ＰＩＧＯＬＯＴＴＩＳｉｍｏｎｅ PIGOLOTTI Simone

… 別表記

PIGOLOTTI Simone Pigolotti Simone

研究者番号	30812193
所属 (現在)	2025年度: 沖縄科学技術大学院大学, 生物複雑性ユニット, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2022年度 – 2024年度: 沖縄科学技術大学院大学, 生物複雑性ユニット, 教授 2020年度 – 2021年度: 沖縄科学技術大学院大学, 生物複雑性ユニット, 准教授 2018年度 – 2019年度: 沖縄科学技術大学院大学, 生物学的複雑性ユニット, 准教授
審査区分/研究分野	研究代表者小区分13040:生物物理、化学物理およびソフトマターの物理関連 / 小区分13010:数理物理および物性基礎関連
キーワード	研究代表者 bacterial cell cycle / replisome / DNA replication / Statistical Physics / Biophysical models / Thermodynamics / thermodynamics / networks Information / tradeoff Chemical / Proofreading Speed-error … もっと見る / Polymerization Kinetic / Information theory / Chemical networks / Speed-error tradeoff / Kinetic Proofreading / Polymerization / Information processing 隠す

DNA replication dynamics in living bacteria研究代表者
- 研究代表者
  
  PIGOLOTTI Simone
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分13040:生物物理、化学物理およびソフトマターの物理関連
- 研究機関
  沖縄科学技術大学院大学
Optimal information processing in biophysical networks研究代表者
- 研究代表者
  
  PIGOLOTTI Simone
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2022
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分13010:数理物理および物性基礎関連
- 研究機関
  沖縄科学技術大学院大学

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2019

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Genome replication in asynchronously growing microbial populations2024
- 著者名/発表者名
  Pflug Florian G、Bhat Deepak、Pigolotti Simone
- 雑誌名
  
  PLOS Computational Biology
  
  巻: 20 号: 1 ページ: e1011753-e1011753
- DOI
  10.1371/journal.pcbi.1011753
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K25843
[雑誌論文] Error-suppression mechanism of PCR by blocker strands2023
- 著者名/発表者名
  Hiroyuki Aoyanagi, Simone Pigolotti, Shinji Ono, Shoichi Toyabe
- 雑誌名
  
  Biophysical Journal
  
  巻: 122 号: 7 ページ: 1334-1341
- DOI
  10.1016/j.bpj.2023.02.028
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03473, KAKENHI-PLANNED-18H05427
[雑誌論文] Pareto optimal fronts of kinetic proofreading2023
- 著者名/発表者名
  Davide Chiuchiu, Shrabani Mondal, Simone Pigolotti
- 雑誌名
  
  New Journal of Physics
  
  巻: 25 号: 4 ページ: 0430007-0430007
- DOI
  10.1088/1367-2630/acc757
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03473
[雑誌論文] Physical bioenergetics: Energy fluxes, budgets, and constraints in cells2021
- 著者名/発表者名
  X. Yang, M. Heinemann, J. Howard, G. Huber, S. Iyer-Biswas, G. Le Treut, M. Lynch, K. L. Montooth, D. J. Needleman, S. Pigolotti, J. Rodenfels, P. Ronceray, S. Shankar, I. Tavassoly, S. Thutupalli, D. V. Titov, J. Wang, and P. J. Foster
- 雑誌名
  
  Proc. Natl. Acad. Sci.
  
  巻: 118 号: 26
- DOI
  10.1073/pnas.2026786118
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03473
[雑誌論文] Assembly of heteropolymers via a continuous reaction coordinate2019
- 著者名/発表者名
  D. Chiuchiu, J. Ferrare, S. Pigolotti
- 雑誌名
  
  Phys. Rev. E 100, 062502, arXiv:1905.05490
  
  巻: -
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03473
[雑誌論文] Error-speed correlations in biopolymer synthesis2019
- 著者名/発表者名
  D. Chiuchiu, Y. Tu, S. Pigolotti
- 雑誌名
  
  Phys. Rev. Lett. 123, 038101, arXiv:1905.12869
  
  巻: -
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03473
[学会発表] Dynamics of genome replication2024
- 著者名/発表者名
  S. Pigolotti
- 学会等名
  DPG-Verhandlungen 2024
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K25843
[学会発表] Speed variations of bacterial replisomes2024
- 著者名/発表者名
  S. Pigolotti
- 学会等名
  OIST - JST Joint Workshop: Biomolecular Super Assembly Insights
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K25843
[学会発表] Speed variations of bacterial replisomes2023
- 著者名/発表者名
  Simone Pigolotti
- 学会等名
  APS March Meeting 2023
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03473
[学会発表] Speed variations of bacterial replisomes2023
- 著者名/発表者名
  S. Pigolotti
- 学会等名
  NCTS STATPHYS28 Satelite Meeting
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K25843
[学会発表] Speed variations of bacterial replisomes2022
- 著者名/発表者名
  Simone Pigolotti
- 学会等名
  The 3rd Workshop on Stochasticity and Fluctuations in Small Systems
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03473
[学会発表] Thermodynamics of Error Correction2021
- 著者名/発表者名
  Simone Pigolotti
- 学会等名
  Max-Planck Institute for Dynamics and Self-Organization
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03473
[学会発表] Information processing in cells: from CRISPR to replisomes2021
- 著者名/発表者名
  Simone Pigolotti
- 学会等名
  APCTP Frontiers in Theoretical Biophysics
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03473
[学会発表] Thermodynamics of Error Correction2020
- 著者名/発表者名
  Simone Pigolotti
- 学会等名
  ICTP (International Centre for Theoretical Physics)
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03473
[学会発表] Error-speed correlations in biopolymer synthesis2019
- 著者名/発表者名
  Simone Pigolotti
- 学会等名
  the 57th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan in Miyazaki
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K03473

1. CHIUCHIU Davide (40817491)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件

ＰＩＧＯＬＯＴＴＩ Ｓｉｍｏｎｅ PIGOLOTTI Simone

PIGOLOTTI Simone Pigolotti Simone

研究課題

研究成果

共同研究者

DNA replication dynamics in living bacteria研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

Optimal information processing in biophysical networks研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] Genome replication in asynchronously growing microbial populations2024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Error-suppression mechanism of PCR by blocker strands2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Pareto optimal fronts of kinetic proofreading2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Physical bioenergetics: Energy fluxes, budgets, and constraints in cells2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Assembly of heteropolymers via a continuous reaction coordinate2019

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Error-speed correlations in biopolymer synthesis2019

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[学会発表] Dynamics of genome replication2024

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Speed variations of bacterial replisomes2024

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Speed variations of bacterial replisomes2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Speed variations of bacterial replisomes2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Speed variations of bacterial replisomes2022

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Thermodynamics of Error Correction2021

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Information processing in cells: from CRISPR to replisomes2021

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Thermodynamics of Error Correction2020

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Error-speed correlations in biopolymer synthesis2019

著者名/発表者名

学会等名

ＰＩＧＯＬＯＴＴＩＳｉｍｏｎｅ PIGOLOTTI Simone