

    • 著者名/発表者名
      Junichi Ono
    • 学会等名
      Telluride workshop on "Multi-scale quantum mechanical analysis of condensed phase systems: methods and applications"
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05264
  • 1.  中井 浩巳 (00243056)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 42件
  • 2.  吉川 武司 (10754799)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 7件
  • 3.  高野 光則 (40313168)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 4.  関根 泰
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 5.  齊藤 真司
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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