五斗進 Goto Susumu

研究者番号	40263149
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等), データサイエンス共同利用基盤施設, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2021年度 – 2022年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等), データサイエンス共同利用基盤施設, 教授 2020年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等), 大学共同利用機関等の部局等, 教授 2017年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等), データサイエンス共同利用基盤施設, 教授 2017年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等), 大学共同利用機関等の部局等, 教授 2016年度: 京都大学, 化学研究所, 研究員 … もっと見る 2016年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(新領域融合研究センター及びライフサイエンス統合データベースセンター), ライフサイエンス統合データベースセンター, 教授 2014年度 – 2015年度: 京都大学, 化学研究所, 准教授 2007年度 – 2009年度: 京都大学, 化学研究所, 准教授 2000年度 – 2006年度: 京都大学, 化学研究所, 助教授 2002年度: 京都大学, 化学研究所, 教授隠す
審査区分/研究分野	研究代表者生体生命情報学 / 生物系 / 生命・健康・医療情報学研究代表者以外中区分63:環境解析評価およびその関連分野 / 水圏生命科学 / 化学系薬学 / 生物系
キーワード	研究代表者データベース / バイオインフォマティクス / 抗原変異 / 糖鎖結合モチーフ / ヘパリン / 赤血球結合膜タンパク質 / 赤血球 / 配列解析 / rifin遺伝子ファミリー / var遺伝子ファミリー … もっと見る / ワクチン開発 / Plasmodium falciparum / マラリア / Network topology / GRID / Reaction network / Molecular interaction / Algorithm / Ontology / Bioinformatics / Database / マイクロアレイ発現データ / 知識抽出 / ゲノムデータベース / 相関ルール発見手法 / リンク情報 / アミノ酸配列類似度データ / 経路探索 / 相関クラスタ / グラフ比較 / 酵素反応 / 分子生物学データベース / グリッドコンピューティング / タンパク質間相互作用予測 / 文献からの知識抽出 / タンパク質立体構造予測 / 統合データベース / グラフトポロジー / 糖鎖構造データベース / 化合物構造比較 / ネットワークトポロジー / グリッド / 反応ネットワーク / 分子間相互作用 / アルゴリズム / オントロジー / 病原微生物 / 進化 / 遺伝子ファミリー / 比較ゲノム … もっと見る研究代表者以外微生物機能分類 / 生理代謝機能 / マンガン酸化菌 / ゲノム情報 / 培養化 / 培地データベース / Genomaple / 生理代謝ポテンシャル / 嫌気的マンガン酸化菌 / 再構築ゲノム / メタゲノム / 未培養菌の培養化 / 好熱微生物 / メタンハイドレード / 水素生成 / 一酸化炭素資化性菌 / ミクロコズム / 好熱菌 / 海洋コア / トランスクリプトーム解析 / ゲノム解析 / CO代謝 / 一酸化炭素資化菌 / Artificial repressor / Artificial restriction enzyme / Gene target / DNA bending / DNA motif / DNA recognition / Artificial protein / Zinc finger / DNAモチーフ / DNA認識 / DNA湾曲 / 人工リプレッサー / 人工制限酵素 / 人工タンパク質 / 遺伝子ターゲット / 亜鉛フィンガー / 遺伝子間相互作用 / べき乗則 / システム生物学 / バイオインフォマティクス / 概日リズム / ネットワーク定常状態 / オペロン / 遺伝子発現データ / 神経細胞 / 形態形成 / ブーリアンネットワーク / 緑膿菌 / 進化動力学モデル / スケールフリー / 生物情報ネットワーク / 大規模進化動力学モデル / 遺伝子発現 / タンパク質ドメイン / スケールフリーネットワーク / タンパク質相互作用 / 代謝ネットワーク / 遺伝子ネットワーク隠す

ゲノムと培地情報から探る未培養環境微生物の培養化戦略
- 研究代表者
  
  高見英人
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2022
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分63:環境解析評価およびその関連分野
- 研究機関
  東京大学
時空間的探索による一酸化炭素資化菌の包括的研究とその応用基盤の構築
- 研究代表者
  
  左子芳彦
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2020
- 研究種目
  
  基盤研究(S)
- 研究分野
  
  水圏生命科学
- 研究機関
  京都大学
抗原変異遺伝子群の進化メカニズムの解明研究代表者
- 研究代表者
  
  五斗進
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2017
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等)
  京都大学
マラリア原虫Plasmodium falciarumの疾病立過程に関する研究研究代表者
- 研究代表者
  
  五斗進
- 研究期間 (年度)
  2006 – 2007
- 研究種目
  
  特別研究員奨励費
- 研究分野
  
  生体生命情報学
- 研究機関
  京都大学
生物情報ネットワークの構造および動的挙動の数理解析
- 研究代表者
  
  阿久津達也
- 研究期間 (年度)
  2005 – 2009
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  京都大学
高度データベースの構築と検索研究代表者
- 研究代表者
  
  五斗進
- 研究期間 (年度)
  2000 – 2004
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  京都大学
オーダーメイド型人工制限酵素・人工リプレッサーの開発
- 研究代表者
  
  杉浦幸雄
- 研究期間 (年度)
  2000 – 2002
- 研究種目
  
  地域連携推進研究費
- 研究分野
  
  化学系薬学
- 研究機関
  京都大学

すべて 2017 2009 2008 2007 2006 2005 2004

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Discriminating the reaction types of plant type III polyketide synthases.2017
- 著者名/発表者名
  Shimizu, Y., Ogata, H. and Goto, S.
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 印刷中号: 13 ページ: 1937-1943
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btx112
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280105
[雑誌論文] Revealing phenotype-associated functional differences by genome-wide scan of ancient haplotype blocks.2017
- 著者名/発表者名
  Onuki, R., Yamaguchi, R., Shibuya, T., Kanehisa, M. and Goto, S.
- 雑誌名
  
  PLOS ONE
  
  巻: 印刷中
- NAID
  120006309307
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280105
[雑誌論文] Type III polyketide synthases: functional classification and phylogenomics.2017
- 著者名/発表者名
  Shimizu, Y., Ogata, H. and Goto, S.
- 雑誌名
  
  ChemBioChem
  
  巻: 18 号: 1 ページ: 50-65
- DOI
  10.1002/cbic.201600522
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280105
[雑誌論文] Systems biology approaches and tools for investigating cardiovascular disease2009
- 著者名/発表者名
  Wheelock, C.E., Wheelock, A.M., Kawashima, S., Diez, D., Kanehisa, M., van Erk, M., Kleemann, R., Haeggstrom, J.Z., Goto, S.
- 雑誌名
  
  Molecular Biosystems 5
  
  ページ: 588-602
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017019
[雑誌論文] Systems biology approaches and tools for investigating cardiovascular disease2009
- 著者名/発表者名
  C.E.Wheelock, A.M.Wheelock, S.Kawashima, D.Diez, M.Kanehisa, M.van Erk, R.Kleemann, J.Z.Haeggstrom, S.Goto
- 雑誌名
  
  Molecular Biosystems
  
  巻: 5 ページ: 588-602
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017019
[雑誌論文] varDB : a pathogen-specific database of protein families involved in antigenic variation2008
- 著者名/発表者名
  C.N. Hayes, D. Diez, N. Joannin, W. Honda, M. Kanehisa, W. Wahlgren. C.E Wheelock and S. Goto
- 雑誌名
  
  Bioinformatics 24
  
  ページ: 2564-2565
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017019
[雑誌論文] KEGG Atlas mapping for global analysis of metabolic pathways2008
- 著者名/発表者名
  S. Okuda, T. Yamada, M. Hamajima, M. Itoh, T. Katayama, P. Bork, S. Goto and M. Kanehisa
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research 36
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017019
[雑誌論文] Prediction of missing enzyme genes in bacterial metabolic network : A reconstruction of lysine degradation pathway of Pseudomonas aeruginosa2007
- 著者名/発表者名
  Yamanishi, Y., Mihara, H., Osaki, M., Muramatsu, H., Esaki, N., Sato, T., Hizukuri, Y., Goto, S., Kanehisa, M.
- 雑誌名
  
  FEBS Journal 274
  
  ページ: 2262-2273
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017019
[雑誌論文] Evolutionary history and functional implication of protein domains and their combinations in eukaryotes2007
- 著者名/発表者名
  Itoh, M., Nacher, J. C., Kuma, K., Goto, S., and Kanehisa, M.
- 雑誌名
  
  Genome Biology 8(論文番号)
  
  ページ: 121-121
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017019
[雑誌論文] Characterization of relationships between transcriptional units and operon structures in Bacillus subtilis and Escherichia coli2007
- 著者名/発表者名
  Okuda, S., Kawashima, S., Kobayashi, K., Ogasawara, N., Kanehisa, M., and Goto S.
- 雑誌名
  
  BMC Genomics 8(論文番号)
  
  ページ: 48-48
- NAID
  120004770315
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017019
[雑誌論文] Regulation of metabolic networks by small molecule metabolites2007
- 著者名/発表者名
  Gutteridge, A., Kanehisa, M., and Goto S.
- 雑誌名
  
  BMC Bioinformatics 8(論文番号)
  
  ページ: 88-88
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017019
[雑誌論文] The commonality of protein interaction networks determined in neurode generative disorders (NDDs)2007
- 著者名/発表者名
  Limviphuvadh, V., Tanaka, S., Goto, S., Ueda, K., and Kanehisa, M.
- 雑誌名
  
  Bioinformatics 23
  
  ページ: 2129-2138
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017019
[雑誌論文] Prediction of missing enzyme genes in bacterial metabolic network: A reconstruction of lysine degradation pathway of Pseudomonas aeruginosa2007
- 著者名/発表者名
  Yamanishi, Y., Mihara, H., Osaki, M., Muramatsu, H., Esaki, N., Sato, T., Hizukuri, Y., Goto, S., and Kanehisa, M.
- 雑誌名
  
  FEBS Journal 274
  
  ページ: 2262-2273
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017019
[雑誌論文] Analysis of the differences in metabolic network expansion between prokaryotes and eukaryotes2006
- 著者名/発表者名
  Tanaka, M., Yamada, T., Itoh, M., Okuda, S., Goto, S., Kanehisa, M.
- 雑誌名
  
  Genome Informatics 17
  
  ページ: 230-239
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017019
[雑誌論文] Extraction of phylogenetic network modules from the metabolic network2006
- 著者名/発表者名
  Yamada, T., Kanehisa, M., Goto, S.
- 雑誌名
  
  BMC Bioinformatics 7
  
  ページ: 130-130
- NAID
  120004770316
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017019
[雑誌論文] ODB : a database of operons accumulating known operons across multiple genomes2006
- 著者名/発表者名
  Okuda S., Katayama, T., Kawashima S., Goto, S., Kanehisa M.
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research 34
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017019
[雑誌論文] Conservation of gene co-regulation between two prokaryotes. Bacillus subtilis and Escherichia coli2005
- 著者名/発表者名
  Okuda, S., Kawashima, S., Goto, S., Kanehisa, M.
- 雑誌名
  
  Genome Informatics 16
  
  ページ: 116-124
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017019
[雑誌論文] Fast and accurate database homology search using upper bounds of local alignment2005
- 著者名/発表者名
  Itoh, M., Goto, S., Akutsu, T., Kanehisa, M.
- 雑誌名
  
  Bioinformatics 21
  
  ページ: 912-921
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12208007
[雑誌論文] Two complementary representations of a scale-free network2005
- 著者名/発表者名
  Nacher, J.C., Yamada, T., Goto, S., Kanehisa, M., Akutsu, T.
- 雑誌名
  
  Physica A 349
  
  ページ: 349-363
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12208007
[雑誌論文] Computational assignment of the EC numbers for genomic-scale analysis of enzymatic reactions2004
- 著者名/発表者名
  Kotera, M., Okuno, Y., Hattori, M., Goto, S., Kanehisa, M.
- 雑誌名
  
  J.Am.Chem.Soc. 126
  
  ページ: 16487-16498
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12208007
[雑誌論文] Extraction of phylogenetic network modules from prokaryote Metabokic pathways2004
- 著者名/発表者名
  Yamada, T., Goto, S., Kanehisa, M.
- 雑誌名
  
  Genome Informatics 15
  
  ページ: 249-259
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12208007
[学会発表] ESTからの植物ゲノムアノテーションとパスウェイ解析2008
- 著者名/発表者名
  五斗進
- 学会等名
  日本植物生理学会第49回年会
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター
- 年月日
  2008-03-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017019
[学会発表] 代謝ネットワークのトポロジー解析2007
- 著者名/発表者名
  五斗進
- 学会等名
  九州大学産業技術数理研究センターワークショップ
- 発表場所
  福岡
- 年月日
  2007-09-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017019
[学会発表] Network perspective in bioinformatics2007
- 著者名/発表者名
  Goto, S.
- 学会等名
  Nishinomiya-Yukawa International & Interdisciplinary Symposium
- 発表場所
  Kyoto, Japan
- 年月日
  2007-10-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017019
[学会発表] Network perspective in bioinformatics2007
- 著者名/発表者名
  Susumu Goto
- 学会等名
  Nishinomiya-Yukawa International & Interdisciplinary Symposium
- 発表場所
  コープイン京都
- 年月日
  2007-10-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017019
[学会発表] 代謝ネットワークのトポロジー解析2007
- 著者名/発表者名
  五斗進
- 学会等名
  九州大学産業技術数理研究センターワークショップ
- 発表場所
  九州大学
- 年月日
  2007-09-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17017019

1. 阿久津達也 (90261859)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 2件
2. 望月敦史 (10304726)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 時田恵一郎 (00263195)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 佐藤賢二 (10215783)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 服部正泰 (60372554)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
6. 奥野恭史 (20283666)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
7. 杉浦幸雄 (40025698)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 永岡真 (60314275)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 二木史朗 (50199402)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 左子芳彦 (60153970)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
11. 高見英人 (70359165)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
12. 吉田天士 (80305490)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
13. 神川龍馬 (40627634)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
14. 緒方博之 (70291432)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 安田尚登 (90175646)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
16. 奥西将之 (70373090)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
17. 前田広人 (80238873)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
18. HAYES Clair Nelson

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件

五斗 進 Goto Susumu

研究課題

研究成果

共同研究者

ゲノムと培地情報から探る未培養環境微生物の培養化戦略

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

時空間的探索による一酸化炭素資化菌の包括的研究とその応用基盤の構築

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

抗原変異遺伝子群の進化メカニズムの解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

マラリア原虫Plasmodium falciarumの疾病立過程に関する研究研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

生物情報ネットワークの構造および動的挙動の数理解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

高度データベースの構築と検索研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

オーダーメイド型人工制限酵素・人工リプレッサーの開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Discriminating the reaction types of plant type III polyketide synthases.2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Revealing phenotype-associated functional differences by genome-wide scan of ancient haplotype blocks.2017

著者名/発表者名

雑誌名

NAID

データソース

[雑誌論文] Type III polyketide synthases: functional classification and phylogenomics.2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Systems biology approaches and tools for investigating cardiovascular disease2009

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Systems biology approaches and tools for investigating cardiovascular disease2009

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] varDB : a pathogen-specific database of protein families involved in antigenic variation2008

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] KEGG Atlas mapping for global analysis of metabolic pathways2008

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Prediction of missing enzyme genes in bacterial metabolic network : A reconstruction of lysine degradation pathway of Pseudomonas aeruginosa2007

著者名/発表者名

雑誌名

五斗進 Goto Susumu