鬼丸洸 Onimaru Koh

研究者番号	30787065
その他のID	https://orcid.org/0000-0002-2428-9510
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2022年度 – 2023年度: 名古屋大学, 医学系研究科, 助教 2018年度 – 2019年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 基礎科学特別研究員 2017年度: 国立研究開発法人理化学研究所, ライフサイエンス技術基盤研究センター, 研究員
審査区分/研究分野	研究代表者小区分43060:システムゲノム科学関連 / 発生生物学
キーワード	研究代表者深層学習 / エピジェノミクス / 体細胞変異 / 非コード配列 / がんゲノム / 進化発生学 / ゲノム配列比較解析 / 次世代シーケンサー / 遺伝子制御 / 機械学習 … もっと見る / 転写制御 / ゲノム解析 / ディープラーニング / 転写制御配列 / 形態形成隠す

深層学習を用いた非コードゲノム配列のがんドライバー変異の探索研究代表者
- 研究代表者
  
  鬼丸洸
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分43060:システムゲノム科学関連
- 研究機関
  名古屋大学
形態形成における全ゲノム転写制御ネットワークの高精度推定方法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  鬼丸洸
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2019
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  発生生物学
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所

すべて 2020 2019 2018 2017

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] The evolutionary origin of developmental enhancers in vertebrates: Insights from non‐model species2020
- 著者名/発表者名
  Koh Onimaru
- 雑誌名
  
  Development, Growth & Differentiation
  
  巻: －号: 5 ページ: 326-333
- DOI
  10.1111/dgd.12662
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15132
[雑誌論文] Developmental hourglass and heterochronic shifts in fin and limb development2020
- 著者名/発表者名
  Koh Onimaru、Kaori Tatsumi、Chiharu Tanegashima、Mitsutaka Kadota、Osamu Nishimura、Shigehiro Kuraku
- 雑誌名
  
  bioRxiv
  
  巻: －
- DOI
  10.1101/2020.01.10.901173
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15132
[雑誌論文] Systems biology approach to the origin of the tetrapod limb2019
- 著者名/発表者名
  Koh Onimaru, Luciano Marcon
- 雑誌名
  
  arXiv
  
  巻: arXiv:1907.02730
- オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15132
[雑誌論文] A regulatory-sequence classifier with a neural network for genomic information processing2018
- 著者名/発表者名
  Onimaru Koh、Nishimura Osamu、Kuraku Shigehiro
- 雑誌名
  
  bioRxiv
  
  巻: - ページ: 355974-355974
- DOI
  10.1101/355974
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15132
[雑誌論文] A staging table for the embryonic development of the brownbanded bamboo shark (Chiloscyllium punctatum)2018
- 著者名/発表者名
  Onimaru Koh、Motone Fumio、Kiyatake Itsuki、Nishida Kiyonori、Kuraku Shigehiro
- 雑誌名
  
  Developmental Dynamics
  
  巻: 247 号: 5 ページ: 712-723
- DOI
  10.1002/dvdy.24623
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07426, KAKENHI-PROJECT-17K15132, KAKENHI-PROJECT-17H03868
[学会発表] Omics approaches to the fin-to-limb evolution2019
- 著者名/発表者名
  Koh Onimaru, Kaori Tatsumi, Chiharu Tanegashima, Mitsutaka Kadota, Osamu Nishimura, Shigehiro Kuraku
- 学会等名
  EMBO Workshop: Limb Development and Regeneration: New Tools for a Classic Model System EMBL Barcelona
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15132
[学会発表] Deep learning を用いた転写因子結合配列の予測用いた転写因子結合配列の予測いた転写因子結合配列の予測転写因子結合配列の予測の予測予測2019
- 著者名/発表者名
  鬼丸洸
- 学会等名
  Rinkai Hackathon 2019 with DDBJing
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15132
[学会発表] Systematic comparison of gene regulation in fin and limb development2019
- 著者名/発表者名
  Koh Onimaru, Kaori Tatsumi, Chiharu Tanegashima, Mitsutaka Kadota, Osamu Nishimura, Shigehiro Kuraku
- 学会等名
  JAPANESE SOCIETY of DEVELOPMENTAL BIOLOGISTS
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15132
[学会発表] Predicting gene regulatory regions with a convolutional neural network for processing double-strand genome sequence information2019
- 著者名/発表者名
  Koh Onimaru, Osamu Nishimura, Shigehiro Kuraku
- 学会等名
  2019年日本バイオインフォマティクス学会年会・第8回生命医薬情報学連合大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15132
[学会発表] Genome-wide comparison of gene regulation in fin and limb development2019
- 著者名/発表者名
  Koh Onimaru, Kaori Tatsumi, Chiharu Tanegashima, Mitsutaka Kadota, Osamu Nishimura, Shigehiro Kuraku
- 学会等名
  The 52th annual meeting of JSDB
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15132
[学会発表] Sequence-based prediction of regulatory genomic regions with an improved deep-learning method2018
- 著者名/発表者名
  Koh Onimaru
- 学会等名
  International Society for Computational Biology
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15132
[学会発表] 複合的アプローチによる鰭から四肢への形態進化における分子機序の研究2017
- 著者名/発表者名
  鬼丸　洸
- 学会等名
  遺伝研研究集会「進化遺伝学における実験的研究と理論的研究の融合」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15132
[学会発表] A deeply conserved Turing mechanism in the fin and limb development2017
- 著者名/発表者名
  Koh Onimaru, Luciano Marcon, Marco Musy, Mikiko Tanaka, James Sharpe
- 学会等名
  the Pan-American Society for Evolutionary Developmental Biology
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15132

1. 工樂樹洋

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

鬼丸 洸 Onimaru Koh

研究課題

研究成果

共同研究者

深層学習を用いた非コードゲノム配列のがんドライバー変異の探索研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

形態形成における全ゲノム転写制御ネットワークの高精度推定方法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] The evolutionary origin of developmental enhancers in vertebrates: Insights from non‐model species2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Developmental hourglass and heterochronic shifts in fin and limb development2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Systems biology approach to the origin of the tetrapod limb2019

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] A regulatory-sequence classifier with a neural network for genomic information processing2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] A staging table for the embryonic development of the brownbanded bamboo shark (Chiloscyllium punctatum)2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] Omics approaches to the fin-to-limb evolution2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Deep learning を用いた転写因子結合配列の予測用いた転写因子結合配列の予測いた転写因子結合配列の予測転写因子結合配列の予測の予測予測2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Systematic comparison of gene regulation in fin and limb development2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Predicting gene regulatory regions with a convolutional neural network for processing double-strand genome sequence information2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Genome-wide comparison of gene regulation in fin and limb development2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Sequence-based prediction of regulatory genomic regions with an improved deep-learning method2018

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 複合的アプローチによる鰭から四肢への形態進化における分子機序の研究2017

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] A deeply conserved Turing mechanism in the fin and limb development2017

著者名/発表者名

学会等名

データソース

鬼丸洸 Onimaru Koh